付寬寬,王小兵,汪曉麗,陳 悅,程 通
(揚州大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院 江蘇揚州 225127)
隨著我國社會經(jīng)濟(jì)的高速發(fā)展和農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的優(yōu)化調(diào)整,我國設(shè)施農(nóng)業(yè)也迎來了高速發(fā)展期。其中,設(shè)施蔬菜生產(chǎn)更是從粗放型逐漸向集約型轉(zhuǎn)變。因為設(shè)施蔬菜種植環(huán)境的密閉性和模式的單一性,導(dǎo)致設(shè)施蔬菜連作現(xiàn)象嚴(yán)重,很容易出現(xiàn)土壤質(zhì)量退化和土傳病害發(fā)生嚴(yán)重等問題。
我國將通過碳源和淹水結(jié)合的方式創(chuàng)造厭氧環(huán)境殺死土傳病害來改善土壤連作障礙的方法叫做強(qiáng)還原土壤滅菌法(Reductive Soil Disinfestation,RSD)。RSD 方法的特點是將易分解的碳源和灌溉結(jié)合,刺激好氧菌的快速生長,加快土壤中氧氣的消耗,厭氧環(huán)境使土壤菌落結(jié)構(gòu)從以好氧菌為主轉(zhuǎn)變?yōu)閰捬蹙蛘呒嫘詤捬蹙鸀橹?。在厭氧環(huán)境下,微生物發(fā)酵產(chǎn)生的代謝有毒物質(zhì)可進(jìn)一步對病原菌起到抑制作用。施用土壤改良劑(石灰氮等)是新興起的一種快速恢復(fù)土壤退化的方法,相比傳統(tǒng)方法具有方便快捷和經(jīng)濟(jì)高效的特點。石灰氮改良機(jī)制是水解后生成氰氨,對土壤病原菌有滅殺作用,氰氨還可以水解形成可被植物直接吸收利用的尿素或氨。它的優(yōu)勢是水解過程無酸根殘留,不會導(dǎo)致土壤酸化加重。土壤微生物群落失衡是導(dǎo)致土傳病害發(fā)生的直接原因,土壤微生物群落的結(jié)構(gòu)組成是衡量土壤健康情況的重要指標(biāo)。有研究表明,土壤微生物群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)、施肥方式、土壤質(zhì)地等有關(guān)。目前,研究微生物的方法很多,高通量測序技術(shù)因具有檢測信息豐富、準(zhǔn)確率高和成本較低等優(yōu)點被廣泛應(yīng)用。
芹菜作為我國深受歡迎的傘形科多葉植物,具有廣泛的種植面積。但在設(shè)施栽培條件下,芹菜常因次生鹽漬化、病蟲害發(fā)生等問題導(dǎo)致減產(chǎn)嚴(yán)重。針對芹菜連作障礙,國內(nèi)通常采取施用石灰氮等改良劑、芹菜合理間作等治理方式。莫娟等研究表明石灰氮能有效防治芹菜根腐病的發(fā)生。袁濤等通過菜豆、芹菜間作來提升芹菜的產(chǎn)量和品質(zhì)。然而,基于Illumina Miseq 高通量測序技術(shù)分析不同改良措施對連作芹菜土壤微生物群落結(jié)構(gòu)影響的研究較少。筆者通過灌水高溫悶棚聯(lián)合施用有機(jī)物或石灰氮的處理措施來緩解芹菜土壤連作障礙,改善土壤微生物群落結(jié)構(gòu),以期為緩解芹菜連作障礙和提高芹菜產(chǎn)量提供技術(shù)支撐。
蔬菜大棚位于江蘇省太倉市三市村。太倉市處于地勢平坦的平原地區(qū),地勢自東北向西南傾斜,屬于北亞熱帶南部濕潤氣候區(qū),光照充足,夏季炎熱多雨,冬季寒冷少雨,7 月平均氣溫為27.7 ℃,1 月平均氣溫為2.8 ℃,年平均氣溫為15.3 ℃。太倉市年平均降水量為1017 mm,年平均降雨日為130 d,太倉市全年受到的日照時長可達(dá)4 423.7 h。試驗前供試土壤的基本理化性質(zhì)測定結(jié)果:pH 值為5.94、全氮含量(,后同)為0.53 g·kg、有效磷含量為72.7 mg·kg、有機(jī)質(zhì)含量為22.1 g·kg、硝態(tài)氮含量為100 mg·kg、電導(dǎo)率為68 mS·m。
供試材料:芹菜()品種為美國西芹文圖拉,由北京思貝奇種子有限公司提供。有機(jī)物料(麥糠)、石灰氮[(總氮)≥21%,(氰氨化鈣)≥55%]由山東金耐特環(huán)??萍加邢薰咎峁?;前茬作物:大蒜;棚齡:5 年。
在試驗中共設(shè)計8 個處理,(1)CK,裸地;(2)CW,灌水高溫悶棚;(3)O1W,灌水高溫悶棚+5000 kg·hm麥糠;(4)O2W,灌水高溫悶棚+10 000 kg·hm麥糠;(5)O3W,灌水高溫悶棚+15 000 kg·hm麥糠;(6)S1W,灌水高溫悶棚+300 kg·hm的石灰氮;(7)S2W,灌水高溫悶棚+600 kg·hm的石灰氮;(8)S3W,灌水高溫悶棚+900 kg·hm的石灰氮。每個試驗小區(qū)長9 m,寬3 m,面積27 m,小區(qū)間隔25 cm,隨機(jī)區(qū)組設(shè)計,3次重復(fù)。將不同用量的麥糠或石灰氮均勻撒在對應(yīng)的試驗小區(qū),用旋耕機(jī)將麥糠和石灰氮深翻入土,然后在小區(qū)四周做小拱,拱寬20 cm、高30 cm,在小拱上覆蓋一層塑料薄膜,對小區(qū)進(jìn)行灌水處理讓土層處于淹水狀態(tài)。在試驗小區(qū)表面覆蓋一層塑料薄膜,密封大棚25 d 后揭棚排水,通風(fēng)5 d 晾干土層,翻耕土壤后即可進(jìn)行芹菜播種。每個小區(qū)種植大約500 株芹菜,株距大約為20 cm。2019 年8 月5 日施用基肥:尿素375 kg·hm、有機(jī)復(fù)合肥1200 kg·hm、磷肥225 kg·hm、鉀肥150 kg·hm。為保持氮素平衡,灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施不施用尿素。在植株生長旺盛期追肥,施用量為復(fù)合肥225 kg·hm、尿素75 kg·hm、鉀肥30 kg·hm。
在芹菜收獲期用五點取樣法采集深度為20 cm的根際混合土樣。采樣時間為2019 年11 月11 日,將土樣分為2 份,1 份保存于-70 ℃的超低溫冰箱用于土壤根際微生物分析(混合樣本,不設(shè)重復(fù));1份風(fēng)干后去除雜物,研磨、過篩后保存。
1.4.1 土壤微生物群落、基本理化性質(zhì)和產(chǎn)量的測定 土壤理化性質(zhì)按照指定標(biāo)準(zhǔn)測定,土壤有機(jī)質(zhì)含量采用重鉻酸鉀容量法(NY/T 1121.6—2006)測定,硝態(tài)氮含量采用紫外分光光度法(GB/T 32737—2016)測定,pH 值采用電位法(HJ 962—2018)測定,電導(dǎo)率采用電極法(HJ 802—2016)測定,有效磷含量采用紫外分光光度法(NY/T 1121.7—2014)測定,全氮含量采用半微量開氏法(NY/T 53—1987)測定。在芹菜收獲期,采摘每個小區(qū)的芹菜分別計產(chǎn),并計算各處理芹菜產(chǎn)量平均值。
1.4.2 土壤細(xì)菌16S rDNA 基因序列的擴(kuò)增 使用引物:515F(5’-GTGCCAGCMGCCGCGG-3’)和907R(5’-CCGTCAATTCMTTTRAGTTT-3’)對細(xì)菌16S rDNA 基因序列V4~V5 可變區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增。PCR 反應(yīng)體系(20 μ L)如下:5 × 高保真緩沖液4 μ L,2.5 mmol·LdNTPs 2 μ L,正反向引物(5 μmol·L)各0.8 μL,高保真DNA 聚合酶0.4 μL,DNA 模板10 ng,補(bǔ)加ddHO 至20 μL。PCR 反應(yīng)程序為:95 ℃2 min;95 ℃30 s,55 ℃30 s,72 ℃30 s,25 個循環(huán);72 ℃5 min。從2%瓊脂糖凝膠中提取擴(kuò)增產(chǎn)物送至凌恩生物科技有限公司(上海)完成測序。
首先對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控過濾,然后將正反向reads 配對,并剔除有問題序列以及嵌合體,構(gòu)建物種分類單元(Operational Taxonomic Units,OTU)豐度表(97%相似度)?;贠TU聚類分析結(jié)果,對OTU 進(jìn)行多種多樣性指數(shù)分析。利用Mothur 做rarefaction 分析,利用R 語言工具制作曲線圖。以O(shè)TU 的物種分類結(jié)果為依據(jù),在門的分類級別上對8 組土壤樣品中細(xì)菌的組成和結(jié)構(gòu)以及相對豐度進(jìn)行分析,并利用R 語言工具作圖。土壤理化性質(zhì)等采用Microsoft Office Excel 2016、SPSS statistics 21 進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析,采用鄧肯氏新復(fù)極差法進(jìn)行差異顯著性檢驗。
分析不同的改良措施對芹菜根際土壤理化性質(zhì)的影響。由表1 可知,經(jīng)改良措施后土壤pH值顯著提高,O3W 處理達(dá)到峰值6.78,比CK 增加了14.1%;土壤全氮含量在灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物或石灰氮措施中均顯著提高,S3W 處理達(dá)到峰值0.80 g·kg,比CK 增加了45.5%;土壤有機(jī)質(zhì)含量在灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物措施中顯著提高,O3W 處理達(dá)到峰值34.4 g·kg,比CK 增加了43.9%;土壤有效磷含量在灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物和石灰氮措施中均顯著提高,O3W 處理達(dá)到峰值為87.3 mg·kg,比CK 增加了20.1%;電導(dǎo)率值在灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物措施中顯著降低,O3W 處理最小,為30 mS·m,比CK 降低了49.2%;土壤硝態(tài)氮含量在灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮措施中顯著降低,S3W 處理最低,為49.0 mg·kg,比CK 降低了40.7%;土壤容重經(jīng)改良措施后顯著降低,S3W 處理最小,為1.05 g·cm,比CK 降低了19.8%。
表1 不同處理對根際土壤理化性質(zhì)的影響
由圖1 可以看出,灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物或石灰氮對芹菜產(chǎn)量有不同的影響。芹菜產(chǎn)量在O2W、O3W 和S3W 處理中提升最顯著。O2W、O3W 和S3W 處理芹菜產(chǎn)量分別為93.4、95.3、90.4 t·hm,與CK 相比分別提高了34.6%、37.3%和30.2%。O1W、S1W 和S2W 處理芹菜的產(chǎn)量顯著高于CK。CW 處理芹菜的產(chǎn)量高于CK,但差異不顯著。灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物處理措施中,O3W 處理效果最好;灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施中,S3W 處理效果最好。
圖1 不同處理下芹菜的產(chǎn)量
利用Illumina Miseq 測序分析平臺對土壤微生物,細(xì)菌16S rDNA 基因序列V3~V4 區(qū)進(jìn)行測序,共得到有效序列355 836 條,序列堿基數(shù)147 858 249 bp,平均長度為415.44 bp(表2)。稀釋性曲線可以用來比較不同樣本中物種的豐富度,也可以用來說明樣本的測序數(shù)據(jù)量是否合理。由圖2 可知,在相似度97%條件下,所有土壤樣品稀釋性曲線均趨于平緩,表明樣本測序數(shù)據(jù)量有較高的可信度,能夠比較真實地反映不同處理間土壤樣本的微生物群落狀況。
表2 不同處理根際土壤的有效序列數(shù)
圖2 不同樣本的稀釋性曲線圖(相似度97%)
2.4.1 不同處理下根際土壤微生物的物種分類單元(OTU)數(shù) 基于OTU 豐度的樣本聚類圖(圖3)。觀察各處理共有的OTU 數(shù)為443 個,OTU 總數(shù)和特有的OTU 數(shù)分別是CK(1821,155)、CW(2045,153)、O1W(2575,167)、O2W(2609,203)、O3W(3148,361)、S1W(2656,167)、S2W(2483,181)、S3W(2900,334)??梢钥闯觯琌3W 處理的OTU 總數(shù)和特有的OTU 數(shù)都是最多的,分別為3148 和361,說明該區(qū)域不僅含有更多的微生物種類,也含有較多的特有微生物種類。
圖3 基于OTU 豐度的不同樣本的聚類圖
2.4.2 不同處理下土壤微生物門水平群落結(jié)構(gòu) 由圖4 可知,在門水平分類上,不同處理間微生物的主要菌門分別為:變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(Actinobacteriota)、厚壁菌門(Firmicutes)、綠彎菌門(Chloroflexi)、酸桿菌門(Acidobacteria)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、髕骨細(xì)菌門(Patescibacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、藍(lán)藻門(Cyanobacteria)、棒狀桿菌門(Rokubacteria)、浮霉菌門(Planctomycetes)。灌水高溫悶棚處理措施對土壤微生物相對豐度的影響較?。还嗨邷貝炁锫?lián)合有機(jī)物處理措施使變形菌門和擬桿菌門的相對豐度提高,而放線菌門、厚壁菌門和酸桿菌門的相對豐度降低;灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施提高了厚壁菌門和放線菌門的相對豐度,降低了變形菌門的相對豐度。
圖4 細(xì)菌群落在門水平上的相對豐度結(jié)構(gòu)
2.5.1 樣本多樣性分析(Alpha-diversity,Alpha)從Alpha 多樣性分析可知(表3),經(jīng)過改良措施后,芹菜根系土壤微生物的豐富度指數(shù)(Chao1 指數(shù))和多樣性指數(shù)(Shannon 指數(shù))都有顯著提高。以O(shè)3W 處理的Chao1 指數(shù)和Shannon 指數(shù)最高,分別為4 281.7、6.903 7,這說明O3W 處理的微生物數(shù)量和種類都相對較多。Simpson 值代表的是微生物的優(yōu)勢度指數(shù),CW 處理Simpson 值最高為0.018 4,說明其微生物群落中菌種的分布不均勻、多樣性較差、優(yōu)勢種比重大。Coverage 指數(shù)越高說明土壤樣本序列被測出的概率越高,在試驗中各土壤樣本指數(shù)都在0.9 以上,代表可以反映樣本中微生物群落的真實情況。
表3 不同處理根際微生物多樣性的變化
2.5.2 樣本間比較分析(Bate-diversity,Bate) 由圖5 可知,采用主坐標(biāo)分析(principal co-ordinates analysis,PCOA),以兩坐標(biāo)軸的零基準(zhǔn)線為參考系,CK 和CW 處理距離PC2 較近,說明PC2 主成分對其影響較大,占菌落總影響的16.74%。O1W、O2W和O3W 處理距離PC1 和PC2 都比較近,說明其菌落結(jié)構(gòu)受PC1 主成分和PC2 主成分影響都比較大,分別占總影響的49.91%和16.74%。S1W、S2W 和S3W 處理距離兩坐標(biāo)軸比較遠(yuǎn),說明其受兩主成分的影響不大。CK、灌水高溫悶棚、灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物、灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮4 種不同處理措施在主坐標(biāo)分析圖上大致分布在4 個方位,說明不同處理措施間有明顯差異。
圖5 Bate 多樣性的主坐標(biāo)分析
對土壤樣本進(jìn)行亢余分析(RDA)可知(圖6),第一坐標(biāo)軸可以解釋74.27%的信息值,第二坐標(biāo)軸可解釋16.90%的信息值,兩坐標(biāo)軸的總解釋達(dá)到91.17%的信息值,可準(zhǔn)確反映樣本的實際情況。各處理點位分散于不同的象限空間內(nèi),說明不同處理間微生物群落的差異明顯??梢钥吹剑鯌B(tài)氮是影響土壤細(xì)菌群落的主要理化性質(zhì)之一。硝態(tài)氮與CK 和CW 處理呈正相關(guān),與灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物處理措施的相關(guān)性不明顯,但與灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施以及放線菌門、厚壁菌門和擬桿菌門呈負(fù)相關(guān)。pH、有機(jī)質(zhì)、有效磷等與CW 處理和綠彎菌門、疣微菌門呈負(fù)相關(guān),與灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物或石灰氮處理措施以及放線菌門、厚壁菌門和擬桿菌門呈正相關(guān)。
圖6 土壤理化性質(zhì)與細(xì)菌群落的關(guān)系
已有研究表明,單純對連作土壤進(jìn)行淹水處理并不能有效滅殺土壤病原菌,而淹水聯(lián)合有機(jī)物料的處理措施卻能取得顯著效果。在連作土壤中單純施用石灰氮取得的滅菌效果可能會受溫度的影響,而灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮的處理措施卻能有效發(fā)揮石灰氮的滅菌效果。筆者以灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物或石灰氮等改良措施來改善芹菜連作障礙,優(yōu)化土壤微生物的群落結(jié)構(gòu)。經(jīng)灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理后,土壤的pH 值顯著提高、硝態(tài)氮含量顯著降低,這與張蕾等和OH 等的研究結(jié)果相同。在灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施中,硝態(tài)氮的降低可能是因為石灰氮水解生成的雙氰胺,對微生物的硝化反應(yīng)產(chǎn)生了抑制作用。施用石灰氮后土壤全氮含量顯著提升,這與Xiao 等的觀點一致。灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物處理措施提高了土壤的有機(jī)質(zhì)、全氮和速效磷含量,可能是有機(jī)質(zhì)礦化釋放了作物生長所需的養(yǎng)分,提高了土壤中氮、磷和鉀的含量。
從Alpha 多樣性分析可知,灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物處理措施顯著提高了根際土壤細(xì)菌的豐富度指數(shù)和多樣性指數(shù),這與劉亮亮等的研究結(jié)果一致。PCOA 分析顯示各處理措施根際土壤微生物區(qū)系結(jié)構(gòu)與對照明顯不同,說明各處理措施均能提高土壤中微生物的多樣性和豐富度。高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施中,施用石灰氮后土壤微生物豐富度并沒有大幅度減少,可能是因為施用石灰氮后雖滅殺了大量的土壤微生物,但同時也為土壤微生物提供了生態(tài)位和氮源,為土壤微生物群落的恢復(fù)創(chuàng)造了條件,這與劉高峰等的研究結(jié)果一致。對細(xì)菌門水平的相對豐度分析顯示,灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施提高了土壤中厚壁菌門的相對豐度,這與前人報道相似。厚壁菌門大多是厭氧菌,也是產(chǎn)生有機(jī)酸的主要菌門,其產(chǎn)生的有機(jī)酸等代謝有毒物質(zhì)可以對病原菌起到抑制和滅殺作用。聶園軍等的研究表明,放線菌門和厚壁菌門有利于促進(jìn)連作西瓜的生長。灌水高溫悶棚聯(lián)合有機(jī)物處理措施能提高變形菌門和擬桿菌門的相對豐度,但會降低放線菌門和厚壁菌門等有益菌門的相對豐度。此外,還會使酸桿菌門的相對豐度降低,這與陳靜等的研究結(jié)果相同。通過亢余分析可知,硝態(tài)氮作為影響細(xì)菌群落的主要因素之一,與灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施以及放線菌門、厚壁菌門和擬桿菌門呈負(fù)相關(guān),說明降低土壤中硝態(tài)氮含量能改善土壤中放線菌門、厚壁菌門和擬桿菌門的生長環(huán)境。
(1)灌水高溫悶棚結(jié)合有機(jī)物或石灰氮處理措施對芹菜連作土壤有改善作用,其中,灌水高溫悶棚聯(lián)合施用15 000 kg·hm麥糠和灌水高溫悶棚聯(lián)合施用900 kg·hm石灰氮的處理措施在緩解土壤酸化、提升土壤養(yǎng)分和作物產(chǎn)量方面效果最顯著。
(2)灌水高溫悶棚聯(lián)合石灰氮處理措施能優(yōu)化土壤原有的代謝關(guān)系,使土壤微生物區(qū)系變成了以放線菌門和厚壁菌門等厭氧菌為主的群落結(jié)構(gòu)。
(3)由此可見,灌水高溫悶棚聯(lián)合施用900 kg·hm石灰氮的處理措施不僅能有效緩解芹菜根際土壤的連作障礙問題,還能改善土壤微生物群落結(jié)構(gòu)。