李春艷,于琦,馮露,成毅,成小松,王雪,張平根(.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,哈爾濱50030;.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,哈爾濱5000)
低溫纖維素降解菌分離鑒定及產(chǎn)酶條件優(yōu)化
李春艷1,于琦1,馮露1,成毅1,成小松2,王雪1,張平根1
(1.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,哈爾濱150030;2.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,哈爾濱150001)
采用富集培養(yǎng)方法在低溫條件下從生活垃圾土壤中分離得到1株能夠降解纖維素細(xì)菌,命名為FLX-1。經(jīng)形態(tài)學(xué)、生理生化學(xué)和分子生物學(xué)16S rDNA序列分析,將菌株FLX-1鑒定為節(jié)桿菌屬(Arthrobacter sp.)細(xì)菌。為探索菌株FLX-1生長特性和最佳產(chǎn)酶條件,利用響應(yīng)面分析方法考查培養(yǎng)時間、溫度、pH和接種量對菌株FLX-1產(chǎn)羧甲基纖維素(Carboxymethylcellulose,CMC)酶活特性影響情況。結(jié)果表明,菌株FLX-1最佳產(chǎn)酶條件為培養(yǎng)時間74.1 h,溫度10.5℃,pH 7.1,接種量2.1%。在最佳條件下,菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活值為14.12 U·mL-1。
纖維素;低溫降解菌;Arthrobacter sp.;CMC酶;響應(yīng)面分析法
我國北方嚴(yán)寒地區(qū)農(nóng)村有機生活垃圾種類和數(shù)量逐年增加。由于嚴(yán)寒地區(qū)冬季水量少、氣溫低、持續(xù)時間長,因此不適宜采用堆肥法處理有機生活垃圾,目前主要以單純填埋或野外堆放焚燒等方法處理,不僅效率低,且對大氣、河流和土壤等環(huán)境造成嚴(yán)重污染[1]。探索高效處理嚴(yán)寒地區(qū)農(nóng)村有機生活垃圾的新方法,是亟待解決問題。
86.8 %有機生活垃圾由餐廚垃圾、水果、蔬菜等組成,主要成分為難降解多糖纖維[2]。目前,已篩選出較多能夠降解纖維素的真菌和放線菌,如青霉屬(Penicillium sp.)[3]、鏈霉菌屬(Streptomyces sp.)[4]和漆斑霉屬(Myrothecium sp.)[5]等;對纖維素降解細(xì)菌研究相對較少,且主要集中在篩選高溫和中溫纖維素降解菌,廖青等從發(fā)酵床墊料中分離出1株纖維素降解細(xì)菌(Streptomyces sp.)F21,30°C培養(yǎng)4 d,CMC酶活值為72.5 U·mL-1[6]。朱軍莉等從袋裝降解筍干中分離出1株纖維素降解細(xì)菌(Bacillus subtilis)BSX5,50℃培養(yǎng)12 h,CMC酶活值為54.5 U·mL-1[7]。低溫纖維素降解細(xì)菌研究鮮見報道。
本文從生活垃圾土壤中篩選分離得到1株低溫條件下高效降解纖維素細(xì)菌,結(jié)合形態(tài)學(xué)、生理生化特性和16S rDNA序列分析等對其鑒定,并對該菌株產(chǎn)CMC酶條件優(yōu)化。該菌株篩選獲得可充實低溫降解纖維素的菌種資源,為探索嚴(yán)寒地區(qū)有機生活垃圾處理新方法奠定基礎(chǔ)。
1.1 樣品來源
土壤樣品源自黑龍江省哈爾濱市南崗區(qū)王崗鎮(zhèn)后興隆村垃圾站。
1.2 培養(yǎng)基
依姆歇涅茨基纖維素分解菌培養(yǎng)基[8]。
纖維素降解菌分離培養(yǎng)基:CMC-Na 5 g,(NH4)H2PO40.5 g,MnSO4·H2O 2.5 g,K2HPO42 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 7.5 mg,MgSO42 g,NaCl 0.3 g,蒸餾水100 mL,pH 7.0。
纖維素降解菌鑒別培養(yǎng)基:CMC-Na 20 g,K2HPO40.5 g,MgSO40.25 g,(NH4)2SO41.4 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0。
無機鹽纖維素瓊脂平板培養(yǎng)基:CMC-Na 20 g,MgSO4·7H2O 0.3 g,CaCl20.3 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.005 g,MnSO4·H2O 0.004 g,ZnCl20.007 g,CoCl20.002 g,(NH4)2SO41.4 g,K2HPO42.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0。
細(xì)菌液體發(fā)酵培養(yǎng)基:MgSO4·7H2O 0.3 g,酵母膏0.5 g,CaC12·2H2O 0.3 g,蛋白胨3.0 g,KH2PO4
4.0 g,CMC-Na 5.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0。
以上培養(yǎng)基均在121℃滅菌20 min,在配制固體培養(yǎng)基時按2%添加瓊脂粉。
1.3 低溫纖維素降解菌富集與分離
取土壤樣品10.0 g加入100 mL LB液體培養(yǎng)基,25℃、160 r·min-1搖床培養(yǎng)24 h,取上清液梯度稀釋,分別取10-1~10-9稀釋液1 mL接種在10 mL依姆歇涅茨基纖維素分解菌培養(yǎng)基中,從濾紙條降解程度高的地方挑取菌落接種到分離培養(yǎng)基上,反復(fù)劃線純化直至獲得純菌。將分離純化得到的純菌在無機鹽纖維素瓊脂平板培養(yǎng)基上劃線培養(yǎng)3~5 d,從25℃起始以5℃為梯度降溫,最終獲得能在低溫條件下生長的菌株。將低溫菌株點種到纖維素鑒別培養(yǎng)基上,10℃倒置培養(yǎng)3~5 d,倒入1 mg·mL-1剛果紅染液染色1 h后[9],用1 mol·L-1NaCl浸泡1 h脫色,觀察菌落周圍透明圈產(chǎn)生情況。
1.4 低溫纖維素降解菌的鑒定
將低溫纖維素降解菌采用平板劃線法接種于牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基,10℃恒溫培養(yǎng)48 h后觀察菌落形態(tài),參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》進(jìn)行生理生化鑒定[10]。采用分子生物學(xué)16S rDNA序列分析方法[11]對菌株種屬鑒定,引物為通用引物,由大連寶生物有限公司合成,反應(yīng)體系及條件參考文獻(xiàn)[12]。測序結(jié)果用BLAST軟件在GenBank中同源性比較,采用MEGA 4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[13]。
1.5 低溫纖維素降解菌酶活測定
將產(chǎn)生透明圈的菌株接種于100 mL液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,以不接菌液體發(fā)酵培養(yǎng)基作為陰性對照。10℃、160 r·min-1條件下培養(yǎng)72 h,取5 mL發(fā)酵液,4℃、3 000 r·min-1條件下離心15 min,取上清液,測定發(fā)酵液中CMC酶活力[14-15]。
1.6 低溫纖維素降解菌產(chǎn)酶活性研究
1.6.1 單因素試驗
分別以1%、2%、3%、4%、5%作為菌體接種量試驗組;分別以5、10、15、20和25℃作為溫度試驗組;分別以24、48、72、96、120 h作為培養(yǎng)時間試驗組;分別以5.0、6.0、7.0、8.0、9.0作為pH試驗組。以上各試驗組均在液體發(fā)酵培養(yǎng)基中恒溫?fù)u床160 r·min-1振蕩培養(yǎng),以不加菌作為陰性對照,以蒸餾水作為空白對照,每隔24 h測定其CMC酶活和OD600。
1.6.2 響應(yīng)面試驗設(shè)計
根據(jù)單因素試驗結(jié)果,利用Design-Expert 8.0.6軟件中的Box-Behnken design(BBD)模型設(shè)計四因素三水平試驗,以接種量(A)、溫度(B)、培養(yǎng)時間(C)、pH(D)為自變量,以CMC酶活為唯一響應(yīng)值,其中試驗設(shè)計因素水平見表1。二次回歸方程用以擬合自變量和響應(yīng)值之間函數(shù)關(guān)系[16],公式如下:
式中,Y-預(yù)期響應(yīng)值;A-常數(shù);Aj-單因素直線系數(shù);Ajj-單因素平方系數(shù);Aij-兩個因素的交互系數(shù)。
表1 菌株FLX-1響應(yīng)面試驗因素及水平Table 1 Factors and levels of response surface experiments ofstrain FLX-1
圖1 菌株FLX-1菌落及菌體形態(tài)Fig.1 Colony and thallus morphologicalcharacteristics of strain FLX-1
表2 菌株FLX-1形態(tài)特征Table 2 Morphologicalcharacteristics of strain FLX-1
2.1 低溫菌株分離純化
經(jīng)分離和純化獲得1株低溫高效纖維素降解細(xì)菌,命名為FLX-1。菌株FLX-1菌落培養(yǎng)特征、革蘭氏染色照片和透射電鏡照片如圖1所示。菌株FLX-1菌落和菌體形態(tài)特征分別見表2,生理生化指標(biāo)見表3。
表3 菌株FLX-1生理生化特征Table 3 Physiologicaland biochemicalcharacteristics of strain FLX-1
圖2 降解菌FLX-1系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree ofstrain FLX-1
2.2 基于16S rDNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
菌株FLX-1序列已在GenBank中注冊,登錄號為KM658453。菌株FLX-1與數(shù)據(jù)庫中同源性較高的9個細(xì)菌模式株比較,菌株FLX-1的16S rDNA序列與Arthrobacter sp.的9個種均有較高序列同源性,其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系見圖2。由圖2可知,菌株FLX-1與Arthrobacter sp.SS-2009-PA1(FN646598)及Arthrobacter sp.TSBY-63(DQ173019)相似性均為99. 0%。目前,細(xì)菌分類學(xué)家的共識是,當(dāng)兩個細(xì)菌的16S rDNA相似性大于95%時,可將其歸為同一屬。從系統(tǒng)發(fā)育樹分析可知,菌株FLX-1屬于Arthrobacter sp.。
2.3 單因素試驗結(jié)果
由圖3可以看出,不同因素對菌株FLX-1生長量及產(chǎn)CMC酶活力影響情況。如圖3a所示,接種量為2%時,菌株FLX-1生長量和產(chǎn)CMC酶活力均達(dá)最大值,分別為1.63和13.22 U·mL-1,可知2%為最佳接種量。由圖3b可知,當(dāng)溫度為10℃時,菌株FLX-1生長量和產(chǎn)CMC酶活力均達(dá)最高點,產(chǎn)CMC酶活力最大值為13.67 U·mL-1。圖3c顯示,菌株FLX-1生長量及產(chǎn)CMC酶活力隨培養(yǎng)時間延長呈現(xiàn)先升高后下降趨勢,當(dāng)培養(yǎng)時間為72 h,菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活力達(dá)最大值,為13.66 U·mL-1。由圖3d可知,菌株FLX-1生長量隨pH增加無明顯變化,當(dāng)pH 7.0~8.0時,菌株FLX-1生長量最佳,說明菌株FLX-1適合在中性偏堿性環(huán)境中生長。菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活力隨pH增加先增大后減小,當(dāng)pH 7.0時,菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活力達(dá)最大值,為13.64 U·mL-1。
綜上所述,影響菌株FLX-1生長量和產(chǎn)CMC酶活力最適條件為接種量2%、溫度10℃、培養(yǎng)時間72 h、pH 7.0。
2.4 響應(yīng)面優(yōu)化結(jié)果
菌株FLX-1響應(yīng)面試驗設(shè)計方案及結(jié)果見表4。利用Design-Expert8.0.6軟件,對BBD模型試驗數(shù)據(jù)進(jìn)行多項回歸分析得到二次擬合模型為:Y= 13.57-0.052A-0.54B-0.50C-0.43D+0.12AB-0.44AC+ 0.097A D-0.87BC+0.42BD+0.45C D-0.34 A2-1.50B2-1.58C2+0.087D2
此回歸方程中,Y為菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活;A、B、C、D分別為接種量、溫度、培養(yǎng)時間和pH的編碼值。
表5是利用Design-Expert8.0.6軟件分析得出菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活力響應(yīng)分析試驗的回歸分析結(jié)果。表中偏差平方和表示樣本值與平均值之間偏離量;均方差表示樣本值與平均值之間偏離程度;F值表示一個服從F分布的統(tǒng)計量,F(xiàn)值越大說明模型越顯著;P值為顯著性概率,當(dāng)P>0.05時,表明變量對響應(yīng)值沒有顯著影響;當(dāng)P<0.05時,表明變量對響應(yīng)值具有顯著影響;當(dāng)P<0.01時,說明變量對響應(yīng)值有極顯著影響[15]。
圖3 各因素對菌株FLX-1生長量及產(chǎn)酶的影響Fig.3 Effects of differentfactors on growth and enzyme production ofstrain FLX-1
由菌株FLX-1回歸分析結(jié)果可知,菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活模型P<0.0001、F=50.84、失擬P= 0.3014、R2=0.9807,表明該模型與實際情況擬合良好[17]。B、C、D、AC、BC、BD、CD、A2、B2和C2的P<0.05,說明這些獨立變量和交互組合對菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活影響顯著。在獨立變量中,B、C和D的P<0.0001,但B的F值最大,即P值最小,說明在獨立變量中B對菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活發(fā)揮作用最顯著。在交互組合中,BC組合P值最小,說明BC對菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活發(fā)揮作用極顯著。
由上述結(jié)果可知,在產(chǎn)CMC酶活響應(yīng)曲面分析試驗中,各變量對CMC酶活影響作用由大到小依次為:溫度>培養(yǎng)時間>pH>接種量。
不同交互組合對菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活影響的響應(yīng)曲面見圖4。響應(yīng)曲面圖是一個開口向下的曲面圖,通過觀察曲面傾斜度可確定交互組合對響應(yīng)值的影響程度,傾斜度越高,即坡度越陡,說明兩個獨立變量交互作用越顯著。結(jié)合等高線圖
和響應(yīng)曲面圖能夠很好分析交互組合對響應(yīng)值影響情況。
表4 菌株FLX-1響應(yīng)面試驗設(shè)計與結(jié)果Table 4 Experimentaldesign and results of RSMof strain FLX-1
表5 菌株FLX-1響應(yīng)分析試驗回歸分析結(jié)果Table 5 Results of the regression analysis of RSA ofstrain FLX-1
由圖4(a)可知,當(dāng)pH和培養(yǎng)時間固定在零水平(7.0,72 h)時,菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活較大值在接種量1.5%~2.5%和溫度9~11℃范圍內(nèi)獲得。圖4(b)為接種量-培養(yǎng)時間交互組合對CMC酶活影響情況。當(dāng)pH和溫度維持在零水平(7.0,10℃)時,菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶活較大值在接種量1.5%~2.5%和培養(yǎng)時間64~80 h范圍內(nèi)獲得。圖4(c)為溫度-培養(yǎng)時間交互組合對CMC酶活的影響情況。圖4(a)和圖4(b)相比可知,溫度-培養(yǎng)時間交互組合的曲面圖最陡峭,說明溫度-培養(yǎng)時間交互組合對CMC酶活作用顯著。
由上述分析結(jié)果可知,當(dāng)各因素固定在零水平時,較大的CMC酶活集中在曲面中心區(qū)域,并且在此區(qū)域內(nèi)均存在CMC酶活極值點。經(jīng)Design-Expert8.0.6軟件分析可得菌株FLX-1高產(chǎn)CMC酶活最優(yōu)條件為:接種量2.1%,溫度10.5℃,培養(yǎng)時間74.1 h,pH 7.1。
為驗證菌株FLX-1高產(chǎn)CMC酶活性響應(yīng)模型預(yù)測CMC酶活的準(zhǔn)確性和可靠性,在最佳條件下進(jìn)行3組平行驗證試驗,所得結(jié)果為(14.12± 0.055)U·mL-1,與模型預(yù)測值(14.24 U·mL-1)非常接近,表明該模型可預(yù)測試驗結(jié)果。
圖4 不同因素對菌株FLX-1的CMC酶活產(chǎn)生交互影響的響應(yīng)曲面圖Fig.4 Response surface plot of the mutualeffecton CMC ofstrain FLX-1
目前已篩選出較多能降解纖維素的真菌和放線菌,對纖維素降解細(xì)菌研究相對較少,但由于細(xì)菌繁殖快、發(fā)酵周期短,細(xì)菌產(chǎn)纖維素降解酶研究已引起關(guān)注[6-8]。按常規(guī)方法篩選獲得的纖維素降解細(xì)菌產(chǎn)CMC酶最適溫度多為45~65℃,而目前篩選到的低溫纖維素降解菌產(chǎn)CMC酶最適溫度為20℃,黃玉蘭等從若爾蓋高寒濕地距表層80 cm處土壤中篩選出1株低溫纖維素酶高產(chǎn)菌株(Brevundimonas sp.)XW-1,20℃培養(yǎng)3 d最高酶活為15.6 U·mL-1[18];侯進(jìn)慧等從農(nóng)田、農(nóng)產(chǎn)品果實表面分離獲得1株低溫纖維素降解菌株(Bacillus sp.)T34,20℃培養(yǎng)48 h最高酶活為1.43 U·mL-1[19]。這種溫度條件無法達(dá)到北方有機生活垃圾降解處理要求。因此,篩選出低溫條件下具有高效產(chǎn)CMC酶能力的細(xì)菌對嚴(yán)寒地區(qū)有機生活垃圾處理尤為重要。
本試驗從生活垃圾土壤中篩選分離獲得1株低溫纖維素高效降解細(xì)菌Arthrobacter sp.FLX-1,pH 7.0、10℃、接種量2%條件下培養(yǎng)72 h,最高酶活為13.64 U·mL-1。同時,對菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶條件優(yōu)化[20-21]。本試驗采用響應(yīng)面分析方法對菌株FLX-1產(chǎn)CMC酶條件優(yōu)化,優(yōu)化結(jié)果為溫度10.5℃,培養(yǎng)時間74.1 h,pH 7.1,接種量2.1%,最高酶活值達(dá)到14.12 U·mL-1,經(jīng)響應(yīng)面優(yōu)化后產(chǎn)CMC酶活力比優(yōu)化前提高0.45 U·mL-1,優(yōu)化率為3.29%。
后續(xù)研究將進(jìn)一步探索菌株FLX-1發(fā)酵條件及優(yōu)化發(fā)酵培養(yǎng)基,以獲得更高酶活性的細(xì)菌發(fā)酵液。探究多株低溫纖維素降解菌的復(fù)配并研究復(fù)配菌劑對生活垃圾的處理效果,為嚴(yán)寒地區(qū)有效降解農(nóng)村有機生活垃圾提供技術(shù)支持。
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Isolation and identification of low-temperature cellulose-degrading bacterium and optimization of enzyme production conditions
/
LI Chunyan1, YU Qi1,FENG Lu1,CHENG Yi1,CHENG Xiaosong2,WANG Xue1,ZHANG Pinggen1
(1.School of Resources and Environmental Sciences,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China; 2.SchoolofFirstClinicalMedicine,Harbin MedicalUniversity,Harbin 15001,China)
A cellulose-degrading strain FLX-1 was isolated from domestic waste soil samples at low temperature by enrichment culture.According to morphologic and physiological-biochemical characteristics as well as 16S rDNA sequence analysis,strain FLX-1 was identified as Arthrobacter sp. The effects of culture time,temperature,pH and inoculation size on the carboxymethyl cellulose enzyme activity by strain FLX-1 were optimized using a response surface methodology(RSM).The results showed that the optimal enzyme production conditions were culture time 74.1 h,temperature 10.5℃,pH 7.1 and inoculation size 2.1%.At the best conditions,the carboxymethylcellulose enzyme activity ofstrain FLX-1 was 14.12 U·mL-1.
cellulose;low-temperature degradation bacterium;Arthrobacter sp.;carboxymethyl cellulose enzyme;response surface methodology
S789;S182
A
1005-9369(2015)10-0074-08
時間2015-10-29 13:40:55[URL]http://www.cnki.net/kcms/detail/23.1391.S.20151029.1340.008.html
李春艷,于琦,馮露,等.低溫纖維素降解菌分離鑒定及產(chǎn)酶條件優(yōu)化[J].東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2015,46(10):74-81.
Li Chunyan,Yu Qi,Feng Lu,et al.Isolation and identification of low-temperature cellulose-degrading bacterium and optimization of enzyme production conditions[J].Journal of Northeast Agricultural University,2015,46(10):74-81.(in Chinese with English abstract)
2015-03-19
“十二五”國家科技支撐計劃項目(2013BAJ12B02-4)
李春艷(1970-),女,教授,博士,博士生導(dǎo)師,研究方向為環(huán)境微生物。E-mail:chunyanli@neau.edu.cn