方向,鄧偉
(廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院 廣西壯族自治區(qū)腫瘤防治研究所,南寧530021)
·綜述·
HBV DNA整合與肝癌關(guān)系的研究進(jìn)展
方向,鄧偉
(廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院 廣西壯族自治區(qū)腫瘤防治研究所,南寧530021)
乙型肝炎病毒(HBV)與人基因組整合在肝細(xì)胞癌發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。目前研究表明,HBV包含編碼表面(S)、核心(C)、聚合酶(P)和X蛋白的4個(gè)開(kāi)放閱讀框(ORF),均可以形成斷裂位點(diǎn)整合到人基因組,其整合率從高至低依次是X區(qū)、S區(qū)、C區(qū)和P區(qū)。HBV在人染色體上的整合位點(diǎn)并非隨機(jī)分布,而是存在與肝癌相關(guān)的潛在優(yōu)勢(shì)整合位點(diǎn),這些優(yōu)勢(shì)整合位點(diǎn)附近的基因常常涉及到細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化和永生化。HBV DNA整合入人基因組后,通過(guò)影響整合位點(diǎn)周?chē)蚬δ?、形成具有致癌作用的HBV截短蛋白以及增加人染色體的不穩(wěn)定性促使肝細(xì)胞的癌變。
乙型肝炎病毒;DNA整合;肝細(xì)胞癌;宿主基因組;遺傳信息;染色體異位;堿基缺失
肝細(xì)胞癌(簡(jiǎn)稱(chēng)肝癌)是常見(jiàn)惡性腫瘤之一,發(fā)病率居惡性腫瘤的第3位。全球每年有大約60萬(wàn)人死于肝癌,其中將近一半發(fā)生在中國(guó)[1]。乙型肝炎病毒(HBV)慢性感染是我國(guó)肝癌最重要的危險(xiǎn)因素,在HBV慢性感染期間,HBV可以通過(guò)DNA整合來(lái)影響整合位點(diǎn)周?chē)蚬δ?,破壞或促進(jìn)對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)和分化至關(guān)重要基因的表達(dá),從而促進(jìn)肝細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化[2]。目前研究[3~6]證實(shí),HBV DNA可通過(guò)整合進(jìn)入宿主基因組促使肝細(xì)胞癌變。現(xiàn)將HBV整合與肝癌關(guān)系的研究進(jìn)展綜述如下。
1.1 HBV整合機(jī)制 1980年人們首次在HBV相關(guān)性肝癌患者體內(nèi)中檢測(cè)到HBV DNA與人染色體整合[7]。HBV復(fù)制過(guò)程中存在反轉(zhuǎn)錄這一特殊階段,人體感染HBV后,HBV病毒成熟體通過(guò)黏附進(jìn)入到肝細(xì)胞,HBV DNA疏松的環(huán)狀結(jié)構(gòu)(rcDNA)首先轉(zhuǎn)變?yōu)殚]合環(huán)狀DNA(cccDNA),接著cccDNA轉(zhuǎn)錄為前基因組RNA(pgRNA)進(jìn)入細(xì)胞質(zhì),然后反轉(zhuǎn)錄為rcDNA,rcDNA再次進(jìn)入肝細(xì)胞核循環(huán)。在cccDNA的循環(huán)中,部分rcDNA可能復(fù)制失敗,形成雙鏈線型DNA(d1DNA),d1DNA可以在斷裂DNA修復(fù)過(guò)程中再次整合入宿主基因。同時(shí),HBV感染可造成其雙鏈DNA斷裂(DsBs),DsBs修復(fù)途徑可以把不同來(lái)源的非鄰近的DNA片段拼接起來(lái),這就為HBV整合入宿主基因提供了分子基礎(chǔ)。HBV整合至宿主基因組中有利于其持續(xù)感染,長(zhǎng)期慢性炎癥可以導(dǎo)致肝細(xì)胞生命周期改變和增殖,增加宿主基因組DNA終端數(shù)量,反過(guò)來(lái)又有利于HBV DNA整合到宿主基因組中[8]。
1.2 HBV整合特點(diǎn) HBV是具有松弛環(huán)形部分雙鏈的DNA病毒,全長(zhǎng)3 200 bp,由長(zhǎng)短2條鏈組成。其中長(zhǎng)鏈為負(fù)鏈,攜帶編碼HBV蛋白的所有遺傳信息,其包含編碼表面(S)、核心(C)、聚合酶(P)和X蛋白的4個(gè)重疊的開(kāi)放閱讀框(ORF)。理論上4個(gè)ORF均可以形成斷裂位點(diǎn)插入到人基因組,但研究發(fā)現(xiàn)它們整合的頻率并不相同,其整合率從高至低依次是X、S、C、P,目前尚無(wú)完整HBV DNA整合到人基因組的病例報(bào)道。HBV這4個(gè)ORF在與人染色體整合后會(huì)重新排列,這種排列紊亂會(huì)導(dǎo)致基因表達(dá)異常,如果這種異常不斷疊加,最終會(huì)促使細(xì)胞癌變。
X基因是HBV DNA中最小的一個(gè)ORF,Jiang等[9]對(duì)癌組織與癌旁組織進(jìn)行對(duì)照,發(fā)現(xiàn)癌組織和癌旁組織中均存在整合,HBV整合部位平均分布在DR1和DR2附近。但屠紅等[10]對(duì)40例肝癌病例整合位點(diǎn)的研究發(fā)現(xiàn),HBV DNA整合可發(fā)生在X基因的任意長(zhǎng)度,并非只出現(xiàn)在HBV DR1和DR2區(qū),X基因有96%以截短形式插入宿主細(xì)胞DNA。研究表明,C-末端截短的HBX可以通過(guò)Stat3/Nanog級(jí)聯(lián)反應(yīng)增強(qiáng)肝癌干細(xì)胞樣特性,在肝癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮重要作用[11]。另外,C-末端截短的HBX可以促進(jìn)CD133肝癌干細(xì)胞亞型的出現(xiàn),并在肝癌中表現(xiàn)出惡性和干細(xì)胞樣特征,通過(guò)激活法尼酯衍生物X受體(FXR)介導(dǎo)癌癥干細(xì)胞作用[12]。HBX蛋白作為反式激活因子,可以影響調(diào)節(jié)性非編碼RNA(ncRNA),包括microRNA和長(zhǎng)ncRNA,HBX也參與表觀遺傳修飾和DNA修復(fù),HBX與各種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑相互作用,如p53、Wnt和核因子-κB通路[13]。另外,X蛋白還可引起肝癌中p21、p16、p62myc、c-myc、p2lras等癌基因和抑癌基因高表達(dá)[14,15]。另一個(gè)經(jīng)常出現(xiàn)斷裂整合的HBV基因是pre-S2/S基因,其編碼3種不同結(jié)構(gòu)相關(guān)的包膜蛋白,pre-S2蛋白可以作為反式激活因子,并與人端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因(hTERT)啟動(dòng)子相互作用,增加端粒酶活性[16]。pre-S2/S基因還可以產(chǎn)生截短的pre-S2/S蛋白,在大量肝癌組織中可以檢測(cè)到截短的pre-S2/S蛋白,這種截短的蛋白有與c-myc和c-fos相類(lèi)似的反式激活作用,可以通過(guò)激活與轉(zhuǎn)錄相關(guān)的級(jí)聯(lián)反應(yīng),提高肝細(xì)胞的增生率[17]。
HBV整合可分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型,Ⅰ型整合起始于DRl向負(fù)鏈3端延伸;Ⅱ型整合也起始于DRl,但延伸方向和Ⅰ型相反;Ⅲ型整合起自DR2向負(fù)鏈3端延伸;Ⅳ型整合也起自DR2,延伸方向和Ⅲ型相反。Chauhan等[18]報(bào)道,土撥鼠在感染HBV和土撥鼠肝炎病毒1 h后,其肝組織內(nèi)可以檢測(cè)到HBV和土撥鼠肝炎病毒DNA及其復(fù)制中間體,同時(shí)可以檢測(cè)到HBV DNA整合到宿主基因中,在感染后1 h和3 h可以檢測(cè)到土撥鼠肝炎病毒X和pre-S序列插入宿主基因組。該研究證實(shí)自然條件下的肝炎病毒在入侵后不久就可以整合入肝細(xì)胞DNA。
目前在人23對(duì)染色體中均發(fā)現(xiàn)HBV DNA的整合,因此有學(xué)者認(rèn)為,HBV DNA在人染色體中的整合是隨機(jī)的[19]。但是,隨著對(duì)HBV DNA整合研究的深入以及第二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的整合位點(diǎn)被發(fā)現(xiàn)。有研究表明,在癌組織中,HBV在染色體5、8、10、19中整合常見(jiàn),在癌旁組織中,HBV在1號(hào)和2號(hào)染色體上整合更常見(jiàn);每個(gè)染色體上的整合位點(diǎn)數(shù)量與非腫瘤組織中脆性位點(diǎn)的數(shù)量相關(guān),而與肝癌組織無(wú)關(guān)[20]。Zhao等[22]發(fā)現(xiàn),HBV傾向于整合在染色體脆性位點(diǎn)和包括CpG島的功能基因區(qū),并且優(yōu)先整合17號(hào)染色體[21]。近年研究顯示,HBV整合存在相對(duì)熱點(diǎn)區(qū)段,HBV整合傾向于發(fā)生在染色體轉(zhuǎn)錄區(qū)域和重復(fù)序列,包括長(zhǎng)散布核元素(LINE)、短散點(diǎn)核因子(SINE)和Alu序列。盡管目前所發(fā)現(xiàn)的熱點(diǎn)整合位點(diǎn)只能代表總體事件中的一小部分,但是反復(fù)發(fā)生的整合插入位點(diǎn)表明HBV存在與肝癌相關(guān)的潛在優(yōu)勢(shì)整合位點(diǎn)。最常見(jiàn)的HBV整合事件位于TERT和骨髓/淋巴或混合白血病4(MLL4),TERT在覆蓋細(xì)胞衰老中起重要作用,細(xì)胞衰老通常在大多數(shù)癌細(xì)胞中上調(diào),MLL4編碼組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶,其在癌基因組的表觀遺傳修飾中具有關(guān)鍵作用。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的HBV DNA在人基因組上整合的腫瘤相關(guān)靶基因有100多個(gè),包括MLL4、TERT、纖連蛋白1、SMAD家族成員5SMAD5、細(xì)胞周期蛋白A、細(xì)胞周期蛋白E1、Rho鳥(niǎo)嘌呤核苷酸交換因子GEF12、磷酸酶和肌動(dòng)蛋白調(diào)節(jié)物4、鈣信號(hào)相關(guān)基因、RNA結(jié)合蛋白fox-1同系物、醇脫氫酶1B、氨基甲酰磷酸合成酶1、雌激素相關(guān)受體γ、視黃酸誘導(dǎo)的1、CTD小磷酸酶、低密度脂蛋白相關(guān)性蛋白1B、sentrin特異性肽酶5、PDGF受體等,這些基因涉及到細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化和永生化。
Jiang等[23]報(bào)道,在60例HBV相關(guān)性肝癌患者癌組織及癌旁組織中都存在相同的X基因C-末端截短基因,此外,兩組的病毒序列具有相似的C1653T、A1762T/G1764A低頻率突變,HBV插入的頻率和模式在癌組織和癌旁組織之間相似,表明大部分HBV DNA整合事件與肝癌的發(fā)生無(wú)關(guān)。關(guān)于HBV整合的致癌機(jī)制,有研究認(rèn)為HBV整合的相關(guān)基因突變和HBV整合引起的染色體穩(wěn)定性改變與肝細(xì)胞癌變有關(guān)。但是,目前普遍認(rèn)為HBV整合導(dǎo)致肝癌的機(jī)制包括以下3個(gè)方面。
3.1 影響整合位點(diǎn)周?chē)虻墓δ?Cao等[24]使用名為“病毒掃描”的生物學(xué)信息系統(tǒng),在3例肝癌患者癌組織中發(fā)現(xiàn)HBV整合到KMT2B基因,但對(duì)應(yīng)的癌旁組織未發(fā)現(xiàn),由此推測(cè)HBV整合誘導(dǎo)宿主驅(qū)動(dòng)基因的改變可能會(huì)促使病毒癌基因表達(dá)和肝癌進(jìn)展。HBV基因組攜帶著諸多轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)元件,如增強(qiáng)子1、增強(qiáng)子2、負(fù)性調(diào)控元件、核心上游調(diào)節(jié)序列、基本核心啟動(dòng)子等,HBV DNA通過(guò)整合嵌入人基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域,通過(guò)這些調(diào)控元件影響HBV整合位點(diǎn)周?chē)蚬δ?,從而?dǎo)致肝癌發(fā)生。
3.2 形成具有致癌作用的HBV截短蛋白 在HBV相關(guān)性肝癌中存在有大量截短的X蛋白,Tu等研究顯示,全長(zhǎng)的X蛋白可以抑制ras與myc引起的集落生長(zhǎng)的功能,截短的X蛋白可以加強(qiáng)ras與myc的轉(zhuǎn)化功能。整合的HBV DNA能夠表達(dá)合成成熟的pre-S/S和X蛋白觸發(fā)級(jí)聯(lián)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),同時(shí)也可以促使肝細(xì)胞惡變。
3.3 增加人基因的不穩(wěn)定性 HBV DNA整合到人基因組可引起人染色體DNA的缺失和易位以及細(xì)胞DNA的擴(kuò)增和融合轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的產(chǎn)生,從而增加基因組DNA的脆性和不穩(wěn)定性。在肝癌組織中可以檢測(cè)到17p13、4q32、llpl4、4q32、11q13等區(qū)域的小片段缺失,有研究[25]在肝癌組織中發(fā)現(xiàn)HBV DNA整合位點(diǎn)兩端出現(xiàn)17號(hào)與18號(hào)染色體易位,并且18號(hào)染色體整合位點(diǎn)附近出現(xiàn)堿基缺失。
目前已經(jīng)初步探明了HBV的整合機(jī)制,并檢測(cè)到了一些常見(jiàn)整合位點(diǎn)和受累基因,其中Pang等[26]通過(guò)量化HBV DNA與肝癌患者白細(xì)胞基因組的整合,確定OR4F3和OR4F17的組合是HBV相關(guān)疾病的新型潛在生物標(biāo)志物。但是,對(duì)于HBV DNA整合導(dǎo)致肝細(xì)胞癌變的確切機(jī)制目前尚不完全清楚。HBV DNA整合與肝癌的關(guān)系非常復(fù)雜,不僅需要精心設(shè)計(jì)的流行病學(xué)研究,還需要對(duì)常見(jiàn)整合基因進(jìn)行體外細(xì)胞功能試驗(yàn)和動(dòng)物模型試驗(yàn),為肝癌的預(yù)防和治療提供理論基礎(chǔ)和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
[1] Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Cancer statistics, 2016[J]. CA Cancer J Clin, 2016,66(1):7-30.
[2] Wang M, Xi D, Ning Q. Virus-induced hepatocellular carcinoma with special emphasis on HBV[J]. Hepatol Int, 2017,11(2):171-180.
[3] Lee S, Lee MJ, Zhang J, et al. C-terminal-truncated HBV X promotes hepato-oncogenesis through inhibition of tumor-suppressive beta-catenin/BAMBI signaling[J]. Exp Mol Med, 2016,48(12):e275.
[4] Levrero M, Zucman-Rossi J. Mechanisms of HBV-induced hepatocellular carcinoma[J]. J Hepatol, 2016,64(1 Suppl):S84-101.
[5] Takeda H, Takai A, Inuzuka T, et al. Genetic basis of hepatitis virus-associated hepatocellular carcinoma: linkage between infection, inflammation, and tumorigenesis[J]. J Gastroenterol, 2017,52(1):26-38.
[6] Kawai-Kitahata F, Asahina Y, Tanaka S, et al. Comprehensive analyses of mutations and hepatitis B virus integration in hepatocellular carcinoma with clinicopathological features[J]. J Gastroenterol, 2016,51(5):473-486.
[7]Bonilla Guerrero R, Roberts LR. The role of hepatitis B virus integrations in the pathogenesis of human hepatocellular carcinoma[J]. J Hepatol, 2005,42(5):760-777.
[8] Ringelhan M, Heikenwalder M, Protzer U. Direct effects of hepatitis B virus-encoded proteins and chronic infection in liver cancer development[J]. Dig Dis, 2013,31(1):138-151.
[9] Jiang Z, Jhunjhunwala S, Liu J, et al. The effects of hepatitis B virus integration into the genomes of hepatocellular carcinoma patients[J]. Genome Res, 2012,22(4):593-601.
[10] 屠紅,高海峰,馬國(guó)豪,等.肝癌中乙型肝炎病毒整合位點(diǎn)的研究[J].中華醫(yī)學(xué)雜志,2006,86(18):1249-1252.
[11] Ching RHH, Sze KMF, Lau EYT, et al. C-terminal truncated hepatitis B virus X protein regulates tumorigenicity, self-renewal and drug resistance via STAT3/Nanog signaling pathway[J]. Oncotarget, 2017,8(14):23507-23516.
[12] Ng KY, Chai S, Tong M, et al. C-terminal truncated hepatitis B virus X protein promotes hepatocellular carcinogenesis through induction of cancer and stem cell-like properties[J]. Oncotarget, 2016,7(17):24005-24017.
[13] Geng M, Xin X, Bi LQ, et al. Molecular mechanism of hepatitis B virus X protein function in hepatocarcinogenesis[J]. World J Gastroenterol, 2015,21(38):10732-10738.
[14]Qadri I, Fatima K, Abde LHH. Hepatitis B virus X protein impedes the DNA repair via its association with transcription factor, TFIIH[J]. BMC Microbiol, 2011,11:48.
[15] Knoll S, Furst K, Thomas S, et al. Dissection of cell context-dependent interactions between HBx and p53 family members in regulation of apoptosis: a role for HBV-induced HCC[J]. Cell Cycle, 2011,10(20):3554-3565.
[16] Wang LH, Huang W, Lai MD, et al. Aberrant cyclin A expression and centrosome overduplication induced by hepatitis B virus pre-S2 mutants and its implication in hepatocarcinogenesis[J]. Carcinogenesis, 2012,33(2):466-472.
[17] Park NH, Song IH, Chung YH. Chronic hepatitis B in hepatocarcinogenesis[J]. Postgrad Med J, 2006,82(970):507-515.
[18] Chauhan R, Churchill ND, Mulrooney-Cousins PM, et al. Initial sites of hepadnavirus integration into host genome in human hepatocytes and in the woodchuck model of hepatitis B-associated hepatocellular carcinoma[J]. Oncogenesis, 2017,6(4):e317.
[19] Sung WK, Zheng H, Li S, et al. Genome-wide survey of recurrent HBV integration in hepatocellular carcinoma[J]. Nat Genet, 2012,44(7):765-769.
[20] Yang X, Wu L, Lin J, et al. Distinct hepatitis B virus integration patterns in hepatocellular carcinoma and adjacent normal liver tissue[J]. Int J Cancer, 2017,140(6):1324-1330.
[21] Zhao LH, Liu X, Yan HX, et al. Genomic and oncogenic preference of HBV integration in hepatocellular carcinoma[J]. Nat Commun, 2016,7:12992.
[22] Lau CC, Sun T, Ching AK, et al. Viral-human chimeric transcript predisposes risk to liver cancer development and progression[J]. Cancer cell, 2014,25(3):335-349.
[23] Jiang S, Yang Z, Li W, et al. Re-evaluation of the carcinogenic significance of hepatitis B virus integration in hepatocarcinogenesis[J]. PLoS One, 2012,7(9):e40363.
[24] Cao S, Wendl MC, Wyczalkowski MA, et al. Divergent viral presentation among human tumors and adjacent normal tissues[J]. Sci Rep, 2016,6:28294.
[25] Tamori A, Yamanishi Y, Kawashima S, et al. Alteration of gene expression in human hepatocellular carcinoma with integrated hepatitis B virus DNA[J]. Clin Cancer Res, 2005,11(16):5821-5826.
[26] Pang Y, Guo W, Wang J, et al. Gene copy number variations in the leukocyte genome of hepatocellular carcinoma patients with integrated hepatitis B virus DNA[J]. Oncotarget, 2016,7(7):8006-8018.
10.3969/j.issn.1002-266X.2017.42.034
R735
A
1002-266X(2017)42-0102-03
國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81260319)。
鄧偉(E-mail: 9608946@qq.com)
2017-06-21)