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      圖書館推動(dòng)數(shù)字學(xué)術(shù)發(fā)展的實(shí)踐探索*

      2022-10-14 13:47:25徐雪靜
      新世紀(jì)圖書館 2022年7期
      關(guān)鍵詞:科研人員館藏學(xué)術(shù)

      0 引言

      隨著大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來(lái)和數(shù)據(jù)密集型科研環(huán)境形成,科學(xué)研究從重視結(jié)果轉(zhuǎn)變?yōu)檫^(guò)程與結(jié)果并重,科研過(guò)程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)作用和價(jià)值凸顯,數(shù)字工具、數(shù)據(jù)平臺(tái)成為了科研人員開展工作的必備條件,數(shù)字化科研成為學(xué)術(shù)研究的主要特征和發(fā)展趨勢(shì)。數(shù)字化科研的領(lǐng)域也從天文、環(huán)境、地球、生物科學(xué)領(lǐng)域擴(kuò)大到社會(huì)、歷史等人文領(lǐng)域。在這種環(huán)境下,數(shù)字學(xué)術(shù)(Digital Scholarship)的概念應(yīng)運(yùn)而生。由于尚未完全成熟,數(shù)字學(xué)術(shù)的內(nèi)涵與外延仍在不斷演變與擴(kuò)充,目前學(xué)界尚未對(duì)其定義形成統(tǒng)一的認(rèn)識(shí)。華盛頓大學(xué)將數(shù)字學(xué)術(shù)定義為廣泛利用數(shù)字媒體獨(dú)特能力提供的一種或多種教學(xué)和研究新可能性的學(xué)術(shù)活動(dòng)

      。印第安納大學(xué)普渡分校圖書館認(rèn)為數(shù)字學(xué)術(shù)包含構(gòu)建(building)、創(chuàng)造(creating)和利用(using)3個(gè)方面,構(gòu)建是指為了進(jìn)一步研究和分析而進(jìn)行數(shù)字化館藏建設(shè),創(chuàng)造是指為館藏建設(shè)、分析和研究館藏而創(chuàng)建適當(dāng)?shù)墓ぞ吆头?wù),利用則是指利用數(shù)字館藏和分析工具來(lái)產(chǎn)生新的知識(shí)產(chǎn)品

      。曾熙,王曉光將數(shù)字學(xué)術(shù)定義為利用數(shù)字技術(shù)與方法介入學(xué)術(shù)研究全過(guò)程的新型研究模式

      圖書館以文化傳承為已任,擁有豐富的信息資源,專注于資源的組織、檢索和管理,配備了數(shù)字展示、保存、出版及開放獲取和數(shù)據(jù)管理的軟硬件環(huán)境,與數(shù)字學(xué)術(shù)具有天然的聯(lián)系

      。一方面,圖書館是數(shù)字學(xué)術(shù)的孵化器,能夠?yàn)閿?shù)字學(xué)術(shù)的理念推廣、研究討論與實(shí)踐探索提供良好的人才、空間、設(shè)施設(shè)備等條件;另一方面,數(shù)字學(xué)術(shù)是圖書館的新引擎,為圖書館的發(fā)展創(chuàng)新、轉(zhuǎn)型與變革提供新的機(jī)會(huì)

      。目前,國(guó)內(nèi)學(xué)者的研究主要集中在后一方面,即圖書館圍繞數(shù)字學(xué)術(shù)如何實(shí)現(xiàn)服務(wù)創(chuàng)新和空間變革方面,比如劉茲恒和涂志芳對(duì)數(shù)字學(xué)術(shù)環(huán)境下學(xué)術(shù)圖書館發(fā)展新形態(tài)進(jìn)行了全面總結(jié)

      ,鄧靈斌對(duì)美國(guó)圖書館界數(shù)字學(xué)術(shù)服務(wù)的實(shí)踐進(jìn)行了分析

      ,鄂麗君對(duì)美國(guó)研究圖書館協(xié)會(huì)的數(shù)字學(xué)術(shù)支持教育活動(dòng)進(jìn)行了考察

      ,宋家梅等對(duì)英國(guó)和愛爾蘭研究型圖書館的數(shù)字學(xué)術(shù)服務(wù)進(jìn)行了調(diào)研

      ,鄂麗君

      和黃曉軍

      都對(duì)高校圖書館數(shù)字學(xué)術(shù)空間建設(shè)問(wèn)題進(jìn)行了探討。有關(guān)圖書館如何發(fā)揮數(shù)字學(xué)術(shù)孵化器作用的研究尚不多見。鑒于此,本研究從當(dāng)好孵化器這一視角,分析總結(jié)圖書館推動(dòng)數(shù)字學(xué)術(shù)發(fā)展的實(shí)踐,即圖書館如何能夠,并確實(shí)為數(shù)據(jù)管理、分析、可視化和監(jiān)管提供基礎(chǔ)設(shè)施,教育和服務(wù)以促進(jìn)數(shù)字學(xué)術(shù)發(fā)展的方式。

      ESR檢測(cè):空腹采集患者靜脈血,1.6 mL靜脈血加入到0.4 mL含109 mmol/L枸櫞酸鈉溶液的真空管中,混合均勻后放入Monitor-100型自動(dòng)紅細(xì)胞沉降率分析儀(美國(guó)Monitor公司產(chǎn)品)的檢測(cè)位,靜置30 min后自動(dòng)報(bào)告結(jié)果。正常值參考范圍:1~20 mm/h。

      1 開發(fā)適用于跨學(xué)科研究的數(shù)據(jù)服務(wù)

      隨著從事跨學(xué)科研究的科研人員和學(xué)生開始探索新興技術(shù)(例如機(jī)器學(xué)習(xí)、容器化和高性能計(jì)算)在學(xué)術(shù)研究中的應(yīng)用,許多研究圖書館建立了數(shù)字學(xué)術(shù)計(jì)劃,以支持科研人員應(yīng)對(duì)研究方法的轉(zhuǎn)變。學(xué)術(shù)和研究圖書館是數(shù)據(jù)活動(dòng)天然的合作伙伴,圖書館員擁有在整個(gè)生命周期中管理數(shù)據(jù)所需的學(xué)科、信息管理和技術(shù)知識(shí),可以說(shuō),在數(shù)據(jù)服務(wù)方面也具有天然的優(yōu)勢(shì)。但由于圖書館數(shù)據(jù)服務(wù)受多種因素影響,包括對(duì)人文和社會(huì)科學(xué)領(lǐng)域數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)研究的日益重視,以及對(duì)將數(shù)據(jù)視為資產(chǎn)的基礎(chǔ)設(shè)施和服務(wù)的需求等,因此,圖書館還需在開發(fā)適用于跨學(xué)科研究的數(shù)據(jù)服務(wù)方面,從以下三個(gè)方面具體體現(xiàn)。

      1.1 收集和許可用于學(xué)術(shù)分析的數(shù)據(jù)集

      數(shù)據(jù)是數(shù)字學(xué)術(shù)的基礎(chǔ),從傳感器和網(wǎng)絡(luò)設(shè)備連續(xù)生成的海量數(shù)據(jù)集,到大量的文本數(shù)據(jù),再到精心收集和監(jiān)管的圖像集。與數(shù)字學(xué)術(shù)的發(fā)展相適應(yīng),許多圖書館將可用于挖掘和分析的授權(quán)數(shù)據(jù)集納入其館藏范圍,精心設(shè)置對(duì)公開可用數(shù)據(jù)的訪問(wèn)權(quán)限,并對(duì)數(shù)據(jù)使用和重用有關(guān)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)問(wèn)題給予指導(dǎo)。圖書館可以利用其信息管理專業(yè)知識(shí)及其與供應(yīng)商的關(guān)系,提供用于挖掘和分析的(大)數(shù)據(jù)館藏,并促進(jìn)對(duì)專有或敏感數(shù)據(jù)的獲取。例如,在紐約大學(xué)(New York University),整個(gè)大學(xué)中數(shù)據(jù)科學(xué)的發(fā)展影響到了圖書館的館藏,紐約大學(xué)圖書館購(gòu)買了更多供應(yīng)商產(chǎn)生的數(shù)據(jù)集,以滿足用戶對(duì)大數(shù)據(jù)的需求(例如大型社交媒體數(shù)據(jù)),并將API集成到其館藏和發(fā)現(xiàn)環(huán)境中

      。與此同時(shí),許多圖書館已經(jīng)承擔(dān)起了談判和解釋許可,以允許對(duì)圖書館館藏進(jìn)行內(nèi)容挖掘的角色

      。

      在許多機(jī)構(gòu)中,研究計(jì)算基礎(chǔ)架構(gòu)正逐漸從本地?cái)?shù)據(jù)中心遷移到云

      。云計(jì)算可促進(jìn)分布式團(tuán)隊(duì)之間的協(xié)作,并為無(wú)法訪問(wèn)本地計(jì)算資源的科研人員提供解決方案。但是,它也帶來(lái)了風(fēng)險(xiǎn)。存儲(chǔ)在商業(yè)云中的數(shù)據(jù)不再完全由科研人員控制,容易受到黑客入侵或?yàn)?zāi)難性損失的影響。根據(jù)所使用的特定服務(wù),科研人員也可能會(huì)授予第三方獲取或使用其數(shù)據(jù)的權(quán)限。無(wú)論是將數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在云中還是本地?cái)?shù)據(jù)中心中,托管數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)基礎(chǔ)設(shè)施的圖書館必須考慮網(wǎng)絡(luò)的安全性。

      跨機(jī)構(gòu)研究圖書館計(jì)劃(Cross-institutional Research Library Initiatives)努力嘗試正式獲取大規(guī)模數(shù)據(jù)集以進(jìn)行學(xué)術(shù)分析的方法。例如,在2019年十大機(jī)構(gòu)利用其集體購(gòu)買力從Web of Science得到了每年13 TB的文獻(xiàn)計(jì)量數(shù)據(jù)的授權(quán)許可。為了使十大園區(qū)的用戶均可以使用這一數(shù)據(jù),由美國(guó)博物館和圖書館協(xié)會(huì)(Institute of Museum and Library Services,IMLS)資助的CADRE項(xiàng)目將原始數(shù)據(jù)處理到印第安納大學(xué)高性能計(jì)算中心的關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)中。完成后,CADRE將采用標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)格式,提供多種格式的數(shù)據(jù),包括關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)和圖形數(shù)據(jù)庫(kù)格式以及平面表和本機(jī)格式,共享的和自定義/私有的計(jì)算資源,提供一個(gè)跨學(xué)科的平臺(tái),一個(gè)用于共享和存儲(chǔ)查詢、算法、派生數(shù)據(jù)、分析結(jié)果、工作流和可視化的空間

      數(shù)據(jù)科學(xué)家、人文主義者和社會(huì)科學(xué)家越來(lái)越多地將圖書館館藏作為創(chuàng)建和發(fā)現(xiàn)新知識(shí)的數(shù)據(jù)源。將圖書館館藏用于計(jì)算研究有很多潛在優(yōu)勢(shì),它們通常包含高質(zhì)量的元數(shù)據(jù),一些館藏是開放獲取的,對(duì)數(shù)據(jù)挖掘的限制少,并且許多館藏已經(jīng)使用機(jī)器可讀的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行了結(jié)構(gòu)化處理。以Collections as Data為代表的一些項(xiàng)目,鼓勵(lì)文化遺產(chǎn)機(jī)構(gòu)認(rèn)真開發(fā)支持“計(jì)算驅(qū)動(dòng)的研究和教學(xué)”的數(shù)字館藏(許可、購(gòu)買和獨(dú)有的)和相關(guān)服務(wù)(例如研討會(huì)、咨詢、數(shù)字平臺(tái))。圖書館可通過(guò)開發(fā)和實(shí)施從文本或其他媒體中提取數(shù)據(jù),清理數(shù)據(jù)并以適合分析的數(shù)據(jù)庫(kù)或其他格式提供數(shù)據(jù)的過(guò)程,建立機(jī)器可讀的館藏?;贑ollections as Data框架,使館藏機(jī)器可操作,從而增加館藏的價(jià)值。猶他大學(xué)的圖書館員對(duì)《女人指數(shù)》(一家鹽湖城的報(bào)紙)的整個(gè)流程進(jìn)行了數(shù)字化處理,重點(diǎn)關(guān)注摩門教女性,開發(fā)了用于基于網(wǎng)絡(luò)查詢的數(shù)據(jù)挖掘工具,并提供了可下載的語(yǔ)料庫(kù)訪問(wèn)權(quán)限。通過(guò)繪制黑人摩門教徒的歷史,探索了將計(jì)算分析應(yīng)用于與其社區(qū)相關(guān)的數(shù)字化館藏材料的可行性

      。

      為了重現(xiàn)結(jié)果,科研人員不僅需要獲取有據(jù)可查的、公開可用的數(shù)據(jù),還需要獲取用于處理和分析數(shù)據(jù)的代碼。獲取用于處理數(shù)據(jù)和生成結(jié)果的計(jì)算步驟與獲取數(shù)據(jù)本身一樣重要

      。許多數(shù)據(jù)科研人員進(jìn)行探索性研究的電子實(shí)驗(yàn)室筆記本身并不支持廣泛的共享或發(fā)布數(shù)據(jù)。與同事共享時(shí),電子實(shí)驗(yàn)室筆記對(duì)環(huán)境的依賴使行為無(wú)法預(yù)測(cè)。相同的代碼可能在不同的環(huán)境中產(chǎn)生不同的結(jié)果,或者無(wú)法完全計(jì)算出

      。

      1.2 開發(fā)支持?jǐn)?shù)據(jù)使用和重用的基礎(chǔ)設(shè)施

      隨著資助機(jī)構(gòu)和出版商的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)要求的提高,以及有關(guān)數(shù)據(jù)共享研究的不斷深入,支持?jǐn)?shù)據(jù)共享和長(zhǎng)期保存的基礎(chǔ)設(shè)施需求也相應(yīng)增長(zhǎng)。圖書館維護(hù)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)、學(xué)科存儲(chǔ)庫(kù)和通用存儲(chǔ)庫(kù)(例如figshare和Zenodo)迅速增加。但是,圖書館在數(shù)據(jù)管理服務(wù)上的投入遠(yuǎn)超過(guò)了對(duì)基礎(chǔ)設(shè)施的投入

      。除了圖書館提供的有價(jià)值的數(shù)據(jù)管理計(jì)劃和咨詢服務(wù)外,學(xué)者也需要基礎(chǔ)設(shè)施來(lái)支持各種格式的超大型、異構(gòu)、實(shí)時(shí)、聯(lián)網(wǎng)和復(fù)雜的數(shù)據(jù)集。他們希望基礎(chǔ)設(shè)施能夠促進(jìn)分布式協(xié)作、數(shù)據(jù)重用和長(zhǎng)期保存。但是,研究圖書館的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)并不總能符合這些期望。當(dāng)前的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)傾向于支持與論文相關(guān)的經(jīng)過(guò)處理的數(shù)據(jù)集,而教師所需要的是一種活的有機(jī)體,一個(gè)不斷發(fā)展的數(shù)據(jù)庫(kù)。

      為了實(shí)現(xiàn)協(xié)作,重用驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)正在利用工具減少與分布式團(tuán)隊(duì)和分散數(shù)據(jù)集一起工作所需的計(jì)算資源和花費(fèi)的精力。例如,iRODS數(shù)據(jù)管理軟件將其數(shù)據(jù)存儲(chǔ)資源虛擬化,以便用戶無(wú)論在哪里,使用什么設(shè)備均可訪問(wèn)數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)虛擬化支持用戶跨系統(tǒng)查詢,而不需要下載到某一設(shè)備或在系統(tǒng)之間復(fù)制數(shù)據(jù)。

      與許多針對(duì)數(shù)據(jù)存檔進(jìn)行了優(yōu)化的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)不同,重用驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)旨在支持內(nèi)置分析工具,使數(shù)據(jù)與計(jì)算資源的共置,并實(shí)現(xiàn)持續(xù)協(xié)作,包括復(fù)雜的權(quán)限選項(xiàng)及地理位置分散團(tuán)隊(duì)的訪問(wèn)權(quán)限設(shè)置。使用和重用驅(qū)動(dòng)的存儲(chǔ)庫(kù)類似于一個(gè)熱鬧的車間,該車間配備了強(qiáng)大的工具來(lái)處理作為原材料的大數(shù)據(jù)集,而不是作為倉(cāng)庫(kù)來(lái)存儲(chǔ)數(shù)據(jù)

      。在數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)中內(nèi)置可視化工具正成為流行功能。普渡大學(xué)(Purdue University)圖書館的科研數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)PURR通過(guò)將GIS服務(wù)器添加到其存儲(chǔ)庫(kù)基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)中,從而合并了地理空間數(shù)據(jù)可視化工具。Web映射功能可有效地使最終用戶在下載之前預(yù)覽數(shù)據(jù)集并確定其與研究興趣的相關(guān)性,而不需要查看和處理大量地理空間數(shù)據(jù)所需的專用軟件。弗吉尼亞大學(xué)(University of Virginia)圖書館與人文科學(xué)高級(jí)技術(shù)學(xué)院(Institute for Advanced Technology in the Humanities)合作,將這種方法應(yīng)用于3D數(shù)據(jù),從而為存儲(chǔ)在Dataverse中的數(shù)據(jù)集創(chuàng)建了增強(qiáng)的接口,使用開源Web 3D瀏覽器3D Heritage Online(3DHOP)提供交互式3D模型供用戶在下載前瀏覽數(shù)據(jù)

      強(qiáng)調(diào)數(shù)據(jù)的使用和重用,要求存儲(chǔ)庫(kù)基礎(chǔ)架構(gòu)從原有的重視存儲(chǔ)和檢索功能轉(zhuǎn)變?yōu)橹匾暦治龊凸蚕砉δ堋8ゼ醽喞砉ご髮W(xué)圖書館采用了使用和重用框架作為其數(shù)據(jù)管理及服務(wù)基礎(chǔ)架構(gòu)的“原動(dòng)力”

      。將學(xué)術(shù)數(shù)據(jù)集與用于創(chuàng)建、顯示或解釋它們的算法和計(jì)算環(huán)境相分離變得越來(lái)越困難。即使有大量有關(guān)“數(shù)據(jù)及其使用環(huán)境”的文檔,將數(shù)據(jù)從分析的自然環(huán)境中剔除以保存在孤立的存儲(chǔ)庫(kù)中,也會(huì)大大降低其價(jià)值。

      當(dāng)科研人員試圖通過(guò)挖掘和其他數(shù)據(jù)處理方法從不斷增長(zhǎng)的數(shù)據(jù)量中提取信息時(shí),他們需要越來(lái)越強(qiáng)的計(jì)算能力。這就要求圖書館與研究計(jì)算中心之間建立程序化合作伙伴關(guān)系,以確保計(jì)算需求與數(shù)據(jù)管理需求之間保持一致。提供用于高速網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)架構(gòu)需要在國(guó)家層面進(jìn)行合作。由美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)(National Science Foundation,NSF)資助的太平洋研究平臺(tái)(Pacific Research Platform,PRP)是區(qū)域協(xié)調(diào)的一項(xiàng)嘗試

      。由NSF資助的項(xiàng)目通過(guò)擴(kuò)展這種方法開發(fā)了國(guó)家研究平臺(tái)(National Research Platform,NRP),該平臺(tái)將有助于訪問(wèn)分布式數(shù)據(jù)集,并使科研人員能夠利用國(guó)家超級(jí)計(jì)算機(jī)設(shè)施的計(jì)算和存儲(chǔ)資源。

      目前,中國(guó)的有效灌溉面積已達(dá)到0.6億hm2,約占全世界灌溉面積的20%。灌溉面積占全國(guó)耕地面積的49.6%,灌區(qū)生產(chǎn)的糧食占全國(guó)糧食總產(chǎn)量的75%。這正是中國(guó)以占世界6%的水資源和9%的耕地解決了占世界21%人口的糧食問(wèn)題的重要基礎(chǔ)。

      隨著數(shù)據(jù)授權(quán)和館藏活動(dòng)的成熟,圖書館已經(jīng)注意到有必要實(shí)施同樣有據(jù)可查的、系統(tǒng)的工作流程,以收集其他學(xué)術(shù)資源。目前,很多大學(xué)圖書館主要是應(yīng)教師的具體要求購(gòu)買或授權(quán)數(shù)據(jù)集。這些數(shù)據(jù)集不會(huì)被集成到圖書館館藏目錄中,也無(wú)法提供給其他潛在用戶使用。弗吉尼亞理工大學(xué)圖書館(Virginia Tech Libraries)有關(guān)數(shù)據(jù)許可工作流程回顧的內(nèi)部報(bào)告明確指出,這種臨時(shí)方法存在固有挑戰(zhàn)

      。該報(bào)告指出“由于供應(yīng)商擔(dān)心專有數(shù)據(jù)的安全性以及涉及在線傳輸大型數(shù)據(jù)集的問(wèn)題”,數(shù)據(jù)集通常通過(guò)CD、USB驅(qū)動(dòng)器或硬盤驅(qū)動(dòng)器提供,但是這些載體缺少相應(yīng)的目錄記錄,因此很難控制存儲(chǔ)情況并促進(jìn)數(shù)據(jù)的發(fā)現(xiàn)。

      北京大學(xué)房地產(chǎn)研究中心主任樓建波表示,《房產(chǎn)測(cè)量規(guī)范》提到的公攤面積計(jì)算方式在《住宅設(shè)計(jì)規(guī)范》中無(wú)相應(yīng)體現(xiàn),致使國(guó)內(nèi)報(bào)批、設(shè)計(jì)、施工每個(gè)環(huán)節(jié)都不是特別清楚公攤?cè)绾斡?jì)算,只能等著房子蓋出來(lái),測(cè)繪部門最終來(lái)測(cè)公攤大小,導(dǎo)致出現(xiàn)不少亂象。

      數(shù)據(jù)密集型研究支持和數(shù)據(jù)管理要求圖書館跨界工作。除了組織數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù),圖書館還需要根據(jù)學(xué)科或研究興趣,通過(guò)基礎(chǔ)設(shè)施、監(jiān)管指導(dǎo)、知識(shí)產(chǎn)權(quán)專業(yè)知識(shí)和社區(qū)建設(shè)為跨機(jī)構(gòu)科研人員社區(qū)提供支持

      。這些“數(shù)據(jù)社區(qū)”從圖書館獲得資金和人力資源,或者與作為校園大使和作為監(jiān)管人的圖書館員合作。盡管學(xué)科和其他公共數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)(例如figshare)顯示出了很高的存儲(chǔ)率和參與度,但是他們?nèi)狈π@數(shù)據(jù)管理員和館員可以建立的機(jī)構(gòu)聯(lián)系和關(guān)系?;跈C(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)專家和與機(jī)構(gòu)無(wú)關(guān)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)之間的協(xié)調(diào)與協(xié)作可以通過(guò)確保研究人員遵循最佳實(shí)踐,并且其研究成果得到保留和可重復(fù)使用來(lái)推進(jìn)

      本研究的不足:(1)樣本量較少;(2)由于倫理要求,未能對(duì)同一患者同時(shí)行兩代320排螺旋CT掃描;(3)觀察者內(nèi)和觀察者間在灌注參數(shù)測(cè)量上的可重復(fù)性存在較多爭(zhēng)議,觀察者內(nèi)的一致性可能優(yōu)于觀察者間[16],但臨床中患者的檢查與隨訪測(cè)量較難由同一位觀察者完成。

      1.3 支持可復(fù)制的科學(xué)研究

      科學(xué)進(jìn)步取決于科學(xué)研究結(jié)果的可復(fù)制性。隨著基于計(jì)算密集型方法進(jìn)行的科學(xué)研究越來(lái)越多,驗(yàn)證和復(fù)制結(jié)果變得越來(lái)越復(fù)雜。圖書館通過(guò)數(shù)據(jù)服務(wù)鼓勵(lì)學(xué)者將數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在開放存儲(chǔ)庫(kù)中,并以重用性為目的考慮組織、記錄和授權(quán)數(shù)據(jù)的方式。圖書館還開發(fā)軟件和基礎(chǔ)設(shè)施幫助科研人員創(chuàng)建和保存可復(fù)制的數(shù)據(jù)集。

      隨著生命科學(xué)和歷史等各個(gè)領(lǐng)域的科研人員探索以新技術(shù)為基礎(chǔ)的方法來(lái)查詢?cè)假Y料,廣泛獲取現(xiàn)有數(shù)據(jù)的需求也日益增長(zhǎng)。單個(gè)大數(shù)據(jù)語(yǔ)料庫(kù)可以由不同的科研人員提出不同的問(wèn)題來(lái)無(wú)限挖掘,或由計(jì)算機(jī)科學(xué)家用來(lái)訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)模型。要利用數(shù)據(jù)集帶來(lái)的可能性,產(chǎn)生這些數(shù)據(jù)的科研人員必須共享它們,并使數(shù)據(jù)以被其他人解釋和重用的方式進(jìn)行共享

      。越來(lái)越多的研究表明,已發(fā)表的科學(xué)文獻(xiàn)和現(xiàn)有數(shù)據(jù)集包含了許多隱藏的假設(shè)、見解和聯(lián)系,可以通過(guò)數(shù)據(jù)挖掘和應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)來(lái)發(fā)現(xiàn)

      。比如科研人員以多種方式使用機(jī)器學(xué)習(xí)對(duì)抗COVID-19的大流行,通過(guò)對(duì)CT掃描圖像進(jìn)行分類,幫助疫苗開發(fā),并嘗試預(yù)測(cè)新的疫情。

      虛擬容器為應(yīng)對(duì)這一挑戰(zhàn)提供了一種解決方案。容器技術(shù)或容器化通常被描述為“虛擬機(jī)的輕量級(jí)替代品”,它將代碼、軟件和操作系統(tǒng)捆綁在一起,以便用戶可以準(zhǔn)確地重現(xiàn)計(jì)算研究。諸如Docker和Singularity之類的容器技術(shù)已被廣泛采用。諸如ReproZip和Binder之類的項(xiàng)目旨在通過(guò)學(xué)術(shù)研究界廣泛使用的容器化技術(shù)來(lái)提高可重復(fù)性。ReproZip的工作方式是自動(dòng)跟蹤工作的執(zhí)行情況,然后將所有依賴項(xiàng)打包在一個(gè)可分發(fā)的程序包中(RPZ文件),并與各種數(shù)據(jù)分析工具、腳本和軟件語(yǔ)言、數(shù)據(jù)庫(kù)及Jupyter等電子實(shí)驗(yàn)室筆記兼容

      。Binder可以檢索托管在Git存儲(chǔ)庫(kù)中的Jupyter筆記,建立一個(gè)容器圖像來(lái)為其服務(wù),并將該圖像開放給網(wǎng)絡(luò)上的任何人。

      圖書館通過(guò)創(chuàng)建和重新定義員工角色支持可復(fù)制的科學(xué)研究。紐約大學(xué)于2017年首次在可復(fù)制性服務(wù)中設(shè)立了專門職位;佛羅里達(dá)大學(xué)圖書館也刊登了類似的招聘廣告。在紐約大學(xué),科研數(shù)據(jù)管理和可復(fù)制性研究支持的館員是圖書館和數(shù)據(jù)科學(xué)中心(Center for Data Science,CDS)共同任命的雙重職位,主要負(fù)責(zé)教育和宣傳活動(dòng),以及支持?jǐn)?shù)據(jù)服務(wù)的工具和基礎(chǔ)架開發(fā)和建設(shè)活動(dòng)

      。亞利桑那大學(xué)圖書館整合數(shù)據(jù)管理最佳實(shí)踐對(duì)可復(fù)制性提供支持,推廣腳本/軟件實(shí)現(xiàn)工作流程的自動(dòng)化,推廣支持可復(fù)制研究的工具(例如Jupyter筆記),并在工作坊和講座中倡導(dǎo)采用開放式研究實(shí)踐

      。德克薩斯大學(xué)圖書館預(yù)測(cè),圖書館員將成為嵌入式研究的合作伙伴,為科研人員自由獲得科研數(shù)據(jù)、實(shí)驗(yàn)記錄提供支持

      。在2020年舉行的首屆“圖書館員建立可復(fù)制性研究的驅(qū)動(dòng)力”會(huì)議上,探討了圖書館支持可復(fù)制性的方式,包括將復(fù)制性教育納入研究生和本科生的學(xué)習(xí)計(jì)劃,研究仿真服務(wù)和其他圖書館管理的工具,并將可再?gòu)?fù)制原則應(yīng)用于圖書館學(xué)研究中

      。

      2 提供并維護(hù)機(jī)器可操作的館藏

      美國(guó)國(guó)家科學(xué)院(National Academies)描述了一個(gè)愿景——科研人員可以立即獲取最新出版物,并可以自由搜索論文檔案,包括預(yù)印本、研究軟件代碼、其他公開出版物、研究結(jié)果數(shù)據(jù)庫(kù),以及與物理標(biāo)本有關(guān)的數(shù)字信息,這些信息全免費(fèi)且不存在其他障礙??蒲腥藛T使用最新的數(shù)據(jù)庫(kù)和文本挖掘工具來(lái)探索這些資源,確定嵌入在研究中的新概念,明確可以在哪里做出新貢獻(xiàn)

      。這一愿景實(shí)現(xiàn)的前提是機(jī)器可操作館藏的可用性。

      由于鐵路線路呈長(zhǎng)帶狀,這種GPR探測(cè)測(cè)線的布設(shè)導(dǎo)致每條測(cè)線都很長(zhǎng)且勘探所獲數(shù)據(jù)量巨大,與GPR探測(cè)配套的專業(yè)數(shù)據(jù)處理與解釋軟件例如常見的RADAN7等,往往需要對(duì)每條測(cè)線分段進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和翻漿冒泥病害的人機(jī)交互解釋圈定,尤其是各個(gè)翻漿冒泥病害區(qū)域底界控制點(diǎn)的標(biāo)定,根本無(wú)法按比例尺沿鐵路正線進(jìn)行狹長(zhǎng)帶狀區(qū)域翻漿冒泥病害底界深度等值線圖的繪制。有鑒如此,本論文結(jié)合RADAN7和Surfer軟件,提出了一種用于GPR勘探的鐵路翻漿冒泥病害底界的等值線圖繪制方法。

      機(jī)器可操作的館藏不僅非常適合于計(jì)算研究,而且非常適合人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)工具的開發(fā)。人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)工具依賴于大量結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),在不久的將來(lái),人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)訓(xùn)練算法可能會(huì)成為圖書館館藏的主要用戶。IFLA的最新博文指出圖書館館藏包含用于開發(fā)機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)的最豐富的資源

      。但是,基于圖書館館藏進(jìn)行人工智能訓(xùn)練的陷阱也有很多。圣塔芭芭拉關(guān)于Collections as Data聲明的作者指出,有些館藏的規(guī)模也可能掩蓋了他們認(rèn)為代表的歷史中隱藏或缺失的事物,文化遺產(chǎn)機(jī)構(gòu)必須牢記這些缺失,并提供應(yīng)對(duì)策略。與有爭(zhēng)議的做法(例如預(yù)測(cè)性警務(wù)試圖通過(guò)對(duì)歷史犯罪數(shù)據(jù)的計(jì)算分析來(lái)預(yù)測(cè)犯罪和再犯)一樣,數(shù)字化圖書館館藏的大數(shù)據(jù)分析也有可能發(fā)掘新的“見解”,再現(xiàn)甚至加劇文化偏見和歷史種族主義。該聲明鼓勵(lì)圖書館員在開發(fā)機(jī)器可操作的館藏時(shí)批判地對(duì)待這些可能的偏見

      。

      3 成為數(shù)據(jù)科學(xué)教育與咨詢主要力量

      在過(guò)去的十年中,數(shù)據(jù)科學(xué)已經(jīng)無(wú)處不在,并且從STEM領(lǐng)域轉(zhuǎn)移到了許多其他領(lǐng)域。同時(shí),大數(shù)據(jù)時(shí)代從事跨學(xué)科研究的科研人員通過(guò)使用網(wǎng)絡(luò)傳感器,挖掘和抓取技術(shù)以及其他方法可以獲得TB級(jí)的復(fù)雜數(shù)據(jù),其生成或操縱數(shù)據(jù)的能力已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)了他們管理、組織數(shù)據(jù),使其易于獲取的能力。美國(guó)國(guó)家科學(xué)院(National Academies)的報(bào)告指出現(xiàn)在許多科學(xué)領(lǐng)域都涉及對(duì)大型數(shù)據(jù)集的計(jì)算分析,人文和社會(huì)科學(xué)領(lǐng)域的科研人員也轉(zhuǎn)向數(shù)據(jù)密集型方法

      。隨著數(shù)據(jù)科學(xué)的快速發(fā)展,即使本科生也存在獲取大數(shù)據(jù)以進(jìn)行數(shù)據(jù)分析的需求。一方面,大數(shù)據(jù)數(shù)量巨大,而且具有窮盡性和多樣性,及時(shí)性和動(dòng)態(tài)性,混亂和不確定性,高度關(guān)聯(lián)性等特點(diǎn),致使處理大數(shù)據(jù)極具挑戰(zhàn)性。另一方面,由于缺乏必要的經(jīng)驗(yàn)和專業(yè)知識(shí),有效地從大數(shù)據(jù)集中提取價(jià)值成為科研人員面臨的最大難題。當(dāng)使用海量、復(fù)雜、異構(gòu)和可變的數(shù)據(jù)集時(shí),科研人員需要工具,同時(shí)也需要接受教育和培訓(xùn)以進(jìn)行數(shù)據(jù)分析、共享和發(fā)布。

      為此,圖書館積極開展數(shù)據(jù)科學(xué)教育咨詢服務(wù),成為推動(dòng)數(shù)字學(xué)術(shù)發(fā)展的主要力量。圖書館努力將大數(shù)據(jù)分析的能力帶給人文和社會(huì)科學(xué)領(lǐng)域的科研人員,支持他們探索新的研究方法,深化用戶對(duì)數(shù)據(jù)科學(xué)的認(rèn)識(shí),鼓勵(lì)用戶對(duì)數(shù)據(jù)科學(xué)進(jìn)行批判性思考

      。加州大學(xué)伯克利分校圖書館(UC Berkeley Libraries)數(shù)據(jù)科學(xué)服務(wù)的核心目標(biāo)是揭開數(shù)據(jù)科學(xué)的神秘面紗,從各個(gè)方向構(gòu)建通往數(shù)據(jù)科學(xué)的新渠道

      。為了讓跨學(xué)科的學(xué)者和學(xué)生了解和使用數(shù)據(jù)科學(xué),一些圖書館啟動(dòng)了包括工作坊和非學(xué)分課程在內(nèi)的教育計(jì)劃。例如,佐治亞理工學(xué)院(Georgia Tech)圖書館員以合作方式提供3D建模、編程語(yǔ)言、網(wǎng)絡(luò)抓取、其他數(shù)據(jù)科學(xué)和數(shù)字學(xué)術(shù)方法,以及針對(duì)非數(shù)據(jù)密集型專業(yè)學(xué)生的數(shù)據(jù)素養(yǎng)課程。哥倫比亞大學(xué)(Columbia University)圖書館提供研究計(jì)算基礎(chǔ)課程,為本校研究生和博士后提供非正式培訓(xùn),開發(fā)利用計(jì)算的基本技能,并建立起使用計(jì)算密集型方法的科研人員社區(qū)。一些圖書館開發(fā)了基于實(shí)驗(yàn)室的教學(xué)項(xiàng)目,邀請(qǐng)協(xié)作團(tuán)隊(duì)一起應(yīng)對(duì)數(shù)據(jù)科學(xué)和數(shù)字學(xué)術(shù)的挑戰(zhàn)。例如,99 AI挑戰(zhàn),它是由多倫多大學(xué)圖書館贊助的活動(dòng),該活動(dòng)召集99名沒(méi)有技術(shù)背景的學(xué)生、教職員工和其他社區(qū)成員,共同學(xué)習(xí)和批判地使用AI技術(shù)

      。以項(xiàng)目為中心的實(shí)驗(yàn)室教學(xué)項(xiàng)目鼓勵(lì)用戶更深入的參與,并可以建立長(zhǎng)期的合作伙伴關(guān)系。它還可以幫助圖書館為新興技術(shù)項(xiàng)目提供負(fù)責(zé)任的、可持續(xù)的支持,通過(guò)邀請(qǐng)“來(lái)自圖書館和信息技術(shù)組織的合作伙伴,以幫助創(chuàng)建適合實(shí)驗(yàn)室任務(wù)核心的通用學(xué)術(shù)解決方案和最佳實(shí)踐。

      獎(jiǎng)品揭曉日期雖五花八門,但最多的還是在11月11日,剁手節(jié)。一些網(wǎng)友在看完獎(jiǎng)品名單后感慨,獎(jiǎng)是一個(gè)沒(méi)中,反倒被禮品清單種了草。我也是在微博和淘寶之間反復(fù)切換。

      需要注意的是,圖書館在聘請(qǐng)數(shù)據(jù)專家方面面臨許多挑戰(zhàn)。亞利桑那大學(xué)圖書館內(nèi)部數(shù)據(jù)專家Jeffrey Oliver在數(shù)據(jù)管理計(jì)劃中與其他圖書館員合作,并為生命科學(xué)研究者提供生物信息學(xué)支持,尤其是在數(shù)據(jù)分析和可視化方面。Oliver認(rèn)為就讓科研人員與圖書館內(nèi)部和外部的資源建立聯(lián)系方面,圖書館發(fā)揮著關(guān)鍵作用,應(yīng)提供基本的教育和指導(dǎo),并幫助建立起長(zhǎng)期的研究合作伙伴關(guān)系。當(dāng)雇用數(shù)據(jù)專家不可行時(shí),提高現(xiàn)有館員的技能是一個(gè)不錯(cuò)的選擇。例如,北卡羅萊納州立大學(xué)成立了面向圖書館員的數(shù)據(jù)科學(xué)和可視化研究所(Data Science and Visualization Institute for Librarians,DSVIL),通過(guò)提供一系列有關(guān)軟件工具和與數(shù)據(jù)分析、可視化、共享和重用相關(guān)的技能的強(qiáng)化培訓(xùn),解決了圖書館員當(dāng)前在數(shù)據(jù)科學(xué)方面的技能差距

      。

      自主學(xué)習(xí)能力能夠在英語(yǔ)實(shí)踐中獲得有效的開發(fā)與提升。不但個(gè)體因素會(huì)對(duì)學(xué)生自主學(xué)習(xí)能力的培養(yǎng)與提高有著影響,外在因素也不容忽視。以往單一的教學(xué)模式已難以滿足學(xué)生發(fā)展的需求,而混合式教學(xué)模式則能夠?yàn)榕囵B(yǎng)與提高學(xué)生的英語(yǔ)自主學(xué)習(xí)能力提供了一個(gè)重要途徑。具體培養(yǎng)策略如下:

      4 結(jié)語(yǔ)

      圖書館數(shù)據(jù)服務(wù)長(zhǎng)期以來(lái)一直專注于基礎(chǔ)設(shè)施,教育和倡導(dǎo)支持?jǐn)?shù)據(jù)歸檔。新興技術(shù)和科研人員不斷變化的期望正在促使圖書館轉(zhuǎn)向開展以數(shù)據(jù)使用和重用為中心的數(shù)據(jù)服務(wù)。開展以數(shù)據(jù)使用和重用為中心的數(shù)據(jù)服務(wù),要求圖書館實(shí)現(xiàn)基礎(chǔ)設(shè)施的重新開發(fā),以支持?jǐn)?shù)據(jù)分析和主動(dòng)協(xié)作;要求圖書館使用軟件和工作流將科研數(shù)據(jù)集與解釋和復(fù)制結(jié)果所必需的代碼和操作系統(tǒng)包裝在一起;要求圖書館繼續(xù)倡導(dǎo)明確支持?jǐn)?shù)據(jù)重用,重新定位和挖掘的許可條款。圖書館通過(guò)提供并維護(hù)機(jī)器可操作的館藏,為人類和機(jī)器用戶通過(guò)數(shù)據(jù)挖掘和分析從數(shù)字館藏中獲取見解做好準(zhǔn)備,對(duì)機(jī)器可操作性的投資有助于進(jìn)一步增強(qiáng)數(shù)字化館藏的價(jià)值,使其成為圖書館最有價(jià)值的資源。作為提供數(shù)據(jù)科學(xué)教育和咨詢的主要力量,圖書館主導(dǎo)的工作坊和教育計(jì)劃可以促進(jìn)科研人員對(duì)數(shù)據(jù)科學(xué)進(jìn)行批判性思考,通過(guò)將大數(shù)據(jù)分析方法和工具提供給人文和社會(huì)科學(xué)研究領(lǐng)域的科研人員,支持他們探索新的研究途徑。在促進(jìn)數(shù)字學(xué)術(shù)發(fā)展的同時(shí),圖書館面臨著專業(yè)人員短缺的難題,對(duì)于具有數(shù)據(jù)科學(xué)教育和經(jīng)驗(yàn)的專業(yè)人員,圖書館將面臨行業(yè)的激烈競(jìng)爭(zhēng)。由于圖書館員要在新能力與現(xiàn)有職責(zé)之間取得平衡,因此重新培訓(xùn)現(xiàn)有館員也會(huì)面臨諸多挑戰(zhàn)。總之,圖書館應(yīng)密切關(guān)注新技術(shù)的發(fā)展,在收集和許可用于分析的數(shù)據(jù)集、開發(fā)支持?jǐn)?shù)據(jù)使用和重用的基礎(chǔ)設(shè)施、支持科學(xué)研究的可復(fù)制性三個(gè)方面,不斷開發(fā)和優(yōu)化面向跨學(xué)科研究的數(shù)據(jù)服務(wù),同時(shí)通過(guò)提供并維護(hù)機(jī)器可操作的館藏增加館藏價(jià)值,擔(dān)當(dāng)數(shù)據(jù)科學(xué)教育與咨詢主要力量等實(shí)踐工作,扮演好數(shù)據(jù)學(xué)術(shù)孵化器的角色,為數(shù)字學(xué)術(shù)的理念推廣,研究討論與實(shí)踐探索創(chuàng)造良好的環(huán)境和條件。

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