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      散發(fā)性阿爾茨海默病早老素2基因的新突變

      2011-05-25 01:44:08白云峰田菊權(quán)文香前田潔
      關(guān)鍵詞:外顯子基因突變遺傳

      白云峰,田菊,權(quán)文香,,前田潔

      (1.解放軍第302醫(yī)院中西醫(yī)結(jié)合肝病診療與研究中心一科,北京 100039;2.北京大學(xué)第六醫(yī)院生化室,北京 100191; 3.日本神戶(hù)大學(xué)醫(yī)學(xué)系研究科精神神經(jīng)科,日本 神戶(hù) 6500017)

      阿爾茨海默?。ˋlzheimer’sdisease,AD)是一種漸進(jìn)性神經(jīng)變性疾病,分為家族性AD(FAD)和散發(fā)性AD(SAD)兩種類(lèi)型,其中SAD占多數(shù)。在歐洲SAD的比例為50%~75%,在日本SAD占80%~90%。目前為止有3種AD的致病基因:β淀粉樣蛋白前體(APP)、早老素 1(presenilin-1,PSEN1)和早老素 2(PSEN2)。FAD 大多與 PSEN1、APP 基因突變有關(guān),極少數(shù)與PSEN2基因突變有關(guān)。迄今為止,世界范圍內(nèi)共發(fā)現(xiàn)與FAD相關(guān)的PSEN1基因突變有164個(gè),與SAD相關(guān)的PSEN1基因突變有3個(gè)。與PSEN1基因同源性的PSEN2基因中也有11種基因突變的報(bào)道,10種基因突變與FAD相關(guān),1種基因突變與SAD相關(guān)。ApoE是SAD和晚發(fā)性FAD的易感基因,ApoE等位基因ε4是SAD的主要遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子[1],然而攜帶APOEε4的SAD患者并不一定發(fā)病,所以可能還存在其他遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子。我們?yōu)榱诉M(jìn)一步探討SAD與PSEN2基因突變的相關(guān)性,進(jìn)行了日本人群中PSEN2基因的序列測(cè)序。

      1 材料與方法

      1.1 材料來(lái)源

      300例患者來(lái)自日本神戶(hù)大學(xué)附屬醫(yī)院精神神經(jīng)科門(mén)診。其中男120例,女180例,年齡56~92歲,平均(72.57±7.56)歲。入組患者均進(jìn)行常規(guī)檢查、腦電圖、MRI檢查,MRI檢查顯示內(nèi)顳葉結(jié)構(gòu)萎縮,包括海馬結(jié)構(gòu)、杏仁核和內(nèi)嗅皮質(zhì)[2,3]。并根據(jù)NINCDS/ADRDA統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)確立為很可能的AD[4],患者或知情者訴有超過(guò)6個(gè)月的緩慢進(jìn)行性記憶減退,測(cè)試發(fā)現(xiàn)有嚴(yán)重的情景記憶損害的客觀證據(jù),主要為回憶受損,通過(guò)暗示或再認(rèn)測(cè)試不能顯著改善或恢復(fù)正常,全部患者無(wú)陽(yáng)性家族史。并用簡(jiǎn)易智能量表(MMSE)進(jìn)行認(rèn)知能力評(píng)估,評(píng)分≤24分者被選入組。對(duì)照組300例來(lái)自社區(qū)隨機(jī)抽樣。其中男120例,女180例,年齡55~94歲,平均(70.97±6.73)歲;進(jìn)行神經(jīng)系統(tǒng)檢查及MRI檢查均正常者被選入組,并且MMSE得分≥28分。此研究經(jīng)日本神戶(hù)大學(xué)醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

      1.2 方法

      1.2.1 DNA提取及PCR:提取所有受試者的周?chē)? ml,用基因組DNA提取試劑盒從外周血的白細(xì)胞中提取基因組DNA。用PCR方法進(jìn)行PSEN2基因外顯子區(qū)域的擴(kuò)增。正向引物及反向引物見(jiàn)表1。用Takara DNA多聚酶進(jìn)行PCR。反應(yīng)體系30μL:包括100ng基因組DNA 1μL、30pmol/L的引物各1μL、3μL的 10×PCR 緩沖液、0.2 mmol/L的dNTP 3μL、1U的Takara Taq DNA多聚酶0.15μL。PCR反應(yīng)條件為:95℃變性9 min后,進(jìn)入主循環(huán);95℃30 s、各外顯子PCR的不同退火溫度30 s、72℃1 min共35個(gè)循環(huán)后72℃延伸10 min。外顯子2的PCR退火溫度為65℃,外顯子4的PCR退火溫度為56℃,其他外顯子PCR的退火溫度為60℃。取PCR產(chǎn)物5μL在2%的瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,之后用EB染色并在紫外線(xiàn)下觀察結(jié)果。

      1.2.2 堿基序列測(cè)序:采取直接測(cè)序PCR產(chǎn)物,首先用PCR純化試劑盒(Qiagen,USA)純化25μL的PCR產(chǎn)物,然后進(jìn)行堿基序列的測(cè)序反應(yīng)(用PCR引物),反應(yīng)體系為20μL;包括純化PCR產(chǎn)物1 μL,10 pmol/L的單向引物2μL,BigDye Terminator1.1的4μL,Sequence緩沖液4μL。退火溫度為56℃。然后用ABI 3700基因測(cè)序儀(ABI,USA)進(jìn)行測(cè)序。核酸序列經(jīng)數(shù)據(jù)收集軟件整理,用DNAsis2軟件進(jìn)行序列對(duì)比分析。

      2 結(jié)果

      采用12對(duì)引物(表1),對(duì)PSEN2基因的各外顯子分別進(jìn)行PCR及直接測(cè)序。測(cè)序300例患者組PSEN2基因序列,在3例SAD患者的外顯子3上發(fā)現(xiàn)了100G>A基因突變,第34號(hào)密碼子由甘氨酸到絲氨酸(G34S)的變化(圖1),而300例對(duì)照組中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)此基因突變。顯然,100G>A基因突變?cè)赟AD組中的頻率為1%,對(duì)照組中的頻率為0%。此外,在1例67歲的SAD患者PSEN2基因的外顯子4上發(fā)現(xiàn)1915C>T基因突變,但此基因突變沒(méi)有引起氨基酸編碼的改變(87H)。

      表1 各外顯子的引物Tab.1 The primers of exons

      3 討論

      圖1 PSEN2基因DNA測(cè)序結(jié)果Fig.1 The results of DNA sequencing of PSEN2

      PSEN2基因全長(zhǎng)24 837 bp,位于1號(hào)染色體,有12個(gè)外顯子,從第3個(gè)外顯子到第12個(gè)外顯子含有編碼區(qū),共2 236 bp。PSEN2蛋白是由PSEN2基因編碼的448個(gè)氨基酸組成,是8次跨膜的膜蛋白質(zhì)。PSEN2蛋白與其同源性的PSEN1蛋白是γ分泌酶復(fù)合體的組成之一,也是活性中心。PSEN屬于天冬酰氨蛋白酶家族(aspartyl protease family),在8個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域(transmenbrane domain,TMD)中,2個(gè)分別位于TMD6及TMD7中的天冬氨酸殘基是催化剪切底物必需的活性位點(diǎn)(圖2)。PSEN首先以無(wú)活性的全蛋白形式分泌,再經(jīng)過(guò)自身催化的跨膜剪切斷裂為功能性片斷C端片段(CTF)和N端片段(NTF),才形成有生物功能的PSEN-NTF/CTF二聚體。除此之外,PSEN在C端保守的PAL(prolinealanine-leucine,脯氨酸-丙氨酸-亮氨酸)序列以及在第 4跨膜區(qū)中保守的 WNF(tryptophan-asparagine-phenylalanine,色氨酸-天冬酰胺-苯丙氨酸)序列,對(duì)于γ分泌酶的活性也很重要[5]。當(dāng)PSEN蛋白異常時(shí),會(huì)改變?chǔ)梅置诿傅幕钚?,從而?dǎo)致中樞神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)外產(chǎn)生過(guò)量的異常沉積的Aβ42,或?qū)е?Aβ42/Aβ40 的比例失調(diào)[6]。目前PSEN2基因測(cè)序的研究中,已發(fā)現(xiàn)11個(gè)PSEN2基因突變,所有基因突變的表現(xiàn)型均為AD。

      為了探索AD的致病基因,以微陣列或SNP(singlenucleotidepolymorphism)為標(biāo)記檢測(cè)堿基全序列的研究是目前國(guó)內(nèi)外的熱門(mén)。根據(jù)國(guó)際人類(lèi)基因組計(jì)劃已經(jīng)清楚人類(lèi)的全部基因,并進(jìn)行了大量的基因分析,盡管這樣還有很多堿基替換的報(bào)道接連不斷。1995年,Sherrington等[7]發(fā)現(xiàn) M146L、H163R、A246E、L286V和C410Y 5個(gè)位于PSEN1基因的突變。相繼100多個(gè)PSEN1基因突變?cè)诩易逍訟D中陸續(xù)被報(bào)道,其中3個(gè)PSEN1基因突變是在SAD中被報(bào)道。其一是Dumanchin等[8]在法國(guó)的37歲SAD患者中發(fā)現(xiàn)的M139K基因突變。其二是Kamimura等[9]在日本的散發(fā)人群中發(fā)現(xiàn)的1例具有H163R基因突變的AD患者。這兩個(gè)基因突變分別位于PSEN1蛋白CTF第5外顯子的TM-II和第6外顯子的HL-II,認(rèn)為均具有致病性[10]。其三是Scacchi等[11]在85歲SAD患者的外顯子4上發(fā)現(xiàn)的N32(AAT>AAC)的基因突變。該基因突變位于PSEN1蛋白的非功能區(qū)NTF,認(rèn)為不具有致病性。另外,Rogaeva等[12]在家族性AD中發(fā)現(xiàn)了R35Q、A79V基因突變。這兩種基因突變也位于PSEN1蛋白的非功能區(qū)NTF,認(rèn)為與AD發(fā)病無(wú)關(guān)。

      PSEN2基因分析中,Bird首次提出PSEN2基因突變會(huì)引起家族性AD。Bird報(bào)道的Volga German家系的發(fā)病原因?yàn)镹141I的基因突變,其AD的平均發(fā)病年齡為58.7歲[13]。同期,Rogaev等在意大利FLO10家系中發(fā)現(xiàn)了具有PSEN2基因M239V基因突變的9例患者,發(fā)病年齡為45~88歲,平均50歲??梢?jiàn)PSEN2基因點(diǎn)突變有早發(fā)性AD也有晚發(fā)性AD,且外顯率不是100%,同一家族里具有PSEN2基因點(diǎn)突變的成員不一定發(fā)病。PSEN2基因突變?cè)赟AD人群中也有報(bào)道,Cruts等在荷蘭的SAD人群中發(fā)現(xiàn)了R62H基因突變,位于PSEN2蛋白的非功能區(qū)NTF,患者的發(fā)病年齡為62歲,在SAD中此基因突變的頻率為1%,正常對(duì)照組中的頻率為0%。Walker等[14]將PSEN2基因突變載體轉(zhuǎn)染到神經(jīng)細(xì)胞內(nèi),觀察Aβ的含量。發(fā)現(xiàn)N141I、M239V、M239I和T122P等基因突變體的Aβ42或者Aβ42/Aβ40的比例比對(duì)照組有明顯增多,但R62H、S130L、V148I、D439A 等基因突變體沒(méi)有相應(yīng)的變化??梢?jiàn)部分PSEN2基因突變可能是與AD發(fā)病無(wú)關(guān)的點(diǎn)突變。本文的G34S基因突變與R62H同樣在SAD中被發(fā)現(xiàn),同樣位于PSEN2蛋白的非功能區(qū)NTF,G34S基因突變?cè)赟AD中的頻率為1%,在對(duì)照組中頻率為0%,曾被認(rèn)為有可能與AD的發(fā)病有關(guān)[15]。G34S基因突變可能與SAD發(fā)病無(wú)關(guān)的正常多態(tài)性,但其生物學(xué)功能有待于進(jìn)一步探討。對(duì)于1915 C>T(87H)的基因突變沒(méi)有引起氨基酸編碼的改變,且同樣位于PSEN2蛋白非功能區(qū)NTF,所以不會(huì)影響PSEN2蛋白的功能。

      今后為了更多的發(fā)掘與AD相關(guān)的新的基因或者新的基因突變,有必要繼續(xù)進(jìn)行基因分析。在AD發(fā)病中除了顯性遺傳之外,還有多個(gè)基因的多重作用,并且在明確的家系中也存在非顯性遺傳方式遺傳、或者母性遺傳方式遺傳的報(bào)道。更不應(yīng)忽視人種差異、區(qū)域、環(huán)境、放射線(xiàn)等基因以外的影響。AD遺傳學(xué)不像單一的顯性遺傳那么簡(jiǎn)單,應(yīng)該是復(fù)合因子相互影響的一個(gè)復(fù)雜的問(wèn)題。

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