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      少棘蜈蚣抗菌肽Scolopin 2-NH2的抗菌作用機(jī)制研究

      2018-11-30 03:09:06盧佳鄧秋萍任文華
      生物技術(shù)通報(bào) 2018年11期
      關(guān)鍵詞:抗菌肽細(xì)胞膜細(xì)胞周期

      盧佳 鄧秋萍 任文華

      (南京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,南京 210046)

      瑞典科學(xué)家Boman在研究巨型蠶蛾Hyalophora cecropia滯育蛹的誘導(dǎo)型防御系統(tǒng)時(shí),發(fā)現(xiàn)了具有抗菌活性的多肽即抗菌肽(Antimicrobial peptides,AMPs)[1],隨后科學(xué)家相繼在微生物、昆蟲、植物和人體中發(fā)現(xiàn)了抗菌肽[2]。目前已發(fā)現(xiàn) 2 600多種抗菌肽[3],廣泛分布于病毒、細(xì)菌、真菌及各類動(dòng)物體內(nèi)??咕膶儆诳股氐囊粋€(gè)新的家族,可作為常規(guī)抗生素治療藥物,也可與抗生素協(xié)調(diào)發(fā)揮作用。研究表明,兩種或幾種抗菌肽、抑或抗菌肽與傳統(tǒng)抗生素聯(lián)用,可以拓寬抗生素的抗菌譜乃至增強(qiáng)治療效果[4]。它不僅可以作用于細(xì)菌、真菌,對(duì)病毒和癌細(xì)胞也有抑制作用,具有廣譜的抗菌活性[5]。此外,抗菌肽還可以有效地殺滅引起人類及動(dòng)物寄生蟲?。ㄈ绡懠?、氏病、菜什曼病等)的寄生蟲,并且具有抗精子作用、神經(jīng)毒性、調(diào)節(jié)細(xì)菌以及在LDS或LPS協(xié)同作用下,增強(qiáng)人和鼠巨噬細(xì)胞產(chǎn)生呼吸爆發(fā)等生物學(xué)功能。

      與傳統(tǒng)抗生素相比,抗菌肽的抗菌作用主要有以下幾個(gè)特點(diǎn):(1)抗菌譜廣:對(duì)革蘭氏陰性菌[6-7]、革蘭氏陽(yáng)性菌、革蘭氏兼性菌和真菌[7-9]都有高效的殺菌作用;(2)作用專一:原核細(xì)胞,腫瘤細(xì)胞與正常細(xì)胞的細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)不同,可以選擇性地作用于原核細(xì)胞和癌細(xì)胞,而對(duì)正常細(xì)胞幾乎無(wú)作用;(3)殺菌快速:大多數(shù)抗菌肽都可在5 min內(nèi)引起菌類細(xì)胞的死亡;(4)不易產(chǎn)生抗藥性:對(duì)抗菌肽的抗藥性起決定性作用的因素系其疏水性和兩親性,而非肽鏈長(zhǎng)度和所攜電荷數(shù),這種特殊的作用機(jī)制使得致病菌很難產(chǎn)生抗藥性或交叉抗性[10];(5)不易蓄積中毒;(6)無(wú)致畸作用。

      目前,公認(rèn)的抗菌肽的作用機(jī)制有兩種:膜作用機(jī)制,即破壞細(xì)胞膜,造成膜穿孔;非膜作用機(jī)制,又可分為細(xì)胞外機(jī)制和細(xì)胞內(nèi)機(jī)制,細(xì)胞外機(jī)制主要指抗菌肽抑制細(xì)胞壁合成、激活自溶素或磷脂酶而發(fā)生溶菌作用[11],細(xì)胞內(nèi)機(jī)制則與干擾真核生物線粒體功能的發(fā)揮,影響核糖體合成蛋白質(zhì),影響基因的轉(zhuǎn)錄、表達(dá)和調(diào)控有關(guān)。陳旋等[12]研究了抗菌肽P7對(duì)大腸桿菌的非膜作用機(jī)制發(fā)現(xiàn),抗菌肽P7可造成DNA的損傷,使DNA復(fù)制相關(guān)基因下調(diào)、DNA損傷修復(fù)基因上調(diào),抑制DNA的復(fù)制和RNA的合成。

      人類許多疾病的治療得益于抗生素的發(fā)現(xiàn)和臨床使用,但近40年以來(lái),新型抗生素僅發(fā)現(xiàn)了3種[13],而隨著抗生素的濫用,耐藥細(xì)菌感染已成威脅人類健康的一大隱患??咕目咕钚愿?、抗菌譜廣[14]、種類多、不易引發(fā)細(xì)菌的耐藥性及對(duì)宿主無(wú)毒性或毒性小等特征,使其有望開發(fā)為新型的抗菌藥物。天然抗菌肽經(jīng)過(guò)人工改造可降低細(xì)胞毒性、增強(qiáng)抗菌性和穩(wěn)定性,對(duì)實(shí)現(xiàn)大規(guī)模生產(chǎn)進(jìn)而造福人類具有重要意義[15]。以腸道菌群和抗菌肽間的相互作用為基礎(chǔ),通過(guò)監(jiān)測(cè)抗菌肽表達(dá)水平的方式建立起的一種疾病預(yù)防和診斷治療的輔助手段,可用來(lái)預(yù)估機(jī)體腸道的健康狀態(tài)[16]。此外,抗菌肽在防控動(dòng)物疫病、增強(qiáng)動(dòng)物機(jī)體免疫水平和抗氧化能力、提高動(dòng)物生產(chǎn)性能等方面也具有廣闊的開發(fā)利用前景[17]。

      蜈蚣(Centipede)是地球上最古老的捕食動(dòng)物之一,屬于節(jié)肢動(dòng)物門唇足綱整形目蜈蚣科蟲體。據(jù)《神農(nóng)本草經(jīng)》所載,蜈蚣具有熄風(fēng)止痙,通絡(luò)止痛和攻毒散結(jié)的作用,而且在治療癌癥、肝炎、腦血管病及多種皮膚病等均有明顯的療效。研究發(fā)現(xiàn),少棘蜈蚣(Scolopendra subspinipes mutilans)的毒液具有多種生化和生理作用[18-19]。Peng等[20]從少棘蜈蚣毒液中分離得到兩種抗菌肽,命名為Scolopin 1 和 Scolopin 2。其中,Scolopin 2經(jīng)酰胺化修飾獲得的Scolopin-2-NH2(S-2-N),具有比其母體肽Scolopin-2(S-2)更強(qiáng)的抗菌活性,但對(duì)抗菌肽S-2-N和S-2的抗菌機(jī)理尚未知曉。因此,本論文對(duì)抗菌肽S-2-N和S-2的抗菌活性、理化性質(zhì)進(jìn)行了研究,并從細(xì)胞水平和分子水平對(duì)其抗菌機(jī)制進(jìn)行了探討。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 抗菌肽及菌種 抗菌肽:Scolopin-2(S-2):GILKKFMLHRGTKVYKMRTLSKRSH;Scolopin-2-NH2(S-2-N):GILKKFMLHRGTKVYKMRTLSKRSHNH2;均由吉爾生化(上海)有限公司合成,自動(dòng)多肽合成儀 APEX396,通過(guò) HPLC 液相色譜進(jìn)行脫鹽、純化,分子量測(cè)定采用快原子轟擊質(zhì)譜法,純度≥95%。菌種:大腸桿菌(E.coliK12D31)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、沙門氏菌(salmonella)和枯草桿菌(Bacillus subtilis)均由本實(shí)驗(yàn)室保存。

      1.1.2 試劑 抗生素Kan+、Amp+購(gòu)自Amresco公司;AnnexinV-FITC/PI 雙染凋亡檢測(cè)試劑盒購(gòu)于南京 Vazyme 公司;DAPI 染色液購(gòu)于美國(guó)Sigma 公司;DNA Marker、蛋白質(zhì)Marker、通用型基因組DNA提取試劑盒(MiniBESTUniversal Genomic DNA Extraction Kit Ver.5.0)和逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTMRT reagent Kit) 購(gòu) 于 TaKaRa 生 物 公 司 ;SYBR?Premix Ex TaqTMII染料購(gòu)于南京羅氏生物公司;RNA提取試劑盒(TranZolTMUp Plus RNA Kit,ER501)購(gòu)于南京TransGen Biotech公司;細(xì)胞周期試劑盒(KGA512)購(gòu)于凱基生物公司。

      1.1.3 儀器 ELx800型酶聯(lián)免疫檢測(cè)儀(美國(guó)BLO-TEK公司)、320-SpH計(jì)(Mettler Toledo公司)、圓二色譜儀(英國(guó)Chirascan,Applied Photophysics)、流式細(xì)胞儀(美國(guó)BD公司)、PTC-200 PCR儀(美國(guó)MJ Research公司)、核酸與蛋白分析儀(美國(guó)NanoDropND-1000),StepOnePlusTMReal-Time PCR System(美國(guó) AB生物系統(tǒng)公司)。

      1.2 方法

      1.2.1 抗菌肽Scolopin-2-NH2的抗菌活性及理化性質(zhì)

      1.2.1.1 抗菌肽的抗菌活性及最小抑菌濃度 配置LB培養(yǎng)基,pH調(diào)至7.0。分別將凍存的4種菌(大腸桿菌K12D31、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌和枯草桿菌)按 1∶100 接種到液體 LB 培養(yǎng)基中,搖床培養(yǎng)過(guò)夜。

      將固體 LB 培養(yǎng)基融化并冷卻至 55℃左右,按1∶100 加入菌液并搖勻,倒入滅菌平板培養(yǎng)皿,9 mL /皿,置于超凈工作臺(tái)內(nèi)冷卻至凝固。用滅菌的打孔器在帶菌的固體 LB平板上打孔,孔徑為 8 mm,分別加入20 μmol/L抗菌肽S-2/S-2-N于瓊脂孔內(nèi),置于37℃培養(yǎng)10 h,拍照。

      按最小抑菌濃度(Minimum inhibitory concentration,MIC)測(cè)定法檢測(cè)抗菌肽S-2/S-2-N對(duì)4種菌株(大腸桿菌K12D31、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌和枯草桿菌)的抗菌活性,酶標(biāo)儀測(cè)定OD值,與初始OD值相比,OD值尚未顯著變化的最小濃度定義為此抗菌肽對(duì)該菌的最小抑菌濃度。

      1.2.1.2 抗菌肽的理化性質(zhì) 以圓二色譜儀檢測(cè)抗菌肽的二級(jí)結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)用Orign 8軟件處理作圖。

      檢測(cè)抗菌肽的熱穩(wěn)定性、酸堿穩(wěn)定性、離子強(qiáng)度穩(wěn)定性及對(duì)消化酶的不敏感性。將抗菌肽樣品分別經(jīng)下述條件處理:溫度(100℃水浴0 min、5 min、10 min、20 min、30 min)、pH磷酸鹽緩沖液(PBS)(pH 梯 度 為 1.0、3.0、5.0、7.0、10.0 和 12.0)、NaCl、KCl、CaCl2(離子濃度分別為 0 mmol/L、50 mmol/L、100 mmol/L和200 mmol/L)、胰蛋白酶和胃蛋白酶(37℃處理0 min、30 min和60 min),加入帶菌(E.coliK12D31)的LB平板瓊脂孔里,37℃培養(yǎng) 10 h,量取抑菌圈直徑。

      1.2.2 抗菌肽Scolopin-2-NH2對(duì)細(xì)菌細(xì)胞膜的影響

      1.2.2.1 抗菌肽在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)的定位 熒光標(biāo)記S-2/S-2-N。將活化的E.coliK12D31培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期(105),5 000 r/min離心5 min收集菌液;PBS洗3次后加入FITC-S-2/S-2-N(10 μmol/L)37℃避光培養(yǎng) 30 min和1 h;PBS洗3次,5 000 r/min,離心5 min,激光共聚焦顯微鏡下觀察拍照。

      1.2.2.2 觀察細(xì)菌超微結(jié)構(gòu)、分析細(xì)胞膜完整性及抗菌肽的穿膜效率 將活化的E.coliK12D31培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期(OD=0.5),離心收集菌液,加入抗菌肽S-2/S-2-N(20 μmol/L)37℃培養(yǎng) 30 min和 2 h,陰性對(duì)照為PBS;以此為材料制備超薄切片,透射電鏡下觀察細(xì)菌超微結(jié)構(gòu)。

      在帶有抗菌肽的E.coliK12D31中加入PI溶液,用流式細(xì)胞儀檢測(cè)PI著染陽(yáng)性細(xì)菌數(shù)。用流式細(xì)胞儀檢測(cè)FITC-S-2/S-2-N處理后的E.coliK12D31著染的陽(yáng)性細(xì)菌數(shù)。

      1.2.3 抗菌肽Scolopin-2-NH2對(duì)細(xì)菌DNA和RNA的作用研究

      1.2.3.1 細(xì)菌基因組DNA、總RNA含量的檢測(cè) 酶標(biāo)儀測(cè)定經(jīng)S-2/S-2-N處理的E.coliK12D31的基因組DNA和RNA的熒光強(qiáng)度。重復(fù)3次,取平均值。

      1.2.3.2 抗菌肽與細(xì)菌DNA/RNA的凝膠阻滯分析 參照試劑盒提取法提取E.coliK12D31基因組DNA。分別用S-2/S-2-N溶于DNA binding buffer并作梯度稀釋,加入到細(xì)菌DNA溶液中,1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),紫外凝膠成像觀察拍照。同上法進(jìn)行抗菌肽與細(xì)菌RNA的凝膠阻滯分析。

      1.2.3.3 抗菌肽結(jié)合DNA后的結(jié)構(gòu)變化 在E.coliK12D31基因組DNA中加入S-2/S-2-N,制成樣品。圓二色譜儀掃描,每個(gè)樣品連續(xù)掃描3次,取平均值;數(shù)據(jù)用Orign 8軟件處理。

      1.2.3.4 抗菌肽對(duì)細(xì)菌細(xì)胞周期及細(xì)菌DNA復(fù)制與修復(fù)相關(guān)基因表達(dá)的影響 將活化的E.coliK12D31培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,加入S-2/S-2-N,37℃分別培養(yǎng)0.5h后,加入PI染色液,流式細(xì)胞儀檢測(cè)。

      取上述培養(yǎng)菌體進(jìn)行總RNA提取,逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系合成cDNA(表1)。

      用羅氏Green qPCR Master Mix 試劑盒對(duì)dnaA、dnaB、dnaG、SSB、RecA和RecN基因進(jìn)行RT-PCR分析。按表3加入20 μL RT-PCR反應(yīng)體系所需的各種試劑于八聯(lián)管中。引物序列如表2所示,進(jìn)行RT-PCR。

      1.2.3.5 統(tǒng)計(jì)分析 所有的實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)3次。采用SPSS18.0統(tǒng)計(jì)軟件分析處理,采用t檢驗(yàn),數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(x-±s)表示,(*)P<0.05為具有顯著差異。

      表1 cDNA合成反應(yīng)體系

      2 結(jié)果

      2.1 抗菌肽Scolopin-2-NH2的抗菌活性及理化性質(zhì)

      2.1.1 抗菌活性檢測(cè)及最小抑菌濃度(MIC)兩種抗菌肽的最小抑菌濃度(MIC)見表4??梢钥闯鲺0坊揎椀腁MP-S-2-N的抑菌活性明顯強(qiáng)于其母肽AMP-S-2,且二者對(duì)E.coliK12D31的抑菌效果最佳,故可選擇大腸桿菌作為抗菌敏感菌株。

      表2 RT-PCR引物序列

      2.1.2 抗菌肽的理化性質(zhì) 圓二色譜技術(shù)探究抗菌肽S-2/S-2-N的二級(jí)結(jié)構(gòu),如圖1顯示的,二者均在197 nm處有一個(gè)負(fù)峰,說(shuō)明具有一個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)。AMP-S-2的峰值為-15.52,而AMP-S-2-N的峰值為-12.60,負(fù)峰值降低,即峰有所上移,這可能與S-2-N比S-2具有更強(qiáng)的抗菌活性有關(guān)。

      表3 Real-time PCR反應(yīng)體系

      表4 抗菌肽的最小抑菌濃度

      圖1 抗菌肽二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

      如圖2-A所示,沸水浴5、10、20 min后,S-2/S-2-N仍具有較好的抗菌活性,30 min后抑菌圈直徑有所減小。說(shuō)明抗菌肽對(duì)高溫具有較強(qiáng)的耐受性,僅在溫度超過(guò)30 min時(shí),抑菌能力才有所下降。

      如圖2-B,pH為 1、3、5、10、12時(shí)與pH為7時(shí)的抑菌圈大小無(wú)明顯差別。這暗示了AMP-S-2/S-2-N 具有酸堿耐受性。

      如圖2-C(S-2)和2-D(S-2-N)顯示,除了Ca2+對(duì)AMP-S-2-N有輕微的抑制作用外,不同濃度的NaCl、KCl、CaCl2離子對(duì)抗菌肽的抑制作用不明顯。說(shuō)明抗菌肽對(duì)Na+和K+離子的耐受力較強(qiáng),而Ca2+可能對(duì)其抗菌活性有一定的影響。

      抗菌肽經(jīng)胰蛋白酶和胃蛋白酶37℃酶切處理后,由圖2-E(胰蛋白酶處理)與圖2-F(胃蛋白酶)發(fā)現(xiàn),處理60 min的實(shí)驗(yàn)組抑菌圈直徑大小與陰性對(duì)照組沒有明顯變化,表明AMP-S-2/S-2-N對(duì)這兩種消化酶具有一定的耐受力。

      2.2 抗菌肽Scolopin-2-NH2對(duì)細(xì)菌細(xì)胞膜的影響

      2.2.1 抗菌肽在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)的定位 如圖3所示,經(jīng)FITC-S-2/S-2-N處理后的細(xì)胞均帶有熒光,說(shuō)明S-2/S-2-N已完全進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)內(nèi);細(xì)胞形態(tài)沒有發(fā)生變化,說(shuō)明S-2/S-2-N的作用靶點(diǎn)應(yīng)位于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)。處理2 h后,觀察到抗菌肽進(jìn)入的細(xì)胞數(shù)增多,且經(jīng)S-2-N處理后的細(xì)胞有少量細(xì)胞碎片。

      2.2.2 觀察細(xì)菌超微結(jié)構(gòu)、分析細(xì)胞膜完整性及抗菌肽的穿膜效率 如圖4,AMP-S-2/S-2-N處理20min后,E.coliK12D31細(xì)胞膜邊緣出現(xiàn)輕微的模糊,細(xì)菌的形態(tài)還比較完整;2 h后,S-2處理的細(xì)胞的細(xì)胞膜開始破裂,內(nèi)容物開始釋放出來(lái),但形態(tài)還可以看清;而經(jīng)S-2-N處理的細(xì)胞內(nèi)容物泄露呈彌散狀,整個(gè)細(xì)胞已基本瓦解破裂。因此推斷,AMPS-2-/S-2-N作用細(xì)菌2 h后導(dǎo)致細(xì)胞質(zhì)膜的破裂。

      如圖 5 所示,處理20 min后,10 μmol/L S-2使PI著染陽(yáng)性細(xì)胞比例為4.10%,而經(jīng)10 μmol/L S-2-N處理后染陽(yáng)性細(xì)胞比例為4.96%。當(dāng)處理濃度增大到20 μmol/L時(shí),陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)分別為7.48%和8.82%。考慮到背景干擾,這樣的結(jié)果暗示了S-2/S-2-N對(duì)細(xì)菌胞膜有輕微的破壞作用,雖然在MIC時(shí),S-2/S-2-N并沒有破壞細(xì)胞膜,影響質(zhì)膜的完整性,但濃度增大破壞性增強(qiáng),且S-2-N對(duì)細(xì)胞膜的擾動(dòng)總比S-2強(qiáng)一些。

      如圖6所示,經(jīng)10 μmol/L的S-2/S-2-N處理20 min后,有41.28%的大腸桿菌細(xì)胞被S-2侵入,而S-2-N則為43.05%,均高于PBS陰性對(duì)照組(0.08%);當(dāng)S-2-N濃度為20 μmol/L時(shí),同樣處理20 min,陽(yáng)性細(xì)胞比例為54.97%高于S-2(44.83%)。以上結(jié)果暗示了S-2-N穿透E.coliK12D31細(xì)胞膜的效率比親本(S-2)高,這可能也是酰胺化的S-2-N比其親本抗菌活性強(qiáng)的原因之一。

      圖2 抗菌肽的穩(wěn)定性

      2.3 抗菌肽Scolopin-2-NH2對(duì)細(xì)菌DNA和RNA的作用研究

      2.3.1 細(xì)菌基因組DNA、總RNA含量的檢測(cè) 如圖7顯示,S-2/S-2-N分別作用5 h后,與對(duì)照組相比,S-2-N組DNA合成量減少了36%(P<0.05),而S-2組為22%;RNA合成量也減少了33%,而S-2組為20%。結(jié)果表明S-2/S-2-N均可抑制大腸桿菌核酸的合成,且S-2-N抑菌能力強(qiáng)于母體肽S-2。

      2.3.2 抗菌肽與細(xì)菌DNA/RNA的凝膠阻滯分析 通過(guò)凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),AMP-S-2/S-2-N與基因組DNA具有很強(qiáng)的結(jié)合力。如圖8所示,當(dāng)S-2濃度為10.4 μmol/L時(shí),即開始出現(xiàn)阻滯現(xiàn)象,當(dāng)濃度達(dá)到13.0 μmol/L時(shí),S-2與NDA已經(jīng)強(qiáng)烈結(jié)合,使DNA無(wú)法跑出點(diǎn)樣孔,即已被完全阻滯。而當(dāng)S-2-N為10.4 μmol/L時(shí),已經(jīng)將DNA阻滯在點(diǎn)樣孔里,隨著濃度的增大,S-2-N與DNA結(jié)合的程度使得gold view已經(jīng)無(wú)法插入到DNA的堿基對(duì)中,使得點(diǎn)樣孔中的DNA沒有發(fā)出熒光。以上現(xiàn)象暗示了這兩個(gè)抗菌肽中,至少S-2-N,與DNA結(jié)合的方式可能與gold view插入DNA的方式類似。實(shí)驗(yàn)結(jié)果不僅說(shuō)明了AMP-S-2/S-2-N能與DNA強(qiáng)烈結(jié)合,而且S-2-N結(jié)合DNA的能力比S-2強(qiáng)。

      圖3 激光共聚焦觀察 FITC-S-2/S-2-N處理過(guò)的大腸桿菌細(xì)胞

      圖4 大腸桿菌經(jīng)S-2/S-2-N處理后的電鏡圖

      圖5 流式細(xì)胞儀分析PI流入抗菌肽處理的大腸桿菌細(xì)胞的結(jié)果

      在抗菌肽與RNA的凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)中,如圖9所示(圖中拖尾現(xiàn)象可能是在提取過(guò)程中RNA部分降解,但主條帶仍保持完好),S-2/S-2-N可與RNA強(qiáng)烈結(jié)合,當(dāng)S-2為15.6 μmol/L時(shí),RNA就出現(xiàn)了阻滯現(xiàn)象,當(dāng)濃度達(dá)到62.5 μmol/L時(shí)已基本被阻滯在點(diǎn)樣孔里;對(duì)S-2-N來(lái)說(shuō),濃度為7.8 μmol/L時(shí),就開始有明顯的阻滯現(xiàn)象,當(dāng)濃度大于15.6 μmol/L時(shí),RNA已經(jīng)完全跑不出點(diǎn)樣孔。實(shí)驗(yàn)結(jié)果說(shuō)明S-2-N結(jié)合RNA的能力比S-2強(qiáng)。

      圖6 流式細(xì)胞儀分析FITC-抗菌肽流入大腸桿菌細(xì)胞的結(jié)果

      圖7 S-2/S-2-N對(duì)大腸桿菌核酸合成的影響

      2.3.3 抗菌肽結(jié)合DNA后的結(jié)構(gòu)變化 如圖10所示,在DNA的CD譜中,270 nm的正峰是由于堿基堆積作用產(chǎn)生的,240 nm的負(fù)峰則對(duì)應(yīng)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)的B型構(gòu)象。AMP-S-2-N/S-2的加入都使DNA的正峰和負(fù)峰強(qiáng)度都降低了,且S-2-N使負(fù)峰降低強(qiáng)度更大,說(shuō)明二者都使DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)變得松散,也消弱了DNA堿基對(duì)之間的π-π堆積作用;圖中DNA的CD譜峰位未發(fā)生紅移(即左右平移),說(shuō)明二者只影響了DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),沒有引起雙螺旋的解旋。該結(jié)果暗示了AMP-S-2-N與DNA發(fā)生了堿基嵌插或溝槽作用。

      2.3.4 抗菌肽對(duì)細(xì)菌細(xì)胞周期及細(xì)菌DNA復(fù)制與修復(fù)相關(guān)基因表達(dá)的影響 凝膠阻滯試驗(yàn)和圓二色譜法分析可知,AMP-S-2/S-2-N可以引起DNA結(jié)構(gòu)的變化。DNA是信息傳遞的載體,故DNA的基本功能必定受到影響,因此利用流式細(xì)胞術(shù)分析了抗菌肽對(duì)大腸桿菌細(xì)胞周期的影響。

      圖11-A為正常大腸桿菌的細(xì)胞周期圖,處于S期的細(xì)胞數(shù)為18.14%,陽(yáng)性對(duì)照組(Buforin II)進(jìn)入S期的細(xì)胞數(shù)為33.10%。經(jīng)S-2/S-2-N處理后,如圖11-B-C所示,處于S期的細(xì)胞數(shù)為23.86%和26.32%,雖然比陽(yáng)性對(duì)照組(Buforin II)稍低,但與對(duì)照組相比有明顯差別(P<0.05),說(shuō)明S-2和S-2-N可以使細(xì)胞停留于S期,進(jìn)而抑制細(xì)胞的增殖。

      圖8 抗菌肽S-2(A)和 S-2-N(B)分別與大腸桿菌DNA作用的凝膠阻滯分析

      圖9 抗菌肽S-2(A)和 S-2-N(B)分別與大腸桿菌RNA作用的凝膠阻滯分析

      如圖12顯示,陽(yáng)性對(duì)照組為Buforin II(5-21)處理,陰性對(duì)照組為PBS處理?;騞naA、dnaB、dnaG和SSB與DNA復(fù)制相關(guān)。在S-2和S-2-N的作用下,基因dnaA在經(jīng)S-2-N處理后表達(dá)水平明顯降低為56.68%(P<0.05),比陽(yáng)性對(duì)照組62.03%還低;dnaG在實(shí)驗(yàn)組(S-2-N)中,表達(dá)量為66.00%,與陽(yáng)性對(duì)照組64.78%結(jié)果類似;其他基因dnaB和SSB的表達(dá)量也均有一定程度的降低。RecA和RecN是與DNA修復(fù)相關(guān)的基因,與陰性對(duì)照組相比,S-2組為1.17倍和1.08倍,而S-2-N組是1.24倍和1.3倍(P<0.05),二者的表達(dá)量均有增加,與陽(yáng)性對(duì)照組類似,說(shuō)明S-2/S-2-N都可以損傷DNA,且暗示了S-2-N引起的DNA損傷高于其親本。表明S-2/S-2-N可以影響DNA復(fù)制與修復(fù)相關(guān)基因的表達(dá)。

      圖10 抗菌肽S-2和S-2-N分別對(duì)大腸桿菌DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響

      3 討論

      AMP-S-2是一種分離自少棘蜈蚣毒液的陽(yáng)離子肽,具有廣譜的抗菌活性,但并不夠理想。本實(shí)驗(yàn)室通過(guò)前期對(duì)AMP-S-2進(jìn)行酰胺化改造,獲得了AMP-S-2-N。在此基礎(chǔ)上,本研究首先采用瓊脂糖孔穴法,通過(guò)篩選不同菌種,發(fā)現(xiàn)AMP-S-2和S-2-N對(duì)E.coliK12D31具有較強(qiáng)的抑制作用,且AMPS-2-N比親本具有更強(qiáng)的抑菌活性,最小抑菌濃度(MIC)實(shí)驗(yàn)也印證了這一點(diǎn)。

      據(jù)報(bào)道,分別來(lái)自豬和牛的抗菌肽PR-39和Indolicidin都具有無(wú)規(guī)則卷曲的松散結(jié)構(gòu),其作用機(jī)制是通過(guò)抑制大分子合成來(lái)發(fā)揮抗菌作用[21]。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)圓二色譜儀預(yù)測(cè)AMP-S-2和S-2-N的二級(jí)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)二者具有無(wú)規(guī)則卷曲的松散結(jié)構(gòu);且AMPS-2-N的負(fù)峰峰值降低,峰位上移,這可能與其抗菌活性更強(qiáng)的原因之一。

      另外,抗菌肽本身也存在著許多亟待解決的問題,如抗菌肽進(jìn)入人體后易被蛋白酶水解,穩(wěn)定性低等在新藥開發(fā)研制中普遍存在。于是,在本文中AMP-S-2和S-2-N在經(jīng)熱、不同pH緩沖液、不同離子強(qiáng)度和不同蛋白酶處理后的,二者均100℃熱的耐受性較強(qiáng),僅在作用半小時(shí)后抗菌能力才有所下降;對(duì)強(qiáng)酸和強(qiáng)堿的環(huán)境具有不敏感性;對(duì)不同離子強(qiáng)度也具有一定的耐受力;可抵抗消化酶的消化作用。AMP-S-2和S-2-N的這種對(duì)消化酶的不敏感性,有利于開發(fā)為口服藥,此研究解除了對(duì)抗菌肽易被體內(nèi)蛋白酶水解及穩(wěn)定性低方面的擔(dān)憂。

      圖11 抗菌肽對(duì)大腸桿菌細(xì)胞周期的影響

      圖12 抗菌肽對(duì)大腸桿菌復(fù)制與修復(fù)相關(guān)基因表達(dá)的影響

      有研究認(rèn)為,抗菌肽在發(fā)揮抑菌作用時(shí),首先攻擊的位點(diǎn)是細(xì)胞膜,通過(guò)促使細(xì)胞膜破裂等起到殺死細(xì)菌的作用,例如,抗菌肽Alamethicin主要通過(guò)由3-11個(gè)螺旋桿排列形成跨膜螺旋束或形成桶-板模式使細(xì)胞膜上形成許多孔洞,從而增強(qiáng)細(xì)胞膜的通透性而殺死細(xì)菌[22]。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)激光共聚焦顯微鏡觀察得知,F(xiàn)ITC綠色熒光可以充滿整個(gè)細(xì)菌細(xì)胞,表明S-2/S-2-N能夠完全進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)內(nèi),且暗示了S-2/S-2-N的作用靶點(diǎn)應(yīng)位于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)。

      據(jù)報(bào)道,環(huán)形肽可以擾亂磷脂雙分子層形成1-2 nm的環(huán)形孔,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)容物大量外漏發(fā)揮殺傷作用[23]。通過(guò)電子透射顯微鏡觀察超微結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),S-2/S-2-N處理細(xì)胞2 h后,大腸桿菌細(xì)胞均有內(nèi)容物流出,且S-2-N可使細(xì)胞達(dá)到基本破裂,甚至瓦解,最后導(dǎo)致細(xì)菌死亡。

      有研究發(fā)現(xiàn),抗菌肽protegrin-1(PG-1)以一種依靠脂質(zhì)成分的膜相互作用方式來(lái)穿透細(xì)胞膜發(fā)揮殺菌作用[24]。于是,我們利用流式細(xì)胞儀檢測(cè)了S-2/S-2-N對(duì)大腸桿菌細(xì)胞完整性和穿透效率的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)對(duì)大腸桿菌菌膜的破壞作用不太強(qiáng),但二者穿透細(xì)胞膜的效率比較高(即陽(yáng)性細(xì)胞的比例),且S-2-N的穿透效率達(dá)到了54.97%。此結(jié)果正好與透射電鏡所觀察到的結(jié)果一致,均說(shuō)明了AMPS-2-N具有更強(qiáng)的殺菌能力。

      大多數(shù)抗菌肽的作用靶點(diǎn)為細(xì)胞膜,通過(guò)破壞或溶解細(xì)胞膜來(lái)達(dá)到殺傷細(xì)菌的效果。而研究發(fā)現(xiàn)有些抗菌肽的作用靶點(diǎn)則位于細(xì)胞內(nèi),例如,抗菌肽Indolicidin可以誘導(dǎo)大腸桿菌絲化并抑制大腸桿菌DNA的合成[25]。在本實(shí)驗(yàn)中,AMP-S-2-N和AMP-S-2的主要作用部位就是胞內(nèi)的核酸-DNA。從圖7可以看出AMP-S-2-N/S-2都減少了大腸桿菌(K12D31)細(xì)胞中DNA/RNA的含量,即影響了核酸的合成。已報(bào)道,抗菌肽Butorin II穿透大腸桿菌細(xì)胞膜后與DNA和RNA結(jié)合,抑制細(xì)胞功能從而導(dǎo)致細(xì)菌快速死亡;而magainin 2也可以進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與DNA和RNA結(jié)合,從起到抑菌作用[26-27]。本文通過(guò)凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)證明了AMP-S-2-N和AMP-S-2可以不同程度地結(jié)合DNA和RNA,呈濃度梯度依賴性,且AMP-S-2-N結(jié)合DNA的能力強(qiáng)于母體肽。另外,圖9結(jié)果與凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)結(jié)果相一致,再次證明了AMP-S-2-N和AMP-S-2與DNA具有親和力,但具體抗菌肽通過(guò)哪種作用力與DNA什么部位結(jié)合需要進(jìn)一步探究。

      此外,有些抗菌肽可以抑制DNA復(fù)制相關(guān)的酶,如PR-39[28]。本實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),AMP-S-2-N 和AMP-S-2不僅能夠影響大腸桿菌的細(xì)胞周期而且對(duì)DNA相關(guān)基因的表達(dá)也有影響。從圖11可以看出,在正常大腸桿菌的細(xì)胞周期圖中,處于S期的細(xì)胞數(shù)為18.14%,S-2/S-2-N處理后,處于S期的細(xì)胞數(shù)為23.86%和26.32%,與陰性對(duì)照組有明顯差異,且與陽(yáng)性對(duì)照組(Buforin II)33.10%結(jié)果類似,說(shuō)明AMP-S-2-N和AMP-S-2抑制了大腸桿菌細(xì)胞周期的進(jìn)行;另外,通過(guò)RT-PCR技術(shù)分析與大腸桿菌DNA復(fù)制和修復(fù)相關(guān)的基因表達(dá)情況發(fā)現(xiàn),AMPS-2-N和AMP-S-2下調(diào)了基因dnaA、dnaB、dnaG和SSB的表達(dá),同時(shí)促進(jìn)了RecA和RecN的表達(dá)。

      綜上所述,AMP-S-2-N和AMP-S-2 通過(guò)抑制大腸桿菌DNA和RNA合成,能夠結(jié)合DNA和RNA,影響DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)以及細(xì)胞周期和DNA相關(guān)基因的表達(dá),從而達(dá)到抑菌的效果。

      4 總結(jié)

      本研究主要以少棘蜈蚣抗菌肽 Scolopin-2-NH2為研究對(duì)象,對(duì)其抗菌活性、理化性質(zhì)以及在細(xì)胞和分子水平上抗菌機(jī)制的進(jìn)行了探究。得出了以下結(jié)論:(1)抗菌肽Scolopin-2-NH2及其母體肽對(duì)E.coliK12D31具有較強(qiáng)的抗菌活性,且Scolopin-2-NH2強(qiáng)于母體肽;研究發(fā)現(xiàn)抗菌肽Scolopin-2-NH2和Scolopin-2具有無(wú)規(guī)則卷曲的松散二級(jí)結(jié)構(gòu),這可能與其抗菌活性有關(guān);另外,二者對(duì)外界環(huán)境(熱、酸堿、離子、消化酶)具有一定的穩(wěn)定性。(2)從細(xì)胞水平對(duì)抗菌機(jī)制研究表明,抗菌肽 Scolopin-2-NH2及其母體肽不僅可以破壞大腸桿菌胞膜、快速地進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)內(nèi)使細(xì)菌內(nèi)容物泄露,還通過(guò)結(jié)合DNA/RNA及影響DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)來(lái)達(dá)到抑菌效果。(3)從分子水平對(duì)抗菌機(jī)制研究顯示,抗菌肽Scolopin-2-NH2及其母體肽還可以阻滯大腸桿菌的細(xì)胞周期,抑制DNA復(fù)制相關(guān)基因(dnaA、dnaB、dnaG和SSB)表達(dá)和促進(jìn)DNA修復(fù)相關(guān)基因(RecA和RecN)的表達(dá)來(lái)抑制大腸桿菌的細(xì)胞增殖,從而發(fā)揮抗菌作用。

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