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      乳酸菌能量代謝的蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展

      2014-04-06 03:15:35劉海新
      化學(xué)與生物工程 2014年1期
      關(guān)鍵詞:蘋果酸球菌乳酸菌

      劉海新

      (青島科技大學(xué)化工學(xué)院,山東 青島266042)

      乳酸菌是非常有趣的生物體,約3億年前,它們起源于厭氧到需氧的過渡時期,并且在演化過程中從未獲得過合成血紅素的能力。存在于細(xì)胞色素、過氧化物酶和過氧化氫酶中的卟啉可使它們進(jìn)行有氧和無氧呼吸及氧自由基的解毒作用。乳酸菌的病原菌種,即鏈球菌,可以通過來自動物宿主的溶血素混入細(xì)胞色素來減少血紅素,從而獲得減少氧氣及加快新陳代謝的功能性呼吸鏈,其它乳酸菌物種則被迫生活在具有較低能量的發(fā)酵代謝中。與厭氧細(xì)菌不同的是,乳酸菌在氧氣中也可以存活[1]。由于缺乏血紅素,它們抵抗氧氣的防御機制主要是以金屬的積累為基礎(chǔ)。事實上,有些乳酸菌物種能夠在細(xì)胞內(nèi)積累大量的錳(可達(dá)25mmol)、硒和鋅。錳可以充當(dāng)類似超氧化物歧化酶的角色,而硒可以在硒代胱氨酸系統(tǒng)中充當(dāng)自由基清除劑,鋅構(gòu)成了氧自由基的離子捕集器。所有這些能力使乳酸菌成為耐氧的厭氧菌,也為其憑借腸道環(huán)境中的金屬濃度成為有益菌種提供了可能。某些異型發(fā)酵的乳酸菌物種可以通過一個簡短的電子傳輸鏈(NADH-黃素-O2)將氧氣還原為水,從而消除氧氣,并最終通過乙酰磷酸產(chǎn)生的醋酸將NADH重新氧化為NAD+,從而維持了系統(tǒng)的循環(huán)。

      由于乳酸菌的生物合成能力有限,因此它們可以與為其提供糖類、維生素和氨基酸的動植物形成共生或寄生關(guān)系。另外,乳酸菌可以生活在食物生態(tài)環(huán)境中,因而普遍存在于水果、蔬菜、奶酪、葡萄酒,特別是牛奶中。牛奶因為含有豐富的乳糖,從而成為乳酸菌首選的生活環(huán)境。異型發(fā)酵乳酸菌可以產(chǎn)生100%的乳酸,兼同型和異型發(fā)酵的乳酸菌可以產(chǎn)生乳酸、乙醇和乙酸。在兼同型和異型發(fā)酵的乳酸菌中,1mol戊糖發(fā)酵代謝可以多產(chǎn)生2mol ATP。同型發(fā)酵的乳酸菌可以從己糖中獲得2mol ATP,而異型乳酸菌只能得到1mol ATP[2]。除了底物磷酸化,一些乳酸菌還可以從質(zhì)子運輸中獲得能量。

      乳酸菌具有悠久的歷史、顯明的特征及與人類生活息息相關(guān)等特點。正是憑借這些特點,乳酸菌受到了各國科研人員的關(guān)注,近年來相關(guān)研究成果層出不窮。特別是最近幾年,利用蛋白質(zhì)組學(xué)作為研究工具對乳酸菌進(jìn)行研究更是成為了生物、醫(yī)學(xué)界關(guān)注的熱點。作者在此概述了乳酸菌能量代謝的蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展,并討論了代謝路徑之間的相互關(guān)系。

      1 乳酸菌替代能源途徑的影響因素

      由于乳酸發(fā)酵是乳酸菌獲得能量的主要途徑,因此在同型乳酸菌物種和可以產(chǎn)生醋酸的異型乳酸菌物種中,減小pH值十分必要。在某些物種中,pH值減小可以通過質(zhì)子或底物的同向運輸來實現(xiàn),系統(tǒng)產(chǎn)生電子并排出質(zhì)子,但不能在低pH值下工作,因為乳酸的pKa是3.9,低于此值時乳酸不能解離,只可以通過被動擴散排出,每摩爾乳酸只能排出1個質(zhì)子[3]。低pH值可能誘發(fā)其它系統(tǒng)來緩沖乳酸的酸性,如氨基酸脫羧或ADI途徑等。

      1.1 氨基酸脫羧反應(yīng)對pH值的控制

      在大腸桿菌中,細(xì)胞外的低pH值將引起cad編碼操縱子由賴氨酸轉(zhuǎn)換為尸胺,并引起谷氨酸轉(zhuǎn)化為氨基丁酸谷氨酸脫羧酶[4],在這些比乳酸菌演化更高級的革蘭氏陰性菌中,氨基酸脫羧路線的活化與能源需求沒有必然的聯(lián)系,因為還有其它可供選擇的發(fā)酵途徑。因此,氨基酸脫羧反應(yīng)的主要生理功能是控制pH值,例如為了在胃管道中存活而調(diào)節(jié)pH值。乳酸菌中氨基酸的脫羧反應(yīng)至少在3個水平上進(jìn)行pH值調(diào)節(jié):微生物種群的篩選、脫羧酶的催化活化和脫羧酶合成的過度表達(dá)。

      1.2 ADI途徑

      和氨基酸脫羧反應(yīng)類似,人們發(fā)現(xiàn)葡萄酒中的乳酸菌的ADI途徑也可被不同的酸性pH值(pH>3.2)激活。由此路徑產(chǎn)生的氨氣,有助于細(xì)胞承受低pH值(pH<4)及保護口腔鏈球菌[5-6]、乳酸菌和酸性應(yīng)力下的干酪乳酸球菌。相比之下,在酵母株乳酸菌Sanfrancisciensis中觀測到不需要控制pH值的ADI途徑表達(dá)。

      1.3 乳酸發(fā)酵

      乳酸發(fā)酵通常在pH值呈酸性(pH值為3左右)時進(jìn)行。Gockowiak和Henschke指出,L-蘋果酸的降解速率在pH值為3.5和2.9時分別以每周3.1g·L-1和8.0g·L-1的速率急劇下降。Rosi等[7]也發(fā)現(xiàn)乳酸菌的代謝活性在pH值為3.2時會下降,因為pH值為3.2時蘋果酸的完全降解需要15d,而pH值為3.6時只需10d。

      1.4 ATP的控制

      促進(jìn)ATP合成的條件不利于 ADI的途徑[8]。ATP濃度和乳酸乳球菌的氨基甲酸酯類激酶的生物合成之間的反比關(guān)系表明,ADI途徑是在ATP衰竭的情況下被激活的[9-10]。有假設(shè)認(rèn)為即使ATP不足,三磷酸腺苷和精氨酸也可以通過促進(jìn)擴散或利用低pH值條件下的跨膜質(zhì)子梯度進(jìn)入細(xì)胞。

      1.5 生長期的控制

      將不同生長期當(dāng)作同一參數(shù)來評估路徑的激活是不正確的。事實上,在每個階段各種復(fù)雜因素在不同程度上發(fā)揮作用,這取決于培養(yǎng)基條件、媒介、菌株、養(yǎng)分供應(yīng)和輔源營養(yǎng)等等。Pessione等通過胺測定和蛋白質(zhì)組學(xué)研究,檢測到組胺的過度積累與乳酸桿菌穩(wěn)定生長期的HDC的過度表達(dá)相關(guān)聯(lián)。對乳酸乳球菌NCDO2118中γ-氨基丁胺的研究也得到了類似的結(jié)果。

      2 碳底物對乳酸菌能量代謝的影響

      除了pH值降低和ATP減少之外,人們認(rèn)為激活普通有機酸和氨基酸產(chǎn)能反應(yīng)的另一個因素是碳水化合物不足。而對于MLF、氨基酸脫羧和ADI途徑中糖類的影響,文獻(xiàn)中卻顯示出相反的結(jié)果。從物種到物種(有時從菌株到菌株)之間存在著巨大的差異[11]。

      2.1 氨基酸脫羧反應(yīng)

      糖類可以影響氨基酸脫羧路徑。Lonvaud-Funel等[12]研究表明,發(fā)酵糖的不足可以提高澳球菌中組胺生產(chǎn)量。隨后Rollan證實澳球菌中葡萄糖的量不影響HDC的催化過程,由此引入了對HDC操縱子進(jìn)行生物合成的假說。最近,Pessioneet等對Lactobacillus菌種的研究表明,葡萄糖耗盡時存在HDC的誘導(dǎo)。此外,雖然糖消耗能增強組氨酸脫羧作用且不發(fā)生酪胺積累,但對L.hilgardii和P.parvulus的研究已明確證實了葡萄糖和果糖對HDC編碼操縱子的抑制作用。糖在氨基酸脫羧途徑中的影響尚未完全明確,初步推斷,它與特定的氨基酸、氨反應(yīng)及與不同菌種的關(guān)系似乎比其它微生物物種更加密切,因為L.hilgardii同時具有兩種現(xiàn)象。

      2.2 ADI途徑

      1987年,Poolman等[9]在乳酸乳球菌的ADI酶生物合成途徑中進(jìn)行了葡萄糖的陰性對照研究,結(jié)果表明,cAMP的拮抗與分解抑制是相兼容的。在果糖加蔗糖和葡萄糖加乳糖中,鏈球菌和乳酸菌Leichmanii得到了相似的結(jié)果。微生物的合成抑制和負(fù)催化調(diào)控已經(jīng)通過乳酸球菌與L.buchneri中3個主要的ADI途徑酶(ADI、OTC、CK)得到證實。盡管在L.sakei中已發(fā)現(xiàn),但負(fù)合成調(diào)控在這些研究結(jié)果中可能是由于物種或菌種差異引起的,ADI途徑的最終結(jié)果可能是合成和催化調(diào)節(jié)的共同結(jié)果。Jonsson和de Angelis等對L.plantarum、L.buchneri和Sanfrancisciensis的研究證明了葡萄糖在ADI途徑中發(fā)揮作用。這些研究表明要激活A(yù)DI途徑,少量的葡萄糖是必需的。pH值較高時,精氨酸才可以進(jìn)入細(xì)胞,并在精氨酸操縱子作用下發(fā)揮其激活作用。然而,仍不能解釋為什么都能產(chǎn)生能量及不同的糖(果糖、蔗糖、乳糖、半乳糖)或高血糖濃度卻產(chǎn)生相反效果等問題。

      2.3 蘋果酸-乳酸發(fā)酵

      乳酸菌中糖的代謝和蘋果酸-乳酸發(fā)酵之間的關(guān)系并沒有得到廣泛研究。Davies等觀察到,澳球菌生長中,在存在葡萄糖、果糖和蘋果酸的情況下,蘋果酸是同時與乳酸產(chǎn)生及消耗的,然而葡萄糖和果糖均不減少。這表明,碳底物酸和糖同時存在時,細(xì)菌傾向于通過蘋果酸-乳酸發(fā)酵消耗蘋果酸。其它研究也表明,在沒有發(fā)酵糖的蘋果酸合成培養(yǎng)基中乳酸菌不能生長。因此,作為MLF唯一補充碳源,盡管L-蘋果酸可以為利用底物補充能量,但它不能作為增長過程的唯一碳源。Landete等還觀察到蘋果酸乳酸酶的表達(dá)可以被葡萄糖激活,而蘋果酸酶基因的表達(dá)卻被葡萄糖抑制[13]。

      3 結(jié)語

      乳酸菌中產(chǎn)生能量的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)比以前人們認(rèn)為的要復(fù)雜得多。利用尖端的技術(shù),如轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),生物合成調(diào)控是普遍存在的,而催化控制至關(guān)重要,調(diào)節(jié)基因表達(dá)往往存在不同的路線。此外,蛋白水解系統(tǒng)和蛋白激酶是相互協(xié)作的,它們一起抵制能量產(chǎn)生過程中pH值的變化等,這是乳酸菌通過漫長的進(jìn)化所得到的結(jié)果。

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