張跡++李智++張宇++袁巧云
摘要:大腸桿菌BL21(DE3)菌株是大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)最常用的宿主菌株,因此人們需要1種便捷有效的感受態(tài)細(xì)胞制備和轉(zhuǎn)化方法。一步法感受態(tài)細(xì)胞制備操作方便,只加1種試劑即可,更快捷穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化也更方便,不需要熱激。研究大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞一步法制備對(duì)BL21菌株的適用性,并對(duì)轉(zhuǎn)化過(guò)程中的關(guān)鍵參數(shù)進(jìn)行探索和優(yōu)化。結(jié)果表明,該一步法制備的BL21菌株感受態(tài)細(xì)胞可獲得106 CFU/μg DNA轉(zhuǎn)化效率,完全能夠滿足常規(guī)轉(zhuǎn)化要求。轉(zhuǎn)化過(guò)程中相關(guān)參數(shù)的最佳條件為冰水浴30 min,室溫放置10 min,37 ℃、150 r/min振蕩復(fù)蘇40 min。
關(guān)鍵詞:感受態(tài)細(xì)胞制備;一步法;大腸桿菌BL21(DE3)菌株;轉(zhuǎn)化條件
中圖分類號(hào): X172文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2016)12-0529-03
收稿日期:2015-11-04
基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金(編號(hào):31300099);江蘇省高等學(xué)校大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計(jì)劃(編號(hào):201310323046X)。
作者簡(jiǎn)介:張跡(1982—),男,江蘇宿遷人,博士,講師,主要從事環(huán)境污染物微生物降解及污染環(huán)境微生物修復(fù)研究。E-mail:zhangjihnu@163.com。
在分子生物學(xué)試驗(yàn)中,DNA重組技術(shù)和外源基因的表達(dá)是最常用的研究手段之一,質(zhì)粒轉(zhuǎn)化進(jìn)入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞是其頻繁使用的一項(xiàng)基本操作技術(shù)。這項(xiàng)技術(shù)分為2個(gè)部分,即大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的制備和質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化。目前,制備感受態(tài)細(xì)胞最常用的方法是CaCl2法[1-2]和電穿孔法[3]。電轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化效率高,但是需要一套特殊儀器,操作過(guò)程也很繁瑣;CaCl2法不需要特殊儀器,操作簡(jiǎn)便,重復(fù)性好,但耗時(shí)較長(zhǎng)[4]。1989年Chung等報(bào)道了一步法制備大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,該法操作簡(jiǎn)便、快捷、重復(fù)性好,獲得單位質(zhì)量轉(zhuǎn)化效率達(dá)到107~108個(gè)/μg單位質(zhì)量的轉(zhuǎn)化子,能夠滿足常規(guī)試驗(yàn)要求,并可在-70 ℃下長(zhǎng)期保存。一步法感受態(tài)細(xì)胞制備及其轉(zhuǎn)化法適用于DH5α、HB101、JM109等多個(gè)大腸桿菌常用菌株[5]。
大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)是目前最常用的外源蛋白表達(dá)系統(tǒng)[6],而大腸桿菌BL21(DE3)菌株是該表達(dá)系統(tǒng)最常用的宿主菌株[7],需要便捷有效的感受態(tài)細(xì)胞制備和轉(zhuǎn)化方法。本研究采用一步法制備大腸桿菌BL21菌株的感受態(tài)細(xì)胞,研究該方法對(duì)BL21菌株的適用性,并對(duì)轉(zhuǎn)化過(guò)程中的關(guān)鍵參數(shù)進(jìn)行探索和優(yōu)化。
1材料與方法
1.1菌株與質(zhì)粒
供試菌株:大腸桿菌BL21(DE3)菌株,由筆者所在實(shí)驗(yàn)室保存。
供試質(zhì)粒:PUC19(2 686 bp)、pET29a(5 371 bp)、pET29a-gfp(5 948 bp)。
1.2試劑
質(zhì)粒抽提試劑盒,購(gòu)自愛(ài)思進(jìn)生物技術(shù)(杭州)有限公司;IPTG、X-GaL、PEG3350、相關(guān)抗生素,均購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司。其他常規(guī)試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.3主要培養(yǎng)基和溶液配方
LB培養(yǎng)基(1 L):蛋白胨(Tryptone,OXCID)10.0 g;酵母提取物(Yeast extract,OXCID)5.0 g;NaCl 5.0 g;用去離子水補(bǔ)足1 000 mL,121 ℃高壓蒸汽滅菌30 min。配制固體培養(yǎng)基時(shí)加入2%瓊脂。
轉(zhuǎn)化與貯存溶液(TSS):液體LB培養(yǎng)基調(diào)pH值為6.5,含10% PEG3350,5%二甲基亞砜(DMSO),10%甘油,MgCl2 10 mmol/L,MgSO4 10 mmol/L,高壓蒸汽滅菌。
5×KCM溶液:KCl 0.5 mol/L,CaCl2 0.15 mol/L,MgCl2 0.25 mol/L。該溶液僅需少量配制(以mL計(jì)),過(guò)濾除菌,分裝成小份于-20 ℃保存?zhèn)溆茫煞磸?fù)凍融。
1.4大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞的制備
制備方法參照文獻(xiàn)[5]所介紹的一步法。活化大腸桿菌BL21菌株,從37 ℃培養(yǎng)過(guò)夜的新鮮LB平板中挑取BL21單菌落,接種到3 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)過(guò)夜;取1 mL過(guò)夜培養(yǎng)菌液接種入100 mL液體LB培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)至D600 nm=0.3~0.5(約3 h);將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)移到滅菌的50 mL離心管中,置冰上10 min;4 ℃、6 000 r/min離心5 min,棄上清;用10 mL預(yù)冷的無(wú)菌TSS重懸菌體細(xì)胞;冰上放置10 min,分裝120 μL/管(在冰上操作),-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.5大腸桿菌一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化
取無(wú)菌的1.5 mL離心管,加入1 μL待轉(zhuǎn)化質(zhì)粒,5×KCM 10 μL,ddH2O 39 μL,置冰上;從-70 ℃冰箱中取出大腸桿菌BL21菌株感受態(tài)細(xì)胞,立即融化;吸取50 μL感受態(tài)細(xì)胞加入上述離心管中,輕輕吹吸使之與上述試劑混勻,冰水浴20 min,室溫放置10 min;加入500 μL新鮮液體LB培養(yǎng)基,于37 ℃、150 r/min搖床中,振蕩復(fù)蘇40~50 min;室溫、 6 000 r/min 離心3 min,棄部分上清,留取約200 μL,重懸后涂布抗生素平板,37 ℃過(guò)夜培養(yǎng),觀察平板,計(jì)數(shù)轉(zhuǎn)化子數(shù),并計(jì)算轉(zhuǎn)化率。
轉(zhuǎn)化率=感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化后形成的菌落數(shù)(CFU)/DNA質(zhì)量(ecg)。
轉(zhuǎn)化所用質(zhì)粒均采用質(zhì)粒提取試劑盒并按其說(shuō)明書要求步驟操作,提取的質(zhì)粒樣品經(jīng)適度稀釋后,用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),根據(jù)其條帶亮度與標(biāo)準(zhǔn)的marker條帶比較并估算質(zhì)粒濃度。
1.6轉(zhuǎn)化過(guò)程中的參數(shù)處理
在大腸桿菌BL21菌株感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化過(guò)程中,分別設(shè)置冰水浴時(shí)間(0、5、10、20、30、40、50 min)、室溫放置時(shí)間(0、5、10、20、30、40、50 min)、復(fù)蘇過(guò)程中的搖床轉(zhuǎn)速(0、50、100、150、180、200 r/min)及復(fù)蘇時(shí)間(0、5、10、20、30、40、50 min)等一系列不同的參數(shù),研究這些參數(shù)對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響,探索大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞的最優(yōu)轉(zhuǎn)化條件。此外,為研究感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化后于4 ℃放置對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響,將感受態(tài)細(xì)胞在最佳條件下轉(zhuǎn)化并復(fù)蘇后,涂布抗生素平板,并于4 ℃保存,定時(shí)取平板(0、2、12、24 h),37 ℃ 過(guò)夜培養(yǎng)后分析計(jì)算轉(zhuǎn)化效率。以上所有處理均設(shè)置3個(gè)重復(fù),取平均值,用Excel作圖,圖中的誤差線均表示標(biāo)準(zhǔn)差。
2結(jié)果與分析
2.1不同質(zhì)粒對(duì)BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化
本研究分別使用大小不同的PUC19、pET29a、pET29a-gfp質(zhì)粒對(duì)BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化試驗(yàn),以探討大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞一步制備法對(duì)BL21菌株的適用性。轉(zhuǎn)化結(jié)果表明,3種不同大小的質(zhì)粒均對(duì)大腸桿菌BL21菌株一步法制備的感受態(tài)細(xì)胞成功地實(shí)現(xiàn)了轉(zhuǎn)化;其中分子量較小的質(zhì)粒pUC19所獲得的轉(zhuǎn)化效率最高,超過(guò)5×106 CFU/μg,分子量較大的質(zhì)粒pET29a和pET29a-gfp獲得的轉(zhuǎn)化效率約為3×106 CFU/μg,略低于pUC19(圖1)。
pET系列載體是常用的大腸桿菌表達(dá)載體,含有T7強(qiáng)啟動(dòng)子,廣泛應(yīng)用于在大腸桿菌BL21菌株中誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白[8-9]。結(jié)果表明,pET29a和pET29a-gfp成功地轉(zhuǎn)化入BL21菌株的一步法感受態(tài)細(xì)胞,并在本研究的試驗(yàn)條件下能獲得約 106 CFU/μg 的轉(zhuǎn)化效率,表明一步法制備的大腸桿菌BL21菌株感受態(tài)細(xì)胞完全能夠滿足常規(guī)重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化的要求。
2.2冰水浴時(shí)間對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響
在對(duì)大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化過(guò)程中,設(shè)置不同的冰水浴時(shí)間。圖2表明,前30 min隨著冰水浴時(shí)間的延長(zhǎng),感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化效率越來(lái)越高,在冰水浴30 min時(shí)表現(xiàn)出最高轉(zhuǎn)化效率,達(dá)到5.4×106 CFU/μg,之后轉(zhuǎn)化效率有所下降。因此,將轉(zhuǎn)化過(guò)程中的冰水浴時(shí)間設(shè)置為30 min最好。
2.3室溫放置時(shí)間對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響
大腸桿菌一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化過(guò)程中,在冰水浴結(jié)束后將轉(zhuǎn)化體系直接放置在室溫中以替代傳統(tǒng)CaCl2法的熱休克步驟。為研究室溫放置時(shí)間對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響,本研究設(shè)置一系列不同的室溫放置時(shí)間。圖3顯示:本組試驗(yàn)中室溫放置10 min時(shí),獲得最高的轉(zhuǎn)化效率達(dá)到7.5×106 CFU/μg;室溫放置時(shí)間不足10 min時(shí),轉(zhuǎn)化效率隨室溫放置時(shí)間延長(zhǎng)而逐漸提高;放置時(shí)間超過(guò)10 min時(shí),轉(zhuǎn)化效率則逐漸降低。因此,在室溫中放置10 min是大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化中該參數(shù)的最適條件。
2.4復(fù)蘇時(shí)間對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響
復(fù)蘇是大腸桿菌轉(zhuǎn)化過(guò)程中的重要步驟,大腸桿菌在此過(guò)程中將修復(fù)感受態(tài)細(xì)胞制備時(shí)留下的損傷,用于轉(zhuǎn)化子篩選的抗生素抗性基因在此過(guò)程中也得到了初步表達(dá)。為了研究一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化的適宜復(fù)蘇時(shí)間,本研究按照 10 min 的時(shí)間間隔設(shè)置了6個(gè)復(fù)蘇時(shí)間。圖4表明:隨著復(fù)蘇時(shí)間的延長(zhǎng),轉(zhuǎn)化效率逐步提高,至復(fù)蘇40 min時(shí)轉(zhuǎn)化效率達(dá)到最高值;復(fù)蘇時(shí)間為50 min時(shí),轉(zhuǎn)化效率較復(fù)蘇30、40 min 時(shí)有所降低。因此,40 min是大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化的最適復(fù)蘇時(shí)間。
2.5復(fù)蘇轉(zhuǎn)速對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響
復(fù)蘇過(guò)程中搖床振蕩的轉(zhuǎn)速對(duì)大腸桿菌轉(zhuǎn)化的效率有明顯影響。為研究大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化過(guò)程中最適的轉(zhuǎn)速,本試驗(yàn)設(shè)置了6組不同的復(fù)蘇轉(zhuǎn)速,圖5顯示:復(fù)蘇轉(zhuǎn)速在0~150 r/min時(shí),隨著轉(zhuǎn)速的增加,轉(zhuǎn)化的效率逐漸增高;轉(zhuǎn)速為150 r/min時(shí)轉(zhuǎn)化效率最高,達(dá)到 4.5×106 CFU/μg;復(fù)蘇轉(zhuǎn)速超過(guò)150 r/min之后,轉(zhuǎn)化效率開(kāi)始逐漸下降。因此,150 r/min是大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化的最適復(fù)蘇轉(zhuǎn)速。
在研究復(fù)蘇轉(zhuǎn)速對(duì)轉(zhuǎn)化效率影響的試驗(yàn)過(guò)程中,由于使用同一臺(tái)搖床設(shè)置不同轉(zhuǎn)速,因此本試驗(yàn)不同處理的轉(zhuǎn)化過(guò)程就存在先后。為保證所有的處理組同時(shí)培養(yǎng),將先轉(zhuǎn)化的菌體細(xì)胞涂布抗生素平板后于4 ℃冰箱中放置,待本試驗(yàn)所有處理全部轉(zhuǎn)化結(jié)束后一同放入37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)。然而,在本試驗(yàn)過(guò)程中偶然發(fā)現(xiàn)相同的重復(fù)平板在4 ℃放置后轉(zhuǎn)化子數(shù)明顯比未在冰箱中放置過(guò)的多,所以重新做了復(fù)蘇轉(zhuǎn)速的試驗(yàn),以避免4 ℃冰箱中放置對(duì)試驗(yàn)結(jié)果的影響,同時(shí)又對(duì) 4 ℃ 冰箱中放置時(shí)間對(duì)大腸桿菌轉(zhuǎn)化效率的影響進(jìn)行研究。
2.64 ℃冰箱中放置時(shí)間對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響
之前的研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)化后涂布的抗生素篩選平板在放入培養(yǎng)箱培養(yǎng)之前,于4 ℃冰箱中放置一段時(shí)間對(duì)最終的轉(zhuǎn)化效率會(huì)產(chǎn)生一定的影響。圖6表明:抗生素篩選平板在4 ℃冰箱中放置一段時(shí)間,長(zhǎng)出的轉(zhuǎn)化子數(shù)明顯比未在冰箱中放置過(guò)的多,冰箱中放置2 h轉(zhuǎn)化效率最高,在冰箱中放置12、24 h的轉(zhuǎn)化效率明顯下降,但仍比未在冰箱中放置過(guò)的高。
3討論
目前,生命科學(xué)研究領(lǐng)域的分子生物學(xué)試驗(yàn)技術(shù)高度發(fā)展[CM(25],并被廣泛應(yīng)用。感受態(tài)細(xì)胞的制備和轉(zhuǎn)化是其中的一項(xiàng)基本操作,其主要方法有化學(xué)轉(zhuǎn)化法[1-2]和電轉(zhuǎn)化法[3]。最常用的化學(xué)法是CaCl2法,此外,大腸桿菌感受態(tài)化學(xué)制備方法還有甘油-聚乙二醇法[10-11]、氯化銣法[12]和一步制備法[5,13]。大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞制備一步法操作便捷,其轉(zhuǎn)化也較方便,適用于DH5α、HB101、JM109等多個(gè)大腸桿菌常用菌株。大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化效率除了與其制備方法和菌株有關(guān)外,還與其凍存條件以及轉(zhuǎn)化過(guò)程密切相關(guān)[14-16]。
本研究采用一步法制備的大腸桿菌BL21菌株的感受態(tài)細(xì)胞可獲得106~107 CFU/μg的轉(zhuǎn)化效率,完全能夠滿足常規(guī)轉(zhuǎn)化試驗(yàn)的要求。同時(shí)該結(jié)果也表明,一步法可用于大腸桿菌BL21菌株感受態(tài)細(xì)胞制備。為探討和優(yōu)化BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化過(guò)程中的關(guān)鍵參數(shù)條件,本研究在參照傳統(tǒng)感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化步驟的基礎(chǔ)上分別設(shè)置冰水浴時(shí)間、室溫放置時(shí)間、復(fù)蘇過(guò)程中的搖床轉(zhuǎn)速以及復(fù)蘇時(shí)間等一系列不同的參數(shù)。
轉(zhuǎn)化條件優(yōu)化試驗(yàn)結(jié)果表明,大腸桿菌BL21菌株一步法感受態(tài)細(xì)胞的最優(yōu)轉(zhuǎn)化條件:轉(zhuǎn)化體系先冰水浴30 min,然后取出樣品置于室溫中放置10 min,加入適量新鮮LB培養(yǎng)基后置于37 ℃、150 r/min搖床中振蕩復(fù)蘇40 min,涂布抗生素平板,37 ℃過(guò)夜培養(yǎng)篩選轉(zhuǎn)化子。
在轉(zhuǎn)化試驗(yàn)中,筆者發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化體系涂布抗生素平板后置于4 ℃冰箱中放置一段時(shí)間,長(zhǎng)出的轉(zhuǎn)化子數(shù)明顯比未在 4 ℃ 冰箱中放置過(guò)而直接于37 ℃培養(yǎng)箱中過(guò)夜培養(yǎng)的多,且重復(fù)幾次試驗(yàn)均得到類似結(jié)果。為此,筆者做了一組轉(zhuǎn)化試驗(yàn),并設(shè)置了一系列不同的4 ℃冰箱放置時(shí)間。結(jié)果顯示,在4 ℃冰箱中放置2 h轉(zhuǎn)化效率最高,在冰箱中放置12、24 h的轉(zhuǎn)化效率又有所下降,但仍比未在冰箱中放置過(guò)的高。筆者目前對(duì)于出現(xiàn)這一試驗(yàn)結(jié)果的原因尚未十分明了,還需要進(jìn)一步研究和分析。
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