朱小甫,吳旭錦
(咸陽職業(yè)技術學院畜牧獸醫(yī)研究所/動物疫病分子生物學診斷實驗室,陜西咸陽 712000)
近年來,在我國雞群中出現了一種被稱為“心包積液-肝炎綜合征”的疾病,經過初步研究,認為該病是由Ⅰ群禽腺病毒(Fowl adenovirus,FAdV)引起[1-3]。目前已知Ⅰ群禽腺病毒分為A~E共5個種,每個種內的病毒根據交叉中和試驗結果進一步分為12個血清型。病毒粒子直徑70 nm~90 nm,無囊膜,呈20面體對稱結構,對脂溶劑有抵抗力,耐受pH 3~9[4]。Ⅰ群禽腺病毒既能水平傳播,又能垂直傳播,與該病毒有關的疾病有包涵體肝炎、心包積液綜合征、肌胃糜爛癥和心包積液-肝炎綜合征,還有報道該病毒能導致產蛋下降、飼料報酬下降以及呼吸道疾病[5-7]。研究表明,這些不同的臨床表現由不同的血清型引起[8-12]。Ⅰ群禽腺病毒六鄰體是主要的衣殼蛋白,由hexon基因編碼,含有型、群和亞群特異性抗原決定簇,與致病性密切相關。hexon基因全長2 829 bp,編碼943個氨基酸,用hexon基因可區(qū)分特定的血清型[13]。為調查雞群Ⅰ群禽腺病毒感染情況,并分析病原血清型分布特點,咸陽職業(yè)技術學院動物疫病分子生物學診斷實驗室采集了2015年-2016年間疑似病例樣品,進行了hexon基因序列分析,為Ⅰ群禽腺病毒的防控提供理論依據。
1.1.1 組織病料 采集自疑似病例蛋雞場或肉雞場,主要采集脾臟和肝臟,取適量組織加滅菌PBS剪碎,研磨破碎細胞后12 000 r/min離心10 min,收集上清液置-70℃保存?zhèn)溆谩悠穪碜躁兾?、甘肅和山西部分地區(qū)雞場。
1.1.2 試劑 DNAiso核酸提取試劑、rTaqDNA聚合酶(5 U/μL)、dNTP(2.5 mmol/L)、pMD18-T載體克隆試劑盒,寶生物工程(大連)有限公司產品;UNIQ-10柱式DNA膠回收試劑盒,上海生工生物工程技術服務有限公司;DH5ɑ大腸埃希菌由動物疫病分子生物學診斷實驗室保存。
1.1.3 引物設計與合成 參考GenBank上FAdV基因序列NC001720、EU979370、GU188428,針對FAdV六鄰體hexon基因設計并合成了2對引物,FAdV-1F:5′-TCAACCACCACCGTAACTG-3′(19802-19820);FAdV-1R:5′-GGGAGTTGTTTGTGTACAT-3′(20956-20938); FAdV-2F:5′-CACTTACGAGTGGGTCCTCAGA-3′(19935-19956);FAdV-2R:5′-CCGGTGTCGTTAACAACG-3′(20684-20667)。引物由上海生工生物工程技術服務有限公司合成,均用DEPC處理水稀釋到20 μmol/L。
1.2.1 病料中總DNA的提取 吸取處理好的組織病料上清液200 μL置于無菌EP管,加入DNAiso Reagent 800 μL,上下顛倒混勻,室溫靜置裂解10 min,4℃、12 000 r/min離心5 min,吸取800 μL上清液轉移至另一無菌EP管,加入600 μL冰冷無水乙醇沉淀10 min,4 ℃、12 000 r/min離心10 min,棄去上清液,加入1 mL冰冷的700 mL/L乙醇清洗2次,倒置干燥,用40 μL 8 mmol/L NaOH充分吹打溶解,即得總DNA溶液。
1.2.2 套式PCR擴增hexon基因 第1次擴增按照以下反應體系進行:DNA溶液 2.0 μL,超純水17.0 μL,10×PCR buffer 2.5 μL,dNTP 2.0 μL,FAdV-1F/FAdV-1R各0.5 μL,rTaq酶0.5 μL,總體積25.0 μL。反應條件為:95℃ 5 min;94℃ 50 s,53℃ 60 s,72℃ 60 s,35個循環(huán);72℃ 10 min。取第1次擴增產物2.0 μL作為模板進行第2次擴增,體系同第1次擴增,引物為FAdV-2F/FAdV-2R。反應條件為:95℃ 5 min;94℃ 40 s,58℃ 45 s,72℃ 45 s 35個循環(huán);72℃ 10 min。取5.0 μL第2次擴增產物,15 g/L瓊脂糖凝膠中電泳,凝膠成像系統(tǒng)中觀察、拍照。
1.2.3 PCR產物的回收、克隆及測序 對PCR陽性產物進行純化回收,操作按照UNIQ-10柱式DNA膠回收試劑盒說明進行。回收產物與pMD18-T載體連接,轉化DH5ɑ感受態(tài)細胞,經Amp篩選,挑取單個菌落,37℃搖動培養(yǎng)至飽和,菌液PCR鑒定為陽性,送陽性菌液至上海生工生物工程技術服務有限公司完成測序。
1.2.4 hexon基因序列分析 共獲得了8株Hexon基因序列,用DNA Star軟件將流行毒株與參考毒株進行核苷酸和氨基酸同源性比較分析,并繪制系統(tǒng)發(fā)生樹。參考毒株信息如下:CELO,GenBank登錄號Z67970,FAdV-1型;SR48,GenBank登錄號EU979368,FAdV-2型;SR49,GenBank登錄號EU979369,FAdV-3型;ON1,GenBank登錄號GU188428,FAdV-4型;340,GenBank登錄號AF508952,FAdV-5型;CR119,GenBank登錄號EU979372,FAdV-6型;YR36,GenBank登錄號EU979373,FAdV-7型;TR59,GenBank登錄號EU979374,FAdV-8a型;764,GenBank登錄號JN112373,FAdV-8b型;A02,GenBank登錄號EU979376,FAdV-9型;GenBank登錄號AY683551,FAdV10型 ;UF71,GenBank登錄號EU979378,FAdV11型;GenBank登錄號AY683553,FAdV12型; Kr-Yeoju,GenBank登錄號HQ709228;PP-01 GenBank登錄號EU938324;SDSX,GenBank登錄號KT899325。
從采集的組織中成功擴增出了hexon基因片段,長度為750 bp,與預期大小相符(圖1)。先后獲得了8株病毒hexon基因,分別是HM株(陜西商洛市,蛋雞場)、SXFS株(山西繁峙縣,肉雞場)、LQQD株(陜西禮泉縣,肉雞場)、HXGB株(陜西戶縣,蛋雞場)、GSPL株(甘肅平涼,蛋雞場)、DYQY株(陜西大荔縣,蛋雞場)、FP株(陜西富平縣,肉雞場)和GS株(甘肅武威,蛋雞場)。
M.DNA標準DL 2 000; 1~4.部分FAdV陽性組織hexon基因擴增
M.DNA Marker DL 2 000; 1-4.FAdV hexon gene amplification
圖1 hexon基因套式PCR擴增電泳圖
Fig.1 Electrophoresis of nested PCR amplification of hexon gene
將所測定的8株序列和16株參考序列導入DNA Star軟件,采用MegAlign比較分析,繪制出系統(tǒng)進化樹,對測定毒株進行分型,能夠直觀的表示毒株之間的進化關系,結果見圖2。
從圖2可見,參比毒株分為兩個大群,1、4、10、12血清型組成一個大的分支,2、3、5、6、7、8a、8b、9、112血清型組成另一個大的分支。測定的流行毒株中,HM、SXFS、LQQD、HXGB、GSPL、DYQY、FP與FAdV-4型的ON1、PP-01、SDSX 、Kr-Yeoju株親緣關系最近,因此這7株均屬于FAdV-4型。GS與CELO株親緣關系最近,屬于FAdV-1型。
由于獲得的8個流行毒株分別屬于FAdV-4型和FAdV-1型,因此選擇相應參考毒株ON1、PP-01、SDSX、Kr-Yeoju和CELO株進行核苷酸、氨基酸序列比對分析,同源性結果見表1。
表1中,屬于FAdV-4型的HM、SXFS、LQQD、HXGB、GSPL、DYQY、FP、ON1、PP-01、SDSX和Kr-Yeoju株核苷酸同源性在98.9%~100%之間,最低的是SDSX和Kr-Yeoju株,同源性為98.9%。測定的7株FAdV-4型流行毒株中,DYQY與FP核苷酸同源性為100%,GSPL、HM、HXGB、LQQD和SXFS之間核苷酸同源性為100%,DYQY與GSPL核苷酸同源性為99.9%。測定的7株FAdV-4型流行毒株推導氨基酸序列同源性均為100%,提示這7株FAdV-4型流行毒株高度同源。屬于FAdV-1型的GS與CELO株核苷酸推導的氨基酸序列同源性均為99.2%,提示GS與CELO株親緣關系較高。
推導氨基酸序列分析顯示,在測定的250個氨基酸中,參比的FAdV-4型11個毒株僅有1個氨基酸位點差異,即第60位ON1和韓國Kr-Yeoju株為纈氨酸,而測定的7個流行毒株、山東鴨源SDSX株以及印度PP-01株均為異亮氨酸。FAdV-1型的GS與CELO株存在2個氨基酸位點差異,即第60位、149位CELO為纈氨酸和甘氨酸,而GS株分別為丙氨酸和絲氨酸。
圖2 基于hexon基因繪制的系統(tǒng)進化樹
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注:右上角為核苷酸同源性,左下角為氨基酸同源性。1~13.分別為DYQY、ON1、CELO、FP、GS、GSPL、HM、HXGB、Kr-Yeoju、LQQD、PP-01、SDSX、SXFS株。
Noet:The upper right corner is the nucleotide homology,the lower left corner is the amino acid homology.1-13. DYQY,ON1,CELO,FP,GS,GSPL,HM,HXGB,Kr-Yeoju,LQQD,PP-01,SDSX,SXFS strains.
從2015年起,我國雞群中流行一種以心包積液和肝臟腫大的疾病,被稱為心包積液-肝炎綜合征[1,5]。咸陽職業(yè)技術學院畜牧獸醫(yī)研究所通過流行病學調查,發(fā)現在陜西及周邊地區(qū)雞群中同樣存在類似疾病。剖檢發(fā)現,主要病變?yōu)楦闻K腫大,顏色變淡,為黃色或黃褐相間,質地變脆;心臟心包腔中有或多或少的淡黃色透明積液,心肌松弛;腎臟腫大呈花斑狀;肌胃腺胃交界處有條帶狀出血。劉東等[5]研究認為,目前國內Ⅰ群腺病毒主要有2個血清型,臨床表現包涵體肝炎的為FAdV-8a/b型,表現為心包積液綜合征的為FAdV-4型。牛登云等[12]通過測序分析發(fā)現,2015年國內主要流行Ⅰ群禽腺病毒C和E兩種基因型,4和8b兩種血清型。通過本課題組設計的Ⅰ群禽腺病毒通用nPCR方法,直接從病變組織中獲得了hexon基因片段,測序分析表明,獲得的8個流行毒株中,HM、SXFS、LQQD、HXGB、GSPL、DYQY和FP株屬于FAdV-4型,僅有GS株屬于FAdV-1型。結果提示引起心包積液-肝炎綜合征的主要病原為Ⅰ群禽腺病毒FAdV-4型,同時存在FAdV-1型,肉雞場和蛋雞場中均有發(fā)生。FAdV-4型是流行毒株的優(yōu)勢血清型,這與劉東等[5]、牛登云等[12]的研究結論一致,但FAdV-1型感染引起心包積液-肝炎綜合征尚未見到類似報道。
核苷酸序列比對分析表明,7個FAdV-4型毒株中,核苷酸同源性為99.9%~100%,推導的氨基酸序列同源性均為100%。與參考毒株相比較,僅有第60位ON1株和韓國Kr-Yeoju株為纈氨酸,而測定的7個流行毒株、山東鴨源SDSX株以及印度PP-01株均為異亮氨酸,我國毒株與韓國、印度等國外毒株同源性很高,結果提示這些流行毒株高度同源,推測在免疫原性上差異很小。FAdV-1型的GS與CELO株核苷酸、推導的氨基酸序列同源性均為99.2%,僅存在2個氨基酸位點差異,第60位、149位CELO為纈氨酸和甘氨酸,而GS株分別為丙氨酸和絲氨酸,提示GS與CELO株親緣關系較高。本研究通過Ⅰ群禽腺病毒的基因分型和hexon基因序列分析,為進一步進行病毒分離、病毒生物學特性研究奠定了基礎。