田潤 陶晴 卞曉軍 朱福琳 顏娟
摘?要?基于醛基化磁珠顆粒 (Aldehyde magnetic beads,AMBs)和DNA 雜交鏈式反應(yīng)(Hybridization chain reaction,HCR)的信號放大策略,設(shè)計了檢測卡那霉素(Kanamycin,Kana)的比色適配體生物傳感器(Aptasensor)。制備了Mbs@DNA復(fù)合物,其上的卡那霉素適配體鏈與卡那霉素發(fā)生特異識別后,釋放出互補鏈,互補鏈含有設(shè)計好的引發(fā)序列,可作為信號探針,引發(fā)HCR反應(yīng),生成的雙鏈DNA(Double-stranded DNA,dsDNA)表現(xiàn)出強負電性,與溶液中帶負電金納米顆粒(Goldnanoparticles,AuNPs)相互排斥,在高鹽條件下,AuNPs的穩(wěn)定性被破壞而發(fā)生聚集,導致溶液的顏色從紅色變?yōu)樽仙?,吸收光譜也發(fā)生變化。本方法檢測卡那霉素的線性范圍為1.6~32.0 nmol/L,檢出限為0.9 nmol/L(S/N = 3);實際樣品牛奶和蜂蜜樣品中卡那霉素的加標回收率在96.0%~105.0%之間,相對標準偏差在3.3%~5.0%之間,說明本方法實用性良好。本方法對卡那霉素的檢測具有較高的靈敏度和特異性,操作簡單便捷,適用于現(xiàn)場檢測等。同時,根據(jù)不同待測物具有與其特異性結(jié)合的適配體,本方法為其它目標物的檢測提供了參考,在食品安全檢測與監(jiān)管中具有良好的應(yīng)用前景。
關(guān)鍵詞?卡那霉素;雜交鏈式反應(yīng);核酸適配體;金納米顆粒;食品安全
1?引 言
卡那霉素(Kanamycin,Kana)是一種氨基糖苷類抗生素,因其價格低廉、抗菌活性好,常作為飼料添加劑或治療劑,應(yīng)用于農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)及水產(chǎn)業(yè)中[1,2]。然而,卡那霉素的濫用會造成其在動物源性食品中殘留,長期攝入含有卡那霉素殘留的食品,會引起毒性、腎毒性及抗生素耐藥性等副作用[3]。歐盟和日本等國際組織和國家明確規(guī)定了動物源性制品中卡那霉素的最大殘留量≤200 μg/kg[4,5],牛奶中的最大殘留量為200 μg/kg[6]。我國國家標準《食品安全國家標準 食品中農(nóng)藥最大殘留限量GB 2763-2016》[7]對其在食品中的殘留量也做了明確規(guī)定。
目前,對卡那霉素的檢測技術(shù)有酶聯(lián)免疫法[8]、高效液相色譜法[9]、毛細管電泳法[10]?等,這些方法雖然準確度高,但需要昂貴的大型設(shè)備和專業(yè)的操作人員,以及復(fù)雜的前處理過程,耗時長。因此,需要建立快速、靈敏、低成本的檢測食品中卡那霉素殘留的方法。
適配體是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進化技術(shù)(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)篩選出來的單鏈寡核苷酸片段,可與各種靶標(如小分子,抗生素和細胞等)發(fā)生特異性識別并結(jié)合,形成穩(wěn)定復(fù)合物[11]。與抗原抗體相比,適配體的生物穩(wěn)定性更好,而且制備簡便、特異性好、親和性高,基于適配體的生物傳感器已被廣泛應(yīng)用[12]。但是,僅依靠適配體捕獲靶標后引起的構(gòu)象變化產(chǎn)生的信號進行檢測的策略[7],在生物檢測分析中的應(yīng)用較為有限。多種核酸信號放大技術(shù),如聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)[13]、滾環(huán)擴增技術(shù)(Rolling circle amplification,RCA)[14]、環(huán)介導等溫核酸擴增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[15]?以及雜交鏈式反應(yīng)(Hybridization chain reaction,HCR)[16]?的使用,大大提高了適配體生物傳感器的檢測靈敏度。目前,雖有很多文獻報道了采用適配體對卡那霉素進行檢測的方法[17~19],然而,這些信號放大技術(shù)中,PCR技術(shù)需要嚴格地控制溫度,同時需要設(shè)計復(fù)雜的引物;RCA則需要設(shè)計及制備環(huán)狀模板;LAMP雖然不需要模板,但需要多條引物;并且這些擴增技術(shù)都需要有聚合酶參與反應(yīng),容易出現(xiàn)假陽性或者假陰性信號,檢測成本也較高相比之下,雜交鏈式反應(yīng)(Hybridization chain reaction,HCR)是一種自組裝信號放大的技術(shù),在常溫下進行,且不需要酶參與,操作簡便,只需通過堿基互補配對進行的交替雜交的信號放大技術(shù)。無酶的參與能夠避免由于酶導致的假信號出現(xiàn),從而提高檢測的準確性。同時,HCR對外部條件要求簡單,不需要額外輔助變溫調(diào)控,在室溫下就可以進行反應(yīng),因此,HCR作為一種簡單且有效的新型信號放大策略備受關(guān)注[20~24]。HCR通過適配體之間的競爭雜交,自組裝成核酸納米結(jié)構(gòu),實現(xiàn)信號放大[16]。HCR的構(gòu)成原件包括引發(fā)探針和兩條可以互補雜交并帶有粘性末端的發(fā)夾型DNA(H1和H2)。當沒有引發(fā)序列時,H1和H2可以穩(wěn)定存在,但當引發(fā)探針出現(xiàn)時,H1的二級結(jié)構(gòu)被引發(fā)探針打開,H1釋放出的莖端將會打開H2的二級結(jié)構(gòu),H2釋放出的莖端與引發(fā)探針的序列相同,又會打開H1的二級結(jié)構(gòu),H1和H2如此循環(huán)往復(fù)地被相互打開,最后形成一條含有缺口的雜交長雙鏈共聚物[25]。HCR與各類檢測技術(shù)都有較好的兼容性,可提高核酸、蛋白、小分子以及重金屬等生物分子檢測的靈敏度。納米金也具有良好的生物相容性,易于進行表面修飾,且具備獨特的光學特性,因此,比色法是最早采用金納米粒子進行分析檢測的一種方法,利用金納米粒子的聚集、溶液顏色的改變,反映溶液相中目標檢測物的量[26]。本研究利用HCR反應(yīng)前后,溶液中不同的DNA鏈與納米金之間的相互作用導致的納米金的變色程度,實現(xiàn)體系中卡那霉素的快速靈敏檢測。
2?實驗部分
2.1?儀器與試劑
UV-2540紫外可見分光光度計(日本島津公司);Synergy2 SLFPTAD 多功能酶標儀(美國伯騰儀器有限公司);Mixer 4K渦旋混合器(生工生物工程(上海)股份有限公司);HCM100-Pro恒溫振蕩金屬浴、D1008掌上離心機(大龍興創(chuàng)實驗儀器(北京)有限公司)。
四氯金酸水合物(HAuCl4·H2O,百靈威科技公司);檸檬酸三鈉(Na3C6H5O7·2H2O,國藥集團化學試劑有限公司);磷酸鹽緩沖液(20 × PBS,pH 7.4~7.6);Tris-HCL緩沖液(含50 mmol/L NaCl,5 mmol/L MgCl2,5 mmol/L KCl,pH 7.0);瓊脂糖M;8600-10氨基磁珠(美國 Polysciences公司);電泳緩沖液(50×TAE,pH 8.4);4S Red Plus 核酸染色劑(10000× 水溶液);牛血清白蛋白(BSA,美國Amresco公司);卡那霉素(Kanamycin)、氯霉素(Chloramphenicol)、四環(huán)素(Tetracycline)、氧氟沙星(Ofloxacin)、環(huán)丙沙星(Ciprofloxacin)均購于生工生物工程(上海)股份有限公司;實驗用水為超純水。DNA 序列(表1)由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,其中,H1、H2使用前需先分別加熱到 95℃,并維持5 min,隨即冰上孵育5 min,再于室溫放置2 h后,備用。
2.2?實驗方法
2.2.1?AuNPs的合成?參照文獻[27]的方法,在圓底燒瓶中加入99 mL水、 1 mL 1% 氯金酸,加熱回流直至沸騰,加入 3.5 mL 1%現(xiàn)配的檸檬酸三鈉溶液,反應(yīng) 20 min 后,停止加熱,室溫下攪拌過夜,產(chǎn)物于4℃保存,備用。
2.2.2?Mbs@ds-DNA的制備?按照產(chǎn)品說明對磁珠(50 mg/mL,1.5 μmol/L)進行活化,使磁珠上的氨基轉(zhuǎn)化為醛基。取80 μL 醛基化磁珠,磁分離,棄上清液。加入160 μL 1×PBS 緩沖液和16 μL 100 μmol/L 氨基修飾的Kana-Aptamer,37℃孵育過夜后,磁分離,加入200 μL 1×PBS洗滌1次,用2% BSA室溫封閉1 h,磁分離后,沉淀重懸于400 μL 1×PBS 緩沖液中,備用。取8 μL 100 μmol/L Kana-Aptamer的部分互補序列Cs-I加入到92 μL Mbs@Kana-Aptamer中,37℃振蕩孵育2 h,磁分離,用100 μL 1×PBS洗滌1次,重懸在100 μL Tris-HCl溶液中,4℃保存,備用。
2.2.3?卡那霉素的測定?20 μL MBs@ds-DNA和30 μL不同濃度的卡那霉素,充分混勻后,37℃振蕩孵育40 min。反應(yīng)結(jié)束后,磁分離,上清液中加入 H1、H2(體系終濃度為1 μmol/L)進行HCR,37℃孵育2 h。采用AuNPs比色檢測,取30 μL HCR產(chǎn)物,加入225 μL AuNPs,在室溫下孵育30 min后,加入30 μL 0.3 mol/L NaCl溶液,靜置10 min,測定體系在520 nm波長處的吸光度。
3?結(jié)果與討論
3.1?實驗原理
提出了基于雜交鏈式反應(yīng)信號放大檢測卡那霉素的策略,引入磁性生物探針Mbs@ds-DNA,通過磁分離消除復(fù)雜樣本體系中基質(zhì)干擾。如圖1所示,連接在磁珠上的適配體序列(Kana-Aptamer)作為捕獲探針,與信號探針(Cs-I)部分互補配對,形成Mbs@ds-DNA復(fù)合物??敲顾卮嬖跁r,Mbs@ds-DNA復(fù)合物上的適配體鏈和卡那霉素發(fā)生特異性結(jié)合,釋放出信號探針。磁分離后,上清液中游離的信號探針上的引發(fā)鏈部分引發(fā)HCR,生成的ds-DNA結(jié)構(gòu)表現(xiàn)出強的負電性,與溶液中帶負電AuNPs相互排斥。隨著鹽濃度增加,AuNPs的穩(wěn)定性持續(xù)降低,并發(fā)生聚集,導致溶液的顏色從粉色變?yōu)樽仙?。當體系中不存在卡那霉素時,信號探針不會游離到上清液中,單獨的DNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)(H1,H2)不會發(fā)生雜交鏈式反應(yīng),即穩(wěn)定存在于溶液中,其單鏈粘性末端通過靜電作用吸附在AuNPs表面上,保護AuNPs免受高鹽濃度引起的聚集,溶液仍保持紅色。
3.2?MBs@ds-DNA的紫外可見吸收光譜
采用吸收光譜對MBs@ds-DNA的組裝進行表征。如圖2A所示,測得Kana-Aptamer在260 nm處的紫外吸收峰值為0.933,收集磁珠和Kana-Aptamer連接后的上清液,測得其在260 nm處的紫外吸收峰值為0.707,紫外吸收值降低,說明NH2-Kana-Aptamer成功組裝在醛基化磁珠表面,體系中游離Kana-Aptamer的數(shù)量減少。同理,將MBs@Kana-Aptamer與Cs-I進行孵育后,Cs-I在260 nm處的紫外吸收峰值也降低,說明MBs@Kana-Aptamer與Cs-I雜交,即MBs@ds-DNA成功制備(圖2B)。
3.3?瓊脂糖凝膠電泳表征
如圖3A所示,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果表明,發(fā)夾探針H1(5 μmol/L)、H2(5 μmol/L)不發(fā)生HCR(泳道1);Cs-I(2 μmol/L)可與H1雜交,形成很短的雙鏈DNA,進行電泳測試時,出現(xiàn)小段拖尾,但是,大部分發(fā)夾H1未打開(泳道2);僅存在H2和Cs-I時,不發(fā)生HCR,故電泳中沒有拖尾(泳道3);只有當H1、H2、Cs-I同時存在時,才會發(fā)生HCR(泳道4)。分別將無引發(fā)鏈存在時HCR體系與加入引發(fā)鏈進行HCR體系的液體滴在干凈平整的云母片上,氮氣吹干后,用原子力顯微鏡觀察(圖3B和3C)。在沒有引發(fā)鏈Cs-I時,只有發(fā)夾結(jié)構(gòu)H1和H2的微小斑點(圖3B),加入互補鏈條CS-I后,有清晰可見的伸展的ds-DNA長鏈(圖3C),說明發(fā)生了HCR。
3.4?比色生物感器的可行性驗證
為了驗證本研究建立的比色檢測方法,將制備的MBs@ds-DNA復(fù)合物分別與0和15 μmol/L的卡那霉素標準品溶液孵育后,磁分離,將上清液進行HCR后,再進行納米金比色檢測。當存在卡那霉素時,HCR產(chǎn)物的ds-DNA結(jié)構(gòu)表現(xiàn)出強的負電性,與溶液中帶負電AuNPs相互排斥。隨著鹽濃度增加,AuNPs的穩(wěn)定性持續(xù)降低,并且發(fā)生聚集,導致溶液的顏色從紅色變?yōu)樽仙2淮嬖诳敲顾貢r,單獨的DNA發(fā)夾H1、H2的單鏈粘性末端可保護AuNPs免于高鹽條件下的聚集,溶液仍保持紅色(圖4A)。透射電鏡圖像(圖4B和4C)進一步驗證了本實驗的可行性,當卡那霉素濃度由0增加到15 μmol/L后,納米金粒子由良好的分散狀態(tài)(圖4B)變?yōu)榫奂癄顟B(tài)(圖4C)。
3.5?基于雜交鏈式反應(yīng)的適配體傳感器對卡那霉素的檢測性能
采用構(gòu)建的適配體傳感器,檢測不同濃度的卡那霉素標準品。如圖5A中插圖所示,隨著卡那霉素濃度增加(0~800 nmol/L),溶液顏色由紅色逐漸變?yōu)樽仙▓D5A插圖),同時吸收光譜(圖5A)也隨之發(fā)生紅移。體系在520 nm處的吸光度比值(A0-A)/A(A0和A分別為空白和樣品在520 nm的吸光度)與卡那霉素濃度在1.6~32.0 nmol/L之間呈線性關(guān)系(圖5B),線性方程為y=0.0047x+0.1237(R2=0.9708),檢出限為0.9 nmol/L(S/N=3)。如表2所示,與其它檢測方法相比,本方法具有操作簡單、易于觀察檢測結(jié)果等優(yōu)勢。
采用本方法檢測卡那霉素(10 nmol/L)與4種對照物(氯霉素、四環(huán)素、氧氟沙星、環(huán)丙沙星,1 μmol/L),考察本方法對卡那霉素檢測的特異性。如圖5C所示,當檢測4種對照物時,納米金溶液顏色無明顯變化(酒紅色),吸光度比值變化幅度較小;當檢測目標卡那霉素時,溶液顏色由紅色迅速變?yōu)樽仙?,吸光度比值變化尤為明顯。因此,本方法對卡那霉素檢測的特異性良好。
3.6?實際樣品分析
采用本方法檢測牛奶及蜂蜜樣品。將純牛奶在室溫下以10000 r/min離心10 min,除去上層脂肪,然后加入一定濃度的卡那霉素進行檢測;取1 mL蜂蜜溶于9 mL去離子水中,加入一定濃度的卡那霉素進行檢測,結(jié)果見表3。牛奶樣品的加標回收率在97.3%~99.4%之間,相對標準偏差(RSD)在3.3%~5.0%之間;蜂蜜的加標回收率在96.0%~105.0%之間,RSD在3.5%~4.8%之間,說明本方法靈敏度較高,特異性較好,可用于牛奶和蜂蜜等實際樣品中卡那霉素殘留的檢測,實用性良好。
4?結(jié) 論
基于金納米粒子體系吸光度的變化和HCR構(gòu)建了適配體傳感器,用于卡那霉素的比色檢測。此策略無需標記,無需酶的參與,不涉及復(fù)雜的引物設(shè)計及變溫調(diào)控,即可實現(xiàn)卡那霉素的特異檢測,檢出限為0.9 nmol/L,并可用于實際樣品如牛奶和蜂蜜中的卡那霉素檢測。本方法操作簡單便捷,適于現(xiàn)場檢測,具有良好的應(yīng)用前景,對其它抗生素或目標物檢測方法的建立具有參考價值。
References
1?Ramezani M,Danesh N M,Lavaee P,Abnous K,Taghdisi S M. Sens. Actuators B,2016,222: 1-7
2?Sharma A,Istamboulie G,Hayat A,Catanante G,Bhand S,Marty J. L. Sens. Actuators B,?2017,245: 507-515
3?Guo W,Sun N,Qin X,Pei M,Wang L. Biosens. Bioelectron.,?2015,74: 691-697
4?Kaufmann A,Butcher P,Maden K. Anal. Chim. Acta,2012,711: 46-53
5?Bogialli S,Bruno M,Curini R,Di Corcia A,Lagana A,Mari B. J. Agric. Food Chem.,2005,53(17): 6586-6592
6?Jiang Y,Sun D W,Pu H,Wei Q. Talanta,2019,197: 151-158
7?GB 2763-2016. Maximum Residue Limits for Pesticides in Food. National Food Safety Standard
食品安全國家標準. 食品中農(nóng)藥最大殘留限量GB 2763-2016
8?Galvidis I A,Burkin M A. ?Russ. J. Bioorg. Chem.,2010,36(6): 722-729
9?Chen C,Zhai W T,Lu D D,Zhang H B,Zheng W G. ?Mater. Res. Bull.,2011,46(4): 583-587
10?Long Y H,Hernandez A,Kaale E,Van Schepdael A,Roets E,Borrull F,Calull M,Hoogmartens J. J. Chromatogr. B,2003,784(2): 255-264
11?Tuerk C,Gold L. Science,1990,249(4968): 505-510
12?Kim Y S,Raston N H,Gu M B. Biosens. Bioelectron.,2016,76: 2-19
13?Kiss M M,Ortoleva-Donnelly L,Beer N R,Warner J,Bailey C G,Colston B W,Rothberg J M,Link D R,Leamon J H. Anal. Chem.,2008,80(23): 8975-8981
14?Mohsen M G,Kool E T. Acc. Chem. Res.,2016,49(11): 2540-2550
15?Huang X,Lin X,Urmann K,Li L,Xie X,Jiang S,Hoffmann M R. Environ. Sci. Technol.,2018,52(11): 6399-6407
16?Dirks R M,Pierce N A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA,2004,101(43): 15275-15278
17?Lin X,Su J,Lin H,Sun X,Liu B,Kankala R K,Zhou S F. Talanta,2019,202: 452-459
18?Zeng R,Zhang L,Luo Z,Tang D. Anal. Chem.,2019,91(12): 7835-7841
19?Chen X,Hao S,Zong B,Liu C,Mao S. Biosens. Bioelectron.,2019,145: 111711
20?Zhao Y,Chen F,Li Q,Wang L,F(xiàn)an C. ?Chem. Rev.,2015,115(22): 12491-12545
21?Zhou J,Ralston J,Sedev R,Beattie D A. J. Colloid. Interface Sci.,?2009,331(2): 251-262
22?Zhen S J,Xiao X,Li C H,Huang C Z. Anal. Chem.,2017,89(17): 8766-8771
23?Zhu D,Huang J,Lu B,Zhu Y,Wei Y,Zhang Q,Guo X,Yuwen L,Su S,Chao J,Wang L. ACS Appl. Mater. Interfaces,2019,11(23): 20725-20733
24?Zhu D,Lu B,Zhu Y,Ma Z,Wei Y,Su S,Wang L,Song S,Zhu Y,Wang L,Chao J. ACS Appl. Mater. Interfaces,2019,11(12): 11220-11226
25?Chen X,Wang J,Shen H Y,Su X,Cao Y,Li T,Gan N. ACS Sens.,2019,4(8): 2131-2139
26?Ikbal J,Lim G S,Gao Z. TrAC-Trend. Anal. Chem.,2015,64: 86-99
27?Frens G. Nat. Phys. Sci.,?1973,241(105): 20-22
28?Xu W,Wang Y,Liu S,Yu J,Wang H,Huang J. New J. Chem.,2014,38(10): 4931-4937
29?Bai X,Hou H,Zhang B,Tang J. Biosens. Bioelectron.,2014,56: 112-116
30?Han X,Yu Z,Li F,Shi W,F(xiàn)u C,Yan H,Zhang G. Bioelectrochemistry,?2019,129: 270-277
31?Ma X,Qiao S,Sun H,Su R,Sun C,Zhang M. Front. Chem.,2019,7: 29