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      基于多重插補神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的減壓病人危險率變化估計

      2022-01-13 03:43:08王純杰任美慧肖男男
      關(guān)鍵詞:分段受試者區(qū)間

      王純杰,任美慧,肖男男,張 鉞

      (長春工業(yè)大學(xué) 數(shù)學(xué)與統(tǒng)計學(xué)院,吉林 長春 130012)

      0 引言

      在生物醫(yī)學(xué)、社會科學(xué)、現(xiàn)代工業(yè)等領(lǐng)域,都需要對相關(guān)的生存資料進行研究.研究的重點主要在生存時間以及相關(guān)的影響因素,生存分析是解決此類問題主要方法.目前,生存分析主要涉及兩個主要研究方向:(1)描述生存時間分布,通過觀測研究對象的生存曲線,進一步明確某一疾病的人群生存規(guī)律;(2)危險函數(shù)估計以及相關(guān)影響因素分析,如在某一疾病的隨訪過程中,分析影響患者生存的影響因素,進一步預(yù)測患者的生存時間分布[1].

      目前,學(xué)者對于生存數(shù)據(jù)的分析與預(yù)測已經(jīng)取得了很大的進步,因此,能夠通過繪制疾病隨訪過程中的疾病危險率變化曲線,可以更加直觀地了解疾病的變化情況,并針對危險率變化峰值采取相應(yīng)的治療措施.D.Faraggi和R.Simon[2]首次將神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型應(yīng)用于Cox比例風險模型中,進一步分析了影響生存時間的相關(guān)因素;K.Liestol[3]提出應(yīng)用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來構(gòu)建離散時間模型和分段指數(shù)模型兩種估計危險率變化情況的非參數(shù)靈活模型;此后,M.Fornili[4-5]再次利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型處理右刪失數(shù)據(jù),分別對乳腺癌以及腎細胞癌患者進行實例分析,對病人的危險變化情況進行預(yù)測估計;L.Zhao[6]將深度學(xué)習(xí)方法應(yīng)用于生存數(shù)據(jù)的處理,同時估計出相應(yīng)的生存函數(shù);進而,C.Lee[7]將神網(wǎng)絡(luò)方法應(yīng)用到生存分析的競爭風險模型中,對危險函數(shù)進行了估計;另外,Y.X.Sun[8]采用分段指數(shù)模型來描述疾病潛伏過程,并將其用于處理帶有空間距離和時變協(xié)變量的疾病數(shù)據(jù).

      本文將神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型應(yīng)用于區(qū)間刪失數(shù)據(jù),由于區(qū)間刪失數(shù)據(jù)缺乏準確的觀測時間點,因此采用多重插補法下,對已有缺失數(shù)據(jù)進行插補,如花琳琳等[9]在不同缺失值處理方法下,對隨機缺失數(shù)據(jù)處理效果的比較;紀忠光等[10]針對缺失數(shù)據(jù)進行非參數(shù)插補;張琳琳等[11]基于數(shù)據(jù)增強算法,將多重插補方法應(yīng)用于失效時間為區(qū)間刪失型數(shù)據(jù)的加速失效時間模型的參數(shù)估計問題中,并將有限區(qū)間刪失(但不是右刪失)數(shù)據(jù)插補成確切失效時間數(shù)據(jù).本文旨在應(yīng)用多重插補法結(jié)合神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型對美國宇航員減壓病數(shù)據(jù)進行分析,關(guān)注后期可能出現(xiàn)的多峰值變化情況.

      1 研究模型與方法

      1.1 分段指數(shù)模型

      考慮分段指數(shù)模型并將隨訪時間劃分為J個不相鄰的區(qū)間,即

      Aj=(aj-1,aj],j=1,2,…,J,

      其中a0=0,aJ=+∞.由此,可以假定風險函數(shù)在每個區(qū)間段內(nèi)均為常數(shù),即

      h(ti,xi)=λj(xi),aj-1

      在分段指數(shù)模型下,相應(yīng)的生存函數(shù)可以改寫為

      為了簡單起見,當滿足t≤a1時,上述生存函數(shù)的第一項可以看作是1.

      1.2 數(shù)據(jù)插補法

      針對于不完全數(shù)據(jù)的分析,通常采用插補法進行分析(包括單次插補和多重插補兩種方法).單次插補是對缺失數(shù)據(jù)依據(jù)某種規(guī)則進行一次填充,插補之后可以得到一個完整的數(shù)據(jù)集[12].多重插補則是對缺失值進行多次補充,插補次數(shù)一般為5~20次,因此可以得到相應(yīng)個數(shù)的完整數(shù)據(jù)集.在此基礎(chǔ)上,針對每個數(shù)據(jù)集進行分析,最終得出更為準確的分析結(jié)果.采用imputeCens包[13]對區(qū)間刪失數(shù)據(jù)進行多重插補,具體操作步驟如下:

      (1)通過ic_par()函數(shù)擬合區(qū)間刪失數(shù)據(jù)的參數(shù)回歸模型,參數(shù)dist采用指數(shù)分布,滿足分段指數(shù)模型;

      (2)輸入Ⅱ型觀測區(qū)間和左刪失數(shù)據(jù)代入模型,進行數(shù)據(jù)處理;

      (3)應(yīng)用imputeCens()函數(shù),對區(qū)間刪失數(shù)據(jù)進行插補.

      通過上述操作,可以將觀測區(qū)間以及左刪失數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成具體的觀測時間點,與原數(shù)據(jù)構(gòu)成右刪失數(shù)據(jù),對此進行相應(yīng)的模型分析.

      1.3 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型及估計方法

      針對右刪失數(shù)據(jù),為了能夠準確地估計腫瘤患者的預(yù)后風險,采用了一種基于似然函數(shù)優(yōu)化的方法.假設(shè)有n名受試者(i=1,2,…,n),其中第i位受試者的生存時間設(shè)為ti,且xi=(xi1,xi2,…,xip)表示個體i的p維協(xié)變量,則n個獨立個體的似然函數(shù)[14]為

      對于上述似然函數(shù),引入分段指數(shù)模型,則相應(yīng)的似然函數(shù)改寫為

      其中:Ji表示個體i所落入的最后一個區(qū)間;

      下面對危險函數(shù)h(t;x)進行建模,利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建協(xié)變量與時間的函數(shù)關(guān)系,采用一種更靈活的模型解決了協(xié)變量之間的相依關(guān)系.采用以下前饋人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對危險函數(shù)進行建模,關(guān)系式為

      其中

      該網(wǎng)絡(luò)分為三層:輸入層是p維協(xié)變量和感興趣時間t;隱藏層包括H個神經(jīng)元;最后輸出層為J個神經(jīng)元(與分段指數(shù)模型的劃分區(qū)間數(shù)相同).另外,輸入層與隱藏層分別設(shè)定偏置單位“1”,相應(yīng)地選取Sigmoid函數(shù)作為激活函數(shù).

      為優(yōu)化神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型參數(shù),選取極大似然函數(shù)的負對數(shù)作為網(wǎng)絡(luò)損失函數(shù),通過最小化損失函數(shù)進一步得出最優(yōu)化的網(wǎng)絡(luò)參數(shù)為

      采用梯度下降法來最小化損失函數(shù),并選定合適的學(xué)習(xí)率,通過計算,M.Akaike等[15]提出的評價指標AIC值,來選擇最優(yōu)模型結(jié)構(gòu);M.Stone[16]已經(jīng)證明AIC指標與交叉驗證的結(jié)果是等價的(具有計算優(yōu)勢),即

      AIC=D+2β,

      其中D為似然函數(shù)的負對數(shù)值,β為待估參數(shù)的個數(shù).

      2 實例分析

      本文主要研究高空飛行時減壓病的危險率變化,數(shù)據(jù)NASAs Hypobaric Decompression Sickness(HDSD)來源于thregI包,該數(shù)據(jù)集記錄了美國空軍在低壓脫氮情況下肺動脈內(nèi)氣栓(VGE IV)發(fā)病時間、年齡、性別、TR值(減壓前組織氮分壓與減壓終壓值的比值)、下肢運動等,以此來分析減壓病(DCS)在觀測時間內(nèi)的發(fā)病危險率.數(shù)據(jù)集內(nèi)包含238個樣本,探測發(fā)生DCS患者自減壓至終壓的失效時間內(nèi)DCS危險變化情況.

      2.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理

      在HDSD中,每位受試者VGE發(fā)生時間在某一固定的檢測時間段內(nèi),并未記錄準確的觀測時間,針對區(qū)間Ⅱ型刪失數(shù)據(jù),本文采取多重插補法,應(yīng)用imputeCens包同時依據(jù)分段指數(shù)分布規(guī)律預(yù)測出可能的生存時間分布,進而將觀測區(qū)間以及左刪失數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成具體的觀測時間點,與原數(shù)據(jù)構(gòu)成右刪失數(shù)據(jù),將插補的準確觀測時間以及相應(yīng)協(xié)變量應(yīng)用到神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型中,進一步分析減壓病的危險變化趨勢.

      2.2 分析結(jié)果

      減壓病是人體暴露在一定程度的低氣壓下而出現(xiàn)的一種特殊病癥,由于處于低氣壓下,使得體內(nèi)的氮氣在減壓時出現(xiàn)過飽和現(xiàn)象,進而生成氣泡而導(dǎo)致的病癥.根據(jù)受試者DCS發(fā)病的時間依從性信息(相關(guān)協(xié)變量)以及終檢時間(暴露期間)是否發(fā)病等信息,研究受試者在低壓暴露時間內(nèi)的危險率變化情況.

      根據(jù)所研究的數(shù)據(jù)集,為了選擇更加合適的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),以M.Stone所提出的AIC準則作為評價指標,分別考慮了6,8,12個隱層單元數(shù)和學(xué)習(xí)率0.1,0.01以及0.001,根據(jù)AIC準則的值,選擇具有較好性能的模型,相應(yīng)的結(jié)果如表1所示,因此選用6個隱層單元和學(xué)習(xí)率0.1來構(gòu)建神經(jīng)網(wǎng)絡(luò).

      表1 AIC值分布Tab.1 AIC value distribution

      在分析中,將隨訪時間0~6 h劃分為12個區(qū)間段,主要考慮了以下協(xié)變量:年齡、性別、TR值(即氮氣過飽和系數(shù))、是否運動以及VGE IV級對減壓病DCS危險率變化的影響,具有不同特征的受試者在低壓情況下,一段隨訪時間內(nèi),各類人群的危險變化情況.

      據(jù)美國潛水與高氣壓醫(yī)學(xué)會組織研究的相關(guān)資料顯示,發(fā)生減壓病的時間一般在剛進入低氣壓環(huán)境時,尤其是進入低壓環(huán)境1 h以內(nèi),危險率呈現(xiàn)遞增趨勢,隨著時間的增長危險率會出現(xiàn)下降趨勢,而后又會出現(xiàn)上升趨勢,直至出現(xiàn)平穩(wěn)狀態(tài).圖1是通過神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型擬合的238位受試者的生存曲線,可以發(fā)現(xiàn)本文所提出的模型擬合的曲線與K-M估計得出的生存曲線基本重合,由此可以說明該模型具有較好的評估性能.

      圖1 生存曲線擬合圖Fig.1 Fitting diagram of survival curve

      為進一步分析危險率變化情況,分別將受試者按照不同協(xié)變量劃分為不同的組別,如:年齡(劃分為三個區(qū)間段:20~30歲、30~40歲以及40~50歲)、性別、TR值(將比值劃分為1.6以下、1.6~1.7以及1.7以上)、是否運動等連續(xù)變量和分類變量對危險率的影響.由圖2結(jié)果發(fā)現(xiàn),處于不同年齡段的受試者在低壓情況下危險率變化情況基本一致,說明年齡對低壓環(huán)境下減壓病的危險率并不造成影響;另外,相較于男性而言,女性在低壓環(huán)境中危險率系數(shù)更低,更具有耐受性.

      圖2 不同年齡段以及不同性別人群的危險率變化曲線Fig.2 Risk curves of different age groups and different genders

      另一方面,還分析了TR值以及在低壓環(huán)境中是否運動對危險率變化的影響,TR值是組織內(nèi)氮分壓與減壓終壓值的比值,有關(guān)資料表明,TR比值一般在1.53~1.63范圍內(nèi)波動,如果TR值過高,相應(yīng)的發(fā)病危險率也會提高.由圖3結(jié)果顯示,當TR值處于1.6水平以下,受試者的危險率較低,但中間仍會出現(xiàn)危險率的波動變化;而當危險率處于1.6~1.7水平之間,受試者在最開始時刻就會面臨著較大的危險率,直至5 h以后趨于平緩;如果TR值超過1.7以上,危險率會出現(xiàn)小高峰,相較于前者,具有更高的危險率.

      圖3 不同TR值含量下的危險率變化曲線Fig.3 Variation curve of risk rate under different TR values

      在低壓環(huán)境中,運動會增加減壓病發(fā)生的概率,因此在低壓情況下,活動的人會比不活動的人具有更高的危險率,因為運動是與氮含量相關(guān)的,運動越多會導(dǎo)致組織內(nèi)的氮含量也越多,導(dǎo)致氮氣過飽和系數(shù)并不斷增加,進而具有更高的危險率,圖4結(jié)果也說明了這一結(jié)論.

      圖4 低壓情況下是、否為運動群體的危險率變化曲線Fig.4 Curves of risk changes in the active and inactive groups under low pressure

      3 結(jié)語

      本文通過多重插補法將區(qū)間Ⅱ型刪失數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為右刪失數(shù)據(jù),并依托于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型對減壓病的危險率變化進行估計,與傳統(tǒng)的比例風險非線性模型相比,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型更具靈活性,解決了協(xié)變量之間的交互作用,進而可以直接得到隨訪時間內(nèi)的個體危險率的變化情況.

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