P132010年巴基斯坦與洪水相關(guān)的O1群霍亂弧菌的基因組流行病學(xué)//MuhammadAliShah,AnkurMutreja,NicholasThomson等

2010年8月，巴基斯坦遭遇了大洪水及隨后的霍亂流行。為了明確巴基斯坦霍亂弧菌的菌群動(dòng)態(tài)和傳播方式，我們將所有O1群埃爾托型霍亂弧菌分離株進(jìn)行基因組測(cè)序，并與來自全球的146株霍亂弧菌基因組進(jìn)行比較。在全球的系統(tǒng)發(fā)育樹中，所有巴基斯坦分離株形成了2個(gè)新的進(jìn)化枝(PSC-1 和 PSC-2)，它們位于第七次大流行傳播的第三波譜系，并能通過基因標(biāo)志缺失和對(duì)抗菌藥物敏感性辨別。地理方面，PSC-1分離株來自沿海，而PSC-2分離株來自被印度河淹沒的內(nèi)陸地區(qū)。單核苷酸多態(tài)性聚類分析顯示，PSC-2的傳播同河道流向有關(guān)。我們發(fā)現(xiàn)2010年巴基斯坦霍亂流行至少有2個(gè)源頭，揭示了在研究霍亂暴發(fā)時(shí)全球基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的價(jià)值。

P21始祖菌肯尼迪分枝桿菌克隆在吉布提引起淋巴結(jié)結(jié)核流行//YannBlouin,GéraldineCazajous,CélineDehan等

存在于未知環(huán)境或儲(chǔ)存宿主的肯尼迪分枝桿菌(Mycobacteriumcanettii)是一種人類機(jī)會(huì)致病菌，是結(jié)核分枝桿菌的始祖菌。自1969年該菌被發(fā)現(xiàn)以來，已知約70株肯尼迪分枝桿菌分離株都來自吉布提共和國(guó)，且常分離自移居國(guó)外的兒童和成人。全基因組測(cè)序發(fā)現(xiàn)，大多數(shù)于2010年2月至2013年3月期間收集的、并與2次兒童淋巴結(jié)結(jié)核暴發(fā)流行相關(guān)的菌株，都屬于同一個(gè)獨(dú)特的肯尼迪分枝桿菌流行性克隆。1983年以來該克隆不斷發(fā)生演變，這種演變可以模擬結(jié)核分枝桿菌的起源。因此，認(rèn)識(shí)這種微生物并確定它的儲(chǔ)存宿主在臨床上具有重要性。

P29輪狀病毒疫苗接種的成本-效益動(dòng)態(tài)模型分析//BirgitteFreieslebendeBlasio,ElmiraFlem,RenatLatipov等

哈薩克斯坦是中亞的一個(gè)中等收入國(guó)家，政府正在考慮將輪狀病毒疫苗納入國(guó)家計(jì)劃免疫項(xiàng)目。我們通過使用綜合動(dòng)態(tài)傳播模型計(jì)算群體保護(hù)率，進(jìn)行跨越20年輪狀病毒疫苗接種成本-效益分析。結(jié)果顯示90%的免疫接種覆蓋率在5歲以下兒童群體減少大約880例輪狀病毒死亡，平均挽救了54 784生命年。間接保護(hù)可分別減少40%重癥及60%輕微的輪狀病毒胃腸炎。每個(gè)生命年可節(jié)省來自社會(huì)方面的費(fèi)用18 044美元及來自衛(wèi)生保健方面的費(fèi)用23 892美元。對(duì)照成本-效益的兩個(gè)主要參數(shù)，死亡率和小于2.78美元的每劑疫苗成本,計(jì)劃免疫成本應(yīng)該被完全抵消。為了進(jìn)一步評(píng)價(jià)計(jì)劃免疫項(xiàng)目的效益，由接種疫苗賦予的間接保護(hù)作用值得進(jìn)一步研究。

P382001-2010年美國(guó)明尼蘇達(dá)州散發(fā)性腸道感染病人食用生奶的情況//TrishaJ.Robinson,JoniM.Scheftel,andKirkE.Smith

生奶多次被確定為食源性疾病爆發(fā)的原因，然而，作為已記錄在冊(cè)的爆發(fā)病例，其數(shù)量?jī)H占實(shí)際生奶相關(guān)疾病病例的一小部分。常規(guī)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)分析表明，2001—2010年間明尼蘇達(dá)州報(bào)告的散發(fā)及國(guó)內(nèi)感染的腸道感染病例中有3.7%在暴露期間有食用生奶。孩子們受影響的比例更大，在這類疾病中，76%的5歲以下兒童食用了來自于自家或親戚農(nóng)場(chǎng)的生奶。21%的O157大腸桿菌感染病例報(bào)告食用生奶，其中的重癥病例包括溶血性尿毒癥，尚有1例死亡。生奶的食用者與潛在的食用者、以及那些認(rèn)為可放松生奶銷售管控的政策制定者，應(yīng)當(dāng)接受教育，了解食用生奶與疾病的關(guān)系。

P45多方驗(yàn)證隱球菌抗原側(cè)向?qū)游鲈囼?yàn)以及激光熱對(duì)比定量試驗(yàn)//DavidR.Boulware,MelissaA.Rolfes,RadhaRajasingham等

在撒哈拉沙漠以南非洲地區(qū)隱球菌腦膜炎是一種常見疾病。為評(píng)價(jià)快速、即時(shí)的隱球菌抗原(CRAG)側(cè)向免疫層析試驗(yàn)(LFA)，我們對(duì)832例疑似腦膜炎的HIV感染者(其中299例來自2006-2009年烏干達(dá)，533例來自2010—2012烏干達(dá)和南非)進(jìn)行了腦脊液(CSF)培養(yǎng)、CRAG乳膠凝集試驗(yàn)、墨汁涂片顯微鏡檢以及CRAG LFA，并評(píng)估其診斷效能。CRAG LFA其診斷效能最好(敏感性為99.3%,特異性為99.1%)，CSF培養(yǎng)的敏感性依賴于CSF量(10 μL為82.4%，100 μL為94.2%)，CRAG乳膠凝集試驗(yàn)敏感性(97.0%～97.8%)和特異性(85.9%～100%)因生產(chǎn)商而異。墨汁涂片顯微鏡檢敏感性為86%。激光熱對(duì)比定量試驗(yàn)測(cè)量免疫層析條帶中的CRAG濃度有92%的準(zhǔn)確性(R=0.91,P<0.001)。在資源有限的條件下，CRAG LFA對(duì)腦膜炎診斷是一種很大的進(jìn)步。

P54孟加拉國(guó)2010-2011年霍亂暴發(fā)期間霍亂弧菌的遺傳變異//ShahM.Rashed,AndrewS.Azman,MunirulAlam等

霍亂仍是一個(gè)主要的公共衛(wèi)生問題。為了比較外環(huán)境菌株和病人菌株在暴發(fā)中所起的不同作用，我們?cè)诿霞永瓏?guó)2個(gè)不同的地理區(qū)域收集了2010—2011年霍亂暴發(fā)期間的標(biāo)本，對(duì)其進(jìn)行多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析。我們系統(tǒng)地收集了222株來自Chhatak和Mathbaria外環(huán)境及臨床的O1群霍亂弧菌菌株。Chhatak的79株菌株中有75株來自同一克隆復(fù)合群，該復(fù)合群在單一基因位點(diǎn)隨時(shí)間發(fā)生連續(xù)廣泛的突變。共有59株分離自6位患者，大多數(shù)來自同一患者的分離株出現(xiàn)連續(xù)的單位點(diǎn)突變。Mathbaria的84株菌株中有60株形成2個(gè)獨(dú)立的克隆復(fù)合群。與來自環(huán)境的菌株相比，來自患者的菌株形成的遺傳譜系數(shù)量較少，這與疾病暴發(fā)期間某些菌株在人間加速傳播的現(xiàn)象相吻合。