王林,汪和廷,王慧,張從合
(安徽荃銀高科種業(yè)股份有限公司,安徽合肥 230088)
水稻(Oryza sativa L.)是重要的糧食作物,我國(guó)大約有2/3 的人口以稻米作為主食[1-2]。隨著生活水平和消費(fèi)水平的不斷提高,人們對(duì)稻米品質(zhì)的要求也越來(lái)越高。稻米品質(zhì)主要由外觀品質(zhì)、碾磨品質(zhì)、食味品質(zhì)和營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)決定,其中食味品質(zhì)為重要的評(píng)價(jià)指標(biāo)之一,而淀粉的結(jié)構(gòu)和含量是影響食味品質(zhì)的關(guān)鍵[3]。稻米品質(zhì)是影響水稻品種推廣和商業(yè)價(jià)值的重要指標(biāo)。因此,目前主要以提高產(chǎn)量和改善品質(zhì)作為水稻育種的主要目標(biāo)[4]。
稻米主要由胚和胚乳兩部分組成,而胚乳中的儲(chǔ)藏物質(zhì)90%以上為淀粉。淀粉的品質(zhì)與其組成、結(jié)構(gòu)及其理化性質(zhì)密切相關(guān)[1],因此,將稻米淀粉的合成途徑和調(diào)控基因等作為研究對(duì)象具有重要意義。長(zhǎng)期以來(lái),科研工作者通過(guò)對(duì)一些人工突變和自然突變材料進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)了大量調(diào)控水稻淀粉生物合成的基因。如flo1 突變會(huì)導(dǎo)致直鏈淀粉含量升高[5-6];在flo2 突變體中,直鏈淀粉含量會(huì)減少,聚合度(DP)9~21 和 DP≥38 減少,DP 22~38 增加[7-8];在flo8 突變體中,直鏈淀粉含量下降,DP 10~12 和DP≥17減少,DP 7~9 和 DP 14~16 增加[9]。此外,通過(guò)生物信息學(xué)分析找到一些胚乳中特異性表達(dá)的相關(guān)基因或蛋白,通過(guò)對(duì)這些基因的克隆以及功能進(jìn)行分析,來(lái)了解它們?cè)诘矸酆铣芍械淖饔茫瑥亩行У卮龠M(jìn)了水稻淀粉生物合成的發(fā)展。
淀粉根據(jù)其連接方式的不同,分為直鏈淀粉和支鏈淀粉,二者的比值決定著稻米品質(zhì)。瞬時(shí)淀粉白天通過(guò)光合作用在葉片中進(jìn)行合成,在夜間進(jìn)行降解,為植物代謝提供能量,其形成的淀粉顆粒幾乎為體積很小的支鏈淀粉[10]。ADP-葡萄糖焦磷酸化酶是淀粉合成中重要的一步,其包括在酶活性中心起主要作用的大亞基AGPL 及在活性中心起到催化和結(jié)合的小亞基AGPS[11]。在葉綠體中,利用卡爾文循環(huán)固定的CO2通過(guò)一系列反應(yīng)形成1-磷酸葡萄糖,ADP-葡萄糖焦磷酸化酶可以催化1-磷酸葡萄糖形成淀粉合成的前體物質(zhì)ADPG,最終在淀粉合成酶及淀粉分支酶的作用下形成直鏈淀粉和支鏈淀粉[12]。相關(guān)研究表明,glgC-16 能夠編碼高活性和對(duì)異構(gòu)調(diào)節(jié)不敏感的AD-Pase,將大腸桿菌的突變基因glgC-16 轉(zhuǎn)入水稻中會(huì)顯著增加水稻籽粒的淀粉含量和千粒重[13]。
在淀粉體中,以蔗糖作為合成淀粉的碳源,經(jīng)過(guò)水解后的蔗糖以磷酸葡萄糖的形式進(jìn)入淀粉體參與淀粉的合成。Hirose 等研究表明,在水稻中有21個(gè)基因參與淀粉的合成[14]。淀粉合成酶一般與總淀粉含量,直鏈淀粉和支鏈淀粉比例以及支鏈淀粉分支長(zhǎng)度有關(guān)。淀粉合成酶一般為葡萄糖轉(zhuǎn)移酶,包括顆粒結(jié)合淀粉合成酶(GBSS)和可溶性淀粉合成酶(SSS)[15]。GBSSI 主要與直鏈淀粉的合成有關(guān),GBSSII 與支鏈淀粉的合成有關(guān)。淀粉分支酶(SBE)具有雙重催化作用,一方面將α-1,4-糖苷鍵水解,另一方面催化非還原性末端連接到C-6 羥基上形成α-1,6-糖苷鍵分支點(diǎn)。淀粉去分支酶(SDBE)主要水解α-1,6-糖苷鍵,屬于淀粉水解酶家族。SDBE 能消除支鏈淀粉中出現(xiàn)的異常支鏈分支,從而形成正常的分支[16]。
bZIP 是第一個(gè)確定參與淀粉合成的轉(zhuǎn)錄因子。據(jù)報(bào)道,OsbZIP58 顯示直接與6個(gè)淀粉合成基因的啟動(dòng)子OsAGPL3、Wx、OsSSIIa、SBE1、OsBEIIb 和 ISA2 結(jié)合,并調(diào)節(jié)它們的表達(dá),從而造成OsbZIP58 突變體中種子形態(tài)異常,在白色腹部區(qū)域淀粉積累改變,導(dǎo)致直鏈淀粉和總淀粉含量的下降[17]。此外,OsbZIP58 可以與OsLOL1 互作,通過(guò)調(diào)控赤霉素合成,進(jìn)而影響種子發(fā)芽和淀粉積累[18]。OsbZIP20 可以與ACGT 元件相互作用,從而影響淀粉合成;而OsbZIP33 在淀粉合成中可以與BEI 和GBSSI 的啟動(dòng)子序列ACGT 結(jié)合,從而調(diào)控淀粉合成[19-20]。
AP2/ERFs 在乙烯及其受體介導(dǎo)的信號(hào)中起著關(guān)鍵的調(diào)節(jié)作用,也參與淀粉代謝和積累[21]。AP2/ERF 家族包括3個(gè)獨(dú)立的亞家族:ERF、AP2 和 RAV。ERF 轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)節(jié)谷物中淀粉的合成[21]。據(jù)報(bào)道,OsRSR1 為AP2/EREBP型調(diào)控因子,其突變體rsr1 會(huì)導(dǎo)致水稻直鏈淀粉含量的增加以及支鏈淀粉結(jié)構(gòu)的改變,同時(shí),也會(huì)增加種子的大小[22]。AP2/ERF 也可以通過(guò)激素來(lái)調(diào)節(jié)淀粉合成基因。研究表明,在過(guò)表達(dá)水稻OsETR2 中,其可以增加淀粉顆粒在節(jié)間的積累[21]。AP2 家族轉(zhuǎn)錄因子OsSERF1,缺失SERF1會(huì)增加RPBF 的表達(dá),以及淀粉含量的增加,從而導(dǎo)致水稻籽粒重量的增加[23]。
OsBP-5 屬于MYC-like 家族轉(zhuǎn)錄因子,主要參與淀粉合成通路中GBSSI 的合成,從而影響淀粉的合成[24]。NAC家族轉(zhuǎn)錄因子OsNAC20 和OsNAC26 具有高度相似的氨基酸序列,單獨(dú)的OsNAC20 和單獨(dú)的OsNAC26 都很好地反式激活 AGPS2b、AGPL2、SSI、SBEI、Pul 和 DPE1,可以改變淀粉的積累,但是不會(huì)造成晶體結(jié)構(gòu)的改變。利用CRISPR/Cas9 構(gòu)建osnac20/osnac26 雙突變體,結(jié)果顯示osnac20/osnac26 雙突變體中總淀粉含量顯著下降,直鏈淀粉的含量顯著增加[25]。
OsESV1 蛋白C 端有富含脯氨酸的序列。為了研究OsESV1 的功能,利用CRISPR/CaS9 系統(tǒng)得到了2 種不同編輯方式的osesv1 突變體,對(duì)其淀粉含量進(jìn)行測(cè)量,結(jié)果表明,osesv1 突變體相對(duì)于野生型總淀粉含量無(wú)明顯變化,但直鏈淀粉含量顯著升高。同時(shí),通過(guò)利用酵母雙雜交試驗(yàn)證明OsESV1 蛋白可以與ADP-葡萄糖焦磷酸化酶小亞基OsAGPS2a 和OsAGPS1 互作[26]。FLO6 蛋白在其N端有一個(gè)質(zhì)體定位信號(hào)肽,C 端具有1個(gè)CBM48 淀粉結(jié)合結(jié)構(gòu)域。研究表明FLO6 在體外和體內(nèi)都可以與異淀粉酶ISA1 互作,其突變體flo6 總淀粉含量上升,直鏈淀粉含量顯著下降,說(shuō)明FLO6 通過(guò)與ISA1 互作來(lái)調(diào)控復(fù)合淀粉顆粒的形成[27]。FLO2 蛋白含在3個(gè)不同位置由氨基酸殘基組成的TPR 結(jié)構(gòu)域,對(duì)60Co 突變得到的9個(gè)flo2 不同位點(diǎn)突變的水稻籽粒進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)相對(duì)于野生型,9個(gè)突變體籽粒的總淀粉含量顯著下降,直鏈淀粉含量和支鏈淀粉含量也呈顯著下降趨勢(shì),表明flo2 突變改變了淀粉的組成成分[28]。FLO11 編碼1個(gè)熱激蛋白70 調(diào)控造粉體的發(fā)育,其突變體flo11 胚乳的中心和外圍淀粉顆粒變球形,外圍表現(xiàn)粉質(zhì)[31]。FLO7 蛋白N 端含有1個(gè)質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽,C 端含有1個(gè)DUF1338 結(jié)構(gòu)域,與野生型相比,flo7突變體中支鏈淀粉的聚合度發(fā)生明顯改變,且在后期胚乳中復(fù)合淀粉顆粒碎裂,無(wú)法形成緊密排列的多邊形,表明FLO7 影響水稻胚乳中正常復(fù)合淀粉顆粒形態(tài)的形成[30]。FLO15 編碼乙二醛酶I 蛋白OsGLY17,其突變體flo15 表現(xiàn)出復(fù)合淀粉顆粒發(fā)育存在缺陷,淀粉含量下降[31]。FLO16 編碼1個(gè)蘋果酸脫氫酶,其突變體flo16 表現(xiàn)出總淀粉含量及直鏈淀粉含量下降,同時(shí)表現(xiàn)出直鏈淀粉和支鏈淀粉的結(jié)構(gòu)發(fā)生改變[32]。Nayeon 等利用T-DNA 插入獲得了flo5 突變體,通過(guò)對(duì)其聚合度、糊化溫度、結(jié)晶度以及鏈長(zhǎng)的分析,闡明了FLO5 在水稻籽粒胚乳的淀粉合成過(guò)程中起著重要的作用[33]。Kang 等采用T-DNA 插入的方法獲得了flo4 突變體,flo4 編碼丙酮酸正磷酸二激酶,通過(guò)測(cè)量淀粉含量發(fā)現(xiàn)與野生型相比無(wú)明顯變化,但是利用掃描電鏡分析發(fā)現(xiàn)flo4 突變體中的胚乳是由松散的淀粉顆粒組成的[34]。
不同家族轉(zhuǎn)錄因子的研究結(jié)果表明,大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子是通過(guò)與淀粉合成通路中淀粉酶的啟動(dòng)子結(jié)合或者通過(guò)與激素的相互作用來(lái)調(diào)控胚乳中淀粉的生物合成。而在蛋白水平上的相關(guān)基因大多是通過(guò)與淀粉合成通路中的相關(guān)酶對(duì)應(yīng)的基因互作來(lái)影響胚乳中復(fù)合顆粒的形成來(lái)調(diào)控淀粉的形成。此外,部分基因是由于其特有的胚乳突變,通過(guò)改變淀粉的結(jié)構(gòu)來(lái)改變?cè)旆垠w的發(fā)育。同時(shí),利用一些T-DNA 插入的方式獲得一些胚乳突變體,雖然對(duì)淀粉的含量沒有明顯差異,但是會(huì)改變淀粉的結(jié)構(gòu)。
研究水稻淀粉的合成途徑可以為人們了解稻米營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的形成提供重要的理論依據(jù),同時(shí)對(duì)培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的水稻新品種具有實(shí)際指導(dǎo)作用。目前已通過(guò)一些方式(如GWAS 分析、EMS 誘變、生物信息學(xué)分析獲得同源基因)獲得了大量胚乳中參與淀粉合成的轉(zhuǎn)錄因子或者蛋白,且部分基因已被克隆,但是仍然存在著一定的問題:①部分基因是如何參與淀粉合成的機(jī)制尚不明確,這些轉(zhuǎn)錄因子或者蛋白間是否存在著聯(lián)系尚不清楚;②當(dāng)下對(duì)淀粉的研究大多是在基因或蛋白水平上,對(duì)于激素水平上的研究較少;③有研究表明不同的插秧密度對(duì)淀粉合成途徑中的相關(guān)酶活性存在一定影響[35],但其影響機(jī)制還不清晰,尚需進(jìn)一步深入研究。
伴隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展,預(yù)測(cè)未來(lái)水稻淀粉仍需系統(tǒng)深入研究的方向?yàn)椋孩偻ㄟ^(guò)施加外源激素進(jìn)行材料的處理來(lái)明確激素信號(hào)對(duì)淀粉形成的調(diào)控作用;②研究不同發(fā)育階段水稻淀粉的合成與代謝;③研究不同溫度、肥力水平以及插秧密度等環(huán)境因素和栽培技術(shù)對(duì)淀粉合成的影響,隨著管理水平以及機(jī)械化程度的提高,此項(xiàng)工作可能成為今后研究的重點(diǎn)。