敖慧娟,石嘉琛,阿依木古麗·阿不都熱依木,喬自林,楊 琨
(1.西北民族大學(xué) 生物醫(yī)學(xué)研究中心甘肅省動物細(xì)胞技術(shù)創(chuàng)新中心,甘肅 蘭州 730030;2.西北民族大學(xué) 生物醫(yī)學(xué)研究中心生物工程與技術(shù)國家民委重點實驗室,甘肅 蘭州 730030;3.西北民族大學(xué) 生命科學(xué)與工程學(xué)院,甘肅 蘭州 730030)
MDCK細(xì)胞系由Madin和Darby于1958年從美國Cocker Spaniel 母曲架犬的腎臟中分離并培育,通常是以貼壁方式生長的上皮樣細(xì)胞.由于其病毒感染效率高、增殖快,不易變異,且適應(yīng)于無血清的生長條件,MDCK細(xì)胞系被公認(rèn)是最適于甲、乙型流感病毒疫苗生產(chǎn)的3種細(xì)胞系之一[1-3].由于MDCK細(xì)胞本身具有較高的成瘤性,用其生產(chǎn)疫苗的安全性一直存在著爭議[4-5].近年來,喬自林等通過單細(xì)胞克隆培養(yǎng)和篩選,得到了數(shù)株低成瘤性的MDCK細(xì)胞株[6],將其與實驗室已有的高成瘤性細(xì)胞株一并做高通量分析發(fā)現(xiàn),某些經(jīng)典的腫瘤通路被靶基因激活,其中l(wèi)ncRNA MSTRG.1056.2直接調(diào)控ERBB3激活PI3K-Akt通路,促進(jìn)腫瘤發(fā)生[7].為了保證疫苗的安全性,開發(fā)低成瘤性 MDCK 細(xì)胞系不僅可以減輕下游純化工藝的難度,還可以從根本上降低以其生產(chǎn)流感疫苗后的接種風(fēng)險.
FOXN2[8]蛋白被證實與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),在某些類型的腫瘤中已經(jīng)觀察到FOXN2的異常表達(dá).當(dāng)FOXN2被下調(diào)時,在T細(xì)胞白血病中起抑癌作用,抑制肺癌的腫瘤發(fā)生和放射抗性,與放療或化學(xué)療法治療的成年成膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的不良預(yù)后密切相關(guān).FOXN2的沉默可以抑制癌干細(xì)胞的間質(zhì)表型.異位表達(dá)FOXN2的表達(dá)顯著抑制了乳腺癌細(xì)胞的遷移和侵襲,并改變了EMT標(biāo)記物(如E-鈣粘蛋白和N-鈣粘蛋白)的表達(dá).此外,F(xiàn)OXN2可以轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)SLUG表達(dá),并且FOXN2的表達(dá)與乳腺癌組織中SLUG的表達(dá)呈負(fù)相關(guān).這些結(jié)果表明,F(xiàn)OXN2可能是EMT進(jìn)展的重要因素,能夠促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的遷移和侵襲[9].檢測人非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞 A549 和人胚肺成纖維細(xì)胞 MRC-5中FOXN2的mRNA 水平,發(fā)現(xiàn)其在A549細(xì)胞中的表達(dá)水平極顯著地低于 MRC-5細(xì)胞.在A549細(xì)胞中過表達(dá)FOXN2抑制了細(xì)胞的增殖,降低了細(xì)胞遷移侵襲能力[10].馬佳等人指出,F(xiàn)OXN2沉默可促進(jìn)肺癌中細(xì)胞周期的重新分布和腫瘤發(fā)生[11],并發(fā)現(xiàn)泛素連接酶β-Trcp可通過作用FOXN2第365位和第369位絲氨酸使FOXN2泛素化降解,進(jìn)而抑制FOXN2的生物學(xué)效應(yīng)[12].
FOXN2作為一個抑癌基因,可以抑制肺癌A549細(xì)胞的生長增殖,可增強肺癌細(xì)胞的放療敏感性.但FOXN2對MDCK細(xì)胞成瘤性的影響尚不清楚,因此對不同成瘤性MDCK細(xì)胞中FOXN2差異表達(dá)及功能的研究具有重要意義.
DMEM、MEM 、懸浮培養(yǎng)基、磷酸緩沖鹽溶液(PBS)、0.25% 胰蛋白酶溶液(蘭州百靈生物技術(shù)有限公司 ),新生牛血清、胎牛血清(蘭州民海生物工程有限公司),臺盼藍(lán),T25 細(xì)胞培養(yǎng)瓶( Corning ),TRIzolTMReagent(Thermo);EVOM-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑盒(艾科瑞生物公司),All-in-OneTMqPCR Mix-實時熒光定量PCR檢測試劑盒(GeneCopoeia,Inc.).
倒置相差顯微鏡 CK-41 (日本 Olympus),細(xì)胞計數(shù)儀 IC1000 (Countstar),移液槍 20~200 μL、1 mL Easypet (eppendorf),液氮罐 YDS-100-200F (樂山市東亞機(jī)電工貿(mào)有限公司),CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱 311 (Thermo),普通冰箱(2~8 ℃) SC387 、超低溫冰箱(-80 ℃) DW-86L386(青島海爾股份有限公司),臺式低速離心機(jī) TDL-80-2B (上海安亭科學(xué)儀器廠),普通PCR擴(kuò)增儀CLASSC K960-Thmal Cycler(Heal force),實時定量基因擴(kuò)增儀 CFX96TMReal-Time System(BIO-RAD).
本實驗所選取的不同成瘤性細(xì)胞株是由課題組在前期實驗中馴化所得.前期裸鼠成瘤性實驗中發(fā)現(xiàn):從ATCC引進(jìn)的貼壁型MDCK-A和由其馴化所得懸浮型MDCK-B在裸鼠成瘤性實驗中的成瘤率均高達(dá)100%(10/10).而將MDCK-A通過有限稀釋法制備得到的貼壁型單克隆細(xì)胞株MDCK-C的裸鼠成瘤率為10%(1/10).貼壁型MRC-5細(xì)胞由蘭州民海生物工程有限公司贈送,其裸鼠成瘤率為0(0/10).因此,選用MRC-5作為陰性對照.將本實驗室已有的不同成瘤性MDCK細(xì)胞從液氮罐中取出,置于37 ℃溫水中直至完全融化,將懸浮型MDCK-B用無血清培養(yǎng)基置于37 ℃,5%CO2,轉(zhuǎn)速為120 r/min的搖床上培養(yǎng),并將貼壁型細(xì)胞MDCK-A,MDCK-C,用含10%新生牛血清的DMEM完全培養(yǎng)基,對照組MRC-5細(xì)胞含10%新生牛血清的MEM培養(yǎng)基,置于37 ℃,5%CO2恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng).
棄掉細(xì)胞培養(yǎng)瓶中的培養(yǎng)液,用PBS洗3遍,并吸去殘余的PBS.加入TRIzol試劑,用槍尖反復(fù)用力吸打裂解細(xì)胞,室溫放置5 min以徹底解離蛋白復(fù)合體.將細(xì)胞與裂解液分裝在2個1.5 mL的已滅菌的無RNA酶PE管中,加入氯仿使其與TRIzol的體積比為1︰5.用力上下?lián)u20 s,室溫靜置3~5 min,12000×g4℃離心10 min,并小心吸取上層水相到新的已滅菌的無RNA酶PE管中,加入100%異丙醇到水相中,使得異丙醇與TRIzol的體積比為1︰2.室溫放置8~10 min以沉淀RNA.12000×g4℃離心5 min后,小心棄上清,防止將RNA沉淀一并棄掉.同1 mL75%的無水乙醇漂洗RNA沉淀,即無水乙醇與TRIzol的體積比為1︰1.將無水乙醇中的RNA以7500×g4℃離心5 min.小心吸去無水乙醇,并打開EP管的蓋子,室溫干燥RNA沉淀5~8 min,注意不可完全干燥.用DEPC水30~50 μL溶解RNA沉淀,用槍尖反復(fù)吹打以徹底增加RNA溶解.吸取1~3 μL RNA測量所提RNA樣品A260/A280的OD值.
在做Real Time PCR 之前,需要將樣品RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA.本實驗用的是艾科瑞生物公司的EVOM-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑盒.
表1 去除gDNA試劑及反應(yīng)體系
將樣品混勻后進(jìn)行短暫離心,再將樣品放入PCR 儀中42 ℃ 2 min.取出樣品放置在冰上加入發(fā)轉(zhuǎn)錄試劑.
表2 反轉(zhuǎn)錄試劑及反應(yīng)體系
混勻后短暫離心,再將樣品放入PCR 儀中37 ℃15 min,85 ℃5 s.以上過程就是將樣品RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA的全過程.將得到的cDNA保存于-20 ℃試劑中.利用Primer 5.0軟件根據(jù)目的基因FOXN2( GeneID: 3344)和內(nèi)參基因GAPDH(GeneID: 2597)設(shè)計所需要的引物,見表3.
表3 基因引物序列信息
將引物系列送到甘肅一棵樹生物有限公司合成后,再用GeneCopoeia,Inc.的All-in-OneTMqPCR Mix-實時熒光定量PCR檢測試劑盒對目的基因進(jìn)行檢測.其反應(yīng)體系見表4.
表4 熒光定量PCR反應(yīng)體系
反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性10 min;95 ℃變性10 s;60 ℃退火20 s;72 ℃延伸15 s;95 ℃10 s到72 ℃15 s共40個循環(huán).溶解曲線分析為65 ℃10 s,95 ℃20 s.注意:每個樣品至少要做3個平行組.隨后搖勻,瞬時離心后,用BIO-RAD CFX96TMReal-Time System 分析目的基因在不同成瘤性MDCK 細(xì)胞中的表達(dá)量.2 h后可以根據(jù)反應(yīng)結(jié)果使用相對定量分析F=2-ΔΔCt進(jìn)行數(shù)據(jù)分析.其計算方法為ΔCt=目的基因Ct值-內(nèi)參基因Ct值;-ΔΔCt=對照組ΔCt平均值-各樣品ΔCt值;最后2-ΔΔCt反映各樣品相對對照組樣品目的基因的相對表達(dá)水平.利用GraphPad Prism 5作圖分析目的基因的表達(dá)量并作差異性分析.
將細(xì)胞培養(yǎng)48小時后置于顯微鏡下用4倍目鏡觀察細(xì)胞的生長狀況,如圖1所示.所培養(yǎng)細(xì)胞生長狀態(tài)良好,細(xì)胞輪廓清晰,懸浮細(xì)胞的活力高、結(jié)團(tuán)少、均勻性好.其中MRC-5(圖A)成纖維狀生長;貼壁型MDCK-A(圖B)成上皮樣生長;懸浮型MDCK-B(圖C)呈圓形懸浮生長于無血清培養(yǎng)基中;MDCK-C(圖D)成上皮樣生長,可用于后續(xù)實驗.
A:陰性對照細(xì)胞MRC-5 B:貼壁型細(xì)胞MDCK-A C:懸浮型細(xì)胞MDCK-B D:單克隆貼壁型細(xì)胞MDCK-C
將提取的RNA進(jìn)行純度分析發(fā)現(xiàn),所有樣品OD值均在1.8~2.0之間,可用于后續(xù)實驗,具體結(jié)果如表5所示.
表5 樣品純度檢測結(jié)果
RT-PCR檢測結(jié)果顯示,所設(shè)計的引物特異性高,定量結(jié)果重復(fù)性好(圖2).以MRC-5為對照組,利用GraphPad Prism 5作圖分析目的基因的表達(dá)量并作差異性分析發(fā)現(xiàn): FOXN2在和MDCK-C細(xì)胞中的 P value< 0.0001,差異極顯著(圖3),且在高成瘤性MDCK-A、MDCK-B與低成瘤性MDCK-C細(xì)胞之間的表達(dá)存在差異(圖4).這說明FOXN2在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)量可能與細(xì)胞成瘤性成正相關(guān),可為進(jìn)一步研究FOXN2在MDCK細(xì)胞成瘤性的作用機(jī)制提供理論參考.
圖2 引物特異性結(jié)果
圖3 FOXN2在不同成瘤性MDCK細(xì)胞中的表達(dá)結(jié)果
FOXN2被證實與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展相關(guān).在研究宮頸癌組織和細(xì)胞系中發(fā)現(xiàn)lncRNA Wilms腫瘤1反義RNA(WT1-AS)顯著下調(diào).功能分析表明,WT1-AS的過表達(dá)顯著抑制宮頸癌細(xì)胞的生長、遷移和侵襲.熒光素酶報告基因分析的結(jié)果證實,miR-203a-5p是WT1-AS的直接靶標(biāo).而FOXN2被鑒定為miR-203a-5p的直接靶基因[13].在接受化學(xué)療法或放射療法的患者中,TCGA驗證隊列中的低FOXN2 mRNA和不良結(jié)局相關(guān)[14].為了鑒定拷貝數(shù)突變靶向的新型癌癥相關(guān)基因,進(jìn)行T細(xì)胞急性淋巴細(xì)胞白血病(T-ALL)細(xì)胞系的基因組分析,識別了腫瘤抑制基因(TS)FBXO11和FOXN2.FBXO11,F(xiàn)OXN2和FOXN3的定量表達(dá)分析證實了已鑒定細(xì)胞系中轉(zhuǎn)錄水平的降低.生物信息學(xué)分析顯示,F(xiàn)OXN2和FOXN3與同源盒基因ZHX1同時減少.實驗證明,F(xiàn)OXN2和FOXN3都能直接激活ZHX1的轉(zhuǎn)錄[15].但FOXN2在MDCK細(xì)胞成瘤性的研究中少有報道.在本研究中,我們挑選了前期實驗室凍存的不同成瘤性細(xì)胞,旨在探究FOXN2在不同成瘤性細(xì)胞中的表達(dá)量關(guān)系,進(jìn)而為利用基因工程手段構(gòu)建穩(wěn)定的低成瘤細(xì)胞系奠定基礎(chǔ).結(jié)果表明,F(xiàn)OXN2在高成瘤性MDCK-A和MDCK-B與低成瘤性細(xì)胞株MDCK-C之間的表達(dá)量具有差異性(圖4).這由MDCK細(xì)胞群的多樣性擴(kuò)展到了其成瘤性蛋白表達(dá)的差異,并為進(jìn)一步開展FOXN2在MDCK細(xì)胞中的成瘤性機(jī)制研究提供了參考信息.
圖4 FOXN2在不同成瘤性 MDCK細(xì)胞中的差異表達(dá)
本研究采用前期裸鼠成瘤性實驗中的不同成瘤性MDCK 細(xì)胞為研究原材料,結(jié)果表明FOXN2在高成瘤性MDCK細(xì)胞株MDCK-A和MDCK-B中的表達(dá)量遠(yuǎn)高于低成瘤性細(xì)胞株MDCK-C.這由MDCK細(xì)胞群的多樣性擴(kuò)展到了其成瘤性蛋白表達(dá)的差異,并為進(jìn)一步開展FOXN2在MDCK細(xì)胞中的成瘤性機(jī)制的研究提供了參考信息.另外,本研究結(jié)果將來可用于表征不同MDCK細(xì)胞的克隆及馴化,為研究MDCK細(xì)胞腫瘤生物學(xué)特征,以及評估MDCK細(xì)胞作為疫苗生產(chǎn)的細(xì)胞基質(zhì)等提供基礎(chǔ).