劉佳,陳建華
蛋白質(zhì)Nα-末端乙?;墓δ苎芯窟M(jìn)展
劉佳,陳建華
蛋白質(zhì) Nα-末端乙?;揎検怯?Nα-末端乙酰轉(zhuǎn)移酶(NATs)所催化的酶促反應(yīng)過程,其結(jié)果是蛋白質(zhì) N-末端的 α氨基接受來自于乙酰輔酶A(AcCoA)的乙?;T谡婧松镏?Nα-末端乙?;且环N廣泛存在的蛋白質(zhì)修飾方式,大約有 68%的酵母蛋白質(zhì)和 85%人蛋白質(zhì)是 Nα-乙?;揎椀模?],但原核和古細(xì)菌蛋白卻很少發(fā)生乙?;?。目前已發(fā)現(xiàn)在真核生物中存在 6個(gè) NATs亞型(NatA~NatF),每一亞型由一個(gè)或多個(gè)亞基組成,且各自都有其獨(dú)特的底物特異性,如起始甲硫氨酸被切除后,N-末端的絲氨酸、丙氨酸、蘇氨酸、甘氨酸和纈氨酸都能夠被NatA催化乙?;∟-末端第三個(gè)氨基酸為脯氨酸除外)[2]。盡管高等真核生物有更多蛋白質(zhì)是 Nα-末端乙?;揎椀?,表達(dá)更多的 NATs,但是酵母等低等真核生物的 Nα-末端乙?;J胶?NAT催化機(jī)制與高等真核生物是相似的[3]。到目前為止,人們發(fā)現(xiàn) Nα-末端乙酰化具有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)降解、抑制內(nèi)質(zhì)網(wǎng)易位和調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)間相互作用等功能,但我們還沒能完全了解 Nα-末端乙?;乃泄δ?。本文主要對(duì)Nα-末端乙酰化和 Nα-末端乙酰轉(zhuǎn)移酶的功能及其與病理聯(lián)系的研究進(jìn)展作一綜述。
1.1 調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的降解
Nα-末端乙?;c泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解和 N-末端規(guī)則途徑有著密切的關(guān)聯(lián)[4]。早期的研究表明帶有游離 α氨基的蛋白質(zhì)能被 ATP依賴性的泛素介導(dǎo)而降解,當(dāng) N-末端的 α氨基被乙?;揎椇竽軌蚍乐狗核亟閷?dǎo)的蛋白質(zhì)降解。然而,近年來的研究發(fā)現(xiàn),Nα-末端乙?;?N-末端規(guī)則途徑促進(jìn)的蛋白質(zhì)降解中起著重要作用。在真核生物中,Nα-末端降解決定子能夠介導(dǎo)蛋白質(zhì)泛素化和蛋白質(zhì)選擇性地被 26s蛋白酶體分解[5]。例如,保守高爾基體寡聚復(fù)合體亞基 Cog1的 Nα-末端乙?;髸?huì)發(fā)生降解[6]。
Nα-末端乙?;倪@兩個(gè)功能分支(促進(jìn)和抑制蛋白質(zhì)降解)看似相互矛盾,實(shí)際上兩者在細(xì)胞中可能是同時(shí)進(jìn)行的,但是在特定條件下每一分支分別應(yīng)用到特定的蛋白質(zhì)子集,同時(shí)細(xì)胞所處環(huán)境狀態(tài)對(duì) Nα-末端乙?;墓δ苡泻艽笥绊?。此外,酵母蛋白質(zhì)組學(xué)研究表明,NatB介導(dǎo)的Nα-末端乙酰化不影響蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性,即 Nα-末端乙?;葲]有穩(wěn)定蛋白質(zhì)的作用也沒有促進(jìn)蛋白質(zhì)降解的作用[7]。
1.2 調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)間的相互作用
Nα-末端乙酰化可以直接調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)-生物膜之間的相互作用。NatB催化原肌球蛋白 N末端乙?;?,可以增強(qiáng)原肌球蛋白二聚體頭尾之間的連接作用[8]。近年的研究表明,泛素結(jié)合酶 Ubc12的起始甲硫氨酸是被乙?;?,乙酰基消除了其 N-末端的一個(gè)正電荷,從而使Ubc12的 N-末端能與泛素連接酶 Dcn1的疏水口袋結(jié)合[9]。這是蛋白質(zhì)能夠識(shí)別蛋白質(zhì) Nα-末端乙?;氖讉€(gè)例子,與布羅莫結(jié)構(gòu)域(bromodomain)能特異性地結(jié)合組蛋白 N-末端乙酰化的氨基酸殘基相似[10]。晶體結(jié)構(gòu)分析顯示 Ubc12 N-末端的乙酰基通過氫鍵直接與 Dcn1的疏水口袋相互作用[9]。此外,Nα-末端乙?;€被證明能夠穩(wěn)定 α-突觸核蛋白的螺旋結(jié)構(gòu),并且能增強(qiáng)其與細(xì)胞膜的親和力[11]。
1.3 抑制蛋白質(zhì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)易位
蛋白質(zhì)的靶向作用與 Nα-末端乙?;兄厥獾穆?lián)系。研究發(fā)現(xiàn) Nα-末端乙?;瘜?duì)蛋白質(zhì)在細(xì)胞質(zhì)中的停留是必不可少的,這是因?yàn)槟承┑鞍踪|(zhì) Nα-末端乙酰化后不再易位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)[12],表明 Nα-末端乙酰化能夠抑制內(nèi)質(zhì)網(wǎng)易位,而Nα-末端缺少乙酰化的蛋白質(zhì)卻可以通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)易位進(jìn)入分泌途徑。
分泌蛋白和膜蛋白穿過 Sec61易位子通道進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔有兩個(gè)主要的機(jī)制:一個(gè)是依賴信號(hào)識(shí)別顆粒的共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn);另一個(gè)是依賴 Sec62的翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)。蛋白質(zhì)進(jìn)入哪種途徑取決于 N-末端 15~30個(gè)氨基酸殘基長度的導(dǎo)肽中心核的疏水性。Forte等[12]發(fā)現(xiàn),所有依賴 Sec62轉(zhuǎn)運(yùn)的蛋白質(zhì)乙?;髸?huì)留在胞漿中。Nα-末端乙?;牡鞍踪|(zhì)不能正確定位到 Sec61易位子,表明乙?;芸赡芷茐牧宿D(zhuǎn)位子自身的相互作用或者破壞了蛋白質(zhì)與起始靶因子(分子伴侶或者 Sec62復(fù)合體)的相互作用。盡管 Forte等明確表示,酵母蛋白為了實(shí)現(xiàn)翻譯后易位,它們需要處于非乙?;臓顟B(tài),但我們?nèi)圆磺宄绻麤]有 Nα-末端乙?;揎?,是否任何原本發(fā)生乙酰化的胞漿蛋白都能夠?qū)崿F(xiàn)易位?
1.4 調(diào)節(jié)蛋白酶體的定位
蛋白酶體是一個(gè)主要的細(xì)胞內(nèi)蛋白酶,并且能夠調(diào)控許多細(xì)胞活動(dòng),其中包括細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)質(zhì)量控制。在細(xì)胞存活期間,蛋白質(zhì)質(zhì)量控制對(duì)防止受損傷的蛋白質(zhì)累積至關(guān)重要[13]。蛋白酶體位于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中,蛋白酶體的亞基在細(xì)胞質(zhì)中組裝成前體復(fù)合物,然后前體復(fù)合物被運(yùn)輸進(jìn)入細(xì)胞核以便形成完整的復(fù)合物。在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,蛋白酶體平均分布在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中。在營養(yǎng)物質(zhì)充足的條件下,釀酒酵母的蛋白酶體主要累積在細(xì)胞核中。當(dāng)酵母細(xì)胞處于饑餓的條件下,蛋白酶體從細(xì)胞核再定位到細(xì)胞質(zhì)[14]。在酵母細(xì)胞中,NatA、NatB和 NatC是酵母細(xì)胞主要的NATs,分別使大約 50%、20%和 20%的蛋白質(zhì) N-末端乙?;W钚碌难芯勘砻?,在饑餓條件下,釀酒酵母的 NatB 和 NatC介導(dǎo)的蛋白質(zhì) Nα-末端乙?;軌蛴绊懙鞍酌阁w的分布[15]。蛋白酶體從細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)的再定位需要 NatB 和 NatC,敲除釀酒酵母的 NatB和 NatC能夠誘導(dǎo)蛋白酶體在饑餓條件下富集于細(xì)胞核中[15]。
2.1 催化 Nα-末端乙?;?/p>
在真核生物中已發(fā)現(xiàn)存在 6種 NATs亞型(NatA~NatF),它們都具有催化蛋白質(zhì) Nα-末端乙?;纳飳W(xué)活性,表 1列出了人的 6種不同 NATs的亞基組成及各自的底物特異性。這里需要強(qiáng)調(diào)的是 NatD在兩方面不同于其他的 NATs。首先,在酵母和人細(xì)胞中只有兩種底物能被NatD催化乙酰化,即組蛋白 H2A和 H4[16];其次,其他NATs亞型的底物特異性由位于底物 N-末端的前 2~5個(gè)氨基酸殘基所決定,而 NatD的底物特異性由底物 N-末端的前 30~50個(gè)氨基酸殘基所決定。表 2總結(jié)了不同NATs(NatA~NatE)缺失或突變后酵母和人細(xì)胞系所產(chǎn)生的功能異常,從中可看出 NATs對(duì)細(xì)胞的生存和生長具有重要的作用。NatF是近幾年被發(fā)現(xiàn)的一種 NAT亞型,目前只在高等真核生物中發(fā)現(xiàn)有 NatF的存在。此外,NatF還可以催化 N-末端具有 Met-Lys-序列的底物發(fā)生 Nα-末端乙?;?N-末端在酵母中卻很少發(fā)生乙?;?9],從而賦予人的 Nα-末端乙?;S度高于酵母。
表1 人 NATs的亞基組成和底物特異性
表2 NATs缺失或突變后酵母細(xì)胞和人細(xì)胞系的影響
2.2 其他生物學(xué)活性
NATs催化 Nα-末端乙酰化的生物學(xué)活性已經(jīng)得到了充分證明。而且有證據(jù)表明 NATs還具有催化賴氨酸乙?;淖饔茫琇im等和 Shin等已經(jīng)證明,人的 NatA能夠催化 β-連環(huán)蛋白和肌球蛋白輕鏈激酶的賴氨酸殘基乙?;?0-21]。NatA也可催化 hNaa10p在 K136處進(jìn)行自乙?;?。
NATs不但具有催化活性,而且能夠不依賴其催化活性對(duì)細(xì)胞的活動(dòng)進(jìn)行調(diào)節(jié)。例如,人類的Naa10p(hNaa10p)與 p21活化激酶(PAK)結(jié)合后能夠影響 PAK與鳥苷轉(zhuǎn)換因子(PIX)的相互作用,從而抑制細(xì)胞遷移[22]。Lee等[23]提出 hNaa10p可以不依賴乙酰轉(zhuǎn)移酶的活性與 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶 1(DNMT1)相互作用,從而促進(jìn)DNMT1與目標(biāo) DNA之間的作用,最終實(shí)現(xiàn) E-鈣黏蛋白轉(zhuǎn)錄沉默。
NATs和 Nα-末端乙酰化在病理過程中起著重要的調(diào)節(jié)作用。人體缺失 NatA活性會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的發(fā)育缺陷,且在許多腫瘤中也會(huì)出現(xiàn) NatA失調(diào)的情況[24]。2011年,人們發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)由 NAT基因突變引起的人類遺傳病——奧氏(Ogden)綜合征。它是一種致命的伴 X染色體紊亂疾病,臨床表現(xiàn)為顱面骨畸形、張力過低、發(fā)育遲緩和心律失常等。編碼 NatA催化亞基(hNaa10p)的基因突變是引起該病的主要原因。
一些研究發(fā)現(xiàn),hNaa10同時(shí)扮演著雙重角色,既可作為癌蛋白起作用,又可抑制腫瘤。Naa10p在肺癌、結(jié)直腸癌和乳腺癌等不同類型癌癥中過表達(dá)。幾項(xiàng)研究表明,hNaa10p可以作為癌蛋白起作用,例如當(dāng)癌細(xì)胞缺失hNaa10p后,能夠誘導(dǎo) p53依賴性的細(xì)胞凋亡[25];在某些腫瘤中細(xì)胞周期蛋白 D1會(huì)出現(xiàn)突變、擴(kuò)增及過表達(dá)的現(xiàn)象,hNaa10p可誘導(dǎo)細(xì)胞周期蛋白 D1的轉(zhuǎn)錄使其表達(dá)異常,從而導(dǎo)致腫瘤[26]。同時(shí),另一些研究表明,hNaa10p具有抑癌作用,Kuo等[27]已經(jīng)報(bào)道,當(dāng)乳腺癌細(xì)胞過表達(dá)Naa10p時(shí)細(xì)胞增長減慢和致瘤性降低。除 NatA外,其他幾種 NATs亞型同樣可以從不同的方面調(diào)節(jié)細(xì)胞的生長和凋亡。研究發(fā)現(xiàn) NatB在肝癌細(xì)胞中過表達(dá),而 NatD在同種類型的癌細(xì)胞中表達(dá)量卻降低[28]。
最新的研究發(fā)現(xiàn) Nα-末端乙?;哂蟹€(wěn)定 α-突觸核蛋白,促進(jìn) Sup35淀粉樣蛋白的形成和防止亨廷頓蛋白(Htt)聚集的作用[29]。Nα-末端乙?;谏窠?jīng)系統(tǒng)變性疾?。ㄈ缗两鹕?、克雅病和亨廷頓?。┌l(fā)生發(fā)展中的作用有待進(jìn)一步研究。
蛋白質(zhì)-末端乙酰化作為一個(gè)多功能的調(diào)節(jié)劑,具有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)降解、抑制內(nèi)質(zhì)網(wǎng)易位和調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)復(fù)合物形成等作用。此外,NATs和 Nα-末端乙酰化在生理和病理過程中也起著重要的調(diào)節(jié)作用,這將為某些疾病發(fā)病機(jī)制研究和治療開辟新的途徑。到目前為止,在真核生物中已鑒定出了6種 NATs(NatA~NatF),是否還存在更多的 NATs仍然是一個(gè)有待研究的問題。未來的研究方向應(yīng)側(cè)重于 Nα-末端乙?;陌l(fā)生機(jī)制,以及探究是否 Nα-末端乙酰化的功能具有像 Nα-末端乙?;鞍滓粯拥亩鄻有?。
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10.3969/cmba.j.issn.1673-713X.2015.02.015
210009南京,中國藥科大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院
陳建華,Email:chenjhnj@163.com
2015-02-09