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      浙江長(zhǎng)興揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性研究

      2022-08-13 03:13:14方黎明付春正鄒衛(wèi)強(qiáng)任大斌徐菊敏韓群花萬(wàn)秋紅方盛國(guó)
      野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2022年3期
      關(guān)鍵詞:揚(yáng)子鱷多態(tài)微衛(wèi)星

      方黎明 付春正 李 慧 鄒衛(wèi)強(qiáng) 任大斌 徐菊敏 韓群花 萬(wàn)秋紅 方盛國(guó)*

      (1.長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷自然保護(hù)區(qū),長(zhǎng)興,313100;2.浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,生命系統(tǒng)穩(wěn)態(tài)與保護(hù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(浙江大學(xué)),國(guó)家瀕危野生動(dòng)植物種質(zhì)基因保護(hù)中心(浙江大學(xué)),杭州,310058)

      生物多樣性是指地球上生存的所有動(dòng)物、植物、微生物和這些生物所擁有的所有遺傳物質(zhì),以及由這些生物構(gòu)成的生態(tài)系統(tǒng),即由遺傳多樣性、物種多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性三部分組成,其中遺傳多樣性是生物多樣性的重要組成部分,是自然界中物種或種群內(nèi)各種不同等位基因的總和,表現(xiàn)為在生物體遺傳上的千差萬(wàn)別[1-5]。遺傳多樣性能夠反應(yīng)物種或種群的遺傳變異水平,生物的遺傳多樣性越高,其對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力就越強(qiáng),生存能力也就越強(qiáng),因此遺傳多樣性是衡量物種或種群生存、進(jìn)化和環(huán)境條件適應(yīng)的關(guān)鍵指標(biāo)[6-7]。此外,遺傳多樣性也是保護(hù)生物學(xué)研究的重要內(nèi)容之一,它可以在一定范圍內(nèi)決定物種的數(shù)量及分布范圍,如果缺乏對(duì)生物的遺傳多樣性研究,就無(wú)法準(zhǔn)確地認(rèn)識(shí)物種種群的地理分布格局、進(jìn)化歷史、適應(yīng)機(jī)理、物種數(shù)量增長(zhǎng)和滅絕等問(wèn)題[8-9]。

      微衛(wèi)星標(biāo)記因多態(tài)性豐富、共顯性遺傳、易于檢測(cè)且有效性高和重復(fù)性好等特點(diǎn),在分析物種或種群的遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系中表現(xiàn)出巨大的優(yōu)勢(shì),被認(rèn)為是研究物種或種群遺傳變異的最優(yōu)分子標(biāo)記,廣泛應(yīng)用于羊、馬、牛、豬和雞等家畜、家禽的遺傳多樣性研究[10-18]。此外,微衛(wèi)星標(biāo)記檢測(cè)因?qū)δ0錎NA要求低,且操作過(guò)程簡(jiǎn)捷、高效和自動(dòng)化,在對(duì)瀕危野生動(dòng)物如揚(yáng)子鱷(Alligatorsinensis)、東北馬鹿(Cervuscanadensis)、朱鹮(Nipponianippon)、大熊貓(Ailuropodamelanoleuca)、虎(Pantheratigris)、豹貓(Prionailurusbengalensis)、丹頂鶴(Grusjaponensis)、東北梅花鹿(Cervusnipponhortulorum)和西伯利亞狍(Capreoluspygargus)[19-27]等的保護(hù)遺傳學(xué)研究中,該檢測(cè)技術(shù)的應(yīng)用越來(lái)越廣泛。

      揚(yáng)子鱷是中國(guó)特有的珍稀瀕危物種,屬爬行綱(Reptilia),鱷形目(Crocodylia),鼉科(Alligatoridae),短吻鱷屬(Alligator)[28-29]。該物種曾廣泛分布于我國(guó)大部分區(qū)域,南起海南儋州,北到新疆呼圖壁;西起新疆呼圖壁,東至浙江余姚,均有揚(yáng)子鱷分布[30]。但隨著氣候變遷、人類對(duì)揚(yáng)子鱷的過(guò)度捕殺及人類對(duì)揚(yáng)子鱷棲息環(huán)境的破壞,導(dǎo)致?lián)P子鱷分布范圍大幅縮小,現(xiàn)今揚(yáng)子鱷主要分布于浙江長(zhǎng)興和安徽宣城[30-31]。浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)始建于1979年,最初的種群由11條奠基揚(yáng)子鱷個(gè)體組成,截至2019年9月,該保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷數(shù)量已達(dá)6 691條[32-33]。浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)由核心區(qū)和野放區(qū)兩部分組成,核心區(qū)為揚(yáng)子鱷研究繁育中心,即最初建設(shè)的揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)所在區(qū)域;野放區(qū)在“國(guó)家Ⅱ期工程”——浙江省揚(yáng)子鱷放歸自然建設(shè)項(xiàng)目的資助下于2009年開(kāi)始建設(shè),2011年完成[32,34]。2012年4月15日,保護(hù)區(qū)首次從核心區(qū)甄選120條揚(yáng)子鱷放歸至野放區(qū),作為野放區(qū)的奠基種群[34-35]。自此,保護(hù)區(qū)每年都從核心區(qū)內(nèi)挑選一定數(shù)量的7~8齡的揚(yáng)子鱷放歸至野放區(qū),截至2019年7月,已有960條揚(yáng)子鱷被放歸至野放區(qū)[34,36-37]。隨著野放區(qū)揚(yáng)子鱷的繁殖,野放區(qū)揚(yáng)子鱷已經(jīng)繁衍發(fā)育成一個(gè)數(shù)量較大的種群。

      已有研究[32,38-40]大多利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群個(gè)體進(jìn)行親子鑒定,或?qū)ΡWo(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性進(jìn)行整體性分析,并未對(duì)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性進(jìn)行單獨(dú)分析和比較,導(dǎo)致保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性差異研究尚有不足。因此,本研究通過(guò)隨機(jī)采集浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)的成年揚(yáng)子鱷血液樣本,利用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù),對(duì)核心區(qū)和野放區(qū)種群進(jìn)行遺傳多樣性分析,從而了解核心區(qū)和野放區(qū)種群的遺傳多樣性及種群遺傳分化情況,為核心區(qū)揚(yáng)子鱷放歸至野放區(qū)提供分子水平上的理論依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 樣品采集與DNA提取

      1.2 微衛(wèi)星標(biāo)記及引物信息

      13個(gè)多態(tài)性較高的微衛(wèi)星標(biāo)記信息見(jiàn)表1[38-39,43]。引物均由上海捷瑞生物工程有限公司合成,上游引物的5′端進(jìn)行熒光修飾(FAM、HEX或TAMRA)。

      表1 微衛(wèi)星標(biāo)記信息

      續(xù)表1

      1.3 PCR擴(kuò)增及STR擴(kuò)增產(chǎn)物掃描分析

      使用20.0 μL PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系,包括2×TaqMaster Mix(上海捷瑞生物工程有限公司)10.0 μL,ddH2O 8.0 μL,模板DNA 1.0 μL,上、下游引物各0.5 μL。PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,在各引物對(duì)應(yīng)的退火溫度下退火30 s,72 ℃延伸30 s,擴(kuò)增34個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸5 min,4 ℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳(120 V,30 min)檢測(cè),將擴(kuò)增成功的PCR產(chǎn)物送至Invitrogen(上海英俊)生物技術(shù)有限公司進(jìn)行STR擴(kuò)增產(chǎn)物掃描分析,確定擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小。

      1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

      使用GeneMarker v1.5讀取STR擴(kuò)增產(chǎn)物掃描分析結(jié)果,確定微衛(wèi)星標(biāo)記片段大??;使用Excel Microsatellite Toolkit version 3.1計(jì)算等位基因頻率、等位基因大小范圍、多態(tài)信息含量和數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)化;等位基因數(shù)量、有效等位基因數(shù)量、觀測(cè)雜合度、期望雜合度、香農(nóng)信息指數(shù)和F-統(tǒng)計(jì)值用POPGENE 1.32計(jì)算;分子方差分析(AMOVA)、FST矩陣計(jì)算和基因流計(jì)算由Arlequin 3.5.2.2完成。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 等位基因分布及頻率

      核心區(qū)和野放區(qū)130條揚(yáng)子鱷在13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記中共檢測(cè)到31個(gè)等位基因,其中含有2個(gè)稀有等位基因(基因頻率<5.00%[44])。13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群中均表現(xiàn)出多態(tài)性,微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-9、CXA-34、CXA-35、CXA-43和CXA-136均具有3個(gè)等位基因,其余8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記均具有2個(gè)等位基因。核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群在13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記上均具有相同的31個(gè)等位基因,平均等位基因數(shù)量均為2.38個(gè)。

      13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因頻率在保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群間存在差異。CXA-4微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因共有2個(gè),大小分別為123、128 bp,核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群基因頻率較高的等位基因是128 bp(64.62%),而野放區(qū)為123 bp(52.31%);CXA-41微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因共有2個(gè),大小分別為156、160 bp,核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群基因頻率較高的等位基因是160 bp(57.69%),而野放區(qū)為156 bp(53.08%);CXA-43微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因共有3個(gè),大小分別為113、117、129 bp,核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群基因頻率較高的等位基因是為113 bp(56.92%),而野放區(qū)為117 bp(49.23%)。其余10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-6、CXA-9、CXA-34、CXA-35、CXA-37、CXA-39、CXA-135、CXA-136、CXA-138和CXA-142,雖然每個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因在核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群間的基因頻率存在差異,但每個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的較高基因頻率的等位基因是一致的,如CXA-35微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因共有3個(gè),大小分別為110、114、118 bp,核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群基因頻率較高的等位基因均為114 bp,頻率分別為87.69%和90.00%。此外,基因頻率<5.00%的等位基因包括微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-9的117 bp,核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群中該基因的頻率分別為3.08%和0.77%;微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-35的118 bp,核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群該基因的頻率分別為3.08%和4.62%(表2)。

      表2 核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因長(zhǎng)度和頻率

      2.2 微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性

      保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的各遺傳多樣性參數(shù)詳見(jiàn)表3。13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因數(shù)量為2或3個(gè),平均等位基因數(shù)量為2.38個(gè);有效等位基因數(shù)量為1.26~2.59個(gè),平均有效等位基因數(shù)量為1.88個(gè),平均等位基因數(shù)量與平均有效等位基因數(shù)量存在差異。有效等位基因數(shù)量最高的微衛(wèi)星標(biāo)記是CXA-34,為2.59個(gè);有效等位基因數(shù)量最低的微衛(wèi)星標(biāo)記是CXA-35,為1.26個(gè)。

      表3 保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性參數(shù)

      13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的觀測(cè)雜合度為0.21~0.75,平均觀測(cè)雜合度為0.50,觀測(cè)雜合度最高的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-34;觀測(cè)雜合度最低的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-9和CXA-35。13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的期望雜合度為0.20~0.62,平均期望雜合度為0.45,期望雜合度最高的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-34;期望雜合度最低的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-35。微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-9和CXA-43的觀測(cè)雜合度低于其期望雜合度。

      13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)信息含量為0.19~0.54,平均多態(tài)信息含量為0.36,多態(tài)信息含量最高的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-34;多態(tài)信息含量最低的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-35。微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-34和CXA-43為高度多態(tài)標(biāo)記(多態(tài)信息含量>0.50[16]);微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-4、CXA-6、CXA-9、CXA-37、CXA-39、CXA-41、CXA-136、CXA-138和CXA-142為中度多態(tài)標(biāo)記(0.25<多態(tài)信息含量<0.50[16]);微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-35和CXA-135為低度多態(tài)標(biāo)記(多態(tài)信息含量<0.25[16])。13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的香農(nóng)信息指數(shù)為0.42~1.01,平均香農(nóng)信息指數(shù)為0.68,香農(nóng)信息指數(shù)最高的微衛(wèi)星標(biāo)記為CXA-34,最低的為CXA-35。

      微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-34的各遺傳多樣性參數(shù),包括有效等位基因數(shù)量、觀測(cè)雜合度、期望雜合度、多態(tài)信息含量和香農(nóng)信息指數(shù)的數(shù)值在13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記中均最高,表明該微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳變異最大,遺傳多樣性最豐富;相反,微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-35的各遺傳多樣性參數(shù)在13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記中均最低,表明該微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳變異最小,遺傳多樣性最匱乏。

      2.3 核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性

      核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群具有相同的平均等位基因數(shù)量,但核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群的平均有效等位基因數(shù)量高于野放區(qū);核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群的平均觀測(cè)雜合度、平均期望雜合度、平均多態(tài)信息含量和平均香農(nóng)信息指數(shù)均高于野放區(qū),表明野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群相較于核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳變異少,遺傳多樣性相對(duì)缺乏(表4)。

      表4 核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性參數(shù)

      2.4 保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳變異與分化

      在保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群具有的總遺傳變異中,有96.83%的遺傳變異來(lái)源于各種群內(nèi)個(gè)體間的遺傳變異,僅有3.17%的遺傳變異來(lái)源于核心區(qū)和野放區(qū)種群間的遺傳變異,表明保護(hù)區(qū)種群內(nèi)的遺傳變異主要來(lái)源于個(gè)體之間的遺傳變異,核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群間的遺傳變異較少,遺傳分化程度較低(表5)。

      表5 保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳變異的分子方差分析結(jié)果

      13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的FIS值為-0.409 5(CXA-142)~0.289 9(CXA-9),平均值為-0.153 1,其中只有微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-9的FIS值為正值,其余12個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的FIS值均為負(fù)值;13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的FIT值為-0.387 6(CXA-41)~0.301 4(CXA-9),平均值為-0.130 0,其中微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-9和CXA-43的FIT值為正值,其余11個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的FIT值均為負(fù)值,且13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的FIS值均小于FIT值;13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的FST值為0.000 2(CXA-37、CXA-39和CXA-136)~0.056 7(CXA-135),平均值為0.020 0(表6)。

      13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的FIS值分別為-0.607 3(CXA-142)~0.413 7(CXA-9)和-0.588 4(CXA-34)~0.0851(CXA-35);13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的FIT值與其自身的FIS值相同,且13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群中的FST值均為0(表6)。此外,保護(hù)區(qū)核心區(qū)與野放區(qū)的FST值為0.031 7,基因流為7.631 5(表7),表明保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳分化程度較低。

      表6 13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的F-統(tǒng)計(jì)值

      表7 核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群間的FST值和基因流

      3 討論

      在微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因中,若某一等位基因的頻率很高,那么該等位基因則很容易遺傳給子代;而若某一等位基因的頻率<5.00%,則稱為稀有等位基因,其在生物種群繁衍過(guò)程中,遺傳給子代的概率很小,很容易在種群繁衍過(guò)程中消失[26,44]。因此,在保護(hù)瀕危動(dòng)物種群繁衍過(guò)程中所發(fā)現(xiàn)的稀有等位基因,也是瀕危動(dòng)物遺傳多樣性研究的重要內(nèi)容[26]。本研究中的13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群中共檢測(cè)到稀有等位基因2個(gè),占所有等位基因的6.45%,分別為微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-9,長(zhǎng)度為117 bp,該基因在核心區(qū)和野放區(qū)種群中的頻率分別為3.08%和0.77%;微衛(wèi)星標(biāo)記CXA-35,長(zhǎng)度為118 bp,該基因在核心區(qū)和野放區(qū)種群中的頻率分別為3.08%和4.62%。稀有等位基因是生物進(jìn)化的重要成果,同樣也是遺傳多樣性保護(hù)的重要內(nèi)容,特別是對(duì)于像浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)中人工繁殖的瀕危小種群,檢測(cè)到的2個(gè)稀有等位基因很可能是最初揚(yáng)子鱷種群中相對(duì)普遍存在的等位基因,但由于20世紀(jì)60年代的氣候變遷,人類對(duì)揚(yáng)子鱷的過(guò)度捕殺和人類對(duì)揚(yáng)子鱷棲息環(huán)境的破壞,造成了揚(yáng)子鱷種群的遺傳瓶頸以及在保護(hù)過(guò)程中人工選擇造成的基因頻率下降。因此,為了保護(hù)浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性,這些稀有等位基因更應(yīng)該得到重視[24,26,45]。在將來(lái)的揚(yáng)子鱷繁育保護(hù)過(guò)程中,研究人員應(yīng)該重點(diǎn)關(guān)注具有稀有等位基因的揚(yáng)子鱷個(gè)體,如有必要,可對(duì)其進(jìn)行集中飼養(yǎng)繁育,防止稀有等位基因在揚(yáng)子鱷隨機(jī)交配繁衍過(guò)程中丟失,造成保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性的進(jìn)一步下降。此外,需對(duì)保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性進(jìn)行定時(shí)檢測(cè),監(jiān)測(cè)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群內(nèi)稀有等位基因動(dòng)態(tài)變化情況,如發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)區(qū)域的揚(yáng)子鱷種群稀有等位基因頻率快速下降且呈消失趨勢(shì),應(yīng)及時(shí)在另一種群內(nèi)選取合適揚(yáng)子鱷個(gè)體補(bǔ)充至稀有等位基因即將消失的種群內(nèi)。

      衡量微衛(wèi)星標(biāo)記多態(tài)性的一個(gè)重要指標(biāo)是多態(tài)信息含量,當(dāng)一個(gè)標(biāo)記的多態(tài)信息含量>0.50時(shí)為高度多態(tài)標(biāo)記;0.25<多態(tài)信息含量<0.50時(shí)為中度多態(tài)標(biāo)記;多態(tài)信息含量<0.25時(shí)為低度多態(tài)標(biāo)記[6,46]。此外,微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)信息含量還與該標(biāo)記的可用性和使用效率相關(guān),微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)信息含量越大,在一個(gè)生物種群中該標(biāo)記的雜合子比例就越大,提供的遺傳信息就越多[46]。本研究使用的13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)信息含量為0.19~0.54,平均多態(tài)信息含量為0.36,其中2個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記為高度多態(tài)標(biāo)記,9個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記為中度多態(tài)標(biāo)記,2個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記為低度多態(tài)標(biāo)記,因此本研究使用的13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記可作為研究浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群遺傳多樣性的有效遺傳標(biāo)記[47]。浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的平均有效等位基因數(shù)量、平均觀測(cè)雜合度、平均期望雜合度、平均多態(tài)信息含量和平均香農(nóng)信息指數(shù)均低于保護(hù)區(qū)核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群,表明保護(hù)區(qū)野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性相對(duì)缺乏。這一結(jié)果可能與在野放過(guò)程中未對(duì)核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群、野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群以及挑選的野放個(gè)體的遺傳多樣性進(jìn)行系統(tǒng)性分析有關(guān)。

      本研究利用13個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群進(jìn)行遺傳多樣性分析,并比較保護(hù)區(qū)核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性差異,了解了浙江長(zhǎng)興尹家邊揚(yáng)子鱷保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群在生存和繁衍過(guò)程中可能存在低頻等位基因丟失的情況。本研究?jī)H檢測(cè)到2個(gè)稀有等位基因,因此在后續(xù)的揚(yáng)子鱷種群保護(hù)繁殖過(guò)程中,保護(hù)區(qū)應(yīng)注重對(duì)低頻等位基因及稀有等位基因的監(jiān)測(cè)和保護(hù)。此外,本研究還發(fā)現(xiàn),雖然2012—2019年保護(hù)區(qū)核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群中已有960條揚(yáng)子鱷被放歸至野放區(qū),但保護(hù)區(qū)野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性與核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群仍存在一定差異[36-37],野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的平均有效等位基因數(shù)量、平均觀測(cè)雜合度、平均期望雜合度、平均多態(tài)信息含量和平均香農(nóng)信息指數(shù)均低于核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群,因此在后續(xù)的揚(yáng)子鱷野外放歸過(guò)程中,保護(hù)區(qū)應(yīng)注重分析核心區(qū)和野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性,保證保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性不會(huì)在野放過(guò)程中降低,從核心區(qū)揚(yáng)子鱷種群中挑選出合適的野放個(gè)體進(jìn)行野外放歸,從而豐富野放區(qū)揚(yáng)子鱷種群的遺傳多樣性。

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