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      CT影像組學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)節(jié)型肺腺癌侵襲性的研究進(jìn)展

      2022-12-06 22:16:45喻媛楊全
      關(guān)鍵詞:組學(xué)腺癌結(jié)節(jié)

      喻媛,楊全

      (重慶醫(yī)科大學(xué)附屬永川醫(yī)院放射科,重慶 402160)

      0 引言

      將肺結(jié)節(jié)在計(jì)算機(jī)斷層成像(Computed Tomography, CT)上的形態(tài)特征和定量特征等常規(guī)CT影像學(xué)表現(xiàn)與人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征相結(jié)合,無創(chuàng)性評(píng)估肺腺癌侵襲性是目前臨床常用的方法。CT影像學(xué)特征是微觀病理改變的宏觀反映形式,由于這些特征的識(shí)別受到成像設(shè)備、圖像質(zhì)量、觀察者經(jīng)驗(yàn)等因素的限制,因此這些特征只能在一定程度上評(píng)估肺腺癌侵襲性,存在局限性。影像組學(xué)(Radiomics)是近年來的研究熱點(diǎn),它通過對(duì)數(shù)字影像圖像進(jìn)行高通量計(jì)算可獲得大量客觀、定量的影像組學(xué)特征,為預(yù)測(cè)肺腺癌侵襲性提供更可靠、更有效的臨床指標(biāo)。這些特征都是肉眼無法識(shí)別的,能更全面、更準(zhǔn)確、更微觀的反映肺腺癌的病理改變。本文旨在簡(jiǎn)談?dòng)跋窠M學(xué)技術(shù)并綜述其在肺腺癌侵襲性研究中的進(jìn)展。

      1 肺腺癌發(fā)病現(xiàn)狀和病理基礎(chǔ)

      國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)在2020年對(duì)全球癌癥患病及癌癥致死情況的統(tǒng)計(jì)顯示,肺癌是全球第二大常見的癌癥(約占全球癌癥總?cè)藬?shù)的11.4%),且全球因癌癥死亡的患者中肺癌是最主要的原因(因肺癌死亡的人數(shù)約占全球因癌癥死亡人數(shù)的18%)[1,2]。同時(shí)肺癌一直是我國(guó)最常見、導(dǎo)致死亡人數(shù)最多的癌癥[3-5]。近年研究發(fā)現(xiàn),肺腺癌的發(fā)生率逐漸超過肺鱗癌,已成為肺癌最常見的組織學(xué)類型,近年來患肺腺癌的患者數(shù)量及因患肺癌導(dǎo)致死亡的患者數(shù)量呈逐漸上升的趨勢(shì)[6,7]。

      2015年,世界衛(wèi)生組織(World Health Organization, WHO)發(fā)布肺腫瘤分類方法,其中指出,根據(jù)是否有浸潤(rùn)性,將肺腺癌分為兩大類,即浸潤(rùn)性病變和浸潤(rùn)前病變,浸潤(rùn)性病變?yōu)榉蜗侔┌l(fā)展的后期改變,包括浸潤(rùn)性腺癌( Invasive Adenocarcinomas, IAC)和微浸潤(rùn)性腺癌(Minimally Invasive Adenocarcinoma, MIA)[8],浸潤(rùn)前病變?yōu)榉蜗侔┑脑缙诟淖?,包括原?癌( Aden-ocarcinoma in Situ,AIS)和 非 典 型腺瘤樣增生( Atypical Adenomatous Hyperplasia,AAH)。在2021年新的肺腫瘤分類中作出新的調(diào)整,將AIS歸為腺體前驅(qū)病變并代替原來的浸潤(rùn)前病變,即腺體前驅(qū)病變包括了AAH和AIS[9]。AAH和AIS預(yù)后良好,臨床可隨診觀察,而MIA和IAC則需手術(shù)切除,以往的多項(xiàng)研究顯示,MIA和AIS一樣,術(shù)后5年復(fù)發(fā)率均為0或幾近于0[10-12],有研究顯示術(shù)后10年復(fù)發(fā)率<5%[13],MIA和AIS被建議有限切除,且切除率在不斷降低[14]。而IAC術(shù)后5年生存率<90%[15],是預(yù)后最差的肺腺癌類型,IAC因其侵襲性又稱侵襲性腺癌。因此將IAC與其他類型肺腺癌區(qū)分開對(duì)于臨床決策和預(yù)后判斷具有重要意義。

      2 影像組學(xué)概念

      在過去的十多年時(shí)間里,模式識(shí)別工具不斷增多、數(shù)據(jù)規(guī)模也在不斷擴(kuò)大,使醫(yī)學(xué)圖像分析領(lǐng)域飛速發(fā)展,使得計(jì)算機(jī)通過對(duì)數(shù)字圖像進(jìn)行高通量計(jì)算提取大量的定量特征的發(fā)展,荷蘭科學(xué)家Lambin[16]在2012年首次提出影像組學(xué)的概念,從此影像組學(xué)被越來越多的人熟知。所謂影像組學(xué)就是計(jì)算機(jī)通過對(duì)醫(yī)學(xué)數(shù)字圖像進(jìn)行高通量計(jì)算,快速提取大量定量的特征,將醫(yī)學(xué)數(shù)字圖像轉(zhuǎn)換成為可供我們深入研究的高維數(shù)據(jù)的過程,在這個(gè)過程中提取的高維數(shù)據(jù)就稱為影像組學(xué)特征[17]。近年來大量研究將影像組學(xué)與機(jī)器學(xué)習(xí)算法相結(jié)合用于良惡性病變鑒別、腫瘤病理類型鑒別、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、基因表達(dá)、判斷治療效果及預(yù)測(cè)預(yù)后等多個(gè)方面,顯示了影像組學(xué)在臨床應(yīng)用巨大的價(jià)值和潛力。

      3 影像組學(xué)分析步驟

      3.1 圖像采集

      可用于提取影像組學(xué)特征的數(shù)字醫(yī)學(xué)圖像來源多樣,這些數(shù)字醫(yī)學(xué)圖像可以是CT、磁共振成 像(Magnetic Resonance Imaging, MRI)、超 聲成像(Ultrasonic Imaging,UI),和正電子發(fā)射斷層掃 描(Positron Emission Tomography-Computed Tomography, PET-CT)的數(shù)字圖像。由于醫(yī)學(xué)圖像是影像組學(xué)分析的基礎(chǔ),因此采用一致的參數(shù)采集醫(yī)學(xué)圖像對(duì)確保分析結(jié)果可信度是非常重要的。

      3.2 感興趣區(qū)標(biāo)注和圖像分割

      感興趣區(qū)(Region of Interest, ROI)是進(jìn)行影像組學(xué)分析選取的分析體素,它直接決定影像組學(xué)特征提取的偏差[18]。圖像分割方法包括自動(dòng)分割和手動(dòng)分割。自動(dòng)分割是利用算法訓(xùn)練計(jì)算機(jī)自動(dòng)分割ROI,這種方式雖然快速、高效,重復(fù)性好,但易受干擾,誤差較大,手動(dòng)分割能避免圖像偽影干擾,更準(zhǔn)確,但缺點(diǎn)也很明顯,工作量大,需要耗費(fèi)大量人力,耗時(shí)久,同時(shí)不同的勾畫者勾畫的ROI之間有異質(zhì)性。因此圖像分割是影像組學(xué)中最關(guān)鍵、最具挑戰(zhàn)性和最具爭(zhēng)議性的組成部分。Pavic等[19]基于三位專家描述的ROI研究了觀察者間變異性對(duì)手動(dòng)腫瘤描繪的影響,發(fā)現(xiàn)觀察者之間的描述差異對(duì)放射組學(xué)分析有相關(guān)影響,并受到腫瘤類型的強(qiáng)烈影響。目前應(yīng)用較多的方法是自動(dòng)和手動(dòng)分割相結(jié)合,且隨著自動(dòng)分割算法的不斷發(fā)展進(jìn)步[20,21],半自動(dòng)分割不僅大大提高手動(dòng)分割的效率,增加了可重復(fù)性,還顯著提高了自動(dòng)分割的準(zhǔn)確性,成為大樣本影像組學(xué)研究的首選分割方法。Parmar等[22]比較了5位專家通過半自動(dòng)分割獲得的ROI得到的放射性特征具有更高的重現(xiàn)性和魯棒性,類內(nèi)相關(guān)系數(shù)( Intraclass Correlation Coefficient, ICC)分別為0.77和0.85。

      3.3 特征提取和選擇

      影像組學(xué)特征的提取過程是非常繁雜的,網(wǎng)絡(luò)上有一些開源軟件包可用。放射組學(xué)特征可以從二維感興趣區(qū)或三維感興趣體積中提取。提取的影像組學(xué)特征可分為四類:統(tǒng)計(jì)類的數(shù)據(jù)(包括基于直方圖和基于紋理的數(shù)據(jù))、由不同模型產(chǎn)生的特征、由不同濾波器產(chǎn)生的特征和描述形態(tài)的特征[23]。通常,通過影像組學(xué)提取得到的高通量影像組學(xué)特征具有類型多樣、數(shù)量眾多的特點(diǎn),但部分特征之間具有相似性,且并不是所有特征都有助于臨床決策[24,25],且特征數(shù)量越大,建立的模型越容易出現(xiàn)過擬合的問題,因此篩選出有意義的特征是建立良好預(yù)測(cè)模型的必要條件。根據(jù)特征本身、特征與自變量的關(guān)系、特征與自變量的函數(shù)關(guān)系來選擇特征篩選的方法,主要包括方差閾值法、Pearson相關(guān)系數(shù)法、回歸和非回歸模型,此外,還可以選擇反復(fù)多次建立模型來篩選最優(yōu)特征的方式[26]。

      3.4 建立模型和預(yù)測(cè)

      篩選出有意義的特征后,就可以使用篩選的特征利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法建立模型進(jìn)行預(yù)測(cè),幫助臨床決策。值得注意的是,用于篩選的特征不僅僅可以是影像組學(xué)特征,還可以納入傳統(tǒng)的CT影像學(xué)特征、實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)和人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征等,有研究顯示,結(jié)合以上特征建立的模型比單獨(dú)的影像組學(xué)模型具有更好的預(yù)測(cè)效能[27-30]。模型的建立通常需要反復(fù)試驗(yàn)不同的算法,根據(jù)研究的特點(diǎn)、經(jīng)驗(yàn)等來選擇算法[31]。研究結(jié)果的可靠性是需要衡量的一個(gè)非常重要的指標(biāo),因此訓(xùn)練好的模型必須進(jìn)行內(nèi)部驗(yàn)證和獨(dú)立的外部驗(yàn)證,相對(duì)于內(nèi)部驗(yàn)證,獨(dú)立的外部驗(yàn)證與訓(xùn)練集無交叉,對(duì)模型產(chǎn)生沒有影響,認(rèn)為這樣的數(shù)據(jù)集才能夠真實(shí)的反映模型的預(yù)測(cè)效能。

      4 影像組學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)節(jié)型肺腺癌侵襲性

      磨玻璃結(jié)節(jié)(Ground Glass Nodules, GGN)通常是早期肺腺癌在胸部CT圖像上的表現(xiàn)[32,33]。隨著病情進(jìn)展,GGN內(nèi)可逐漸出現(xiàn)實(shí)性成分,根據(jù)實(shí)性成分的有無,GGN可分為純磨玻璃結(jié)節(jié)(pure Ground Glass Nodules, pGGN)和亞實(shí)性結(jié)節(jié)(Subsolid Nodules, SN)。即使是小于6mm且穩(wěn)定5年的磨玻璃結(jié)節(jié)也不應(yīng)被忽視,特別是在隨訪中新增固體成分時(shí)[34,35]。有研究顯示,表現(xiàn)為純磨玻璃結(jié)節(jié)與亞實(shí)性結(jié)節(jié)的肺腺癌在臨床和預(yù)后特征方面都不同[36,37]。目前研究的大部分是CT上表現(xiàn)為GGN(包括pGGN和SN)的肺腺癌的侵襲性。

      4.1 預(yù)測(cè)磨玻璃結(jié)節(jié)侵襲性

      影像組學(xué)評(píng)分模型對(duì)預(yù)測(cè)肺腺癌侵襲性具有良好效能,而且結(jié)合了臨床特征的聯(lián)合模型預(yù)測(cè)效能可得到有效提高。Hui Zheng等[38]納入312例表現(xiàn)為GGN的肺腺癌,采用邏輯(Logistic)回歸,分別建立臨床模型、影像組學(xué)評(píng)分模型,以及將前兩者結(jié)合起來的聯(lián)合模型(即臨床-影像組學(xué)評(píng)分模型),結(jié)果顯示,單一臨床或放射組學(xué)模型(訓(xùn)練集和測(cè)試集AUC值分別為0.86、0.80)均較臨床-影像組學(xué)聯(lián)合模型AUC值低,盡管前兩個(gè)模型在訓(xùn)練集和測(cè)試集上表現(xiàn)出的預(yù)測(cè)能力均良好。

      前期大部分研究主要集中在結(jié)節(jié)內(nèi)部特征,有學(xué)者發(fā)現(xiàn)結(jié)節(jié)周圍肺組織特征(腫瘤周圍微環(huán)境)在預(yù)測(cè)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)、腺癌與肉芽腫的鑒別等多方面具有重要作用[39,40]。Linyu W等[41]的感興趣區(qū)不僅為結(jié)節(jié)內(nèi),還包含了結(jié)節(jié)周圍的肺組織區(qū)域,該研究納入了121例經(jīng)病理確診的肺腺癌磨玻璃結(jié)節(jié),人工勾畫結(jié)節(jié)內(nèi)和結(jié)節(jié)周圍(指結(jié)節(jié)周圍2mm的擴(kuò)張區(qū)域)ROI,采用多變量邏輯(Logistic)回歸分析方法建立結(jié)節(jié)內(nèi)放射模型、結(jié)節(jié)周圍放射模型、結(jié)節(jié)總的放射組學(xué)模型和臨床-放射組學(xué)聯(lián)合模型,結(jié)果顯示結(jié)節(jié)總的放射組學(xué)模型和臨床-放射組學(xué)聯(lián)合模型預(yù)測(cè)效能優(yōu)于結(jié)節(jié)內(nèi)、結(jié)節(jié)周圍特征的模型。

      有研究將影像組學(xué)特征與深度學(xué)習(xí)(Deep Learning, DL)結(jié)合預(yù)測(cè)肺腺癌侵襲性,并取得良好結(jié)果。Xiang Wang等[42]的研究納入了經(jīng)病理確診的886個(gè)表現(xiàn)為GGN的肺腺癌,建立了三個(gè)深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),即XimaNet(基于深度學(xué)習(xí)的分類模型)、XimaSharp(分類和結(jié)節(jié)分割模型)和Deep-RadNet(深度學(xué)習(xí)和放射組學(xué)組合分類模型,即深度放射組學(xué))預(yù)測(cè)非侵襲性腺癌和侵襲性腺癌,三個(gè)模型的AUC分別為0.785、0.778和0.889,結(jié)果顯示深度放射組學(xué)模型能夠更準(zhǔn)確的評(píng)價(jià)GGN的侵襲性。Xianwu Xia等[43]將影像組學(xué)特征與DL結(jié)合預(yù)測(cè)肺腺癌侵襲性,并取得良好結(jié)果。該研究從兩個(gè)中心收集了373例經(jīng)手術(shù)病理證實(shí)的GGN,提出了一種基于U-Net的遞歸殘差卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)GGN進(jìn)行分割,然后通過支持向量機(jī)(SVM)分類器建立了兩種非IAC和IAC之間的分類方案,即放射組學(xué)方案和DL方案,為了提高分類性能,又采用信息融合的方法融合了這兩種方案的預(yù)測(cè)分?jǐn)?shù),并將融合的方法與兩位經(jīng)驗(yàn)豐富的放射科醫(yī)生的診斷性能相比較,結(jié)果顯示新的融合方案(AUC=0.90)的曲線下面積高于DL方案(AUC=0.83)、放射組學(xué)方案(AUC=0.87),且新的融合方案準(zhǔn)確性比兩名放射科醫(yī)生更高,為80.3%。新的融合模型整合了定量和深度特征,與單獨(dú)使用DL或放射組學(xué)特征構(gòu)建的模型相比,融合模型顯著提高了方案的預(yù)測(cè)性能,顯示DL對(duì)預(yù)測(cè)肺腺癌侵襲性是有價(jià)值的。

      諾莫圖(Nomogram)是一種可用于診斷或預(yù)測(cè)疾病發(fā)展或進(jìn)展的方法,通過聯(lián)合多種生物學(xué)指標(biāo)達(dá)到診斷或預(yù)測(cè)疾病的目的,在疾病診斷、鑒別診斷、病理分型、判斷預(yù)后等臨床實(shí)踐中應(yīng)用廣泛。Wei Zhao等[44]收集了626例CT上表現(xiàn)為≤10mm GGN且有病理確診的肺腺癌,基于多變量邏輯回歸模型,在訓(xùn)練集將影像組學(xué)特征和平均CT值等CT影像學(xué)特征聯(lián)合起來建立了諾莫圖模型,該諾莫圖模型在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集中均表現(xiàn)出良好的識(shí)別和校準(zhǔn)(訓(xùn)練集和驗(yàn)證集AUC分別為0.716和0.707)。該研究不僅顯示對(duì)于≤10mm的病灶影像組學(xué)仍有良好預(yù)測(cè)效能,還證實(shí)包含影像組學(xué)和CT定量特征的諾莫圖模型能良好、準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)肺腺癌侵襲性。

      4.2 預(yù)測(cè)純磨玻璃結(jié)節(jié)侵襲性

      Lan Song等[27]收集了187例表現(xiàn)為pGGN的肺腺癌,以8:2的比例,隨機(jī)化分為訓(xùn)練集和測(cè)試集,采用CT平掃圖像,提取高通量的計(jì)算得到定量的影像組學(xué)特征以及包括人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征、吸煙情況和反映腫瘤形態(tài)和周圍信息的常規(guī)CT特征的臨床特征,使用梯度增強(qiáng)回歸樹分類器建立臨床、放射組學(xué)和臨床放射組學(xué)模型,其中臨床放射組學(xué)模型預(yù)測(cè)效能最好,訓(xùn)練集和驗(yàn)證集AUC分別為0.934和0.929。YONG LI等[45]收集了147個(gè)病理證實(shí)的表現(xiàn)為pGGN的肺腺癌,病理類型包括AIS、MIA和IAC,采用常規(guī)的定量特征和形態(tài)特征、選擇低劑量胸部CT和標(biāo)準(zhǔn)劑量CT的放射組學(xué)特征、術(shù)中冷凍切片診斷,分別建立Logistic回歸模型,結(jié)果提示在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集中這些模型的AUC值之間沒有顯示出明顯的差異,基于低劑量胸部CT的定量-形態(tài)評(píng)分和放射組學(xué)特征具有良好的預(yù)測(cè)性能,可作為侵襲性生物標(biāo)志物,用于評(píng)估肺癌篩查中pGGN的侵襲性風(fēng)險(xiǎn)。

      4.3 預(yù)測(cè)亞實(shí)性結(jié)節(jié)侵襲性

      YunJu Wu等[46]收集了203例表現(xiàn)為亞實(shí)性結(jié)節(jié)的肺腺癌,使用開源軟件手動(dòng)進(jìn)行三維結(jié)節(jié)體積分割,采用常規(guī)CT特征、選定的放射組學(xué)特征和3位經(jīng)驗(yàn)豐富的放射科醫(yī)生建立診斷模型。在預(yù)測(cè)侵襲性肺腺癌方面,影像組學(xué)特征的診斷性能與定量CT特征(結(jié)節(jié)大小和實(shí)體成分,包括肺和縱隔窗)相似,CT影像組學(xué)特征的AUC值高于常規(guī)CT形態(tài)學(xué)特征和3位經(jīng)驗(yàn)豐富的放射科醫(yī)師。該研究簡(jiǎn)化了影像組學(xué)特征,用基于GLCM的特征(GLCM_Entropy_log10)的列線圖預(yù)侵襲性肺腺癌病變的性能仍高于3位放射科醫(yī)師。Feng B等[47]收集了100例病理確診為IAC或MIA的亞實(shí)性肺結(jié)節(jié),采用CT平掃的數(shù)字醫(yī)學(xué)圖像,提取高通量的影像組學(xué)特征,采用lasso算法降維,篩選出影像組學(xué)特征,再結(jié)合主觀的傳統(tǒng)CT影像特征利用logistic回歸建立諾莫圖,諾莫圖在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集中AUC分別為0.943和0.912,并在決策曲線中被確定為對(duì)臨床有用。

      5 總結(jié)與展望

      影像組學(xué)采用高通量算法可提取大量肉眼不可見的特征,較傳統(tǒng)CT影像學(xué)特征或有經(jīng)驗(yàn)的放射科醫(yī)生對(duì)侵襲性肺腺癌有更好的鑒別能力和更高的準(zhǔn)確率。將影像組學(xué)與深度學(xué)習(xí)結(jié)合能進(jìn)一步提高模型的效能。影像組學(xué)在臨床應(yīng)用中潛力巨大,但由于影像組學(xué)的掃描參數(shù)、特征提取算法、模型等多樣,影像組學(xué)結(jié)果對(duì)其異質(zhì)性較敏感,目前還沒有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),因此將其應(yīng)用于臨床實(shí)踐是巨大的挑戰(zhàn)和機(jī)遇,仍需要我們深入研究。

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