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      雌核發(fā)育、野生及養(yǎng)殖牙鲆形態(tài)差異分析

      2019-12-11 10:07趙海濤范寧寧萬玉美孫桂清吳彥徐晨曦
      河北漁業(yè) 2019年11期
      關(guān)鍵詞:形態(tài)學(xué)體長(zhǎng)聚類

      趙海濤 范寧寧 萬玉美 孫桂清 吳彥 徐晨曦

      摘要:通過測(cè)定牙鲆(Paralichthys olivaceus)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)特征數(shù)據(jù),利用方差、聚類、主成分和判別分析等方法,分析了雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)特征差異。結(jié)果顯示:雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆間38個(gè)指標(biāo)存在顯著差異(P<0.05)。雌核發(fā)育牙鲆先和野生牙鲆聚成一支,二者再與養(yǎng)殖牙鲆聚到一支。共得到9個(gè)主成分,表明三種牙鲆的形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。雌核發(fā)育、野生、養(yǎng)殖牙鲆的判別準(zhǔn)確率P1均為90%,其判別準(zhǔn)確率P2分別為96.43%、90%、8438%,綜合判別率為90%。研究表明:方差、聚類、主成分和判別分析等方法對(duì)三種牙鲆差異分析比較有效。

      關(guān)鍵詞:牙鲆(Paralichthys olivaceus);形態(tài)差異;多元分析;聚類;主成分;判別分析

      牙鲆(Paralichthys olivaceus),隸屬硬骨魚綱,鰈形目,鲆科[1-2],主要分布于中國(guó)、朝鮮半島和日本沿海,是我國(guó)重要的海洋經(jīng)濟(jì)魚類之一。它肉質(zhì)細(xì)嫩鮮美、營(yíng)養(yǎng)成分高,是人們喜愛的佳肴,具有非常廣闊的市場(chǎng),經(jīng)濟(jì)價(jià)值高。牙鲆在我國(guó)漁業(yè)生產(chǎn)上占有一定的地位,但是由于過度捕撈和環(huán)境污染,造成牙鲆自然資源大幅度下降。為滿足市場(chǎng)需求,20世紀(jì)90年代初期,國(guó)內(nèi)開始進(jìn)行牙鲆親魚越冬、自然產(chǎn)卵和苗種繁育技術(shù)研究,并取得成功。20世紀(jì)90年代后期開始進(jìn)行人工養(yǎng)殖,隨著養(yǎng)殖技術(shù)的發(fā)展,牙鲆養(yǎng)殖業(yè)逐漸發(fā)展壯大,但人工養(yǎng)殖牙鲆也出現(xiàn)了生長(zhǎng)緩慢、疾病頻發(fā)等種質(zhì)退化現(xiàn)象,針對(duì)這一現(xiàn)象,種質(zhì)改良和新品種的研發(fā)成了牙鲆研究的重點(diǎn),由中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院利用雌核發(fā)育選育全雌牙鲆研究取得成功[3]。雌核發(fā)育是只有母本遺傳的特殊生殖方式[4-5],該方法培育的后代具有提高生長(zhǎng)速度、抗病性和產(chǎn)量等優(yōu)勢(shì),具有很大的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。

      形態(tài)學(xué)特征是遺傳因子與環(huán)境因子相互作用的結(jié)果[6],是物種鑒定和分類的參考依據(jù)。利用多元分析法對(duì)形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行綜合分析,可以有效地鑒定不同的種群或家系。國(guó)內(nèi)外學(xué)者在這方面的研究已取得一些成績(jī)[4,6-15]。牙鲆方面主要集中在牙鲆雌核發(fā)育間[3,15]、普通牙鲆間[2]、不同地域牙鲆間[2]的研究,但迄今未見有雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆和普通養(yǎng)殖牙鲆間形態(tài)差異研究的報(bào)道。本研究通過對(duì)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)指標(biāo)的測(cè)定,用方差、聚類、主成分和判別分析等多元分析方法,分析了雌核發(fā)育、野生、養(yǎng)殖三種牙鲆的形態(tài)特征差異,以期為牙鲆新品種的研發(fā)和家系選育提供理論依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1材料

      實(shí)驗(yàn)對(duì)象為雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆和養(yǎng)殖牙鲆,采自河北省紅鰭東方鲀良種場(chǎng),每個(gè)種類均隨機(jī)采集樣本30尾[2],實(shí)驗(yàn)魚均體型健壯、體表無損傷,無疾病,生命力強(qiáng)。

      1.2數(shù)據(jù)采集

      實(shí)驗(yàn)選取形態(tài)特征共52個(gè),包括5個(gè)采用傳統(tǒng)形態(tài)特征和47個(gè)現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)性狀。數(shù)據(jù)采用Motic Images Plus 2.0軟件進(jìn)行測(cè)量。5個(gè)特征的度量值:體長(zhǎng)、體高、頭長(zhǎng)、吻長(zhǎng)、尾柄長(zhǎng)、尾柄高[2]?,F(xiàn)代框架測(cè)量共用了14個(gè)框架數(shù)據(jù)采集點(diǎn),以獲得牙鲆的框架結(jié)構(gòu)。如圖1所示,根據(jù)14個(gè)框架數(shù)據(jù)采集點(diǎn)之間的直線距離共測(cè)量了47個(gè)牙鲆的框架結(jié)構(gòu)性狀。

      1.3分析方法

      為消除魚體大小不同對(duì)參數(shù)的影響,對(duì)52個(gè)測(cè)量特征進(jìn)行校正,度量值除以體長(zhǎng),共得到51個(gè)可量參數(shù)。運(yùn)用SPSS 19.0對(duì)校正后的51個(gè)特征數(shù)據(jù)進(jìn)行了方差分析、主成分分析、判別分析和聚類分析[2]。

      方差分析:運(yùn)用SPSS 19.0對(duì)三種牙鲆群體的傳統(tǒng)數(shù)據(jù)和框架數(shù)據(jù)分別進(jìn)行單因素方差分析(ANOVA),當(dāng)數(shù)據(jù)具有方差齊性的時(shí)候采用LSD法,當(dāng)數(shù)據(jù)不具有方差齊性的情況下采用Tamhane's T2法分析牙鲆的形態(tài)差異。當(dāng)P>0.05時(shí),牙鲆形態(tài)無顯著性差異;當(dāng)P<0.05時(shí),牙鲆形態(tài)差異顯著;當(dāng)P<0.01時(shí),牙鲆形態(tài)差異極顯著。

      聚類分析:運(yùn)用SPSS19.0 中的系統(tǒng)聚類功能對(duì)三種牙鲆進(jìn)行聚類分析,首先計(jì)算51項(xiàng)形態(tài)比例參數(shù)的均值,然后利用歐氏距離的最短系統(tǒng)聚類法構(gòu)建聚類樹,即歐氏距離系數(shù)越小樣本差異性越小,反之則越大。

      主成分分析:首先運(yùn)用SPSS 19.0對(duì)三種牙鲆的形態(tài)學(xué)特征數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分分析,得到的各主成分負(fù)荷值和貢獻(xiàn)率,然后根據(jù)各主成分的得分繪制主成分散點(diǎn)圖,以進(jìn)一步判斷種群之間相似性大小。

      判別分析:運(yùn)用SPSS 19.0對(duì)三種牙鲆的形態(tài)學(xué)特征數(shù)據(jù)進(jìn)行判別分析,采用逐步判別法,并用以下公式計(jì)算其判別率。

      P1=判別正確的尾數(shù)/實(shí)際尾數(shù)

      P2=判別正確的尾數(shù)/判別尾數(shù)

      綜合判別率=∑Ai/∑Bi

      式中:Ai為第i個(gè)群體判別正確的尾數(shù),Bi為第i群體的實(shí)際尾數(shù),綜合判別率為三組相應(yīng)數(shù)的和[2,16]。

      2結(jié)果與分析

      2.1方差分析

      方差分析結(jié)果顯示(見表1):養(yǎng)殖牙鲆與雌核發(fā)育牙鲆相比,可量性狀中尾柄長(zhǎng)/體長(zhǎng)差異極顯著(P<0.01),頭長(zhǎng)、體高、吻長(zhǎng)與體長(zhǎng)之比差異不明顯;47個(gè)指標(biāo)框架數(shù)據(jù)中,9個(gè)指標(biāo)差異極顯著(P<0.01)占19.1%,12個(gè)指標(biāo)差異顯著(P<0.05),占25.5%,其余差異不顯著,占55.3%。養(yǎng)殖牙鲆與野生牙鲆相比較,尾柄長(zhǎng)/體長(zhǎng)差異顯著,頭長(zhǎng)、體高、吻長(zhǎng)與體長(zhǎng)之比差異不顯著;47個(gè)指標(biāo)框架數(shù)據(jù)中,8個(gè)指標(biāo)差異顯著,占17.0%(P<0.05),5個(gè)指標(biāo)差異極顯著,占10.6%(P<0.01),34個(gè)指標(biāo)差異不顯著,占72.3%。雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆相比,頭長(zhǎng)/體長(zhǎng)差異顯著,吻長(zhǎng)/體長(zhǎng)、尾柄長(zhǎng)/體長(zhǎng)差異極顯著;可量性狀體高/體長(zhǎng)差異不顯著,在47個(gè)指標(biāo)框架數(shù)據(jù)中31個(gè)指標(biāo)差異不顯著,占66.0%,6個(gè)指標(biāo)差異顯著,占12.8%,10個(gè)指標(biāo)差異極顯著,占21.3%。

      2.2聚類分析

      聚類分析結(jié)果顯示,雌核發(fā)育牙鲆先和野生牙鲆聚成一支,二者再與養(yǎng)殖牙鲆聚到一起。表明,雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆形態(tài)特征差異較小,而與養(yǎng)殖牙鲆差異較大(見圖2)。

      1.代表養(yǎng)殖牙鲆,2.代表雌核發(fā)育牙鲆,3.代表野生牙鲆

      2.3主成分分析

      基于5個(gè)可量性狀及47個(gè)框架性狀對(duì)雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆進(jìn)行主成分分析,得到9個(gè)主成分,其特征根、方差貢獻(xiàn)率、累計(jì)貢獻(xiàn)率如表2所示。9個(gè)主成分對(duì)三種牙鲆總變異的累積貢獻(xiàn)率為86.389%,其中第一主成分的變異貢獻(xiàn)率最大,為50.237%,主要取決于D3-7/體長(zhǎng)、D5-2/體長(zhǎng)、D5-4/體長(zhǎng)、D5-6/體長(zhǎng)、D5-8/體長(zhǎng)、D5-14/體長(zhǎng)、D6-10/體長(zhǎng)、D7-14/體長(zhǎng)等比例性狀指標(biāo)(見表3),其中D5-2/體長(zhǎng)、D5-4/體長(zhǎng)、D5-6/體長(zhǎng)、D5-8/體長(zhǎng)反映了牙鲆魚體縱向指標(biāo),D3-7/體長(zhǎng)、D5-14/體長(zhǎng)、D6-10/體長(zhǎng)反映了牙鲆魚體橫向指標(biāo),D7-14/體長(zhǎng)反映的是牙鲆尾部的形態(tài)。第二主成分的變異貢獻(xiàn)率為9.675%,貢獻(xiàn)率最大的比例性狀指標(biāo)為D1-4/體長(zhǎng)、D1-6/體長(zhǎng)、D3-4/體長(zhǎng)、D3-6/體長(zhǎng),主要反映牙鲆頭部指標(biāo)。因此,可認(rèn)為雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。

      三種牙鲆的第一、二主成分的散點(diǎn)分布圖(圖3)顯示,野生牙鲆重疊最多,與養(yǎng)殖牙鲆重疊最少,與全雌牙鲆重疊最多。三種牙鲆均有不同程度的相互疊交。

      2.4判別分析

      如表4所示,基于5個(gè)可量性狀及47個(gè)框架性狀的判別結(jié)果表明:三種牙鲆的判別準(zhǔn)確率P1均為90%,雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆判別準(zhǔn)確率P2分別為96.43%、90%、84.38%,綜合判別率為90%。

      采用逐步判別法進(jìn)行了變量逐步篩選,從51個(gè)性狀中篩選出10個(gè)變量對(duì)區(qū)分三種牙鲆有顯著貢獻(xiàn)。10個(gè)變量為尾柄長(zhǎng)/體長(zhǎng)、D1-4/體長(zhǎng)、D3-2/體長(zhǎng)、D7-6/體長(zhǎng)、D5-8/體長(zhǎng)、D6-10/體長(zhǎng)、D13-14/體長(zhǎng)、D10-14/體長(zhǎng)、D9-14/體長(zhǎng)、D12-13/體長(zhǎng)。建立三種牙鲆的判別函數(shù),利用判別函數(shù)可以對(duì)未知種群的牙鲆魚進(jìn)行判定。判別函數(shù)如下:

      3討論

      傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法不能對(duì)種下的群體如不同地域內(nèi)種群、雜交種、人工選育家系等等進(jìn)行分類或鑒定,是由于HUBBS和 LAGLER[17]提出魚類傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分析的參數(shù)主要集中在魚體的橫軸方向、頭部及尾部的局限性。然而框架分析法可與形態(tài)學(xué)分析有效地結(jié)合用于魚類的形態(tài)分析、種質(zhì)鑒定及分類,如團(tuán)頭魴地理種群間[16]、尼羅羅非魚品系間[6]、“奧尼”魚同其親本(尼羅羅非魚[6,16],奧利亞羅非魚)間[16]、雜交種與親本間[11-12]的形態(tài)判別。本研究對(duì)三種牙鲆8個(gè)可量性狀和47個(gè)框架性狀對(duì)雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)特征差異進(jìn)行分析,研究表明,方差、聚類、主成分和判別分析等方法對(duì)三種牙鲆區(qū)分比較有效。主成分中,9個(gè)主成分對(duì)三種牙鲆間總變異的累積貢獻(xiàn)率為86.389%,第一主成分的變異貢獻(xiàn)率指標(biāo)為D3-7/體長(zhǎng)、D5-2/體長(zhǎng)、D5-4/體長(zhǎng)、D5-6/體長(zhǎng)、D5-8/體長(zhǎng)、D5-14/體長(zhǎng)、D6-10/體長(zhǎng)、D7-14/體長(zhǎng)等比例性狀指標(biāo),其主要反映的是牙鲆魚體縱向、橫向、頭部框架指標(biāo),可認(rèn)為雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。聚類分析的結(jié)果顯示,雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆形態(tài)接近,這可能是由于雌核發(fā)育牙鲆主要是由母本遺傳而來,而本研究采集的雌核發(fā)育牙鲆基本上是以野生牙鲆為母本培育而成,這一結(jié)果充分說明了雌核發(fā)育母本遺傳的優(yōu)勢(shì),其結(jié)果同羅非魚[16]報(bào)道一致。判別分析是多元分析中比較有效的方法,直觀地判斷出牙鲆個(gè)體屬于哪個(gè)品種,綜合判別率為90%。這樣對(duì)于未知種的牙鲆魚類可以用不同品種的判別函數(shù)去判斷其所屬種類。這與其他物種如紅鰭東方鲀[10]、羅非魚[6,11,16]等等的研究結(jié)果是一致的??傊嘣治龇椒梢杂行цb別牙鲆種類。

      4結(jié)論

      本研究采用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)測(cè)定相結(jié)合,利用多元分析法分析了雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)特征差異。結(jié)果表明,雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆間38個(gè)指標(biāo)差異顯著(P<0.05),聚類分析和主成分分析顯示,雌核發(fā)育牙鲆先和野生牙鲆形態(tài)接近,與養(yǎng)殖牙鲆距離遠(yuǎn),其形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。利用判別分析法進(jìn)行分析綜合判別率為90%。研究表明:方差、聚類、主成分和判別分析等多元分析方法對(duì)三種牙鲆形態(tài)比較有效,在牙鲆其他家系等的鑒定中值得推廣。

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