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      鱸魚FBP基因的克隆和表達(dá)分析

      2012-05-30 08:52:46童彩環(huán)錢云霞鄭偉賢
      海洋學(xué)研究 2012年4期
      關(guān)鍵詞:糖異生鱸魚克隆

      童彩環(huán),錢云霞,鄭偉賢,韓 柳

      (寧波大學(xué) 生命科學(xué)與生物工程學(xué)院,應(yīng)用海洋生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 寧波 315211)

      0 引言

      果 糖-1,6-二 磷 酸 酶 (fructose-1,6-bisphosphatase,F(xiàn)BP,EC 3.1.3.11)糖異生途徑中的關(guān)鍵酶之一,可催化果糖-1,6-二磷酸(fructose-1,6-bisphosphate)水解成果糖-6-磷酸(fructose-6-phosphate)和無(wú)機(jī)磷酸鹽(inorganic phosphate,Pi)[1]。FBP是一個(gè)同源四聚體,由4個(gè)結(jié)構(gòu)相同的單體組成,其催化作用需鎂、錳、鈷或鋅等2價(jià)陽(yáng)離子參與[2],所以FBP除底物結(jié)合位點(diǎn)外還有金屬離子結(jié)合位點(diǎn)。FBP以活性形式和非活性形式存在[3],果糖-2,6-二磷酸(fructose-2,6-bisphosphate)和 腺 嘌 呤 核 糖 核 苷 酸(adenosine monophosphate,AMP)都能抑制FBP的催化活性,其中果糖-2,6-二磷酸是直接與活性位點(diǎn)結(jié)合進(jìn)行抑制,而AMP是通過(guò)變構(gòu)調(diào)節(jié)進(jìn)行抑制,即AMP結(jié)合于變構(gòu)位點(diǎn),影響FBP與金屬離子的結(jié)合,從而抑制FBP的催化活性。除哺乳動(dòng)物外,F(xiàn)BP廣泛存在于細(xì)菌、鳥類、甲殼動(dòng)物、魚類和兩棲類[4-5]。而在哺乳動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)有2種編碼FBP的基因存在,一種稱肝臟型FBP(FBP1),最早發(fā)現(xiàn)于葡萄糖異生作用的組織中,如肝臟,腎臟和消化道;另一種稱為肌肉型FBP(FBP2),僅在骨骼肌中表達(dá),主要參與乳酸鹽類物質(zhì)的糖異生作用[6-7]。

      由于FBP參與調(diào)控糖異生途徑,抑制FBP的活性可以治療小鼠二型糖尿病,因而FBP對(duì)葡萄糖的動(dòng)態(tài)平衡至關(guān)重要[8]。在魚類尤其是肉食性魚類中,增強(qiáng)肝臟和消化道中的糖異生作用是食物缺乏時(shí)防止血糖波動(dòng)的有利途徑[9]。FBP作為糖異生作用的三大關(guān)鍵酶之一,其編碼序列已在彩虹胡瓜魚Osmerusmordax、斑馬魚Daniorerio、異育銀鯽Caras-siusgibelio和大西洋鮭Salmosalar等少數(shù)幾種魚類中被分離和鑒定。

      鱸魚Lateolabraxjaponicus,也叫海鱸、花鱸、七星鱸,屬于鱸形目,是一種廣鹽性的肉食性魚類,也是我國(guó)海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖的重要魚類之一?,F(xiàn)實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)克隆了鱸魚糖異生途徑中的另外2種關(guān)鍵酶:葡萄糖-6-磷酸酶(glucose-6-phosphatase,G6Pase)和磷酸烯醇丙酮酸羧激酶(phosphoenolpyruvate carboxykinase,PEPCK)基因[10-11]。本實(shí)驗(yàn)分離了鱸魚 FBP基因,對(duì)其cDNA和氨基酸序列進(jìn)行了分析,并對(duì)其組織表達(dá)特性進(jìn)行了研究,為進(jìn)一步研究鱸魚FBP的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。

      1 材料和方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      實(shí)驗(yàn)所用二齡鱸魚購(gòu)于寧波水產(chǎn)品大世界。

      引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成。MS-222為sigma公司產(chǎn)品;Trizol試劑為Invitrogen公司產(chǎn)品;逆轉(zhuǎn)錄試劑PrimeScriptTM1st Strand cDNA Synthesis Kit、Taq酶和pMD-18T載體等均為Takara公司產(chǎn)品(大連);SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit購(gòu)自Clontech公司。大腸桿菌EscherichiacoliDH5α由本實(shí)驗(yàn)室保存。其它試劑為國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?/p>

      1.2 總RNA的提取和cDNA第一條鏈的合成

      鱸魚經(jīng)MS-222麻醉后取其肝臟,參照Trizol試劑操作提取總RNA,經(jīng)NanoDrop 1000Spectrophotometer檢測(cè)RNA的濃度和純度,用1.2%(w/v)的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)總RNA的完整性。取1μg總RNA參照PrimeScriptTM1st Strand cDNA Synthesis Kit試劑操作說(shuō)明書反轉(zhuǎn)錄合成肝臟cDNA第一條鏈。

      1.3 FBP全長(zhǎng)cDNA擴(kuò)增

      根據(jù)其他動(dòng)物的FBP cDNA序列在保守區(qū)分別設(shè)計(jì)兼并引物FBP-F/R克隆核心片段,引物序列見(jiàn)表1。以上述肝臟cDNA為模板,用FBP-F/R擴(kuò)增FBP核心片段。FBP核心片段的擴(kuò)增條件為:預(yù)變性94℃,3min;94 ℃、30s,58~55 ℃、30s,72℃、1min,共進(jìn)行36個(gè)循環(huán)(前4個(gè)循環(huán)退火溫度每循環(huán)下降1℃);最后72℃延伸5min。PCR產(chǎn)物用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),割膠回收后與pMD18-T載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α,經(jīng)PCR檢測(cè)后將陽(yáng)性克隆送上海英駿生物工程公司進(jìn)行測(cè)序。

      在測(cè)序得到的核心序列的基礎(chǔ)上,分別設(shè)計(jì)FBP的5’RACE和3’RACE特異性引物,序列見(jiàn)表1。參照SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit說(shuō)明書,取鱸魚肝臟總RNA分別合成5’Ready和3’Ready cDNA,用于5’和3’末端cDNA的克隆。PCR產(chǎn)物純化、克隆和測(cè)序方法同上。最后對(duì)所獲得的序列進(jìn)行拼接,獲得FBP全長(zhǎng)cDNA序列。

      1.4 FPB的同源性分析與系統(tǒng)進(jìn)化分析

      應(yīng)用BioEdit軟件進(jìn)行氨基酸序列推導(dǎo),并將鱸魚FBP與彩虹胡瓜魚、斑馬魚、人Homosapiens和小鼠Musmusculus的肝臟型FBP進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)分析。并對(duì)鱸魚FBP與其它已知?jiǎng)游锏腇BP作同源性分析。使用 MEGA 4.0軟件,通過(guò)鄰接法(Neighbor Joining,NJ)對(duì)鱸魚FBP和GenBank中已收錄的其它物種的FBP氨基酸序列進(jìn)行分子進(jìn)化樹聚類分析。

      1.5 FBP在組織中的表達(dá)分析

      以18S為內(nèi)參基因,檢測(cè)FBP在不同組織中的表達(dá)特點(diǎn)。提取鱸魚肝臟、肌肉、脾臟、心臟、眼、腎臟、腸、脂肪、鰓和大腦等10個(gè)組織的RNA,各取1 μg參照PrimeScriptTM1st Strand cDNA Synthesis Kit說(shuō)明書反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。根據(jù)得到的FBP序列,設(shè)計(jì)組織表達(dá)引物FBP-RT-F/R,序列見(jiàn)表1。

      表1 PCR擴(kuò)增用引物列表Tab.1 Primers used in PCR

      2 結(jié)果

      2.1 FBP cDNA的克隆及序列分析

      用兼并引物FBP-F和FBP-R進(jìn)行PCR克隆到鱸魚FBP的核心片段741bp,在此基礎(chǔ)上利用引物FBP-5RACE-1/2和 FBP-3RACE-1/2分別進(jìn)行2輪5’RACE和3’RACE PCR,得到5’末端序列724bp和3’末端序列810bp,與核心序列分別有545bp和350bp的重疊。進(jìn)行拼接后得到鱸魚FBP cDNA的全長(zhǎng)為1 357bp,5’非翻譯區(qū)和3’非翻譯區(qū)分別為42bp和301bp,開(kāi)放閱讀框?yàn)? 014bp,共編碼337個(gè)氨基酸(圖1),預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)分子量約為36.7kD,理論pI為6.90。

      2.2 FBP的同源性分析與系統(tǒng)進(jìn)化分析

      經(jīng)同源性分析發(fā)現(xiàn)鱸魚FBP基因與裸蓋魚Anopiopomafimbria(ACQ58743)、彩虹胡瓜魚、斑馬魚、異育銀鯽和大西洋鮭的同源性分別為94.3%,90.8%,89.3%,88.1%和84.1%,與哺乳動(dòng)物中的人、牛BosTaurus、豬Susscrofa和小鼠的肝臟型FBP同 源 性 分 別 為 78.9%,77.8%,77.8% 和75.4%,與人、牛、豬和小鼠的肌肉型FBP的同源性分別為74.9%,75.5%,68.7%和73.7%。

      將鱸魚FBP與人、斑馬魚、小鼠和彩虹胡瓜魚的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),鱸魚FBP也具有AMP結(jié)合位點(diǎn)、金屬結(jié)合位點(diǎn)、活性位點(diǎn)和底物結(jié)合位點(diǎn)等功能位點(diǎn)(圖2)。

      圖1 鱸魚FBP cDNA及其推導(dǎo)的氨基酸序列(*為終止子)Fig.1 The cDNA and deduced amino acid sequences of the Lateolabrax japonicus FBP gene(*indicates terminator)

      圖2 鱸魚、人、斑馬魚、小鼠和彩虹胡瓜魚FBP氨基酸序列的多重比對(duì)Fig.2 Multiple alignment of amino acid sequences of FBP of Lateolabrax japonicus,Homo sapiens,Danio rerio,Mus musculus and Osmerus mordax

      用MEGA 4.0軟件的鄰接法對(duì)鱸魚和其它魚類、甲殼類、昆蟲類、鳥類和哺乳動(dòng)物的2種FPB型的氨基酸序列構(gòu)建進(jìn)化樹。通過(guò)進(jìn)化樹可以發(fā)現(xiàn),本實(shí)驗(yàn)克隆的鱸魚FBP與其它魚類的肝臟型FBP成簇后再與哺乳動(dòng)物的肝臟型FBP聚成一支,然后才與哺乳動(dòng)物的肌肉型FBP匯成簇(圖3)。

      圖3 鱸魚和其他物種FBP的氨基酸序列系統(tǒng)分析Fig.3 Phylogenetic analysis of FBP amino acid sequences of Lateolabrax japonicus and other species

      2.3 FPB的組織表達(dá)分析

      用RT-PCR檢測(cè)鱸魚FPB基因的組織表達(dá)特點(diǎn),所檢測(cè)3尾鱸魚的10個(gè)組織包括肝臟、鰓、心臟、腎臟、大腦、眼、腸、脾臟、肌肉和脂肪等。結(jié)果表明FPB僅在肝臟、腸和腎臟這3個(gè)組織中有明顯表達(dá)(圖4)。

      3 討論與結(jié)論

      圖4 鱸魚FPB組織表達(dá)結(jié)果Fig.4 Expression of Lateolabrax Japonicus RXRα,RXRβand RXRγin various tissues

      本實(shí)驗(yàn)從鱸魚肝臟cDNA中分離得到FBP的全長(zhǎng)cDNA序列共1 357bp,該序列包含1個(gè)1 014bp的完整開(kāi)放閱讀框,可編碼337個(gè)氨基酸組成的蛋白。序列分析表明,鱸魚FBP含有AMP結(jié)合位點(diǎn)、底物結(jié)合位點(diǎn)、金屬結(jié)合位點(diǎn)和活性位點(diǎn),其中活性位點(diǎn)和底物結(jié)合位點(diǎn)有數(shù)處重疊且較在其他物種間更為保守,但AMP結(jié)合位點(diǎn)略有變化,比如AMP結(jié)合位點(diǎn)的第2個(gè)氨基酸小鼠為Q,而鱸魚的為E且和彩虹胡瓜魚、斑馬魚及人的氨基酸相同。已有研究表明,肌肉型FBP和肝臟型FBP對(duì)鈣離子和AMP二種抑制物的敏感程度不同,但二者的AMP結(jié)合位點(diǎn)和金屬結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸差異并不大[12-13]。

      在哺乳動(dòng)物中,糖異生作用主要發(fā)生在肝臟中,消化道和腎臟也參與糖異生過(guò)程,是魚類糖異生過(guò)程發(fā)生的3個(gè)主要組織[14-15]。本實(shí)驗(yàn)對(duì)鱸魚糖異生過(guò)程的關(guān)鍵酶FBP的組織特異性表達(dá)研究發(fā)現(xiàn),該基因只在肝臟、腎臟和腸這3個(gè)組織中表達(dá),和糖異生作用發(fā)生的組織特異性基本吻合。我們前期的研究結(jié)果表明,鱸魚的另2種糖異生途徑關(guān)鍵酶PEPCK基因和 G6P也主要在這3個(gè)組織中表達(dá)[10-11],該結(jié)果也和虹鱒魚Oncorhynchusmykiss3種關(guān)鍵限速酶的組織表達(dá)特點(diǎn)一致[9],但銀鯽的FBP基因(肝臟型)在肝臟、腦、心臟、脾臟、腎臟、腸、肌肉和卵巢等組織中都有表達(dá),以肝臟表達(dá)量最高[16]。

      FBP是糖異生過(guò)程的關(guān)鍵酶之一,在哺乳動(dòng)物中存在2個(gè)編碼FBP的基因,一個(gè)為肝臟型,主要表達(dá)于肝、腎﹑肺和消化道中;另一個(gè)為肌肉型,僅表達(dá)于骨骼肌中。比較肝臟型和肌肉型FBP的一級(jí)結(jié)構(gòu)和二者間的突變積累推測(cè)FBP復(fù)制成肝臟型大概發(fā)生在3億年前,且用RT-PCR的方法沒(méi)有檢測(cè)到魚類肌肉中存在肌肉型FBP這一基因,因此有人推測(cè)在魚類中沒(méi)有肌肉型 FBP[4,17]。但是,從 GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索發(fā)現(xiàn)大西洋鮭和斑馬魚都存2種FBP序列,從同源性分析和進(jìn)化樹結(jié)果看,這2個(gè)基因分別與哺乳動(dòng)物的肌肉型的FBP和肝臟型的FBP聚合。王銳 等[16]也證實(shí)魚類至少存在肝臟型和肌肉型2種類型的FBP,但至今未見(jiàn)關(guān)于魚類肌肉型FBP的報(bào)道。本實(shí)驗(yàn)克隆所得到的FBP與肝臟型的FBP聚為一支,且表達(dá)的組織也與肝臟型的表達(dá)特點(diǎn)一致,推測(cè)該基因?yàn)轺|魚肝臟型FBP,關(guān)于鱸魚中是否還存在另一種肌肉型FBP還有待研究。

      (References):

      [1]PILKIS S J,CLAUS T H.Hepatic gluconeogenesis/glycolysis:regulation and structure/function relationships of substrate cycle enzymes[J].Annu Rev Nutr,1991,11:465-515.

      [2]RAKUS D,MACIASZCZYK E,WAWRZYCKA D,et al.The origin of the high sensitivity of muscle fructose1,6-bisphosphatase towards AMP[J].FEBS Letters,2005,579(25):5 577-5 581.

      [3]LU G,STEC B,GIROUX E L,et al.Evidence for an active T-state pig kidney fructose 1,6-bisphosphatase:Interface residue Lys-42is important for allosteric inhibition and AMP cooperativity[J].Protein Science,1996,5(11):2 333-2 342.

      [4]TILLMANN H,BERNHARD D,ESCHRICH K.Fructose-1,6-bisphosphatase genes in animals[J].Gene,2002,291(1/2):57-66.

      [5]SOULIMANE T.Thermus thermophilus encodes an archaeal-like fructose-1,6-bisphosphatase:Purification of native and recombinant protein for structural studies[J].Protein Expression and Purification,2010,74(2):175-180.

      [6]SKALECKI K,RAKUS D,WISNIEWSKI J R,et al.cDNA sequence and kinetic properties of human lung fructose (1,6)bisphosphatase[J].Arch Biochem Biophys,1999,365(1):1-9.

      [7]AL-ROBAIY S,ESCHRICH K.Rat muscle fructose-1,6-bisphosphatase:Cloning of the cDNA,expression of the recombinant enzyme,andexpression analysis in different tissues[J].Biol Chem,1999,380(9):1 079-1 085.

      [8]HEBEISEN P,HAAP W,KUHN B,et al.Orally active aminopyridines as inhibitors of tetrameric fructose-1,6-bisphosphatase[J].Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters,2011,21(11):3 237-3 242.

      [9]KIRCHNER S,PANSERAT S,LIM P L,et al.The role of hepatic,renal and intestinal gluconeogenic enzymes in glucose homeostasis of juvenile rainbow trout[J].J Comp Physiol B,2008,178(3):429-438.

      [10]QIAN Yun-xia,YANG Sun-xiao,TONG Li-juan,et al.Low salinity induces cytosolic PEPCK expression in Sea Perch(Lateolabraxjaponicus)[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2006,26(7):651-658.

      錢云霞,楊孫孝,童麗娟,等.低鹽度可誘導(dǎo)鱸魚胞漿型PEPCK基因表達(dá)[J].中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào),2006,26(7):651-658.

      [11]QIAN Yun-xia,ZHENG Wei-xian,SONG Juan-juan.Cloning and sequence analysis ofLateolabraxjaponicusGlucose-6-phosphatase Catalytic Subunit(G6PC)cDNA and its 5’-flanking region[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2011,19(4):606-615.

      錢云霞,鄭偉賢,宋娟娟.鱸魚6-磷酸葡萄糖酶催化亞基(G6PC)cDNA和5’側(cè)翼序列的克隆及分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào),2011,19(4):606-615.

      [12]GIZAK A,MAJKOWSKI M,DUS D,et al.Calcium inhibits muscle FBPase and affects its intracellular localization in cardiomyocytes[J].FEBS Lett,2004,576(3):445-448.

      [13]RAKUS D,TILLMANN H,WYSOCKI R,et al.Different sensitivities of mutants and chimeric forms of human muscle and liver fructose-1,6-bisphosphatases towards AMP[J].Biol Chem,2003,384(1):51-58.

      [14]MITHIEUX G,GAUTIER-STEIN A,RAJAS F,et al.Contribution of intestine and kidney to glucose fluxes in different nutritional states in rat[J].Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol,2006,143(2):195-200.

      [15]SUAREZ R K,MOMMSEN T P.Gluconeogenesis in teleost fishes[J].Can J Zool,1987,65:1 869-1 882.

      [16]WANG Rui,XIAO Qing,GUI Jian-fang.Molecular cloning and expression analysis of fructose-1,6-bisphosphatase in gibel carp[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2010,34(6):1 130-1 135.

      王銳,肖青,桂建芳.銀鯽果糖-1,6-二磷酸酶的分子克隆與表達(dá)分析[J].水生生物報(bào),2010,34(6):1 130-1 135.

      [17]TILLMANN H,STEIN S,LIEHR T,et al.Structure and chromosomal localization of the human and mouse muscle fructose-1,6-bisphosphatase genes[J].Gene,2000,247(1/2):241-253.

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