顧 佳,李 浩,安瑞朋,劉 剛,王冬梅
(華北作物改良與調(diào)控國家重點實驗室/河北省植物生理與分子病理學(xué)重點實驗室/河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院, 河北 保定 071001)
類受體蛋白激酶(Receptor-like protein kinases,RLKs)是植物蛋白激酶家族中最大的家族,在跨膜信號傳導(dǎo)中起著至關(guān)重要的作用。富含半胱氨酸的類受體激酶(Cysteine-rich receptor-like kinases, CRKs)是RLKs 中最大的亞家族。典型的CRKs 胞外含有2 個具有抗菌活性的DUF26 結(jié)構(gòu)域(Domain of unknown function 26, DUF26)[1],DUF26 結(jié)構(gòu)域包含3 個半胱氨酸(C-Xn-C-X2-C)的保守序列,可能作為氧化還原調(diào)節(jié)的潛在靶標(biāo),表明CRKs 可能會受到活性氧(Reactive oxygen species,ROS)的調(diào)節(jié),而ROS 是植物響應(yīng)多種逆境脅迫共同的信號分子,這意味著CRKs 可能在多種脅迫應(yīng)答中起重要作用。
目前對模式植物擬南芥中CRKs 的研究較多,通過T-DNA 插入序列集合的大規(guī)模細胞組學(xué)分析,確定了與氧化應(yīng)激相關(guān)的AtCRK 的主要作用[2]。AtCRK6 和AtCRK7 均參與胞外氧化脅迫的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程[3]。AtCRK13 的上調(diào)導(dǎo)致與細胞死亡相關(guān)的超敏反應(yīng),并誘導(dǎo)對病原體的防御[4]。AtCRK28過表達增加擬南芥抵抗丁香假單胞菌的能力[5]。AtCRKs 的研究成果引起了對該基因家族的極大關(guān)注,近幾年,人們逐漸增加了對不同農(nóng)作物抵抗病原菌侵染過程中CRKs 功能的研究。大麥HvCRK1在感染白粉菌后高表達,瞬時沉默HvCRK1 增強了大麥抵御白粉菌的能力,表明HvCRK1 在大麥抵抗白粉菌侵染過程中發(fā)揮負調(diào)控作用[6]。沉默OsCRK1 后獲得的轉(zhuǎn)基因植株表現(xiàn)出明顯的感病性狀,表明OsCRK1 正調(diào)控水稻對白葉枯病菌的抗 性[7]。同時,六倍體小麥中CRKs 的功能研究也已經(jīng)展開,試驗證明TaCRK1 在抗病品種CI12633 受到紋枯病菌侵染時有較高水平的表達[8]。以上研究表明CRKs 在植物應(yīng)答生物或非生物脅迫過程中起到了至關(guān)重要的作用。
在研究小麥抵抗葉銹菌侵染的抗病機制過程中,本實驗室通過RNA-Seq 分析分離克隆了小麥中富含半胱氨酸的類受體激酶2(Cysteine-rich receptorlike kinases2, TaCRK2),利用VIGS 和RNAi 技術(shù)沉默TaCRK2 后導(dǎo)致小麥抵御葉銹菌的能力降低[9],借助串聯(lián)親和純化-質(zhì)譜鑒定(TAP-MS)技術(shù),發(fā)現(xiàn)了1 個TaCRK2 潛在的互作蛋白即翻譯控制腫瘤蛋白(Translationally controlled tumor proteins,TCTP)。但對于TaCRK2 與TaTCTP 的相互作用缺乏試驗驗證。
TCTP 是一種廣泛存在于植物、動物和酵母等真核生物中且高度保守的親水蛋白,在細胞內(nèi)、外均能發(fā)揮作用,對細胞的增殖、分化和凋亡起調(diào)控作用,參與細胞免疫應(yīng)答等[10-12]。AtTCTP 的過表達抑制了BAX 蛋白誘發(fā)的細胞程序性死亡,表明其參與了對細胞程序性死亡的調(diào)控[13]。另外,Meng 的研究發(fā)現(xiàn),黃瓜TCTP 基因超表達會導(dǎo)致黃瓜對白粉病的抗性降低,表明其對白粉病起負調(diào)控作用[14]。在小麥中對TCTP 也有了初步的認識,TaTCTP 正調(diào)控小麥抵抗葉銹菌侵染的過程[15]。雖然利用TAP-MS 技術(shù)發(fā)現(xiàn)了TaTCTP 是TaCRK2 的互作蛋白,但對TCTP 互作蛋白的研究還鮮有報道。本試驗利用DUALmembrane系統(tǒng)酵母雙雜交(DUALmembrane system yeast-twohybrid)和雙分子熒光互補(Bimolecular fluorescence complementation,BiFC)試驗驗證兩者間的相互作用。
本研究使用的DUALmembrane 系統(tǒng)不同于可溶性蛋白質(zhì)間相互作用驗證的酵母雙雜交系統(tǒng)[16-17]。DUALmembrane 系統(tǒng)是利用分裂泛素機制來檢測細胞內(nèi)自然環(huán)境中膜整合蛋白或膜相關(guān)蛋白間或與其他蛋白質(zhì)間的相互作用,能夠在膜上原位檢測到發(fā)生相互作用的蛋白。Zhang 等人利用DUAL 膜系統(tǒng)從感染甘蔗花葉病毒的植株中篩選并檢測到與SCMV-6K2 相互作用的蛋白[18]。本實驗室前期工作已經(jīng)證明TaCRK2 定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上[9],因此利用DUALmembrane 系統(tǒng)可以更準(zhǔn)確的驗證TaCRK2 與TaTCTP 的相互作用。
借助DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交、BiFC試驗驗證TaCRK2 與TaTCTP 二者間的相互作用,有助于進一步了解TaCRK2 在小麥與葉銹菌互作過程中的作用機制,對揭示小麥抗葉銹病的機理及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機制具有重要意義。
小麥(Triticum aestivum L.)近等基因系TcLr26與本生煙草(Nicotiana benthamiana)均為本實驗室長期保存的材料。小麥葉銹菌(Puccinia triticina)生理小種260 與TcLr26 組成不親和組合,利用感病品種‘鄭州5389’進行小麥葉銹菌的繁殖。
TcLr26 小麥幼苗在23 ~25 ℃的溫室中培養(yǎng),7 日齡TcLr26 接種小麥葉銹菌生理小種260。根據(jù)Qiao[19]的方法種植小麥及接種葉銹菌。本生煙草在23 ~25 ℃ 的溫室中培養(yǎng)大約30 d,可以注射農(nóng)桿菌,進行雙分子熒光互補試驗,根據(jù)Sparkes[20]的方法種植 煙草。
利 用primer premier 5.0 軟 件, 根 據(jù)TaCRK2 (GenBank 登錄號: MK424819)核苷酸序列,設(shè)計出具有Sfi I 限制性位點的基因特異性引物Y2HTaCRK2 F/R 和具有Sal I 和Kpn I 限制性位點的基因特異性引物BiFC-TaCRK2 F/R。根據(jù)TaTCTP(GenBank 登錄號:542949)核苷酸序列,設(shè)計出具有Sfi I 限制性位點的基因特異性引物Y2HTaTCTP F/R 和具有Sal I 和Kpn I 限制性位點的基因特異性引物BiFC-TaTCTP F/R。除 M13 F/R 外,其余引物均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成(表1)。
在7 日齡小麥葉片表面接種Puccinia triticina生理小種260,在接種48 h 時取樣,利用Trizol (生工,上海)的方法提取總RNA,依據(jù)TaKaRa 反轉(zhuǎn)錄試劑盒 PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser (TaKaRa,大連)合成cDNA。以該cDNA 為模板,利用引物TaTCTP F/R,使用高保真酶PrimeSTAR?Max DNA Polymerase (TaKaRa,大連) 擴增得到TaTCTP 的編碼區(qū),長度為507 bp,連接至克隆載體pEASY-T1 (全式金,北京) 上,利用引物M13F/R 篩選陽性克隆,測序由北京華大基因股份有限公司完成。通過5’RACE 技術(shù)克隆得到TaCRK2 編碼區(qū)全長1 482 bp[9]。
表 1 試驗所用引物Table 1 Primers used in the study
為構(gòu)建TaCRK2 和TaTCTP DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交載體,使用具有Sfi I 限制性位點的基因特異性引物Y2H-TaCRK2 F/R 和Y2H-TaTCTP F/R (表1),擴增TaCRK2 和TaTCTP 的編碼序列,將擴增產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,使用SanPrep 柱式DNA 膠回收試劑盒 (生工,上海) 回收目的片段,目的片段與載體pPR3-N 和pBT3-N 經(jīng)Sfi I 進行酶切后,用Solution I DNA 連接酶進行連接,然后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌 (Escherichia coli) DH5α 感受態(tài)細胞。對得到的陽性克隆進行酶切驗證和測序。測序結(jié)果用DNAMAN 軟件進行比對分析。
為構(gòu)建TaCRK2 和TaTCTP 雙分子熒光互補載體,使用具有Sal I 和Kpn I 限制性位點的基因特異性引物BiFC-TaCRK2 F/R 和BiFC-TaTCTP F/R(表1),擴 增TaCRK2 和TaTCTP 的編碼序列。過程與構(gòu)建DUAL- membrane 系統(tǒng)酵母雙雜交載體相同,將構(gòu)建成功的重組質(zhì)粒通過熱激法轉(zhuǎn)化到根癌農(nóng)桿菌(GV3101)中。
使用PEG/LiAc 法轉(zhuǎn)化酵母NMY51。pPR3-N和pBT3-N 為 空 載 體 對 照、pPR3-N 和pBT3-NTaCRK2、pPR3-N 和pBT3-N-TaTCTP 為陰性對照,檢測2 個基因的自激活。pPR3-N-TaTCTP 和pBT3-N-TaCRK2 共 轉(zhuǎn) 化、pPR3-N-TaCRK2 和pBT3-NTaTCTP 共轉(zhuǎn)化作為試驗組。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到NMY51 酵母感受態(tài)細胞中,菌液涂布于缺陷型二缺 (SD/-Leu/-Trp) 培養(yǎng)基上,28 ℃倒置培養(yǎng)3 d ,挑取較大的單個菌斑到二缺液體培養(yǎng)基中,28 ℃振蕩培養(yǎng),直至OD546大約為0.6,用雙蒸水稀釋至OD546為0.2,稀釋后的菌液點在二缺、三缺 (SD/-Leu/-Trp/-His) 和四缺 (SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade) 的培養(yǎng)基上,28 ℃倒置培養(yǎng)3 ~4 d 后觀察并拍照。
在煙草葉片中,將含有目的基因的重組質(zhì)粒瞬時表達。對分別攜帶有pSPYNE、pSPYCE、pSPYNE-TaCRK2、pSPYCE-TaCRK2、pSPYNETaTCTP 和pSPYCE-TaTCTP 重 組 質(zhì) 粒 的GV3101農(nóng)桿菌進行過夜培養(yǎng),4 000 r/min,15 min 離心,所得菌體用侵染緩沖液(10.06 g/L MES、0.76 g/L Na3PO4、5 g/L 葡萄糖、0.1 mmol/L AS)洗滌,再用侵染緩沖液重懸菌體,調(diào)OD600值約為0.6。將攜帶有pSPYNE 和pSPYCE-TaCRK2、pSPYNETaCRK2 和 pSPYCE、pSPYNE 和 pSPYCETaTCTP、pSPYNE-TaTCTP 和pSPYCE、pSPYNETaCRK2 和pSPYCE-TaTCTP、pSPYNE-TaTCTP 和pSPYCE-TaCRK2 的農(nóng)桿菌均按1∶1 的比例混合,然后注射煙草,在48 h 后使用激光掃描共聚焦顯微鏡(OLYMPUS FV1000,日本)進行觀察并拍照。
以pPR3-N 和pBT3-N 為載體,使用單酶切連接法構(gòu)建DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交載體。使用引物Y2H-TaCRK2 F/R 擴增TaCRK2 編碼區(qū),使用引物Y2H-TaTCTP F/R 擴增TaTCTP 編碼區(qū)。用Sfi Ⅰ將目的基因和表達載體pPR3-N 和pBT3-N酶切,用連接酶進行連接、轉(zhuǎn)化到DH5α 感受態(tài)細胞中。在大約1 482 bp(圖1-a, b)和507 bp(圖1-c, d)處檢測到目的條帶,結(jié)果表明TaCRK2 和TaTCTP基因的DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交載體構(gòu)建成功。
圖1 DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交載體的酶切鑒定Fig. 1 Restriction enzyme digestion of the DUALmembrane system yeast two-hybrid vectors
使用引物BiFC-TaCRK2 F/R 擴增帶Sal I 和Kpn I 酶切位點的TaCRK2 編碼區(qū),使用引物BiFCTaTCTP F/R 擴 增 帶Sal I 和Kpn I 酶 切 位 點 的TaTCTP 編碼區(qū)。將目的基因TaCRK2 和TaTCTP 與表達載體pSPYNE 和pSPYCE 用Sal I 和Kpn I 雙酶切,用連接酶進行連接、轉(zhuǎn)化到DH5α 感受態(tài)細胞中。結(jié)果顯示,在大約1 482 bp(圖2-a, b)和507 bp(圖2-c, d)處檢測到目的條帶,表明TaCRK2 和TaTCTP 基因的雙分子熒光互補載體構(gòu)建成功。
圖2 雙分子熒光互補載體的酶切鑒定Fig. 2 Restriction enzyme digestion of the bimolecular fluorescence complementary vectors
在SD/-Leu/-Trp(-LW)平板培養(yǎng)基上,pPR3-N 和pBT3-N 空載體、pPR3-N 和pBT3-N-TaCRK2 共轉(zhuǎn)化、pPR3-N 和pBT3-N-TaTCTP 共轉(zhuǎn)化、pPR3-N-TaTCTP 和pBT3-N-TaCRK2 共 轉(zhuǎn) 化、pPR3-NTaCRK2 和pBT3-N-TaTCTP 共轉(zhuǎn)化的酵母均正常生長,并且其生長狀態(tài)基本一致。在SD/-Leu/-Trp/-His(-LWH)培養(yǎng)基上,只有pPR3-N-TaTCTP和pBT3-N-TaCRK2 共 轉(zhuǎn) 化、pPR3-N-TaCRK2 和pBT3-N-TaTCTP 共轉(zhuǎn)化的酵母正常生長(見圖3)。在SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade(-LWHA)培養(yǎng)基上的生長狀況與SD/-LWH 平板培養(yǎng)基上的生長狀況基本一致。結(jié)果表明TaCRK2 與TaTCTP 在酵母中發(fā)生了相互作用。
圖3 DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交檢測 TaCRK2 與TaTCTP 的相互作用Fig. 3 DUALmembrane system yeast two-hybrid detection of TaCRK2 and TaTCTP interaction
在酵母細胞中TaCRK2 與TaTCTP 能發(fā)生相互作用,為了進一步檢測TaCRK2 與TaTCTP 是否會在植物體內(nèi)相互作用,使用雙分子熒光互補試驗驗證TaCRK2 與TaTCTP 在煙草細胞中的相互作用。將 攜 帶TaCRK2 與TaTCTP 的pSPYNE 和pSPYCE載體單獨或共同注射煙草葉片,用激光掃描共聚焦顯微鏡觀察。結(jié)果顯示,TaCRK2 和TaTCTP 共同轉(zhuǎn)化的煙草下表皮細胞的熒光信號很強,而單獨注射的對照組煙草沒有熒光(圖4),其熒光信號的分布特征與前期對TaCRK2 進行的亞細胞定位結(jié)果極其相似[9]。結(jié)果表明,TaCRK2 與TaTCTP 可以在植物細胞內(nèi)相互作用,由于TaCRK2 定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,所以二者的相互作用很可能發(fā)生在內(nèi)質(zhì)網(wǎng) 膜上。
圖4 雙分子熒光互補檢測 TaCRK2 與TaTCTP 的相互作用Fig. 4 Bimolecular fluorescence complementary detection of TaCRK2 and TaTCTP interaction
植物通過識別病原菌效應(yīng)物蛋白,激發(fā)抗病防衛(wèi)反應(yīng),導(dǎo)致寄主細胞發(fā)生超敏反應(yīng)(Hypersensitive reaction, HR),從而使病原菌的生長受到抑制[21]。已經(jīng)證明Ca2+作為信號分子參與調(diào)控小麥-葉銹菌互作中HR 的發(fā)生[19,22]。然而,Ca2+如何調(diào)控HR 尚不清楚。本課題組前期借助轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)一個受Ca2+調(diào)控的基因TaCRK2,以Ca2+依賴的方式調(diào)控小麥對葉銹菌的抗性[9]。CRK 是RLKs 的亞家族成員,在植物抗病性和細胞死亡中起重要作用。在擬南芥中AtCRK4、AtCRK6 和AtCRK36 的過表達導(dǎo)致對對丁香假單胞菌的抗性增強,并且增強了早期和晚期PTI 反應(yīng)的激活[23]。AtCRK13 過表達也會誘導(dǎo)細胞死亡[5]。但目前人們對CRKs 參與生物脅迫和非生物脅迫的作用機制卻知之甚少。AtCRK36 的過表達植株表現(xiàn)出高敏感性細胞死亡,與BIK1 相互作用,介導(dǎo)ROS 產(chǎn)生,增強氣孔防御[24]。AtCRK28 在擬南芥中過表達增強了對丁香假單孢菌的抗性,在煙草中瞬時表達AtCRK28 可以誘導(dǎo)細胞死亡,AtCRK28 能夠和BAK1-FLS2 復(fù)合體啟動寄主的防衛(wèi)反應(yīng),誘導(dǎo)細胞死亡[5]。在本試驗中通過DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交和BiFC 試驗證明了TaCRK2 與TaTCTP 之間存在相互作用。
TaCRK2 定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,TaTCTP 定位于細胞質(zhì)和細胞核。通過DUALmembrane 系統(tǒng)酵母雙雜交驗證TaCRK2 與TaTCTP 存在相互作用后,進一步使用BiFC 試驗在活細胞的生理環(huán)境中原位顯示蛋白質(zhì)的相互作用,結(jié)果顯示TaCRK2 與TaTCTP的相互作用可能發(fā)生在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,說明TaTCTP可能在TaCRK2 調(diào)控小麥抵抗葉銹菌侵染誘導(dǎo)HR的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)中起作用,參與胞質(zhì)內(nèi)信號的傳遞,但二者的上下游關(guān)系仍有待進一步探討。下一步的工作將通過免疫共沉淀技術(shù)進一步證明二者在體內(nèi)存在互作。前期研究表明TaCRK2 的激酶結(jié)構(gòu)域缺少了催化核心域(VIb 和VII)[9],那么TaCRK2與TaTCTP 相互作用的本質(zhì),互作位點的特征將是研究的重點。已知TaTCTP 和TaSnRK1 存在相互作用[25],因此推測TaTCTP 可能作為磷酸化靶標(biāo),在TaTCTP 和TaCRK2 之間進行信號傳遞,但TaCRK2是否與TaSnRK1 發(fā)生相互作用仍需要試驗驗證,這些問題的澄清將有助于完善TaCRK2 參與小麥抵抗葉銹菌侵染誘導(dǎo)HR 的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機制。在以后研究中將利用VIGS 和RNAi 技術(shù)沉默TaCRK2、TaTCTP 或?qū)⒍咄瑫r沉默,觀察基因沉默對葉銹菌發(fā)育及HR 的影響,對其上下游關(guān)系進行探究;通過位點突變進一步研究TaCRK2 與TaTCTP 相互作用的實質(zhì)。這為闡明TaCRK2 調(diào)控葉銹菌侵染小麥后誘發(fā)HR 的分子機制奠定了重要基礎(chǔ), 亦對全面地闡釋TaCRK2 在植物免疫過程中的作用機制具有重要的理論意義和實踐意義。