□張幼芳
(浙江警察學(xué)院,浙江 杭州 310053)
浙江畬族人群16個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性調(diào)查
□張幼芳
(浙江警察學(xué)院,浙江 杭州 310053)
調(diào)查浙江畬族Y-STR基因座多態(tài)性,為群體遺傳學(xué)和法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別積累基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。用The AmpF1STR Y filer試劑盒調(diào)查106名無(wú)血緣關(guān)系浙江畬族男性,檢出106種單倍型,各基因座的基因多樣性GD值最小為0.3680,最大為0.9464,累計(jì)GD值達(dá)0.99999998,說(shuō)明所調(diào)查Y-STR基因座在浙江畬族男性個(gè)體中有較好的多態(tài)性,適合法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別。
Y-STR;遺傳多態(tài)性;單倍型;浙江畬族人群
Y染色體短串聯(lián)重復(fù)序列(Y-STR)是Y染色體特有的遺傳標(biāo)記,應(yīng)用于法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和父系親緣關(guān)系鑒定,在偵查排摸案犯工作中起到獨(dú)特的作用。本文對(duì)浙江畬族男性群體Y染色體16個(gè)STR基因座的等位基因頻率和單倍型頻率進(jìn)行了調(diào)查,為法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和群體遺傳學(xué)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
1.1 樣本
隨機(jī)采集106份浙江麗水地區(qū)無(wú)血緣關(guān)系的畬族男性個(gè)體靜脈血,EDTA抗凝,-20℃保存。
1.2 方法
常規(guī) Chelex 100法提取 DNA,使用 The AmpF1STR Y filer試劑盒(美國(guó)ABI公司)擴(kuò)增模板DNA,10ul反應(yīng)體系,試劑各成分比例和擴(kuò)增條件按試劑盒標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行,設(shè)007陽(yáng)性對(duì)照和9947A陰性對(duì)照。擴(kuò)增產(chǎn)物在3100-A型遺傳分析儀上電泳,GeneMapper ID v3.2軟件基因分型,記錄樣本各等位基因和單倍型。
2.1 等位基因及頻率
用直接法計(jì)算各等位基因頻率,結(jié)果見(jiàn)表1。
本調(diào)查中檢出個(gè)別基因座上等位基因超出了標(biāo)準(zhǔn)等位基因階梯范圍,如YGATAH4基因座檢見(jiàn)14;同時(shí)發(fā)現(xiàn)有些基因座未觀察到相應(yīng)的等位基因,如DYS391、DYS392、DYS438等,與王永在等[1]報(bào)道一致,說(shuō)明Y-STR基因座等位基因分布具有一定地域和種族差異。因此,有必要建立本地區(qū)本民族的等位基因頻率分布數(shù)據(jù)。
2.2 數(shù)據(jù)分析
各基因座的基因多樣性(Gene Diversity,GD)值按統(tǒng)計(jì)學(xué)公式GD=n(1-)/(n-1)[2]計(jì)算,n為檢測(cè)的樣本數(shù),Pi為第i個(gè)等位基因的頻率,結(jié)果見(jiàn)表1,其中DYS391基因座的GD值最小,為0.3680,DYS385基因座的GD值最大,為0.9464,累計(jì)GD值達(dá)0.99999998。16個(gè)基因座在106個(gè)樣本中共檢出106種不同的單倍型,說(shuō)明所調(diào)查Y-STR基因座在浙江畬族男性個(gè)體中有較好的多態(tài)性,適合法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和家族排查。
表1 浙江畬族男性16個(gè)Y-STR基因座頻率分布(n=106)
[1]王永在,王勇,黃太宇,等.內(nèi)蒙古漢族人群17個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J].中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志,2009,(2):117-118.
[2]Roewer L,Arnemann J,Spurr NK,et al.Simple repeatsequences on the human Y chromosome are equallypolymorphic as their autosomal counterparts[J].HumGenet,1992,89(4):389-394.
D919.2
A
1674-3040(2010)06-0051-02
2010-11-05
張幼芳,浙江警察學(xué)院刑事科學(xué)技術(shù)系教授。
(責(zé)任編輯:莊 稼)