李正風(fēng),朱 杰,唐 麗,董高峰,吳 濤,廖頭根,張 偉,夏玉珍,王奕權(quán),李 巖
(1.云南中煙工業(yè)有限責(zé)任公司技術(shù)中心,云南 昆明 650231;2.紅塔煙草(集團(tuán))有限責(zé)任公司,云南 玉溪 653100;3.北京微普聯(lián)合生物科技有限公司,北京 102200)
【研究意義】纖維素是地球上儲量最豐富的可再生性能源物質(zhì),全球植物每年新和成纖維素產(chǎn)物達(dá)29億t左右[1],中國每年秸稈類纖維素產(chǎn)量達(dá)7億t[2]。大量的秸稈被焚燒或丟棄造成資源浪費[3],秸稈類物質(zhì)是生態(tài)有機(jī)質(zhì)資源,腐熟還田能增加土壤有機(jī)質(zhì)含量、改善土壤質(zhì)量、減輕長期施加化肥對土壤的影響、提高農(nóng)作物產(chǎn)量和品質(zhì)[4]。云南是中國煙草的主產(chǎn)區(qū),每年煙葉收獲后產(chǎn)生大量的廢棄秸稈,這些秸稈的隨意堆放及丟棄不僅會影響環(huán)境而且容易引發(fā)火災(zāi)?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】研究顯示,不同作物的秸稈還田能提高土壤團(tuán)聚體穩(wěn)定性[5],改良植煙土壤且利于提高煙草品質(zhì)。產(chǎn)纖維素酶菌株的應(yīng)用能提高秸稈類物質(zhì)的腐熟效率[6],縮短發(fā)酵周期,加快秸稈還田效率。【本研究的切入點】從云南煙草秸稈自然腐熟物中選擇性分離產(chǎn)纖維素酶菌株,對菌株進(jìn)行初篩選定部分酶活較高的菌株進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定,通過復(fù)篩確定高效菌株,并對產(chǎn)纖維素酶條件進(jìn)行優(yōu)化?!緮M解決的關(guān)鍵問題】為促進(jìn)煙草秸稈堆肥還田提供了優(yōu)良種質(zhì)資源,所篩選的高效菌株和優(yōu)化的產(chǎn)酶條件將利于纖維素酶的純酶產(chǎn)品開發(fā)。
樣品取自云南曲靖、彌勒煙草秸稈自然堆肥樣品。
稱取堆肥樣品1 g于10 mL滅菌生理鹽水(0.85 %)中,28 ℃搖床,200 r/min震蕩10 min,分別梯度稀釋10-1~10-8,并分別取100 μl涂布于分離培養(yǎng)基(羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉5 g、K2HPO41 g、MgSO40.5 g、NaNO33 g、KCl 0.5 g、FeSO40.01 g、瓊脂15 g、蒸餾水 1000 mL)上。28℃倒置培養(yǎng)5~7 d。分別挑取單菌落至羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基反復(fù)劃線純化,直至純化。并分別保藏至20 %甘油中,-80 ℃冷凍保藏。
將純化后的菌株點接在羧甲基纖維素鈉平板上,28 ℃倒置培養(yǎng)5 d,測定菌落直徑(D),在平板上加入剛果紅染液(1 g/L)沒過菌落,常溫1 h后棄染液,加入NaCl溶液(0.06 %,w/v),沖洗3~5次,向平板中加入足量的NaCl溶液1 h,測定透明圈直徑(H),計算H/C值。
將初篩中能形成水解圈的菌株接種至牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(牛肉膏3.0 g、蛋白胨10.0 g、NaCl 5.0 g、瓊脂15~25 g、蒸餾水 1000 mL,pH 7.4~7.6)中,28 ℃、200 r/min培養(yǎng)至OD=0.8,分別取1 mL菌液,12 000 r/min離心2 min,棄上清,用天根細(xì)菌基因組提取試劑盒提取總DNA,用Nano Drop OD 2000C檢測DNA濃度和純度,-20 ℃保存?zhèn)溆?。分別以菌株基因組總DNA為模板,用細(xì)菌16S rRNA基因通用引物27F/1492R[7]擴(kuò)增16S rRNA基因序列,電泳檢測合格后送至北京奧科鼎盛生物科技有限公司測序。分別將序列通過GenBank比對并選取參考序列,用MEGA 7.0[8]構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并根據(jù)系統(tǒng)關(guān)系確定分類地位。
1.5.1 粗酶液制備 分別將待測菌株接種至15 mL發(fā)酵培養(yǎng)基(羧甲基纖維素鈉5 g、K2HPO41 g、MgSO40.5 g、NaNO33 g、KCl 0.5 g、FeSO40.01 g、蒸餾水 l 000 mL)中,28 ℃、220 r/min振蕩培養(yǎng)3~4 d,6000 r/min離心10 min,上清液即為粗酶液。
1.5.2 纖維素酶活力測定 (1)葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制:配制1.0 mg/mL的葡萄糖溶液作為標(biāo)準(zhǔn)葡萄糖母液,將母液分別稀釋為0、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7 mg/mL的葡萄糖溶液于5 mL離心管中,分別取2 mL,并分別加入1mL DNS溶液(酒石酸鉀鈉182 g、3,5-二硝基水楊酸6.3 g、NaOH 21 g、苯酚 5 g、亞硫酸鈉5 g、蒸餾水1000 mL),沸水浴煮沸10 min,冷卻,補(bǔ)加21.5 mL蒸餾水。分別在波長540 nm用分光光度計測定吸光值,并繪制葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線。
(2)菌株纖維素酶活力測定:濾紙酶活測定:將新華1號濾紙剪成1 cm×3 cm的小條,卷成小卷后置5 mL 試管內(nèi),分別加入醋酸-醋酸鈉緩沖液(pH = 4.8) 1.75和0.25 mL酶液,搖勻,使濾紙完全浸泡在液體中,將試管置于50 ℃水浴1 h,加入1 mL DNS試劑,沸水浴10 min后置冷水中冷卻。用酶標(biāo)儀測定吸光度值,波長為540 nm。內(nèi)切酶酶活測定:取含有0.5 %羧甲基纖維素鈉的醋酸緩沖液1.75 mL加入5 mL 試管中,加入酶液0.25 mL,將EP管放入50 ℃水浴0.5 h,加入1 mL DNS試劑,沸水浴10 min,冷水冷卻。用酶標(biāo)儀測定吸光度值,波長為540 nm。外切酶酶活測定:取含有0.5 %微晶纖維素的醋酸緩沖液1.75 mL加入5 mL試管中,加入酶液0.25 mL,于50 ℃水浴2 h后,加入1 mL DNS試劑,沸水浴10 min,冷水冷卻。用酶標(biāo)儀測定吸光度值,波長為540 nm。
(3)酶活力計算:酶活力定義:在50 ℃條件下,1 mL粗酶液在1 min內(nèi)水解底物生成1 μg葡萄糖所需的酶量為1個纖維素酶酶活力單位(U/mL)[9-11]。
1.6.1 培養(yǎng)基pH對產(chǎn)酶的影響 分別配制pH為4、5、6、7、8、9的羧甲基纖維素鈉液體培養(yǎng)基,分別接種高效菌株,于28 ℃、200 r/min培養(yǎng)3 d后測定纖維素酶活力,確定最佳pH。
1.6.2 碳源對產(chǎn)酶的影響 配制最佳pH條件,含0.25 %、0.5 %、0.75 %、1.0 %、1.25 %羧甲基纖維素鈉的羧甲基纖維素鈉發(fā)酵培養(yǎng)基,分別接種高效菌株,于28 ℃、200 r/min培養(yǎng)3 d后測定纖維素酶活力,確定最佳碳源濃度。
表1 產(chǎn)纖維素酶菌株初篩結(jié)果Table 1 Primarily screening results for cellulase producing strains
表2 纖維素酶活力測定結(jié)果Table 2 Results of cellulase activity
1.6.3 氮源對產(chǎn)酶的影響 分別配制最佳pH條件、最佳羧甲基纖維素鈉濃度、含0.25 %、0.5 %、1.0 %、1.5 %、2.0 %的NaNO3的羧甲基纖維素鈉發(fā)酵培養(yǎng)基,分別接種高效菌株,于28 ℃、200 r/min培養(yǎng)3 d后測定纖維素酶活力,確定最佳氮源濃度。
從分離平板上分別挑取不同形態(tài)的細(xì)菌及放線菌,根據(jù)單菌落大小、形態(tài)、顏色最終選定51株菌。經(jīng)剛果紅染色初篩,有15株細(xì)菌形態(tài)菌株、3株放線菌形態(tài)菌株產(chǎn)生透明水解圈。其中9株菌的水解圈最明顯(表1)。透明圈直徑/菌落直徑最大的是菌株L43和zy004,比值達(dá)4.0。雖然透明圈直徑/菌落直徑比值直接反映了酶濃度的高低,但其不能作為菌株酶活的唯一定量指標(biāo),所以有必要對這些菌株進(jìn)一步進(jìn)行產(chǎn)酶酶活測定。
葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線如圖1所示,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線構(gòu)建了線性回歸方程。對在羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基上有較大水解圈的菌株分別測定濾紙酶活、內(nèi)切酶酶活、外切酶酶活,結(jié)果如表2所示。其中菌株L43的濾紙酶活最高,達(dá)8.53 U/mL,其外切酶酶活最高,達(dá)20.17 U/mL。綜合初篩和酶活測定結(jié)果,菌株L43的纖維素酶活力最高。
分別擴(kuò)增并測定了9株產(chǎn)纖維素酶菌株的16S rRNA基因序列,并分別在GenBank中比對以獲取同源序列。從系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2)和相似性分析表明,zy001與StenotrophomonaspavaniiLMG 25348T相似性最高99.9 %,命名為Stenotrophomonassp. zy001;zy002與PantoeadispersaDSM 30073T相似性最高99.6 %,命名為Pantoeasp. zy002;zy003與EnterobacterludwigiiEN-119T相似性最高為99.9 %,命名為Enterobactersp. zy003,zy004與NovosphingobiumgossypiiJM-1396T相似性最高為99.6 %,命名為Novosphingobiumsp. zy004,zy005與StreptomycesalbolongusNBRC 13465T相似性最高為99.9 %,命名為Streptomycessp. zy005;zy006與StreptomycesdiastaticusNBRC 15402T相似性最高為99.9 %,命名為Streptomycessp. zy006;zy007與PseudomonastaiwanensisBCRC 17751T相似性最高為98.4 %,命名為Pseudomonassp. zy007;zy008與PseudomonastaiwanensisBCRC 17751T相似性最高為99.9 %,命名為Pseudomonassp. zy008;L43與LuteibacterrhizovicinusLJ96T相似性最高為97.5 %,命名為Luteibactersp. L43。9株纖維素酶活力較高的菌株屬于7個屬,其中L43與參考菌株相似性最低,是該屬的一個潛在新種。
圖1 DNS比色法測定葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.1 Standard curve of glucose based on DNS colorimetric method
圖2 根據(jù)16S rRNA構(gòu)建的產(chǎn)纖維素酶菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Neighbor-joining phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences of cellulase producing bacteria
圖3 pH對纖維素酶的影響Fig.3 The effect of pH on cellulase
這9株產(chǎn)纖維素酶較高的菌中,L43酶活最高,所以選擇該菌進(jìn)行發(fā)酵產(chǎn)酶條件優(yōu)化。如圖3所示,pH對該菌的纖維素酶活力有一定影響,在pH 6的發(fā)酵培養(yǎng)基中纖維素酶酶活最高。
如圖4所示,在pH 6的發(fā)酵培養(yǎng)基中當(dāng)羧甲基纖維素鈉為1.25 %時,纖維素酶活力最高。
配制pH 6、羧甲基纖維素鈉為1.25 %的不同氮源(NaNO3)濃度的發(fā)酵培養(yǎng)基,酶活測定表明在羧甲基纖維素鈉為0.5 %時纖維素酶活力最高(圖5)。在發(fā)酵培養(yǎng)基pH 6、羧甲基纖維素鈉濃度為1.25 %、NaNO3濃度為0.5 %時纖維素酶活力最高,濾紙酶活達(dá)(16.9±1.61)U/mL,外切酶酶活達(dá)(39.62±1.65)U/mL。
圖4 碳源濃度對L43纖維素酶的影響Fig.4 The effect of carbon source concentration on cellulase
圖5 氮源濃度對L43纖維素酶的影響Fig.5 The effect of nitrogen source concentration on cellulase
本實驗用羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基從自然發(fā)酵的煙草秸稈堆肥腐熟物中選擇性分離出能產(chǎn)纖維素酶的51株菌,從形態(tài)上分為細(xì)菌及放線菌。經(jīng)過剛果紅染色初篩,篩選到9株透明圈較大、產(chǎn)纖維素酶活力較高的菌株。經(jīng)16S rRNA序列分析將這些菌為7個屬。其中纖維素酶活力最高的菌株L43與參考菌株L.rhizovicinusLJ96T相似性較低,為Luteibacter的潛在新種。通過單因素試驗明確發(fā)酵培養(yǎng)基的pH、碳源濃度、氮源濃度對纖維素酶活力的影響,并篩選出最優(yōu)的發(fā)酵培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉12.5 g、K2HPO41 g、MgSO40.5 g、NaNO35 g、KCl 0.5 g、FeSO40.01 g、蒸餾水 l 000 mL、pH 6。其最高酶活為濾紙酶活:16.9 U/mL,外切酶酶活:39.62 U/mL,培養(yǎng)基優(yōu)化后濾紙酶活提高了,所分離的產(chǎn)纖維素酶活力較高的細(xì)菌及放線菌的外切酶酶活較高,但所有菌株的內(nèi)切酶酶活較低。試驗結(jié)果為高效菌株L43的纖維素酶利用提供了理論基礎(chǔ)。
產(chǎn)纖維素酶菌株在自然界中分布廣泛,作為纖維素生物質(zhì)的分解者,在自然界中植物秸稈降解物質(zhì)循環(huán)中發(fā)揮重要的作用,從煙草秸稈中分離出多種產(chǎn)纖維素酶菌株,為煙草秸稈還田提供了優(yōu)良的菌株資源。Stenotrophomonas[12]、Pseudomonas[12-13]、Pantoea[14-15]、Enterobacter[13,16]、Novosphingobium[17]、Streptomyces[13]等屬的菌株有纖維素降解活性,也有相關(guān)報道。但Luteibacter菌株的報道并不多,目前該屬有效發(fā)表的種有3個,其中Luteibacterrhizovicinus分離自大麥根際[18],從三尖杉根際分離的Luteibactersp.對三尖杉寧堿具有轉(zhuǎn)化作用[19],從西沙野生諾尼果成熟果實中也分離到Luteibacter屬的菌株[20]。因此,Luteibacter屬的菌在自然界與植物會有一定的互作關(guān)系。有關(guān)Luteibacter菌具產(chǎn)纖維素酶活性是首次報道,提供了新的產(chǎn)纖維素酶菌株資源。不同微生物有著不同降解效率[21],多種菌互作能更有效降解纖維素[22],因此要重視和加強(qiáng)對多種產(chǎn)纖維素酶菌提高煙草秸稈腐熟的研究。若把混菌發(fā)酵技術(shù)應(yīng)用到煙草秸稈堆肥中,將會有效提高煙草秸稈的腐熟效率,對煙草秸稈及其他農(nóng)作物秸稈類資源的開發(fā)應(yīng)用及環(huán)境保護(hù)具有重要的意義。
本研究為煙草秸稈腐熟提供了優(yōu)良產(chǎn)纖維素酶菌株資源,為Luteibactersp. L43的開發(fā)利用奠定了基礎(chǔ)。