周超群,湯石鵬,錢亮亮,甄政安,程如梅
溫州醫(yī)科大學 眼視光學院(生物醫(yī)學工程學院) 納米生物材料研究所,浙江 溫州 325027
正確的蛋白折疊形態(tài)是維持細胞與組織穩(wěn)定生化過程的基礎[1]?;蛲蛔?、應激以及不良的翻譯后修飾常常導致蛋白錯誤折疊[2]。錯誤折疊蛋白的堆積易引發(fā)一系列疾病,例如阿爾茨海默病、亨廷頓病、白內障等[3]。最近,科學家嘗試利用自噬標志物微管相關蛋白1輕鏈3(LC3)作為靶標,設計引導型藥物分子,識別并誘導致病的錯誤折疊蛋白定位到自噬體膜上,利用自噬降解相關致病蛋白,保留結構相近的功能性蛋白,達到治療目的,取得了理想的結果[4]。
本研究將氧蒽酮與腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸反應,得到腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸-氧蒽酮希夫堿(S1),研究其與自噬標志物LC3B的作用,得到二者的結合模式和穩(wěn)定常數(shù),從分子水平上揭示如何通過LC3B的作用來開發(fā)誘導自噬的潛在藥物。
1.1 主要試劑 氧蒽酮、腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸、三乙胺、磷酸系PBS緩沖溶液、乙醇,均由國藥集團上海試劑公司提供。重組人LC3B蛋白(ab103506)購自艾博抗(上海)貿易有限公司。LC3B溶液使用時新鮮配制。所有溶液均用去離子水配制。
1.2 實驗儀器 紫外可見分光光度計(Lamda 35,美國Perkin Elmer公司),熒光光譜儀(AB-series 2 luminescence spectrometer,日本Hitachi High-Technologies公司),元素分析儀(Vario EL III型,德國Elmentar公司)。
1.3 S1的合成 將0.1961 g(1 mmol)氧蒽酮溶解于20 mL無水乙醇中,加入0.3292 g(1 mmol)腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸和0.3 mL冰醋酸,加熱回流450 min,冷到室溫,過濾,收集淺黃色沉淀,分別用水、乙醇、無水乙醚洗滌多次。真空干燥。產率:73%。元素分析:計算值C22H18N5O7P,C 53.34%,H 3.66%,N 14.14%,O 22.61%;測試值:C 53.32%,H 3.86%,N 14.11%,O 22.63%。
1.4 光譜測試 所有測試均在pH 7.4的PBS緩沖溶液中進行,使用時將LC3B新鮮配成濃度為1× 10-4mol/L工作溶液;測試前將LC3B溶液和S1溶液混合后放置160 s,再進行紫外-可見光譜或者熒光光譜測定。反應動力學測定,將LC3B溶液和S1溶液調成所需要的濃度,混合后,間隔一定時間測定 352 nm附近的紫外-可見光譜變化。
2.1 LC3B與S1作用的動力學 圖1為濃度 2.0×10-5mol/L的S1與LC3B作用160 s后的紫外-可見光譜圖。由圖1可見,S1有三個典型的譜峰,分別在239、260、341 nm處。位于大約270 nm處的一個弱而寬的峰,歸屬于LC3B芳基氨基酸殘基的弱的n-π*吸收峰。將濃度相同的S1和LC3B溶液混合,每隔一段時間對體系進行掃描,所得的紫外-可見光譜圖見圖2。從圖可知,在剛開始時S1的紫外-可見光譜處于最上端,加入LC3B后吸光度下降。在160 s之內,隨時間的推移,光譜逐步從341 nm紅移,最后穩(wěn)定在350 nm,吸收強度緩慢下降。
圖1 S1和LC3B相互作用的紫外-可見光譜圖
圖2 S1和LC3B隨時間變化的紫外-可見光譜圖(S1和LC3B濃度均為1.0× 10-5 mol/L)
由一級反應動力學方程和朗伯比爾定律[5],得
式中A0、A分別為S1全部處于自由狀態(tài)下的吸光度和S1與LC3B完全結合后的吸光度(這里取波長為352 nm處的吸光度),At為時刻t時的吸光度,k是反應速率常數(shù)。通過ln(A-A0)對t作圖,可以得到S1與LC3B結合后的反應速率常數(shù)(見圖3、表1)。
表1 LC3B與S1不同比例的反應動力學參數(shù)
圖3 不同[LC3B]/[S1]比例的反應動力學關系圖
2.2 LC3B與S1作用的熱力學研究 圖4顯示在239 nm 激發(fā)下,LC3B在278 nm處有一個很寬的熒光峰,而S1在315 nm發(fā)出較強的熒光,覆蓋了大部分的LC3B譜峰。S1熒光峰隨著LC3B濃度變化(見圖5)的測定結果表明隨著LC3B濃度的增大,S1在315 nm處的熒光峰并沒有成比例提高,反而呈現(xiàn)出下降趨勢。
圖4 S1和LC3B溶液的熒光光譜
圖5 LC3B對S1的熒光滴定圖
從分子相互碰撞能量轉移的角度研究,當熒光體與猝滅劑由于熱運動發(fā)生碰撞時,可引起熒光體的熒光猝滅。這種碰撞猝滅服從Stern-Volmer方 程[6]:
其中F0是自由的S1的熒光強度,F(xiàn)是加入LC3B后的熒光強度,C為LC3B的濃度,Ksv為Stern-Volmer熒光猝滅常數(shù)。從圖6和表2看,S1和LC3B作用符合Stern-Volmer方程。在這樣的情況下,碰撞分子形成復合物的結合常數(shù)K和位點數(shù)n與熒光強度存在以下關系:
圖6 不同溫度下的Stern-Volmer線性圖
綜合Stern-Volmer方程關系,得到表2的Stern-Volmer方程和分子復合物參數(shù)。
表2 LC3B滴定S1的熒光特征參數(shù)
由表2所得到的S1和LC3B結合常數(shù)K可以進一步計算出S1和LC3B結合的熱力學參數(shù)ΔH、ΔS和ΔG:
式中ΔG、ΔH、ΔS分別為吉布斯自由能、焓變及熵變。其結果列于表3。
表3 S1結合到LC3B上的熱力學參數(shù)
藥物分子與蛋白質分子的相互作用包括靜電力、氫鍵、疏水作用力和范德華力。不同類別的作用力將會影響藥物分子與蛋白質結合、藥物代謝、轉運等過程。為此,本研究從分子動力學和熱力學角度去探討與自噬相關的LC3B靶向化合物的作用模式。由圖1紫外-可見光譜可知,S1在239和260 nm處顯示出兩處典型的共軛環(huán)π-π*躍遷峰,290 nm的寬的肩峰為雜環(huán)的n-π*吸收峰,而希夫堿的C=N強烈的n-π*則出現(xiàn)在341 nm處。LC3B只顯示很弱的芳基氨基酸殘基的n-π*吸收峰。通過時間變化觀察LC3B與S1的變化過程,發(fā)現(xiàn)隨著時間的增加S1的C=N吸收峰下降,并逐步紅移,最后平衡在352 nm。說明S1與LC3B作用有一個緩慢的滯后期,時間為 4 min,希夫堿就與LC3B發(fā)生了強烈的作用。且當S1作用于LC3B時,LC3B在反映蛋白質螺旋結構的210 nm處吸光度有所下降,顯示出S1有嵌插進入LC3B主鏈的情況,螺旋結構稍微變松散[7]。改變S1和LC3B濃度比,可以發(fā)現(xiàn)所得的反應速率常數(shù)基 本維持不變,符合準一級反應和藥物的定比轉運規(guī)律[8]。
熒光光譜表明隨著LC3B的加入,S1位于315 nm的熒光發(fā)射峰緩慢下降,而該峰與S1分子中的C=N雙鍵和幾乎共平面的氧蒽酮三環(huán)共軛結構相關[9], 表明S1和LC3B的相互作用的確發(fā)生在希夫堿的碳氮雙鍵上,與紫外-可見光譜的結果一致。S1和LC3B作用符合Stern-Volmer方程,隨著溫度的升高,斜率下降,表明溫度的升高,分子運動增強,并沒有引起熒光猝滅的增強,體系不是動態(tài)猝滅,為靜態(tài)猝滅,二者形成了復合物。且在不同實驗溫度下,Stern-Volmer方程具有良好的線性關系,說明復合物只有一種結合模式。通過方程(3)計算得到S1和LC3B的結合位點數(shù)為1。熱力學結果表明,吉布斯自由能ΔG<0,S1和LC3B的結合為一個自發(fā)的過程。而研究[10]表明,當ΔH<0、ΔS>0,藥物分子與蛋白質之間主要是疏水作用,當ΔH<0、ΔS<0時為典型的氫鍵和范德華力結合,而當ΔH接近0、ΔS>0或者當ΔH<0,忽略ΔS的情況下,主要為靜電作用。結合前述光譜研究和表3,可以發(fā)現(xiàn)S1和LC3B的作用力主要為靜電作用,這種靜電力,影響了C=N上的電子共軛,從而導致熒光猝滅。
綜上所述,本研究合成得到了一種具有LC3B結合綁定功能的腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸-氧蒽酮希夫堿,其與LC3B的結合滿足準一級動力學方程和藥物分子的定比轉運規(guī)律。分子熱力學研究表明二者的結合為靜電作用的結果,S1與LC3B以一種復合物的結合模式存在,結合位點數(shù)為1。