文 Peter(新加坡國立大學(xué)生物學(xué)博士) 圖 視覺中國
以希臘字母“奧密克戎”(Omicron)命名的新冠病毒變異株自去年11月在南非被發(fā)現(xiàn)和確定后,很快擴(kuò)散到世界各地,世界衛(wèi)生組織稱其傳播速度之快“前所未見”。一時間,謠言甚囂塵上,奧密克戎好像充滿智慧,繼承了前幾次變種的大部分“優(yōu)點(diǎn)”,比如2020年5月在南非發(fā)現(xiàn)的貝塔(Beta)變種具有免疫逃逸的特點(diǎn),2020年10月在印度發(fā)現(xiàn)的德爾塔(Delta)變種具有超強(qiáng)的傳染性,而奧密克戎兩者兼有。好在奧密克戎的癥狀相對溫和,也算是對目前焦灼的抗疫形勢的一絲絲慰藉。
自新冠疫情暴發(fā)至今,病毒變異的速度簡直令人瞠目結(jié)舌,目前的變種多到連24 個希臘字母都快被用完了。而且在變異的過程中,新冠病毒不斷獲得新的“技能”,比如潛伏時間變得更長,早期更難被檢測到……它真的那么聰明,讓我們毫無招架之力?其實(shí)并不是。破除我們內(nèi)心恐懼最好的方式,就是了解它的前世今生。
新冠病毒的全名是SARS-CoV-2,它屬于臭名昭著的Beta 冠狀病毒家族(冠狀病毒四大家族之一),是冠狀病毒中第7 名可以感染人類的成員。2003年,它的“長兄”SARS 病毒引發(fā)了“非典”。2012年,它的“二哥”MERS 病毒造成了中東呼吸綜合征。而這一次,新冠病毒令全球500多萬人失去了生命,而且這一數(shù)字還在不斷增長。
新冠病毒是全長約3 萬個堿基的RNA 病毒,在病毒中屬于大個頭了。相比之下,艾滋病毒只有9200 個堿基,乙肝病毒只有3200 個堿基,即使是流感病毒也只有1.2 萬個堿基,不到新冠病毒的一半。一般來說,遺傳物質(zhì)越大,能生成的基因越多,結(jié)構(gòu)也就越復(fù)雜,所以新冠病毒算是病毒界比較“厲害”的存在。當(dāng)然,這是相對病毒而言,比病毒更大的細(xì)菌,結(jié)構(gòu)就復(fù)雜多了,比如容易造成腹瀉的大腸桿菌有450 萬個堿基,我們平時喜歡喝的養(yǎng)樂多里的活性乳酸菌也有320萬個堿基。人類的基因組則有64 億個堿基,與病毒已經(jīng)不是一個數(shù)量級的了。
擁有3 萬堿基的新冠病毒一共表達(dá)了29 種蛋白質(zhì),其中有一種特別重要,叫作“刺突蛋白”。這種蛋白分布在病毒外表,是病毒與人體黏膜的接觸點(diǎn),也是病毒進(jìn)入人體的鑰匙。20世紀(jì)60年代,科學(xué)家首次在電子顯微鏡下看到冠狀病毒的刺突蛋白,它的外形很特別,像太陽的日冕,冠狀病毒才因此得名。
面對眼花繚亂的變異株,很多人不禁要問,為什么新冠病毒能不斷進(jìn)化,而且越來越強(qiáng)呢?
在這里我們要復(fù)習(xí)一下達(dá)爾文的進(jìn)化論:物競天擇,適者生存。地球上存在各種各樣的生物,自然選擇使得一些生物存活和繁衍下去,剩下的則消失滅絕。但當(dāng)時達(dá)爾文并不知道基因的存在,因此缺少了很重要的一部分——生物多樣性的基礎(chǔ)是基因,而且基因突變在有機(jī)生命體里是無時無刻不在發(fā)生的。倘若沒有基因突變,沒有自然選擇,也就沒有今天的人類,地球上可能只有最簡單的單細(xì)胞生物。
我們在中學(xué)生物課上就知道,生物在繁殖的過程中,有一個復(fù)制自己的遺傳物質(zhì)的步驟。絕大部分的遺傳物質(zhì)是DNA,而新冠病毒的遺傳物質(zhì)是RNA。在復(fù)制拷貝的過程中,“錯誤”一定會發(fā)生,雖然大部分生物體都有一個自我審查的過程,但即便審查了,有一些錯誤還是會成為“漏網(wǎng)之魚”。這種“錯誤”絕大部分是無意義的,可能“錯誤”的位置不在基因上,或者錯誤發(fā)生在基因上但并不會改變生成蛋白質(zhì)。舉個例子,我們看氨基酸口訣表就能清楚地知道,三個堿基解碼一個氨基酸,比如GGU、GGC、GGA、GGG 解碼的都是甘氨酸(氨基酸的一種),倘若變異發(fā)生在第三個堿基上,對表達(dá)的蛋白質(zhì)來說完全沒有影響。
然而,新冠病毒的總數(shù)基數(shù)實(shí)在太大,它在全球肆虐了2年多,感染了幾億人,平均每個被感染的病人體內(nèi),病毒復(fù)制的數(shù)量最高峰能達(dá)到10 億到1000 億(不過總的重量不到0.1 微克,順便一提,權(quán)威學(xué)術(shù)刊物《美國科學(xué)院院報》在2021年6月發(fā)表過一次演算,預(yù)測當(dāng)時全球所有的新冠病毒加起來不足10 千克),因此大量的變異一直不斷地產(chǎn)生。新加坡科技研究局的一位科研工作者在2021年5月估算,新冠病毒在17個月變異了6600 次,平均2 小時一次。
既然變異了這么多次,希臘字母豈不是早就不夠用了?實(shí)際上,絕大部分的變異缺乏競爭力,甚至在人體內(nèi)就被清除掉了。對病毒來說,人體的免疫系統(tǒng)就是它的“自然選擇”。當(dāng)初新冠病毒的產(chǎn)生,可能只是一個再普通不過的冠狀病毒復(fù)制自己的RNA 時發(fā)生了一次決定性的“錯誤”,讓它能輕松地繞過人體的免疫防線,在人體內(nèi)快速地復(fù)制自己,并迅速地傳播開去。起初,它的這種能力并不強(qiáng),但在小范圍的傳播過程中,病毒經(jīng)歷了無數(shù)次變異,產(chǎn)生了很多個新的“錯誤”。有些“錯誤”對病毒傳播有利,比如更好地逃逸人體免疫系統(tǒng)的能力,或者能在體外存活更久,這類“高質(zhì)量”的新冠病毒存活了下來并傳播給了更多的人。這時,病毒的復(fù)制總量成指數(shù)增長,變異也是?!案哔|(zhì)量”的病毒不僅擁有了“父母”的高質(zhì)量屬性,自己也通過變異獲得了新的“技能”。對病毒有利的“技能”,在不斷復(fù)制中得到了保留,而新“技能”又通過變異不斷產(chǎn)生。病毒不停優(yōu)化自己,從而成為更加完美的生物。
奧密克戎被認(rèn)為是迄今為止突變最多、變異程度最深的新冠變異毒株,且與原始新冠病毒和之前流行的主要變異株差別非常大。這意味著針對已知病毒和變異株研制的疫苗、藥物的效果可能受到影響。當(dāng)然,我們在擔(dān)憂的同時,也要對國家的防疫工作給予無條件的支持。相信隨著新冠病毒科研工作的深入,科學(xué)家們終將發(fā)明出能阻斷病毒傳播的特效藥物,在不遠(yuǎn)的將來,人類能戰(zhàn)勝病毒或者與病毒共處。