傅科鶴 范莉莉 陳慧穎
摘要:纖維素是自然界中分布最廣泛的一種生物質(zhì)能源,篩選能夠高效降解纖維素的菌株對(duì)于開(kāi)發(fā)利用這類物質(zhì)具有重要意義。從土壤中分離純化獲得一株高產(chǎn)纖維素酶的菌株TW063-3,通過(guò)形態(tài)學(xué)結(jié)合分子生物學(xué)鑒定得出,該菌株為草酸青霉。通過(guò)單因素優(yōu)化試驗(yàn)尋找最佳培養(yǎng)條件,然后通過(guò)正交試驗(yàn)確定關(guān)鍵因子的最佳參數(shù)。篩選得出最佳培養(yǎng)條件:15 g/L羧甲基纖維素鈉+2 g/L硝酸銨,pH值為3.0,200 r/min培養(yǎng)6 d。在最佳培養(yǎng)條件下,酶活性比優(yōu)化前提高了34.1%,達(dá)到524.4 U/mL。研究結(jié)果可為生物降解纖維素酶提供一定的理論及應(yīng)用價(jià)值。
關(guān)鍵詞:纖維素酶;草酸青霉;培養(yǎng)基優(yōu)化
纖維素酶能夠?qū)⒆匀唤缰凶钬S富的生物質(zhì)能源——纖維素類物質(zhì)分解成可溶性單糖,從而為大批量生產(chǎn)生物燃料乙醇提供廉價(jià)原料[1]。經(jīng)過(guò)50多年的研究發(fā)現(xiàn),纖維素酶已經(jīng)成為第四大工業(yè)酶種[2],在生物能開(kāi)發(fā)、食品、畜牧業(yè)及工農(nóng)業(yè)廢棄物回收等多個(gè)領(lǐng)域都具有遠(yuǎn)大的應(yīng)用前景[3]。
已有研究發(fā)現(xiàn),自然界中能分解纖維素的生物類群主要是細(xì)菌與真菌[4]。絲狀真菌是產(chǎn)纖維素酶非常重要的一大類群,能夠產(chǎn)生多種胞外纖維素酶[5]。里氏木霉是研究得較為清楚的產(chǎn)纖維素酶菌株,但是其生長(zhǎng)量相對(duì)較小,產(chǎn)酶量不能滿足工業(yè)中轉(zhuǎn)化纖維素的需求[6]。許多研究發(fā)現(xiàn),青霉菌具有胞內(nèi)分泌組分齊全、纖維素酶活性高、易培養(yǎng)和生長(zhǎng)速度快的優(yōu)勢(shì)[7],而且青霉源纖維素酶能產(chǎn)生比木霉源纖維素酶較多的β-葡萄糖苷酶[8]。
本研究從海灘邊土壤篩選獲得一株高產(chǎn)纖維素酶的青霉菌株,通過(guò)優(yōu)化培養(yǎng)條件,旨在提高該菌株的纖維素酶產(chǎn)量,研究成果可為今后工業(yè)化應(yīng)用纖維素酶提供一定的理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 剛果紅篩選培養(yǎng)基 培養(yǎng)基配方為10 g/L羧甲基纖維素鈉,0.2 g/L剛果紅,2 g/L K2HPO4·3H2O,0.01 g/L FeSO4·7H2O,0.5 g/L MgSO4·7H2O,0.5 g/L KCl,14 g/L瓊脂。
1.1.2 搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基 培養(yǎng)基配方為10 g/L羧甲基纖維素鈉,3 g/L蛋白胨,0.5 g/L酵母粉,4 g/L (NH4)2SO4,2 g/L K2HPO4·3H2O,0.3 g/L CaCl2,0.5 g/L MgSO4·7H2O,2 g/L吐溫-80。
1.2 方法
1.2.1 樣品采集與處理 土壤樣品從海洋和森林中采集,取5點(diǎn)采樣,混合為1個(gè)樣品。在樣品中加入適量純凈水后,加玻璃珠打散,取上層液體,稀釋后涂板篩選。
1.2.2 纖維素酶活性的測(cè)定 采用DNS(3,5-二硝基水楊酸)法測(cè)定纖維素酶活性。對(duì)照(CK)處理方法:取1 mL菌液,煮沸(100 ℃、5 min)滅活后用冷水冷卻5 min,之后加入1 mL 1%羧甲基纖維素鈉溶液和3 mL DNS,混合均勻后沸水(100 ℃、5 min)水浴,再用冷水冷卻5 min,然后在波長(zhǎng)(λ)為540 nm的紫外-可見(jiàn)分光光度計(jì)中測(cè)吸光度。
酶活性的測(cè)定:取1 mL菌液,加入1 mL 1%羧甲基纖維素鈉溶液,混合均勻后在37 ℃水浴鍋中水浴30 min,煮沸(100 ℃、5 min)滅活后用冷水冷卻 5 min,再加入3 mL DNS溶液,混合均勻后沸水(100 ℃、5 min)水浴,再用冷水冷卻5 min。每組測(cè)定吸光度前用其對(duì)應(yīng)的CK清零后再測(cè)定540 nm處的吸光度,每瓶設(shè)3次重復(fù)。酶活性單位的定義:催化產(chǎn)生1 μg葡萄糖的酶量為1 U[9]。
酶活性(U/mL)=D540 nm×n×1 000/K。
式中:n為稀釋倍數(shù);K為標(biāo)準(zhǔn)曲線斜率。
1.2.3 高產(chǎn)纖維素酶菌株的篩選 將菌株活化后接種至剛果紅初篩平板上,于28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待初篩獲得的高產(chǎn)漆酶菌株活化產(chǎn)孢后,用3層擦鏡紙過(guò)濾獲得孢子,稀釋至1×104 個(gè)/mL,在每瓶培養(yǎng)基(250 mL三角瓶裝量50 mL)中接入1 mL孢子懸液,28 ℃、200 r/min培養(yǎng)5 d后測(cè)定酶活性。
1.2.4 發(fā)酵產(chǎn)酶條件的優(yōu)化
1.2.4.1 碳源的優(yōu)化 對(duì)經(jīng)搖瓶復(fù)篩得到的最佳菌株進(jìn)行培養(yǎng)基的優(yōu)化,其中發(fā)酵培養(yǎng)基的碳源分別取10 g/L羧甲基纖維素鈉、10%葡萄糖、10%淀粉、10%蔗糖進(jìn)行篩選,其余條件不變,發(fā)酵5 d后測(cè)定酶活性,確定最佳碳源。
1.2.4.2 氮源的優(yōu)化 將發(fā)酵培養(yǎng)基的碳源改為最適碳源,分別取2 g/L硝酸鈉、硫酸銨、氯化銨、硝酸銨、蛋白胨進(jìn)行初始發(fā)酵培養(yǎng)基最適氮源的篩選,其余條件不變,發(fā)酵5 d后,測(cè)定酶活性,確定最佳氮源。
1.2.4.3 pH值的優(yōu)化 取最適碳源和氮源,pH值分別設(shè)為3.5、4.0、4.5、5.0、5.5,其余條件不變,發(fā)酵5 d后,測(cè)定酶活性,確定最佳pH值。
1.2.4.4 發(fā)酵培養(yǎng)時(shí)間的優(yōu)化 選擇優(yōu)化后的最佳培養(yǎng)基進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),從培養(yǎng)2 d開(kāi)始,每天測(cè)定1次纖維素酶活性,確定最佳培養(yǎng)時(shí)間。
1.2.4.5 正交優(yōu)化 依據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,選擇碳源、氮源、pH值和生長(zhǎng)時(shí)間,設(shè)計(jì)4因素4水平正交試驗(yàn)[10],采用 L16(44)正交表。
1.2.5 菌種的鑒定
1.2.5.1 形態(tài)學(xué)的鑒定 將菌種TW063-3活化后,接1小塊菌餅到CYA平板上,于28 ℃培養(yǎng)3 d產(chǎn)孢后,挑取少量帶孢子的菌絲置于載玻片上,顯微觀察并拍照。
1.2.5.2 分子生物學(xué)鑒定 DNA提取參照生工生物工程(上海)股份有限公司(Sangon Biotech)DneasyPlant Mini Kit(50)的試劑盒。采用真菌18S rDNA通用引物ITS1f(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)、ITS4R(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)擴(kuò)增ITS(內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū))序列,PCR擴(kuò)增程序:94 ℃ 4 min;94 ℃ 30 s,57 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,33個(gè)循環(huán);72 ℃10 min。經(jīng)生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序后通過(guò)MEGA 7構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。
2 結(jié)果與分析
2.1 高產(chǎn)纖維素酶菌株的篩選
本研究共分離純化164株菌株,通過(guò)初篩獲得6株纖維素酶活性最高的菌株(圖1)。復(fù)篩結(jié)果表明,菌株TW063-3(P=8.73e-10<0.01)的纖維素酶活性最高,為268.2 U/mL。因此,選取TW063-3進(jìn)行后續(xù)研究。
2.2 高產(chǎn)纖維素酶菌株的分類鑒定
2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定 菌株活化后接種于CYA培養(yǎng)基上培養(yǎng)3 d產(chǎn)孢后,挑取菌絲進(jìn)行顯微觀察,結(jié)果見(jiàn)圖2。觀察發(fā)現(xiàn),菌落呈灰綠色,邊緣為白色,多分生孢分散形成許多小菌落(圖2-A);分生孢子梗多次分枝后出現(xiàn)多簇對(duì)稱或不對(duì)稱的小梗,形如掃帚,具有隔膜且多個(gè)分支。分生孢子大多為球形和橢圓形,生長(zhǎng)時(shí)為藍(lán)綠色(圖2-B~圖2-D),因此初步鑒定TW063-3為青霉菌。
2.2.2 分子生物學(xué)鑒定 TW063-3序列通過(guò)NCBI
BLAST進(jìn)行序列比對(duì),通過(guò)MEGA 7的NJ法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。由圖3可以看出,TW063-3與草酸青霉的同源性都為99%,可靠性為100%。綜合形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果,確定TW063-3為草酸青霉(NCBI登錄號(hào):MT020385)。
2.3 產(chǎn)酶條件優(yōu)化
2.3.1 最佳碳源 如圖4所示,以羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)為碳源時(shí),纖維素酶活性最高,為33015 U/mL(P=0.016 7<0.05)。而葡萄糖和淀粉2種碳源產(chǎn)酶活性差異不顯著。因此選擇羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)作為最佳碳源。
2.3.2 最佳氮源 如圖5所示,以硝酸銨為氮源的酶活性與除蛋白胨外其他3種氮源的差異不顯著,但是其生長(zhǎng)量(P=0.004 24<0.01)比其他3種氮源高(圖6)。因此,選擇硝酸銨作為最佳氮源。
2.3.3 最適pH值 pH值為3.5時(shí),酶活性顯著低于其他4種pH值(P=0.000 154<0.01),pH值為4.0的酶活性與pH值4.5、5.0時(shí)差異顯著,pH值為4.5、5.0、5.5的酶活性差異不顯著,其中pH值為5.0時(shí)酶活性最高。因此,選則pH值5.0為產(chǎn)酶的最佳pH值,酶活性為300.9 U/mL(圖7)。
2.3.4 最佳培養(yǎng)時(shí)間 確定該菌株最佳培養(yǎng)基后,從培養(yǎng)2 d開(kāi)始,每天測(cè)定1次菌株所產(chǎn)纖維素酶活性,培養(yǎng)7 d結(jié)束。如圖8所示,TW063-3菌株在培養(yǎng)4 d時(shí)酶活性最高,在培養(yǎng)5 d時(shí)酶活性下降,但是培養(yǎng)6 d又開(kāi)始上升,在培養(yǎng)7 d開(kāi)始小幅度下降。而培養(yǎng)4 d與培養(yǎng)6 d的酶活性差異不顯著,培養(yǎng)6 d與培養(yǎng)3 d的酶活性差異不顯著,培養(yǎng) 2 d 與培養(yǎng)7 d的酶活性差異不顯著,培養(yǎng)4 d的酶活性為300.42 U/mL,高于培養(yǎng)6 d的酶活性。因此, 選擇培養(yǎng) 4 d 作為 TW063-3 產(chǎn)纖維素酶的最
佳培養(yǎng)時(shí)間。
2.3.5 正交優(yōu)化 依據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,選擇羧甲基纖維素鈉(A,設(shè)5、10、15、20 g/L 4個(gè)水平)、硝酸銨(B,設(shè)2、4、6、8 g/L 4個(gè)水平)、pH值(C,設(shè)3、4、5、6 4個(gè)水平)和培養(yǎng)時(shí)間(D,設(shè)3、4、5、6 4個(gè)水平)設(shè)計(jì)4因素4水平正交試驗(yàn),采用 L16(44) 型正交設(shè)計(jì)。正交試驗(yàn)結(jié)果的極差分析表明,影響酶活性的4個(gè)因素排序?yàn)榕囵B(yǎng)時(shí)間(D)>pH值(C)>碳源(A)>氮源(B),對(duì)于A因素,由于k3>k1>k4>k2,所以取A3,同理,B因素取B1,C因素取C1,D因素取D4,其最優(yōu)組合為A3B1C1D4(表1),即產(chǎn)纖維素酶最佳培養(yǎng)基組合為15 g/L羧甲基纖維素鈉+2 g/L硝酸銨,pH值為3.0,培養(yǎng)時(shí)間為6 d。
由于正交極差分析表中培養(yǎng)組合為A1B4C1D4的酶活性最高,因此選取A1B4C1D4、A3B1C1D4的培養(yǎng)條件進(jìn)行驗(yàn)證試驗(yàn)。結(jié)果表明,組合A3B1C1D4的培養(yǎng)條件下培養(yǎng)的TW063-3產(chǎn)生的纖維素酶活性高達(dá)524.4 U/mL。由此,確定培養(yǎng)條件的最佳組合為A3B1C1D4。
3 結(jié)論
纖維素是自然界中分布最廣、產(chǎn)量最大的多糖類物質(zhì),由于其多糖結(jié)合的高聚合性及復(fù)雜性,導(dǎo)致這類最豐富的資源一直無(wú)法得到充分開(kāi)發(fā)利用。
近幾十年來(lái),相關(guān)研究熱點(diǎn)一直集中于如何充分開(kāi)發(fā)利用這類資源[11-12],而篩選1株高產(chǎn)纖維素酶的菌株是纖維素資源充分開(kāi)發(fā)利用的基礎(chǔ)工作,相關(guān)成果將為纖維素的利用奠定理論依據(jù)。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn),細(xì)菌、放線菌與真菌等多種生物都能夠分泌豐富的纖維素復(fù)合酶體系為分解利用纖維素提供能量[13]。其中真菌纖維素酶由于種類全、活性高、作用底物廣等特點(diǎn)被廣泛開(kāi)發(fā)成商業(yè)化的酶系[14]。
本研究從廈門(mén)海灘邊土壤中分離出的1株能夠高效分解纖維素的絲狀真菌TW063-3,通過(guò)一系列形態(tài)學(xué)分析及分子生物學(xué)鑒定,確定該菌株為青霉屬真菌。通過(guò)單因素優(yōu)化結(jié)合正交試驗(yàn)設(shè)計(jì),確定該菌株最佳產(chǎn)纖維素酶培養(yǎng)條件為15 g/L羧甲基纖維素鈉+2 g/L硝酸銨,pH值為3.0,轉(zhuǎn)速為200 r/min,培養(yǎng)時(shí)間為6 d。優(yōu)化后的酶活性比優(yōu)化前提高了34.1%,達(dá)到524.4 U/mL。研究成果為進(jìn)一步研究纖維素酶降解機(jī)制及工業(yè)化發(fā)酵產(chǎn)酶提供一定的理論基礎(chǔ)。
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