• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探究滌痰湯治療冠心病的作用機(jī)制

      2023-04-25 12:34:16王朕劉光輝王洋
      中國(guó)醫(yī)藥科學(xué) 2023年7期
      關(guān)鍵詞:分子對(duì)接網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)作用機(jī)制

      王朕 劉光輝 王洋

      [關(guān)鍵詞]滌痰湯;網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué);冠心??;分子對(duì)接;作用機(jī)制

      冠心病(coronaryheartdisease,CHD)是一種缺血性心肌病,CHD可引起管腔狹窄或閉塞,導(dǎo)致心肌缺血、缺氧或壞死。CHD中醫(yī)又稱“胸痹心痛”,出自《靈樞·經(jīng)脈》,由多種原因引起瘀血、寒凝、痰濁、氣滯痹阻心脈。痰濁是氣機(jī)失調(diào)或血行不暢引發(fā)的病理產(chǎn)物,近現(xiàn)代醫(yī)家多從痰濁辨證治療胸痹心痛,楊關(guān)林教授團(tuán)隊(duì)研究結(jié)果表明,痰濁貫穿于胸痹心痛的整個(gè)病程[1]。滌痰湯出自明代董宿《奇效良方》卷一,具有補(bǔ)虛豁痰,清熱利氣之功,善于治療動(dòng)脈粥樣硬化痰濁瘀阻證?,F(xiàn)代研究證實(shí)滌痰湯治療CHD穩(wěn)定型心絞痛具有顯著臨床效果[2]。滌痰湯關(guān)于CHD的治療研究已經(jīng)進(jìn)入分子水平[3],但缺少基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析滌痰湯治療CHD作用機(jī)制的研究。本研究通過(guò)篩選交集靶點(diǎn),進(jìn)行富集分析、分子對(duì)接技術(shù),將前期預(yù)測(cè)靶點(diǎn)和活性成分進(jìn)行對(duì)接驗(yàn)證,探討滌痰湯治療CHD的生物分子作用機(jī)制,為今后學(xué)者使用該方治療CHD及相關(guān)疾病提供依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 滌痰湯藥物活性成分及其作用靶點(diǎn)的篩選

      通過(guò)檢索中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)[4]檢索滌痰湯9種中藥的化學(xué)活性成分,根據(jù)類藥性(DL)≥0.18,口服利用度(OB)≥30%篩選獲得中藥活性化合物。在Uniprot蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)將其轉(zhuǎn)化為基因靶點(diǎn)進(jìn)行規(guī)范。

      1.2 差異基因(DEGs)的篩選與處理

      從高通量基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)獲得編號(hào)GSE71226基因芯片的原始數(shù)據(jù)及對(duì)應(yīng)的GPL基因注釋文件,使用在線分析工具GEO2R篩選出CHD和正常人的差異基因。導(dǎo)入在線繪圖平臺(tái),以表達(dá)差異檢驗(yàn)P<0.05、表達(dá)倍數(shù)(FC)絕對(duì)值>2為條件,導(dǎo)出差異基因并繪制熱圖及火山圖。

      1.3 CAD相關(guān)靶點(diǎn)獲取及維恩圖的繪制

      以“coronaryheartdisease”為關(guān)鍵詞,在Drugbank、OMIM和GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)篩選取并集,獲得本研究使用CHD疾病靶點(diǎn)繪制維恩圖。

      1.4 滌痰湯成分-CHD靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)

      將1.3獲得疾病靶點(diǎn)與藥物靶點(diǎn)取交集,得到CHD-滌痰湯有效成分交集靶點(diǎn)。使用Cytoscape3.8.2軟件得到“中藥-活性成分-基因靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖。

      1.5 基因本體(geneontology,GO)功能富集分析

      使用metascape和David數(shù)據(jù)庫(kù),選擇物種信息為人,導(dǎo)出富集通路信息,進(jìn)行可視化富集分析。

      1.6 基因組百科全書(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)通路富集分析

      通過(guò)metascape和David數(shù)據(jù)庫(kù)交集靶點(diǎn)進(jìn)行富集分析。繪制氣泡圖發(fā)掘CHD治療中滌痰湯作用機(jī)制。

      1.7 滌痰湯處方組成-活性成分-CHD靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建

      將KEGG通路富集結(jié)果導(dǎo)入Cytoscape3.8.2軟件,獲得“活性成分-靶標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò)圖,根據(jù)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)判斷核心靶點(diǎn)前10位及發(fā)揮藥效的主要活性成分。

      1.8 分子對(duì)接驗(yàn)證

      以1.7所作圖中度值較大的有效成分和兩個(gè)網(wǎng)絡(luò)圖靶點(diǎn)度值排名前10位交集的關(guān)鍵靶點(diǎn)蛋白為研究對(duì)象進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。

      2 結(jié)果

      2.1 滌痰湯活性成分的篩選

      通過(guò)篩選共得到滌痰湯中有效活性化合物73個(gè),其中人參10個(gè)、甘草20個(gè)、橘紅5個(gè)、茯苓3個(gè)、膽星5個(gè)、竹茹6個(gè)、枳實(shí)12個(gè)、菖蒲4個(gè)、半夏8個(gè)。

      2.2 DEGs的篩選與處理

      GSE71226共含基因45119個(gè)。log2FC>0為上調(diào)基因,反之為下調(diào)基因,繪制火山圖,見(jiàn)圖1。以FC絕對(duì)值>2、P<0.05為條件篩選到正常組和CHD組差異基因3473個(gè),選擇幅度最大的前18位基因繪制聚類熱圖,見(jiàn)圖2。

      2.3 滌痰湯治療CHD的潛在作用靶點(diǎn)及文氏圖的繪制

      去重得到4511個(gè)CHD疾病基因,見(jiàn)圖3。把交集靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),限定物種為“人”,得到疾病藥物共有靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)圖,見(jiàn)圖4。節(jié)點(diǎn)度值通過(guò)文字大小節(jié)點(diǎn)面積來(lái)表示,度值越高的節(jié)點(diǎn)的面積越大,其中AKT1、RELA和HSP90AA1可能是滌痰湯治療CHD重要靶點(diǎn)。

      2.4 藥物-成分-靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)圖

      滌痰湯治療CHD的“中藥-活性成分-基因靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖,見(jiàn)圖5。網(wǎng)絡(luò)中所有成分均對(duì)應(yīng)2個(gè)以上靶點(diǎn),說(shuō)明滌痰湯發(fā)揮作用是“多成分、多靶點(diǎn)”共同的結(jié)果,符合我國(guó)中醫(yī)藥辨證、辨病、辨癥相結(jié)合治療疾病的特點(diǎn)。研究方劑滌痰湯的核心成分,按度值進(jìn)行排序,前3位為去山柰酚(度值=125)、β-谷甾醇(度值=95)、柚皮素(度值=93),見(jiàn)表1。

      2.5 GO富集分析

      得到GO-BP(生物過(guò)程)富集結(jié)果361條、GO-CC(細(xì)胞成分)富集結(jié)果44條、GO-MF(分子功能)富集結(jié)果66條。于BP、MF、CC中分別選出FDR值最小的10條通路,繪制富集條形圖,見(jiàn)圖6。

      2.6 KEGG富集分析

      得到KEGG富集結(jié)果163條。于BP、MF、CC中分別選出FDR值最小的15條通路。如圖可知,CHD疾病病機(jī)是多通路共同作用的結(jié)果,KEGG主要涉及脂質(zhì)與CHD、白介素17和TNF信號(hào)通路等,見(jiàn)圖7。

      2.7 滌痰湯處方組成-活性成分-CHD靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建

      分析KEGG結(jié)果,構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)。找出對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)和有效成分,根據(jù)度值、介度及緊密度大于閾值篩選。獲得關(guān)鍵靶點(diǎn)47個(gè),見(jiàn)表2。可視性優(yōu)化(圖8)。找出藥效作用的主要成分及核心靶點(diǎn)。結(jié)果顯示主要成分為豆甾醇、β-谷甾醇、柚皮素、山柰酚、谷甾醇和槲皮素等。核心靶點(diǎn)前10個(gè)為:RELA(16)、AKT1(15)、JUN(15)、CASP3(14)、MAPK1(12)、MAPK3(12)、HSP90AA1(12)、pTGS2(12)、pRKCA(11)、MAPK14(10)。與PPI網(wǎng)絡(luò)的前10個(gè)核心靶點(diǎn)對(duì)比,有6個(gè)共同靶點(diǎn)。此網(wǎng)絡(luò)體現(xiàn)了滌痰湯通過(guò)多靶點(diǎn)、多成分、多通路的方式干預(yù)CHD的特點(diǎn)。

      2.8 分子對(duì)接驗(yàn)證

      分子對(duì)接兩者之間有一定的結(jié)合活性,則結(jié)合能≤-4.25kcal/mol;若結(jié)合活性較好,則結(jié)合能≤-5.0kcal/mol;若兩者之間有強(qiáng)的結(jié)合活性,則結(jié)合能≤-7.0kcal/mol[5]。選取篩選得到的核心成分分別與關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證,計(jì)算其對(duì)接分?jǐn)?shù)(表3),由表可見(jiàn),其中100%的活性成分與其蛋白質(zhì)靶點(diǎn)之間有較好的結(jié)合活性,大部分有強(qiáng)的結(jié)合活性,而β-谷甾醇與MAPK3的對(duì)接分?jǐn)?shù)最高,為-10.2。

      3 討論

      3.1 CHD成因與滌痰湯治療CHD理論依據(jù)

      心血管疾病發(fā)病率逐年上升,截至2017年,我國(guó)心血管疾病患者數(shù)量高達(dá)2.9億人[6]。濁、毒、痰、瘀等邪氣通過(guò)血液的流通對(duì)脈道產(chǎn)生影響,脈道變厚,血流速度變緩,血管異常收縮,形成血栓或粥樣斑塊[7]。有學(xué)者治療胸痹心痛時(shí)多從調(diào)理水谷之海入手,運(yùn)用祛瘀、行氣、化痰、健脾等治法[8]。滌痰湯由二陳湯化裁而成,具有祛痰化瘀的功效,相關(guān)研究認(rèn)為,滌痰湯能緩解CHD(痰濁瘀阻證)患者臨床表現(xiàn),減少血液粥樣斑塊,使血液流變學(xué)指標(biāo)改善[9]。對(duì)治療不穩(wěn)定型心絞痛痰濁瘀阻型CHD,滌痰湯可在一定程度上提高臨床預(yù)后,緩解胸痛、胸悶、心悸等癥狀[10]。

      3.2 滌痰湯以“β-谷甾醇”等為主要活性成分治療CHD

      臨床中,滌痰湯常用于急性心梗和不穩(wěn)定型心絞痛痰濁瘀阻證等疾病,方中橘紅理氣寬中,半夏燥濕化痰。相關(guān)活性成分β-谷甾醇能發(fā)揮保護(hù)缺血再灌注損傷心肌的作用[11]。竹茹化痰止嘔,枳實(shí)破氣行痰,膽南星清熱化痰,主要成分柚皮苷通過(guò)調(diào)節(jié)絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號(hào)通路減少脂質(zhì)條紋增殖以及血管平滑肌細(xì)胞遷移[12]。炙甘草調(diào)和諸藥,槲皮素是人參、甘草、竹茹等中藥的主要成分之一,具有保護(hù)內(nèi)皮、擴(kuò)張血管、降脂等內(nèi)分泌調(diào)節(jié)的作用[13]。因此滌痰湯可能通過(guò)以上藥物活性成分,發(fā)揮調(diào)節(jié)膽固醇、保護(hù)心肌、降糖、調(diào)脂、抑制心肌細(xì)胞凋亡等作用。

      3.3 滌痰湯以“MAPK1”等核心靶基因治療CHD

      MAPK系列在CHD的發(fā)展、心肌細(xì)胞凋亡和增殖及血管內(nèi)皮細(xì)胞新生中具有重要的組織學(xué)作用。MAPK1和MAPK3是重要多通路功能蛋白,與心肌纖維化發(fā)生發(fā)展有密不可分的關(guān)系。RELA是NF-κB家族中最常見(jiàn)的成員,有研究表明,RELA(p65)可以通過(guò)調(diào)控人主動(dòng)脈平滑肌細(xì)胞生物學(xué)機(jī)制減緩CHD的病理進(jìn)展[14]。AKT信號(hào)通路在心血管系統(tǒng)中控制著多種細(xì)胞功能。通過(guò)Ap-1、c-JUN與Fank1、Jab1共同作用,上調(diào)下游基因Bcl-2的表達(dá),起到抑制細(xì)胞凋亡的作用[15]。以上靶點(diǎn)與緩解動(dòng)脈粥樣硬化和心肌細(xì)胞凋亡、保護(hù)動(dòng)脈重構(gòu)密不可分,提示滌痰湯可能通過(guò)增強(qiáng)或抑制相關(guān)靶點(diǎn)的表達(dá)來(lái)治療CHD。

      3.4 滌痰湯治療CHD各分類疾病涉及的生物學(xué)過(guò)程及信號(hào)通路

      WHO將CHD分為5大類,其中心力衰竭是由于心臟收縮或舒張功能障礙,心臟射血不能滿足機(jī)體的需要,TNF通路通過(guò)激活CASP3對(duì)凋亡因子起到抑制作用和抗凋亡因子的激活作用[16]。心肌梗死是冠狀動(dòng)脈急性、持續(xù)性缺血缺氧所引起的心肌壞死。PI3K-AKT通路通過(guò)調(diào)節(jié)NOS3的表達(dá),調(diào)控JNK和p38,上調(diào)Bcl-2和下調(diào)Bax的表達(dá),從而達(dá)到抗凋亡的目的。綜上,對(duì)于CHD多種分型,以上靶點(diǎn)與通路分別通過(guò)調(diào)節(jié)抗炎和抑制細(xì)胞凋亡、抗氧化因子等機(jī)制,發(fā)揮緩解和治療的作用。

      4 小結(jié)

      本研究證實(shí)了滌痰湯多靶點(diǎn)、多成分、多通路的中藥藥物作用機(jī)制。由于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接技術(shù)的局限性,后期可圍繞藥效學(xué)評(píng)價(jià)-物質(zhì)基礎(chǔ)代謝組學(xué)-通路驗(yàn)證等開(kāi)展實(shí)驗(yàn)研究,為滌痰湯治療CHD以及藥物開(kāi)發(fā)利用提供理論依據(jù)。

      猜你喜歡
      分子對(duì)接網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)作用機(jī)制
      基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析中藥臨床治療胸痹的作用機(jī)制
      從網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)角度研究白芍治療類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的作用
      基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的沙棘總黃酮治療心肌缺血的作用機(jī)制研究
      基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析丹參山楂組分配伍抗動(dòng)脈粥樣硬化的作用機(jī)制研究
      基于計(jì)算機(jī)輔助水解的中藥大豆寡肽的ETA拮抗活性預(yù)測(cè)
      靈芝三萜化合物的抗腫瘤靶點(diǎn)預(yù)測(cè)與活性驗(yàn)證
      計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)在分子對(duì)接中的應(yīng)用
      通過(guò)技術(shù)創(chuàng)新促進(jìn)我鎮(zhèn)農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整
      冠心丹參方及其有效成分治療冠心病的研究進(jìn)展
      大數(shù)據(jù)對(duì)高等教育發(fā)展的推動(dòng)研究
      人間(2016年26期)2016-11-03 17:51:57
      梅州市| 腾冲县| 凤山市| 枝江市| 双峰县| 微博| 松桃| 靖远县| 滦南县| 吉林市| 泾阳县| 南汇区| 澳门| 资溪县| 云林县| 库伦旗| 南安市| 朝阳县| 东兰县| 芜湖县| 株洲市| 张家界市| 体育| 富顺县| 正安县| 甘南县| 岐山县| 九江县| 陆丰市| 仪征市| 万源市| 福州市| 宜黄县| 巫山县| 鄱阳县| 濮阳县| 古蔺县| 肇州县| 东辽县| 赣榆县| 建湖县|