王 瑋 楊 倩 王 凱 鐘惠敏 潘凡凡 查兵兵
(復(fù)旦大學(xué)附屬上海市第五人民醫(yī)院內(nèi)分泌科,上海200240)
Graves?。℅raves'disease,GD)是甲狀腺功能亢進(jìn)癥的最常見類型,發(fā)病率為1.0%~1.5%,且逐年上升[1]。體液免疫與GD發(fā)病緊密相關(guān),促甲狀腺激素受體抗體(thyrotropin receptor antibody,TRAb)與甲狀腺上皮細(xì)胞表面的促甲狀腺激素受體(thyrotropin receptor,TSHR)結(jié)合,刺激甲狀腺上皮細(xì)胞過度增生,使甲狀腺激素分泌失控,導(dǎo)致疾病發(fā)生[2]。
B細(xì)胞是體液免疫重要的執(zhí)行者,與GD的發(fā)生、發(fā)展息息相關(guān)。B細(xì)胞不僅可以分化為漿細(xì)胞分泌致病性抗體TRAb,還能作為抗原提呈細(xì)胞將TSHR的抗原表位呈遞給T細(xì)胞。盡管B細(xì)胞在GD的發(fā)病機(jī)制中起著至關(guān)重要的作用,但GD中B細(xì)胞的基因表達(dá)譜尚不清楚,對(duì)其表達(dá)譜的研究有望為治療GD病提供新靶點(diǎn)。
miRNA是一種長(zhǎng)度為18~25個(gè)核苷酸的小分子非編碼RNA,能夠靶向識(shí)別mRNA的3'端非編碼區(qū)的特異性結(jié)合位點(diǎn),直接降解mRNA或抑制其翻譯,從而調(diào)節(jié)基因的表達(dá)[3]。miRNA在自身免疫性疾病中發(fā)揮重要作用,如自身免疫性甲狀腺疾?。╝utoimmune thyroid disease,AITD)、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡等[4-6]。多項(xiàng)數(shù)據(jù)表明GD中miRNA的表達(dá)異??赡軈⑴c疾病的發(fā)生發(fā)展[7-9]。LIU等[7]發(fā)現(xiàn)初發(fā)GD患者外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中miR-154、miR-376b和miR-431表達(dá)下調(diào)。YAMADA等[8]發(fā)現(xiàn)GD患者血清中miR-16、miR-22、miR-375和miR-451表達(dá)上調(diào)。QIN等[9]通過對(duì)GD患者和健康對(duì)照組的甲狀腺組織進(jìn)行微陣列分析,發(fā)現(xiàn)GD患者的甲狀腺組織中共有23種miRNA異常表達(dá),導(dǎo)致超過2 000種mRNAs表達(dá)失調(diào)。miRNA與GD的研究是目前的研究熱點(diǎn),但對(duì)miRNA與GD患者外周血B細(xì)胞的研究比較少見。
因此,本項(xiàng)研究采用微陣列技術(shù)比較初發(fā)GD患者和健康受試者外周血B細(xì)胞中miRNA和mRNA表達(dá)譜的差異,揭示其異常表達(dá)與GD之間的關(guān)系,并通過qRT-PCR和流式細(xì)胞術(shù)對(duì)mRNA和蛋白水平進(jìn)行驗(yàn)證。研究發(fā)現(xiàn)GD患者外周血B細(xì)胞中hsa-miR-146b-5p的下調(diào)可能是其發(fā)病的潛在機(jī)制,下調(diào)的hsa-miR-146b-5p可能通過上調(diào)CD79B促進(jìn)B細(xì)胞活化與增殖從而促進(jìn)GD的發(fā)生發(fā)展。
1.1 資料
1.1.1 一般資料41例初次發(fā)病且未經(jīng)治療的GD患者外周血取自2016年至2022年上海市第五人民醫(yī)院內(nèi)分泌科。GD患者入組標(biāo)準(zhǔn):①高代謝癥候群;②促甲狀腺激素(thyroid stimulating hor‐mone,TSH)水平降低,游離三碘甲狀腺原氨酸(free triiodothyronine,F(xiàn)T3)和游離甲狀腺素(free thyrox‐ine,F(xiàn)T4)水平正常/升高;③甲狀腺彌漫性腫大;④甲狀腺吸碘率升高。排除標(biāo)準(zhǔn):①近期接受免疫抑制劑或糖皮質(zhì)激素者;②應(yīng)激狀態(tài);③妊娠期或哺乳期婦女;④合并心腦血管疾病、肝腎功能衰竭者;⑤合并嚴(yán)重感染及其他自身免疫性疾病者。41例健康受試者外周血取自上海市第五人民醫(yī)院體檢中心2016年至2022年既往無甲狀腺疾病、年齡和性別相匹配的健康受試者。所有試驗(yàn)對(duì)象均自愿參加本研究并簽署知情同意書。本研究經(jīng)上海市第五人民醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),倫審批件號(hào):2017-
029。
1.1.2 試劑 甲狀腺功能和甲狀腺抗體試劑購自Roche Diagnostics公司;人淋巴細(xì)胞分離液Lympho‐prepTM購自Axis-Shield公司;Human BD Fc BlockTM購自BD Biosciences公司;流式抗體購自Biolegend公司;人B細(xì)胞分選試劑盒購自Miltenyi Biotec公司;RNAsimple總RNA提取 試劑盒、miRNA提取 試 劑盒、miRcute增強(qiáng)型miRNA cDNA試劑盒購自TIAN‐GEN公司;PrimeScriptTMRT reagent試劑盒、PCR試劑盒購自TaKaRa公司。
1.2 方法
1.2.1 甲狀腺功能和甲狀腺抗體檢測(cè) 所有試驗(yàn)對(duì)象檢測(cè)前禁食12 h,于第2天清晨6:00抽血送檢,無抗凝劑樣本采集后,靜置1 h離心、分離血清,檢測(cè)指標(biāo)包括FT3(參考范圍:3.10~6.80 pmol/L)、FT4(參考范圍:12.0~22.0 pmol/L)、TSH(參考范圍:0.27~4.20 mU/L)、抗甲狀腺過氧化物酶抗體(thyroid peroxidase antibody,TPOAb)(參考范圍:0~34.0 U/ml)、抗甲狀腺球蛋白抗體(thyroglobulin antibody,TGAb,參考范圍:0~115.0 U/ml)和TRAb(參考范圍:<1.75 U/L)。甲狀腺功能和甲狀腺抗體經(jīng)電化學(xué)發(fā)光免疫法測(cè)定。
1.2.2 PBMC分離 生理鹽水等體積稀釋人外周血,將稀釋后血緩慢滴入人淋巴細(xì)胞分離液Lym‐phoprepTM上層,根據(jù)密度梯度離心法提取PBMC。
1.2.3 流式細(xì)胞術(shù)法 向PBMC中加入Human BD Fc BlockTM,室溫孵育10 min,使其與細(xì)胞表面Fc受體結(jié)合,以阻斷流式抗體Fc段與細(xì)胞表面Fc受體的非特異性結(jié)合;加入anti-human CD19抗體或anti-human CD19抗 體 和anti-human CD79B抗體進(jìn)行表面染色,4℃避光孵育30 min,隨后加入適量PBS離心洗去除未與細(xì)胞結(jié)合的流式抗體,加入500 μl PBS重懸細(xì)胞。使用Beckman counter CyAn流式細(xì)胞儀分別檢測(cè)CD19+B細(xì)胞比例和CD19+B細(xì)胞表面CD79B細(xì)胞熒光強(qiáng)度。使用FlowJo V10軟件分析數(shù)據(jù)。
1.2.4 B細(xì)胞純化和RNA提取 向健康受試者和GD患者外周血的PBMC中加入PE-conjugated anti-CD19抗體和anti-PE微珠陽性分選得到CD19+B細(xì)胞,流式細(xì)胞術(shù)驗(yàn)證其純化效率>90%。使用RNA‐simple總RNA提取試劑盒提取獲得CD19+B細(xì)胞總RNA;使用miRNA提取試劑盒提取獲得CD19+B細(xì)胞miRNA。
1.2.5 差異表達(dá)miRNA與mRNA篩選 取健康受試者和GD患者外周血各3份,根據(jù)密度梯度離心法提取PBMC,隨后進(jìn)行B細(xì)胞純化和RNA提取。使用Affymetrix WT PLUS Reagent Kit對(duì)總RNA進(jìn)行擴(kuò)增、標(biāo)記和純化以獲得cRNA,GeneChip Kit對(duì)生物素標(biāo)記的cRNA進(jìn)行雜交和洗滌。使用Affymetrix GeneChip Scanner 3000對(duì)芯片結(jié)果進(jìn)行掃描,Com‐mand Console Software 3.1軟件讀取原始數(shù)據(jù)以及歸一化處理,所用算法為Gene level_SST_RMA,Transcriptome Analysis Console軟件對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行分析。以|log2(fold change)|≥2.0且P<0.05為條件篩選差異表達(dá)的miRNA和mRNA。
1.2.6 差異miRNA靶基因預(yù)測(cè) 利用TargetScan(http://www.targetscan.org/)、miRBase(http://www.mirbase.org/)等數(shù)據(jù)庫對(duì)差異miRNA的靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè)。
1.2.7 靶基因的選取、miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建以及靶基因蛋白互作分析 將1.2.6得到的差異miRNA靶基因與1.2.5得到的差異mRNA取交集,篩選出miRNA的靶基因。將靶基因與對(duì)應(yīng)的差異miRNA以及差異表達(dá)倍數(shù)等導(dǎo)入Cytoscape軟件中構(gòu)建miRNA-mRNA差異表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。通過geneMA‐NIA數(shù)據(jù)庫對(duì)靶基因進(jìn)行蛋白互作分析。
1.2.8 GO富集分析 采用R包c(diǎn)luster profiler對(duì)miRNA的靶基因交集進(jìn)行GO富集分析。
1.2.9 qRT-PCR使用PrimeScriptTMRT reagent試劑盒將總RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA;使用miRcute增強(qiáng)型miRNA cDNA試劑盒將miRNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。使用qRT-PCR試劑盒驗(yàn)證GD病患者外周血B細(xì)胞中差異表達(dá)的miRNA和mRNA。應(yīng)用ΔΔCt法處理數(shù)據(jù)。所有引物由上海生工生物有限公司合成和純化,引物序列見表1。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 所有數(shù)據(jù)采用SPSS22.0軟件和GraphPad Prism 8.0軟件分析,正態(tài)分布數(shù)據(jù)用±s表示,組間比較采用t檢驗(yàn),非正態(tài)分布數(shù)據(jù)用M(P25,P75)表示,組間比較采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn)。P<0.05時(shí)認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 GD患者和健康受試者臨床資料 本研究共納入GD患者和健康受試者各41例。GD患者中女性28例,男性13例,中位年齡36歲,臨床指標(biāo)檢測(cè)結(jié)果見表2。
表2 臨床資料Tab.2 Clinical features
2.2 GD患者外周血CD19+B細(xì)胞比例升高 與健康受試者相比,GD患者外周血中CD19+B細(xì)胞比例顯著升高(3.46%vs7.77%,P<0.000 1,圖1)。
圖1 GD患者PBMCs CD19+B細(xì)胞比例升高Fig.1 Percentages of CD19+B in PBMCs was increased in GD patients
2.3 GD患者外周血B細(xì)胞中miRNA和mRNA差異表達(dá)譜 為揭示GD中B細(xì)胞異常增加的機(jī)制,對(duì)3例GD患者和3例健康受試者外周血CD19+B細(xì)胞中差異表達(dá)的miRNA和mRNA進(jìn)行分析。以|log2(fold change)|≥2.0且P<0.05作為差異miRNA和mRNA的篩選標(biāo)準(zhǔn),共篩選出119個(gè)差異miRNA,其中73個(gè)在GD組上調(diào),46個(gè)在GD組下調(diào)(圖2A);共篩選出572個(gè)差異mRNAs,其中399個(gè)在GD組上調(diào),包括CD3D、CD5、CD2、CD79B、IL2RA等,173個(gè)在GD組下調(diào)(圖2B)。
圖2 GD患者和健康受試者外周血B細(xì)胞miRNA和mRNA差異表達(dá)譜Fig.2 Differential miRNA and mRNA expression profiles in B cells between healthy individuals and GD pa?tients
2.4 差異miRNA潛在靶基因預(yù)測(cè)及其功能富集分析 利用TargetScan等多個(gè)數(shù)據(jù)庫對(duì)119個(gè)差異miRNA進(jìn)行潛在靶基因預(yù)測(cè),并與2.3所述的差異mRNAs取交集,獲得152個(gè)靶基因。篩選獲得的靶基因包括CD79B、CD3D、CDR2以及IL2RA等。對(duì)靶基因進(jìn)行GO富集分析,結(jié)果顯示靶基因的生物學(xué)過程主要富集于免疫反應(yīng)及其調(diào)控中(圖3A),包括免疫應(yīng)答、細(xì)胞因子分泌以及粒細(xì)胞遷移等。進(jìn)一步對(duì)上調(diào)靶基因進(jìn)行GO富集分析,結(jié)果顯示上調(diào)靶基因的生物學(xué)過程主要富集于免疫系統(tǒng)的調(diào)控(圖3B),主要包括免疫系統(tǒng)調(diào)控、胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及免疫系統(tǒng)正向調(diào)控等。對(duì)富集最為集中的幾個(gè)生物學(xué)過程進(jìn)行回溯分析,發(fā)現(xiàn)這些生物學(xué)過程均與CD79B、IL2RA以及FOSB等基因緊密相關(guān)。
圖3 差異表達(dá)基因GO富集分析Fig.3 GO enrichment analysis of differentially expressed genes
2.5 GD患者外周血B細(xì)胞中差異表達(dá)mRNA驗(yàn)證及蛋白互作分析 對(duì)篩選得到的152個(gè)靶基因進(jìn)行B細(xì)胞增殖相關(guān)基因的篩選,結(jié)果顯示mRNA表達(dá)譜中CD79B水平顯著上調(diào)。同時(shí),將152個(gè)靶基因進(jìn)行蛋白互作分析,發(fā)現(xiàn)包括CD4、CD79B以及CD44等29個(gè)上調(diào)的靶基因出現(xiàn)于網(wǎng)絡(luò)核心位置中(圖4A)。因此推測(cè)CD79B可能是B細(xì)胞發(fā)揮功能的關(guān)鍵分子。通過qRT-PCR對(duì)7例GD患者和7例健康受試者外周血B細(xì)胞中CD79B mRNA進(jìn)行驗(yàn)證;通過流式細(xì)胞術(shù)對(duì)13例GD患者和13例健康受試者外周血CD19+B細(xì)胞中CD79B進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示與健康受試者相比,GD患者外周血CD19+B細(xì)胞中CD79B mRNA表達(dá)顯著上調(diào)(P<0.01,圖4B),且CD79B熒光強(qiáng)度顯著上調(diào)(P<0.01,圖4C)。對(duì)GD患者外周血CD19+B細(xì)胞中CD79B蛋白水平與其甲狀腺功能(FT3、FT4)和自身抗體(TPOAb、TGAb、TRAb)進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果顯示CD79B與FT3(r=0.51,P>0.05)、FT4(r=0.58,P>0.05)、TPOAb(r=0.38,P>0.05)、TGAb(r=0.11,P>0.05)和TRAb(r=?0.13,P>0.05)均無相關(guān)性。
圖4 qRT-PCR和FACS驗(yàn)證mRNAFig.4 mRNA was verified by qRT-PCR and FACS
2.6 GD患者外周血B細(xì)胞中差異表達(dá)miRNA驗(yàn)證 探究靶向CD79B的關(guān)鍵miRNA,對(duì)CD79B靶miRNA進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié) 果 顯 示:9個(gè)miRNAs可調(diào)控CD79B,分別為hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-650、hsamiR-6085、hsa-miR-4430、hsa-miR-146a-5p、hsa-miR-378i、hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-378a-3p和hsa-miR-31-5p(圖5A)。根據(jù)表達(dá)量高低對(duì)這9個(gè)miRNAs進(jìn)行排序,并選取表達(dá)量最高的4個(gè)miRNAs進(jìn)行驗(yàn)證,即hsa-miR-6085、hsa-miR-146a-5p、hsa-miR-146b-5p和hsa-miR-378a-3p(圖5B)。通過qRT-PCR對(duì)7例GD患者和7例健康受試者外周血B細(xì)胞中miRNAs進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示,與健康受試者相比,GD患者外周血CD19+B細(xì)胞中hsa-miR-146b-5p表達(dá)顯著下調(diào)(P<0.001,圖5C),而hsa-miR-6085、hsamiR-146a-5p和hsa-miR-378a-3p表達(dá)無明顯差異(P>0.05,圖5C)。對(duì)GD患者外周血CD19+B細(xì)胞中hsa-miR-146b-5p與其甲狀腺功能和自身抗體進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果顯示:hsa-miR-146b-5p與FT3(r=0.11,P>0.05)、FT4(r=0.25,P>0.05)、TPOAb(r=?0.39,P>0.05)、TGAb(r=?0.11,P>0.05)和TRAb(r=?0.14,P>0.05)均無相關(guān)性。利用Tar‐getScan數(shù)據(jù)庫對(duì)miRNA調(diào)控CD79B的靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)hsa-miR-146b-5p可靶向CD79B mRNA的3'端非編碼區(qū)211~217號(hào)位點(diǎn),即UCAAGAG與AGUUCUC互補(bǔ),提示CD79B是hsa-miR-146b-5p的潛在靶點(diǎn)(圖5D)。因此推測(cè)hsa-miR-146b-5p可能通過靶向CD79B調(diào)控B細(xì)胞的功能。
圖5 qRT-PCR驗(yàn)證miRNAFig.5 miRNA was verified by qRT-PCR
GD是體液免疫介導(dǎo)的AITD,伴隨B細(xì)胞的數(shù)量和功能異常[10]。本課題組既往研究發(fā)現(xiàn),與健康受試者相比,GD患者甲狀腺組織中CD20+B細(xì)胞浸潤(rùn)顯著升高[11]。本研究與健康受試者相比,初發(fā)GD患者外周血CD19+B細(xì)胞的比例顯著升高。早在20世紀(jì)80年代,MORI等[12]研究發(fā)現(xiàn)與健康受試者相比,GD患者外周血B細(xì)胞比例和計(jì)數(shù)均明顯提高;而經(jīng)藥物治療后甲狀腺功能正常的GD患者外周血B細(xì)胞的比例和計(jì)數(shù)無顯著差異。以上數(shù)據(jù)證實(shí)了GD中B細(xì)胞異?;钴S。雖然GD的研究越來越多,但導(dǎo)致B細(xì)胞異常的分子機(jī)制并未明確。
近年關(guān)于miRNA和GD的生物信息學(xué)研究越來越多,多數(shù)是對(duì)PBMC、T細(xì)胞、血清、血漿和甲狀腺組織的研究,很少對(duì)外周血純化的B細(xì)胞進(jìn)行研究[7-8,13-15]。本研究通過微陣列分析初發(fā)GD患者和健康受試者外周血B細(xì)胞中miRNA和mRNA的差異表達(dá)譜,鑒定出GD患者外周血B細(xì)胞中有119個(gè)差異表達(dá)的miRNAs和572個(gè)差異表達(dá)的mRNAs,發(fā)現(xiàn)hsa-miR-146b-5p可能通過靶向CD79B調(diào)控B細(xì)胞的功能進(jìn)而影響疾病進(jìn)展,hsa-miR-146b-5p和CD79B與初發(fā)GD的疾病狀態(tài)無相關(guān)性。
過去幾十年里,常規(guī)GD方案一直未變,且不能滿足臨床需求。近些年來,隨著科研工作者對(duì)GD的深入研究,使用針對(duì)B細(xì)胞的單克隆抗體治療GD已經(jīng)進(jìn)入臨床試驗(yàn)并取得了一定成果,如抗CD20單抗和抗CD40單抗[16-17]。這些臨床試驗(yàn)的開展表明針對(duì)B細(xì)胞的免疫療法是目前治療GD的熱點(diǎn)。CD79B(Igβ)是 一 種35~40 kD的 跨 膜 蛋 白,與CD79A(Igα)形成異二聚體,CD79A/CD79B(Igα/Igβ)異二聚體與膜表面免疫球蛋白相聯(lián),形成B細(xì)胞受體(B cell receptor,BCR)復(fù)合物[18]。BCR復(fù)合物識(shí)別特定抗原并傳遞第一信號(hào),參與B細(xì)胞活化,活化的B細(xì)胞在抗原的刺激下增殖,進(jìn)一步分化為漿細(xì)胞和記憶B細(xì)胞發(fā)揮體液免疫效應(yīng)[18-19]。因此推測(cè)CD79B的表達(dá)上調(diào)促進(jìn)B活化,最終促進(jìn)GD患者外周血B細(xì)胞異常增殖。利用CD79B靶向藥物治療彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤已進(jìn)入臨床試驗(yàn),2019年首款CD79B靶向抗體偶聯(lián)物Polatuzumab Vedotin治療彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤已在美國上市[20-21]。以上臨床進(jìn)展表明通過阻斷CD79B抑制B細(xì)胞功能從而治療疾病的前景光明。不久的將來,CD79B也可能成為治療GD的新靶點(diǎn)。
miR-146家族包括miR-146a和miR-146b,參與免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)和與自身免疫性疾病的發(fā)生[22]。有研究報(bào)道,miR-146在自身免疫性甲狀腺炎小鼠的甲狀腺和脾臟CD4+T細(xì)胞中上調(diào)表達(dá);miR-146a在GD眼病的血清中表達(dá)下調(diào);而在橋本甲狀腺炎的甲狀腺組織中表達(dá)上調(diào)[23-25]。通過對(duì)CD79B對(duì)應(yīng)miRNA的預(yù)測(cè)和驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)GD患者外周血B細(xì)胞中hsa-miR-146b-5p表 達(dá) 下 調(diào),CD79B是hsa-miR-146b-5p的潛在靶點(diǎn),兩者的靶向關(guān)系需要Lucifer‐ase進(jìn)一步驗(yàn)證。因此,本課題組推測(cè)hsa-miR-146b-5p的下調(diào)可能促進(jìn)CD79B水平上調(diào),引起B(yǎng)細(xì)胞活化,最終使GD外周血B細(xì)胞異常增殖。
綜上所述,本研究通過微陣列對(duì)GD患者外周血miRNA和mRNA異常表達(dá)譜分析和驗(yàn)證得出,hsa-miR-146b-5p和CD79B在GD患者外周血中異常表達(dá)。hsa-miR-146b-5p可能通過上調(diào)CD79B促進(jìn)GD外周血B細(xì)胞的活化,CD79B可能成為GD新的生物標(biāo)志物和治療的潛在靶點(diǎn)。但本研究也存在不足之處,后續(xù)需要通過luciferase確定hsa-miR-146b-5p是否直接調(diào)控CD79B。