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      利用python/RGB色彩數(shù)據(jù)分析平臺(tái)快速測(cè)定還原糖濃度

      2021-07-27 04:16:08陳慧郝錦亨袁志濤羅佳偉陳胤熹鄭少鵬黎佩瑜呂詠鍶梁世濠賴(lài)林浩曹詩(shī)林
      現(xiàn)代食品科技 2021年7期
      關(guān)鍵詞:光度葡萄糖向量

      陳慧,郝錦亨,袁志濤,羅佳偉,陳胤熹,鄭少鵬,黎佩瑜,呂詠鍶,梁世濠,賴(lài)林浩,3,曹詩(shī)林,3

      (1.佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院食品科學(xué)與工程學(xué)院,廣東佛山 528000)(2.可持續(xù)生物化學(xué)與合成生物工程中心,佛山無(wú)遠(yuǎn)生物科技有限公司,廣東佛山 528000)(3.華南理工大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,廣東廣州 510640)

      食品生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中,包括了對(duì)食品中常見(jiàn)的成分進(jìn)行定量分析的教學(xué)內(nèi)容。食品中糖類(lèi)物質(zhì)與蛋白質(zhì)的含量檢測(cè)是食品檢測(cè)的常見(jiàn)項(xiàng)目,也是食品生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)的一個(gè)重要的部分??梢?jiàn)分光光度法是根據(jù)郎伯比爾定律[1],根據(jù)顏色深淺變化,在特定波長(zhǎng)處測(cè)定被測(cè)物質(zhì)的吸光度,可對(duì)其物質(zhì)進(jìn)行定量分析,具有應(yīng)用廣泛,靈敏性高等優(yōu)點(diǎn)。在這個(gè)方法中,需要使用分光光度計(jì)來(lái)進(jìn)行定量檢測(cè)。然而,普通的分光光度計(jì)不便攜帶、便攜式分光光度計(jì)價(jià)格昂貴。因此,設(shè)計(jì)一種簡(jiǎn)單可行的分析方法,并考察其是否有進(jìn)一步開(kāi)發(fā)為便攜設(shè)備的可能,是一個(gè)很有意思的研究課題。

      基于3,5-二硝基水楊酸(DNS)[2],苯酚硫酸法[3],是經(jīng)典的還原糖的檢測(cè)方法。DNS法的原理是:3,5-二硝基水楊酸溶液與還原糖溶液共熱后被還原成棕紅色氨基化合物,顏色隨濃度變化而變化,隨著濃度增大,顏色加深。

      由于以上兩種方法中,待測(cè)溶液顏色隨待測(cè)樣品濃度變化而呈現(xiàn)一定的規(guī)律,因此,待測(cè)溶液的顏色數(shù)據(jù)有可能與待測(cè)樣品的濃度具有相關(guān)性。如何提取待測(cè)溶液的顏色數(shù)據(jù)是建立上述相關(guān)性的一個(gè)難點(diǎn),其主要在于獲得待測(cè)樣品的圖像,并從中提取出數(shù)據(jù)。RGB色彩體系是一種應(yīng)用極其廣泛的顏色系統(tǒng),利用紅(R)、綠(G)、藍(lán)(B)三個(gè)顏色通道數(shù)據(jù)來(lái)表征所有的顏色特征[4]。通過(guò)數(shù)碼成像方法,可以獲得RGB數(shù)據(jù)。數(shù)碼成像[5]的原理是通過(guò)電荷耦合原件(CCD[6])將色彩信號(hào)轉(zhuǎn)換成電信號(hào)。CCD的色彩信號(hào)由紅綠藍(lán)(RGB[7])三色信號(hào)混合而成。因此,在分析過(guò)程中,通過(guò)讀取被染色溶液中的RGB數(shù)據(jù),并進(jìn)行進(jìn)一步處理,可望在不進(jìn)行分光的情況下,對(duì)樣品的濃度進(jìn)行準(zhǔn)確的測(cè)量。在本課題組前期研究中,利用python腳本建立了在圖片中批量讀取樣品RGB顏色數(shù)據(jù)的方法。因此,本文在此基礎(chǔ)上,進(jìn)行了以下研究:(1)進(jìn)一步開(kāi)發(fā)出了基于RGB的在線分析平臺(tái);(2)進(jìn)而研究了還原糖待測(cè)樣品濃度與RGB數(shù)據(jù)的關(guān)系;(3)研究了還原糖最適圖片分辨率、吸光度和RGB向量三者之間的關(guān)系。最后建立了基于RGB色彩體系的食品中還原糖快速檢測(cè)方法。

      1 材料與方法

      1.1 實(shí)驗(yàn)材料

      無(wú)水葡萄糖為上海伯奧生物科技有限公司產(chǎn)品;3,5-二硝基水楊酸國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司產(chǎn)品;酒石酸鉀鈉為天津市福晨化學(xué)試劑廠。

      1.2 儀器

      酶標(biāo)儀為BioTek Instruments,Inc公司產(chǎn)品;水浴鍋為鞏義市予華儀器有限責(zé)任公司產(chǎn)品;電子天平為上海浦春計(jì)量?jī)x器有限公司產(chǎn)品;掃描儀為精工愛(ài)普生公司產(chǎn)品。

      1.3 實(shí)驗(yàn)方法

      1.3.1 基于python的RGB色彩分析模塊的思路

      本文自行設(shè)計(jì)了一個(gè)用于自動(dòng)批量抓取顏色數(shù)據(jù)的腳本,具體的設(shè)計(jì)思路如下:先本研究利用96孔板作為裝載待測(cè)溶液的容器。由于96孔板中每一個(gè)圓孔中心與相鄰圓孔中心距離相同,在圖像中圓孔中心與相鄰圓孔中心的距離以像素來(lái)計(jì)算也是一定的。因此,通過(guò)python腳本程序讀取特定中心點(diǎn)像素區(qū)域的RGB值,可獲得待測(cè)液顏色數(shù)據(jù)。

      首先設(shè)置兩個(gè)字符集,分別命名為Charset X和CharsetY。Charset X用于記錄酶標(biāo)板短板的像素位置(8列),CharsetY用于記錄酶標(biāo)板長(zhǎng)板的像素位置(12行)。以每個(gè)中心點(diǎn)為基準(zhǔn),±n個(gè)像素的x和y的區(qū)域?yàn)閿?shù)據(jù)讀取區(qū)域。

      數(shù)據(jù)讀取的順序是先讀中心點(diǎn)(x1,y1)至(x1,y12),再按順序讀x2的y1-y12,如此類(lèi)推讀至x8的y1-y12。故每次最多能讀取96組樣品數(shù)據(jù)。

      利用skimage數(shù)字圖片處理包抓取每個(gè)數(shù)據(jù)區(qū)域平均的RGB數(shù)據(jù)值,輸出后進(jìn)行分析。

      利用1.3.1中的python腳本對(duì)掃描得到的圖片進(jìn)行分析,通過(guò)運(yùn)行該程序一次性讀取所有樣品的RGB顏色數(shù)據(jù),最后將所得的RGB顏色數(shù)據(jù)與待測(cè)溶液的濃度、吸光度進(jìn)行整合、分析,建立其三者之間的內(nèi)在聯(lián)系,同時(shí)探究出最適的樣品取樣量以及最適圖片分辨率。

      1.3.2 在線分析平臺(tái)的建立

      在線分析平臺(tái)上,由圖1可知,RGB模塊的工作流程為:(1)客戶(hù)端通過(guò)網(wǎng)絡(luò)界面上傳需要讀取的圖片文件(tiff格式)與XY軸坐標(biāo)文件(csv格式),隨后提交計(jì)算請(qǐng)求。(2)服務(wù)器收到請(qǐng)求后通過(guò)Thinkphp框架調(diào)用RGB腳本進(jìn)行計(jì)算,最后通過(guò)Linux自帶的壓縮打包命令來(lái)實(shí)現(xiàn)輸出文件的整理壓縮。本分析平臺(tái)已部署在互聯(lián)網(wǎng),用戶(hù)可登陸以下網(wǎng)址使用:https://atomevo.com/。

      圖1 RGB分析模塊流程圖Fig.1 The flow-process diagram of RGB analysis module

      1.3.3 DNS試劑的制備

      用電子天平精確稱(chēng)取1 g 3,5-二硝基水楊酸于100 mL燒杯中,加入20 mL 1 mol/L NaOH溶液和50 mL蒸餾水,再加30 g酒石酸鉀鈉,攪拌溶解,冷卻后加蒸餾水定容至100 mL,貯于棕色瓶中備用。

      1.3.4 葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制和稀釋

      將無(wú)水葡萄糖充分溶解于蒸餾水,配制成1 mg/mL的葡萄糖標(biāo)曲溶液。隨后各取0、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6、1.8 mL于10個(gè)相同的比色管中,編號(hào)0~9(葡萄糖含量分別為0、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6、1.8 mg),向其中補(bǔ)充蒸餾水至2 mL。

      1.3.5 繪制葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線

      向上述的每支比色管中均加入1.5 mL DNS,充分搖勻后在沸水浴中準(zhǔn)確加熱5 min,隨后冷卻至室溫,用蒸餾水定容至10 mL,加塞后顛倒混勻.依次取各葡萄糖濃度的待測(cè)溶液200、150、100 μL于96孔板,使用酶標(biāo)儀在520 nm波長(zhǎng)處測(cè)定其吸光度,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到葡萄糖濃度與吸光度之間的關(guān)系。

      1.3.6 數(shù)碼成像

      將上述裝載好待測(cè)溶液的96孔板放置在掃描儀中,分別在150、300、600、1200 dpi下進(jìn)行掃描,使樣品成像。

      1.3.7 探究不同掃描樣品量以及不同圖片分辨率對(duì)對(duì)RGB顏色分析法檢測(cè)效果的影響

      利用1.3.2中在線分析平臺(tái)上的RGB分析模塊對(duì)上述掃描所得的tiff格式圖片進(jìn)行快速檢測(cè)分析,獲取葡萄糖濃度、葡萄糖吸光度與RGB向量數(shù)據(jù),在不同條件下建立三者之間的內(nèi)在聯(lián)系,探究不同掃描樣品量以及不同圖片分辨率對(duì)對(duì)RGB顏色分析法檢測(cè)效果的影響,從而得到最適樣品取樣量和最適圖片分辨率。

      1.3.8 樣品前處理

      樣品處理:準(zhǔn)確稱(chēng)取0.5 g蘋(píng)果放置在研缽中,充分研磨。隨后轉(zhuǎn)移至燒杯,加入100 mL蒸餾水并混勻,將待測(cè)樣品溶液在3000 r/min條件下離心5 min之后,上清液置于陰暗干燥處備用。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 Magical-RGB計(jì)算平臺(tái)的構(gòu)建及使用說(shuō)明

      在RGB模塊中,首先需要準(zhǔn)備輸入文件,包括圖片(***.tiff)與圖片的坐標(biāo)(***.csv),選擇文件之后點(diǎn)擊上傳到服務(wù)器,之后點(diǎn)擊執(zhí)行計(jì)算等待輸出的文件。任務(wù)完成之后可以在處理結(jié)果一欄對(duì)輸出文件(allFile.zip)進(jìn)行下載以獲得輸出的結(jié)果,界面與結(jié)果可見(jiàn)圖2。

      圖2 Magical-RGB模塊Fig.2 The module between magical and RGB

      2.2 利用在線分析平臺(tái)進(jìn)行葡萄糖的快速檢測(cè)

      由圖3可知,葡萄糖濃度與葡萄糖在波長(zhǎng)為520 nm下吸光度值呈現(xiàn)出良好的線性關(guān)系。因此接下來(lái)需要驗(yàn)證在何種條件下,其葡萄糖濃度或吸光度與RGB向量之間的關(guān)系也呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,從而建立三者之間的內(nèi)在聯(lián)系,嘗試更加便捷,高通量的檢測(cè)方法。

      圖3 葡萄糖濃度-葡萄糖吸光度之間的關(guān)系Fig.3 The relationship between glucose concentration and glucose absorbance

      2.2.1 樣品取樣量對(duì)RGB顏色分析法檢測(cè)效果的影響

      在探究具體條件對(duì)RGB顏色數(shù)據(jù)的影響之前,將裝載待測(cè)樣品的96孔板放置在掃描儀中,通過(guò)改變不同掃描條件可得到類(lèi)似如圖4所示的圖片,隨后用Python程序腳本對(duì)該圖片進(jìn)行讀取和分析RGB顏色數(shù)據(jù),探究出最適的成像條件。

      圖4 掃描樣品圖Fig.4 Scanning sample map

      根據(jù)表1可知,在葡萄糖濃度相同,圖片分辨率為150 dpi,而樣品取樣量不同的條件下,葡萄糖濃度與RGB向量可以呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,但擬合系數(shù)R2因樣品取樣量的不同而有所差異,結(jié)果表明,當(dāng)樣品取樣量為100 μL時(shí),所得曲線擬合系數(shù)最大,達(dá)0.9858。根據(jù)表2可知,在上述相同的條件下,葡萄糖吸光度與RGB向量也能呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系。同樣在100 μL條件下擬合系數(shù)最大,達(dá)0.9870。

      表2 葡萄糖吸光度-RGB向量之間的關(guān)系Table 2 The relationship between Glucose absorbance and RGB vectors

      2.2.2 最適圖片分辨率對(duì)RGB顏色分析法檢測(cè)效果的影響

      在探究出最適樣品取樣量為100 μL后,只改變掃描時(shí)的圖片分辨率,分析數(shù)據(jù)可得表1。由此可知,葡萄糖濃度與RGB向量仍然可呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,且當(dāng)圖片分辨率為1200 dpi時(shí),所得曲線擬合系數(shù)最大,達(dá)0.9957。

      表1 葡萄糖濃度-RGB向量之間的關(guān)系Table 1 The relationship between Glucose concentration and RGB vectors

      在上述條件不變情況下,分析葡萄糖吸光度與RGB向量之間的關(guān)系,從表2中可以看出兩者之間能呈線性關(guān)系,同樣在1200 dpi時(shí)擬合系數(shù)最大,達(dá)0.9953。

      通過(guò)以上兩組實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的相互對(duì)比,可以得出在樣品取樣量為100 μL,圖片分辨率為1200 dpi時(shí),葡萄糖濃度、吸光度、RGB向量三者之間均能呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系。通常,圖片分辨率越大,通過(guò)掃描儀掃描得到的圖片清晰度更高,更能準(zhǔn)確的反映待測(cè)樣品溶液的顏色,因此所得到的RGB顏色數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確。

      2.2.3 平行實(shí)驗(yàn)的探究

      為了增強(qiáng)本研究方法的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性,在探究出最適成像條件后,同時(shí)進(jìn)行了7組平行實(shí)驗(yàn)。將各測(cè)點(diǎn)RGB向量分別取平均值,計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)偏差及變異系數(shù),按下式計(jì)算合并變異系數(shù)MCV%[8]。

      式中:j為測(cè)定點(diǎn)數(shù),n為測(cè)定次數(shù)。

      表3 平行實(shí)驗(yàn)的變異系數(shù)Table 3 Coefficient of variation in parallel experiments

      2.2.4 RGB色彩數(shù)據(jù)分析法與紙上熒光數(shù)碼成像法的比較

      對(duì)本文研究的RGB色彩數(shù)據(jù)分析法與紙上熒光數(shù)碼成像法[9]。進(jìn)行了比較,經(jīng)過(guò)對(duì)比可知,紙上熒光數(shù)碼成像法具有試劑消耗量少,成本低廉的特點(diǎn)。但RGB色彩數(shù)據(jù)分析法檢測(cè)所需的材料更少,RGB色彩數(shù)據(jù)法只需要一張圖片即可對(duì)其進(jìn)行RGB快速檢測(cè)。因此在追求快速檢測(cè)的測(cè)定中,RGB色彩數(shù)據(jù)分析法更具有優(yōu)勢(shì)。

      2.2.5 RGB色彩數(shù)據(jù)分析法與紫外分光光度法法在實(shí)際應(yīng)用中的比較

      蘋(píng)果中還原糖的測(cè)定:分別吸取0.2 mL樣品待測(cè)液于兩個(gè)10 mL比色管中,用蒸餾水補(bǔ)齊至2 mL,隨后各加入1.5 mL DNS,充分搖勻后在沸水浴中準(zhǔn)確加熱5 min,隨后冷卻至室溫,用蒸餾水定容至10 mL,加塞后顛倒混勻。吸取待測(cè)溶液100 μL于96孔板,使用酶標(biāo)儀在520 nm波長(zhǎng)處測(cè)定其吸光度。將上述裝有待測(cè)樣品的96孔板在1200 dpi條件下掃描得到tiff格式圖片。利用在線分析平臺(tái)分析得到葡萄糖濃度并與紫外分光光度法測(cè)得的葡萄糖濃度進(jìn)行對(duì)比,如表4所示。

      表4 RGB分析方法與分光光度法測(cè)定蘋(píng)果中還原糖含量的比較Table 4 Comparison of reducing sugar content in appledetermined by RGB analysis method and spectrophotometry

      3 結(jié)論

      本文探討了食品生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中還原糖分析的新方法,利用RGB色彩空間原理,建立了一個(gè)基于RGB色彩體系中的食品中還原糖的快速檢測(cè)方法。該方法在RGB-PYTHON檢測(cè)方法中已經(jīng)取得一定的成果,包括獲得2020年廣東省大學(xué)生生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)技能大賽一等獎(jiǎng)、2020年第五屆全國(guó)大學(xué)生生命科學(xué)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽創(chuàng)新組一等獎(jiǎng)。本研究嘗試了在不同檢測(cè)的條件下,使用在線分析平臺(tái)的RGB分析模塊分析葡萄糖濃度,吸光度和RGB向量三者之間的關(guān)系。結(jié)果表明,葡萄糖濃度和RGB向量呈現(xiàn)良好的線性相關(guān),說(shuō)明本研究用RGB向量表征物質(zhì)的濃度的設(shè)想是可行的。目前,該方法仍然有進(jìn)一步改進(jìn)的空間,比如通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)方法降低數(shù)據(jù)區(qū)域選取時(shí)由于圖像色澤不均勻帶來(lái)的檢測(cè)不確定性、通過(guò)設(shè)計(jì)更好的用戶(hù)圖形界面(GUI)增加該分析平臺(tái)的易用性。相關(guān)技術(shù)還有進(jìn)一步拓展的空間,可以通過(guò)顯色反應(yīng)或者分光光度法進(jìn)行檢測(cè)的物質(zhì)比如蛋白質(zhì),也使用本方法和分析模塊,從而開(kāi)發(fā)出更多簡(jiǎn)便、靈敏的食品檢測(cè)方法。

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