范海燕,范可章,蔡 健,盧良峰
(1.阜陽師范學(xué)院 生物與食品工程學(xué)院, 安徽 阜陽 236037;2. 河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程系, 河南 中牟 451460)
小麥K-CMS保持系品種遺傳多樣性的系統(tǒng)聚類分析
范海燕1,范可章1,蔡 健1,盧良峰2*
(1.阜陽師范學(xué)院 生物與食品工程學(xué)院, 安徽 阜陽 236037;2. 河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程系, 河南 中牟 451460)
采用系統(tǒng)聚類分析法對22個小麥K-CMS保持系品種的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。以2 年田間試驗(yàn)得到的品種株高、穗長、小穗數(shù)、穗下節(jié)長、穗粒草重、穗粒數(shù)、穗粒重、旗葉長等農(nóng)藝性狀為依據(jù), 計算22 個品種間遺傳距離, 采用類平均分析法對供試材料進(jìn)行聚類分析。結(jié)果表明: 供試的21 個品種共劃分為5 個類群,Ⅰ類為金源6號,秦豫麥1號,寶亮1號,財源1號,光泰68,糧源26;Ⅱ類為鄭大121,金科1號,南04-59,華育129;Ⅲ類為駐麥168,科林7371,宇豐1號,紅滿天1號;Ⅳ類為憑心2號,河科大527,鑫麥68,科森05-1;Ⅴ類為洛麥30,珍麥1號,百農(nóng)419,建華0165。劃分結(jié)果與系譜分析基本一致, 并把系譜來源不清的品種劃分到相應(yīng)的雜種優(yōu)勢群。小麥K-CMS保持系品種形態(tài)學(xué)形狀檢測是研究保持系品種間遺傳差異的一種方法, 可為小麥“三系”選育提供初步的理論依據(jù)。
小麥;K-CMS; 農(nóng)藝性狀; 遺傳多樣性; 聚類分析
小麥細(xì)胞質(zhì)雄性不育(Cytoplasmicmalesterile,CMS)是小麥雜交育種和雜種優(yōu)勢利用的重要工具。目前人們已經(jīng)創(chuàng)制了40 余種不同細(xì)胞質(zhì)雄性不育類型, 其中以T型、V型和K型等不育系的研究較多, 并基本實(shí)現(xiàn)了“三系”配套, 選育出一批雜交組合已在生產(chǎn)上小面積示范推廣,其中,T型不育系研究出現(xiàn)較早,應(yīng)用范圍較大,但其恢復(fù)源狹窄、恢復(fù)因子比較復(fù)雜[1]。以黏果山羊草(Ae.kotschyi)細(xì)胞質(zhì)不育基因控制的K型不育系雖出現(xiàn)的較晚,卻克服了T型不育系恢復(fù)源窄、種子皺縮等缺點(diǎn),被認(rèn)為是最有應(yīng)用前景的新類型[2]。研究表明,K型小麥雜種優(yōu)勢利用的突破在于特殊類型種質(zhì)—新保持系的出現(xiàn),因此,通過對K型雄性不育保持系遺傳多樣性的研究,對于增加和豐富普通小麥的遺傳變異,拓寬其種質(zhì)資源和提高小麥產(chǎn)量具有重要意義[3]。
近年來,多元統(tǒng)計分析中的聚類分析和相關(guān)分析被應(yīng)用于農(nóng)業(yè)研究中,如數(shù)量遺傳、植物生態(tài)分類、植物病蟲害預(yù)測等方面[4-7]。蔡健等[8]用系統(tǒng)聚類方法分析了20個皖北主栽小麥品種的遺傳多樣性。愈世蓉等[9]對小麥聚類分析結(jié)果表明:由于遺傳分離以及對不同株系不同方向的選擇,使同一組合的不同后代產(chǎn)生了比較大的遺傳差異,在聚類上成為不同的類。張芬等[10]對冬小麥品種作的聚類分析也有類似結(jié)果。
本研究利用系統(tǒng)聚類和相關(guān)分析方法對21個小麥K-CMS保持系品種進(jìn)行遺傳多樣性分析,探討品種間遺傳差異,旨在為合理利用K-CMS保持系種質(zhì)資源、小麥“三系”選育和親本雜交組配提供初步的理論依據(jù)。
1.1 試驗(yàn)材料
22個小麥K-CMS保持系由河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院盧良峰老師提供(表1)。
1. 2 材料種植
田間實(shí)驗(yàn)于2013-2014 年在河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院試驗(yàn)基地進(jìn)行。采用隨機(jī)完全區(qū)組設(shè)計,3 次重復(fù)。每小區(qū)定株調(diào)查10 株。對以下8種性狀分別進(jìn)行田間考查及實(shí)驗(yàn)室考種:株高、穗長、小穗數(shù)、穗下節(jié)長、穗粒草重、穗粒數(shù)、穗粒重、旗葉長等。
1.3 統(tǒng)計分析方法
多元分析采用劉來福[11]的計算方法,聚類用常用的類平均法。
表l 供試小麥K-CMS保持系品種
1.3.1 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化
以當(dāng)年所有參試小麥品種的株高、穗長、小穗數(shù)、穗下節(jié)長、穗粒草重、穗粒數(shù)、穗粒重、旗葉長等8個農(nóng)藝性狀數(shù)據(jù),進(jìn)行聚類分析。由于8個農(nóng)藝性狀單位不一致,故聚類、相關(guān)分析前對原始數(shù)據(jù)作標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化變換[12]
(n—品種數(shù),y—變數(shù)觀測值)。
1.3.2 系統(tǒng)聚類及相關(guān)分析
兩年的性狀平均數(shù)經(jīng)正態(tài)標(biāo)準(zhǔn)化后, 采用歐氏距離(Euclideandistance)計算成對品種的遺傳距離。采用類平均法(UPGMA,unweightedpairgroupmethodarithmeticaverage)對遺傳距離矩陣進(jìn)行聚類分析。對聚類分析結(jié)果計算共表型相關(guān)系數(shù) (copheneticcorrelationcoefficient) 矩陣。兩個矩陣之間的相似性采用相關(guān)分析。用DPS3.01專業(yè)軟件[13]聚類。
2.1 22個小麥K-CMS保持系農(nóng)藝性狀調(diào)查
2013-2014 年在河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院試驗(yàn)基地進(jìn)行田間試驗(yàn),并對所有參試小麥品種的株高、穗長、小穗數(shù)、穗下節(jié)長、穗粒草重、穗粒數(shù)、穗粒重、旗葉長等8個農(nóng)藝性狀進(jìn)行調(diào)查(表2)。
2.2 依據(jù)農(nóng)藝性狀的系統(tǒng)聚類分析
對調(diào)查性狀作方差分析,并對各性狀的原始數(shù)據(jù)作標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化變換。對品種遺傳距離的類平均法聚類結(jié)果 (圖1) 進(jìn)行共表型相關(guān)分析,表明品種遺傳距離矩陣與類平均法聚類樹表型相關(guān)系數(shù)矩陣的相關(guān)系數(shù)為0.745 5, 達(dá)極顯著,說明聚類結(jié)果可靠。若以整個遺傳距離的總平均數(shù)作尺度對聚類圖的結(jié)果進(jìn)行分類,可將供試材料劃分為5個類群,Ⅰ類為金源6號,秦豫麥1號,寶亮1號,財源1號,光泰68,糧源26;Ⅱ類為鄭大121,金科1號,南04-59,華育129;Ⅲ類為駐麥168,科林7371,宇豐1號,紅滿天1號;Ⅳ類為憑心2號,河科大527,鑫麥68,科森05-1;Ⅴ類為洛麥30,珍麥1號,百農(nóng)419,建華0165。劃分結(jié)果與系譜分析基本一致,并把系譜來源不清的品種劃分到相應(yīng)的雜種優(yōu)勢群??梢姡螒B(tài)學(xué)形狀檢測是研究小麥K-CMS保持系品種間遺傳差異的一種方法,可為小麥“三系”選育和親本雜交組配提供初步的理論依據(jù)。
表2 22個小麥K-CMS保持系品種的農(nóng)藝性狀
2.3 主要農(nóng)藝性狀間的相關(guān)分析
8 個農(nóng)藝性狀間的相關(guān)系數(shù)如表3所示。
其中x1為穗長,x2為穗下節(jié)長,x3為小穗數(shù),x4為穗粒草重,x5為穗粒數(shù),x6為穗粒重,x7為株高,x8為旗葉長。從表 2 可以看出小穗數(shù)與穗粒草重、穗粒數(shù)和穗粒重的相關(guān)系數(shù)分別為0.568、0.577和0.576,表現(xiàn)出極顯著的正相關(guān),小穗數(shù)與株高的相關(guān)系數(shù)為0.438,表現(xiàn)出顯著正相關(guān);穗粒草重與穗粒數(shù)、穗粒重和株高的相關(guān)系數(shù)分別為0.573、0.895和0.635,表現(xiàn)出極顯著的正相關(guān);穗粒數(shù)與穗粒重的相關(guān)系數(shù)為0.545,表現(xiàn)出極顯著的正相關(guān)性;
圖1 22份小麥K-CMS保持系種質(zhì)基于農(nóng)藝性狀的系統(tǒng)聚類圖
表3 小麥K-CMS保持系各農(nóng)藝性狀間的相關(guān)系數(shù)
穗粒重與株高的相關(guān)系數(shù)為0.576,表現(xiàn)出極顯著的正相關(guān)性。因此,在合理利用K-CMS保持系種質(zhì)資源、親本選配及雜種后代選擇時,注意小穗數(shù)與穗粒草重、穗粒數(shù)、穗粒重和株高,穗粒草重與穗粒數(shù)、穗粒重和株高,;穗粒數(shù)與穗粒重、株高之間的關(guān)系,選育出強(qiáng)優(yōu)勢組合。
利用植物細(xì)胞質(zhì)雄性不育性進(jìn)行作物雜交育種的實(shí)踐,保持系對不育系授粉產(chǎn)生不育后代的同時,會在一定程度上把保持系的遺傳多樣性貢獻(xiàn)給不育系,從而使不育系的遺傳多樣性增加,達(dá)到培育優(yōu)質(zhì)雜交種的目的[14]。作物遺傳變異的產(chǎn)生是遺傳育種的基礎(chǔ),鑒別作物遺傳多樣性水平可精確估計其遺傳變異的水平。外部形態(tài)的多樣性是遺傳多樣性最直觀的表現(xiàn)之一,如顏色、體形、外形等性狀。對于質(zhì)量性狀,遺傳控制顯得較為簡單,方法簡便;數(shù)量性狀受環(huán)境的制約并存在遺傳與環(huán)境的交互作用,需借助嚴(yán)密的統(tǒng)計分析,從特定的雜交試驗(yàn)和后裔測定來計算遺傳方差在總表型方差中的比例和交互作用,用一系列遺傳參數(shù)度量群體的遺傳變異[8]。本研究對21個小麥K-CMS保持系的遺傳多樣性進(jìn)行了分析,通過農(nóng)藝性狀調(diào)查,形態(tài)學(xué)分析,利用類平均法(UPGMA)聚類,成功地將供試材料劃分為6個類群,劃分結(jié)果與系譜親緣相比基本一致。蔡健[15]等利用AFLP標(biāo)記和形態(tài)學(xué)形狀檢測的皖北地區(qū)小麥主栽品種遺傳多樣性,研究結(jié)果表明:基于品種表現(xiàn)型計算的遺傳距離的聚類結(jié)果,基本上是與AFLP標(biāo)記計算的遺傳相似系數(shù)的聚類結(jié)果相一致,而且基于表現(xiàn)型聚類結(jié)果進(jìn)行了共表型相關(guān)分析,分析結(jié)果表明,品種遺傳距離矩陣與類平均法(UPGMA)聚類樹表型相關(guān)系數(shù)矩陣的相關(guān)系數(shù)為0.826,相關(guān)達(dá)極顯著,說明聚類結(jié)果可靠。本研究中對聚類分析結(jié)果進(jìn)行共表型相關(guān)分析表明,品種遺傳距離矩陣與類平均法(UPGMA)聚類樹表型相關(guān)系數(shù)矩陣的相關(guān)系數(shù)為0.745 5,相關(guān)達(dá)極限著,也說明了聚類結(jié)果的可靠性。
[1] 劉東濤,張改生,劉宏偉,等.小麥雄性不育的育性基因定位研究進(jìn)展[J].麥類作物學(xué)報,1999,19(4):8-13.
[2] 謝迎秋,孫蘭珍.K、V型雄性不育小麥保持系、恢復(fù)系預(yù)測的細(xì)胞學(xué)和生化標(biāo)記的初步研究[J].山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,1998,29(1):53-58, 61-62.
[3] 盧良峰,朱鳳榮.K型小麥保持系及恢復(fù)系篩選研究[J].河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2004(10):3-6.
[4] 胡秉民,王振宙.聚類分析及其在農(nóng)業(yè)研究中的應(yīng)用[J].浙江農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,1984,10(1):121-127.
[5] 王 林.應(yīng)用模糊聚類軟件預(yù)測麥類赤霉病[J].計算機(jī)農(nóng)業(yè)應(yīng)用,1993(4):31-34.
[6]JainAK.Dataclustering: 50yearsbeyondK-means[J].PatternRecognitionLetters, 2010, 31(8,SI): 651-666.
[7]CilibrasiRL,VitányiPM.Afastquartettreeheuristicforhierarchicalclustering[J].PatternRecognition, 2011, 44(3): 662-677.
[8] 蔡 健,蘭 偉,羅瑞麗,等.皖北小麥主栽品種遺傳多樣性的系統(tǒng)聚類法分析[J].中國農(nóng)學(xué)通報,2006,22(11):143-146.
[9] 俞世蓉,郭藹平,魏燮中.聚類分析應(yīng)用于小麥品種資源數(shù)量分類上的研究初探[J].南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,1982(4):117-125.
[10]張 芬,楊 明.冬小麥數(shù)量性狀的遺傳距離估測與聚類分析[J].安徽農(nóng)學(xué)院學(xué)報,1987,14(1):23-30.
[11]劉來福.作物數(shù)量性狀的遺傳距離及其測定[J].遺傳學(xué)報,1979,6(3):349-355.
[12]郭平仲.?dāng)?shù)量遺傳學(xué)分析[M].北京:首都師范大學(xué)出版社,1993:8-11.
[13]唐啟義,馮明光.實(shí)用統(tǒng)計分析及其DPS數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)[M].北京:科學(xué)出版社,2002:551-603.
[14]黃壽松,李萬隆,徐 潔,等.藍(lán)標(biāo)型小麥核雄性不育、保持系的選育研究[J].作物學(xué)報,1991,17(2):81-87.
[15]蔡 健,蘭 偉,李飛天,等.利用AFLP標(biāo)記和形態(tài)性狀檢測皖北小麥主栽品種的遺傳多樣性[J].核農(nóng)學(xué)報,2007,21(2):116-119.
GeneticdiversitydetectedbyclusteranalysisofthemaintainerLineforK-typecytoplasmicmalesterility(CMS)inwheat
FANHai-yan1,FANKe-zhang1,CAIJian1,LULiang-feng2*
(1.SchoolofBiologicalScienceandFoodEngineering,FuyangNormalUniversity,FuyangAnhui236037,China; 2.SchoolofModernAgriculturalEngineering,HenanVocationalCollegeofAgricultural,Henan451450,China)
Thepresentstudywascarriedoutwiththeobjectivetoinvestigatethegeneticdiversityofthe22themaintainerlineforK-typecytoplasmicmalesterility(CMS)inwheatbyclusteranalysis.Geneticdistancebasedontheagronomiccharactersofplantheight,paniclelength,perpanicle,paniclenextsectionlength,earkernelweight,perpaniclegrains,perpaniclegrainsweightandflagleaflengthwascalculatedandclusteredusingtheunweightedpair-groupmethodArithmeticAverages(UPGMA).Theresultsshowedthat22cultivarscouldbeclassifiedintosixgroups.GroupIconsistsofjinyuan6,qinyumai1,baoliang1,caiyuan1,guangtai68,liangyuan26;GroupⅡconsistsofzhengda121,jinke1,nan04-59,huayu129;GroupⅢconsistsofzhumai168,kelin7371,yufeng1,hongmantian1;GroupⅣconsistsofpingxin2,hekeda527,xinmai68,kesen05-1;GroupⅤconsistsofluomai30,zhenmai1,bainong419,jianhua0165.Theresultswereconsistentwiththegroupingbasedontheavailablepedigreedata.Moreover,cultivarswithunkonwnpedigreewereassignedtotheestablishedheteroticgroups.ThephenotypesofthemaintainerlineforK-CMSinwheatcanbeappliedinclassifingcultivars.Thestudyinitiallyprovidesusefulinformationfortheselectionofparentsinthedevelopmentofwheatcultivarsand"threelines"aswell.
wheat;K-typecytoplasmicmalesterility;agronomiccharacters;geneticdiversity;clusteranalysis
2015-09-20
安徽省高校省級自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(KJ2014A194)。
范海燕(1975-),女,碩士,研究方向:人體生理與生化學(xué)理論與教學(xué)。
盧良峰 (1956-),男,副教授,研究方向:遺傳學(xué)。Email:luliangf845969181@qq.com。
S330
A
1004-4329(2015)04-069-05
10.14096/j.cnki.cn34-1069/n/1004-4329(2015)04-069-05