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      長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在肝癌組織中的表達(dá)及臨床意義

      2020-09-11 13:43:48
      腫瘤防治研究 2020年8期
      關(guān)鍵詞:長鏈試劑盒編碼

      0 引言

      肝癌為臨床高發(fā)惡性腫瘤,其發(fā)病率及死亡率逐年升高,由于患者早期癥狀不明顯,多數(shù)患者就診時處于中晚期,往往錯過根治性手術(shù)最佳時機(jī)[1-2]。盡管肝癌的臨床診療手段日趨成熟,但患者術(shù)后五年生存率仍較低[3]。因此,尋找肝癌生物學(xué)標(biāo)志物對患者的早期診療及預(yù)后評估具有重要意義。長鏈非編碼RNA是近年來發(fā)現(xiàn)的一類可參與腫瘤細(xì)胞增殖、遷移和凋亡等多個層面調(diào)控的不編碼蛋白質(zhì)的RNA[4]。本研究組前期通過芯片技術(shù)發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)量隨肝癌的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程變化明顯,因此,我們采用實(shí)時定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)進(jìn)一步驗(yàn)證其在肝癌組織中的表達(dá),并分析了其與患者臨床病理特征及預(yù)后的相關(guān)性。

      1 資料與方法

      1.1 一般資料

      選取2016年10月—2018年10月中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬海口醫(yī)院收治的106例原發(fā)性肝癌患者,均經(jīng)手術(shù)病理證實(shí)為肝細(xì)胞癌,且術(shù)前均未接受化學(xué)藥物及放射治療。其中,男57例,女49例;年齡38~73歲,平均年齡57.42±3.69歲;按AJCC第八版分期標(biāo)準(zhǔn)分為:Ⅰ期23例,Ⅱ期55例,Ⅲ期17例,Ⅳ期11例;淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移11例;腫瘤直徑1.2~9.7 cm;乙型肝炎73例(判定標(biāo)準(zhǔn):患者血液標(biāo)本中可檢測到乙肝病毒DNA)。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理學(xué)委員會審批通過,入組對象均知情同意。

      1.2 方法

      1.2.1 組織樣本 術(shù)中切取肝癌及癌旁正常組織(距腫瘤組織邊緣≥2 cm,經(jīng)病理證實(shí)無癌細(xì)胞)作為檢測樣本,置于-80℃的冰箱中保存待檢。

      1.2.2 試劑與儀器 TRIzol 試劑購于美國Invitrogen公司,反轉(zhuǎn)錄試劑盒及qRT-PCR試劑盒均購于美國ABI公司,7500型qRT-PCR儀及Veriti 96孔熱循環(huán)儀購于美國ABI公司,分光光度計購于美國Bio-Rad公司。

      1.2.3 總RNA提取 取4 mm3樣本組織超聲勻漿,按照TRIzol試劑盒說明書提取樣本中總RNA,經(jīng)DEPC水溶解,應(yīng)用分光光度計測定RNA的濃度和純度。另取1 μl RNA經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測其完整性,將電泳條帶清晰者用于qRT-PCR檢測。

      1.2.4 反轉(zhuǎn)錄反應(yīng) 按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書操作,采用熱循環(huán)儀將長鏈非編碼RNA HOXA11-AS反轉(zhuǎn)錄為cDNA,反應(yīng)體系為20 μl:RNA樣品2 μl、引物1 μl、5×RT buffer 4 μl、dNTP Mixture(10 mmol/L)1 μl、U6 Reverse primer 1 μl、Reverse Transcriptase 1 μl、RNase Inhibitor 0.5 μl、RNase Free H2O 9.5 μl。反應(yīng)條件:65℃ 5 min,37℃ 2 min,5℃ 5 min,37℃ 10 min,65℃ 10 min。

      1.2.5 實(shí)時定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)q RTPCR 應(yīng)用Primer premier 6.0軟件設(shè)計引物,并委托上海生工生物工程有限公司進(jìn)行合成。長鏈非編碼RNA HOXA11-AS:上游引物序列為:5’-GCCACAUGCACCCGCCUCAGUGGUUCACA AUGGCAUCCGCUGAA-3’,下游引物序列為:5’-CAUCAGACACAGUCCACUAUGCG-3’;內(nèi)參U6引物序列為:5’-CTCGTGCAGCACAGCTC-3’(正義),5’-AGCTACAACGTATCTGTCTG-3’(反義);長鏈非編碼RNA HOXA11-AS反轉(zhuǎn)錄引物序列為:5’-UCGUGAUCUGUCACUUCAAG CGAGAGAGCACUUAUGGCCCGCAUGCAGUG CAA-3’;內(nèi)參U6反轉(zhuǎn)錄引物序列為:5’-AATCTG GTATCCGTGCCTCTAGT-3’。按照qRT-PCR試劑盒說明書操作,采用7500型qRT-PCR儀進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR,反應(yīng)體系為25 μl:已稀釋的cDNA 2 μl、引物2 μl、SYBR 12.5 μl、ddH2O 8.5 μl。反應(yīng)條件:95℃ 10 min,95℃ 15 s,60℃ 30 s,72℃ 10 s,共40個循環(huán)。采用2-ΔΔCt方法計算長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的相對表達(dá)量,以U6為內(nèi)參,?Ct=Ct長鏈非編碼RNAHOXA11-AS-CtU6。

      1.3 術(shù)后隨訪

      隨訪截至2019 年10 月,平均隨訪時間為(25.42±2.61)月,無失訪病例。隨訪方式主要為門診隨訪和電話隨訪,術(shù)后第一年每3月隨訪一次,第二年開始每半年隨訪一次,隨訪期內(nèi)出現(xiàn)復(fù)發(fā)和(或)轉(zhuǎn)移為病情惡化,患者死亡為隨訪終止事件。

      1.4 統(tǒng)計學(xué)方法

      2 結(jié)果

      2.1 長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在肝癌及癌旁正常組織中的表達(dá)

      檢測結(jié)果顯示,長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在肝癌組織中的表達(dá)明顯高于癌旁正常組織(2.97±0.81vs.0.83±0.22,t=26.249,P<0.001),見圖1。

      圖1 長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在組織樣本中的相對表達(dá)量Figure 1 Relative expression of lncRNA HOXA11-AS in tissue samples

      2.2 肝癌組織中長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)與臨床病理特征的關(guān)系

      長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在不同AJCC分期及是否發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的肝癌組織中的表達(dá)量比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001),見表1。

      表1 長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)與肝癌患者臨床病理特征的關(guān)系 ()Table 1 Relation between lncRNA HOXA11-AS expression and clinicopathological characteristics of liver cancer patients ()

      表1 長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)與肝癌患者臨床病理特征的關(guān)系 ()Table 1 Relation between lncRNA HOXA11-AS expression and clinicopathological characteristics of liver cancer patients ()

      2.3 生存分析

      隨訪期內(nèi),106例原發(fā)性肝癌患者中51例患者病情發(fā)生惡化,其中,長鏈非編碼RNA HOXA11-AS高表達(dá)(≥2.97)36例,低表達(dá)(<2.97)15例。Kaplan-Meier分析結(jié)果提示,長鏈非編碼RNA HOXA11-AS高表達(dá)組1年、2年、3年生存率均明顯低于低表達(dá)組(1年:39.72%vs.62.71%,χ2=11.715,P<0.001; 2年:30.56%vs.53.33%,χ2=6.029,P<0.001; 3年:22.22%vs.53.33%,χ2=4.760,P=0.029),見圖2。為進(jìn)一步探究長鏈非編碼RNA HOXA11-AS是否為預(yù)測原發(fā)性肝癌患者預(yù)后的獨(dú)立危險因素,我們進(jìn)行了單因素和多因素Cox回歸分析,結(jié)果提示,長鏈非編碼RNA HOXA11-AS高表達(dá)、AJCC分期增高是影響原發(fā)性肝癌患者預(yù)后的獨(dú)立危險因素(95%CI:1.315~4.083/0.876~3.845,P=0.017/0.022)。

      圖2 長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)與肝癌患者生存期的關(guān)系Figure 2 Relation between lncRNA HOXA11-AS expression and survival of liver cancer patients

      3 討論

      肝癌為常見的惡性腫瘤,臨床死亡率較高,由于早期癥狀較為隱匿,臨床檢出率較低[5]。因此,尋找肝癌早期診斷標(biāo)志物成為臨床關(guān)注的焦點(diǎn)。長鏈非編碼RNA為不編碼蛋白質(zhì)的RNA,在發(fā)現(xiàn)初期并未獲得足夠重視,隨著臨床研究的深入,有研究發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA可在表觀遺傳學(xué)、基因組轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等層面上調(diào)控基因的表達(dá)[6]。最近有研究顯示,長鏈非編碼RNA在腫瘤細(xì)胞增殖、遷移、凋亡等過程中發(fā)揮調(diào)控作用[7-8]。盡管目前在肝癌組織中發(fā)現(xiàn)了多種長鏈非編碼RNA,但臨床對于長鏈非編碼RNA與肝癌的關(guān)系尚不明確。本研究組前期通過芯片技術(shù)發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)量隨肝癌的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程變化明顯。因此,我們猜想長鏈非編碼RNA HOXA11-AS有可能成為臨床肝癌診療的新靶點(diǎn)。

      本研究發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在肝癌組織中高表達(dá),且在肝癌組織中的表達(dá)明顯高于癌旁正常組織。通過分析長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)與肝癌患者臨床病理特征,發(fā)現(xiàn)其在不同AJCC分期及是否發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的肝癌組織中的表達(dá)量間差異有統(tǒng)計學(xué)意義,結(jié)果提示,長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的表達(dá)與肝癌的發(fā)生及轉(zhuǎn)移有關(guān),其可能在肝癌中發(fā)揮促癌作用。張莉等[9]對24例頭頸部鱗狀細(xì)胞癌患者進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在頭頸部鱗狀細(xì)胞癌組織中表達(dá)上調(diào),可促進(jìn)癌細(xì)胞的遷移,可能成為頭頸部鱗狀細(xì)胞癌治療的新靶點(diǎn)。張鴻程等[10]對13例骨肉瘤患者研究發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在骨肉瘤細(xì)胞表達(dá)下調(diào),且長鏈非編碼RNA HOXA11-AS的過表達(dá)可抑制骨肉瘤的發(fā)生發(fā)展,可能成為骨肉瘤治療潛在的分子靶標(biāo)。由此可見,長鏈非編碼RNA HOXA11-AS在惡性腫瘤組織中表達(dá)異常,但其表達(dá)量在不同腫瘤中存在差異,推測這可能與腫瘤的異質(zhì)性有關(guān)[11]。

      本研究進(jìn)一步分析了長鏈非編碼RNA HOXA11-AS與肝癌患者預(yù)后的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA HOXA11-AS高表達(dá)組3年生存率明顯低于低表達(dá)組,結(jié)果提示,其高表達(dá)可能與肝癌患者預(yù)后不良有關(guān)。進(jìn)一步采用單因素和多因素Cox分析發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA HOXA11-AS高表達(dá)、AJCC分期增高是影響原發(fā)性肝癌患者預(yù)后的獨(dú)立危險因素,提示長鏈非編碼RNA HOXA11-AS可作為肝癌患者預(yù)后的評價指標(biāo)。

      綜上,肝癌組織中長鏈非編碼RNA HOXA11-AS表達(dá)上調(diào),其可能參與肝癌的發(fā)生發(fā)展,可成為肝癌患者預(yù)后評估的新指標(biāo)。

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