李素麗 周 芳 張慶瑜△ 賈文亮 張安玲 韓 磊 康春生
microRNA(miRNA)是長(zhǎng)約22 nt的短鏈RNA,可與miRNA反應(yīng)元件(miRNA response elements,MREs)互補(bǔ)結(jié)合,結(jié)合后能夠通過(guò)促進(jìn)靶mRNA的降解和(或)抑制其翻譯而負(fù)性調(diào)控基因的表達(dá)。人們對(duì)miRNA-mRNA已有足夠的認(rèn)識(shí),但關(guān)于mRNA-miRNA反向作用卻知之甚少。已證實(shí)MREs能夠作用于miRNAs,從而調(diào)節(jié)后者的作用[1-2]。Tay等[3]證實(shí)腫瘤抑制因子PTEN假基因(PTENP1)的3′非翻譯區(qū)(UTR)能與PTEN結(jié)合相同的miRNA,以miRNA依賴的方式調(diào)控細(xì)胞PTEN和P-Akt蛋白水平。miR-200a/b/c在胃癌中低表達(dá),通過(guò)抑制E盒結(jié)合鋅指蛋白(ZEB)的表達(dá),調(diào)節(jié)腫瘤的發(fā)生發(fā)展[4-5]。因此,本研究應(yīng)用人工合成ZEB2 3′UTR轉(zhuǎn)染人胃黏膜上皮細(xì)胞GES-1,研究其對(duì)miR-200家族的調(diào)節(jié)作用,觀察并分析其對(duì)GES-1的影響,旨在從其增殖、遷移、侵襲力方面探討ZEB2 3′UTR導(dǎo)致正常胃黏膜上皮細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的可能性。
1.1 實(shí)驗(yàn)材料 ZEB2 3′UTR質(zhì)粒由南京金斯瑞公司合成;QIAGEN質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)自德國(guó)QIAGEN公司,Trizol試劑及轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2000購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司,ZEB1、ZEB2單克隆抗體購(gòu)自美國(guó)Abcam公司,基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)-2/9、增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)及相應(yīng)二抗均購(gòu)自中杉金橋公司;dNTP mixture、反轉(zhuǎn)錄酶(MMLV)、RNase抑制劑購(gòu)自大連Takara公司,逆轉(zhuǎn)錄引物及qRT-PCR引物、熒光定量miRNA PCR試劑盒、miR-200b micmics購(gòu)自上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司;matrigel購(gòu)自美國(guó)BD公司;GES-1由天津醫(yī)科大學(xué)神經(jīng)腫瘤研究所饋贈(zèng)。
1.2 方法
1.2.1 質(zhì)粒的構(gòu)建與提取 利用GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)檢索ZEB2基因序列(Gen Bank,NM_001171653.1,NM_014795.3)找出其3′UTR含miR-200家族的結(jié)合序列全長(zhǎng),選用PGL3-Control表達(dá)載體。將序列交由南京金斯瑞公司合成,見(jiàn)圖1。根據(jù)QIAGEN質(zhì)粒中提試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行質(zhì)粒的提取與純化。
1.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)與分組處理 GES-1細(xì)胞用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,于含5%CO2,37℃的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。第一部分:檢測(cè)ZEB2 3′UTR轉(zhuǎn)染后對(duì)ZEB1/ZEB2 mRNA、蛋白水平及miR-200a/b/c的影響;實(shí)驗(yàn)分為對(duì)照組、突變組和ZEB2 3′UTR組。第二部分:驗(yàn)證miR-200b在ZEB2 3′UTR轉(zhuǎn)染后調(diào)節(jié)增殖、侵襲、遷移中的作用;實(shí)驗(yàn)分為對(duì)照組、ZEB2 3′UTR組、ZEB2 3′UTR+無(wú)義序列組、ZEB2 3′UTR組+miR-200b micmics組。根據(jù)Lipofectamine2000轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行轉(zhuǎn)染,繼續(xù)處理細(xì)胞48 h后進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
1.2.3 qRT-PCR檢測(cè)細(xì)胞miR-200a/b/c及ZEB1/ZEB2的表達(dá)變化 Trizol法提取待測(cè)細(xì)胞總RNA,按試劑盒說(shuō)明書(shū)應(yīng)用ZEB1、ZEB2、miR-200a/b/c特異性逆轉(zhuǎn)錄、PCR引物及相應(yīng)組分配置反應(yīng)體系。microRNA逆轉(zhuǎn)錄條件:16℃30 min,42℃30 min,85℃10 min。所得逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物cDNA行qRTPCR檢測(cè)各組miR-200a/b/c的表達(dá)水平,反應(yīng)條件:95℃10 min;95℃15 s,65℃30 s,72℃30 s;共40個(gè)循環(huán)。ZEB1、ZEB2 cDNA模板合成條件:42℃1 h。PCR擴(kuò)增,其特異性引物序列,見(jiàn)表1。擴(kuò)增條件:94℃12 min,94℃30 s,58℃30 s,72℃30 s,共40個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min。分別以U6、GAPDH作為內(nèi)參,結(jié)果判定采用2-ΔΔCT法。
Figure 1 Schematic representation of the ZEB2 3′UTR plasmid constructs圖1 ZEB2 3′UTRs區(qū)質(zhì)粒構(gòu)建示意圖
Table 1 The qRT-PCR primers sequences of ZEB1/ZEB2/GAPDH表1ZEB1、ZEB2、GAPDH qRT-PCR引物序列
1.2.4 Western blot檢測(cè)細(xì)胞蛋白表達(dá)水平 用細(xì)胞裂解液RIPA裂解提取待測(cè)細(xì)胞的總蛋白。SDS-PAGE凝膠電泳分離,恒壓80 V電轉(zhuǎn)移至PVDF印跡膜。膜封閉液封閉1 h后,加入一抗ZEB1、ZEB2、MMP2/9、PCNA、GAPDH(1∶1 000稀釋)4℃孵育過(guò)夜。用辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的二抗(1∶1 000稀釋),室溫孵育1 h,凝膠成像系統(tǒng)采集成像。GAPDH蛋白作為內(nèi)參。以目標(biāo)蛋白條帶灰度值/同一樣本內(nèi)參條帶灰度值計(jì)算目標(biāo)蛋白相對(duì)表達(dá)量。
1.2.5 Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞侵襲能力 在Transwell上室聚碳酸酯濾膜(孔徑8 μm)上加入預(yù)冷無(wú)血清DMEM培養(yǎng)基稀釋的Matrigel基質(zhì)膠(Matrigel∶DMEM=1∶2)100 μL,37℃30 min后待其凝固,接種100 μL無(wú)血清培養(yǎng)基稀釋GES-1細(xì)胞(1×106個(gè)/mL),下室加入600 μL含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液,每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔。37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)24 h后,棄去上室液體,用棉簽輕輕擦掉上層未遷移細(xì)胞,蘇木精染色。DP-70熒光相差倒置顯微鏡(×100)采集圖像,隨機(jī)讀取3個(gè)視野,計(jì)算穿過(guò)膜的細(xì)胞數(shù)。
1.2.6 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移能力 將已轉(zhuǎn)染的細(xì)胞放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中孵育。次日用200 μL微量移液槍頭在6孔板內(nèi)垂直及平行劃痕,PBS液洗滌2次后加入無(wú)血清培養(yǎng)基,在倒置顯微鏡下觀察0、48 h后劃痕兩側(cè)細(xì)胞的遷移情況并拍照。距離差除以2為細(xì)胞相對(duì)遷移距離,計(jì)算細(xì)胞相對(duì)遷移率(相對(duì)遷移率=相對(duì)遷移距離/0 h時(shí)劃痕邊緣距劃痕中線距離),重復(fù)3次并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
1.2.7 MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖活性 取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期細(xì)胞,常規(guī)胰酶消化制成單細(xì)胞懸液,細(xì)胞以4×103個(gè)/孔接種于96孔培養(yǎng)板中,每孔加入100 μL培養(yǎng)基,5%CO2、37℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24 h后轉(zhuǎn)染。取3組細(xì)胞測(cè)其吸光度(A)值,每組3個(gè)復(fù)孔,每24 h測(cè)1次。測(cè)時(shí)每孔加入20 μL(5 g/L)MTT,溫育4 h后,棄去培養(yǎng)基,加入200 μL DMSO,振蕩10 min。在酶標(biāo)儀上測(cè)490 nm處各孔的A值,計(jì)算生長(zhǎng)增殖率=(實(shí)驗(yàn)組A490值/對(duì)照組A490值-1)×100%。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 應(yīng)用SPSS 18.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,3組及以上數(shù)據(jù)間比較采用單因素方差分析,組間多重比較采用LSD-t法,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR對(duì)GES-1細(xì)胞miR-200a/b/c及ZEB1、ZEB2 mRNA表達(dá)水平的影響 結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR后,GES-1細(xì)胞中miR-200a/b/c表達(dá)水平較對(duì)照組及突變組明顯下降,以miR200b下調(diào)最為顯著(均P<0.01),突變組較對(duì)照組無(wú)明顯改變,見(jiàn)圖2。ZEB1及ZEB2 mRNA表達(dá)水平較對(duì)照組及突變組明顯上升(均P<0.01),見(jiàn)圖3。
2.2 Western blot檢測(cè)轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR后ZEB1/ ZEB2蛋白表達(dá)變化 轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR后,GES-1細(xì)胞中ZEB1和ZEB2蛋白相對(duì)表達(dá)水平較對(duì)照組、突變組明顯升高(P<0.01),見(jiàn)圖4、表2。
2.3 轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR及恢復(fù)miR-200b micmics表達(dá)后對(duì)細(xì)胞侵襲、遷移能力的影響 ZEB2 3′UTR+ miR-200b micmics組miR-200b的表達(dá)水平高于其他3組,見(jiàn)圖5。Transwell體外侵襲實(shí)驗(yàn)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后穿過(guò)微孔的平均細(xì)胞數(shù)目,結(jié)果顯示,ZEB2 3′UTR組較對(duì)照組均明顯升高,而聯(lián)合miR-200b micmics后,穿過(guò)小室的細(xì)胞數(shù)較ZEB2 3′UTR組明顯減少(均P<0.01),見(jiàn)圖6、表3。劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,48 h后ZEB2 3′UTR組細(xì)胞運(yùn)動(dòng)速度明顯快于對(duì)照組,遷移率顯著升高,而恢復(fù)miR-200b表達(dá)后,其遷移能力有所下降(P<0.01),見(jiàn)圖6、表3。且MMP2/9侵襲指標(biāo)也出現(xiàn)相應(yīng)變化,見(jiàn)圖7、表4。
Figure 2 Comparison of miR-200a/b/c expression levels between three groups圖2 各組細(xì)胞的miR-200a/b/c表達(dá)水平比較(n=3)
Figure 3 Comparison of ZEB1 and ZEB2 expression levels between three groups圖3 各組細(xì)胞的ZEB1、ZEB2表達(dá)水平比較(n=3)
Figure 4 The protein expression levels of ZEB1/ZEB2 in three groups圖4 3組細(xì)胞內(nèi)ZEB1/ZEB2蛋白表達(dá)水平
Table 2 Comparison of protein expression levels of ZEB1/ZEB2 between three groups表2 各組細(xì)胞中ZEB1/ZEB2蛋白表達(dá)水平比較(n=3,±s)
Table 2 Comparison of protein expression levels of ZEB1/ZEB2 between three groups表2 各組細(xì)胞中ZEB1/ZEB2蛋白表達(dá)水平比較(n=3,±s)
**P<0.01;a與對(duì)照組比較,b與突變組比較,P<0.05
組別對(duì)照組(1)突變組(2)ZEB2 3′UTR組(3)F ZEB1相對(duì)表達(dá)量0.23±0.02 0.22±0.01 0.41±0.07ab 35.344**ZEB2相對(duì)表達(dá)量0.10±0.03 0.10±0.07 0.19±0.02ab 40.700**
Figure 5 The expression levels of miR-200b evaluated by qRT-PCR in four groups圖5 qRT-PCR檢測(cè)不同處理組miR-200b的表達(dá)水平
Table 3 Comparison of the invasive capability and migrating rates after transfection between four groups表3 4組轉(zhuǎn)染后細(xì)胞侵襲能力及細(xì)胞遷移率比較(n=3,±s)
Table 3 Comparison of the invasive capability and migrating rates after transfection between four groups表3 4組轉(zhuǎn)染后細(xì)胞侵襲能力及細(xì)胞遷移率比較(n=3,±s)
**P<0.01;a與(1)組比較,b與(2)組比較,c與(3)組比較,P<0.01;表4同
組別對(duì)照組(1)ZEB2 3′UTR組(2)ZEB2 3′UTR+無(wú)義序列組(3)ZEB2 3′UTR+200b micmics組(4)F穿膜細(xì)胞數(shù)(個(gè))45.67±3.21 76.33±3.78a 77.33±2.51a 47.33±3.79bc 81.353**48 h遷移率(%)24.91±2.56 52.45±2.63a 54.01±3.10a 26.33±3.02bc 94.602**
2.4 MTT檢測(cè)轉(zhuǎn)染后細(xì)胞增殖活性 4組之間A490值于第1天差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=0.995,P>0.05),第2~6天差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F分別為8.630、18.377、11.925、24.545、35.058,均 P<0.01);且ZEB2 3′UTR組A490值于第2~6天較對(duì)照組及ZEB2 3′UTR+miR-200b micmics組顯著升高(均P<0.01);而ZEB2 3′UTR+miR-200b micmics組A490值于第1~6天和對(duì)照組比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),見(jiàn)圖8。相應(yīng)反映增殖能力指標(biāo)的PCNA蛋白與生長(zhǎng)曲線一致,出現(xiàn)相應(yīng)變化,見(jiàn)圖7、表4。
Figure 6 Comparison of trans-membrane cell numbers and migrating rates between four groups(×100)圖6 4組細(xì)胞中穿過(guò)小室細(xì)胞數(shù)及遷移率比較(×100)
Figure 7 The protein expression levels of MMP2/9 and PCNA in four grouops圖74組細(xì)胞內(nèi)MMP2/9及PCNA蛋白表達(dá)水平
Figure 8 The growth curves of GES-1 in different groups圖8 不同處理組GES-1細(xì)胞的生長(zhǎng)曲線
Table 4 Comparison of protein expression levels of MMP2/9 and PCNA between four groups表4 各組細(xì)胞中MMP2、MMP9和PCNA蛋白表達(dá)水平比較(n=3,±s)
Table 4 Comparison of protein expression levels of MMP2/9 and PCNA between four groups表4 各組細(xì)胞中MMP2、MMP9和PCNA蛋白表達(dá)水平比較(n=3,±s)
組別對(duì)照組(1)ZEB2 3′UTR組(2)ZEB2 3′UTR+無(wú)義序列組(3)ZEB2 3′UTR+miR-200b micmics組(4)F MMP2 0.28±0.02 0.53±0.01a 0.55±0.05a MMP9 0.36±0.03 0.69±0.03a 0.67±0.04a PCNA 0.63±0.03 1.03±0.05a 1.01±0.06a 0.30±0.03bc 77.993**0.39±0.02bc 107.487**0.66±0.02bc 69.147**
3.1 mRNA-miRNA反向作用的機(jī)制 近期提出的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceR?NA)假說(shuō)認(rèn)為:mRNA、被轉(zhuǎn)錄的假基因和長(zhǎng)的非編碼RNA之間能夠通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)miRNA的方式進(jìn)行交互對(duì)話,這種作用依賴于“MREs”[6]。RNA之間通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合相應(yīng)的miRNA,對(duì)該miRNA的后續(xù)轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用發(fā)生有效的控制。Sumazin等[7]繪制出了惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞中RNA相互作用網(wǎng)絡(luò),有超過(guò)7 000種基因編碼RNA以借助miRNA的方式發(fā)生了相互作用,與癌癥相關(guān)的基因起著重要的調(diào)控作用,從而參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。
3.2 3′UTR在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的調(diào)節(jié)作用 PTENP1的3′UTR及PTEN ceRNA ZEB2能與PTEN結(jié)合相同的miRNA,以miRNA依賴的方式調(diào)控細(xì)胞內(nèi)PTEN和P-Akt蛋白水平;其缺失可致PI3K/AKT信號(hào)激活,誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生[3,8]。外源性表達(dá)“miRNA海綿”能夠有效特異地抑制miRNA的功能[9]。含MREs的3′UTR具有強(qiáng)大的生物學(xué)活性,成為miRNA“誘餌”,螯合miRNA,從而影響它們對(duì)所表達(dá)的基因的調(diào)控。本研究中轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR后,ZEB1/ZEB2 mRNA及蛋白水平均升高,可能與上述機(jī)制有關(guān)。
3.3 ZEB2 3′UTR對(duì)細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的影響及可能機(jī)制 本研究轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR質(zhì)粒后,miR-200a/b/c表達(dá)下調(diào),以miR-200b降低最為明顯,此變化可能與2種因素有關(guān):一方面,特異的miRNA結(jié)合位點(diǎn)結(jié)構(gòu)與miRNA結(jié)合后觸發(fā)miRNA加尾和3′→5′修剪及亞細(xì)胞定位而影響miRNA的穩(wěn)定性有關(guān)[10-11];另一方面,ZEB1/ZEB2能結(jié)合miR-200b/200a/429啟動(dòng)子區(qū)以調(diào)節(jié)其表達(dá)[12],ZEB2 3′UTR的導(dǎo)入引起miR-200家族表達(dá)降低,進(jìn)而減弱其對(duì)ZEB1/ZEB2的抑制作用,升高的ZEB1/ZEB2則進(jìn)一步加強(qiáng)了其對(duì)miR-200家族成員的表達(dá)抑制作用,形成一個(gè)正反饋調(diào)節(jié)作用?;謴?fù)miR-200b表達(dá)后,細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化能力部分被逆轉(zhuǎn),ZEB2 3′UTR對(duì)miR-200b的調(diào)控可能是其發(fā)揮作用的主要機(jī)制之一。
ZEB2 3′UTR可以促進(jìn)人胃黏膜上皮細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化傾向,此作用可能與轉(zhuǎn)染ZEB2 3′UTR后調(diào)控miR-200家族進(jìn)而影響相應(yīng)的靶基因ZEB1/ZEB2的表達(dá)有關(guān)。本研究證實(shí)了非編碼轉(zhuǎn)錄在基因規(guī)模上的影響,有望為抑制GES-1細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化提供新的途徑或方法。
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