任永超
摘要:為了提高當歸及其混偽品的分子鑒定結(jié)果的可靠性,研究了一種當歸及其混偽品的分子鑒定技術(shù)。先對當歸材料及其混偽品的trn L-F序列和ropC1序列進行了基因序列擴增和測序,引入DNA條形碼鑒定技術(shù),鑒定當歸及其混偽品的分子,最后通過trn L-F序列有效區(qū)分出了所有的當歸及其混偽品的分子,而rpoC1序列僅能區(qū)分部分當歸和其混偽品。
關(guān)鍵詞:分子鑒定技術(shù);當歸;混偽品;遺傳信息;基因序列
引言
當歸屬于傘形科類植物,味道比較甘甜,稍帶辣味且性暖,對于人體來說具有補血活血、調(diào)理經(jīng)絡、止疼以及通便之功效。在臨床上通常將當歸用于血虛血瘀、眩暈心悸,治理女性的月經(jīng)失調(diào)、閉經(jīng)痛經(jīng)、虛寒腹痛以及風濕關(guān)節(jié)炎等疾病,對于皮外傷、癰痛以及腸燥便秘等病狀也具有顯著療效。
到目前為止,當歸藥材的鑒定方法主要有基原、性狀、顯微、理化、生物等。但是這些鑒定方法都對相關(guān)的鑒定人員有著較高的經(jīng)驗要求,且具有主觀性強、通用性差等明顯缺陷,不利于當歸藥材鑒定方法的標準化建立、發(fā)展以及大力推廣。近年來,伴隨著分子生物學技術(shù)的飛速發(fā)展,將遺傳物質(zhì)DNA鑒定方法應用到當歸藥材的鑒定方法中去已經(jīng)成為當今的主流研究方向。當歸藥材中的基因信息直接通過DNA在藥材分子間傳遞,且在同一個生物體內(nèi),每一種藥材細胞都包含著相同的遺傳信息,在遺傳上具有較強的穩(wěn)定性,不會輕易因外界因素的影響而發(fā)生變化。DNA分子鑒定技術(shù)為當歸藥材鑒定問題的解決提供了客觀、快速、有效的依據(jù),因此本文主要研究了一種當歸及其混偽品的分子鑒定技術(shù)。
當歸及其混偽品的分子鑒定
利用NCBI的BLAST相似性,對當歸及其混偽品的trn-L-F序列和rpoC1序列進行搜索,如果兩個序列都可以被搜索到,說明trn-L-F序列和rpoC1序列具有很好的匹配度,將其看作是目標序列。用megav.5.0化學成分分析軟件計算trn-L-F序列和rpoC1序列在當歸及其混偽品中的組成情況以及平均G+C含量(%),并計算出每一種分子序列的堿基變異數(shù)、信息位點、相同堿基數(shù)量以及轉(zhuǎn)換/轉(zhuǎn)化等信息。
作為一種新的物種鑒定方法,DNA條形碼技術(shù)可以通過分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)來顯示植物體內(nèi)基因序列的具體信息,并直觀準確地作出判斷,彌補了傳統(tǒng)鑒定方法的不足。DNA條形碼鑒定方法不僅可以明確物種之間的差異,還可以明確較小物種內(nèi)部的差異。DNA片段要盡可能短,才能方便DNA序列提取和PCR序列擴增,因此一般引物設計要高度保守。
通過由trn-L-F序列構(gòu)造的系統(tǒng)發(fā)生樹可以將當歸藥品聚類為一個分支,并對聚類結(jié)果進行分析,從而確定所有相關(guān)物種在一個分枝上都能聚集成一個具有高度親和力的物種群,也就是理論上利用trn-L-F序列可以構(gòu)建一個當歸識別數(shù)據(jù)庫,從而識別當歸及其混偽品之間的區(qū)別。接下來的工作中,只需放大trn-L-F序列,并與數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進行比較,即可確定鑒定結(jié)果的真實性。但由rpoC1序列構(gòu)造的系統(tǒng)發(fā)生樹不能很好地區(qū)分各屬的關(guān)系,所以trn-L-F序列更適合于當歸及其混偽品的鑒定。但是該序列鑒定功能不強,可作為輔助鑒定工具,并與其他基因結(jié)合進行鑒定。該規(guī)律說明,trn-L-F基因?qū)Ξ敋w品種的種間鑒別優(yōu)于rpoC1基因,能夠完全區(qū)分真假當歸,具有較高的應用價值。
用葉綠體基因組片段trn L-F序列擴增當歸及其混偽品發(fā)現(xiàn),SNP的21位特異性鑒定位點為當歸。有9個堿基A在273-284處連續(xù)重復,但片段中的堿基A重復次數(shù)不同,或含有其他堿基,因此也可根據(jù)此區(qū)分當歸及其偽混品。另外,在trn-L-F序列基礎上構(gòu)造的系統(tǒng)發(fā)生樹表明,純當歸本身具有與其他摻假物明顯不同的擴展性。但是在不同產(chǎn)地的當歸樣品上trn-L-F和rpoC1這兩個序列并沒有很大差別。由trn-L-F和rpoC1序列構(gòu)造的系統(tǒng)發(fā)生樹表明,目前市場上三種商品當歸藥材與正品當歸相差甚遠,證明這三種原料都是假藥,應謹慎使用。
結(jié)束語
本文主要研究了當歸及其混偽品的分子鑒定技術(shù),在分子鑒定方面,利用trn-L-F序列能有效地區(qū)分當歸、混偽品與近緣種,而rpoC1序列只能區(qū)分部分當歸、混偽品與近緣種,而部分明確區(qū)分白芷、阿壩當歸等樣品,且鑒定效率低下,這為當歸市場中提供了一種快速有效的鑒定方法,對當歸產(chǎn)品DNA條碼的補充和完善具有重要意義。
基金項目:
貴州省2017年度黔南州社會發(fā)展科技計劃項目“黔南地區(qū)當歸道地性相關(guān)的遺傳信息研究”(編號:黔南科合社字(2017)1號)