• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      嗜熱菌Thermaerobacter subterraneus DSM13965磷酸三酯酶的原核表達(dá)、純化及性質(zhì)表征

      2013-12-03 06:38:10林禹欣劉惠麟韓葳葳詹冬玲劉景圣
      關(guān)鍵詞:水解酶有機(jī)磷基因組

      林禹欣,劉惠麟,韓葳葳,詹冬玲,劉景圣

      (1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 食品科學(xué)與工程學(xué)院,長春 130118;2.吉林大學(xué) 分子酶學(xué)工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長春 130012)

      有機(jī)磷農(nóng)藥常被用作殺蟲劑噴灑在果樹和蔬菜上,主要通過與膽堿酯酶的活性內(nèi)羥基結(jié)合抑制酶活性,使其失去分解乙酰膽堿的能力,導(dǎo)致乙酰膽堿的積累[1].

      磷酸三酯酶(phosphotriesterase,PTE,EC31118)是降解有機(jī)磷毒劑的主要酶類,可與水果蔬菜表面殘留的農(nóng)藥發(fā)生化學(xué)反應(yīng),破壞有毒成分的化學(xué)結(jié)構(gòu),使其變?yōu)闊o毒、可溶于水的小分子物質(zhì)[2-4].

      嗜熱酶具有較高的熱穩(wěn)定性和高抗性[5-7].嗜熱磷酸三酯酶由于具有較高的熱穩(wěn)定性及可溶性而使其在實(shí)際應(yīng)用中潛力較大.目前發(fā)現(xiàn)的嗜熱磷酸三酯酶主要包括嗜熱菌Deinococcusradiodurans來源的磷酸三酯酶(Dr-OPH)、超嗜熱菌Sulfololussolfataricus來源的磷酸三酯酶(SsoPox)和嗜熱菌Geobacilluskaustophilus來源的磷酸三酯酶[2].

      本文通過克隆ThermaerobactersubterraneusDSM13965的磷酸三酯酶(PTE)基因,用雙酶切將其與質(zhì)粒pET15b連接,轉(zhuǎn)化入大腸桿菌BL21中進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),利用His抗體鑒定目標(biāo)蛋白,并研究重組蛋白(DSM-PTE)的酶學(xué)性質(zhì).

      1 材料與方法

      1.1 材 料

      嗜熱菌T.subterraneusDSM13965購自德國菌種保藏中心;大腸桿菌BL21及質(zhì)粒pET15b為美國Invitrogen公司產(chǎn)品;DNA快速提取試劑盒和DNA膠回收試劑盒購自杭州維特潔生化技術(shù)有限公司;限制性內(nèi)切酶、T4-DNA連接酶及瓊脂糖為荷蘭Boehringer Mannheim公司產(chǎn)品;其他試劑均為美國Sigma公司產(chǎn)品.由上海生物工程有限公司對引物進(jìn)行合成和測序.

      1.2 方 法

      1.2.1 同源序列比對 分別將T.subterraneusDSM13965的有機(jī)磷水解酶、來自G.KaustophilusHTA426的磷酸三酯酶、來自S.solfataricus的內(nèi)酯酶/磷酸三酯酶和來自D.Radiodurans的有機(jī)磷水解酶進(jìn)行同源序列比對.

      1.2.2 嗜熱菌T.subterraneusDSM13965基因組DNA的調(diào)取 按細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(TIAGEN)說明提取TS基因組DNA,用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.8%的凝膠電泳檢測基因組DNA的純度和濃度,分裝后于-40 ℃保存?zhèn)溆?

      PCR反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃變性1 min,58 ℃退火1 min,72 ℃延伸10 min,循環(huán)30次,72 ℃延伸20 min.通過質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物,目的基因片段于-20 ℃保存.

      1.2.4 磷酸三酯酶基因表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建 由DNA膠回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物,將PCR產(chǎn)物連接至pET-15b上,轉(zhuǎn)化入E.coliXL中.將篩選到含PTE的陽性克隆進(jìn)行雙酶切和序列分析.對陽性克隆和質(zhì)粒pET-15b分別進(jìn)行NdeⅠ和BamHⅠ雙酶切,將酶切得到的目的基因與雙酶切后載體pET-15b相連.連接反應(yīng)體系為:T4 DNA連接酶0.3 μL,T4 DNA連接酶緩沖液1.2 μL,雙酶切后的載體pET-15b 1.5 μL,雙酶切后的目的基因片段7 μL.

      將反應(yīng)物置于16 ℃金屬浴中連接過夜,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至感受態(tài)E.coliBL21中.挑取單菌落,培養(yǎng)并提取質(zhì)粒,通過PCR對重組質(zhì)粒進(jìn)行篩選和序列分析.

      1.2.5 目的基因的誘導(dǎo)表達(dá)及產(chǎn)物純化 將工程菌接種于含100 μg/mL氨芐青霉素(AMP)的10 mL Luria-Bertani(LB)液體培養(yǎng)基中,于37 ℃振蕩培養(yǎng)過夜,再按照質(zhì)量分?jǐn)?shù)的1%接種量接種于100 mL LB液體培養(yǎng)基中,相同條件下培養(yǎng)至A600=0.6~0.8,加入異丙基-β-D-硫代砒喃半乳糖苷(IPTG,終濃度為0.3 mmol/L),30 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)過夜.于4 ℃,6 000 r/min離心收集菌體,并懸浮于50 mmol/L pH=7.5的Na2HPO4/NaH2PO4緩沖液中,在冰浴中超聲裂菌,60 ℃熱處理30 min,離心,棄沉淀,上清液經(jīng)鎳柱純化,收集蛋白峰.融合蛋白部分經(jīng)聚乙二醇(10 000)濃縮后,檢測酶活.

      1.2.6 磷酸三酯酶鑒定 用SDS-PAGE和Western-blot分析鑒定純化后得到的目標(biāo)蛋白[8-9].通過質(zhì)量分?jǐn)?shù)為5%的濃縮膠和質(zhì)量分?jǐn)?shù)為10%的分離膠變性蛋白電泳進(jìn)行檢測.

      1.2.7 磷酸三酯酶的活力測定 以甲基對氧磷(methyl-paraoxon)為底物,通過分光光度計測定磷酸三酯酶活力.監(jiān)測水解產(chǎn)物對硝基酚在405 nm隨時間變化的光吸收值,反應(yīng)體系為2 mL,緩沖體系為50 mmol/L磷酸緩沖液(pH=7.5),甲基對氧磷的終濃度為0.1 mmol/L,加入適量的酶,70 ℃反應(yīng)20 min,用T6紫外-可見分光光度計測定單位時間內(nèi)的光吸收值,以不加入酶的體系作為空白對照.1個酶活力單位為每20 min催化水解1 μmol底物所需的酶量.酶比活計算公式如下:

      其中:Δ OD405為反應(yīng)時間內(nèi)405 nm處光吸收強(qiáng)度的變化值;V1為反應(yīng)體系 (2 mL);ε為消光系數(shù)(0.016(μmol/L)-1);t為反應(yīng)時間(min);V2為加入的酶量(mL);ρ為酶的質(zhì)量濃度(mg/mL).每次做3個平行實(shí)驗(yàn),取平均值.

      1.2.8 最適pH值及溫度的測定 分別以三羥甲基甲胺基丙磺酸(TAPS)、2-嗎啉乙磺酸(MES)、3-(環(huán)己胺)-1-丙磺酸(CAPS)和4-羥乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)配制不同pH值的緩沖液,酶活性測定方法同1.2.7.在pH=4~11內(nèi)檢測酶活力,最高酶活力設(shè)為100%,以相對活性為縱坐標(biāo)對pH值做圖,求得最適pH值.

      在30~90 ℃內(nèi)測定融合蛋白的磷酸三酯酶活力,觀察溫度對酶活性的影響.最高酶活性設(shè)為100%,以相對活性為縱坐標(biāo)對溫度做圖,求得最適溫度.

      1.2.9 熱穩(wěn)定性測定 將PTE純化酶液置于70 ℃水浴中,用石蠟油封頂,每間隔1 h取一次酶液進(jìn)行活力測定.磷酸三酯酶活力測定同1.2.7.

      2 結(jié)果與討論

      2.1 同源序列比對結(jié)果

      通過NCBI的protein blast檢索發(fā)現(xiàn),與DSM-PTE同源性高的蛋白主要都是有機(jī)磷水解酶.將已知結(jié)構(gòu)的有機(jī)磷水解酶[10-11]和DSM-PTE進(jìn)行同源序列比對,結(jié)果如圖1所示.

      DSM為T.subterraneus DSM13965的有機(jī)磷水解酶(同源性99%);3ORW為G.kaustophilus HTA426的磷酸三酯酶(同源性62%);2VC5為S.solfataricus的內(nèi)酯酶/磷酸三酯酶 (同源性35%);3GU1為D.radiodurans的磷酸三酯酶(同源性61%).圖 1 DSM-PTE同源序列比對Fig.1 Sequence alignment of DSM-PTE with other members

      由圖1可見,其同源性均大于35%,推測DSM-PTE具有有機(jī)磷水解酶的活性.

      2.2 磷酸三酯酶表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建

      TS基因組的調(diào)取結(jié)果如圖2所示.由圖2可見,TS基因組提取準(zhǔn)確,以其為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果如圖3所示.由圖3可見,目的片段(約1 000 bp)成功插入,與預(yù)期大小一致,序列測定結(jié)果表明,所獲目的基因正確.

      2.3 重組蛋白DSM-PTE的表達(dá)與純化

      用SDS-PAGE檢驗(yàn)純化蛋白組分,結(jié)果如圖4所示.由圖4的第2條帶可見,重組蛋白的相對分子量為50 000,主要以二聚體形式存在.由Western-blot(第3條帶)的免疫印跡可見,重組蛋白DSM-PTE是約為50 000的大分子化合物.與文獻(xiàn)[12]結(jié)果相符,PTE在溶液中主要以單體和二聚體的形式存在.

      圖2 TS基因組的調(diào)取 圖3 磷酸三酯酶基因的調(diào)取 圖4 PTE蛋白純化電泳 Fig.2 Extraction of TS genome Fig.3 Extraction of PTE gene Fig.4 SDS-PAGE of purified PTE

      2.4 最適溫度與pH值

      本文以甲基對氧磷為底物,利用分光光度計測定磷酸三酯酶的活力.溫度和pH值的相對活力曲線如圖5所示.由圖5(A)可見,在70~90 ℃內(nèi),酶的相對活力均大于50%,其最適溫度為70 ℃;在30~60 ℃內(nèi),酶的相對活力均低于50%.表明異源表達(dá)的磷酸三酯酶是對溫度敏感的高溫酶.

      圖5 磷酸三酯酶的最適溫度(A)和pH值(B)Fig.5 Optimal temperature (A) and pH (B) of PTE

      在70 ℃,TAPS,MES,CAPS和HEPES的緩沖液中,以甲基對氧磷作為底物,在pH=4.0~11.0內(nèi)檢測磷酸三酯酶酶活力.由圖5(B)可見,酶相對活力最高的pH=10.0.當(dāng)pH=7.0~11.0時,酶的相對活力均大于50%,當(dāng)pH=4.0~6.0時,酶的相對活力低于40%,表明重組磷酸三酯酶適合中性偏堿的環(huán)境,是一種典型的堿性磷酸水解酶.

      2.5 熱穩(wěn)定性

      磷酸三酯酶在70 ℃的相對活力與時間變化關(guān)系如圖6所示.由圖6可見,DSM-PTE具有較好的熱穩(wěn)定性.工程菌分泌的磷酸三酯酶PTE主要以二聚體形式存在,酶活力隨時間的增加而逐漸減弱,這是因?yàn)槎垠w解聚至無活力的單體所致,其半衰期為1 h.

      圖6 PTE的熱穩(wěn)定性Fig.6 Thermal stability of PTE

      綜上所述,嗜熱菌T.subterraneusDSM13965的磷酸水解酶基因編碼產(chǎn)物主要以二聚體的形式存在,并具有磷酸三酯酶的活性,在高溫下有良好的穩(wěn)定性.

      [1] Merone L,Mandrich L,Porzio E,et al.Improving the Promiscuous Nerve Agent Hydrolase Activity of a Thermostable Archaeal Lactonase [J].Bioresour Technol,2010,101(23):9204-9212.

      [2] Aubert S D,LI Ying-chun,Raushel F M.Mechanism for the Hydrolysis of Organophosphates by the Bacterial Phosphotriesterase [J].Biochemistry,2004,43(19):5707-5715.

      [3] Hong S B,Mullins L S,Shim H,et al.Mechanism-Based Inhibitors for the Inactivation of the Bacterial Phosphotriesterase [J].Biochemistry,1997,36(29):9022-9028.

      [4] ZHANG Xin,WU Rui-bo,SONG Ling-chun,et al.Molecular Dynamics Simulations of the Detoxification of Paraoxon Catalyzed by Phosphotriesterase [J].J Comput Chem,2009,30(15):2388-2401.

      [5] CHEN Lu-qing,ZHANG Xiu-yan,TANG Yan-jie,et al.Progress in the Molecular Mechanism and Strategies for Thermostability of Thermophili Enzyme [J].Bulletin of Science and Technology,2008,24(6):792-798.(陳路清,張秀艷,唐彥捷,等.嗜熱酶的穩(wěn)定機(jī)制和穩(wěn)定策略的研究進(jìn)展 [J].科技通報,2008,24(6):792-798.)

      [6] Merone L,Mandrich L,Rossi M,et al.A Thermostable Phosphotriesterase from the ArchaeonSulfolobussolfataricus:Cloning,Overexpression and Properties [J].Extremophiles,2005,9(4):297-305.

      [7] Horne I,Sutherland T D,Oakeshott J G,et al.Cloning and Expression of the Phosphotriesterase GeneHocAfromPseudomonasmonteiliiC11[J].Microbiology,2002,148(9):2687-2695.

      [8] Halio S B,Blumentals I I,Short S A,et al.Sequence,Expression in Escherichia Coli,and Analysis of the Gene Encoding a Novel Intracellular Protease (PfpI) from the Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus Furiosus [J].J Bacteriology,1996,178(9):2605-2612.

      [9] Halio S B,Bauer M W,Mukund S,et al.Purification and Characterization of Two Functional Forms of Intracellular Protease PfpI from the Hyperthermophilic ArchaeonPyrococcusfuriosus[J].Applied and Environmental Microbiology,1997,63(1):289-295.

      [10] Livnat A,Cintia R,Giuseppe M,et al.The Latent Promiscuity of Newly Identified Microbial Lactonases Is Linked to a Recently Diverged Phosphotriesterase [J].Biochemistry,2006,45(46):13677-13686.

      [11] Lawrence R G,Sarah J S,Ademir N,et al.Phosphate Ester Hydrolysis:Metal Complexes as Purple Acie Phosphatase and Phosphotriesterase Analogues [J].Eur J Inorg Chem,2009,2009(19):2745-2758.

      [12] Porzio E,Merone L,Mandrich L,et al.A New Phosphotriesterase from Sulfolobus Acidocaldarius and Its Comparison with the Homologue from Sulfolobus Solfataricu [J].Biochimie,2007,89(5):625-636.

      猜你喜歡
      水解酶有機(jī)磷基因組
      腈水解酶反應(yīng)機(jī)制與催化性能調(diào)控研究進(jìn)展
      氨基甲酸乙酯水解酶的家族生物信息學(xué)分析
      牛參考基因組中發(fā)現(xiàn)被忽視基因
      石油化工應(yīng)用(2018年3期)2018-03-24 14:54:36
      有機(jī)磷化工廢水治理方法探討
      有機(jī)磷改性納米SiO2及其在PP中的應(yīng)用
      中國塑料(2016年2期)2016-06-15 20:29:59
      有機(jī)磷中毒致周圍神經(jīng)損害的電生理研究
      基因組DNA甲基化及組蛋白甲基化
      遺傳(2014年3期)2014-02-28 20:58:49
      固相萃取填料對有機(jī)磷農(nóng)殘萃取效率
      有趣的植物基因組
      北安市| 唐山市| 若羌县| 宣武区| 布尔津县| 宝丰县| 万盛区| 家居| 丰都县| 宁波市| 孟州市| 汤阴县| 彩票| 礼泉县| 永济市| 桑日县| 甘谷县| 普兰店市| 白沙| 陈巴尔虎旗| 高陵县| 湖口县| 莫力| 原阳县| 师宗县| 旬阳县| 闽清县| 高陵县| 拉萨市| 杭州市| 秭归县| 新竹市| 鄂州市| 岳西县| 古浪县| 阿坝县| 浑源县| 大新县| 古蔺县| 余姚市| 苏尼特右旗|