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      馬鈴薯瘡痂病高效拮抗菌的篩選及鑒定

      2017-04-05 14:40:21高同國姜軍坡郭曉軍張冬冬
      江蘇農(nóng)業(yè)科學 2016年12期
      關鍵詞:生物防治

      高同國++姜軍坡++郭曉軍++張冬冬++朱寶成

      摘要:為獲得對馬鈴薯瘡痂?。╬otato scab)病原菌具有較強拮抗作用的優(yōu)良菌株,以筆者所在實驗室保存的237株細菌為出發(fā)菌株,采用十字交叉劃線法和平板擴散法進行初篩和復篩。經(jīng)篩選后得到1株拮抗活性明顯的菌株 12-82,其抑菌圈直徑達26.2 mm。經(jīng)菌落菌體形態(tài)觀察、16S rRNA基因序列分析及生理生化試驗,將菌株12-82初步鑒定為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens),該研究為開發(fā)防治馬鈴薯瘡痂病的生物菌劑奠定了基礎。

      關鍵詞:馬鈴薯瘡痂??;生物防治;解淀粉芽孢桿菌;菌種鑒定;生物菌劑

      中圖分類號: S435.32文獻標志碼: A

      文章編號:1002-1302(2016)12-0157-03

      收稿日期:2015-11-17

      基金項目:河北省自然科學基金(編號:C2015204031)。

      作者簡介:高同國(1984—),男,河北邢臺人,博士,講師,主要從事植物真菌病害及生物防治研究。E-mail:gtgrxf@163.com。

      通信作者:朱寶成,博士,教授,博士生導師,主要從事微生物發(fā)酵秸稈飼料研究。E-mail:baochengzhu@126.com。

      馬鈴薯種植區(qū)域廣泛,僅次于水稻、小麥和玉米。近年來,馬鈴薯瘡痂?。╬otato scab)的發(fā)生逐漸加重,已成為馬鈴薯主要病害之一。該病主要由鏈霉菌引起,可危害馬鈴薯塊莖,感病的薯塊表面形成痂狀病斑,影響馬鈴薯的外觀品質(zhì),從而降低薯塊的商品價值[1-2],嚴重時還會延遲馬鈴薯出苗,甚至減少產(chǎn)量[3]。在我國,引起瘡痂病的病原菌有瘡痂鏈霉菌(Streptomyces scabies)、酸性瘡痂鏈霉菌(S. acidiscabies)、腫痂鏈霉菌(S. turgidiscabies)和加利利鏈霉菌(S. galilaeus)等多種病原菌[4-5]。

      目前缺乏有效手段防治馬鈴薯瘡痂病,而利用生物防治方法越來越多地引起人們的重視。Beauséjour等利用生物制劑與殼聚糖結合用于防治瘡痂病取得良好效果[6]。Neeno-Eckwall等在田間試驗中使用S.diastatochromogenes PonSSII防治瘡痂病,癥狀明顯減輕[7]。Hiltunen等報道利用非致病性鏈霉菌也可以防治瘡痂鏈霉菌[8-10]。劉大群等采用生防拮抗鏈霉菌防治馬鈴薯瘡痂病,結果表明,不同的菌系有明顯的防效差異,單個拮抗菌的防效優(yōu)于2個拮抗菌的混合使用效果[11]。另外,利用微生物代謝產(chǎn)物防治瘡痂病也是有效手段之一,Han等報道利用芽孢桿菌產(chǎn)生的代謝物macrolactin A有效地防治馬鈴薯瘡痂病,使瘡痂病的發(fā)病率降低了40%[12]。

      本研究以瘡痂病病原菌瘡痂鏈霉菌作為指示菌,從筆者所在實驗室保存的237株細菌中篩選對瘡痂病有拮抗作用的菌種,并通過菌落菌體形態(tài)特征、16S rRNA基因序列和生理生化特性對拮抗活性較強的菌株進行鑒定,該研究以期為馬鈴薯瘡痂病的生物防治提供理論基礎。

      [BT1#]1材料與方法

      1.1試驗菌株

      馬鈴薯瘡痂病病原菌:瘡痂鏈霉菌,來源于河北農(nóng)業(yè)大學植物保護學院植物病理實驗室。237株細菌來源于河北農(nóng)業(yè)大學生命科學院制藥工程系。

      1.2供試培養(yǎng)基

      牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(NA):牛肉膏3.0 g、蛋白胨 10.0 g、NaCl 5.0 g、瓊脂15.0~20.0 g,加H2O至1 L,pH值7.0~7.2;NA培養(yǎng)基中不添加瓊脂為NB培養(yǎng)基;燕麥瓊脂培養(yǎng)基(OMA):瓊脂18.0 g,加2%燕麥汁至1 L,調(diào)pH值至7.2。以上培養(yǎng)基在121 ℃高壓滅菌30 min。

      1.3方法

      1.3.1制備病原菌孢子懸浮液

      將病原菌接種于OMA固體培養(yǎng)基中,置于28 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~5 d。取10 mL無菌水于長滿瘡痂病病原菌的培養(yǎng)皿中,用玻璃棒輕刮培養(yǎng)物表面的孢子,再用裝有脫脂棉的5 mL無菌注射器筒過濾除去菌絲團,濾液倒入離心管中,4 ℃、6 000 r/min離心15 min,使孢子沉淀,離心完畢后倒掉上清,將離心管在漩渦混合器上振蕩,使孢子沉淀物分散于殘存的無菌水中。在無菌條件下,將制備好的菌種用無菌水稀釋,孢子懸浮液的濃度不低于 107 CFU/mL。

      1.3.2拮抗菌篩選

      初篩:取100 μL孢子懸浮液均勻涂抹在OMA平板上,將已活化的待篩選菌種以十字劃線方式接種于培養(yǎng)皿中。28 ℃培養(yǎng)7 d,觀察抑菌圈的大小。

      復篩:將NA培養(yǎng)基上活化好的待篩選細菌接種于NB培養(yǎng)基,37 ℃、200 r/min發(fā)酵48 h,10 000 r/min離心10 min,收集上清液,并經(jīng)細菌濾器(0.22 μm)過濾,即得無菌發(fā)酵液,待用。取100 μL孢子懸浮液均勻涂抹在OMA平板上,將培養(yǎng)皿平均分為4個扇形區(qū)域,在扇形中央用打孔器打1個直徑6.0 mm的孔,用移液器取50 μL無菌發(fā)酵液滴于孔內(nèi),28 ℃培養(yǎng)7 d,測量抑菌圈的直徑(mm)。每處理重復3次。

      1.3.316S rRNA基因PCR擴增

      用十六烷基三甲基溴化銨(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,簡稱CTAB)提取菌株的總DNA[13],選用16S rRNA基因通用引物進行PCR擴增。正向引物為27F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,反向引物為1492R:5′-CTACGGCTACCTTGTTACGA-3′。25 μL PCR反應體系:DNA模板2 μL,10×緩沖液2.5 μL,正向引物與反向引物各0.5 μL,10 mmol/L dNTP 0.25 μL,Taq DNA聚合酶(5 U/μL)0.25 μL,ddH2O補足至25 μL。PCR反應條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 1 min,50 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,30個循環(huán);72 ℃ 10 min。PCR結束后,采用1%瓊脂糖凝膠對PCR結果進行檢測,并交華大基因進行序列測定。將菌株的16S rRNA基因序列與GenBank中已知的核酸序列進行BLAST比對,獲得相近屬種菌株序列,利用ClustalX 1.83、MEGA 5軟件構建 Neighbour-Joining系統(tǒng)發(fā)育樹。

      1.3.4形態(tài)學與生理生化鑒定

      將優(yōu)良拮抗細菌菌株接種于NA培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)24 h,觀察菌落形態(tài)并經(jīng)革蘭氏染色后鏡檢。參照《伯杰細菌鑒定手冊》[14]和《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》[15],采用細菌微量生化反應管對硝酸鹽還原、大分子利用、酶類利用以及耐鹽性等生理生化指標進行測定。

      2結果與分析

      2.1對馬鈴薯瘡痂病菌的抑菌效果

      從237株細菌中篩選得到4株對病原菌抑制效果較好的菌株,分別為3011、Z-6、12-82、12-34(圖1),其中菌株 12-82抑菌活性最強,抑菌圈直徑達26.2 mm。

      [TPGTG1.tif]

      2.2菌落、菌體形態(tài)

      拮抗菌株12-82在NA培養(yǎng)基平皿上生長良好,菌落形態(tài)呈圓形或近圓形,略隆起,乳白色,不透明,表面光滑,無色素產(chǎn)生,延長培養(yǎng)時間發(fā)現(xiàn),菌落干燥,有褶皺及突起,邊緣不整齊(圖2-A)。在光學顯微鏡下觀察發(fā)現(xiàn),經(jīng)革蘭氏染色后的拮抗細菌12-82菌株的菌體呈桿狀(圖2-B)。

      2.3總DNA提取和16S rRNA基因擴增結果

      進一步采用16S rRNA基因?qū)卓辜毦?2-82進行分子水平鑒定。首先采用CTAB法提取細菌的總DNA(圖3),表明該DNA可用于PCR擴增。

      用16S rRNA基因通用引物27F、1492R對菌株12-82總DNA進行PCR擴增,擴增結果具有單一特異性條帶(圖4),可直接將PCR產(chǎn)物送華大基因進行測序。

      以菌株12-82的總DNA為模板,PCR 擴增得到該菌株1.5 kb左右的基因片段,測序后提交GenBank獲取登錄號(KT247502),經(jīng)BLAST比對獲取若干同源序列。用 MEGA 5 構建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖5),可見菌株12-82與Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum FZB42的親緣關系最近(9778%)。

      2.4生理生化試驗結果

      根據(jù)菌落菌體形態(tài)及16S rRNA基因鑒定結果,對菌株12-82的生理生化性質(zhì)進行測定。從表1可見,菌株12-82經(jīng)動力試驗、伏-普反應(Voges-Proskauer reaction,簡稱 V-P反應)、接觸酶、糖類發(fā)酵、硝酸鹽還原、酪素水解、檸檬酸鹽利用、明膠水解、淀粉水解等反應均為陽性,甲基紅、丙二酸鹽反應均為陰性,與已報道的解淀粉芽孢桿菌性質(zhì)一致。

      綜合菌株12-82的形態(tài)特征、16S rRNA基因序列及菌株[CM(25]的生理生化特性,對照《伯杰細菌鑒定手冊》《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》,鑒定拮抗菌12-82菌株屬于解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)。

      3討論

      馬鈴薯瘡痂病是難以防治的世界性土傳病害,目前缺乏防治該病害的有效手段,而生物防治已成為防治植物病害的有效手段,芽孢桿菌因營養(yǎng)簡單、繁殖速度快、可產(chǎn)生內(nèi)生芽孢、抗逆能力強、易定殖等優(yōu)點而逐漸成為世界生物防治的重點。郭鳳柳等對從土壤中分離的對瘡痂病病原菌具有拮抗活性的菌株B1進行了鑒定,菌株B1屬于枯草芽孢桿菌[16]。李勇篩選出1株對瘡痂病有抑制作用的枯草芽孢桿菌ZWQ-1,其抑菌帶寬度最高為18.75 mm[17]。除上述報道外,國內(nèi)關于瘡痂病生物防治的報道較少。

      本研究從筆者所在實驗室保存的237株細菌中篩選獲得1株對瘡痂病病原菌瘡痂鏈霉菌具有較強拮抗作用的菌株 12-82,其抑菌圈直徑達26.2 mm。經(jīng)形態(tài)觀察、16S rRNA基因序列分析及生理生化試驗,初步鑒定該菌株為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)。本研究增加了國內(nèi)研究馬鈴薯瘡痂病生防菌株資源,為菌株12-82抑菌機制研究及應用奠定了基礎。

      [HS2][HT8.5H]參考文獻:[HT8.SS]

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