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      乳源金黃色葡萄球菌耐藥性分析與分型

      2018-05-25 06:10:44趙吳靜董書偉倪春霞武中庸才讓卓瑪蒲萬霞
      中國草食動物科學(xué) 2018年2期
      關(guān)鍵詞:金黃色葡萄球菌分型

      趙吳靜,董書偉,倪春霞,武中庸,侯 曉,才讓卓瑪,蒲萬霞

      (1.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州畜牧與獸藥研究所,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院新獸藥工程重點開放實驗室,甘肅省新獸藥工程重點實驗室,蘭州 730050;2.甘肅省獸藥飼料監(jiān)察所,蘭州 730030)

      乳房炎是奶牛養(yǎng)殖場中的高發(fā)病之一,該病易反復(fù),對奶牛生長發(fā)育以及產(chǎn)品質(zhì)量影響較大,甚至?xí)鼓膛适a(chǎn)性能而造成巨大損失[1]。金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus,SA)可產(chǎn)生溶血毒素、腸毒素、血漿凝固酶、耐熱核酸酶等毒素,引起急性、慢性和亞臨床性(隱性乳房炎)乳房炎;也可引起化膿性感染、食物中毒、牛乳房炎、仔豬滲出性皮炎等疾病,其致病性強(qiáng),危害性大,分離率不斷上升[2-7]。近年來,由于抗生素的不合理使用,耐藥金黃色葡萄球菌的感染率和分離率也不斷增加。李光超等[8]采用微量肉湯稀釋法測定其對7種藥物的敏感性,結(jié)果顯示,金黃色葡萄球菌對磷霉素最為敏感,而對紅霉素、氨芐西林和克林霉素具有較強(qiáng)的耐藥性。王華等[9]對兔源金黃色葡萄球菌進(jìn)行了藥敏性試驗,結(jié)果顯示,分離株對氨芐西林、青霉素高度敏感,對利福平、氟苯尼考、慶大霉素、氧氟沙星中度敏感,對頭孢噻呋、環(huán)丙沙星、土霉素等耐藥。王秋東等[10]采用微量肉湯稀釋法對分離自內(nèi)蒙古部分地區(qū)規(guī)?;膛龅?4株金黃色葡萄球菌進(jìn)行了藥敏試驗,結(jié)果表明,分離株對林可霉素、青霉素、環(huán)丙沙星、苯唑西林、紅霉素、卡那霉素、四環(huán)素、頭孢噻呋耐藥,對萬古霉素、泰妙菌素、沃尼妙林及氟苯尼考敏感。疫苗被認(rèn)為是預(yù)防和治療奶牛乳房炎最有效的手段,但疫苗研制的前提是必須清楚了解感染地區(qū)流行菌株的基因型特性[11]。DNA 隨機(jī)多態(tài)性擴(kuò)增(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)技術(shù)是一種簡便、快速、靈敏可行的遺傳標(biāo)記技術(shù),目前該技術(shù)被普遍用于對微生物進(jìn)行基因分型與鑒定[12-13]。筆者等對分離于上海和內(nèi)蒙古地區(qū)的金黃色葡萄球菌進(jìn)行藥敏試驗,確定其藥物敏感性,以指導(dǎo)臨床用藥;同時采用RAPD技術(shù)對分離自我國內(nèi)蒙古和上海兩個地區(qū)的引起奶牛乳房炎的金黃色葡萄球菌進(jìn)行基因分型,分析其分子流行病學(xué)特點,以期為奶牛乳房炎金黃色葡萄球菌疫苗的研制提供依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 臨床樣品及標(biāo)準(zhǔn)菌株

      臨床型乳房炎奶樣采于內(nèi)蒙古和上海地區(qū)的規(guī)模化奶牛養(yǎng)殖場;金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)株CVCC2246購自中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;表皮葡萄球菌作為陰性菌株,由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院新獸藥工程重點開放實驗室分離鑒定。

      1.2 試劑與儀器

      DNA Ladder Marker、蛋白酶 K、溶菌酶、Premix EX Taq酶,均來自TaKaRa寶生物工程(大連)有限公司;細(xì)菌染色體DNA提取試劑盒(離心柱型),來自TIANGEN生物制品公司;細(xì)菌DNA提取試劑盒為天根生化科技(北京)有限公司生產(chǎn);選用OXOID的氟哌酸、復(fù)方新諾明、左氟沙星、氧氟沙星、環(huán)丙沙星、阿莫西林、青霉素、氯霉素、紅霉素、慶大霉素、萬古霉素、四環(huán)素和先鋒霉素V藥敏紙片,直徑為5mm;Applied Biosystems PCR擴(kuò)增儀、DYY-8C型高壓電泳儀、VITEK-2 COMPACT全自動微生物生化鑒定儀。

      1.3 方法

      1.3.1 菌株分離純化 搖勻奶樣,吸取200μL均勻涂布于血瓊脂平板,37℃過夜培養(yǎng)。挑取大而凸起、表面光滑、濕潤呈金黃或白色、周圍有溶血圈的菌落進(jìn)行純化培養(yǎng),涂片、革蘭氏染色、鏡檢,對具有葡萄串狀的分離菌進(jìn)行進(jìn)一步的生化鑒定、金黃色葡萄球菌16S rRNA PCR鑒定及特異性基因——耐熱核酸酶基因nuc種屬鑒定。1.3.2 生化鑒定 根據(jù)鏡檢結(jié)果,采用VITEK-2全自動微生物生化鑒定儀鑒定。

      1.3.3 16S rRNA鑒定在無菌條件下,挑取純培養(yǎng)單菌落于LB液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)20~24 h。按天根基因組提取試劑盒的步驟提取細(xì)菌基因組DNA。利用細(xì)菌16S rRNA通用引物,并結(jié)合金黃色葡萄球菌特異性基因——耐熱核酸酶基因nuc進(jìn)行種屬鑒定,引物序列信息見表1。

      表1 鑒定金黃色葡萄球菌PCR引物

      1.3.4 藥敏試驗 采用K-B紙片擴(kuò)散法,選用“1.2”項中13種藥敏片進(jìn)行藥敏試驗,分別將菌株接種于5mL的MH液體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)20~24 h,取200μL菌液均勻涂布在MH瓊脂培養(yǎng)基上,置37℃培養(yǎng)20~24 h取出,用游標(biāo)卡尺測量各菌抑菌圈直徑,最后計算平均值,按照美國臨床實驗室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(CLSI)頒布的《抗微生物藥物敏感性試驗執(zhí)行標(biāo)準(zhǔn)》判斷受試菌對藥物的敏感性。

      1.3.5 菌株RAPD分型 在無菌條件下,挑取純培養(yǎng)單菌落于LB液體培養(yǎng)基中,37℃孵育20~24 h。按細(xì)菌DNA提取試劑盒操作。獲得的DNA于-20℃保存?zhèn)溆谩8鶕?jù)文獻(xiàn)[14]選擇序列 4M:5′-AAGACGCCGT-3′作為擴(kuò)增引物。采用25μL反應(yīng)體系,體系參數(shù)為:Premix混合液12.5μL,DNA模板2μL,引物2μL,去離子水8.5μL。PCR循環(huán)參數(shù)分別為94℃5min,37℃5min,72℃5min,循環(huán) 4次;94℃ 1min,37 ℃ 1min,72 ℃ 2min,循環(huán) 30次;72℃延伸10min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,后用Quantity One 1-D成像系統(tǒng)紫外成像。電泳圖像采用BioNumerics軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,具體參數(shù)設(shè)定標(biāo)準(zhǔn)如下:最適值為0.5%,位置公差為1.25%,閾值為80%。圖像采用Dice相關(guān)系數(shù)和非加權(quán)組算術(shù)平均法UPGMA(Unweighted pair groupmethod with arithmeticmean)進(jìn)行聚類分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 菌株的生化鑒定及16S rRNA鑒定

      2.1.1 菌株的生化鑒定 VITEK-2鑒定顯示有91株被鑒定為金黃色葡萄球菌。

      2.1.2 16S rRNA鑒定通過細(xì)菌16SrRNA通用引物,并結(jié)合金黃色葡萄球菌特異性基因——耐熱核酸酶基因nuc進(jìn)行種屬鑒定。PCR擴(kuò)增結(jié)果顯示,擴(kuò)增的16S rRNA基因片段及nuc基因片段與對照菌目的基因擴(kuò)增長度相符。將預(yù)定基因進(jìn)行測序并用NCBIBlast在線軟件比對分析,有91株菌株被鑒定為金黃色葡萄球菌,與生化鑒定結(jié)果一致。

      2.2 藥敏試驗結(jié)果

      內(nèi)蒙古地區(qū)臨床型乳房炎金黃色葡萄球菌分離株對先鋒霉素V、環(huán)丙沙星、氧氟沙星和左氟沙星均高度敏感,對萬古霉素、慶大霉素、復(fù)方新諾明和青霉素均耐藥;上海地區(qū)臨床型乳房炎金黃色葡萄球菌分離株對左氟沙星和環(huán)丙沙星均高度敏感,對氯霉素、氧氟沙星、青霉素、紅霉素、阿莫西林、慶大霉素、四環(huán)素和萬古霉素均耐藥。兩個地區(qū)分離菌均對喹諾酮類抗生素高度敏感,說明此類抗生素對兩個地區(qū)奶牛乳房炎金黃色葡萄球菌均有較好的抑制作用(表2)。

      表2 內(nèi)蒙古和上海地區(qū)奶牛乳房炎金黃色葡萄球菌藥敏試驗結(jié)果mm

      2.3 菌株RAPD分型

      2.3.1 RAPD擴(kuò)增結(jié)果 對分離鑒定出的91株金黃色葡萄球菌和1株金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌CVCC2246基因組DNA模板進(jìn)行隨機(jī)多態(tài)性擴(kuò)增,由擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果可知,除第76株外,所有菌株基因組DNA經(jīng)擴(kuò)增后均產(chǎn)生了清晰、可分辨的帶譜,擴(kuò)增產(chǎn)物在1~7條帶之間,片段分子質(zhì)量大小在400~4 500 bp之間,具有多種帶型(圖1)。

      圖1 92株金黃色葡萄球菌RAPD-PCR擴(kuò)增條帶

      圖2 92株金黃色葡萄球菌RAPD擴(kuò)增產(chǎn)物的遺傳聚類圖

      2.3.2 遺傳相關(guān)性分析 聚類分析親緣關(guān)系樹狀圖(圖2)顯示,菌株共分為12個基因型,其中1型5株(5.5%),2型 6株 (6.6%),3型 15株 (16.5%),4型 10株(11.0%),5型 13株(14.3%),6型、9型和 12型各 2株(2.2%),7型8株(8.8%),8型24株(26.4%),10型 3株(3.3%),11型僅1株(1.1%)。8型菌株占總菌株數(shù)的26.4%,為主要流行的優(yōu)勢菌群。

      3 討論

      奶牛乳房炎是奶牛養(yǎng)殖業(yè)最嚴(yán)重的隱患之一,也是影響奶牛業(yè)發(fā)展的主要疾病之一,因此,加強(qiáng)對奶牛乳房炎的診斷和防治尤為重要[15]。引起奶牛乳房炎的主要病原菌之一是金黃色葡萄球菌,具有高傳染性和難治愈等特性[16-17]。本研究對從內(nèi)蒙古和上海地區(qū)分離鑒定的91株金黃色葡萄球菌進(jìn)行藥敏紙片試驗,結(jié)果顯示內(nèi)蒙古地區(qū)和上海地區(qū)分離金黃色葡萄球菌均呈現(xiàn)多重耐藥性,但耐藥的抗生素種類有所不同,上海地區(qū)分離菌的耐藥情況比內(nèi)蒙古地區(qū)嚴(yán)重,這可能與地區(qū)用藥種類、用藥方法和劑量及菌株生長環(huán)境不同有關(guān)。

      金黃色葡萄球菌易對抗生素產(chǎn)生多重耐藥性[18-19],使得其藥物治愈率不佳,隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展,從分子基因水平上研究金黃色葡萄球菌越來越受到人們重視[20]。由于各地區(qū)環(huán)境不同,養(yǎng)殖場飼養(yǎng)管理水平參差不齊,導(dǎo)致引起奶牛乳房炎的金黃色葡萄球菌差異較大,給疾病防治帶來了諸多困難。為了解不同地區(qū)金黃色葡萄球菌的基因型特征,需對分離自奶牛乳房炎的金黃色葡萄球菌進(jìn)行基因分型,尤其是對引發(fā)局部地區(qū)感染的致病性金黃色葡萄球菌進(jìn)行基因分型,對實現(xiàn)奶牛乳房炎病原菌有效溯源和控制感染源具有重要意義。

      RAPD是一種采用通用的隨機(jī)引物對基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,再利用擴(kuò)增產(chǎn)物指紋圖譜進(jìn)行基因分型的技術(shù)。國內(nèi)外學(xué)者均證實RAPD技術(shù)是一種應(yīng)用比較廣泛、靈敏、可行的分型方法。王琳等[21]對新疆地區(qū)奶牛乳房炎金黃色葡萄球菌進(jìn)行RAPD基因分型,16株菌可分為2個類群。Kurlenda等[22]對234株金黃色葡萄球菌進(jìn)行RAPD分析,分為10個基因型。周長卿等[23]對青海地區(qū)奶牛乳房炎金黃色葡萄球菌進(jìn)行RAPD基因型分析,可將21株金黃色葡萄球菌分為3個聚類群。于丹等[24]對北京地區(qū)奶牛乳房炎的金黃色葡萄球菌進(jìn)行RAPD基因分型,通過聚類分析,29株菌產(chǎn)生11個基因型。

      本試驗采用隨機(jī)引物4M對分離自我國不同地區(qū)的91株金黃色葡萄球菌和1株金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌基因組DNA模板進(jìn)行隨機(jī)多態(tài)性擴(kuò)增,除第76株外,所有菌株基因組DNA經(jīng)擴(kuò)增后均產(chǎn)生了清晰、可分辨的帶譜,可清晰反映菌株間的基因多態(tài)性特征。兩個地區(qū)中,內(nèi)蒙古地區(qū)主要集中于2、5型和8型,占其總菌數(shù)的61.8%。內(nèi)蒙古地區(qū)菌株分布較廣,但其余各基因型所占菌株數(shù)較少,可能為內(nèi)蒙古地區(qū)養(yǎng)殖業(yè)發(fā)達(dá),病原菌容易發(fā)生地區(qū)間流行傳播。上海地區(qū)主要集中在3、4和8型,占其總菌數(shù)的64.3%。上海地區(qū)菌株分離于兩不同奶牛場,其中某牛場菌株基因型較集中,另一牛場菌株基因型分布較廣,這可能與牛場飼養(yǎng)管理水平等有關(guān)。

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