郭文逸,潘學(xué)瑋,尤甲甲,楊洪江
(天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院工業(yè)微生物教育部重點實驗室,天津市工業(yè)微生物重點實驗室,天津,300457)
微生物具有生產(chǎn)2,3-丁二醇的能力,其中肺炎克雷伯氏菌為常用的生產(chǎn)菌株,但該菌株為條件致病菌,不利于大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn)[1]。地衣芽胞桿菌屬于GRAS(generally recognized as safe)菌株,具有生長繁殖迅速、代謝快、產(chǎn)生多種蛋白酶等特點,利于產(chǎn)物的快速生成,并且它能夠產(chǎn)生芽孢,抗逆性強[2],所以近年來有越來越多關(guān)于地衣芽孢桿菌產(chǎn)2,3-丁二醇的報道。
在前期實驗中,篩選到1株地衣芽孢桿菌BL41[3]。發(fā)酵后期,發(fā)酵液的 OD600值逐漸下降,且逐漸變黏稠,與之相對應(yīng),2,3-丁二醇的合成能力逐步下降。本文通過分析胞外多糖、聚谷氨酸產(chǎn)量以及細(xì)菌數(shù)量的變化,最終發(fā)現(xiàn)此現(xiàn)象主要由細(xì)胞自溶引起。因此推測,如果發(fā)酵后期細(xì)胞自溶水平下降,即可防止菌株生物量快速減少,2,3-丁二醇產(chǎn)率增加,從而提高2,3-丁二醇的產(chǎn)量。因此對該菌株進行紫外誘變,在篩選平板中獲得自溶水平低的突變株,進而篩選得到高產(chǎn)2,3-丁二醇的菌株。
LB培養(yǎng)基(g/L):酵母粉5,蛋白胨10,NaCl 10。MR-VP 培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨7,葡萄糖5,K2HPO45。種子培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖40,酵母粉10,硫酸銨1,K2HPO41。發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖100,酵母粉5,蛋白胨 12,MnSO40.025,K2HPO43,MgSO40.2,乙酸鈉5。上述培養(yǎng)基pH值均為7.0,除LB培養(yǎng)基121℃滅菌20 min外,其余培養(yǎng)基均為115℃滅菌20 min。
自溶檢測培養(yǎng)基:將菌株BL41單菌落接種于600 mL的液體LB培養(yǎng)基中,37℃,220 r/min培養(yǎng)3~4 h,菌體濃度達(dá)到108,100 ℃煮1 h,殺死細(xì)胞,于4 000 r/min離心10 min,棄去上清液,將菌體細(xì)胞加到200 mL無菌的LB瓊脂培養(yǎng)基中制備平板,用于篩選自溶水平低的突變株[4]。
1.2.1 胞外多糖和聚谷氨酸的測定
以葡萄糖為標(biāo)準(zhǔn),繪制葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線。利用醇沉法沉淀發(fā)酵液中多糖,沉淀重懸制成多糖溶液,采用苯酚硫酸法測定其胞外多糖產(chǎn)量[5]。
采用生物傳感儀測定發(fā)酵液水解前后谷氨酸含量,其差值為 γ-聚谷氨酸的產(chǎn)量[6]。
1.2.2 菌株生物量的測定
將單菌落進行兩級種子培養(yǎng)后,按5%的接種量轉(zhuǎn)接到30 mL發(fā)酵培養(yǎng)基中,37℃,160 r/min培養(yǎng),選取不同時間點取樣,稀釋10-6后涂布于LB平板上,37℃培養(yǎng)12 h,然后記錄菌落數(shù)。
1.2.3 紫外誘變篩選高產(chǎn)2,3-丁二醇菌株
將菌株BL41紫外誘變[3]后避光培養(yǎng)24 h,然后取100 μL轉(zhuǎn)接于新鮮LB中,37℃,220 r/min培養(yǎng),每隔12 h轉(zhuǎn)接1次,轉(zhuǎn)接30代后將其稀釋涂板,避光培養(yǎng)48 h后觀察菌落周圍透明圈大小。選取自溶水平低的突變株進行肌酸比色實驗,從而獲得高產(chǎn)乙偶姻菌株[4]。將上述菌株分別進行兩級種子培養(yǎng)后接種于初始葡萄糖質(zhì)量濃度分別為100、120、140、160 g/L的發(fā)酵培養(yǎng)基中,利用氣相色譜法分別測定36、42、48 h 時2,3-丁二醇產(chǎn)量,從而篩選高產(chǎn) 2,3-丁二醇菌株。
1.2.4 四聯(lián)發(fā)酵罐的分批補料實驗
為進一步確定突變株的生產(chǎn)能力,在四聯(lián)發(fā)酵罐中進行分批補料發(fā)酵,菌種經(jīng)過兩級種子培養(yǎng)后按5%接種量接入600 mL的發(fā)酵培養(yǎng)基中,培養(yǎng)溫度為37℃,通氣量2 vvm。前期轉(zhuǎn)速為400 r/min,14 h后降低為200 r/min。通過補加一定量的葡萄糖,殘?zhí)菨舛染S持在30 g/L左右。初始pH為7.0,隨著發(fā)酵的進行,pH會先下降然后再上升,當(dāng)pH上升到6.5時,補加氨水使其降到6.0。
1.2.5 分析檢測方法
利用紫外分光光度計測定OD600。發(fā)酵上清液過膜后,稀釋100倍利用生物傳感儀測定葡萄糖濃度。發(fā)酵上清液過膜后,稀釋10倍利用氣相色譜法測定2,3-丁二醇和乙偶姻含量[3]。
地衣芽孢桿菌BL41在發(fā)酵過程中發(fā)酵液變黏稠,推測為其產(chǎn)生了胞外多糖或γ-聚谷氨酸。然而苯酚硫酸法結(jié)果顯示,發(fā)酵液中胞外多糖的含量僅為1.0 g/L,含量較低。因此,這不是發(fā)酵液黏稠的主要原因。通過生物傳感儀測定發(fā)酵液及其水解樣品中谷氨酸含量,結(jié)果顯示均為0.2 g/L,說明發(fā)酵液中無γ-聚谷氨酸產(chǎn)生,這也不是引起發(fā)酵液黏稠的原因。
進一步推測地衣芽孢桿菌BL41在發(fā)酵中存在細(xì)胞自溶現(xiàn)象,導(dǎo)致OD600值顯著下降和胞內(nèi)核酸和蛋白質(zhì)等大分子釋放到培養(yǎng)基中,使發(fā)酵液變黏。瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,12 h的發(fā)酵上清液中沒有DNA條帶產(chǎn)生,此時細(xì)胞處于對數(shù)期,沒有顯著自溶現(xiàn)象發(fā)生,無大分子物質(zhì)泄露到細(xì)胞外;而隨著發(fā)酵的進行,在24 h和48 h的樣品中,均出現(xiàn)大于15 kb的DNA條帶,特別是36 h樣品中的DNA數(shù)量要顯著多于24 h的樣品,且伴隨明顯的DNA降解現(xiàn)象(圖1)。
同時,采用涂板方法直接測定地衣芽孢桿菌BL41的生物量。發(fā)酵前期,細(xì)菌數(shù)量逐漸增加,12 h時達(dá)到最高,菌濃為3.9×109CFU/mL。隨后,細(xì)菌數(shù)量開始下降,至發(fā)酵結(jié)束時,細(xì)菌細(xì)胞數(shù)減少了48.7%(圖2)。
圖1 細(xì)胞自溶產(chǎn)生的胞外DNAFig.1 Extracellular DNA produced by autolysis
圖2 發(fā)酵過程中B.licheniformis BL41生物量Fig.2 Cell biomass of B.licheniformis BL41 during fermentation process
由上述結(jié)果得出,發(fā)酵后期,細(xì)胞大量死亡,導(dǎo)致生產(chǎn)2,3-丁二醇的生物量減少,從而降低2,3-丁二醇的生成。Nagraj以凍干細(xì)胞為底物,設(shè)計自溶篩選平板,通過觀察自溶圈大小,獲得不產(chǎn)自溶素的菌株[4]。然而冷凍干燥法耗時過長,獲得細(xì)胞干粉量較小,因此本文對其進行改造。
菌株BL41的細(xì)胞加熱死亡后,以死細(xì)胞及細(xì)胞碎片作為底物加入到LB瓊脂培養(yǎng)基中,倒平板備用。將菌液稀釋后均勻涂布于上述平板,觀察菌落周圍透明圈大小。如圖3所示,中間白色部分為單菌落,而菌落周圍的黑色部分則為自溶素裂解細(xì)胞產(chǎn)生的透明圈,其中圖(A)和(B)分別表示出發(fā)菌株和突變菌株的自溶圈,兩菌落直徑大小相似,然而明顯可以看出,出發(fā)菌株的透明圈較大。
透明圈直徑與菌落直徑之比可以表征菌株自溶水平高低,比值越高說明自溶水平越高。通過紫外誘變的方法,獲得自溶水平低的突變株。在自溶篩選平板上共得到220株突變子,其中61株突變子的透明圈直徑/菌落直徑比值小于出發(fā)菌株1.57,結(jié)果如表1所示。
圖3 篩選平板上菌落周圍的透明水解圈Fig.3 Transparent zones around the colonies on the screen plate
表1 突變子的相對自溶水平分析Table 1 Analysis of the relative autolysis level of the mutants
將上述31株透明圈直徑/菌落直徑比值小于1.29的突變子進行肌酸比色實驗,分析乙偶姻含量,從而快速大量篩選出高產(chǎn)乙偶姻菌株,減少復(fù)篩工作量。其結(jié)果如圖4所示,菌株 BL41-103,BL41-105,BL41-122,BL41-196,BL41-202,BL41-213,BL41-216的乙偶姻產(chǎn)量最高,均高于出發(fā)菌株BL41。
圖4 突變子合成乙偶姻的水平Fig.4 Analysis of acetoin production in mutants
選取乙偶姻產(chǎn)量高的菌株,進一步通過搖瓶發(fā)酵分析其2,3-丁二醇產(chǎn)量。然而,不同菌株的葡萄糖利用能力不同,因此采用不同的初始葡萄糖濃度進行發(fā)酵。由表2所示,發(fā)酵36 h時,除BL41-103外,大部分菌株在100 g/L的初始葡萄糖濃度下獲得最高2,3-丁二醇產(chǎn)量,然而隨葡萄糖濃度的升高,其產(chǎn)量下降。菌株BL41-213在36 h時2,3-丁二醇產(chǎn)量最高,為54.6 g/L,相比于出發(fā)菌株提高了34.2%。
表2 初始葡萄糖質(zhì)量濃度對2,3-丁二醇產(chǎn)量的影響Table 2 Effect of initial glucose concentration on 2,3-butanediol production
發(fā)酵42 h時,在初始葡萄糖質(zhì)量濃度為100 g/L的情況下,菌株的乙偶姻產(chǎn)量升高,而2,3-丁二醇產(chǎn)量下降??赡苁怯捎谂囵B(yǎng)基中葡萄糖消耗完后,生成的2,3-丁二醇作為儲備碳源可逆的轉(zhuǎn)化為乙偶姻。而此時,初始葡萄糖濃度大于100 g/L的培養(yǎng)基中,由于葡萄糖未耗盡,仍有2,3-丁二醇生成,因此其產(chǎn)量均較高。
大部分菌株在120 g/L的初始葡萄糖質(zhì)量濃度下,發(fā)酵48 h獲得最大2,3-丁二醇產(chǎn)量。其中菌株BL41-196的2,3-丁二醇的產(chǎn)量達(dá)到54.7 g/L,為發(fā)酵過程中的最高值。而BL41-103的2,3-丁二醇產(chǎn)量在48 h,初始葡萄糖質(zhì)量濃度為100 g/L時最高,達(dá)到44.1 g/L。
大部分菌株在初始葡萄糖質(zhì)量濃度為140 g/L和160 g/L時,2,3-丁二醇的產(chǎn)量普遍低于100 g/L和120 g/L時的產(chǎn)量。底物濃度過高,抑制了2,3-丁二醇的生成。
為進一步確定突變株的生產(chǎn)能力,對上述3株高產(chǎn)2,3-丁二醇菌株 BL41-103,BL41-196和 BL41-213進行四聯(lián)發(fā)酵罐的擴大培養(yǎng),并以出發(fā)菌株BL41為對照。
由圖5(A)所示,發(fā)酵前20 h時,4株菌的2,3-丁二醇產(chǎn)量近似相等,此后,2,3-丁二醇產(chǎn)量則出現(xiàn)差別。BL41-103在發(fā)酵36 h時即達(dá)到最高產(chǎn)量,為60.3 g/L,比出發(fā)菌株 BL41提高了25.9%,此后,BL41-103的2,3-丁二醇產(chǎn)量即開始下降。除BL41-103外,其余3株菌的2,3-丁二醇產(chǎn)量均在44 h時達(dá)到最高值,其中BL41-196的2,3-丁二醇產(chǎn)量最高,為 65.1 g/L,比出發(fā)菌株提高了 36.0%。而BL41-213的產(chǎn)量為56.1 g/L,僅比菌株BL41提高了17.1%。
發(fā)酵時間為24 h時,BL41-196的產(chǎn)率達(dá)到最高,并且維持1.7 g/(L· h)長達(dá)12 h。而BL41-213也在24 h時達(dá)到最高產(chǎn)率1.7 g/(L·h),此后,2,3-丁二醇產(chǎn)率則快速下降。BL41-103在28 h時產(chǎn)率為1.7 g/(L·h),并在此產(chǎn)率下維持8 h,發(fā)酵36 h后產(chǎn)率則快速下降,因此,BL41-103在較短時間內(nèi)達(dá)到最大2,3-丁二醇產(chǎn)量。BL41在24 h時達(dá)到最高產(chǎn)率1.4 g/(L·h),然后,其產(chǎn)率開始下降(圖5(B))。
發(fā)酵過程中,副產(chǎn)物乳酸和乙偶姻的產(chǎn)量如圖6(A、B)所示。發(fā)酵后期,2,3-丁二醇產(chǎn)量開始下降,轉(zhuǎn)化為乙偶姻,因此乙偶姻的產(chǎn)量呈逐漸上升趨勢,但是整個發(fā)酵過程中其產(chǎn)量都低于3 g/L。乳酸的產(chǎn)量則略高,最高達(dá)到12 g/L。
圖5 四聯(lián)發(fā)酵罐發(fā)酵分析2,3-丁二醇的產(chǎn)量和產(chǎn)率Fig.5 Production and productivity of 2,3-BD for mutant strains in multifors
圖6 四聯(lián)發(fā)酵罐發(fā)酵的副產(chǎn)物產(chǎn)量Fig.6 Production of the byproducts of the mutants in fermentation process with a multifors bioreactor
上述發(fā)酵進行到20 h后,細(xì)胞自溶現(xiàn)象明顯,四株菌的OD600均在此時開始下降,其中BL41-103的OD600由14.6下降為12.1。而其余3株菌的OD600則近似相等,均由12.6左右降至11.0左右。同時,由于發(fā)酵后期營養(yǎng)成分的不足及副產(chǎn)物的積累,細(xì)胞開始死亡,這兩種原因?qū)е录?xì)胞生物量快速下降。
如圖7所示,四株菌在發(fā)酵后期細(xì)菌數(shù)量均下降,其中菌株BL41的細(xì)胞死亡率最高,發(fā)酵36 h時為36.5%,而另外 3株菌(BL41-103,BL41-196,BL41-213)的死亡率分別為 29.0%,23.5% 和31.0%,均小于出發(fā)菌株BL41。菌株BL41-196的細(xì)胞死亡率最低,且其最終細(xì)菌濃度高于BL41,而該菌株的2,3-丁二醇產(chǎn)量最高,生物量與代謝產(chǎn)物的生成保持一致。BL41-103的細(xì)胞死亡率也較低,并且在發(fā)酵前期BL41-103的生長速率高于另外三株菌,因此其在短時間內(nèi)獲得較高2,3-丁二醇產(chǎn)量。盡管最終菌株BL41-213細(xì)菌數(shù)量少于出發(fā)菌株,但其細(xì)胞死亡率小于出發(fā)菌株BL41,因此其2,3-丁二醇產(chǎn)量也略高于出發(fā)菌株。
圖7 突變株的生物量變化Fig.7 Biomass production of mutant strains during fermentation
地衣芽孢桿菌在植物病害防治、飼料加工、醫(yī)藥開發(fā)等多方面具有廣泛應(yīng)用,是非常具有應(yīng)用價值的菌株[7],其在2,3-丁二醇生產(chǎn)上也有很大潛力。早在1992年,就有研究利用地衣芽孢桿菌生產(chǎn)2,3-丁二醇,發(fā)酵72 h后,其2,3-丁二醇的產(chǎn)量為47 g/100 g,為當(dāng)時的最高產(chǎn)量[8]。而在地衣芽孢桿菌NCIMB 8059中則得到最優(yōu)培養(yǎng)條件,溫度為37℃,pH 為6.0,接種量10 g/L,初始底物濃度30 g/L[9]。
自溶素普遍存在于細(xì)菌之中,它參與細(xì)菌的生長發(fā)育、細(xì)胞分離、孢子形成等重要生理活動[10]。自溶現(xiàn)象在芽孢桿菌中也有多種應(yīng)用,如蠟狀芽孢桿菌群中,通過不同pH條件下自溶現(xiàn)象的不同,對其進行分類[11]。在蘇云金芽孢桿菌中,利用細(xì)胞壁錨定結(jié)合性能的自溶素作為運載蛋白,構(gòu)建芽孢桿菌的表面展示系統(tǒng)[12]。然而,菌體自溶對發(fā)酵過程卻具有不良影響。乳酸桿菌的高密度培養(yǎng)過程中,由于菌體自溶,活菌數(shù)很難達(dá)到較高的增殖水平[13]。而且,自溶素對細(xì)胞壁的水解作用導(dǎo)致細(xì)胞壁破裂出現(xiàn)孔洞,胞內(nèi)容物,如DNA、RNA等,流失到細(xì)胞外[14]。而胞外DNA在菌體表面間起到了粘結(jié)作用,致使發(fā)酵液變黏[15]。
本研究通過分析發(fā)酵后期培養(yǎng)液粘稠現(xiàn)象產(chǎn)生的原因,證實了該菌株在發(fā)酵期間細(xì)胞自溶現(xiàn)象比較嚴(yán)重。而在金黃色葡萄球菌中,通過轉(zhuǎn)座子Tn917-lacZ隨機誘變,獲得了2株無法合成自溶素的缺陷型突變株[4]。由于紫外誘變的方法方便簡單,因此本文利用紫外誘變篩選自溶水平降低的突變子,并從這些突變子中挑選出乙偶姻合成水平較高的菌株,最終突變子產(chǎn)2,3-丁二醇水平較出發(fā)菌株有了明顯提高。本研究首次將降低細(xì)胞自溶水平、提高發(fā)酵過程中生物量和提高2,3-丁二醇產(chǎn)量聯(lián)系在一起,取得了較好的結(jié)果。
本研究通過紫外誘變,成功地篩選出自溶水平較低的突變子,并從中進一步篩選出2,3-丁二醇的高產(chǎn)菌株。本研究結(jié)果顯示,通過降低菌株的自溶水平,增加發(fā)酵過程中的生物量,是提高發(fā)酵水平的一條重要途徑。
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