李墨釗,熱米拉·阿扎提,鄭曉冬,周文文*
(1浙江大學(xué)生物系統(tǒng)工程與食品科學(xué)學(xué)院 杭州 310058 2華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院 武漢 430070)
新疆奶疙瘩是一類歷史悠久的結(jié)晶狀發(fā)酵酸奶,風(fēng)味獨特,營養(yǎng)價值豐富,可加速人體代謝,提升人體抵抗力及提供維生素和礦物質(zhì),成為深受哈薩克族和維吾爾族等少數(shù)民族喜愛的傳統(tǒng)食品。乳酸菌作為食品發(fā)酵中的重要微生物,是乳制品生產(chǎn)過程中的優(yōu)勢菌種。作者對新疆奶疙瘩開展研究,從中分離出多種乳酸菌,通過特定生化指標的測定篩選出有益生特性的優(yōu)質(zhì)乳酸菌資源[1]。課題組阿扎提等[2]對奶疙瘩中相關(guān)菌株進行分離純化,篩選獲得鼠李糖乳桿菌(Lactobacillus rhamnosus)R4 和瑞士乳桿菌(Lactobacillus helveticus)S4 等代表性菌株。秀麗隱桿線蟲具有生命周期短,易于培養(yǎng)和與哺乳動物的高相似性等特征,可作為益生菌動物模型建立的良好材料,一直被認為是人體衰老領(lǐng)域研究的首選模式生物[3]。
本試驗選用奶疙瘩樣品,對其含有的益生菌進行高通量測序,研究其菌群多樣性,確定優(yōu)勢菌群。前期對不同益生菌種的耐酸耐膽鹽、疏水性、抑菌性及抗氧化等生化特性進行測定,從中分離篩選得到具有良好益生特性的菌株鼠李糖乳桿菌R4。本文以秀麗隱桿線蟲為研究模型,研究R4 對其正常生理、生化指標(線蟲壽命、產(chǎn)卵量、運動能力、熱應(yīng)激和氧化應(yīng)激抵抗能力)的影響,探究R4的抗衰老作用,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析其延壽機制,為進一步開發(fā)高效微生態(tài)制劑奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 原料與試劑 奶疙瘩樣品來自新疆維吾爾族自治區(qū)5 個地區(qū)(烏魯木齊市、伊犁市、塔城市、阿泰勒地區(qū)和石河子南山地區(qū)) 的牧民家庭(圖1),制作工藝采取家庭式傳統(tǒng)方法發(fā)酵,輸送途中用冰袋保藏,在實驗室中4 ℃保存。
圖1 來源于新疆不同區(qū)域的5 個奶疙瘩樣品Fig.1 Five samples of milk knots from different regions in Xinjiang
瓊脂糖、蛋白酶K、MgCl2、Platinum-DNApolymerase、dNTP-mix、PCR Buffer I、Chelex 裂解液、脫脂乳、M9 緩沖溶液、線蟲凍存緩沖液、S medium、同期化漂白液、NGM 培養(yǎng)基、LB 培養(yǎng)基,杭州索萊爾博奧生物技術(shù)有限公司。鼠李糖乳桿菌R4(L.rhamnosus R4),本實驗室分離保存。大腸桿菌(E.coli )OP50 和野生型秀麗隱桿線蟲(C.elegans Bristol)N2 株,浙江大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院杜愛芳教授惠贈。
1.1.2 主要設(shè)備與儀器 MLS-3750 型全自動滅菌鍋,日本Sanvo 公司;電子天平,德國Sartotious公司;AF-100 型離心機,中國湘儀集團;Research plus 8 道移液器,德國Eppendorf 公司;WB-14 恒溫水浴鍋,德國Memmert 公司;Spectra mas Plus 384 型酶標儀,美國MD 公司;AF-100 型制冰機,上海Scotsman 公司;HiSeq 2000 型Illumina 測序儀,美國Illumina 公司;PTC-225Thermal PCR 儀,美國伯樂(Bio-Rad) 公司;StepOne 型定量PCR儀,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)(ABI)公司;LRH-250 型培養(yǎng)箱,上海一恒科技有限公司;U-RFL-T 型光學(xué)顯微鏡,日本Olympus 公司。
1.2.1 基因組DNA 的提取 采用SDS-CTAB 法提取樣品中菌種宏基因組DNA,通過紫外分光光度法測定其濃度,瓊脂糖凝膠電泳判斷其分子質(zhì)量,加入無菌水稀釋至樣品質(zhì)量濃度為1 ng/μL。
1.2.2 16 S rRNA V4 區(qū)、18S rRNA V4 及V9 區(qū)的PCR 擴增及高通量測序 以稀釋后的基因組DNA 為模板,對16S rRNA V4 區(qū)、18S rRNA V4及V9 區(qū)進行PCR 擴增。引物使用帶Barcode 的特異引物,對應(yīng)區(qū)域:ITS1 區(qū)引物是ITS1-5FITS2;ITS2 區(qū)引物是ITS2-3F-ITS2-4;16S V4 區(qū)引物是515F-806R;18S V4 區(qū)引物是528F-706R;18S V9 區(qū)引物是1380F-1510R。使用PCR反應(yīng)預(yù)混液Phusion?High-Fidelity PCR Master Mix with GC Buffer(New England Biolabs 公司)擴增。PCR 過程中使用高效酶,以保證反應(yīng)的擴增效率和準確性。
按照高通量測序標準流程進行測試,構(gòu)建PCR 產(chǎn)物文庫,通過DNA 測序儀IUumina HiSeq 2000 對其進行雙末端測序。為確保reads 的高質(zhì)量,去除低復(fù)雜度、低質(zhì)量序列及接頭序列,得到clean reads,通過Overlap 拼接軟件SOAP denovoV.1.0(華大自主產(chǎn)權(quán))進行Overlap 拼接[4]。加入兩端PCR 引物并確保引物3’端保守,處理后得到拼接后一致的序列,形成tag 序列并通過Mothur軟件統(tǒng)計其豐度[5]。
1.2.3 線蟲的同期化 秀麗隱桿線蟲在NGM 培養(yǎng)基經(jīng)72 h 以上的培育,部分轉(zhuǎn)移成熟蟲體至新平板開始培育、產(chǎn)卵。用5 mL M9 緩沖液洗至離心管中,1200 r/min 離心3 min,倒去上清。加入5 mL 新配的同期化漂白液,激烈振蕩3 min,再次離心2 min,倒去上清。重復(fù)第1 步離心操作3 次,保留最后一次上清液2 mL,搖勻后轉(zhuǎn)入不含大腸桿菌OP50 的平板中,20 ℃靜置過夜后接種至NGM培養(yǎng)基。20 ℃培養(yǎng)20 d,此時線蟲受精卵發(fā)育至L4 期,同期化完成。
1.2.4 線蟲壽命及產(chǎn)卵、運動、氧化應(yīng)激和熱應(yīng)激等表觀性狀 將線蟲分為對照組和給藥組。OP50為對照組,鼠李糖乳桿菌(L.rhamnosus)R4 為實驗組,每組100 條。每天將其轉(zhuǎn)移到新板上,20 ℃培養(yǎng)。當(dāng)成蟲不再產(chǎn)卵后,每2 d 挑取線蟲1 次,直到線蟲全部死亡時停止,使用軟件SPSS 16.0分析數(shù)據(jù)[6]。重復(fù)壽命實驗3 次,繪制圖表。
將等數(shù)目同期化的對照組和實驗組線蟲挑取到各自平板中,每個平板1 條,產(chǎn)卵后以12 h 為周期轉(zhuǎn)移,直至線蟲不再具有生殖能力。培養(yǎng)所有留有線蟲的平板,統(tǒng)計蟲卵孵化至L4 期的成蟲數(shù)量,即待測線蟲的產(chǎn)卵量。
隨機選取對照組和實驗組中的線蟲,以4 d為1 個周期培養(yǎng),以其1 min 內(nèi)運動的次數(shù)作為擺動頻率的計數(shù)依據(jù),分別記錄2 組線蟲的擺動頻率數(shù)據(jù),觀測其運動能力。
將同期化至L4 的線蟲分為對照組和實驗組,每組有30 條,分別喂食大腸桿菌OP50 和乳酸菌,3 d 后將其轉(zhuǎn)入溶液濃度為20 mmol/L 的過氧化氫中靜置2 h,隨后將線蟲挑到NGM 培養(yǎng)基上,將培養(yǎng)基放在培養(yǎng)箱內(nèi)20 ℃處理16 h,每小時統(tǒng)計線蟲存活率,測定抗氧化應(yīng)激能力[7]。重復(fù)實驗3 次。
同期化對照組和實驗組線蟲至產(chǎn)卵期,各取出30 條轉(zhuǎn)移至NGM 培養(yǎng)基(含OP50)中35 ℃熱敷16 h 以上,統(tǒng)計其存活情況,分析線蟲抗熱激能力。當(dāng)線蟲對機械性刺激不再產(chǎn)生反應(yīng)時,記錄為已死亡[8]。
線蟲成熟后再持續(xù)培養(yǎng)48 h,實驗組加入乳酸菌,對照組加入大腸桿菌OP50。2 組線蟲使用M9 緩沖液洗滌,冷凍、離心、冰浴破碎,提取上清液。SOD 酶活、CAT 酶活、MDA 含量用對應(yīng) 的SOD、CAT 和MDA 檢測試劑盒測定。
1.2.5 轉(zhuǎn)錄組重測序與實時定量PCR 分析 對提取的線蟲樣本RNA 使用DNA 聚合酶I 處理DNA 后用含有Oligo(dT)的磁珠對其mRNA 進行富集;添加打斷試劑,將mRNA 打斷成許多短片段,以這些短片段為模板合成一鏈cDNA;隨后配制相應(yīng)反應(yīng)體系以合成二鏈cDNA,經(jīng)純化回收,修復(fù)黏性末端,cDNA 的3’端添加腺嘌呤“A”,連接接頭,篩選片段大小,進行PCR 擴增反應(yīng),構(gòu)建cDNA 文庫;對構(gòu)建好的文庫進行質(zhì)檢和測序[9]。將過濾后的數(shù)據(jù)比對到參考基因組上,得到新轉(zhuǎn)錄版本,將其加入?yún)⒖蓟蛐蛄蝎@得完整的參考序列,計算基因表達水平。參考KEGG 注釋情況和官方分類,對差異基因在代謝通路上進行分類,聚集表達相近的基因成類,用R 軟件phyper 函數(shù)富集分析差異基因,研究其作用及其所在信號通路。
對提取的線蟲總RNA 進行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,對照已知秀麗隱桿線蟲的衰老相關(guān)基因,對照Wormbase 及GenBank 中的序列用Primer 軟件設(shè)計引物,按照熒光定量PCR 反應(yīng)預(yù)混液Platinum SYBR Green qPCR Super Mix-UDG with ROX(Invitrogen 公司)試劑盒的方法進行實時定量PCR。
1.2.6 數(shù)據(jù)處理 實驗重復(fù)3 次,取平均值,使用SPSS 16.0 軟件,通過方差分析進行統(tǒng)計學(xué)檢驗。全部實驗數(shù)據(jù)表示為±s,當(dāng)P<0.05 時具統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1.1 樣品細菌總PCR 擴增結(jié)果 5 個樣品細菌總DNA 經(jīng)PCR 擴增,進行2%瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果見圖2。其中RS1.1、RS1.2、RS1.3、RS1.4 和RS1.5 分別由條帶4,5,6,16 及17 表示,5 個樣品的條帶均清晰明亮。測定樣品的密度分布大于50 ng/μL,總量大于100 μL,說明樣品符合測試要求,可進一步實驗。
圖2 16S rDNA V6 區(qū)PCR 擴增產(chǎn)物電泳圖Fig.2 PCR products of V6 region in 16S rDNA
2.1.2 高通量測序結(jié)果分析 5 個奶疙瘩樣品經(jīng)測序得到3.10 Gb 原始數(shù)據(jù),對5 個樣品的全部Effective Tags 序列聚類成為OTUs,并對tags 序列去冗余,選出unique tags 序列[10]。根據(jù)物種注釋特征,對比這5 個樣品序列,比較16S rDNA V6 區(qū)域的初始數(shù)據(jù)和獲得的tags 結(jié)果,發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)選出的unique tags 序列處于“屬”這一分類單元。選出最大相對豐度前10 名的屬對應(yīng)OTUs 的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的數(shù)據(jù)和對應(yīng)OTUs 的相對豐度信息(圖3)。測序結(jié)果表明奶疙瘩樣品中的鏈球菌屬(Streptococcus)、假單胞屬(Pseudomonas)、乳球菌屬(Lactococcus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)為其優(yōu)勢菌群。其中,在除RS1.1 樣品外的4 個樣品中乳酸菌屬均為優(yōu)勢菌,即:乳酸菌在RS1.2 樣品中有34.10%,在RS1.3 中有17.93%,在RS1.4 中達54.53%,在RS1.5 中也達40.05%。對比5 個樣品菌群含量,推測RS1.1 中高含量的假單胞菌屬可能是在家庭作坊生產(chǎn)時被污染產(chǎn)生的。
圖3 OTUs 豐度聚類圖Fig.3 Operational taxonomic units abundance clustering diagram
2.2.1 鼠李糖乳桿菌R4 的性質(zhì) 前期研究[2]表明,鼠李糖乳桿菌R4 為樣品中乳桿菌屬中功效優(yōu)良的益生菌。在pH 3.0 和0.3%膽鹽濃度條件下分別處理3 h 后,鼠李糖乳桿菌R4 分別具有87.1%和74.9%的存活率,最高的抗氧化活性,對膽固醇和甘油三酯降解率高達50.97%[11]。基于其優(yōu)良性質(zhì)對R4 飼喂的線蟲在不同條件下實驗,進一步探究R4 的功效。
2.2.2 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲產(chǎn)卵量和運動能力的影響 線蟲的產(chǎn)卵量和運動能力可作為線蟲壽命的相關(guān)指標,用于全面評價乳酸菌對其的抗衰老作用。產(chǎn)卵為線蟲機體生長發(fā)育的有效生物指標之一。實驗中,將秀麗線蟲分別放在涂有R4和大腸桿菌OP50 兩種菌株的已滅活組、活菌和上清液的NGM 培養(yǎng)基上培養(yǎng),60 h 后分別計數(shù)各培養(yǎng)基中線蟲的產(chǎn)卵數(shù)(圖4)。飼喂R4 活菌的實驗組線蟲產(chǎn)卵數(shù)量為347.2±4.53,而飼喂OP50 活菌的對照組的產(chǎn)卵量為315.4±8.99。飼喂滅活R4 菌株的實驗組產(chǎn)卵量為323.5±3.61,對照組的產(chǎn)卵量為306.2±5.90。上述結(jié)果表明,R4 菌株的3 種處理方式均對線蟲的生殖系統(tǒng)沒有產(chǎn)生明顯影響,反而有一定的促進作用。
圖4 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲產(chǎn)卵量的影響Fig.4 Effect of L.rhamnosus R4 on nematodes brood sizes
線蟲的肌肉功能強、弱可由其運動狀態(tài)測定,其運動能力隨年齡增長而下降,于是將8日齡秀麗線蟲的壽命作為指標,探究R4 對其運動能力的影響[11]。線蟲運動軌跡見圖5,身體擺動頻率的測定結(jié)果顯示:實驗組中喂食R4 的線蟲在20 s 內(nèi)身體擺動頻率為11.73±1.82,均大于對照組(OP50)11.35±0.91,然而無顯著性差異。在第8~12天內(nèi),與對照組相比,實驗組秀麗線蟲的運動能力和活躍程度顯著增強,死亡數(shù)量顯著降低(圖6)。運動能力的減弱會導(dǎo)致線蟲需要的能量減少和呼吸水平降低,進而氧化損傷減少,這說明R4 延緩線蟲衰老。
圖5 線蟲的運動軌跡(放大為25 倍)Fig.5 The actions of C.elegans(at 25×magnification)
圖6 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲運動能力的影響Fig.6 Effect of L.rhamnosus R4 on the movements of C.elegans
2.2.3 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲壽命的影響 前面研究表明,鼠李糖乳桿菌R4 與大腸桿菌OP50飼喂組相比,R4 飼喂蠕蟲的平均壽命增加,R4供體蟲的壽命為(31.05±0.54)d,比對照蟲的壽命(22.81±0.62)d 長36.1%[2]。本研究對反映線蟲存活能力的重要指標——熱激壽命和氧化應(yīng)激壽命進行探討。在抗熱激實驗中,與對照組的(8.34±1.51)h 相比,R4 明顯延長了線蟲的平均壽命至(12.55±0.68)h。線蟲對過氧化氫導(dǎo)致的氧化損傷的耐受能力也明顯升高39.9%,其平均壽命達(9.78±1.86)h,延緩壽命趨勢明顯(圖7)。在壓力條件下,鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲的抗氧化應(yīng)激能力的顯著提高可能是其對延緩線蟲壽命的機制之一[12],這說明在不良環(huán)境下,奶疙瘩中乳酸菌對線蟲有一定的保護作用。
圖7 不同條件下鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲平均壽命的影響Fig.7 Effects of different conditions on the lifespan of C.elegans with L.rhamnosus R4
2.2.4 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲生化指標的影響SOD 與CAT 的表達同線蟲抵御環(huán)境氧化應(yīng)激相關(guān)。用R4 處理后的秀麗線蟲體內(nèi)SOD 與CAT等抗氧化酶的活力顯著提高(圖8),這印證了R4能夠增強線蟲抵御環(huán)境氧化應(yīng)激能力的結(jié)果,說明其通過提高線蟲體內(nèi)SOD 和CAT 等的酶活來提高其抗氧化應(yīng)激水平。對比對照組CAT 酶活(33.57±4.52)U/mg,R4 活菌處理組中CAT 酶活明顯提高到(47.43±0.85)U/mg;上清液處理組中CAT 酶活(23.01±2.87)U/mg 雖比對照組OP50(25.63±3.46)U/mg 稍有減少,但差異不顯著。而R4 滅活組CAT 酶活與OP50 對照組相比大幅降低,表明R4 活菌的CAT 酶活力最強。從圖8可以發(fā)現(xiàn),喂食R4 活菌、上清液和滅活菌體等3 種處理組的線蟲體內(nèi)MDA 含量均顯著降低,表明鼠李糖乳桿菌R4 具有抗脂質(zhì)過氧化的作用。
圖8 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲體內(nèi)生化指標的影響Fig.8 Effects of L.rhamnosus R4 on antioxidative enzymes of C.elegans
轉(zhuǎn)錄組測序顯示,飼喂鼠李糖乳桿菌R4 的線蟲體內(nèi)出現(xiàn)大量與編碼壽命相關(guān)蛋白的基因和次級代謝通路基因轉(zhuǎn)錄變化。這其中影響線蟲壽命的蛋白為乙酰輔酶A 脫氫酶(acdh-1)、卵黃原蛋白(vit-4)、脂肪酸脫氫酶(fat-7)和脂肪酸結(jié)合蛋白等。同時,線蟲在一定濃度的R4 影響下氧化還原,與物質(zhì)代謝的相關(guān)基因也受到影響,主要有:過氧化氫酶(ctl-1)、3-羥酰-輔酶A 脫氫酶(hacd-1)、超氧化物歧化酶(sod-3)、飲食限制下調(diào)蛋白(drd-1)、水化酶(ech-7)以及脂肪酸結(jié)合蛋白(fat-5)。此外,秀麗線蟲體內(nèi)daf-16 基因的表達水平出現(xiàn)明顯上調(diào)(6.12 倍),其在胰島素信號通路中起關(guān)鍵作用。鼠李糖乳桿菌R4 能抑制水化酶和乙酰輔酶A 脫氫酶(Enoyl-CoA Hydratase和Acyl CoA Dehydrogenase) 等合成基因的表達(E 值均為0)。
隨機對線蟲體內(nèi)與抗衰老有關(guān)的基因進行RT-PCR 測試,以增強測序結(jié)果的可信性,發(fā)現(xiàn)顯著影響的6 個基因,如圖9所示。在氧化應(yīng)激條件下,以管家基因gpd-1 為內(nèi)參,用R4 處理的線蟲體內(nèi)sod-3、hsp-16.2、ctl-1 和daf-16 基因的mRNA 水平均明顯升高。該實驗表明在氧化應(yīng)激條件下,R4 在激活線蟲表達sod-3 的同時,也顯著上調(diào)熱激蛋白hsp-16.2 的表達量。sod-3 基因編碼的蛋白具有清除生物體內(nèi)過量的超氧化物自由基的功能,可以阻止細胞的氧化損傷;熱激蛋白在生長溫度過高時幫助新合成的肽鏈正確折疊、伸展以發(fā)揮正常功能,保持生物活性,防止蛋白質(zhì)變性,有效避免細胞受到熱損傷。研究結(jié)果表明:在氧化應(yīng)激條件下,鼠李糖乳桿菌R4 可通過daf-16轉(zhuǎn)錄因子的激活促進下游sod-3 基因的激活,使細胞獲得氧化應(yīng)激保護。
圖9 鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲體內(nèi)與衰老相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平的影響Fig.9 Influences of L.rhamnosus R4 on the mRNA expression of ageing-associated genes in C.elegans
daf-2 基因主要負責(zé)線蟲體內(nèi)壽命延長和發(fā)育停滯的調(diào)控,與能量攝取緊密聯(lián)系,被認為作用于胰島素信號通路的下游抑制daf-16 表達[13]。然而,實驗結(jié)果顯示,daf-2 對daf-16 沒有產(chǎn)生抑制作用,說明R4 并非直接抑制daf-2 來激活daf-16,同時說明R4 對daf-2 的影響較小,對daf-16的影響較大。由此可推斷鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲壽命的調(diào)控可能依賴于daf-16/FOXO 信號通路,通過激活通路下游抵抗壓力的基因來清除自由基,從而減慢衰老。經(jīng)R4 處理后,秀麗線蟲體內(nèi)sir-2.1 與daf-2 基因mRNA 的表達水平的明顯下調(diào),說明鼠李糖乳桿菌R4 或許通過Insulin/IGF-1通路參與線蟲壽命的正向調(diào)控,延緩衰老。
Insulin/IGF-1 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路上的sod-3 轉(zhuǎn)錄水平的提高同樣證明R4 可以激活下游轉(zhuǎn)錄因子daf-16。影響線蟲發(fā)育的“生物鐘”基因ctl-1 是daf-16 的下游基因,其表達量的上調(diào)也進一步證實R4 激活了daf-16 的轉(zhuǎn)錄活性。本研究表明鼠李糖乳桿菌R4 對線蟲的正向保護作用依賴于daf-16/FOXO 通路。此外,本文推測R4 的作用可能是通過曲線調(diào)節(jié),即以間接的方式實現(xiàn)調(diào)控。當(dāng)氧化壓力較大時,R4 通過調(diào)節(jié)sir-2.1 基因的表達,從而進一步調(diào)控壽命。通常情況下R4 對壽命的正調(diào)控多被認為是通過sir-2.1 實現(xiàn)的。
本研究對新疆奶疙瘩進行菌群分析,對其中的高活性益生菌鼠李糖乳桿菌R4,以秀麗隱桿線蟲為模型,測試其對線蟲壽命及其它生理、生化指標的影響,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組重測序等手段揭示其對線蟲壽命的調(diào)節(jié)方式。R4 處理的秀麗線蟲的產(chǎn)卵率和運動頻率上升,對熱應(yīng)激和氧化應(yīng)激脅迫的抵抗力有所提高,同時線蟲體內(nèi)SOD 和CAT 酶活顯著升高,而MDA 的含量下降??梢奟4 具有較強的延壽作用。實驗顯示:該菌株的活菌不僅可以延緩線蟲壽命,還能夠保護線蟲在不良環(huán)境下免受機體損傷。對壽命和衰老相關(guān)基因的監(jiān)測表明,乳酸菌R4 主要影響daf-16、daf-2、sir-2.1、ctl-1、hsp-16.2 和sod-3,R4 主要通過激活胰島素信號通路(Insulin/IGF pathway)下游的daf-16 基因增強抗應(yīng)激能力和延長壽命。R4 活菌處理組對秀麗線蟲sod-3 mRNA 水平的上調(diào)表明其對daf-16轉(zhuǎn)錄因子的激活作用。而daf-16 的下游基因ctl-1表達量的上調(diào)也證實鼠李糖乳桿菌R4 活菌激活了daf-16 的轉(zhuǎn)錄活性。