韓雪++朱麗莉++粟朝芝++吳松成++陶宇航
摘要:采用特異性引物PCR技術(shù)獲得長順綠殼蛋雞PRL基因,將其克隆至pGM-T載體,并對該序列進(jìn)行測序分析。結(jié)果表明,長順綠殼蛋雞PRL基因全序列長度為690 bp,包含5個(gè)外顯子和4個(gè)內(nèi)含子,編碼229個(gè)氨基酸。將長順綠殼蛋雞PRL基因與GenBank已公布的雞、鴨、鵝、魚等動(dòng)物的PRL基因序列進(jìn)行同源性比較,發(fā)現(xiàn)親緣關(guān)系越遠(yuǎn)則同源性越低。
關(guān)鍵詞:長順綠殼蛋雞;催乳素基因;克隆;序列分析
中圖分類號: Q785文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號:1002-1302(2016)12-0082-03
收稿日期:2015-10-13
基金項(xiàng)目:貴州省科學(xué)技術(shù)基金(編號:黔科合J字[2011]2174);貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生創(chuàng)新基金(編號:黔農(nóng)科合[創(chuàng)新基金]2010011);貴州省動(dòng)植物育種專項(xiàng)(編號:黔農(nóng)育專字[2011]027);貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院專項(xiàng)(編號:黔農(nóng)科院院專項(xiàng)[2014]006號)。
作者簡介:韓雪(1982—),女,江蘇徐州人,碩士,助理研究員,主要從事動(dòng)物遺傳育種研究。E-mail:hanxue8855601@126.com。
通信作者:陶宇航,副研究員,主要從事家禽養(yǎng)殖研究。E-mail:1043694421@qq.com。
催乳素(prolactin,PRL)是動(dòng)物垂體前葉嗜酸細(xì)胞分泌的一種多肽類激素,對哺乳動(dòng)物的乳腺發(fā)育、泌乳、卵巢功能、維持妊娠、機(jī)體免疫等具有重要的生物學(xué)效應(yīng)[1]。在家禽中,PRL是促進(jìn)母禽就巢孵卵行為和調(diào)控生殖活動(dòng)的關(guān)鍵激素[2],就巢期間PRL表達(dá)量升高可抑制垂體促性腺激素的分泌,致使卵巢萎縮,排卵泡停止,最終終止產(chǎn)蛋[3]。很多物種PRL基因的cDNA或基因全序列已被測定,其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物在不同物種中高度保守。對人、雞、鴨、鵝等動(dòng)物的研究表明,PRL基因由5個(gè)外顯子和4個(gè)內(nèi)含子構(gòu)成。禽類PRL前體含229個(gè)氨基酸,其中包括30個(gè)氨基酸的信號肽序列和199個(gè)氨基酸的PRL成熟蛋白[4]。
長順綠殼蛋雞因其產(chǎn)地地處貴州省長順縣而得名,是中國稀有的珍禽品種。長順綠殼蛋雞是在貴州省特定自然生態(tài)環(huán)境下,經(jīng)長期自然選擇和人工選擇而形成的品種,具有耐粗飼、抗病力強(qiáng)、覓食能力強(qiáng)等特點(diǎn)。然而,長順綠殼蛋雞產(chǎn)蛋量低、就巢性強(qiáng),嚴(yán)重限制了其產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。以長順綠殼蛋雞為研究對象,克隆其催乳素基因并進(jìn)行測序分析,為長順綠殼蛋雞品種資源的保護(hù)利用及其產(chǎn)蛋性能的提高提供依據(jù)。
1材料與方法
1.1材料
血樣采自貴州省長順縣長寨鎮(zhèn)新民村長順綠殼蛋雞純種繁殖場,翅靜脈采血,共采取30羽長順綠殼蛋雞的血樣。所有母雞均在相同環(huán)境下單籠飼養(yǎng),采取的血樣經(jīng)EDTA抗凝劑抗凝,送至實(shí)驗(yàn)室于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2方法
1.2.1DNA提取
采用血液基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)提取血樣中的DNA。
1.2.2引物設(shè)計(jì)
根據(jù)GenBank已公布的禽、鼠等PRL基因序列,采用Primer 5.0軟件在序列保守區(qū)設(shè)計(jì)引物,引物序列見表1,由北京鼎國生物技術(shù)有限公司合成。
1.2.3PCR擴(kuò)增與測序
50 μL PCR反應(yīng)體系為10×PCR Buffer 5 μL、dNTP(10 μm) 1 μL、Template 1 μL、primer-F(10 μm) 1 μL、primer-R(10 μm) 1 μL、rTaqDNA聚合酶(2 U/μL) 0.5 μL,最后采用ddH2O補(bǔ)足至50 μL。PCR反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,52~47 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共50個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。PCR產(chǎn)物采用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送至北京鼎國生物技術(shù)有限公司進(jìn)行克隆和測序。
1.3數(shù)據(jù)處理
將PRL基因5個(gè)外顯子片段進(jìn)行拼接,并采用GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST分析。同時(shí),將cDNA序列翻譯成氨基酸序列,確定正確的開放閱讀框(open readingf rame,ORF);采用DNAman軟件(www.dnastar.com)對長順綠殼蛋雞PRL基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫公布的其他動(dòng)物PRL基因序列進(jìn)行核苷酸、氨基酸序列同源性比較及生物信息學(xué)分析。
2結(jié)果與分析
2.1長順綠殼蛋雞PRL基因的PCR擴(kuò)增
以長順綠殼蛋雞血總DNA為模板,利用5對特異引物分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物與預(yù)期片段大小吻合,引物擴(kuò)增結(jié)果見圖1。
2.2重組質(zhì)粒的酶切鑒定
將重組質(zhì)粒導(dǎo)入大腸桿菌,經(jīng)過藍(lán)白斑和抗性篩選,提取陽性大腸桿菌并進(jìn)行質(zhì)粒提取,然后對質(zhì)粒進(jìn)行EcoRⅠ酶切鑒定。結(jié)果表明,重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,將陽性克隆送至北京鼎國生物技術(shù)有限公司測序,最后對其外顯子序列進(jìn)行拼接。
2.3長順綠殼蛋雞PRL基因的序列測定
序列測定結(jié)果(圖2)表明,長順綠殼蛋雞PRL基因 cDNA 片段長690 bp,共編碼229個(gè)氨基酸,起始密碼子為ATG,終止密碼子為TAA。
[FK(W13][TPHX1.tif]
[FK(W22][TPHX2.tif]
2.4PRL基因核苷酸和氨基酸序列同源性比較
將長順綠殼蛋雞PRL基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫上獲取的雞、鴨、鵝、魚等動(dòng)物的PRL基因序列(表2)進(jìn)行同源性分析。由表3可知,禽類PRL基因編碼區(qū)序列具有高度的保守性。其中,長順綠殼蛋雞與白來航、太和絲羽烏骨雞、隱性白洛克的核苷酸序列同源性最高,為99.9%;與尖嘴鱸的同源性最低,僅為47.3%。氨基酸序列同源性比較可得到與核苷酸序列相似的結(jié)果。
2.5系統(tǒng)發(fā)育分析
將PRL基因序列繪制進(jìn)化樹(圖3)。遺傳進(jìn)化分析表明,長順綠殼蛋雞與楊山雞、太和絲羽烏骨雞、白來航的親緣關(guān)系較近,與人、鯉魚、尖嘴鱸的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
3結(jié)論與討論
大多數(shù)研究者認(rèn)為,PRL是促進(jìn)母禽就巢孵卵行為和調(diào)控[CM(25]生殖活動(dòng)的關(guān)鍵激素[5],過高和過低的催乳素均對卵泡發(fā)
育不利[6]。Dawson等研究發(fā)現(xiàn),火雞和鴿剛就巢時(shí),PRL顯著升高以維持正常的孵化期[7]。Reddy等研究發(fā)現(xiàn),催乳素水平與雞的產(chǎn)蛋量呈負(fù)相關(guān)[8-9]。PRL必須通過受體作用于靶細(xì)胞,[JP2]從而產(chǎn)生各種生理效應(yīng)。目前,關(guān)于催乳素受體基因(prolactin receptor,PRLR)與家禽就巢性之間的相關(guān)性研究表明,二者間相關(guān)不顯著[10]。雌激素受體基因(estrogen receptor,ER)、VIP、垂體特異轉(zhuǎn)錄因子(pituitary-specific transcription factor,POU1F1)基因等也會影響家禽就巢性,因此這些基因也是就巢性候選基因[11]。雖然學(xué)者已對這些基因開展了大量研究,但均側(cè)重于單基因研究,為揭示其就巢性機(jī)理,必須從PRL表達(dá)調(diào)控信號通道進(jìn)行更系統(tǒng)的研究。
本研究結(jié)果表明,長順綠殼蛋雞PRL基因編碼區(qū)序列全長為690 bp,共編碼229個(gè)氨基酸,基因推導(dǎo)的蛋白分子量為 29.122 ku,理論等電點(diǎn)pI為5.94,表明編碼肽鏈偏酸性。PRL氨基酸殘基二級結(jié)構(gòu)由41.58% α-螺旋、14.34% β-折疊、44.07%無規(guī)卷曲3種結(jié)構(gòu)組成。將克隆獲得的長
[FK(W25][TPHX3.tif]
順綠殼蛋雞PRL基因與GenBank數(shù)據(jù)庫公布的雞、鴨、鵝、魚等動(dòng)物的PRL基因序列進(jìn)行同源性比較,發(fā)現(xiàn)長順綠殼蛋雞與禽類的同源性均高于90%,氨基酸序列同源性高于90%。與其他動(dòng)物PRL基因相比較,發(fā)現(xiàn)親緣關(guān)系越遠(yuǎn)則同源性越低。同源分析結(jié)果表明,禽類PRL基因編碼區(qū)序列高度保守,可見物種分化以后,作為影響哺乳動(dòng)物產(chǎn)乳性狀的PRL發(fā)生了較大變異,這為PRL特性和作用機(jī)理的進(jìn)一步研究以及哺乳動(dòng)物產(chǎn)乳和繁殖性能的改良提供依據(jù)。
在禽類進(jìn)化的過程中,家雞、火雞、鵪鶉首先發(fā)生分支,而鵝與鴨的分支則較晚,這與序列分析結(jié)果一致。由于起源與進(jìn)化不同,長順綠殼蛋雞與原雞、白來航、楊山雞、太和絲羽烏骨雞、隱性白洛克聚為一類,再與鵪鶉、火雞、印度孔雀聚為一類,分支最外側(cè)的為人、鯉魚、尖嘴鱸。長順綠殼蛋雞、原雞、白來航、楊山雞等禽類與魚類的親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn),這與古生物學(xué)、形態(tài)學(xué)、生化遺傳學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)以及其他DNA分子水平上的分類結(jié)果基本一致,這也佐證了PRL基因全序列適合用于研究動(dòng)物種間系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。
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