鄧?yán)缀?,徐芳華,曾 濤,徐想達(dá),巢海潮
1南昌大學(xué)研究生院醫(yī)學(xué)部,南昌 330006 江西省人民醫(yī)院 2病理科 3泌尿外科 4臨床醫(yī)學(xué)研究所,南昌 330006
膀胱癌是泌尿系最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,位居全部惡性腫瘤第8位,具有易復(fù)發(fā)、易進(jìn)展、預(yù)后差等臨床特點(diǎn)[1]。在我國(guó),其發(fā)病率高居泌尿生殖系腫瘤首位,并呈逐年上升趨勢(shì),已成為一個(gè)嚴(yán)重危害公民健康的重大疾病[2]。目前,膀胱癌的發(fā)病機(jī)制仍不明確[3],缺乏特異性的早期篩選、診斷指標(biāo)及有效治療靶點(diǎn),使得雖然臨床診療水平在不斷提高,但其5年生存率無(wú)明顯改觀。因此,探索新的診斷、預(yù)后標(biāo)志物及基因治療靶點(diǎn)一直是相關(guān)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)和哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)激活劑3(late endosomal/lysosomal adaptor,MAPK and MTOR activator 3,LAMTOR3)是諸多信號(hào)通路的關(guān)鍵調(diào)控因子,在細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖及凋亡等生物學(xué)行為方面發(fā)揮了重要作用[4]。近期研究發(fā)現(xiàn),LAMTOR3與多種腫瘤的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)[5],但目前鮮有與膀胱癌相關(guān)的報(bào)道。本研究擬通過(guò)檢索基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘信息,并結(jié)合細(xì)胞實(shí)驗(yàn)及臨床組織標(biāo)本進(jìn)行驗(yàn)證,分析LAMTOR3在膀胱癌中的表達(dá)及其臨床意義,為其相關(guān)基礎(chǔ)研究及臨床應(yīng)用提供切入點(diǎn),為基因芯片數(shù)據(jù)信息挖掘及應(yīng)用提供思路。
基因芯片數(shù)據(jù)篩選Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.Oncomine.org/)是基于腫瘤基因芯片數(shù)據(jù)構(gòu)建的在線數(shù)據(jù)分析平臺(tái),收錄了多種腫瘤的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及臨床相關(guān)信息[6]。Expression Atlas 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ebi.ac.uk/gxa/home)是一種開(kāi)放的科學(xué)資源,可提供不同組織、細(xì)胞類(lèi)型,生物各發(fā)育階段和疾病轉(zhuǎn)歸等相關(guān)的基因表達(dá)信息[7]。本研究以“LAMTOR3/MP1”和“bladder cancer”為關(guān)鍵詞,檢索了Oncomine和Expression Atlas數(shù)據(jù)庫(kù),根據(jù)檢索相關(guān)基因表達(dá)譜芯片信息,對(duì)不同細(xì)胞、組織類(lèi)型,各臨床分期、病理分級(jí)等相關(guān)的大數(shù)據(jù)進(jìn)行二次分析。
標(biāo)本來(lái)源2010年1月至2017年12月在江西省人民醫(yī)院收治的行膀胱癌根治術(shù)患者的病理石蠟標(biāo)本63例,新鮮的膀胱癌組織及其配對(duì)的正常組織8對(duì)。63例患者中,男57例,女6例,平均年齡(63.4±7.5)歲(43.2~65.9歲)。所有納入患者的臨床資料完備,均經(jīng)常規(guī)組織病理學(xué)確診為膀胱癌,術(shù)前均未行放療、膀胱化學(xué)灌注、免疫因子等治療。組織臨床分期、病理學(xué)分級(jí)分別參照國(guó)際抗癌聯(lián)盟(Union for International Cancer Control,UICC)2002年TMN分期、世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)病理分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行。本研究經(jīng)江西省人民醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),所有患者均簽署知情同意書(shū)(倫理批號(hào)2018040)。
材料和試劑人源性膀胱癌細(xì)胞株UMUC3、J82、5637、T24及人源性正常膀胱永生化細(xì)胞SV-HUC-1均購(gòu)自中國(guó)科學(xué)院細(xì)胞庫(kù),其中J82于含10% 胎牛血清的MEM(Gibco,USA)高糖培養(yǎng)基中培養(yǎng),余細(xì)胞株于含10% 胎牛血清的RPMI 1640(Gibco,USA)培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)條件:37℃、5% CO2、飽和濕度。RNA提取試劑盒及2×EasyTaq PCR Super Mix購(gòu)自北京全式金生物公司,LAMTOR3及GAPDH內(nèi)參引物購(gòu)自北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司;兔抗人LAMTOR3及鼠抗人β-actin單克隆抗體購(gòu)自美國(guó)Gene Tex試劑公司,羊抗兔二抗購(gòu)自北京康為世紀(jì)公司,Pro-light HRP化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑購(gòu)自天根生化科技有限公司,DAB酶底物顯色試劑盒購(gòu)自福州邁新生物公司。
RT-PCR法檢測(cè)LAMTOR3 mRNA表達(dá)采用RNA提取試劑盒提取組織及細(xì)胞總RNA,紫外分光光度計(jì)法定量。按試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA。引物序列:LAMTOR3上游引物序列為5’-ATGGCGGATGACCTAAAGCG-3’,下游引物序列為5’-GAAACTTCCACAACTTGTCTCAGTTC-3’;GAPDH上游引物序列為5’-ACAGCCTCAAGATCATCAGC-3’;下游引物序列為5’-GGTCAT GAGTCCTTCCACGAT-3’。以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,程序設(shè)定:預(yù)變性95℃ 30 s;循環(huán)參數(shù)95℃ 30 s,59℃ 30 s,72℃ 30 min,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。設(shè)置3次平行實(shí)驗(yàn)。
Western blot檢測(cè)LAMTOR3蛋白水平收集膀胱癌組織及正常膀胱組織,加入裂解液充分裂解,制備細(xì)胞總蛋白,BCA法測(cè)定各蛋白濃度。配置相應(yīng)濃度的SDS-PAGE電泳凝膠,依次進(jìn)行電泳、轉(zhuǎn)膜、10%脫脂牛奶封閉。一抗孵育,4℃搖床過(guò)夜;第2天回收一抗后加入二抗孵育1 h;TBST洗膜5次,每次5 min;ECL法顯影,重復(fù)3次實(shí)驗(yàn)。采用Image J軟件分析各條帶灰度值,分別計(jì)算目的蛋白的相對(duì)表達(dá)量并使用Adobe Illustrator軟件作圖。
免疫組織化學(xué)法使用石蠟標(biāo)本制作4 μm切片。按免疫組織化學(xué)SP法試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行實(shí)驗(yàn):將切片依次經(jīng)過(guò)烤片、水化、高溫高壓抗原修復(fù)、羊血清封閉,稀釋一抗(1∶200)室溫孵育1 h,PBS洗滌再行二抗室溫孵育15 min,蘇木精復(fù)染,中性樹(shù)膠封片鏡檢;采用等量PBS代替一抗為陰性對(duì)照。切片染色完成后進(jìn)行結(jié)果判定。
LAMTOR3在各膀胱癌細(xì)胞株中的表達(dá)Expression Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果顯示,LAMTOR3在20株膀胱癌細(xì)胞中的基礎(chǔ)表達(dá)水平存在差異,其中,以Hs 172.T、HT-1376、RT4、JMSU-1、T24細(xì)胞株中呈較高表達(dá)(圖1)。
LAMTOR3在膀胱癌組織及正常組織中的表達(dá)Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)中Dyrskj?t等[8]報(bào)道的基因芯片數(shù)據(jù)顯示:LAMTOR3在浸潤(rùn)性(t=2.857,P=0.005)及非浸潤(rùn)性膀胱癌組織(t=3.105,P=0.003)中的表達(dá)均明顯高于正常膀胱組織,LAMTOR3在病理分級(jí)越高的膀胱癌組織中表達(dá)越高(P<0.05)。Sanchez-Carbayo等[9]報(bào)道的基因芯片數(shù)據(jù)顯示:LAMTOR3在浸潤(rùn)性膀胱癌組織的表達(dá)明顯高于正常膀胱組織(t=3.766,P=0.00021),但在非浸潤(rùn)性癌組織中的表達(dá)與正常組織差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=-1.001,P=0.81),LAMTOR3表達(dá)水平與膀胱癌病理分級(jí)有關(guān)(P<0.05),病理分級(jí)越高,LAMTOR3表達(dá)越高(圖2)。
LAMTOR3:絲裂原活化蛋白激酶和雷帕霉素靶蛋白激活劑3;TPM:每百萬(wàn)映射讀取的轉(zhuǎn)錄組數(shù)
LAMTOR3:late endosomal/lysosomal adaptor,mitogen-activated protein kinase and mammalian target of rapamycin activator 3;TPM:transcripts per million reads
圖1LAMTOR3在各膀胱癌細(xì)胞系中的表達(dá)(顏色越深,表達(dá)越高)
Fig1Expression of LAMTOR3 in bladder cancer cell lines in Expression Atlas(deeper color indicates higher expression level)
LAMTOR3 mRNA/蛋白在膀胱癌細(xì)胞及組織中的表達(dá)RT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示:LAMTOR3 mRNA在膀胱癌細(xì)胞株UMUC3(t=10.84,P=0.0084)、J82(t=21.75,P=0.0021)、5637(t=45.88,P=0.0005)和T24(t=87.58,P=0.0001)中的表達(dá)明顯高于正常人膀胱永生化細(xì)胞SV-HUC-1(圖3A)。在8對(duì)配對(duì)的膀胱癌組織和正常膀胱組織中,LAMTOR3 mRNA在膀胱癌組織中的表達(dá)明顯高于正常組織(t=9.076,P=0.0008;t=17.550,P<0.0001;t=7.792,P=0.0014;t=27.460,P<0.0001;t=32.510,P<0.0001;t=35.110,P<0.0001;t=13.990,P<0.0001;t=20.600,P<0.0001)(圖3B)。Western blot檢測(cè)結(jié)果顯示:LAMTOR3蛋白水平在癌組織中的表達(dá)也明顯高于正常組織(t=20.560,P<0.0001;t=32.510,P<0.0001;t=30.620,P<0.0001;t=4.865,P=0.0082;t=8.129,P=0.0012;t=19.600,P<0.0001;t=13.030,P=0.0002;t=13.970,P<0.0001)(圖3C)。
LAMTOR3的表達(dá)與膀胱癌臨床病理特征的關(guān)系免疫組織化學(xué)檢測(cè)結(jié)果顯示:LAMTOR3蛋白主要定位于胞漿,染色呈棕褐色,在正常膀胱組織中低表達(dá),在癌組織中高表達(dá);在浸潤(rùn)性癌組織中較非浸潤(rùn)性癌組織高表達(dá)(圖4);其表達(dá)水平與膀胱癌臨床分期(χ2=9.189,P=0.002)、病理分級(jí)(χ2=4.746,P=0.029)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(χ2=6.210,P=0.013)密切相關(guān),但與性別(χ2=0.965,P=0.326)、年齡(χ2=2.126,P=0.145)、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(χ2=1.261,P=0.261)等無(wú)明顯相關(guān)性(表1)。
與正常膀胱組織相比,aP<0.05,bP<0.01,cP<0.001
aP<0.05,bP<0.01,cP<0.001 compared with the normal group
圖2LAMTOR3在Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)基因芯片中的表達(dá)水平
Fig2Expression level of LAMTOR3 in Oncomine database
Mr:相對(duì)分子質(zhì)量;aP<0.05,bP<0.01,cP<0.001
Mr:relative molecular mass;aP<0.05,bP<0.01,cP<0.001
A.RT-PCR檢測(cè)LAMTOR3 mRNA在各膀胱癌細(xì)胞株及膀胱永生化細(xì)胞的表達(dá);B.RT-PCR檢測(cè)LAMTOR3 mRNA在8對(duì)配對(duì)的膀胱癌(T)和癌旁組織(N)中的表達(dá);C.Western blotting檢測(cè)8對(duì)配對(duì)的膀胱癌組織(T)和相鄰的非癌組織(N)中LAMTOR3蛋白表達(dá),以β-actin為內(nèi)參對(duì)照
A.RT-PCR was used to detect the expression of LAMTOR3 mRNA in bladder cancer cell lines and bladder immortalized cells;B.RT-PCR was used to detect the expression of LAMTOR3 mRNA in eight paired bladder cancer(T)and paracancerous tissues(N);C.Western blotting was used to detect the expression of LAMTOR3 protein in eight pairs of bladder cancer tissues(T)and adjacent non-cancer tissues(N),with β-actin as the internal reference
圖3LAMTOR3 mRNA/蛋白在膀胱癌細(xì)胞及組織中的表達(dá)
Fig3Expressions of LAMTOR3 mRNA/protein in bladder cancer cells and tissues
圖4LAMTOR3分別在正常膀胱組織、非浸潤(rùn)性及浸潤(rùn)性膀胱癌組織中的表達(dá)(HE)
Fig4Expression of LAMTOR3 in normal bladder tissues,non-invasive,and invasive bladder cancer tissue(HE)
LAMTOR3別名MP1,定位于人染色體4q22.3,是蛋白編碼基因,其編碼的為支架蛋白,由124個(gè)氨基酸組成,相對(duì)分子質(zhì)量約為13 623,該支架蛋白主要以蛋白復(fù)合體的方式定位于有絲分裂后期的細(xì)胞核上,通過(guò)MAPK1/胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶2(extracellular signal-regulated kinase 2,ERK2),以及MAPK激酶MAP2K1/MEK1等,調(diào)節(jié)MAPK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,參與細(xì)胞有絲分裂和生長(zhǎng)過(guò)程[4]。有研究發(fā)現(xiàn),LAMTOR3作為調(diào)控因子促進(jìn)細(xì)胞增殖、遷移和凋亡[10],在肺癌[11]、乳腺癌[12]、胃癌[13]、胰腺癌[14]等多種惡性腫瘤中異常表達(dá),與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[5]。有學(xué)者發(fā)現(xiàn),LAMTOR3參與了雌激素依賴的乳腺癌細(xì)胞的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,對(duì)雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌細(xì)胞系的存活至關(guān)重要[12]。Jun等[14]研究發(fā)現(xiàn),LAMTOR3可調(diào)節(jié)癌細(xì)胞內(nèi)的生長(zhǎng)因素、氧水平、細(xì)胞內(nèi)能量和氨基酸含量等,誘導(dǎo)胰腺癌細(xì)胞迅速增殖,說(shuō)明LOMTOR3在腫瘤的生長(zhǎng)存活及增殖方面發(fā)揮了重要的調(diào)控作用。同時(shí)有研究表明,LOMTOR3還與腫瘤細(xì)胞的侵襲、轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。Park 等[15]研究證實(shí),LOMTOR3可調(diào)節(jié)腫瘤遷移關(guān)鍵因子p21激活激酶(p21 activated kinases,PAK)[16],從而抑制前列腺癌細(xì)胞DU145的遷移。Kwon等[17]研究發(fā)現(xiàn),LOMTOR3通過(guò)驅(qū)動(dòng)ERK1/2活性提高膠質(zhì)瘤腫瘤干細(xì)胞的侵襲力,并證實(shí)其表達(dá)與腦腫瘤的不良預(yù)后密切相關(guān),提示LAMTOR3和腫瘤的生長(zhǎng)、侵襲、轉(zhuǎn)移、預(yù)后等關(guān)系密切,為腫瘤的診斷和治療提供新的可能。2007年,Araujo等[18]首次提出將LOMTOR3用于乳腺癌的診斷和靶向治療。此外,最近研究報(bào)道LAMTOR3高表達(dá)可增加腫瘤對(duì)放療、化療的抗性;敲除LAMTOR3基因后,肺癌細(xì)胞對(duì)化療敏感性明顯增加[11]。以上研究說(shuō)明,LAMTOR3可能是一個(gè)潛在的腫瘤調(diào)控因子,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。
表1 膀胱癌組織中LAMTOR3的表達(dá)與臨床病理特征的相關(guān)性Table 1 Correlations between LAMTOR3 and clinicopathological characteristics in bladder cancer patients
LAMTOR3:絲裂原活化蛋白激酶和哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白激活劑3
LAMTOR3:late endosomal/lysosomal adaptor,mitogen-activated protein kinase and mammalian target of rapamycin activator 3
本研究檢索了Oncomine和Expression Atlas數(shù)據(jù)庫(kù),挖掘了LAMTOR3表達(dá)相關(guān)的基因芯片數(shù)據(jù),分析LAMTOR3在膀胱癌細(xì)胞及組織中的表達(dá),及其與膀胱癌臨床病理特征的關(guān)系。Expression Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果顯示,LAMTOR3在20株膀胱癌細(xì)胞中表達(dá)存在差異,以Hs172.T、HT-1376、RT4、JMSU-1、T24細(xì)胞株中表達(dá)較高,提示LAMTOR3和膀胱癌細(xì)胞密切相關(guān)。Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果顯示,LAMTOR3在膀胱癌組織中的表達(dá)明顯高于正常膀胱組織,其表達(dá)水平和膀胱癌病理分級(jí)相關(guān),提示LAMTOR3在膀胱癌發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中可能扮演了重要的調(diào)控角色。
為進(jìn)一步驗(yàn)證基因芯片數(shù)據(jù)結(jié)果,本研究體外培養(yǎng)膀胱癌細(xì)胞株及收集行膀胱癌根治術(shù)患者的病理石蠟標(biāo)本63例,以及新鮮的膀胱癌組織及其配對(duì)的正常組織8對(duì),分別采用RT-PCR、Western blot及免疫組織化學(xué)法檢測(cè)LAMTOR3的表達(dá)。結(jié)果顯示,LAMTOR3 mRNA在膀胱癌細(xì)胞株中的表達(dá)明顯高于正常細(xì)胞株,LAMTOR3基因/蛋白在膀胱癌組織中明顯高于正常組織,LAMTOR3蛋白主要定位于胞漿,染色呈棕褐色,在正常膀胱組織中低表達(dá),在癌組織中高表達(dá),在浸潤(rùn)性癌組織中較非浸潤(rùn)性癌組織高表達(dá),其表達(dá)水平與膀胱癌臨床分期、病理分級(jí)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān),但與性別、年齡、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移等無(wú)明顯相關(guān)性,與生物信息學(xué)相關(guān)分析結(jié)果一致,提示LAMTOR3和膀胱癌關(guān)系密切。
綜上,本研究根據(jù)生物信息分析并結(jié)合細(xì)胞、組織標(biāo)本水平驗(yàn)證,評(píng)估了LAMTOR3在膀胱癌中的表達(dá)及其臨床意義,結(jié)果提示LAMTOR3在膀胱癌細(xì)胞及組織中高表達(dá),與膀胱癌發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),為其相關(guān)基礎(chǔ)研究及靶向分子治療提供新的切入點(diǎn),為基因芯片數(shù)據(jù)信息挖掘及應(yīng)用提供了思路。