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      云南地區(qū)非小細(xì)胞肺癌外周血EGFR基因突變檢測(cè)分析

      2019-09-10 15:28:01崔靜楊麗琳宋蜀伶方虹強(qiáng)潘鑫艷
      關(guān)鍵詞:外顯子基因突變外周血

      崔靜 楊麗琳 宋蜀伶 方虹 強(qiáng) 潘鑫艷

      【摘 ???要】 ???目的:探討云南地區(qū)非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者外周血中表皮因子生長(zhǎng)受體(EGFR)基因突變情況。方法:收集2017年10月-2019年7月本院云南地區(qū)晚期NSCLC患者外周血標(biāo)本37例,運(yùn)用ARMS-Taqman 探針?lè)z測(cè)標(biāo)本中EGFR 基因突變情況。結(jié)果:37例血液標(biāo)本中,14例(37.8%)存在EGFR基因突變,其中19Del占總突變的28.6%(4/14),L858R 占總突變的42.8%(6/14),L858R、19Del占總突變的71.4%(10/37),有2例同時(shí)存在L858R、T790M突變;2例同時(shí)存G719X、S768I 雙突變14.3%(2/14);2例存在L861Q突變14.3%(2/14)。結(jié)論:云南地區(qū)外周血EGFR 基因突變檢測(cè)率與國(guó)內(nèi)其他報(bào)道一致,主要以EGFR基因L858R及19Del突變?yōu)橹?但云南地區(qū)的S768I 則明顯高于其他地區(qū)。

      【中圖分類號(hào)】R821.4+2 ???【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A ???【文章編號(hào)】1004-7484(2019)04-0091-02

      肺癌是一種高度異質(zhì)性的惡性腫瘤,其中非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)約占肺癌的80%~90%,惡性程度高。在我國(guó),肺癌已成為惡性腫瘤第一死因,而云南省的肺癌發(fā)病率與死亡率一直在國(guó)內(nèi)位居榜首,特別是云南宣威地區(qū),發(fā)病率是全國(guó)平均水平的20倍。70%~80%的NSCLC患者確診時(shí)已處于晚期,失去了手術(shù)治療或根治性放療的機(jī)會(huì),晚期NSCLC全身化療中位生存期僅為8~10個(gè)月。隨著對(duì)肺癌生物標(biāo)志物的深入研究和致病機(jī)理的逐步闡明,分子靶向治療已經(jīng)成為肺癌綜合治療中的最新模式,受到廣泛關(guān)注。目前NSCLC治療的重要方向之一是以表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)為靶點(diǎn)的分子靶向治療。EGFR基因突變主要發(fā)生在18~21外顯子, 大量臨床研究顯示檢測(cè)EGFR基因突變可以篩查對(duì)EGFR酪氨酸激酶抑制劑(epidermalgrowth factor receptor tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)靶向藥敏感的患者,從而實(shí)現(xiàn)靶向個(gè)體化治療。

      但是臨床上常由于多種原因,如肺癌病理組織標(biāo)本過(guò)少、患者病情過(guò)重?zé)o法耐受獲取組織標(biāo)本的相關(guān)檢查,創(chuàng)傷大,操作繁瑣等,導(dǎo)致無(wú)法進(jìn)行組織學(xué)EGFR 突變檢測(cè),從而缺乏使用EGFR-TKIs治療的依據(jù)。近年來(lái),NSCLC患者的外周血循環(huán)DNA分析可一定程度反映腫瘤情況,其檢測(cè)得到了廣泛關(guān)注。研究發(fā)現(xiàn)腫瘤患者外周血腫瘤DNA含量明顯高于正常人群,且外周血腫瘤DNA 與腫瘤組織DNA 具有類似的遺傳學(xué)特性,有數(shù)據(jù)顯示血液EGFR水平與組織樣本的一致性為60%~95%。楊長(zhǎng)紹等對(duì)云南地區(qū)NSCLC患者組織標(biāo)本的EGFR基因突變進(jìn)行了檢測(cè),發(fā)現(xiàn)了具有顯著的地區(qū)差異性,本文就云南地區(qū)NSCLC患者外周血中的EGFR基因突變情況進(jìn)行檢測(cè)分析。

      1 ???材料和方法

      1.1 臨床資料

      本院自2017年10月至2019年7月共收治37例僅有細(xì)胞學(xué)標(biāo)本但無(wú)組織學(xué)標(biāo)本、僅行外周血EGFR突變檢測(cè)的Ⅳ期非小細(xì)胞肺癌患者。其中男20例,女17例;年齡36~69歲,中位年齡55歲;有吸煙史者20例,無(wú)吸煙史者26例;腺癌36例。

      1.2 外周血EGFR檢測(cè)方法

      1.2.1 標(biāo)本采集

      常規(guī)采血10 ml,用一次性真空采血管(游離DNA保護(hù)專用) 接采血針收集血樣10 ml,立即輕柔地上下顛倒采血管8~10次,并于4 h內(nèi)提取游離DNA。

      1.2.2 血漿分離

      全血4000 rpm 離心10 min,取上清(吸取時(shí)槍尖離底部殘留物2~3 mm),此上清即為血漿(≥2 ml) 。

      1.2.3 DNA提取

      取4 ml血漿樣品(不少于3 ml),加入1.8 ml Buffer CDL,再加入50μl蛋白酶K液,充分混勻10 s, 63℃水浴消化15 min。快速冷卻至室溫,加入400μl DNA Tracer 混勻,再加入3.3ml 預(yù)冷的異丙醇,顛倒混勻,10000 rpm 離心5 min,棄上清;往沉淀中加入470μl Buffer CDB 與10μl蛋白酶K液,63℃消化10 min,快速冷卻至室溫,加入200μl無(wú)水乙醇,將沉淀吹打混勻。將沉淀混合液全部轉(zhuǎn)移至吸附柱中,10000 rpm 離心30 s,棄廢液。加入700 μl Buffer CW1, 10000 rpm 離心30 s;加入700 μl Buffer CW2, 10000 rpm 離心30 s,;加入700 μl 無(wú)水乙醇,10000 rpm 離心30 s,更換收集管, 13000 rpm 離心5 min;將吸附柱轉(zhuǎn)移至干凈的1.5 ml離心管中,往吸附膜中心滴加50 μl Buffer CDE,90℃孵育5 min, 13000 rpm 離心1 min,收集樣品DNA。

      1.2.4 DNA濃度測(cè)定

      用微量紫外分光光度測(cè)定DNA 樣品的濃度及OD260/OD280值。

      1.2.5 ARMS法進(jìn)行PCR 擴(kuò)增

      人EGFR基因突變檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)基因突變檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)購(gòu)自廈門艾德生物醫(yī)藥科技股份有限公司。取42.3 μl 樣品DNA,加入2.7 μl Taq 酶(EGFR) ,混勻后向每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)加入5μl。將8連排反應(yīng)條蓋上蓋子,離心后放入實(shí)時(shí)定量PCR儀中。每輪反應(yīng)設(shè)置陰陽(yáng)對(duì)照各一。擴(kuò)增程序: 95℃ 5 min; 95℃25 s, 64℃ 20 s,72℃ 20 s,15 個(gè)循環(huán); 93℃ 25 s,60℃ 35 s,72℃ 20 s, 31 個(gè)循環(huán),在60℃時(shí)收集FAM/VIC 熒光信號(hào)。

      1.2.6 結(jié)果判定

      陰性對(duì)照無(wú)信號(hào),陽(yáng)性對(duì)照Ct值<20。待測(cè)樣品內(nèi)控、外控信號(hào)應(yīng)升起,外控信號(hào)應(yīng)在13~19。滿足上述條件的試驗(yàn)結(jié)果為可信結(jié)果。突變Ct值≥陰性臨界值時(shí)為(-),<陽(yáng)性臨界值為強(qiáng)(+)。當(dāng)突變Ct值≥陽(yáng)性臨界值且<陰性臨界值時(shí),計(jì)算△Ct值(△Ct 值=突變Ct值-外控Ct值)。若△Ct值<相應(yīng)的△Ct Cut-off 值,則該樣品為弱(+);若△Ct值>相應(yīng)的△Ct Cut-off值,則該樣品為(-)。

      2 ???結(jié)果

      2.1 血漿DNA質(zhì)量控制

      用微量紫外分光光度儀測(cè)定DNA 樣品的濃度,平均濃度為11.02 ngμl,平均OD260/OD280 比值為1.96。

      2.2 EGFR基因突變頻率與類型

      云南地區(qū)37例中血液標(biāo)本中,14例(37.8%)存在EGFR 基因的突變,其中EGFR基因外顯子21 L858R突變率最高,為42.8%(6/14);其次為19 缺失突變(28.6%,4/14);19Del、L858R 占總突變的71.4%(10/14);2例患者(14.3%,2/14)同時(shí)出現(xiàn)外顯子18 G719X 和外顯子20 S761I 雙突變, S761I無(wú)獨(dú)立突變,與18外顯子G719X伴隨存在;2例患者(14.3%,2/14)同時(shí)出現(xiàn)外顯子20 T790M 和外顯子21 L858R 突變;2例患者出現(xiàn)外顯子21 L861Q突變(14.3%,2/14)。

      3 ???討論

      表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor, EGFR)酪氨酸激酶受體抑制劑(tyrosine kinases inhibitors, TKIs)是目前最重要的靶向治療藥物,對(duì)于有EGFR敏感突變的NSCLC,采用EGFR-TKIs治療具有明顯的臨床療效。然而,肺癌組織活檢樣本具有局限性,如很多高齡患者診斷時(shí)已無(wú)法手術(shù)因而無(wú)標(biāo)本可取,氣管鏡取材小,某些腫瘤解剖位置及肺部基礎(chǔ)疾病不適和穿刺,穿刺本身諸多風(fēng)險(xiǎn),反復(fù)取材患者接受程度低等?!耙后w腫瘤學(xué)檢測(cè)”因其操作可行性強(qiáng)、侵害性小、具有實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)等特點(diǎn)正越來(lái)越受到臨床關(guān)注。循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA) 是凋亡和壞死的腫瘤細(xì)胞直接釋放到外周血中的DNA 片段,并攜帶腫瘤組織相關(guān)信息。朱毅等報(bào)道NSCLC 患者外周血EGFR突變與組織中EGFR突變的一致率為92%。研究發(fā)現(xiàn)福爾馬林固定及石蠟包埋技術(shù)對(duì)樣本DNA 的會(huì)產(chǎn)生一定的影響,每個(gè)樣本腫瘤細(xì)胞的數(shù)量與形態(tài)和取樣的位置及大小存在很大關(guān)系,加上腫瘤異質(zhì)性,導(dǎo)致腫瘤病理組織活檢可能不能反映整個(gè)病灶的完整信息。外周血中的ctDNA 來(lái)源于腫瘤原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶壞死凋亡的腫瘤細(xì)胞碎片,這就可能可以避免腫瘤組織的遺傳異質(zhì)性而體現(xiàn)整個(gè)腫瘤的遺傳學(xué)特征。研究表明在中國(guó)EGFR 基因的突變存在顯著的地域差異,臺(tái)灣地區(qū)的EGFR 基因的突變以外顯子21 為主,云南和廣東地區(qū)以外顯子19 為主。云南宣威是肺癌高發(fā)的地區(qū),其EGFR基因外顯子18 G719X、外顯子20 S768I突變相對(duì)較高。

      本研究檢測(cè)云南地區(qū)37例NSCLC 患者血漿EGFR基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)EGFR基因突變陽(yáng)性14例,突變率37.8%,同文獻(xiàn)報(bào)道相符。本研究結(jié)果顯示,云南地區(qū)NSCLC 患者中,EGFR 基因的突變主要發(fā)生在21 號(hào)外顯子L858R 突變及19 號(hào)外顯子缺失,與文獻(xiàn)報(bào)道一致。本研究中20號(hào)外顯子S761I無(wú)獨(dú)立突變,與18外顯子G719X伴隨存在,突變率為14.3%,這與楊長(zhǎng)紹等人報(bào)道的云南宣威地區(qū)非小細(xì)胞肺癌組織標(biāo)本中EGFR基因突變結(jié)果一致,原因是因?yàn)楸狙芯窟x取的云南地區(qū)標(biāo)本包括了云南宣威地區(qū),只是由于標(biāo)本量相對(duì)較少,進(jìn)行區(qū)域劃分意義不大。Jian 等對(duì)56 例晚期NSCLC 患者血樣本檢測(cè)EGFR突變的檢出率為23.2%,并認(rèn)為血中檢測(cè)到的EGFR突變可以用于預(yù)測(cè)吉非替尼的治療療效。Liu等對(duì)比了不同方法檢測(cè)血漿樣本與組織樣本EGFR 突變的準(zhǔn)確性,發(fā)現(xiàn)與組織樣本相比,血漿的靈敏度67.5%( 27/40),特異性為100%( 46/46)。Kim 等對(duì)57 例配對(duì)樣品的組織和血漿分別進(jìn)行EGFR突變檢測(cè),血漿樣本和組織樣本EGFR突變狀態(tài)的一致率87.7%。

      綜上所述,應(yīng)用ARMS方法檢測(cè)外周血中腫瘤細(xì)胞的EGFR基因突變,可以較準(zhǔn)確地反映NSCLC患者的EGFR突變情況,而且耗時(shí)短,損傷小,標(biāo)本易得且經(jīng)濟(jì)實(shí)惠,是值得臨床推廣。但由于ctDNA的含量非常少,通過(guò)外周血檢測(cè)EGFR突變?nèi)杂幸欢ǖ木窒扌?。雖然一次檢測(cè)外周血EGFR突變陰性,但不說(shuō)明實(shí)體腫瘤細(xì)胞的EGFR突變也是陰性,多次檢測(cè)中任何一次突變陽(yáng)性都可以成為臨床使用EGFR-TKI的依據(jù)。但由于外周血樣本存在假陰性的可能,組織標(biāo)本存在腫瘤異質(zhì)性等特點(diǎn),因此,我們建議在送檢時(shí)應(yīng)進(jìn)行多種標(biāo)本兼顧。

      參考文獻(xiàn)

      [1]高云, 陳嘉昌, 朱振宇, 彭煥玉, EGFR基因突變及其檢測(cè)方法的研究進(jìn)展, 分子診斷與治療雜志, 3 (2011) 51-56.

      [2] 姜北, 李晶, 鞏平, 非小細(xì)胞肺癌患者血清EGFR基因突變循環(huán)DNA檢測(cè), 中華腫瘤防治雜志, 21 (2014) 29-33.

      [3] 沈立, 沈紅, 杜興冉, 杜強(qiáng), 朱成華, 晚期非小細(xì)胞肺癌外周血EGFR基因檢測(cè)與腫瘤抗原標(biāo)志物的臨床意義, 臨床肺科雜志, 22 (2017) 614-617.

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      [5] 楊長(zhǎng)紹, 徐文漭, 馮強(qiáng), 王媛媛, 潘鑫艷, 王力, 楊舉倫, 王麗, 云南不同地區(qū)非小細(xì)胞肺癌EGFR 基因突變檢測(cè)分析, 西南國(guó)防醫(yī)藥, 26 (2016) 4-7.

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      [7] 朱毅, 裴鋒, 擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)檢測(cè)晚期非小細(xì)胞肺癌患者外周血游離DNA 中EGFR基因突變, 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志, 26 (2016) 3574-3577.

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