譚 珊,宋欣媛,張明通,吳培福
(西南林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,云南昆明 650224)
野生動物是一種寶貴的生物資源,在保持生物多樣性與生態(tài)平衡中處于重要地位,對人類社會的持續(xù)發(fā)展有重要價(jià)值。動物園是飼養(yǎng)野生動物的重要場所,同樣也流行一些動物疾病,其中大腸桿菌病較為普遍。致病性大腸桿菌能引起動物嚴(yán)重腹瀉、蜂窩織炎、腫頭綜合征、腹膜炎、輸卵管炎、滑膜炎、臍帶炎、眼炎、纖維蛋白性心包炎和敗血癥等[1],給動物健康造成了嚴(yán)重影響。大腸桿菌的致病性由多種毒力因子共同決定。在大腸桿菌侵襲宿主組織并引起發(fā)病的過程中,這些毒力因子相互協(xié)調(diào),共同發(fā)揮作用,幫助微生物逃避或破壞宿主防御機(jī)制,進(jìn)而引發(fā)對宿主有害的炎癥[2]。因此,開展野生動物疾病防治研究,可以為保護(hù)野生動物和人類自身健康提供技術(shù)保障。本研究以昆明市圓通山動物園內(nèi)37種不同動物源糞樣中分離鑒定的大腸桿菌為研究對象,分析分離株毒力基因的流行病學(xué)特征,以期為動物園動物大腸桿菌病治療和防控提供參考。
2018年3月,在圓通山動物園,隨機(jī)無菌采集37種動物糞便樣品各3份(表1)。
麥康凱培養(yǎng)基、伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基、營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基、營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基、三糖鐵培養(yǎng)基、LB液體培養(yǎng)基等:均購于云南凌普生物科技有限公司,按常規(guī)方法配制。
挑取0.1 g糞樣于2 mL離心管中作105倍稀釋,將得到的樣品稀釋液,運(yùn)用平板劃線法,通過伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基(EMB)、麥康凱培養(yǎng)基、LB固體培養(yǎng)基培養(yǎng)觀察,初步篩選大腸桿菌。
根據(jù)《腸科細(xì)菌生化鑒定編碼冊》進(jìn)行生化鑒定,包括糖發(fā)酵試驗(yàn)、吲哚試驗(yàn)、甲基紅試驗(yàn)、明膠液化試驗(yàn)、硫化氫試驗(yàn)等。
表1 采集樣品的動物園動物種類
根據(jù)GenBank中大腸桿菌的ECO和Uid基因序列[3],設(shè)計(jì)合成2對引物,序列見表2。
表2 大腸桿菌鑒定引物
根據(jù)GenBank中已發(fā)表的大腸桿菌超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(Extended-spectrumβ-lactamases,ESBLs)毒力因子調(diào)查與分析[4],將毒力引子劃分為:粘附素類基因(fimA、fimH、papA、papC、sfa等),鐵獲得系統(tǒng)類基因(irp-2、fyuA、iucA、iucD、iutA、iroN等),溫度敏感血凝素(tsh),血清抗性蛋白(iss),腸細(xì)胞脫落位點(diǎn)毒力島(eaeA),毒素(vat、stx2f、astA),大腸桿菌素V(colv、colBM),溶血素(hlyE),外膜蛋白(traT),保護(hù)素(kpsmT-K1、kpsmT II), 侵 襲 素(ibeA)。 采 用 Primer-Blast設(shè)計(jì)引物并計(jì)算理論退火溫度。引物由鉑尚生物技術(shù)(上海)有限公司合成,引物序列設(shè)計(jì)見表3。
從37種動物糞樣中,共分離純化出37株大腸桿菌。通過伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基(EMB)、麥康凱培養(yǎng)基、LB固體培養(yǎng)基培養(yǎng)特性觀察,在伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基(EMB)上,菌落中心呈深紫或無明顯暗色中心,菌落呈圓形,稍凸起,邊緣整齊,表面光滑、濕潤,常有綠色金屬光澤;在麥康凱培養(yǎng)基上,菌落為鮮桃紅或微紅色,中心為深桃紅色,菌落呈圓形、扁平,邊緣整齊,表面光滑、濕潤;革蘭染色均為陰性。生化鑒定結(jié)果符合大腸桿菌特性(表4)。
表4 大腸桿菌生化鑒定結(jié)果
擴(kuò)增的ECO和Uid目的條帶大小分別為232 bp和293 bp,與預(yù)期目的片段大小一致(圖5、圖6),表明分離菌均為陽性。PCR檢測與生化鑒定結(jié)果相符,確定分離的病原菌為大腸桿菌。
表3 毒力基因PCR引物
圖5 ECO基因片段電泳結(jié)果
圖6 Uid基因片段電泳結(jié)果
2.3.1 毒力基因檢測 對分離鑒定出的37株大腸桿菌,利用19對毒力基因引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示:37株菌的ompA基因檢測全部為陽性,ibeA、neuC、iutA、traT、stx檢測全部為陰性;35株細(xì)菌(94.59%)檢出iroN陽性,31株(83.78%)檢出 fimC陽性,26株(70.27%)檢出aatA陽性,19株(51.35%)檢出vat陽性,13株(35.14%)檢出fyuA陽性,6株(16.22%)檢出tsh陽性,其他基因的檢測結(jié)果見表5。
2.3.2 同時(shí)攜帶毒力基因數(shù)量分布 運(yùn)用PCR方法對37株大腸桿菌分離株的ompA等19種毒力基因進(jìn)行檢測,并計(jì)算19種毒力基因的共攜帶率。結(jié)果顯示:同時(shí)攜帶大于或等于10個(gè)毒力基因的大腸桿菌有3株(8.10%),攜帶5~8個(gè)的有22株(59.46%),攜帶5個(gè)以下的有12株(32.43%),具體結(jié)果見表6。此次檢測的19個(gè)毒力基因中,強(qiáng)毒力島基因分別是tsh、iroN、fyuA、iucD、irp2、traT、iss 7種。在37個(gè)分離株中,同時(shí)攜帶6種強(qiáng)毒力島基因的有3株,攜帶3~4種的有6株,攜帶2種的有9株,只攜帶1種的有18株,只有豪豬糞樣中分離的1株菌株沒有攜帶強(qiáng)毒力島基因。強(qiáng)毒力島基因中,iroN的檢出率最高,為94.59%,traT未檢出,其余的依次為fyuA(35.14%)、iucD(24.32%)、irp2(18.92%)、iss(18.92%)、tsh(16.22%)。
表5 19種毒力基因檢出率情況
2.3.3 毒力基因的動物種間分布 對37種動物糞樣分離提取的大腸桿菌攜帶毒力基因情況進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),棕樹鳳頭鸚鵡中分離的大腸桿菌攜帶的毒力基因數(shù)最多(12個(gè)),其次是赤猴(11個(gè))、馬來熊(10個(gè)),最少的是老虎(2個(gè)),其余動物中大腸桿菌的攜帶情況見表7。
表6 同時(shí)攜帶毒力基因數(shù)量分布
表7 不同動物源大腸桿菌毒力因子攜帶情況
細(xì)菌毒力的強(qiáng)弱很大程度上取決于其所攜帶的毒力因子(VFs)[5]。目前,致病性大腸桿菌的毒力因子主要劃分為黏附素( fim、ompA)、溫度敏感血凝素(tsh、iutA)、攝鐵系統(tǒng)(耶爾森強(qiáng)毒力島基因irp2、fyuA)、侵襲因子(ibeA)、血清抗性蛋白(iss)、毒素和大腸桿菌素。
本研究對37株不同動物源糞樣大腸桿菌分離株進(jìn)行19種毒力基因檢測,發(fā)現(xiàn)檢出率相對較高的依次為ompA(100%)、iroN(94.59%)、 fimC(83.78%)、aatA(70.27%)、vat(51.35%),其他的均在35.14%以下。由此可以看出,ompA、iroN、 fimC基因在圓通山動物園的致病性大腸桿菌中最為常見。 fimC、kspM、papC是菌毛蛋白基因,aatA是轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,tsh、iroN、fyuA、iucD、irp2、traT、iss 7種基因?qū)儆趶?qiáng)毒力島基因[6]。7種強(qiáng)毒力島基因中有6種在分離株中被檢測出來,其中iroN的攜帶率最高,為95.49%,其余5種的攜帶率也較高,說明動物園動物攜帶了不同致病性的大腸桿菌。
研究發(fā)現(xiàn),動物大腸桿菌病的致病力與其攜帶的毒力因子種類及數(shù)量密切相關(guān),涉及的基因主要有 iutA、tsh、iroN、cvaC、astA、iss、irp2、papC、iucD、vat等。董向磊[7]研究認(rèn)為,在iutA、iss、tsh、iroN、irp2、cvaC 6種毒力基因中,如果APEC分離株同時(shí)攜帶有2種以上毒力基因,則有89.74%的概率認(rèn)定該分離株具有致病性,誤差率為7.90%。
根據(jù)不同動物大腸桿菌毒力基因攜帶情況,結(jié)合相關(guān)研究推斷,動物園動物中,棕樹鳳頭鸚鵡、赤猴、馬來熊、麋鹿、緋胸鸚鵡、野豬等攜帶的毒力基因數(shù)量最多,由大腸桿菌致病的風(fēng)險(xiǎn)較高,豪豬、老虎、耳廓狐、環(huán)尾狐猴、灰葉猴、黑毛仙猴、黑葉猴等相對較低。導(dǎo)致這個(gè)結(jié)果的原因可能與它們的生活環(huán)境有關(guān)。生活環(huán)境較為密閉的動物,如老虎、耳廓狐、環(huán)尾狐猴、灰葉猴、黑毛仙猴、黑葉猴等動物體內(nèi)的大腸桿菌攜帶的毒力基因種類較少,而生活環(huán)境與外界接觸較大的動物,如赤猴、馬來熊、麋鹿等體內(nèi)的大腸桿菌攜帶的毒力基因種類較多,更容易患病。也有可能與動物自身的適應(yīng)能力和抵抗力有關(guān)。有些動物比較適應(yīng)昆明市的氣候條件,抵抗力更強(qiáng),患病率低,而有些動物不能適應(yīng)昆明市的氣候條件或者抵抗力太差,則患病率高,需要改善飼養(yǎng)條件,加強(qiáng)飼養(yǎng)管理,提高其抵抗力。
本研究從圓通山動物園37個(gè)動物種群糞便中分離鑒定出37株大腸桿菌,并對19種毒力基因的攜帶情況進(jìn)行了檢測,發(fā)現(xiàn)昆明市圓通山動物園內(nèi)流行的大腸桿菌以致病菌為主,不同種類動物體內(nèi)大腸桿菌的毒力基因攜帶率存在較大差異,其原因可能與動物的飼養(yǎng)環(huán)境以及動物自身的適應(yīng)能力和抵抗力有關(guān)。因此,對于棕樹鳳頭鸚鵡、赤猴、馬來熊、麋鹿、緋胸鸚鵡、野豬等具有較高大腸桿菌致病風(fēng)險(xiǎn)的動物,要采取相應(yīng)防治措施,加強(qiáng)預(yù)防和控制,防止大腸桿菌病發(fā)生與流行。