楊曉龍
摘要:目的:研究分析新型冠狀病毒核酸檢測中對標(biāo)本進行不同前處理對于檢測結(jié)果的影響情況。方法:選取新型冠狀病毒核酸檢測顯示為陽性為12份滅活的咽拭子標(biāo)本,分為四份,A前處理為化學(xué)裂解15min,B為化學(xué)裂解30min,C為56℃水浴30min,D為56℃水浴60min,分析四組的檢測結(jié)果。結(jié)果:水浴檢查獲得的陽性情況優(yōu)于化學(xué)裂解,化學(xué)裂解出現(xiàn)兩份陰性。結(jié)論:化學(xué)裂解會一定程度會破壞病毒的結(jié)構(gòu),對結(jié)果影響較大,日常不建議使用該種前處理模式。
關(guān)鍵詞:新型冠狀病毒;核酸檢測;標(biāo)本處理
由新型冠狀病毒所感染導(dǎo)致的肺炎稱為新型冠狀病毒肺炎,該肺炎在2019年全球爆發(fā)。人類感染該種病毒后會出現(xiàn)咳嗽、發(fā)熱以及呼吸困難等癥狀,如果不及時開展相應(yīng)的治療可直接威脅患者生命安全。為了進一步防治該種病毒,需要開展核酸檢測,而核酸檢測一般為咽拭子,在核酸檢測之前需要對樣本進行前處理,前處理模式比較多,日常檢測分析中應(yīng)該選取何種為本次研究重點。
1.資料與方法
1.1基礎(chǔ)資料來源
檢測結(jié)果為陽性的12份滅活的咽拭子標(biāo)本。
1.2處理方法
1.2.1儀器材料
所用的儀器為數(shù)顯電熱恒溫水浴鍋;全自動核酸提取儀;熒光定量PCR;SARS-Co-2核酸檢測試劑盒。
1.2.2檢測方法
采取全自動核酸提取儀對核酸進行提取,并依據(jù)SARS-Co-2核酸檢測試劑盒相關(guān)說明書進行操作,之后置于PCR之上,于45℃ 10min,95℃ 15s;58℃ 30s循環(huán)40次。58℃進行單點熒光檢測,檢測ORFlab基因、N基因、內(nèi)源性基因MNBH,并且內(nèi)源性基因MNBH作為本次的參照基因。
1.3結(jié)果判斷依據(jù)
陰性:擴增曲線不是S型,Ct值>39.00或者Ct值為空白;擴增曲線S型,Ct值≤39.00為陽性。SARS-Co-2核酸檢測為陽性時需要符合以下兩個條件其中1個:(1)同一份標(biāo)本中ORFlab基因、N基因在PCR檢測中均為陽性;(2)兩種類型標(biāo)本PCR檢測同時出現(xiàn)單靶標(biāo)陽性,或者同種類型標(biāo)本兩次采集檢測均出現(xiàn)單靶標(biāo)陽性。
1.4數(shù)據(jù)分析
相應(yīng)的數(shù)據(jù)納入辦公軟件EXCEL中進行分析。
2.結(jié)果
A組、B組出現(xiàn)陰性,C組和D組結(jié)果均為陽性,具體結(jié)果見表1。
3.討論
新型冠狀病毒具有比較強的傳染性,因此在對標(biāo)本進行檢測分析前,一般需要對其進行滅活處理,但是如果滅活的方式不對可能會導(dǎo)致病毒核酸降解從而出現(xiàn)假陰性。
本次的研究分析中,使用水浴處理的結(jié)果與不處理的結(jié)果相近,且假陽性率為0 ,并且該種分析結(jié)果比較經(jīng)濟。而化學(xué)裂解的處理模式出現(xiàn)的假陰性,結(jié)果與未處理的標(biāo)本之間差異性比較大,造成該種情況原因可能為長時間的化學(xué)裂解后標(biāo)本被破壞,釋放的SARS-Co-2核酸被RNA酶降解,該結(jié)果提示我們后續(xù)的處理中,使用化學(xué)裂解模式需要慎重考慮。
新型冠狀病毒可導(dǎo)致患者出現(xiàn)新型冠狀病毒性肺炎,該種疾病出現(xiàn)后患者出現(xiàn)呼吸系統(tǒng)方面的障礙,嚴(yán)重情況下會直接威脅患者的生命安全。在我國雖然該種病毒已經(jīng)被控制,但在國外,特別是印度該病毒還在危害著人們,因此需要對該疾病做出及時的檢測,并給予患者相應(yīng)的治療,從而保證其生命安全。但是由于病毒具有非常強的傳染性,需要對樣本進行處理,之后進行核酸分析,根據(jù)核酸的陰性或者陽性判斷,其是否感染新型冠狀病毒。本次的處理分析中我們選擇了化學(xué)裂解15min、化學(xué)裂解30min、56℃水浴30min以及56℃水浴60min,結(jié)果顯示,使用水浴后獲得的結(jié)果比較接近未處理的樣本,該種處理模式獲得更加客觀的結(jié)果,而化學(xué)裂解后的樣本出現(xiàn)比較高的假陰性,說明該種處理模式不適合臨床應(yīng)用。
綜上所述,化學(xué)裂解會一定程度會破壞病毒的結(jié)構(gòu),對結(jié)果影響較大,日常不建議使用該種前處理模式。
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