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      膠質(zhì)細(xì)胞源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子基因克隆及表達(dá)載體的構(gòu)建

      2015-10-21 19:58孫曉晨孫磊磊李小東
      關(guān)鍵詞:質(zhì)粒試劑盒測(cè)序

      孫曉晨 孫磊磊 李小東

      【摘要】 目的:克隆大鼠膠質(zhì)細(xì)胞源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(GDNF)的全長(zhǎng)基因,并構(gòu)建真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒。方法:運(yùn)用已合成的GDNFcDNA,加入自行設(shè)計(jì)的引物擴(kuò)增GDNF基因,并與質(zhì)粒pEGFP-C3連接,構(gòu)建表達(dá)質(zhì)粒。結(jié)果:PCR擴(kuò)增的目的基因?yàn)?30bp,對(duì)構(gòu)建的表達(dá)質(zhì)粒雙切酶電泳及測(cè)序證明基因片段為630bp。 結(jié)論:正確克隆了GDNF基因并成功構(gòu)建表達(dá)質(zhì)粒,為下一步進(jìn)行載體介導(dǎo)的體內(nèi)轉(zhuǎn)基因奠定了基礎(chǔ)。

      【關(guān)鍵詞】 膠質(zhì)細(xì)胞源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子; 載體; 克隆

      【中圖分類號(hào)】R562.21 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】B【文章編號(hào)】1004-4949(2015)02-0101-01

      膠質(zhì)細(xì)胞源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(Glial cell line-derived neurotrophic factor,GDNF)是1993年Lin等從大鼠膠質(zhì)瘤細(xì)胞B49中純化獲得的一種新型神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子,化學(xué)結(jié)構(gòu)為糖蛋白,并發(fā)現(xiàn)它具有促進(jìn)多巴胺能神經(jīng)元存活的功能[1] . Lin LFH,Doherty DH,Lile JD,et al.GDNF:a glial cell line-derived neurotrophic factor for midobrai dopaminergic neurons.[J].Science,1993,260(5111):1130-1132],后來進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)其對(duì)運(yùn)功、感覺等多種神經(jīng)元有營(yíng)養(yǎng)作用。Oorschot等研究發(fā)現(xiàn)GDNF對(duì)培養(yǎng)的大鼠胚胎運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元存活具有重要作用,其效應(yīng)分別是腦源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(BDNF)、睫狀神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(CNTF)和人類膽堿能分泌因子-白血病抑制因子(CDF/LIF)的75倍,650倍,和2500倍[2] Oorschot DE,Mclennan IS.The trophic requirements of mature motoneurons.[J].Brain Res,1998,789(2):315-321],Annette等發(fā)現(xiàn)GDNF在胚胎期可以促進(jìn)感覺神經(jīng)元軸突的發(fā)育,在成熟期可以促進(jìn)軸突的延長(zhǎng)[3] Annette Markus,Tushar D,Patel,William D.Snider. Neurotrophic factors and axonal growth[J].Curr Opin Neurobiol,2002,12(5):523-53]。由于其對(duì)神經(jīng)的營(yíng)養(yǎng)作用,目前被應(yīng)用到腦缺血,帕金森病等的研究中。后來,在研究疼痛的過程中,發(fā)現(xiàn)其對(duì)神經(jīng)源性疼痛具有強(qiáng)烈的鎮(zhèn)痛與抑痛作用。但由于其在腦組織含量低,提取復(fù)雜,價(jià)格昂貴而限制了他的進(jìn)一步引用。為此我們克隆了大鼠的GDNF基因,連于pcDNA3質(zhì)粒,制備了帶有目的基因的真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒,為下一步研究載體介導(dǎo)的GDNF質(zhì)粒的治療作用打下基礎(chǔ)。

      1 材料和方法

      1.1材料

      1.1.1GDNFcDNA菌種與質(zhì)粒

      鼠GDNFcDNA及質(zhì)粒pEGFP-C3購自北京泛基諾公司。大腸桿菌JM109由西安交通大學(xué)遺傳學(xué)教研室提供。

      1.1.2實(shí)驗(yàn)試劑

      限制性內(nèi)切酶BamHI,XhoI購自Promega,T4 DNA連接酶、T4DNA聚合酶、TaqDNA聚合酶及dNTPs均購自華美生物公司,DNA合成試劑盒、DNA回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購自上海生物工程公司。其他試劑為國(guó)產(chǎn)分析純及西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室自備。

      1.2方法

      1.2.1鼠GDNFcDNA的擴(kuò)增

      參照GeneBank和文獻(xiàn)報(bào)道,設(shè)計(jì)上下游引物,上游:5'-AGGATCCATGAAGTTATGGGATGTCGT-3',下游:5'-ACTCGAGTCAGATACATCCACACCGTT-3'。由上海生物工程公司代替合成。按PCR試劑盒說明書將無RNA酶水、dNTPs,5×buffer、已合成的上下游引物、25mmolMgSO4加入到置于冰上的0.2ml離心管中反應(yīng)條件,混勻后加入T4 DNA連接酶、T4DNA聚合酶。震蕩10秒混勻,放入PCR儀擴(kuò)增目的基因。反應(yīng)條件和反應(yīng)體系如下:

      樣品于94℃變性5min,加入2U的Taq聚合酶,按下列參數(shù)循環(huán)30次:94℃變性30s,56℃退火30s,72℃延伸1min,最后一個(gè)循環(huán)72℃,延伸5min。

      結(jié)束后擴(kuò)增樣品在0.8%瓊脂糖凝膠電泳中檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,用DNA marker判斷擴(kuò)增片段的大小。同時(shí)切出GDNFcDNA條帶,用膠回收試劑盒予以回收純化。

      1.2.2構(gòu)建重組質(zhì)粒pEGFP-GDNFcDNA

      將回收的GDNFcDNA和載體質(zhì)粒用BamHI和XhoI進(jìn)行雙酶切反應(yīng),雙酶切產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢切出DNA條帶用膠回收試劑盒純化后合并,加入T4 DNA連接酶16℃連接過夜

      1.2.3轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)菌、細(xì)菌的擴(kuò)增及質(zhì)粒提取

      取上述連接后反應(yīng)液10ul,加感受態(tài)細(xì)菌JM109 100ul冰上放置20min,然后420C熱休克2min, 加1ml LB,37 0C震蕩培養(yǎng)30min, 取100ul涂布到卡那霉素培養(yǎng)平皿上,370C培養(yǎng)過夜。然后挑起單個(gè)克隆接種到5ml LB+Kana培養(yǎng)液中37 0C震蕩培養(yǎng)18小時(shí)提取質(zhì)粒.質(zhì)粒提取方法按質(zhì)粒提取試劑盒操作手冊(cè)中常規(guī)堿裂解法提取。質(zhì)粒命名為pEGFP-GDNG(代號(hào)為C3M-GDNF)。

      1.2.4質(zhì)粒的鑒定及pEGFP-GDNF的測(cè)序。

      將構(gòu)建的重組質(zhì)粒pEGFP-GDNF予以雙酶切(BamHI / XhoI)后電泳鑒定及測(cè)序。

      2 結(jié)果

      2.1 GDNFcDNA PCR產(chǎn)物的擴(kuò)增結(jié)果

      用大鼠的GDNFcDNA中加入設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行擴(kuò)增,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳實(shí)驗(yàn),純化后獲得的GDNF片段長(zhǎng)度630bp,與預(yù)期片段長(zhǎng)度相一致,無明顯非特異性擴(kuò)增帶(圖-1)。

      2.2 重組質(zhì)粒pEGFP-GDNFcDNA的雙酶切鑒定結(jié)果

      將pEGFP-GDNFcDNA用BamHI / XhoI雙酶切,切出GDNAcDNA及pEGFP-C3進(jìn)行電泳(圖-2),pEGFP-GDNFcDNA經(jīng)雙酶切后分別切出GDNFcDNA及載體質(zhì)粒,很據(jù)酶切電泳圖譜,重組質(zhì)粒pEGFP-GDNFcDNA總大小約6.0kb,及雙酶切后切出630bp與5.4kb兩條電泳帶,與預(yù)期結(jié)果一致。

      2.3 pEGFP-GDNFcDNA測(cè)序結(jié)果

      將最終構(gòu)建成功的pEGFP-GDNFcDNA送交測(cè)序,結(jié)果如圖(圖-3),與GeneBanK結(jié)果一致,測(cè)序正確。

      3 討論

      神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(NTFs)在神經(jīng)再生、突觸形成以及神經(jīng)損傷修復(fù)過程中起著重要作用,NTFs由神經(jīng)元及神經(jīng)元支配的靶器官或膠質(zhì)細(xì)胞產(chǎn)生,可以在神經(jīng)軸突中進(jìn)行順行、逆行性轉(zhuǎn)運(yùn)[4] Curtis R,Scherer SS,Somogyi R,Ip NY.Retrograde axonal transport of LIF is increased by peripheral nerve injury:correlation with increased LlF expression in distal nerve.[J].Neuron,1994,12():19l-204.,到達(dá)神經(jīng)中樞,發(fā)揮其生物學(xué)效應(yīng)。其中GDNF在促進(jìn)神經(jīng)元的生長(zhǎng)、分化和損傷后的修復(fù)方面被認(rèn)為是最有效的神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子[5] Barbara F,Macie JF,Jurgen E,et al.CNS glial are targets for GDNF and neurturin.[J].Histochem Cell Biol,1998,110(2):595-601.,不僅對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng),而且對(duì)周圍的運(yùn)動(dòng)、感覺和自主神經(jīng)系統(tǒng)也有同樣的作用[[[6] Choir DL,Lin Q,Chang YN,et al.Dopaminergic neurons protected from degeneration by glial cell linedderived neurotrophic factor gene therapy[J].Science,1997,275(5):838-841.,同時(shí)在防止神經(jīng)元的損傷,損傷后的修復(fù)再生等方面有其他生長(zhǎng)因子無法比擬的作用[7] Hisashi K,Chihoko S,Wen RZ,et al.Induction of glialcell line-derived neurotrophic factor receptor proteins incerebral cortex and striatum after permanent middle cerebral artery occlusion in rat.[J].Brain Research,1999,834(5):190-195]]。由于GDNF在腦內(nèi)含量較少,單純依賴生物提取無法大量獲得。而且目前在研究GDNF生物學(xué)效應(yīng)的實(shí)驗(yàn)中,給藥方式絕大多數(shù)都是脊髓鞘內(nèi)或者蛛網(wǎng)膜下腔局部注射治療。局部注射GDNF有很多缺點(diǎn):首先注射部位定位困難,一次給藥后很快降解,多次給藥使治療復(fù)雜,增大了創(chuàng)傷和感染的機(jī)會(huì),而且過量的GDNF注射會(huì)帶來副作用[8] Georgievska B,Kirik D,Bjorklund A,et al. Aberrant sprouting and downregulation of tyrosine hydroxylase in lesioned nigrostriatal dopamine neurons induced by long-lasting overexpression of glial cell line derived neurotrophic factor in the striatum by lentiviral gene transfer.[J].Exp Neurol,2002,177(2):461-474],最后由于GDNF是大分子物質(zhì),難以通過血腦屏障,使得其很難到達(dá)腦內(nèi)發(fā)揮其生物學(xué)作用。因此,學(xué)者們將目光集中到基因治療上,及通過一定的載體將GDNA轉(zhuǎn)入體內(nèi),使其在體內(nèi)穩(wěn)定表達(dá),長(zhǎng)期發(fā)揮其生物學(xué)效應(yīng)。

      基因治療的步驟包括:目的基因的獲得,表達(dá)載體的構(gòu)建,靶細(xì)胞的選擇,將目的基因?qū)氚屑?xì)胞的方法,目的基因在宿主細(xì)胞的表達(dá)。本研究根據(jù)GeneBank報(bào)道的GDNF基因序列,自行設(shè)計(jì)引物,使GDNFcDNA大量擴(kuò)增,瓊脂糖電泳結(jié)果表明,擴(kuò)增的DNA長(zhǎng)630bp,與文獻(xiàn)報(bào)道一致。接著對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物及脂質(zhì)體進(jìn)行酶切,構(gòu)建重組質(zhì)粒pEGFP-GDNF cDNA。根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,GDNF的N末端氨基酸殘基對(duì)其生物活性的維持作用不大[9]Eigenbrot C,Gerber N. X-ray structure of glial cell-derived neurotrophic 1.9 resolution and implications for receptor binding[J].Nat Struct Biol,1997,4:435-438.]],因此目前絕大多數(shù)實(shí)驗(yàn)是將EGFP基因連接到GDNF基因的5‘端,兩者之間以編碼柔軟肽段的核苷酸連接以保持EGFP與GDNF各自的活性,這樣既保留了GDNF蛋白對(duì)神經(jīng)的營(yíng)養(yǎng)活性,又可以通過EGFP觀察GDNF蛋白在體內(nèi)的表達(dá)[10] Che ZY,He ZY,He C,et al.Human glial cell-derived neurotrophic factor:a [11]structure-function analysis[J].Biochem Biophys Res Commun,2000,268(3):692-696..。本實(shí)驗(yàn)同樣將質(zhì)粒連接到GDNF基因的5‘端,為下一步觀察將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到靶細(xì)胞后的生物學(xué)效應(yīng)提供了依據(jù)。但通過該方法構(gòu)建的重組質(zhì)粒在動(dòng)物體內(nèi)是否可以發(fā)揮正常生物學(xué)活性,還需動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)。目的基因與載體形成重組體的過程中需要特異性核酸內(nèi)切酶,限制性內(nèi)切酶酶切后產(chǎn)生的是兩種不相同的粘性末端,提高了基因重組技術(shù)中T4 DNA連接酶連接反應(yīng)的效率。及確保GDNFcDNA片段是正向、單倍插入到載體pEGFP-C3中。對(duì)重組質(zhì)粒再次用限制性內(nèi)切酶BamHI 、XhoI雙酶切進(jìn)行雙酶切,根據(jù)電泳條帶重組質(zhì)粒大小6.0Kb,切出的擴(kuò)增產(chǎn)物大小約630bp,pEGFP-C3大小為5400bp,兩者之和為重組質(zhì)粒的大小,證明通過雙酶切連接后確實(shí)得到了需要的重組質(zhì)粒。抽提質(zhì)粒DNA成功的關(guān)鍵是把染色體DNA、蛋白質(zhì)、RNA去除干凈,獲得純度較高的質(zhì)粒DNA。由圖-2第3道電泳圖譜可以看出有兩條電泳亮帶,其中分子量小的大約相當(dāng)于3.5kb的條帶可能就是未除去的蛋白質(zhì)或RNA,也有可能是質(zhì)粒酶切不完全導(dǎo)致連接產(chǎn)物中含有空質(zhì)粒。針對(duì)這一問題,我們加強(qiáng)了對(duì)電泳膠帶的回收純化,并應(yīng)用YT豐富的培養(yǎng)基,用多級(jí)培養(yǎng)的方法,在大腸桿菌的培養(yǎng)基內(nèi)挑取一個(gè)單一菌落在接種到一個(gè)新的培養(yǎng)基,經(jīng)培養(yǎng)一段時(shí)間后再次挑取單一菌落接種只新的培養(yǎng)基,如此反復(fù)多次,則可保證提取質(zhì)粒DNA的參量和純度,另外在抽提過程中要把握好變性和復(fù)性的時(shí)機(jī),使試劑與染色體充分作用變性,又要使染色體DNA不至斷裂與質(zhì)粒DNA相混淆。

      大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)是較為常用的一種。其優(yōu)點(diǎn)是遺傳背景比較清楚,表達(dá)水平較穩(wěn)定,易操作,有許多菌株突變體和含強(qiáng)啟動(dòng)子的載體可供選擇,并且成本低、蛋白表達(dá)量高、容易純化等。在重組質(zhì)粒的構(gòu)建中,本實(shí)驗(yàn)是通過化學(xué)法將GDNF和質(zhì)粒連接反應(yīng)液轉(zhuǎn)化JM109感受態(tài),感受態(tài)是本實(shí)驗(yàn)室通過CaCl2法制備獲得,將PCR陽性單菌落挑至新鮮的LB液體培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),第二天將菌液送西安交通大學(xué)法醫(yī)學(xué)司法鑒定中心代為測(cè)序,結(jié)果表明片段為630bp,與文獻(xiàn)報(bào)道一致,且未發(fā)生突變。

      本研究成功擴(kuò)增大鼠GDNFcDNA基因,并成功構(gòu)建重組質(zhì)粒pEGFP-GDNFcDNA,經(jīng)雙酶切及測(cè)序證明與文獻(xiàn)報(bào)道一致,未發(fā)生異常突變。GDNF因其具有強(qiáng)大的神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)作用,而被越來越多的應(yīng)用到帕金森、腦缺血、脊髓損傷、神經(jīng)痛等的治療和神經(jīng)再生研究中,本課題成功擴(kuò)增并構(gòu)建重組質(zhì)粒,對(duì)于GDNF的基因治療及下一步利用合適的載體介導(dǎo)重組質(zhì)粒在大鼠體內(nèi)轉(zhuǎn)染,觀察GDNF基因治療的可行性并進(jìn)一步驗(yàn)證該重組質(zhì)粒的活性奠定了基礎(chǔ)。

      參考文獻(xiàn)

      [1] Lin LFH,Doherty DH,Lile JD,et al.GDNF:a glial cell line-derived neurotrophic factor for midobrai dopaminergic neurons.[J].Science,1993,260(5111):1130-1132

      [2]Oorschot DE,Mclennan IS.The trophic requirements of mature motoneurons.[J].Brain Res,1998,789(2):315-321

      [3]Annette Markus,Tushar D,Patel,William D.Snider. Neurotrophic factors and axonal growth[J].Curr Opin Neurobiol,2002,12(5):523-53

      [4]Curtis R,Scherer SS,Somogyi R,Ip NY.Retrograde axonal transport of LIF is increased by peripheral nerve injury:correlation with increased LlF expression in distal nerve.[J].Neuron,1994,12():19l-204.

      [5]Barbara F,Macie JF,Jurgen E,et al.CNS glial are targets for GDNF and neurturin.[J].Histochem Cell Biol,1998,110(2):595-601.

      [6]Choir DL,Lin Q,Chang YN,et al.Dopaminergic neurons protected from degeneration by glial cell linedderived neurotrophic factor gene therapy[J].Science,1997,275(5):838-841.

      [7]Hisashi K,Chihoko S,Wen RZ,et al.Induction of glialcell line-derived neurotrophic factor receptor proteins incerebral cortex and striatum after permanent middle cerebral artery occlusion in rat.[J].Brain Research,1999,834(5):190-195

      [8]Georgievska B,Kirik D,Bjorklund A,et al. Aberrant sprouting and downregulation of tyrosine hydroxylase in lesioned nigrostriatal dopamine neurons induced by long-lasting overexpression of glial cell line derived neurotrophic factor in the striatum by lentiviral gene transfer.[J].Exp Neurol,2002,177(2):461-474

      [9]Eigenbrot C,Gerber N. X-ray structure of glial cell-derived neurotrophic 1.9 ? resolution and implications for receptor binding[J].Nat Struct Biol,1997,4:435-438.

      [10]Che ZY,He ZY,He C,et al.Human glial cell-derived neurotrophic factor:a [11]structure-function analysis[J].Biochem Biophys Res Commun,2000,268(3):692-696.

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