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      環(huán)狀RNA與氧化應(yīng)激互作機(jī)制的研究進(jìn)展

      2022-05-05 08:51:24趙久紅童佳婷沈郅珺呂葉輝
      關(guān)鍵詞:氧化應(yīng)激標(biāo)志物調(diào)控

      趙久紅,童佳婷,沈郅珺,呂葉輝

      上海健康醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,上海 201318

      環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類共價閉環(huán)非編碼RNA,是由mRNA 前體通過特殊的可變剪切連接而成的內(nèi)源性RNA[1]。circRNA 在哺乳動物細(xì)胞中廣泛表達(dá), 可通過充當(dāng)微RNA(miRNA)海綿、與RNA 結(jié)合蛋白相互作用、調(diào)節(jié)mRNA 穩(wěn)定性、作為競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)等機(jī)制在多個水平參與基因調(diào)控,廣泛參與缺血、缺氧、損傷修復(fù)、腫瘤發(fā)生等多種病理生理過程[1-3]。氧化應(yīng)激是指機(jī)體在衰老或者遭受有害刺激時,機(jī)體內(nèi)活性氧(reactive oxygen species,ROS)的產(chǎn)生與清除(抗氧化)失衡的狀態(tài),進(jìn)而導(dǎo)致?lián)p傷,與多種疾病的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。隨著研究深入,已有證據(jù)表明多種circRNA 在氧化應(yīng)激狀態(tài)下表達(dá)異常。分析circRNA 的表達(dá)改變及其對氧化應(yīng)激相關(guān)分子指標(biāo)的作用機(jī)制具有重要意義,不僅有助于揭示發(fā)病機(jī)制,也可為相關(guān)疾病的防治提供理論基礎(chǔ)。本文在梳理現(xiàn)有研究的基礎(chǔ)上,以器官系統(tǒng)疾病為主線,就氧化應(yīng)激過程中的circRNA 的表達(dá)變化及調(diào)控作用機(jī)制做一綜述。

      1 氧化應(yīng)激概述

      氧化應(yīng)激即體內(nèi)ROS 的產(chǎn)生與ROS 清除失衡的一種狀態(tài)。ROS 是生物體有氧代謝過程中的正常副產(chǎn)物,在機(jī)體內(nèi)被不斷地產(chǎn)生,包括超氧陰離子、羥基自由基、氧自由基衍生的單線態(tài)氧、過氧化氫(H2O2)、過氧亞硝酸鹽、一氧化氮(NO)等,并通過信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和表達(dá)調(diào)控參與各項生命過程[4]。生理狀態(tài)下,代謝產(chǎn)生的ROS 能被體內(nèi)抗氧化系統(tǒng)清除,而ROS 和抗氧化系統(tǒng)之間的良好平衡對于細(xì)胞的正常功能至關(guān)重要[5]。在機(jī)體衰老或病理狀態(tài)下,都有可能導(dǎo)致ROS 產(chǎn)生和清除失衡,導(dǎo)致各類分子受到氧化損傷,如DNA 斷裂、蛋白質(zhì)變性和脂質(zhì)過氧化等,細(xì)胞表現(xiàn)為衰老、凋亡或壞死[6]。上述氧化應(yīng)激改變可出現(xiàn)在中樞神經(jīng)系統(tǒng),如阿爾茨海默病和帕金森?。?-8];也可出現(xiàn)在心血管系統(tǒng)疾病,如氧自由基攻擊心肌細(xì)胞和動脈粥樣硬化等[9-10];也有研究表明氧化應(yīng)激在腎臟損傷、肺損傷等疾病的發(fā)生、 發(fā)展過程中發(fā)揮著重要作用[11-12]。

      氧化應(yīng)激標(biāo)志物是指能反映機(jī)體內(nèi)氧化應(yīng)激水平的一系列生化分子。在氧化應(yīng)激過程中,清除氧化產(chǎn)物的蛋白酶減少,大量氧化中間產(chǎn)物蓄積,從而導(dǎo)致分子、細(xì)胞和機(jī)體的一系列損傷。而目前常用的氧化應(yīng)激標(biāo)志物也是從蛋白酶、中間產(chǎn)物及損傷產(chǎn)物3 個層面進(jìn)行選取,詳見表1。氧化應(yīng)激發(fā)生時,超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)表達(dá)下降,活性降低,產(chǎn)生過多的脂質(zhì)過氧化產(chǎn)物丙二醛(malondialdehyde,MDA);谷胱甘肽過氧化物酶(glutathione peroxidase,GSH-Px) 也是體內(nèi)重要的過氧化物分解酶,可使MDA 還原,從而保護(hù)細(xì)胞免受氧化損傷;因此SOD、MDA 和GSH-Px 常被作為判斷氧化應(yīng)激程度的指標(biāo)[13-14]。過量表達(dá)的誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase,iNOS) 是NO 異常增多的主要原因,過氧化氫酶(catalase,CAT)也是重要的H2O2清除酶,這些酶亦可用來評估氧化應(yīng)激狀態(tài)。氧化應(yīng)激本就表現(xiàn)為ROS 升高,所以ROS 本身也是氧化應(yīng)激標(biāo)志物。在機(jī)體處于氧化應(yīng)激狀態(tài)下,增多的ROS 可使體內(nèi)的生物大分子等出現(xiàn)不同程度的氧化:谷胱甘肽大量轉(zhuǎn)化成氧化型谷胱甘肽(oxidized glutathione, GSSG); 3- 硝基酪氨酸(3-nitrotyrosine,3-NT)為蛋白硝基化終產(chǎn)物,能不斷積累活性氮和活性氧,影響細(xì)胞內(nèi)線粒體生物功 能 ; 8- 羥 基 脫 氧 鳥 苷 (8-hydroxy-2-deoxyguanosine,8-OHdG)是ROS 攻擊DNA 分子中鳥嘌呤堿基的第8 位碳原子形成的氧化加合物;故而GSSG、3-NT 和8-OHdG 也可作為氧化應(yīng)激標(biāo)志物。此外,亦有研究表明鐵、汞等金屬處理可造成機(jī)體內(nèi)的氧化與抗氧化的不平衡,也有學(xué)者推薦將微量金屬元素作為標(biāo)志物來檢測機(jī)體的氧化應(yīng)激狀態(tài)[15]。

      表1 研究常用的氧化應(yīng)激標(biāo)志物Tab 1 Commonly used oxidative stress markers in present studies

      標(biāo)志物含量的變化既可以明確氧化應(yīng)激狀態(tài),也是分析疾病發(fā)生、發(fā)展與氧化應(yīng)激相關(guān)性的前提,無論是蛋白酶、中間產(chǎn)物,還是終產(chǎn)物,相關(guān)的表達(dá)調(diào)控主要在3 個水平上進(jìn)行,即miRNA-mRNA-蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡(luò)。circRNA 作為近年來生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的熱點分子,其轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控作用主要表現(xiàn)為以下幾點[16-18]:轉(zhuǎn)錄時與mRNA 前體發(fā)生剪接競爭,起到ceRNA 作用;充當(dāng)miRNA 海綿,與mRNA 競爭miRNA 位點;少數(shù)circRNA 包含核糖體進(jìn)入位點,具有翻譯能力;在翻譯后水平與蛋白結(jié)合,調(diào)節(jié)蛋白的活性。鑒于上述調(diào)控機(jī)制和相關(guān)研究基礎(chǔ),circRNA 可能是氧化應(yīng)激過程中的關(guān)鍵分子,對于氧化應(yīng)激標(biāo)志物的表達(dá)調(diào)控和下游改變具有重要作用。在氧化應(yīng)激狀態(tài)下特異性表達(dá)的circRNA,可通過多種機(jī)制進(jìn)行調(diào)控,特別是通過miRNA 影響下游基因表達(dá),參與氧化應(yīng)激造成的損傷,亦可上調(diào)相關(guān)抗氧化因子,降低氧化應(yīng)激的影響。根據(jù)在氧化應(yīng)激過程中不同的調(diào)控作用(促進(jìn)或抑制),本文將相關(guān)circRNA 大致分為促氧化應(yīng)激損傷和抗氧化應(yīng)激損傷2類。

      2 circRNA 在心血管疾病氧化應(yīng)激中的作用

      心血管疾病在世界范圍內(nèi)都有著極高的發(fā)病率和死亡率,越來越多的證據(jù)表明氧化應(yīng)激參與了多種心血管疾病的發(fā)生、發(fā)展。已有研究表明circRNA 是高血壓、心肌梗死、動脈粥樣硬化等心血管疾病中的重要調(diào)控因子,而且與氧化應(yīng)激損傷有關(guān)[9]。系列研究表明差異性表達(dá)的circRNA 可通過多種作用機(jī)制對氧化應(yīng)激誘發(fā)的炎癥反應(yīng)或細(xì)胞損傷發(fā)揮調(diào)控作用,詳見表2。

      表2 circRNA在心血管疾病氧化應(yīng)激中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制Tab 2 Regulatory mechanism of circRNA expression under oxidative stress in cardiovascular diseases

      2.1 促氧化應(yīng)激circRNA

      H2O2或缺血再灌注損傷(ischemia/reperfution,Ⅰ/R)處理的心肌細(xì)胞可誘導(dǎo)circNCX1 高表達(dá),miR-133a-3p 與circNCX1 競爭性結(jié)合,以致前者對促凋亡因子細(xì)胞死亡誘導(dǎo)蛋白(cell death-inducing p53 target protein 1,CDⅠP1)的翻譯抑制作用喪失,最終導(dǎo)致心肌細(xì)胞死亡[19]。circHⅠPK2 在H2O2處理新生小鼠心肌細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),并通過miR-485-5p/ATG101 通路促進(jìn)自噬,加速氧化應(yīng)激中的細(xì)胞凋亡和死亡[20]。在氧化低密度脂蛋白(oxidized low density lipoprotein,ox-LDL) 誘導(dǎo)的細(xì)胞模型中,hsa_circ_0007478 (circTM7SF3) 通過miR-206 的介導(dǎo)上調(diào)天冬酰胺β 羥化酶(aspartyl β-hydroxylase,ASPH)、TNF-α、ⅠL-6 表達(dá),起到促炎、促凋亡的作用[21]。在高葡萄糖(high glucose,HG)或脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)處理的氧化應(yīng)激細(xì)胞模型中,高表達(dá)的circBPTF 和circHⅠPK3 可通過上調(diào)TNF-α、ⅠL-6、Bax、caspase3、CK-MB 等起到促炎、促凋亡的作用[22-23]。在LPS 誘導(dǎo)的心肌炎小鼠模型中,敲除circHⅠPK3 可有效降低ROS、MDA 等氧化應(yīng)激標(biāo)志物的含量,抑制心肌細(xì)胞凋亡,減輕心肌組織損傷[23]。

      2.2 抗氧化應(yīng)激circRNA

      2.2.1 氧化應(yīng)激條件下表達(dá)下調(diào) Ⅰ/R 后心肌細(xì)胞內(nèi)hsa_circ_0000064(circB4GALT2) 表達(dá)降低,上調(diào)的CK-MB、Bax和caspase3參與氧化應(yīng)激狀態(tài)下的細(xì)胞損傷;如損傷前采用紅景天苷預(yù)處理,細(xì)胞內(nèi)的hsa_circ_0000064 顯著上調(diào),上述凋亡相關(guān)蛋白表達(dá)下降,減輕氧化應(yīng)激對心肌細(xì)胞的損傷[24]。在ox-LDL 誘導(dǎo)的細(xì)胞模型中, hsa_circ_0001445(circSMARCA5)和hsa_circ_0000345(circRSF1)的表達(dá)顯著下調(diào):前者與miR-640 的介導(dǎo)有關(guān),下調(diào)后引起TNF-α、ⅠL-6、ⅠL-β、Bax 和caspase3 等炎癥因子及凋亡相關(guān)蛋白的上調(diào);后者與細(xì)胞周期素D2(cyclin D2,CCND2)競爭性結(jié)合miR-758,下調(diào)后CCND2 表達(dá)下降,Bax 和HⅠF-1α 的表達(dá)升高;兩者的低表達(dá)均起到促炎、促凋亡的作用。值得注意的是,將過表達(dá)的circSMARCA5或circRSF15的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到細(xì)胞后,再行氧化應(yīng)激時,高水平的circRNA 可通過下調(diào)相關(guān)炎癥因子及凋亡相關(guān)蛋白的表達(dá),起到抗氧化應(yīng)激的作用[25-27]。

      2.2.2 氧化應(yīng)激條件下表達(dá)上調(diào) 在ox-LDL 誘導(dǎo)的血管平滑肌細(xì)胞中,circ_0029589(circCHFR)表達(dá)上調(diào),通過miRNA 海綿吸附miR-424-5p 使胰島素樣生長因子2 (insulin-like growth factor 2,ⅠGF2)表達(dá)增加,減少細(xì)胞凋亡,起到抗氧化應(yīng)激的作用;沉默circ_0029589 或過表達(dá)miR-424-5p,可使細(xì)胞在氧化應(yīng)激時增殖下降且凋亡增加[28]。該研究也提示機(jī)體在氧化應(yīng)激下,會通過高表達(dá)部分circRNA 來應(yīng)對過氧化狀態(tài)、減輕損傷,這是一種自我保護(hù)機(jī)制。

      3 circRNA 在神經(jīng)系統(tǒng)疾病及肺部疾病氧化應(yīng)激中的作用

      在神經(jīng)系統(tǒng)疾病,特別是神經(jīng)退行性病變中,ROS增多、脂質(zhì)過氧化、細(xì)胞色素C釋放等因素是氧化應(yīng)激損傷的重要機(jī)制,可導(dǎo)致神經(jīng)元凋亡或死亡的發(fā)生,是病變的重要基礎(chǔ)[7]。肺也是氧化應(yīng)激暴露的常見受累器官,特別是在慢性阻塞性肺?。╟hronic obstructive pulmonary disease,COPD) 中,氧化應(yīng)激是重要的致病機(jī)制[12,29]。隨著研究深入,已有證據(jù)表明circRNA 可能是連接氧化應(yīng)激與神經(jīng)系統(tǒng)疾病或肺部疾病之間的關(guān)鍵環(huán)節(jié)[30-31],詳見表3。

      表3 circRNA在神經(jīng)系統(tǒng)及肺疾病氧化應(yīng)激中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制Tab 3 Regulatory mechanism of circRNA expression under oxidative stress in neurological disorders and lung diseases

      3.1 促氧化應(yīng)激circRNA

      百草枯處理神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系制作氧化應(yīng)激模型,發(fā)現(xiàn)circSLC8A1 顯著升高,與線性mRNA 競爭導(dǎo)致SLC8A1表達(dá)下調(diào);circSLC8A1 還具有miR-128和Ago2 蛋白結(jié)合位點,使miR-128 的靶基因表達(dá)上調(diào),參與氧化應(yīng)激所致的帕金森?。?2]。在谷氨酸誘導(dǎo)的HT22 細(xì)胞(小鼠海馬神經(jīng)元細(xì)胞系)氧化應(yīng)激模型中,circFoxO3 表達(dá)升高,介導(dǎo)凋亡相關(guān)蛋白BimEL、cytochrome 及caspase 上調(diào),從而減弱細(xì)胞活力、促進(jìn)細(xì)胞凋亡;敲除circFoxO3 后BimEL 下調(diào),間接抑制HT22 細(xì)胞的線粒體凋亡,減輕氧化應(yīng)激損傷[33]。

      香煙煙霧被公認(rèn)為COPD 的危險因素,香煙煙霧所致的氧化應(yīng)激在COPD 中也至關(guān)重要。有3 個不同的實驗組借助香煙煙霧提取物(cigarette smoke extract,CSE)誘導(dǎo)細(xì)胞氧化應(yīng)激,并檢測出多種circRNA 異常升高,這些指標(biāo)可能是阻斷氧化應(yīng)激的潛在靶點。XUE 等[12]發(fā)現(xiàn)發(fā)生氧化應(yīng)激條件下,hsa_circ_0006872 (circASCC3) 通過miR-145-5p/NF-κB 途徑,促進(jìn)CSE 誘導(dǎo)的人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)ROS、SOD 和MDA 增多,促炎、促凋亡。WANG 等[34]發(fā)現(xiàn)circANKRD11 可與miR-145-5p 結(jié)合,導(dǎo)致Bax、caspase3、TNF-α 等炎癥因子及凋亡相關(guān)蛋白的表達(dá)增加,沉默circANKRD11 可明顯改善CSE 誘導(dǎo)氧化應(yīng)激所致的炎癥及凋亡情況。QⅠAO 等[35]發(fā)現(xiàn)在CSE 處理的人支氣管上皮樣細(xì)胞中,circRBMS1 在氧化應(yīng)激狀態(tài)下表達(dá)上調(diào),敲除circRBMS1 后可降低炎癥水平、減少細(xì)胞凋亡。

      3.2 抗氧化應(yīng)激circRNA

      研究發(fā)現(xiàn)在H2O2誘導(dǎo)的神經(jīng)元氧化應(yīng)激模型中,circPRKCⅠ表達(dá)下調(diào),通過circPRKCⅠ-miR-545/589-E2F7軸,上調(diào)凋亡相關(guān)蛋白caspase3和caspase9的表達(dá),而過表達(dá)circPRKCⅠ可顯著減輕氧化應(yīng)激損傷,減少細(xì)胞凋亡[36]。

      4 circRNA在腎疾病氧化應(yīng)激中的作用

      氧化應(yīng)激是急性腎損傷(acute kidney injury,AKⅠ)和糖尿病腎?。╠iabetic nephropathy,DN)的發(fā)病機(jī)制之一,circRNA 在其中也發(fā)揮著重要作用,見表4。

      表4 circRNA在腎疾病氧化應(yīng)激中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制Tab 4 Regulatory mechanism of circRNA expression under oxidative stress in kidney diseases

      4.1 促氧化應(yīng)激circRNA

      在盲腸結(jié)扎穿刺(cecum ligation and puncture,CLP)制作的膿毒癥相關(guān)性AKⅠ模型中,circTLK1的表達(dá)升高,通過miR-106a-5p 軸加劇炎癥、凋亡等氧化應(yīng)激損傷[37]。在腎Ⅰ/R 損傷模型中,高表達(dá)的circAKT3 通過miRNA 海綿作用下調(diào)miR-144-5p 的表達(dá),致使Bax 及caspase3 上調(diào),介導(dǎo)了氧化應(yīng)激過程[38]。在HG誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激細(xì)胞模型中,circLRP6顯著上調(diào)并吸附miR-205,使高遷移率族蛋白1(high mobility group protein 1,HMGB1)表達(dá)上調(diào),HMGB1 具有促炎作用,可加劇氧化應(yīng)激所致的細(xì)胞損傷,也是DN病情進(jìn)展的獨立危險因素[39]。

      4.2 抗氧化應(yīng)激circRNA

      SHⅠ等[40]的實驗表明,在LPS 誘導(dǎo)腎細(xì)胞模型中,circVMA21 表達(dá)下調(diào),通過miR-9-3p/SMG1/炎癥因子軸介導(dǎo)氧化應(yīng)激過程,過表達(dá)circVMA21 則可降低炎癥水平、減少細(xì)胞凋亡。

      當(dāng)然,circRNA 參與和介導(dǎo)的氧化應(yīng)激不只局限于上述器官系統(tǒng)疾病中。LⅠ等[41]在HG 誘導(dǎo)的人視網(wǎng)膜上皮細(xì)胞中,發(fā)現(xiàn)高表達(dá)的circRNA_0084043 參與氧化應(yīng)激過程,導(dǎo)致細(xì)胞活力下降和凋亡增加,下調(diào)其表達(dá)則可減輕氧化應(yīng)激損傷。YANG 等[42]從circRNA 的角度研究了氧化應(yīng)激在骨關(guān)節(jié)炎中的發(fā)病機(jī)制,揭示了circRSU1/miR-93-5p/MAP3K8軸,通過MEK/ERK1/2和NF-κB途徑促進(jìn)骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)生。

      5 circRNA 與氧化應(yīng)激相互作用機(jī)制分析與探討

      5.1 氧化應(yīng)激狀態(tài)導(dǎo)致circRNA表達(dá)改變

      多項研究已經(jīng)證實氧化應(yīng)激狀態(tài)下多種circRNA出現(xiàn)明顯的上調(diào)或下調(diào),雖然氧化應(yīng)激介導(dǎo)circRNA形成和變化的機(jī)制尚未完全明確,但有報道表明氧化應(yīng)激可通過影響轉(zhuǎn)錄過程的順式作用元件[43]、促進(jìn)反式作用因子的核轉(zhuǎn)移[44]、改變剪接體的功能[45],進(jìn)而對基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,而上述機(jī)制都在circRNA的形成過程中發(fā)揮重要作用。當(dāng)然,氧化應(yīng)激狀態(tài)下circRNA 的差異性表達(dá)很可能是一個復(fù)雜的多通路機(jī)制,還有待進(jìn)一步深入。

      5.2 circRNA調(diào)控氧化應(yīng)激進(jìn)程

      circRNA 可通過多種機(jī)制,在轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控氧化應(yīng)激的進(jìn)程。已有多項研究[12,19-24,35-38]表明circRNA 主要通過miRNA 的介導(dǎo)調(diào)控相關(guān)炎癥因子及凋亡基因的表達(dá),影響炎癥水平及細(xì)胞凋亡、死亡進(jìn)程,發(fā)揮促或抗氧化應(yīng)激損傷的作用。也有研究[22-24,32-33]顯示circRNA 直接或間接調(diào)控抗氧化基因的表達(dá),改變氧化應(yīng)激進(jìn)程。以核因子E2相關(guān)因子2(nuclear factor-erythroid 2-related factor 2,NRF2)和Kelch 樣環(huán)氧氯丙烷相關(guān)蛋白1 (Kelch-like ECHassociated protein 1,KEAP1)為例,KEAP1/NRF2信號通路在調(diào)控抗氧化基因的表達(dá)中發(fā)揮重要作用,circKEAP1與miR-141-3p結(jié)合可激活KEAP1/NRF2信號通路,減輕氧化應(yīng)激損傷[46],circTCONS_l2_00004572則可下調(diào)NRF2的表達(dá),導(dǎo)致ROS增加,加劇氧化應(yīng)激損傷[47]。

      6 結(jié)語與展望

      氧化應(yīng)激可導(dǎo)致circRNA 表達(dá)變化,circRNA 也可調(diào)控氧化應(yīng)激狀態(tài),兩者相互作用和影響,參與多種疾病的發(fā)生、發(fā)展。氧化應(yīng)激條件下表達(dá)變化的circRNA 大致可分為促氧化應(yīng)激和抗氧化應(yīng)激2 類:前者多在氧化應(yīng)激時表達(dá)上調(diào),介導(dǎo)炎癥因子及凋亡蛋白表達(dá)增多,加劇氧化應(yīng)激損傷,下調(diào)此類circRNA 可減輕氧化應(yīng)激損傷;后者多在氧化應(yīng)激時表達(dá)下調(diào),過表達(dá)此類circRNA 可降低炎癥水平、減少細(xì)胞凋亡,起到抗氧化應(yīng)激損傷的作用。本文綜述了各系統(tǒng)疾病中circRNA 與氧化應(yīng)激的相互作用,分析了circRNA 在促氧化應(yīng)激和抗氧化應(yīng)激中的具體作用機(jī)制,希望能為進(jìn)一步研究提供參考。

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