宋建治 徐禮森
(武漢市第一醫(yī)院,湖北 武漢 430022)
類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)是一種全身性自身免疫性疾病,以滑膜內(nèi)膜明顯增生為特征,伴有嚴(yán)重的關(guān)節(jié)炎癥〔1,2〕。RA是一種慢性疾病,會(huì)導(dǎo)致關(guān)節(jié)損傷和功能障礙,并給患者帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)負(fù)擔(dān)〔3,4〕。RA的生物學(xué)發(fā)病機(jī)制仍未完全清楚。微小RNA(miRNA)在人類多種疾病中的重要調(diào)控功能已得到肯定,包括RA〔5,6〕,但仍有部分新發(fā)現(xiàn)的miRNA的功能需要探索。miR-1277-5p是一種近期在RA中發(fā)現(xiàn)的失調(diào)miRNA,其在RA中的功能尚未十分清楚。研究表明,含clip結(jié)構(gòu)域的絲氨酸蛋白酶(UBASH)3A在多種自身免疫性疾病中起著關(guān)鍵作用,包括RA〔7〕。但是UBASH3A在RA中的功能及與miR-1277-5p之間的關(guān)系尚未清楚。本研究旨在探討miR-1277-5p、UBASH3A在RA中的功能及關(guān)系。
1.1一般資料 選取2019年1~10月武漢市第一醫(yī)院確診的RA關(guān)節(jié)置換術(shù)患者3例,意外事故導(dǎo)致的截肢或關(guān)節(jié)粉碎的患者2例?;颊呒凹覍倬炇鹬橥鈺?。胎牛血清(FBS)購(gòu)自杭州四季青公司;實(shí)時(shí)熒光定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)試劑盒購(gòu)自日本TaKaRa公司;杜氏細(xì)胞培養(yǎng)基(DMEM)購(gòu)自上?;鄯f生物科技有限公司;細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒(CCK)-8購(gòu)自日本同仁化學(xué)研究所;膜聯(lián)蛋白V-異硫氰酸熒光素/碘化丙啶(Annexin V-FITC/PI)雙染細(xì)胞凋亡檢測(cè)試劑盒購(gòu)自北京索萊寶公司;雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒購(gòu)自上海宇玫博生物。
1.2方法
1.2.1細(xì)胞分離培養(yǎng) 參照彭菲菲等〔8〕的方法,將正?;そM織和RA滑膜組織采用組織塊和酶消化法分離正常滑膜細(xì)胞和RA滑膜細(xì)胞,分別標(biāo)記為正常組和RA組。將細(xì)胞使用DMEM培養(yǎng)基(10% FBS)進(jìn)行常規(guī)的細(xì)胞培養(yǎng)、傳代,用5~7代的細(xì)胞用于實(shí)驗(yàn)。
1.2.2實(shí)驗(yàn)分組 將分離培養(yǎng)的RA滑膜細(xì)胞標(biāo)記為RA組、對(duì)照組,并將其隨機(jī)分為miR-NC組、miR-1277-5p組、anti-miR-NC組、anti-miR-1277-5p組、pcDNA組、pcDNA-UBASH3A組、si-NC組、si-UBASH3A組、miR-1277-5p+pcDNA組、miR-1277-5p+pcDNA-UBASH3A組、anti-miR-1277-5p+si-NC組、anti-miR-1277-5p+si-UBASH3A組。各組細(xì)胞均按1:3的量加入脂質(zhì)體將相應(yīng)的質(zhì)?;駾NA進(jìn)行轉(zhuǎn)染。miR-NC組(轉(zhuǎn)染miR-NC)、miR-1277-5p組(轉(zhuǎn)染miR-1277-5p mimics)、anti-miR-NC組(轉(zhuǎn)染anti-miR-NC)、anti-miR-1277-5p組(轉(zhuǎn)染anti-miR-1277-5p)、pcDNA組(轉(zhuǎn)染pcDNA)、pcDNA-UBA-SH3A組(轉(zhuǎn)染pcDNA-UBASH3A)、si-NC組(轉(zhuǎn)染si-NC)、si-UBASH3A組(轉(zhuǎn)染si-UBASH3A)、miR-1277-5p+pcDNA組(共轉(zhuǎn)染miR-1277-5p mimics和pcDNA)、miR-1277-5p+pcDNA-UBASH3A組(共轉(zhuǎn)染miR-1277-5p mimics和pcDNA-UBASH3A)、anti-miR-1277-5p+si-NC組(共轉(zhuǎn)染anti-miR-1277-5p和si-NC)、anti-miR-1277-5p+si-UBASH3A組(共轉(zhuǎn)染anti-miR-1277-5p和si-UBASH3A),轉(zhuǎn)入RA滑膜細(xì)胞,轉(zhuǎn)染48 h,用qRT-PCR確認(rèn)轉(zhuǎn)染成功后用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究。
1.2.3qRT-PCR 收集待檢測(cè)的細(xì)胞,提取總RNA,并將其反轉(zhuǎn)錄為cDNA,-20℃保存、備用。用qRT-PCR試劑盒檢測(cè)樣本中的miR-1277-5p、UBASH3A mRNA表達(dá)。結(jié)果以U6、GAPDH為內(nèi)參,2-△△Ct法計(jì)算miR-1277-5p、UBASH3A的表達(dá)水平。miR-1277-5p上游引物5′-ACACTCCAGCTGGGAAATATATATATATATGT-3′,下游引物5′-TGGTGTCGTGGAGTCG-3′;UBASH3A上游引物5′-GGA CTTGCACGACTAA-3′, 下游引物5′-CCGT-ACGTCAATTGAC-3′;U6上游引物5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游引物5′-AACGCTTCACGA-ATTTGCG T-3′;GAPDH上游引物5′-CTCTGCTCCTCCTGTTC GAC-3′,下游引物5′-GCGCCCAATACGACCAAATC-3′。
1.2.4Western印跡實(shí)驗(yàn) 將需要檢測(cè)的細(xì)胞裂解、提取總蛋白并定量和變性,用上清液進(jìn)行蛋白電泳上樣。用5%的分離膠和8%的濃縮膠進(jìn)行電泳,再用轉(zhuǎn)膜儀將蛋白從膠上轉(zhuǎn)移至聚偏氟乙烯(PVDF)膜,最后用2.5%脫脂奶粉封閉2 h。行一抗(1∶1 500)4℃孵育過夜,二抗(1∶1 000)37℃孵育2 h。用超敏電化學(xué)(ECL)發(fā)光試劑盒進(jìn)行顯影曝光。以目的條帶灰度與內(nèi)參條帶灰度的比值表示蛋白的表達(dá)水平。
1.2.5CCK-8實(shí)驗(yàn) 將需要檢測(cè)的細(xì)胞調(diào)整至105個(gè)/ml,按照CCK-8試劑盒要求操作,取適量細(xì)胞加入CCK-8溶液反應(yīng),終止反應(yīng)后,在490 nm波長(zhǎng)下檢測(cè)細(xì)胞吸光度(A)。細(xì)胞增殖率為A490樣本/A490對(duì)照×100%。
1.2.6流式細(xì)胞術(shù) 先將需要檢測(cè)的細(xì)胞用磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌2次,重懸,再用結(jié)合緩沖液將細(xì)胞懸浮。然后按照Annexin V-FITC/PI雙染細(xì)胞凋亡檢測(cè)試劑盒要求操作,加入Annexin V-FITC、PI,避光反應(yīng)15 min,結(jié)束后,快速上流式細(xì)胞儀進(jìn)行結(jié)果檢測(cè)分析。細(xì)胞凋亡率為Annexin V-FITC陽(yáng)性率與PI陽(yáng)性率之和。
1.2.7生物信息學(xué)預(yù)測(cè) 使用生物信息學(xué)在線預(yù)測(cè)網(wǎng)站mircode(http://mircode.org/)和StarBase(http://starbase.sysu.edu.cn)預(yù)測(cè)與UBASH3A存在結(jié)合位點(diǎn)的miRNA,從中篩選保守的miRNA。另一方面結(jié)合NCBI中上傳的RA相關(guān)的差異miRNA表達(dá)譜分析,確定miRNA。
1.2.8雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn) 首先通過化學(xué)合成野生型UBASH3A片段(UBASH3A-WT)和突變型UBASH3A片段(UBASH3A-MUT),再將其克隆至psiCHECK2載體,構(gòu)建熒光素酶報(bào)告載體并提取質(zhì)粒。用8倍質(zhì)粒量的脂質(zhì)體將miR-NC、miR-1277-5p、anti-miR-NC、anti-miR-1277-5p分別與psiCHE CK2-UBASH3A-WT、psiCHECK2-UBASH3A-MUT共轉(zhuǎn)染48 h。用雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)所處理細(xì)胞的熒光素酶活性。測(cè)量螢火蟲熒光素酶的活性(F),在測(cè)量海腎熒光素酶熒光強(qiáng)度(R),結(jié)果以二者的比值(R/F)表示。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用PEMS3.2軟件進(jìn)行單因素方差分析、LSD-q檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)。GraphPad Prism6.0進(jìn)行相關(guān)圖片的繪制。
2.1各組miR-1277-5p、UBASH3A水平比較 與對(duì)照組關(guān)節(jié)滑膜細(xì)胞相比,RA組關(guān)節(jié)滑膜細(xì)胞中miR-1277-5p表達(dá)水平明顯降低,UBASH3A mRNA和蛋白表達(dá)水平均明顯升高(P<0.05)。見圖1和表1。
2.2miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的調(diào)控 與miR-NC組相比,miR-1277-5p組RA滑膜細(xì)胞miR-1277-5p mRNA表達(dá)水平明顯升高,細(xì)胞增殖率明顯降低,細(xì)胞凋亡率明顯升高,增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)、凋亡抑制蛋白(XIAP)表達(dá)水平明顯降低,P16、裂解DNA修復(fù)酶(cleaved-PARP)蛋白表達(dá)水平明顯升高(P<0.05);與anti-miR-NC組相比,anti-miR-1277-5p組RA滑膜細(xì)胞miR-1277-5p mRNA表達(dá)水平明顯降低,細(xì)胞增殖率明顯升高,細(xì)胞凋亡率明顯降低,PCNA、XIAP蛋白表達(dá)水平明顯升高,P16、cleaved-PARP蛋白表達(dá)水平明顯降低(P<0.05)。見圖2、表2、圖3。
圖1 UBASH3A在RA滑膜細(xì)胞中表達(dá)
表1 各組miR-1277-5p、UBASH3A表達(dá)
圖2 miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞凋亡的調(diào)控
表2 miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的影響
1~5:對(duì)照組,miR-NC組,miR-1277-5p組,anti-miR-NC組,anti-miR-1277-5p組圖3 RA滑膜細(xì)胞增殖凋亡相關(guān)蛋白的表達(dá)
2.3miR-1277-5p靶向UBASH3A 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)果見圖4,miR-1277-5p與UBASH3A之間存在連續(xù)的7個(gè)核苷酸互補(bǔ)結(jié)合位點(diǎn)。與miR-NC組相比,miR-1277-5p組UBASH3A-WT細(xì)胞熒光素酶活性明顯降低,與anti-miR-NC組相比,anti-miR-1277-5p組UBASH3A-WT細(xì)胞熒光素酶活性明顯升高(P<0.05)。miR-1277-5p負(fù)向調(diào)控UBASH3A蛋白表達(dá)水平(P<0.05)。見圖5和表3。
圖4 miR-1277-5p與UBASH3A之間的結(jié)合位點(diǎn)
1~4:miR-NC組,miR-1277-5p組,anti-miR-NC組,anti-miR-1277-5p組圖5 miR-1277-5p調(diào)控UBASH3A蛋白表達(dá)
表3 miR-1277-5p直接調(diào)控
2.4UBASH3A對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的調(diào)控 與pcDNA組相比,pcDNA-UBASH3A組RA滑膜細(xì)胞UBASH3A mRNA表達(dá)水平明顯升高,細(xì)胞增殖率明顯升高,細(xì)胞凋亡率明顯降低,PCNA、XIAP蛋白表達(dá)水平明顯升高,P16、cleaved-PARP蛋白表達(dá)水平明顯降低(P<0.05);與si-NC組相比,si-UBASH3A組RA滑膜細(xì)胞UBASH3A mRNA表達(dá)水平明顯降低,細(xì)胞增殖率明顯降低,細(xì)胞凋亡率明顯升高,PCNA、XIAP蛋白表達(dá)水平明顯降低,P16、cleaved-PARP蛋白表達(dá)水平明顯升高(P<0.05)。見圖6、表4、圖7。
圖6 UBASH3A處理的RA滑膜細(xì)胞凋亡
表4 UBASH3A對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的調(diào)控
1~4:pcDNA組,pcDNA-UBASH3A組,si-NC組,si-UBASH3A組圖7 UBASH3A處理的RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡相關(guān)蛋白表達(dá)
2.5過表達(dá)UBASH3A部分逆轉(zhuǎn)miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的作用 與miR-1277-5p+pcDNA組相比,miR-1277-5p+pcDNA-UBASH3A組RA滑膜細(xì)胞miR-1277-5p mRNA表達(dá)水平明顯降低,細(xì)胞增殖率明顯升高,細(xì)胞凋亡率明顯降低,PCNA、XIAP蛋白表達(dá)水平明顯升高,P16、cleaved-PARP蛋白表達(dá)水平明顯降低(P<0.05)。見圖8、圖9、表5。
圖8 過表達(dá)UBASH3A和miR-1277-5p處理的RA滑膜細(xì)胞凋亡圖
1,2:miR-1277-5p+pcDNA組,miR-1277-5p+pcDNA-UBASH3A組圖9 Western印跡檢測(cè)PCDNA、P16、XIAP、cleaved-PARP水平
表5 過表達(dá)UBASH3A部分逆轉(zhuǎn)miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的調(diào)控
2.6抑制UBASH3A逆轉(zhuǎn)anti-miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的作用 與anti-miR-1277-5p+si-NC組相比,anti-miR-1277-5p+si-UBASH3A組RA滑膜細(xì)胞miR-1277-5p mRNA表達(dá)水平明顯升高,細(xì)胞增殖率明顯降低,細(xì)胞凋亡率明顯升高,PCNA、XIAP蛋白表達(dá)水平明顯降低,P16、cleaved-PARP蛋白表達(dá)水平明顯升高(P<0.05)。見表6、圖10、圖11。
表6 抑制UBASH3A逆轉(zhuǎn)anti-miR-1277-5p對(duì)RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡的作用
圖10 抑制UBASH3A和miR-1277-5p處理的RA滑膜細(xì)胞凋亡
1,2:anti-miR-1277-5p+si-NC組,anti-miR-1277-5p+si-UBASH3A組圖11 抑制UBASH3A和miR-1277-5p處理的RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡相關(guān)蛋白電泳
研究證實(shí)miRNA在RA中具有重要作用〔5,9〕。Crowe等〔10〕報(bào)道,miR-1277-5p是人骨關(guān)節(jié)炎(OA)軟骨細(xì)胞中異常下調(diào)的miRNA之一。Wang等〔11〕研究顯示,miR-1277-5p可同時(shí)靶向長(zhǎng)鏈非編碼RNA X失活特異性轉(zhuǎn)錄本(XIST)、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)-13和血小板反應(yīng)蛋白1型基序5的ADAM金屬肽酶(ADAMTS5)參與OA發(fā)展,具體為XIST通過在OA中起miR-1277-5p的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA)的作用來(lái)促進(jìn)MMP-13和ADAMTS5表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)降解。本研究結(jié)果說(shuō)明miR-1277-5p在RA滑膜細(xì)胞的增殖、凋亡中具有關(guān)鍵作用。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),miR-1277-5p還可靶向UBASH3A,這可能與miR-1277-5p在RA中的功能具有聯(lián)系。研究在韓國(guó)和歐洲人群中通過全基因組分析發(fā)現(xiàn)兩個(gè)新的RA易感基因(UBASH3A和SYNG-R1)〔12〕。Liu等〔13〕研究中也報(bào)道,UBASH3A與RA患者的疾病嚴(yán)重程度具有緊密相關(guān)性。Yang等〔14〕研究發(fā)現(xiàn),RA患者的 外周血單核細(xì)胞(PBMC)中UBASH3A的mRNA表達(dá)異常增加,揭示UBASH3A失調(diào)可能與RA的發(fā)病有關(guān),并且UBASH3A基因多態(tài)性(rs1893592和rs3788013)可能導(dǎo)致中國(guó)漢族人群RA的易感性。本研究結(jié)果說(shuō)明UBASH3A在RA中的失調(diào),確實(shí)具有促進(jìn)RA病情發(fā)展的作用;UBASH3A能夠恢復(fù)miR-1277-5p在RA滑膜細(xì)胞增殖、凋亡中的作用。這些結(jié)果為miR-1277-5p、UBASH3A在RA中的功能探索奠定基礎(chǔ)。