剪接體
- Sirtuins 基因家族及其剪接體在雌雄小鼠骨骼肌的時空表達譜研究
t1基因的不同剪接體對細胞衰老具有一定影響[7]。有研究結果顯示，Sirt1-FL 抑制H2O2誘導的氧化損傷，而Sirt1-ΔExon8 則可促進氧化應激損傷。Sirtuins基因家族對骨骼肌方面的研究主要集中于其在Sirt1/PGC-1α 和AMPK/SIRT/PGC1α 相關能量代謝通路中[8-9]及其在氧化應激中發(fā)揮的作用[10]。以往對骨骼肌的相關研究顯示，Sirt1 和Sirt2 分別起到誘導對氧化應激的抵抗和動員脂質儲存的作用[11-12]；
現(xiàn)代畜牧獸醫(yī) 2023年10期2023-11-06
- 基于次要剪接體snRNA研究中醫(yī)經(jīng)絡腎氣的特征性物質
需物質——次要剪接體snRNA”的視角研究經(jīng)絡，有突破性的新發(fā)現(xiàn)。筆者綜合中醫(yī)經(jīng)典《黃帝內經(jīng)》《難經(jīng)》和中醫(yī)針刺推測出，腎氣是一種“在人體數(shù)種細胞的某些基因的表達過程中不可缺少的、細胞外源性的”物質。筆者綜合現(xiàn)代生命科學研究次要剪接體snRNA 的參考文獻，創(chuàng)新思考其中的實驗異常發(fā)現(xiàn)和未解之謎，推測出健康體細胞中的次要剪接體snRNA 來自于胞外分泌囊泡。結合古中醫(yī)學和現(xiàn)代生命科學的研究，筆者推測出腎氣的特征性物質，在此特征性物質的基礎上簡明扼要地闡明經(jīng)絡
按摩與康復醫(yī)學 2023年11期2023-10-09
- 水稻多胚候選基因OsPE可變剪接體鑒定與分析
中存在3種可變剪接體,在秈稻中無可變剪接體。因此,通過分析水稻OsPE基因序列及其可變剪接體,有助于深入研究OsPE基因功能及其調控水稻多胚產(chǎn)生的分子機制——OsPE是否能真正控制水稻多胚的產(chǎn)生;或者,OsPE在水稻中存在可變剪接體,在其他剪接體的參與下,共同調控水稻多胚的產(chǎn)生;或者,OsPE另具功能。本研究以粳稻品種日本晴和秈稻品種巴斯馬蒂370為研究材料,根據(jù)生物信息學分析結果設計特異引物,通過RT-PCR及TA克隆技術對OsPE基因的可變剪接體進行鑒
華北農學報 2023年3期2023-07-08
- 獲“世界最具潛力女科學家獎”白蕊：我要攻克癌癥
師安排我們去做剪接體這樣一個世界級的難題。我當時心里是發(fā)怵的?！卑兹镎f。什么是剪接體？白蕊拿電影剪輯打了個比方：“我們的遺傳信息寫在 DNA（脫氧核糖核酸）里，但它只是遺傳信息儲存庫，并不能直接執(zhí)行這些功能，需要先形成 RNA（核糖核酸），再形成蛋白質，然后由蛋白質來完成生命活動。但我們的基因是片斷式的，不連續(xù)，就像電影素材一樣，是一段一段的，不是從頭拍到尾，需要一個剪輯師來完成片斷的重新拼接。執(zhí)行這個剪接功能的就叫剪接體。剪接體是由上百種蛋白組成的大分子
婦女·女人觀天下 2023年2期2023-05-30
- “90后”清華女博士白蕊：潛心研究，攻克世界級高端科技難題
整RNA循環(huán)的剪接體系列研究，已攻克多個世界級高端科技難題，為相關遺傳病和癌癥機理研究帶來新途徑。（圖1）1992年，白蕊出生在內蒙古一個普通家庭，少年時最愛看《少年兒童百科全書》等科普類書籍。上初中時，白蕊各科成績名列前茅。周末時光，懂得一張一弛的白蕊和其他的“90后”女孩一樣愛美食，愛追劇……興趣廣泛。白蕊勤奮好學，初中畢業(yè)后以優(yōu)異的成績考上了重點高中，通過一段時間對各科目的深入學習，覺得對生物特別感興趣，因為她很享受在課堂上和老師一起探討難題的過程，
青春期健康·青少版 2023年1期2023-02-07
- “90后”清華女博士白蕊：潛心 研究， 攻克世界級高端科技難題
整RNA循環(huán)的剪接體系列研究，已攻克多個世界級高端科技難題，為相關遺傳病和癌癥機理研究帶來新途徑。（圖1）圖1 白蕊勤奮好學，對生物特別感興趣1992年，白蕊出生在內蒙古一個普通家庭，少年時最愛看《少年兒童百科全書》等科普類書籍。上初中時，白蕊各科成績名列前茅。周末時光，懂得一張一弛的白蕊和其他的“90后”女孩一樣愛美食，愛追劇……興趣廣泛。白蕊勤奮好學，初中畢業(yè)后以優(yōu)異的成績考上了重點高中，通過一段時間對各科目的深入學習，覺得對生物特別感興趣，因為她很享
青春期健康 2023年2期2023-02-06
- 白蕊：“世界最具潛力女科學家”
師安排我們去做剪接體這樣一個世界級的難題。我當時心里是發(fā)怵的?！卑兹镎f。什么是剪接體？白蕊拿電影剪輯打了個比方：“我們的遺傳信息是寫在DNA（脫氧核糖核酸）里的，但它只是遺傳信息儲存庫，并不能直接執(zhí)行這些功能，需要先形成RNA（核糖核酸），再形成蛋白質，然后由蛋白質來完成生命活動。但我們的基因是片斷式的，不連續(xù)，就像拍電影的電影素材一樣，不是從頭拍到尾，一刀都不剪，需要一個剪輯師來完成片斷的重新拼接。執(zhí)行這個剪接功能的就叫剪接體?！卑兹镎f，剪接體是非常復雜
華聲 2022年12期2023-01-14
- 曾被清華拒收的“世界最具潛力女科學家”
師安排我們去做剪接體這樣一個世界級的難題。我當時心里是發(fā)怵的?！笔裁词?span id="j5i0abt0b" class="hl">剪接體？白蕊拿電影剪輯打了個比方：“我們的遺傳信息是寫在DNA（脫氧核糖核酸）里的，但它只是遺傳信息儲存庫，并不能直接執(zhí)行這些功能，需要先形成RNA（核糖核酸），再形成蛋白質，然后由蛋白質來完成生命活動。但我們的基因是片段式的，不連續(xù)，就像拍電影的電影素材一樣，不是從頭拍到尾，一刀都不剪，需要一個剪輯師來完成片段的重新拼接。執(zhí)行這個剪接功能的就叫剪接體?！卑兹镎f，剪接體是非常復雜的、由上
戀愛婚姻家庭·青春 2022年12期2023-01-05
- 曾被清華拒收的『世界最具潛力女科學家』
師安排我們去做剪接體這樣一個世界級的難題。我當時心里是發(fā)怵的?！笔裁词?span id="j5i0abt0b" class="hl">剪接體？白蕊拿電影剪輯打了個比方：“我們的遺傳信息是寫在DNA（脫氧核糖核酸）里的，但它只是遺傳信息儲存庫，并不能直接執(zhí)行這些功能，需要先形成RNA（核糖核酸），再形成蛋白質，然后由蛋白質來完成生命活動。但我們的基因是片段式的，不連續(xù)，就像拍電影的電影素材一樣，不是從頭拍到尾，一刀都不剪，需要一個剪輯師來完成片段的重新拼接。執(zhí)行這個剪接功能的就叫剪接體?！卑兹镎f，剪接體是非常復雜的、由上
戀愛婚姻家庭 2022年35期2023-01-02
- “我要攻克癌癥”
師安排我們去做剪接體這樣一個世界級的難題。我當時心里是發(fā)怵的。”白蕊說。什么是剪接體？白蕊拿電影剪輯打了個比方：“我們的遺傳信息寫在DNA（脫氧核糖核酸）里，但它只是遺傳信息儲存庫，并不能直接執(zhí)行這些功能，需要先形成RNA（核糖核酸），再形成蛋白質，然后由蛋白質來完成生命活動。但我們的基因是片斷式的，不連續(xù)，就像電影素材一樣，是一段一段的，不是從頭拍到尾，需要一個剪輯師來完成片斷的重新拼接。執(zhí)行這個剪接功能的就叫剪接體。剪接體是由上百種蛋白組成的大分子機器
環(huán)球人物 2022年23期2022-12-11
- 骨髓增生異常綜合征中U2AF1突變的研究進展
合物等[2]。剪接體基因是MDS患者常見的突變靶點之一，這些突變在50%～60%的MDS患者中發(fā)生，常見的突變基因有U2AF1、SF3B1、SRSF2和ZRSR2等[2]。剪接機制被認為是產(chǎn)生成熟mRNA分子的必要條件，現(xiàn)也被廣泛理解為一種共轉錄和轉錄后機制，除了能改變基因產(chǎn)物功能外，對基因的表達和調節(jié)也至關重要[3]。U2AF1突變即為剪接體突變中的一種，約11%的MDS病例中發(fā)現(xiàn)有U2AF1突變，且U2AF1突變常與預后不良相關[4,5]。近年來有研究
醫(yī)學研究雜志 2022年5期2022-11-26
- 家蠶絲腺中Abd-A 3 種剪接體的克隆、序列分析及原核表達
中發(fā)現(xiàn)存在7種剪接體，參與果蠅第2至第8腹節(jié)的形成，主要調控前后體節(jié)軸分化、生殖腺和脂肪體發(fā)育及中腸的形成等生理過程[14‐17]。Abd-A 還參與調控鱗翅目、半翅目等昆蟲中色素沉著模式的形成[18‐19]。家蠶轉錄因子Abd-A 至少有3 種剪接體，能夠影響家蠶胚胎早期發(fā)育，參與調節(jié)第3 至第6腹節(jié)的發(fā)育和腹足的形成[20]，還參與調控變態(tài)發(fā)育期間翅形成相關成蟲盤的分化和發(fā)育[21]。已有研究表明，參與調控絲蛋白基因表達的轉錄因子多屬于HOX 和FOX
河南農業(yè)科學 2022年4期2022-07-06
- 生菜LsPHYB可變剪接體的克隆與高溫誘導表達模式
溫祥珍生菜可變剪接體的克隆與高溫誘導表達模式隋心意，趙小剛，陳鵬宇，李亞靈，溫祥珍山西農業(yè)大學園藝學院，山西晉中 030801【】光敏色素B（phytochrome，PHYB）是光和溫度的受體。通過克隆光敏色素B基因（）可變剪接體并分析其在高溫誘導下的表達模式，探究可變剪接體在生菜響應環(huán)境高溫中的生物學功能，為培育耐熱性生菜提供理論依據(jù)。采用生物信息學方法在生菜的基因組數(shù)據(jù)庫搜索獲得的cDNA序列的相關信息；對克隆得到的3個可變剪接體、和進行多序列比對、可
中國農業(yè)科學 2022年9期2022-05-17
- 人SNRPN基因在果蠅S2細胞中的功能研究*
核生物中RNA剪接體可以去除絕大多數(shù)前體mRNA內含子,并調控mRNA加工過程[1-2]。RNA剪接體參與多種疾病的發(fā)生,對細胞存活發(fā)揮至關重要的作用[3-5]。精子發(fā)生過程在果蠅和人類中高度保守[6-8],可以利用果蠅模型研究男性不育癥。本實驗擬采用UAS-Gal4系統(tǒng)構建人—果蠅模型,在果蠅S2細胞中實現(xiàn)人SNRPN(small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N)基因過表達,觀察人SNRPN基因對果蠅S2細
交通醫(yī)學 2021年5期2021-11-27
- 乳腺癌中長鏈非編碼RNA H19可變剪接體的鑒定
mRNA的可變剪接體，這些剪接體稱為剪接異構體[3-4]?？勺兗艚硬坏l(fā)生在編碼基因上，也發(fā)生在非編碼基因上。長鏈非編碼基因的可變剪接是長鏈非編碼基因進行調控的重要手段，長鏈非編碼基因的異?？勺兗艚訒е露喾N疾病的發(fā)生，特別是癌癥[5]。乳腺癌是女性中發(fā)病率最高的癌癥，是女性的“第一殺手”，嚴重威脅著女性的身體健康。盡管近年來乳腺癌的死亡率出現(xiàn)下降趨勢，但對乳腺癌的治療仍然面臨著巨大的挑戰(zhàn)。本研究利用幾株常用的乳腺癌細胞系細胞，對乳腺癌中長鏈非編碼RNA
麗水學院學報 2021年5期2021-10-31
- 水稻OsHSP40基因可變剪接體鑒定及表達分析
定其存在的可變剪接體，為后續(xù)深入研究該基因在水稻生長發(fā)育和逆境適應過程中的生物學功能奠定基礎。1 材料和方法1.1 材料與試劑試驗用的植株材料為粳稻中花11(ZH11)由江西省分子生物學與基因工程重點實驗室提供。超薄DNA產(chǎn)物純化試劑盒和DNA割膠回收試劑盒(TIANGEN)、金牌Mix(TSINGKE)、TransTaq HiFi DNA聚合酶(TRAN)。1.2 試驗菌株及載體大腸埃希菌DH5α(上海唯地生物技術有限公司)、PMD18-T(TaKaRa
華北農學報 2021年3期2021-07-01
- RNA剪接“分子時鐘”精確原子模型
子Spp2催化剪接體激活過程中結構重塑的分子機理》的論文，2020年11月27日在《科學》雜志以長文形式發(fā)表。此文報道了釀酒酵母處于激活狀態(tài)的剪接體2.5埃的高分辨率電鏡結構，該結構是目前報道的最高分辨率的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態(tài)轉變過程中的“動力驅動”蛋白——ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化其重塑的結構基礎，為理解剪接體激活重塑的分子機理提供了迄今最清晰的結構信息。相關研究顯示，人類超過95%的基因都會發(fā)生RNA剪接，任何異常
中國科學探險 2021年2期2021-06-01
- 人SMAD4全長及剪接體在HEK-293T細胞中的亞細胞定位及轉錄活性分析
能的蛋白質差異剪接體。SMAD4全長蛋白質共包含11個外顯子,本文中研究的6種剪接體在3號外顯子至7號外顯子區(qū)段內發(fā)生了不同程度的外顯子缺失,分別為 SMAD4△3、SMAD4△4、SMAD4△6、SMAD4△5-6、SMAD4△4-6 和 SMAD4△4-7[12],這6種剪接體與全長外顯子的組成情況如圖1所示。越來越多的研究表明,許多腫瘤的發(fā)生與發(fā)展同一些轉錄因子的異常剪接體存在與否密切相關[13～15]。因此,在那些未發(fā)現(xiàn)SMAD4基因突變或表達異常
生命科學研究 2021年2期2021-06-01
- 白蕊：要做就做世界級難題
棘手的難題——剪接體的三維結構與RNA（核糖核酸）剪接的分子機理。該項研究被認為是當今世界富有挑戰(zhàn)性且亟待解決的課題之一。施一公實驗室率先解析了八種主要剪接狀態(tài)中的一種，但八種狀態(tài)之間差距甚大，想要逐個攻克絕非易事。面對空前的壓力，白蕊說：“要做就做世界級難題！”通過反復研究，她發(fā)現(xiàn)在細胞內改造某些RNA剪接過程中的關鍵蛋白，使得剪接體在細胞內被阻隔在某些特定狀態(tài)，可以突破剪接體領域的瓶頸。由于這方面幾乎沒有相關文獻和專著可以參考，她只能一邊摸索，一邊前進
文萃報·周二版 2020年46期2020-12-23
- 獺兔 MITF不同可變剪接體對黑色素沉積的影響
ITF不同可變剪接體對黑色素沉積的影響如何？目前尚未見相關報道。此外，有研究表明MITF可直接調控毛色相關基因的轉錄，包括TYR、TYRP-1和TYRP-2(DCT)等酪氨酸家族[8]。MITF可調控與黑素小體成熟及運輸密切相關的基因表達，包括GPNMB、PMEL-17等[9-10]。其中，GPNMB作為細胞粘附分子、黑素體蛋白、細胞表面受體和可溶性配體發(fā)揮重要作用[11]。PMEL-17基因的正常表達是淀粉樣纖維形成的關鍵，其表達受MITF基因的調控[1
西北農業(yè)學報 2020年11期2020-12-04
- 白蕊：要做就做世界級難題
棘手的難題——剪接體的三維結構與RNA（核糖核酸）剪接的分子機理。研究表明，30%的人類遺傳紊亂和多種癌癥均與某些基因的錯誤剪接、剪接體蛋白組分的突變、剪接體的錯誤調控有關?？捎捎?span id="j5i0abt0b" class="hl">剪接體的高度動態(tài)性，RNA剪接的清晰結構和復雜機理遲遲沒有被攻克，以至于該項研究成為當今世界富有挑戰(zhàn)性且亟待解決的課題之一。施一公實驗室率先解析了八種主要剪接狀態(tài)中的一種，但八種狀態(tài)之間差距甚大，想要逐個攻克絕非易事。更緊迫的是，國內外一共有四個課題組在爭分奪秒地研究這個課題，容
知識窗 2020年11期2020-11-30
- 肝細胞癌模型小鼠中外泌體來源RNA剪接基因的功能及差異表達分析
和剪接RNA。剪接體的磷酸化可能通過調節(jié)RNA剪接參與HCC（hepatocellular carcinoma，HCC）的轉移［7］。RNA聚合酶相關蛋白則能參與mRNA前體的選擇性剪接并誘導人肝癌細胞凋亡［8］?？梢奟NA剪接與癌癥息息相關。為探究這一問題，本研究以PM作為對照，通過構建肝癌模型小鼠，分別提取PM、PTM和TM三組樣本中的總RNA進行RNA測序（RNA-seq）和生物信息學分析，并構建外泌體來源RNA剪接基因作為比對數(shù)據(jù)庫與測序數(shù)據(jù)比對，
贛南醫(yī)學院學報 2020年9期2020-11-14
- 雞BRD2基因及其剪接體的克隆測序與亞細胞定位分析
D2）基因及其剪接體，并對其進行序列分析和亞細胞定位，為深入研究雞BRD2基因及其剪接體在細胞轉錄調控中的作用機理打下基礎。【方法】通過RT-PCR擴增雞BRD2基因及其剪接體的編碼區(qū)（CDS）序列，采用BioEdit、ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、CDART等在線軟件進行生物信息學分析;雞BRD2基因及其剪接體經(jīng)Xho I和BamH I雙酶切后，分別亞克隆至真核表達載體pEGFP-C1多克隆位點上構建重組真核表達載體，通過轉染H
南方農業(yè)學報 2020年8期2020-11-02
- 白蕊：“清華人，要做就做世界級難題”
達出來，這時候剪接體就會去剪斷它們，再對那些可以表達出來的信息進行拼接，這個過程被稱為RNA剪接。據(jù)了解，人類35%的人類遺傳紊亂跟RNA剪接的異常和剪接體蛋白的突變有直接關系。剪接體催化過程中結構的嚴重缺失使剪接體成為了亟待解決的課題之一。而由于剪接體高度的動態(tài)性，獲得不同狀態(tài)的剪接體的高分辨率三維結構被公認為世界級難題。2015年進入清華大學后，白蕊師從施一公教授進行這方面的研究。全球研究剪接體的頂級實驗室有3-4個，大家在同一條跑道上比拼，只要稍有松
作文與考試·高中版 2020年21期2020-08-14
- “世界最具潛力女科學家獎”得主白蕊：堅持所愛，攻克難題
，從此踏上研究剪接體結構與機理的征途。對于剪接體以及RNA剪接通路上各復合物結構的研究是當今世界最富有挑戰(zhàn)性、最亟待解決的課題之一，白蕊憑借自己扎實的基礎知識以及不懈的努力迎難而上，與團隊做出了剪接體完成第一次剪接的循環(huán)模型，并以第一作者的身份將其發(fā)表在《科學》雜志上。審稿人將該結構評價為“史上最重要、最振奮人心的剪接體結構之一”。1993年諾貝爾生理醫(yī)學獎得主Philip Sharp也激動地說，以為自己有生之年看不到這樣的結構。人物素描1 堅持內心所愛，
意林·作文素材 2020年10期2020-06-03
- 選擇性剪接與細胞凋亡
用的剪接因子或剪接體其他成分的突變引起人類多種疾病，進一步凸顯了AS 的生物學重要性[5]。本綜述介紹AS 生理學基礎及調控機制，同時還探討了AS 事件與凋亡的關系。1 AS 的生物學基礎真核生物基因序列中含有多個外顯子及內含子，然而成熟的mRNA 只含有外顯子序列信息，這種將前體mRNA 剪接加工去除內含子形成成熟mRNA 的現(xiàn)象稱為選擇性剪接（alternative splicing，AS）。剪接位點選擇的改變直接影響遺傳序列，導致蛋白質一級結構序列改
世界最新醫(yī)學信息文摘 2020年36期2020-05-25
- 家蠶miR-2769靶基因的鑒定及表達分析
75C3個可變剪接體，且其編碼蛋白同樣具有相同的C末端和不同的N末端(Segraves and Hogness, 1990)。對BmE75A,BmE75B和BmE75C在家蠶BmN細胞、前胸腺和脂肪體中的表達研究結果也表明，BmE75A,BmE75B和BmE75C具有不同的組織和時期特異性，而且三者的表達與20E的滴度密切相關(Lietal., 2015)。 近年研究表明，E75基因可參與不同昆蟲幼蟲到蛹的變態(tài)發(fā)育過程(Guoetal., 2016; Li
昆蟲學報 2020年3期2020-05-22
- 看！學術大牛施一公身旁的年輕人
的課題之一——剪接體發(fā)起進攻。施一公安排她承擔酵母剪接體課題組的剪接體提純工作。她要打響的是解析酵母剪接體的第一戰(zhàn)：為解析結構提供優(yōu)質的剪接體樣品。這是非常基礎又至關重要的工作，當時實驗室在這方面還沒有豐富的經(jīng)驗，一切都需要萬蕊雪自己找到突破點。萬蕊雪很忐忑，她鉚足了勁，讀了很多文獻，想了一個又一個大膽的實驗方向，然后一一排除。最后，她決定提取內源剪接體。這個方法不算新，但清華實驗室當時沒有人做過。萬蕊雪四處打聽，得知位于昌平的北京生命科學研究所的一個實驗
現(xiàn)代家長 2020年2期2020-03-24
- RNA剪接"分子時鐘"精確原子模型
Spp2 催化剪接體激活過程中結構重塑的分子機理》的論文，11 月27 日在《科學》雜志以長文形式發(fā)表。此文報道了釀酒酵母處于激活狀態(tài)的剪接體2.5 埃的高分辨率電鏡結構，該結構是目前報道的最高分辨率的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態(tài)轉變過程中的“動力驅動”蛋白——ATP 水解酶/解旋酶Prp2 及其激活因子Spp2 催化其重塑的結構基礎，為理解剪接體激活重塑的分子機理提供了迄今最清晰的結構信息。相關研究顯示，人類超過95%的基因都會發(fā)生RNA 剪接，任何
儀器儀表用戶 2020年12期2020-02-18
- 雞G蛋白α亞基基因可變剪接體的克隆和組織表達
4等4 種轉錄剪接體，但尚無這方面的實例報道。我們前期通過聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性（polymerase chain reaction of restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP）和DNA測序發(fā)現(xiàn)，雞GNAS 基因的突變與雞膚色性狀顯著相關[9]，但該基因的轉錄狀態(tài)并不明確；因此，本研究旨在進一步通過5′和3′cDNA 末端快速擴增（rapid-amplification cDNA
浙江大學學報（農業(yè)與生命科學版） 2019年5期2019-12-04
- 大豆抗SC3候選基因的克隆及分析
和IN3不同的剪接體, 所有的剪接體都能夠響應病毒的誘導增加表達量, 且在抗病品種中的表達量高于感病品種, IN1和IN2的表達量隨時間的變化較為明顯, IN3的表達量則相對穩(wěn)定, 說明這些剪接體可能參與大豆對SMV的抗病過程。本研究為后續(xù)基因功能的研究奠定了基礎。大豆花葉病毒; 抗病基因; 誘導表達; 可變剪接大豆花葉病毒病是由大豆花葉病毒(SMV)引發(fā)的一種大豆病害, 在我國主要大豆產(chǎn)區(qū)都有分布, 給我國大豆的產(chǎn)量和品質帶來嚴重影響[1]。目前大豆花葉
作物學報 2019年12期2019-11-13
- 哪有什么學霸，一切都是厚積薄發(fā)
最難的課題之一剪接體“發(fā)起進攻”。在施教授的安排下，她承擔起酵母剪接體課題組的剪接體提純的工作。簡單來說，她要打響的是解析酵母剪接體的第一站：為解析結構提供優(yōu)質的剪接體樣品。盡管萬蕊雪很忐忑，但她那股不服輸?shù)膫€性讓她再一次鉚足了勁兒。她閱讀了很多文獻，想了很多大膽的實驗方向，然后一個一個地排除，最后決定提取內源剪接體。這個方法不算新，但她們實驗室當時沒有人做過。于是她多方打聽，最后找到了北京生命科學研究所的一個實驗室在給內源蛋白加標簽方面有很多經(jīng)驗，她便去
故事家·花開不敗 2019年2期2019-09-10
- 水稻OsHDT703基因的可變剪接體分析
，設計各種可變剪接體的特異引物，通過RT-PCR對不同剪接體進行擴增，經(jīng)TA克隆后進行測序分析，以確定OsHDT703真實存在的可變剪切體，為后續(xù)深入研究該基因在水稻生長發(fā)育、生理代謝、生物和非生物脅迫等過程中可能具有的生物學功能奠定基礎。1 材料和方法1.1 植物材料試驗材料為粳稻中花11(ZH11)的葉片和幼穗。1.2 質粒和菌株用于TA克隆的pMD18-T(TaKaRa)載體，大腸桿菌菌株DH5α。1.3 試驗方法1.3.1 總RNA提取以及cDNA
華北農學報 2019年4期2019-09-02
- CG5844基因沉默、過表達果蠅S2胚胎細胞中的剪接體組分表達觀察
—剪切體完成，剪接體組分(U2A)可編碼U2小核糖核蛋白顆粒(snRNP)的組成蛋白，它作為一種主要的剪接體亞基，與前體mRNA上的其他snRNP結合以組裝剪接體。目前有研究顯示，果蠅睪丸生殖細胞中U2A的缺乏將導致精原細胞無法分化為精母細胞和成熟的精子，最終影響雄性果蠅的生育能力[3]。目前關于CG5844基因在果蠅S2胚胎細胞中的功能及作用機制尚未被闡明。2017年12月～2018年12月，我們觀察了沉默、過表達CG5844基因的果蠅S2胚胎細胞中的U
山東醫(yī)藥 2019年18期2019-07-10
- 破解“桌子”密碼
曉，萬蕊雪因在剪接體三維結構及RNA剪接方面的研究成果，成為細胞及分子生物學類別的勝出者。2013年，23歲的萬蕊雪正在中山大學海洋科學學院讀大四，按照學制，本科畢業(yè)后，她可以直接讀博士。但是，萬蕊雪選定了自己的研究方向——生物大分子結構，清華大學施一公實驗室成了她的最佳選擇。兩次發(fā)郵件爭取，萬蕊雪接到了施一公親自打來的電話：“歡迎到我的實驗室做畢業(yè)設計，清華見！”剛到清華大學，萬蕊雪有點兒適應不了，做實驗就和吃飯、睡覺一樣，成為生活的日常。好強的萬蕊雪開
知識窗 2019年5期2019-06-03
- 綿羊IGF- I基因II類變異剪接體生物信息學及組織表達分析
晰，產(chǎn)生的變異剪接體類型有待進一步揭示。IGF-I基因在不同物種間高度保守，本研究基于已發(fā)表的綿羊IGF-I基因I類變異剪接體類型[13]，以東北細毛羊為實驗材料，探討IGF-I基因II類變異剪接體的生物學特性及組織表達規(guī)律，為揭示IGF- I基因不同變異剪接體的生物學功能奠定基礎。1 材料與方法1.1 實驗動物 實驗動物選擇來自東北農業(yè)大學綿羊新品種繁育基地的30日齡和36月齡東北細毛羊公羊各3只，屠宰后立即取心臟、肝臟、肌肉、脾臟、肺臟、腎臟、腸、胃、
中國畜牧雜志 2019年1期2019-01-23
- 奶牛CD4基因選擇性剪接的鑒定
檢測到的選擇性剪接體。因此，本試驗利用反轉錄PCR (reverse transcription-PCR, RT-PCR)和測序，檢測奶牛CD4基因外顯子8處的剪接體，為研究奶牛CD4基因的結構和功能提供相應基礎。1 材料與方法1.1 試驗材料采集1頭成年荷斯坦奶牛3 mL尾靜脈血，立即加入9 mL RNAfixer保護劑(北京百泰克生物技術有限公司)充分混合，靜置10 min后于-70 ℃保存。用RNA提取試劑盒(QIAGEN凱杰生物技術有限公司)提取血
安徽科技學院學報 2018年3期2018-09-18
- 玉米蛋白磷酸酶2C基因ZmPP2C26兩個可變剪接體的功能分析
轉錄產(chǎn)物的可變剪接體。根據(jù)其推導蛋白與擬南芥和水稻PP2C家族成員的同源性和進化樹分析，這一基因在近期的研究中被重新命名為ZmPP2C26[10]。越來越多的證據(jù)表明，50%以上的植物基因均存在可變剪接現(xiàn)象，通過增加轉錄組和蛋白質組的多樣性，應答發(fā)育過程和環(huán)境脅迫[13-23]。例如，小麥DREB2基因[18]、擬南芥SR和SOS4基因[19-20]、水稻OslM和OsMAPK5基因[21-22]的可變剪接都被證明與非生物逆境脅迫應答有關。在耐旱性極強的復
西北農林科技大學學報（自然科學版） 2018年7期2018-07-25
- 乳腺癌中c-MYC調節(jié)的剪接基因鑒定及其臨床意義分析△
表達異常影響了剪接體的正常功能，與腫瘤的進展和轉移有關[1]。MYC癌蛋白是大多數(shù)人類腫瘤的主要驅動因子，MYC可以結合到基因組中的活性調控元件上，廣泛擴大基因表達，導致細胞不受限制地生長[2]。MYC開啟一組與剪接體組成元件相關的基因表達，剪接相關基因對MYC驅動腫瘤形成起到至關重要的作用[3-4]。本研究通過分析乳腺癌多組學數(shù)據(jù)，鑒定MYC調控的剪接基因，并評價其潛在的預后價值，為深入研究MYC在乳腺癌中的作用機制，鑒定潛在的乳腺癌治療靶點提供理論依據(jù)
癌癥進展 2018年5期2018-06-13
- 金發(fā)草LEA3基因2個剪接體轉化煙草的抗干旱脅迫能力分析
3基因存在2個剪接體(PpLEA3.a和PpLEA3.b)，與PpLEA3.a相比，PpLEA3.b保留了以疏水性為主的第2個內含子，該內含子的存在改變了LEA蛋白的親水性，進而可能影響蛋白質的功能，鑒于這2個剪接體在氨基酸序列和預測的空間結構上都有較大的差異，筆者先前研究已經(jīng)通過釀酒酵母表達系統(tǒng)鑒定了這些差異在細胞內產(chǎn)生的耐受性的差異，發(fā)現(xiàn)2個剪接體在不同非生物脅迫下抗逆能力存在差異，尤其在模擬干旱條件下，剪接體重組菌的生存能力大幅提高，且PpLEA3.
西南農業(yè)學報 2018年5期2018-06-05
- 拿下科研奧斯卡 清華學霸減肥也不含糊
后萬蕊雪因其在剪接體三維結構及RNA剪接方面的研究成果，當選為細胞及分子生物學類別的勝出者。萬蕊雪的獲獎短文“A key component of gene expression， revealed-High resolution microscopy sheds light on the molecular mechanisms of the spliceosome”也于11月23日同步在線發(fā)表在《科學》雜志上。萬蕊雪是近兩年來清華大學非常耀眼的學術新星
科學大觀園 2018年24期2018-05-30
- 骨髓增生異常綜合征剪接體突變的研究進展
增生異常綜合征剪接體突變的研究進展黃林娜 劉鵬琴 綜述 代國知 審校研究發(fā)現(xiàn)剪接體突變在骨髓增生異常綜合征（myelodysplastic syndrome，MDS）疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用，其突變基因包括SF3B1、U2AF1（U2AF35）、SRSF2、ZRSR2、PRPF40B、SF1、SF3A1和U2AF2等，突變基因（45%～85%）發(fā)生在mRNA剪接過程中的3'剪接位點，主要表現(xiàn)為雜合性錯義突變。了解RNA剪接對MDS的靶向治療及預后具有指
中國腫瘤臨床 2017年19期2017-11-14
- 馬身豬ZNF280D基因新型剪接體的鑒定及生物信息學分析
80D基因新型剪接體的鑒定及生物信息學分析靳玉舒，李萌，張旗，高鵬飛，李步高，郭曉紅*(山西農業(yè)大學 動物科技學院，山西 太谷 030801)[目的]本試驗旨在探究馬身豬中鋅指蛋白(zinc finger protein)ZNF280D基因的剪接體類型。[方法]在豬轉錄組測序對ZNF280D基因剪切位置預測的基礎上，采用RT-PCR和克隆測序技術對預測的剪切位點進行驗證，檢測該基因不同剪接體的結構并進行生物信息學分析。[結果]共檢測到2個剪接體，分別是ZN
山西農業(yè)大學學報（自然科學版） 2017年10期2017-10-10
- 樹鼩中APP基因特征描述及可變剪接體的分型鑒定
特征描述及可變剪接體的分型鑒定罕園園，孫曉梅，匡德宣，陸彩霞，陳玲霞，仝品芬，王文廣，李娜，代解杰*(中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院醫(yī)學生物學研究所樹鼩種質資源中心，云南省重大傳染病疫苗研發(fā)重點實驗室，中國醫(yī)學科學院醫(yī)學生物學研究所實驗樹鼩標準化與應用研究省創(chuàng)新團隊，昆明 650118)目的 區(qū)分并鑒定樹鼩中APP基因mRNA的多種可變剪接體，對APP基因特征進行描述，并確定其在各組織中的表達分布。方法 參考已知人的和樹鼩基因組預測的APP基因序列，設計樹鼩
中國實驗動物學報 2017年2期2017-05-18
- 骨架蛋白ENH在心血管系統(tǒng)中作用的研究進展
在多種mRNA剪接體，不同的剪接體具有不同的組織表達方式和功能。ENH在心血管系統(tǒng)中發(fā)揮骨架蛋白的結構功能，在心臟發(fā)育和維持心臟Z線結構穩(wěn)定中有重要作用。ENH還能與不同的蛋白激酶結合，作為信號分子的錨定蛋白，調控信號轉導，調節(jié)心肌細胞的生長、血管平滑肌細胞的增殖與遷移。心血管系統(tǒng)；ENH；骨架蛋白；錨定蛋白心肌細胞與骨骼肌細胞是具有收縮功能的高度分化的肌細胞。肌小節(jié)是肌細胞結構與功能的最小單元。連接兩個相鄰肌小節(jié)的重要結構是Z線，由輔肌動蛋白α-Acti
國際心血管病雜志 2016年6期2017-01-10
- 人CAP1蛋白與PIF1解螺旋酶及其剪接體蛋白的相互作用
1解螺旋酶及其剪接體蛋白的相互作用張 瑩1,3，劉 旭2,3，王 彬2,3，潘秀頡3，楊陟華3，周平坤3，朱茂祥3，顧永清1,3(1. 石河子大學醫(yī)學院，新疆石河子 832003；2. 石河子大學生命科學學院，新疆石河子 832003；3. 軍事醫(yī)學科學院放射與輻射醫(yī)學研究所，北京 100850)目的 在細胞水平及體外驗證腺苷酸環(huán)化酶相關蛋白1(CAP1)蛋白與PIF1解螺旋酶及其剪接體是否存在相互作用。方法 采用激光共聚焦免疫熒光實驗，通過細胞內蛋白共定
西安交通大學學報（醫(yī)學版） 2016年6期2016-12-08
- 質膜鈣ATP酶異構體1～4的剪接體在新生大鼠前庭器官的表達△
異構體1～4的剪接體在新生大鼠前庭器官的表達△羅蜜1,2褚漢啟1陶雁玲1周良強1陳金1劉云1潘春晨1陳請國1目的研究質膜鈣ATP酶異構體(plasma membrane Ca2+-ATPase isoforms，PMCAs)1～4(PMCA1～4)的A端和C端剪接變異體在新生大鼠前庭器官的表達。方法取出生2天的健康SD大鼠10只, 斷頭后分離出前庭器官(橢圓囊斑和球囊斑)，提取總RNA，通過逆轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)方法，檢測PMCA1～4的A端和
聽力學及言語疾病雜志 2016年5期2016-10-19
- 清華大學破解剪接體精細三維結構并揭示其工作機理
率高達3.6的剪接體三維結構，第一次在近原子分辨率上看到了剪接體的細節(jié)——剪接體的外形輪廓十分不對稱，各個蛋白相互纏繞，形成了分子量和體積巨大的復合物，并闡述了剪接體的基本工作機理，破解了結構生物學的一個重大難題。據(jù)介紹，剪接體由RNA和蛋白分子組成，是真核生物基因表達過程中的關鍵物質之一。上述成果是自1993年RNA剪接發(fā)現(xiàn)以來，中國科學家率先對剪接體近原子分辨率結構進行解析，不僅初步解答了基礎生命科學領域長期以來備受關注的核心問題，且對人類進一步揭示與
生物學教學 2016年2期2016-04-10
- 喝咖啡可防癌癥復發(fā)
鏡）解析的酵母剪接體近原子分辨率的三維結構，并在此結構基礎上進行詳細分析，闡述了剪接體對前體信使RNA執(zhí)行剪接的基本工作機理。這是科學家首次捕獲到真核細胞剪接體復合物的高分辨率空間三維結構，并闡述相關工作機理。在所有真核細胞中，基因表達分為三步進行，分別由RNA聚合酶、剪接體和核糖體執(zhí)行。其中，剪接體的作用是針對由多個內含子和外顯子間隔形成的前體信使RNA，通過去除內含子、連接外顯子，使前體信使RNA轉變?yōu)槌墒斓男攀筊NA。“這就好比用石頭建一所房子，前體
大眾科學 2015年9期2015-09-21
- 生命奧秘，我們解開關鍵一環(huán)
來充滿神秘感的剪接體的三維結構終被揭示。這幾天，生命科學領域的學者都在熱議中國的一項重大成果。因為這項成果不僅標志著人類對生命過程和本質的理解又向前邁進了關鍵一步，也標志著困擾國際生命科學界二十幾年的分子生物學“中心法則”中的一個關鍵步驟、一直以來充滿神秘感的剪接體的三維結構終被揭示。這項成果來自清華大學生命科學學院施一公教授的團隊。8月21日，施一公團隊在《科學》（Science）同時在線發(fā)表了兩篇研究長文，《3.6埃的酵母剪接體結構》和《前體信使RNA
人民周刊 2015年9期2015-09-15
- 施一公：不為獲獎做科研
清華大學召開“剪接體的三維結構和RNA剪接的分子結構基礎”重大成果發(fā)布會?！斑@項研究成果的意義，很可能超過了我過去25年科研生涯中所有研究成果的總和?！闭劦饺〉贸晒年P鍵因素時，施一公說：“創(chuàng)造性的思維、團隊和無法形容的勤奮。”“諾獎”級成果探秘8月21日，施一公團隊在世界頂級期刊《科學》（Science）以及期刊在線同時發(fā)表了兩篇研究長文，《3.6埃的酵母剪接體結構》和《前體信使RNA剪接的結構基礎》。這兩篇關于“剪接體”的文章，被譽為是生命科學領域里程
民生周刊 2015年17期2015-09-10
- 酵母剪接體高分辨率三維結構的解析
本刊記者)酵母剪接體高分辨率三維結構的解析段艷芳(本刊記者)2015年8月21日，清華大學生命科學學院施一公教授帶領的研究團隊在美國《科學》雜志上同時發(fā)表了兩篇論文——《3.6 ?的酵母剪接體結構》(Structure of a yeast spliceosome at 3.6-Angstrom resolution)和《前體信使RNA剪接的結構基礎》(Structural basis of pre-mRNA splicing)，介紹了通過單顆粒冷凍電子顯
自然雜志 2015年6期2015-05-12
- 牙髓干細胞向成牙本質細胞誘導分化過程中Oct4可變剪接體表達改變的研究
中Oct4可變剪接體表達改變的研究賀 瑩，關麗娜，孫雪飛，韓 冰，張亞慶，楊 帆（軍事口腔醫(yī)學國家重點實驗室，陜西省口腔醫(yī)學重點實驗室，第四軍醫(yī)大學口腔醫(yī)院牙體牙髓病科，陜西西安710032）目的：研究多能性轉錄因子Oct4可變剪接體在人牙髓干細胞（hDPSCs）向成牙本質細胞定向分化過程中的表達改變。方法：礦化液誘導hDPSCs向成牙本質細胞分化，RT－PCR檢測未經(jīng)分化誘導、分化誘導7、14 d時Oct4可變剪接體（Oct4A，Oct4B）以及干性分子
牙體牙髓牙周病學雜志 2015年5期2015-04-20
- 不同毛色山羊皮膚組織Agouti基因剪接體類型研究
gouti基因剪接體類型研究張 天1，2，3，李祥龍1，2*，周榮艷2，李蘭會2(1.河北科技師范學院，秦皇島066600； 2.河北農業(yè)大學，保定 071000； 3.晉州市職教中心，晉州 052260)本研究旨在探討白色和黑色山羊皮膚組織Agouti基因所具有的不同剪接體類型。采用PCR擴增和5′RACE方法分別獲得白色和黑色山羊皮膚組織Agouti基因部分基因組序列及mRNA 序列，并進行拼接比對。結果，分別獲得了長度為27 793和27 858 b
畜牧獸醫(yī)學報 2015年11期2015-03-22
- PRMT2及其剪接體在乳腺癌MCF-7細胞中的亞細胞定位及意義
PRMT2及其剪接體在乳腺癌MCF-7細胞中的亞細胞定位及意義陳亞軍1，2，3，鐘 警1，楊 靖1，文格波1摘要目的 構建蛋白質精氨酸甲基轉移酶2（PRMT2）及其差異剪接體與綠色熒光蛋白（GFP）的真核表達載體，轉染后觀察其融合蛋白在乳腺癌MCF-7細胞中的表達及亞細胞定位，為進一步研究PRMT2基因及其新的差異剪接體在乳腺癌中的作用奠定基礎。方法 以pGEM-T-PRMT2／α／β／γ載體為模板，設計引物，PCR擴增目的基因，并將PCR產(chǎn)物克隆至pcD
安徽醫(yī)科大學學報 2015年4期2015-03-03
- 分析PRMT2及其剪接體在乳腺癌中的表達及臨床價值
PRMT2及其剪接體在乳腺癌中的表達及臨床價值王妮妮綜述，文芳，曹仁賢審校 （南華大學附屬第一醫(yī)院，湖南衡陽421001）乳腺腫瘤；雌激素受體α；蛋白精氨酸N-甲基轉移酶；細胞增殖；綜述乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤，也是導致女性死亡的主要原因之一，基因、激素、年齡和環(huán)境都是乳腺癌發(fā)病的相關風險因素[1]。乳腺癌現(xiàn)已發(fā)展成為女性發(fā)病率最高的惡性腫瘤，在西方8例女性中就有1例為乳腺癌患者，在我國患乳腺癌的人數(shù)呈逐年上升趨勢，其發(fā)病率與年齡存在著明顯關系。其年齡
現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生 2015年3期2015-02-23
- RBPMS不同剪接體的真核表達和亞細胞定位
EGF）的2種剪接體促轉移VEGF（165）a和抗轉移VEGF（165）b的相對變化水平，使得細胞侵襲性增加[8]。此外，SRSF1可參與cas?pase-9的選擇性剪接過程，及其在非小細胞肺癌中增強化療敏感性的作用[9]。綜上，目前報道的含RRM的RBP在調控機體功能方面的研究具有重要意義，且具有深入闡明其功能的必要性。具有多種剪接形式的RNA結合蛋白（RBP with multiple splicing，RBPMS，又名 Hermes）基因是1996年
生物技術通訊 2013年1期2013-10-29
- 人胰腺癌編碼SUFU蛋白的新剪接體
UFU蛋白的新剪接體徐清 滿曉華 高軍 李兆申 龔燕芳 吳紅玉 金晶目的分析人胰腺癌組織和細胞中Hedgehog信號通路主要成員SUFU蛋白的剪接體。方法用反轉錄和3′cDNA末端快速擴增(3′RACE)法擴增suppresser of fused(SUFU)片段，測序發(fā)現(xiàn)一個新的外顯子，應用RT-PCR方法擴增全長含新外顯子的SUFU(nSUFU)。采用脂質體法將nSUFU及SUFU轉染SW1990細胞，應用蛋白質印跡法檢測SW1990細胞及胰腺癌組織新
中華胰腺病雜志 2013年4期2013-10-19
- 釀酒酵母與擬南芥Ｐｒｅ－ｍＲＮＡ剪接位點的比較
：RNA剪接；剪接體；剪接因子；跨物種表達；剪接位點釀酒酵母細胞繁殖快，操作簡便，屬于真核模式生物。將植物的基因放入酵母中表達，在于能用酵母細胞大量表達植物蛋白。在2002年有一篇論文關于植物mRNA前體在裂殖酵母中的剪接和1983年的跨物種基因表達的研究。[1]RNA剪接(RNA splicing)是tRNA、rRNA，特別是mRNA加工與成熟的重要生物學過程，也是蛋白質分子多樣性產(chǎn)生的關鍵機制之一，在基因表達調控中扮演著重要的角色[2]。RNA剪接需要
科技經(jīng)濟市場 2009年5期2009-07-31