• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      蟬棒束孢交配型基因MAT的群體分布特征

      2022-09-30 01:51:14滿海喬唐光甫桂艷玲趙杰宏
      貴州農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年9期
      關(guān)鍵詞:棒束有性交配

      滿海喬,王 嬌,唐光甫,桂艷玲,韓 潔,趙杰宏

      (貴州中醫(yī)藥大學(xué) 藥學(xué)院,貴州省中藥生藥學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,貴州 貴陽(yáng) 550025)

      0 引言

      【研究意義】 蟬花(Cordycepscicadae)為我國(guó)傳統(tǒng)名貴中藥材,是由蟲生真菌蟬棒束孢〔IsariacicadaeMiquel;同物異名:蟬擬青霉Paecilomycescicadae(Miquel) Samson〕寄生蟬若蟲后形成的菌蟲復(fù)合體[1]。早在南北朝的《雷公炮炙論》中已有記載,歷代醫(yī)藥典籍對(duì)蟬花有大量描述,其具疏散風(fēng)熱、透疹、明目退翳的功效[2]。近代研究表明,蟬花有改善腎功能、抗腫瘤、降血糖等藥理作用[3-4],臨床上有望成為冬蟲夏草的替代藥。蟬花主要生長(zhǎng)環(huán)境為竹林以及熱帶和亞熱帶的闊葉林等,遍布在中國(guó)秦嶺至淮河以南的省份[5-6],因?yàn)槠湮兜栗r美,營(yíng)養(yǎng)豐富,民間有長(zhǎng)期食用的習(xí)慣,已成為藥食兩用的重要蟲草資源。蟲草往往有無(wú)性型和有性型兩種形態(tài),自然界常見的是有性型,如蛹蟲草(Cordycepsmilitaris)和冬蟲夏草(C.sinensis),但蟬花卻主要是無(wú)性型(即蟬棒束孢),其有性型極其稀缺,也無(wú)法通過人工培養(yǎng)獲得,導(dǎo)致蟬花有性型的藥材基原混亂,至今也未知蟬花有性型稀缺的原因。因此,解析蟬花有性生殖的遺傳調(diào)控機(jī)制對(duì)其深入研發(fā)具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】近年來(lái),劉愛英等[7]從廣西樂業(yè)天坑采集1株有性型和無(wú)性型共存的復(fù)型蟬花標(biāo)本,并將其命名為神木蟬蟲草(C.cicadae-SM sp.Nov.Liu Ai-Ying&Zou Xiao);李增智等[8]從江西井岡山采挖到蟬花有性型標(biāo)本,命名為C.chanhuaZ.Z.Li,F.G.Luan,Hywel-Jones,C.R.Li &S.L.Zhang,sp.nov.,并指出與劉愛英等[7]報(bào)道的標(biāo)本在顯微結(jié)構(gòu)上存在區(qū)別,因此蟬花有性型仍存在爭(zhēng)議。有性生殖能去除真菌有害基因突變,還可以產(chǎn)生基因型多樣性,增強(qiáng)環(huán)境適應(yīng)性[9-10]。蟲草屬真菌的有性生殖主要由交配型基因MAT參與調(diào)控。MAT基因及其編碼蛋白具有調(diào)控生殖器官分化、營(yíng)養(yǎng)繁殖和子囊殼形成等作用[11-12]。根據(jù)MAT基因在單倍體細(xì)胞中的分布情況,有性生殖可分為同宗配合和異宗配合[13-14]。同宗配合是同時(shí)含有MAT1-1和MAT1-2交配型基因[15],1株即可完成有性生殖;而異宗配合含有不同交配型基因,需不同交配型的菌株共同完成有性生殖[16-18]。MAT1-1含MAT1-1-1、MAT1-1-2和MAT1-1-3交配型基因,其中,MAT1-1-1研究較多,編碼含HMG α-box保守域的轉(zhuǎn)錄因子[19-20];MAT1-2僅含交配型基因MAT1-2-1,編碼含HMG box保守域的轉(zhuǎn)錄因子[21-22]?!狙芯壳腥朦c(diǎn)】蟬花有性型稀缺,其是否與蟬棒束孢交配型基因MAT的序列結(jié)構(gòu)、基因變異及基因分布特征有關(guān),尚未見報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問題】通過研究7省12市100份蟬花標(biāo)本中蟲生真菌蟬棒束孢的MAT基因,初步揭示蟬棒束孢M(jìn)AT基因的分布特征和多樣性,為提高蟬花的生殖率提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 菌種

      新鮮蟬花標(biāo)本共100個(gè),采自全國(guó)7省12市(表1)。用酒精棉球擦拭蟲體表面,無(wú)菌鑷子輕輕將其掰開,接種針挑取少許內(nèi)菌核,接種于常規(guī)沙氏固體培養(yǎng)基上,培養(yǎng)7 d和14 d時(shí)觀察記錄各菌株的菌落形態(tài)及微觀結(jié)構(gòu)。

      表1 蟬花標(biāo)本的來(lái)源Table 1 Source of Cordyceps cicadae samples

      1.2 ITS和MAT序列擴(kuò)增

      用基因組提取試劑盒(購(gòu)自北京天根生化)提取各菌株的基因組DNA,采用引物ITS1/4、1MAT1-1F/R、2MAT1-1F/R、gaoMAT1-1F/R和gaoMAT1-2F/R(表2)分別擴(kuò)增目標(biāo)序列,反應(yīng)體系:上下游引物(10 μmol/L)各1 μL,2×Taq PCR Mix 10 μL,模板2 μL,最后用ddH2O補(bǔ)足20 μL。PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物送華大基因測(cè)序。

      表2 ITS和MAT序列的擴(kuò)增引物Table 2 Amplification primers of ITS and MAT sequences

      1.3 聚類分析

      獲得的ITS或MAT序列在NCBI進(jìn)行 Blastn(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/)比對(duì),選取覆蓋率和相似性最高的菌種作為分子鑒定結(jié)果。在MEGA 7中,將獲得的不同ITS序列進(jìn)行Align對(duì)齊,截去兩端不齊序列后,選擇Phylogenetic Analysis,點(diǎn)擊Phylogeny,選擇Construct/Test Neighbor-Joining Tree,更改No.of Bootstrap Replications為1 000,其余參數(shù)為默認(rèn)值點(diǎn)擊Compute,最后查看和下載聚類樹。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 不同蟬花的形態(tài)多樣性

      不同來(lái)源的蟬花標(biāo)本均在蟲體上具有典型的無(wú)性型孢梗束結(jié)構(gòu),但未發(fā)現(xiàn)有性型子座。不同產(chǎn)地蟬花的孢梗束長(zhǎng)短、色澤和產(chǎn)孢量差異較大,其中,福建產(chǎn)蟬花的孢梗束較細(xì)長(zhǎng);廣州的較短,產(chǎn)孢量也較??;安徽宣城、安徽霍山、安徽新華、廣州和平蟬花的孢梗束金黃色,福建德化的淡黃色,四川雅安的棕色。蟬花菌種在沙氏培養(yǎng)基上的菌落呈多層輪狀。顯微鏡下各菌株產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)的瓶?;颗虼?,頂端驟尖,孢子為長(zhǎng)橢圓形,串生,孢子大小(5.0~7.5) μm ×(2.5~5.0) μm,產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)無(wú)明顯差異,具有典型的蟬棒束孢顯微特征(圖1)。

      2.2 ITS序列聚類

      對(duì)從蟬花分離的100份菌株進(jìn)行ITS序列擴(kuò)增和測(cè)序,經(jīng)NCBI blastn比對(duì),100份

      注:A為廣州和平3,B為福建德化1,C為四川天主4,D為安徽霍山5,E為安徽宣城3,F(xiàn)為安徽宣城9,G為安徽新華2;測(cè)微尺為2.5 μm/小格。

      菌株與NCBI上蟬花C.cicadae(GenBank:MN128643.1)的序列相似性最高。隨機(jī)選擇從不同產(chǎn)地蟬花分離的13份菌株與NCBI上蟬擬青霉P.cicadae(GenBank:HQ874633.1)、環(huán)鏈棒束孢I.cateniannulata(GenBank:KT944289.1)、玫煙色棒束孢I.fumosorosea(GenBank:KR184828.1)、斜鏈棒束孢I.cateniobliqua(GenBank:KP743151.1)、爪哇棒束孢I.javanica(GenBank:MF416455.1)、日本棒束孢I.japonica(GenBank:AT001673.1)以及蟬花C.cicadae(MF460361.2,KY924492.1,MZ373136.1,MN128643.1)的ITS序列聚類分析,以產(chǎn)黃青霉Penicilliumchrysogenum(GenBank:U57323.1)為外群,由MEGA 7構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2)顯示,13份菌株與蟬擬青霉和蟬花聚為一類,支持率為100%,與其他棒束孢屬菌種的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),進(jìn)一步證明該試驗(yàn)的菌株是從蟬花分離的蟬棒束孢。

      注:?為研究分離菌株。Note:? indicates studied isolated plant.圖2 部分不同來(lái)源蟬棒束孢ITS序列進(jìn)化樹Fig.2 ITS sequence cladogram of different I. cicadae strains from different sources

      2.3 MAT序列的克隆

      用引物分別克隆各菌株的1MAT1-1-1、2MAT1-1-1、gaoMAT1-1-1和gaoMAT1-2-1靶標(biāo)序列,獲得的片段分別是1 150 bp、1 850 bp、480 bp和362 bp(圖3),符合預(yù)期大小。測(cè)序表明,1MAT1-1-1有HMG α-box功能域,2MAT1-1-1缺失HMG α-box,gaoMAT1-1-1為1MAT1-1-1的部分序列,gaoMAT1-2-1具有HMG box。以FJDH7和AHLJ1菌株為例,1MAT1-1-1、2MAT1-1-1分別與NCBI上蟬花MAT1-1-1(GenBank:KP749925.1)的堿基序列相似性為99.80%(覆蓋率100%)和99.81%(覆蓋率48%),氨基酸序列相似性為100%和42.02%;gaoMAT1-2-1與NCBI上蟬花MAT1-2-1(GenBank:KP749926.1)的堿基序列相似性為99.73%(覆蓋率99%),氨基酸序列相似性為90.18%??梢?,1MAT1-1-1和gaoMAT1-2-1指向的基因具有功能,2MAT1-1-1的基因可能序列和功能不全。

      2.4 MAT序列的分布

      PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,100個(gè)菌株中13個(gè)菌株僅有1MAT1-1-1,79個(gè)菌株僅有g(shù)aoMAT1-2-1,其中,兼有1MAT1-1-1和gaoMAT1-2-1交配型基因的菌株有8個(gè)(表3),兼有菌株分布在安徽新華、安徽宣城、江西湖口、四川天主和福建德化。2MAT1-1-1與gaoMAT1-2-1同時(shí)存在,有1MAT1-1-1(包括兼有g(shù)aoMAT1-2-1)的菌株未檢測(cè)到2MAT1-1-1,但福建產(chǎn)FJDH7和FJDH9菌株同時(shí)存在1MAT1-1-1、2MAT1-1-1和gaoMAT1-2-1序列(圖3D)。多數(shù)地區(qū)的菌株以gaoMAT1-2-1占優(yōu)勢(shì),而四川天主和廣西樂業(yè)菌株以1MAT1-1-1占優(yōu)勢(shì)。安徽廬江、安徽霍山、江蘇宜興和廣州和平的菌株未檢測(cè)到1MAT1-1-1。從數(shù)據(jù)上看,蟬花有同宗配合的潛力,也存在異宗配合的可能,有性生殖的概率較高,但與蟬花有性型稀缺的實(shí)際情況不符。

      Note:A,gaoMAT1-2-1;B,gaoMAT1-1-1(1~6:GZHP2,AHWH7,AHCZ2,AHXC5,AHXC6 and AHXC7);C,1MAT1-1-1(7~13:AHXC7,AHXC8,AHXC9,AHXH2,AHWH3,AHWH6 and AHCZ4);D,2MAT1-1-1(14~35:AHWH8,JSYX3,JXHK3,JXHK4,JXHK8,JXHK9,SCTZ2,SCTZ6,AHLJ1,AHLJ2,AHXC3,AHXC9,AHXC11,AHXH1,AHXH2,AHCZ1,GZHP1,AHHS12,AHHS13,F(xiàn)JDH6,GXTK1 and ddH2O);E:1MAT1-1-1/2MAT1-1-1(36~37:FJDH7 and FJDH9).M1:DL1 000 DNA marker.M2:DL2 000 DNA marker.圖3 部分菌株MAT基因的電泳圖譜Fig.3 Electrophoretogram of MAT gene of part strains

      表3 不同蟬棒束孢M(jìn)AT序列存在類型Table 3 Types of MAT sequence in different I.cicadae strains

      2.5 MAT序列聚類和結(jié)構(gòu)特性

      對(duì)21個(gè)菌株的1MAT1-1-1序列、87個(gè)菌株的gaoMAT1-2-1序列分別進(jìn)行聚類分析(圖4),21個(gè)1MAT1-1-1與蟬花已知序列(GenBank:KP749925.1)聚為一枝,支持率99%;87個(gè)gaoMAT1-2-1與蟬花已知序列(GenBank:KP749926.1)聚為一枝,支持率98%。安徽來(lái)源的多株蟬棒束孢未單獨(dú)聚類成群,可見相同來(lái)源蟬棒束孢菌株間無(wú)明顯地域居群分布相關(guān)性,與參比菌種的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),其中親緣關(guān)系較近的參考菌種是細(xì)腳棒束孢(Isariatenuipes)。

      序列比對(duì)結(jié)果(圖4C)顯示,1MAT1-1-1為蟬花MAT1-1-1(KP749925.1)的一部分外顯子序列,2MAT1-1-1為NCBI 上現(xiàn)有3個(gè)獨(dú)立蟬花基因組(GenBank:ASM296887v1、ASM1021170v1和ASM164478v1)的部分基因序列,在3個(gè)蟬花基因組僅有2MAT1-1-1和gaoMAT1-2-1序列,未發(fā)現(xiàn)1MAT1-1-1。2MAT1-1-1與1MAT1-1-1僅有30%序列覆蓋(覆蓋區(qū)域相似性99.69%),推測(cè)缺失HMG ɑ-box的2MAT1-1-1無(wú)功能。

      注:A為MAT1-1-1序列聚類分析,B為gaoMAT1-2-1序列聚類分析,C為MAT 1-1-1序列結(jié)構(gòu)示意圖;方框?yàn)橥怙@子,橫線為內(nèi)含子或居間序列。Note:A:Cluster analysis of MAT1-1-1;B:Cluster analysis of gaoMAT1-2-1;C:Structure diagram of MAT1-1-1;Box:Exon;Horizontal line:Intron or intermediate sequence.圖4 蟬棒束孢M(jìn)AT序列進(jìn)化樹和MAT1-1-1序列結(jié)構(gòu)Fig.4 MAT sequence cladogram of I. cicadae.and MAT1-1-1 sequence structure

      3 討論

      蟬花在食品和臨床等領(lǐng)域有較廣泛的應(yīng)用,但至今其有性型仍存爭(zhēng)議[7-8],現(xiàn)有中醫(yī)藥典籍《中藥大辭典》和《中華本草》等著作中記載的蟬花有性型更是被上述報(bào)道推翻。出現(xiàn)以上現(xiàn)狀的主要原因是蟬花有性型非常稀缺,難以采集也無(wú)法人工培養(yǎng),至今對(duì)蟬花的有性生殖知之甚少。

      圍繞蟬花的交配型基因研究,高揚(yáng)等[18]將采自安徽各地的40株蟬棒束孢分成了2組,分別含有交配型MAT1-1-1和MAT1-2-1序列,比例接近1∶2,且未發(fā)現(xiàn)同時(shí)含有2種交配型基因或缺少2種基因的菌株。本研究的靶標(biāo)序列1MAT1-1-1是根據(jù)高揚(yáng)等[18]發(fā)表的蟬花MAT1-1-1序列(GenBank:KP749925.1)設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增的部分序列(163~1 334 bp),靶標(biāo)序列2MAT1-1-1是利用MAT1-1-1在NCBI 與蟬花基因組blastn〔database:whole-genome shotgun contigs(wgs);organism:cordyceps cicadae〕,根據(jù)獲得的最高相似序列及其上下游序列(GenBank:WJIA01000209)設(shè)計(jì)引物進(jìn)行擴(kuò)增分析。

      通過檢測(cè)安徽省6地市59個(gè)蟬花標(biāo)本分離的蟬棒束孢菌株發(fā)現(xiàn),AHXH2、AHXC3和AHXC9同時(shí)含有MAT1-1-1(即1MAT1-1-1)和MAT1-2-1(即gaoMAT1-2-1)序列;來(lái)自其他6省市的41個(gè)蟬花標(biāo)本分離的菌株中檢測(cè)到5個(gè)菌株同時(shí)含有以上2個(gè)交配型基因序列,檢出率為8%;其他菌株僅含其中1個(gè)交配型基因,也未發(fā)現(xiàn)完全缺失的菌株。全部1MAT1-1-1與gaoMAT1-2-1的比例為24.14%(接近1∶4),兼有菌株、單1MAT1-1-1菌株、單gaoMAT1-2-1菌株的比例為1∶1.625∶9.875(接近1∶1.5∶10),可見不同交配型分布的比例不對(duì)等,對(duì)稀少的蟲草來(lái)說,其有性生殖變得更加困難。

      LU等[23]對(duì)蟬花BA-001菌株的基因組(GenBank:AEIW00000000)分析發(fā)現(xiàn),蟬棒束孢M(jìn)AT1-2和1個(gè)缺少HMG ɑ-box截短的MAT1-1-1同時(shí)存在,在各時(shí)期轉(zhuǎn)錄組中該截短基因不表達(dá),并且通過單基因或雙基因敲除MAT1-2和MAT1-1-1對(duì)無(wú)性型孢梗束的形成無(wú)影響。另外,這種截短現(xiàn)象也發(fā)生在植物病原Grosmanniaspp.[24]、甲蟲相關(guān)真菌Leptographiumprocerum和L.profanum[25]中。本研究從100份蟬棒束孢I.cicadae菌株中也檢測(cè)到此段截短的MAT1-1-1(即2MAT1-1-1),發(fā)現(xiàn)有1MAT1-1-1(包括兼有g(shù)aoMAT1-2-1)的菌株卻無(wú)2MAT1-1-1,2MAT1-1-1常與gaoMAT1-2-1共存,這與上述報(bào)道以及NCBI 上現(xiàn)有3個(gè)獨(dú)立的蟬花基因組(GenBank:ASM296887v1、ASM1021170v1和ASM164478v1)序列一致,但福建產(chǎn)FJDH7和FJDH9菌株含有1MAT1-1-1、2MAT1-1-1和gaoMAT1-2-1序列,暗示蟬花交配型基因在進(jìn)化過程中有著復(fù)雜的表現(xiàn)形態(tài),似乎蟬棒束孢同時(shí)存在同宗配合和異宗配合的潛力,處于特殊的進(jìn)化階段。對(duì)于同宗配合和異宗配合的進(jìn)化,早期認(rèn)為兩者為共同起源,即MAT基因?yàn)槿旧w上同一DNA保守區(qū),該區(qū)發(fā)生突變,導(dǎo)致不同交配方式產(chǎn)生,后又有研究支持子囊菌中的異宗配合起源于同宗配合[26-27]。因此,蟬花可能成為研究交配型基因進(jìn)化的重要樣本。

      通過聚類分析未發(fā)現(xiàn)MAT基因的地域分布相關(guān)性特征,這可能與各菌株間缺乏基因交流,主要采用無(wú)性生殖有關(guān)。推測(cè)蟬花為了充分適應(yīng)生存環(huán)境,可能通過某種未知的機(jī)理,抑制或中斷了有性生殖途徑,逐漸將無(wú)性生殖方式保留。

      4 結(jié)論

      從7省12市100份蟬花標(biāo)本中分離出蟬棒束孢菌株,對(duì)各菌株的MAT基因分析發(fā)現(xiàn),有的菌株僅有1MAT1-1-1或MAT1-2-1,兼有菌株占8%。此外還發(fā)現(xiàn),截短的MAT1-1-1(即2MAT1-1-1)普遍不與1MAT1-1-1共存,常與MAT1-2-1伴存,但FJDH7和FJDH9菌株卻同時(shí)存在1MAT1-1-1、2MAT1-1-1和MAT1-2-1序列,可見群體中不同蟬棒束孢菌株的MAT基因有4種可能:?jiǎn)?MAT1-1-1、兼有MAT1-2-1和1MAT1-1-1、兼有MAT1-2-1和2MAT1-1-1、共有1MAT1-1-1/MAT1-2-1/2MAT1-1-1序列,給蟬花有性生殖帶來(lái)不確定性。推測(cè)蟬花有性型稀缺與MAT基因的分布模式多樣及比例失衡有密切關(guān)系。

      猜你喜歡
      棒束有性交配
      【再讀蘇州】吳有性與淡淡齋
      不同交配方式對(duì)家蠶種性影響
      二化螟的多次交配及其對(duì)雌蛾產(chǎn)卵量的影響
      一株寄生茶大灰象甲的棒束孢菌的分子鑒定
      蟲草棒束孢類枯草桿菌蛋白酶基因克隆及分析
      珍稀克隆植物北極花有性繁殖及其對(duì)資源的分配和利用
      當(dāng)自由交配遇上自由組合的幾種解法淺析
      棒束內(nèi)超臨界水傳熱實(shí)驗(yàn)研究
      黑龍江省發(fā)現(xiàn)馬鈴薯晚疫病菌(Phytophthora infestans)A2交配型
      女孩有性沒朋友,沒性有朋友
      麟游县| 唐河县| 集安市| 宜宾市| 甘南县| 乌兰浩特市| 五华县| 呼伦贝尔市| 尉氏县| 昭平县| 华阴市| 元江| 乐都县| 太保市| 乌什县| 朔州市| 东乡县| 浑源县| 唐海县| 石景山区| 南投县| 长白| 苏尼特左旗| 本溪市| 襄垣县| 措勤县| 珠海市| 连城县| 涞源县| 仲巴县| 叙永县| 漳平市| 和硕县| 钦州市| 怀远县| 岗巴县| 股票| 确山县| 乌拉特前旗| 西平县| 孝感市|