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      金屬離子對(duì)中間錦雞兒2C 型絲/蘇氨酸蛋白磷酸酶酶活的體外調(diào)節(jié)*

      2022-08-06 00:49:20劉昱成韓曉東雷艷紅高仙靈李國(guó)婧賈永紅
      林業(yè)科技 2022年4期
      關(guān)鍵詞:錦雞兒蘇氨酸磷酸酶

      劉昱成 韓曉東 雷艷紅 高仙靈 戴 玉 李國(guó)婧 賈永紅**

      (1.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)植物逆境生理與分子生物學(xué)自治區(qū)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010018;2.內(nèi)蒙古赤峰市翁牛特旗農(nóng)牧局,內(nèi)蒙古 赤峰 024500;3.呼和浩特職業(yè)學(xué)院,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010051)

      植物中存在著多種復(fù)雜的信號(hào)通路,共同調(diào)節(jié)植物的生命活動(dòng),蛋白質(zhì)的磷酸化/去磷酸化是生物調(diào)節(jié)細(xì)胞過(guò)程的一種基本機(jī)制[1],是細(xì)胞信號(hào)通路的重要組成部分[2]。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化分別與蛋白激酶和蛋白磷酸酶有關(guān),絲/蘇氨酸蛋白磷酸酶家族根據(jù)序列的相似性可以分為PPP和PPM 2 個(gè)亞家族,PPP 亞家族包括PP1、PP2A、PP2B 和PP4-7,而PPM 亞家族則是由依賴錳離子和鎂離子的蛋白磷酸酶組成。2C 型蛋白磷酸酶(PP2Cs)屬于PPM 亞家族[3],是蛋白磷酸酶中最大的一個(gè)亞家族,被認(rèn)為在信號(hào)途徑中作為負(fù)調(diào)控因子起作用,通過(guò)與蛋白激酶相互拮抗進(jìn)而調(diào)控蛋白質(zhì)的磷酸化程度。

      PP2Cs 參與多種激素的信號(hào)通路,包括脫落酸(ABA),乙烯等[2,4],目前研究比較深入的是PP2Cs在ABA 信號(hào)通路中的作用[5,6]。ABA 是植物中抵抗生物脅迫和環(huán)境脅迫的重要激素,可以調(diào)節(jié)多種基因的表達(dá),是一種與滲透脅迫相關(guān)的植物激素[7]。研究發(fā)現(xiàn),PP2Cs 在ABA 信號(hào)通路中有著重要的作用,如調(diào)控植物抗病[8]、ABA 依賴的植物發(fā)育(包括種子的萌發(fā)、根的伸長(zhǎng)和氣孔的開(kāi)閉等[9-12])、非生物脅迫(主要為干旱和鹽脅迫[6,13])和不依賴ABA的抗逆境脅迫[14]等過(guò)程。Xue T 等在擬南芥中鑒定出80 個(gè)PP2Cs 基因,水稻中有78 個(gè)。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)PP2C 家族是目前發(fā)現(xiàn)的植物中最大的基因家族之一。系統(tǒng)發(fā)育分析將擬南芥和水稻中的PP2Cs 分別劃分為11(包括A-E、F1、F2、G-H家族)和13 個(gè)亞家族(包括A-E、F1、F2、G-L 家族),不同亞家族的植物PP2Cs 參與不同的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑[1]。

      中間錦雞兒(Caragana intermedia)屬于豆科錦雞兒屬灌木,生命力頑強(qiáng),廣泛分布于內(nèi)蒙古干旱以及半干旱地區(qū)[15],是防治水土流失和土地荒漠化的優(yōu)良造林樹(shù)種之一,對(duì)于保護(hù)環(huán)境及維持生態(tài)平衡有著重要意義[16,17]。本研究利用原核表達(dá)系統(tǒng)對(duì)中間錦雞兒的CiPP2C37-like 蛋白進(jìn)行了表達(dá),研究了不同因素對(duì)CiPP2C37-like 的酶活性影響。

      1 研究材料、實(shí)驗(yàn)試劑及儀器

      1.1 研究材料

      野生型中間錦雞兒成株葉片采自內(nèi)蒙古烏蘭察布市四子王旗。

      1.2 主要試劑

      Imidazole、NaCl(分析純)、Tris-HCl、E·coliDH5α、E·coliBL21、瓊脂糖凝膠DNA 回收試劑盒(Tiangen)、植物總RNA 提取試劑盒(Tiangen)、質(zhì)粒小提試劑盒(上海生工)、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(全式金)、EGTA、MgCl2(分析純)、BSA(北京酷來(lái)博科技有限公司)、β-巰基乙醇、Ser/Thr Phosphatase Assay System(普洛麥格)、酵母粉(Thermo)、蛋白胨(Thermo)、IPTG (北京酷來(lái)博科技有限公司)。

      1.3 主要儀器

      PCR 擴(kuò)增儀(德國(guó)SENSO)、臺(tái)式冷凍離心機(jī)(美國(guó)Backman Coulter)、滅菌鍋(日本三洋)、凝膠成像儀(德國(guó)SYNGENE)、定量紫外檢測(cè)儀(美國(guó)Quawel)、水平槽電泳儀(中國(guó)六一有限公司)、分析天平(德國(guó)Sartorius)、恒溫培養(yǎng)箱(上海福瑪有限公司)、pH計(jì)(德國(guó)Sartorius)、酶標(biāo)儀(美國(guó)Bio Tek)、NTA-親和層析柱(上海生物工程有限公司)、超濾管(美國(guó)MiLipore)。

      2 實(shí)驗(yàn)方法

      2.1 構(gòu)建CiPP2C37-like 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

      從NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中選擇已知功能的PP2C 基因,利用MEGA 軟件基于1 000 次重復(fù)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析。

      2.2 表達(dá)目的蛋白

      2.2.1 RT-PCR 獲得中間錦雞兒cDNA

      取一定量的新鮮野生型中間錦雞兒葉片于液氮中保存,將樣品放在研缽中低溫研磨,采用總RNA提取試劑盒(Tiangen)提取中間錦雞兒RNA,提取步驟均按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。1%瓊脂糖凝膠電泳檢驗(yàn)后用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(全式金)對(duì)檸條總RNA 進(jìn)行RTPCR,具體操作均按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。得到中間錦雞兒的cDNA 存于-20 ℃冰箱,用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

      2.2.2 構(gòu)建CiPP2C37-like 基因原核表達(dá)載體

      根據(jù)cDNA 末端快速擴(kuò)增技術(shù)得到的CiPP2C37-like 基因序列[16],利用Primer Premier 5.0 設(shè)計(jì)引物,以檸條cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增條件為94℃預(yù)變性2 min;94 ℃,30 s;55 ℃,30 s;72 ℃,2 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃,5 min;1%瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證。采用瓊脂糖凝膠DNA 回收試劑盒(Tiangen)回收目的基因,具體操作步驟按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。利用T4DNA 聚合酶的外切活性產(chǎn)生的粘性末端將目的基因連接到pET-30a 載體上,連接產(chǎn)物42 ℃,熱激45 s 后轉(zhuǎn)入克隆菌株DH5α 中。利用卡那霉素抗性平板篩選陽(yáng)性克隆后,挑取單菌落于試管中擴(kuò)增菌體。用質(zhì)粒小提試劑盒提取質(zhì)粒,使用Xho I、Xba I進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證后送華大基因公司測(cè)序。

      2.2.3 誘導(dǎo)表達(dá)CiPPC37-like 蛋白

      將重組質(zhì)粒42 ℃,熱激45 s 后轉(zhuǎn)入表達(dá)菌株E·coli BL21 中。利用卡那霉素抗性平板篩選陽(yáng)性克隆,將篩選出的陽(yáng)性克隆接入終濃度為0.05 mg/mL卡那霉素的100 mL LB 培養(yǎng)基中,37 ℃震蕩培養(yǎng)6 h后,將100 mL 菌液接入含有終濃度為0.05 mg/mL 卡那霉素的1L LB 液體培養(yǎng)基中繼續(xù)震蕩培養(yǎng)2 h,終濃度0.1 mM IPTG、16 ℃過(guò)夜誘導(dǎo)。

      2.2.4 純化CiPPC37-like 蛋白

      誘導(dǎo)12 h 后,5 000 r,離心15 min 收集菌體,用30 mL NTA-0(25 mM Tris-HCl,0.5 M NaCl,pH=8.0)重懸菌體。加入終濃度為1 mM 的DTT,在超聲波信號(hào)發(fā)生器中超聲2 s,間隔4 s,破碎20 min。18 000 r,離心40 min 去除溶液中破碎的菌體。采用Ni-NTA柱純化蛋白上清,分別用25 mL 含有0、10、20、50、100、200、500 mM 咪唑的NTA-0 洗脫目的蛋白,收集含有不同濃度咪唑的NTA-0 洗脫的穿透液,進(jìn)行SDS-PAGE 電泳分析。采用超濾濃縮去除穿透液中含有的磷離子,得到的粗酶液用于后續(xù)酶活的測(cè)定[18]。

      2.3 CiPPC37-like 蛋白酶活的測(cè)定及計(jì)算

      CiPP2C37-like 磷酸酶活性的測(cè)定采用絲蘇氨酸磷酸酶測(cè)定系統(tǒng)(普洛麥格),每個(gè)反應(yīng)體系為50 μL,使用NTA-0 調(diào)整蛋白濃度使每個(gè)體系中蛋白含量在5 μg 以下。將10 μL 反應(yīng)緩沖液(50 mM咪唑,pH7.2,5 mM MgCl2,0.2 mM EGTA 和0.1 mg/mL牛血清白蛋白)與5 μL 多肽底物(隨絲蘇氨酸磷酸酶測(cè)定系統(tǒng)試劑盒提供)預(yù)混勻后在對(duì)應(yīng)反應(yīng)溫度下孵育3 min,加入粗酶樣品反應(yīng)15 min。室溫靜置15 min,待顏色穩(wěn)定后測(cè)定600 nm 處的吸光值。

      酶活力的定義為:在一定條件下,每分鐘釋放出1 μmoL 的磷酸鹽的酶量為一個(gè)酶活力單位(U)。計(jì)算公式如下:

      式中,X 為磷酸酶的酶活力,U/mL;c 為磷酸鹽的濃度,μmol/L;V1為反應(yīng)的總體積,mL;V2為粗酶液的用量,mL;t 為作用時(shí)間,min[19]。

      2.3.1 磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制

      用無(wú)磷水(隨絲蘇氨酸磷酸酶測(cè)定系統(tǒng)試劑盒提供)以1∶20 的比例稀釋磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)(隨絲蘇氨酸磷酸酶測(cè)定系統(tǒng)試劑盒提供)。向96 孔板中分別加入0、2、4、10、20 μL和40μL稀釋后的磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)液,用1×PP2C 緩沖液將體系補(bǔ)足50 μL。向每個(gè)梯度中加入等體積的鉬酸鹽染料顯色,待顏色穩(wěn)定后測(cè)定600 nm 處的吸光度[20]。

      2.3.2 測(cè)定不同溫度、pH 值、金屬離子對(duì)CiPP2C37-like 磷酸酶活性的響應(yīng)

      在20~60 ℃的溫度范圍內(nèi),以5 ℃為間隔設(shè)定溫度梯度,測(cè)定不同溫度下的酶活變化。加入等體積的鉬酸鹽染料顯色,待顏色穩(wěn)定后測(cè)定600 nm處吸光值。分別配置pH 為5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9 的5×PP2C 緩沖液,測(cè)定不同pH 值下的酶促反應(yīng)體系的酶活。金屬離子能夠與酶活性中心結(jié)合,參與電子的轉(zhuǎn)移反應(yīng),穩(wěn)定酶的構(gòu)象,對(duì)酶活力有著較大的影響。配置終濃度為50 mM 的金屬離子(Cu2+、Li+、K+、Na+、Ba2+)5×PP2C 緩沖液,調(diào)節(jié)pH=8.0,以不添加其他金屬離子的PP2C 緩沖液配置酶活體系為對(duì)照,測(cè)定酶活性。

      2.3.3 CiPP2C37-like 磷酸酶對(duì)磷酸肽的親和性

      將1 mM 的磷酸肽(隨普洛麥格試劑盒提供)按比例分別稀釋至0.25、0.5、1 mM。每50 μL反應(yīng)體系加入5μL底物,底物終濃度分別為0.25、0.1、0.05mM。測(cè)定600 nm 處的吸光值,采用雙倒數(shù)作圖法計(jì)算Km 值。

      3 結(jié)果與分析

      3.1 原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)CiPP2C37-like 蛋白

      3.1.1 中間錦雞兒cDNA

      為了獲得中間錦雞兒cDNA,以中間錦雞兒葉片為材料,采用總RNA 提取試劑盒(Tiangen)提取中間錦雞兒總RNA,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證(圖1),提取的總RNA 略有降解,經(jīng)定量紫外檢測(cè)儀檢測(cè),A260/A280=2.153,可用于RT-PCR。

      圖1 中間錦雞兒總RNA 瓊脂糖凝膠電泳

      3.1.2 CiPP2C37-like 全長(zhǎng)cDNA 的克隆及構(gòu)建pET-30a::CiPP2C37-like 表達(dá)載體

      以中間錦雞兒cDNA 為模板進(jìn)行PCR 反應(yīng),獲得CiPP2C37-like 基因,大小為1227 bp。由圖2可見(jiàn),條帶處于2 000 bp 與1 000 bp 之間,特異性較強(qiáng),基本符合預(yù)期結(jié)果,可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。將2.5 μL T4 聚合酶處理的PCR 產(chǎn)物和1 μL同樣經(jīng)T4 聚合酶處理的線性化的pET-30a 載體混合,22 ℃孵育20 min 后加入1 μL 25 mM 的EDTA 終止反應(yīng),22℃繼續(xù)孵育20 min。熱激轉(zhuǎn)化DH5α,對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證(圖3),雙酶切驗(yàn)證成功的質(zhì)粒送華大基因進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果正確。

      圖3 pET-30a-CiPP2C37-like 重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定

      3.1.3 表達(dá)及純化可溶性CiPP2C37-like 蛋白

      為了得到純度較高的CiPP2C37-like 蛋白,對(duì)破碎后的菌體經(jīng)低溫高速離心,取上清進(jìn)行Ni-NTA柱純化。CiPP2C37-like 蛋白大小約為44.88 ku,大部分以包涵體的形式存在于菌體沉淀中,但上清中仍存在部分可溶性蛋白能夠用于酶活性的測(cè)定(圖4)。CiPP2C37-like 蛋白在50 mM 和100 mM 咪唑濃度下被洗脫。將50 mM 和100 mM 咪唑洗脫的穿透液進(jìn)行超濾濃縮,得到粗酶液。

      圖4 Ni 柱純化的CiPP2C37-like蛋白SDS-PAGE 電泳

      3.2 磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制

      為獲得用于后續(xù)進(jìn)行酶活力的計(jì)算對(duì)應(yīng)OD值下的磷酸鹽含量,我們繪制了磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)曲線,繪制方法均按Ser/Thr Phosphatase Assay System 試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。R2=0.997 4>0.995(圖5),符合標(biāo)準(zhǔn)曲線的標(biāo)準(zhǔn),可以用于計(jì)算。

      圖5 磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)曲線

      3.3 CiPP2C37-like 磷酸酶活性對(duì)溫度的響應(yīng)

      通過(guò)不同溫度對(duì)應(yīng)的吸光度利用磷酸鹽標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算酶活力用于繪制酶活溫度曲線。在20 ℃到40 ℃之間,隨著溫度的增高,酶活性逐漸增強(qiáng);40 ℃之后,隨著溫度的升高酶活性逐漸下降(圖6)。表明CiPP2C37-like 反應(yīng)的最適溫度為40 ℃左右。

      圖6 溫度對(duì)酶活力的影響

      3.4 CiPP2C37-like 磷酸酶為堿性磷酸酶

      當(dāng)反應(yīng)體系的pH 值小于7.5 時(shí),CiPP2C37-like磷酸酶活性較弱,當(dāng)反應(yīng)體系pH 值高于7.5 時(shí),酶活性緩慢下降(圖7)。綜上,CiPP2C37-like 磷酸酶活性在堿性條件下較強(qiáng),其最適pH 值為7.5,屬于堿性磷酸酶。

      圖7 pH 值對(duì)酶活力的影響

      3.5 CiPP2C37-like 磷酸酶活性對(duì)金屬離子的響應(yīng)

      以不含金屬離子的酶活反應(yīng)體系為對(duì)照,發(fā)現(xiàn)Li+和Ba2+對(duì)CiPP2C37-like 磷酸酶的活性起到了較為明顯的促進(jìn)作用,K+和Na+對(duì)其活性的影響不明顯。當(dāng)反應(yīng)體系中加入Cu2+時(shí),酶活性被極大的抑制(圖8),推測(cè)原因可能是Cu2+與酶的活性中心結(jié)合,改變了酶的構(gòu)象,影響了酶與底物的結(jié)合能力,降低了磷酸鹽的生成速率,導(dǎo)致酶活性降低。

      圖8 金屬離子對(duì)酶活的影響

      3.6 CiPP2C37-like 蛋白與磷酸肽的親和性

      通過(guò)雙倒數(shù)曲線作圖計(jì)算CiPP2C37-like 蛋白與人工合成磷酸肽(隨試劑盒提供)的Km值。根據(jù)擬合趨勢(shì)線y=0.000 4x+0.0005,算得Km值為0.8(圖9)。

      圖9 Km 值的雙倒數(shù)曲線圖

      3.7 CiPP2C37-like 與擬南芥中PP2CA 親緣關(guān)系

      根據(jù)NCBI 查詢模式植物擬南芥的PP2C 基因,選擇了10 個(gè)已知功能的基因進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,發(fā)現(xiàn)CiPP2C37-like 基因序列與擬南芥中PP2CA 親緣關(guān)系最近(圖10)。已有研究發(fā)現(xiàn)PP2CA在模式植物擬南芥中負(fù)調(diào)控ABA 信號(hào)通路[21-23],故預(yù)測(cè)CiPP2C37-like 蛋白可能在中間錦雞兒的ABA 信號(hào)通路中起作用。

      圖10 CiPP2C37-like 蛋白與擬南芥中PP2C 的系統(tǒng)進(jìn)化分析

      4 結(jié)論

      利用原核表達(dá)系統(tǒng),經(jīng)過(guò)鎳柱純化得到了可溶的、有酶活性的CiPP2C37-like 磷酸酶。確定了CiPP2C37-like 磷酸酶與底物反應(yīng)的最適溫度為40 ℃左右,最適pH 值為7.5。Li+和Ba2+能夠明顯增強(qiáng)酶活性,Cu2+對(duì)酶活性具有抑制作用,其對(duì)絲蘇氨酸磷酸酶測(cè)定系統(tǒng)中的磷酸肽的Km值為0.8。通過(guò)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,發(fā)現(xiàn)CiPP2C37-like 在所有已知功能的PP2C 相關(guān)基因中與PP2CA 的親緣關(guān)系最近,在擬南芥中已揭示部分PP2CA 在ABA信號(hào)途徑中的作用機(jī)理,PP2CA 的缺失導(dǎo)致擬南芥種子萌發(fā)中ABA 高度敏感,抑制ABA 調(diào)控的氣孔閉合[22],通過(guò)ABA 的受體抑制PP2CA 的蛋白活性和E3 連接酶調(diào)控PP2CA 降解,進(jìn)而調(diào)控ABA 相關(guān)基因表達(dá)[23],故預(yù)測(cè)CiPP2C37-like 蛋白可能在ABA 信號(hào)通路中起負(fù)調(diào)節(jié)作用,為日后CiPP2C37-like 蛋白質(zhì)在中間錦雞兒中的作用機(jī)理研究提供參考。

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