冠狀病毒屬的病毒是具囊膜結(jié)構(gòu)的單股正鏈RNA 病毒，可感染人、鼠、豬、貓、犬、禽類等脊椎動物，引起包括哺乳動物和禽在內(nèi)的多種動物呼吸系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、泌尿生殖系統(tǒng)和神經(jīng)系統(tǒng)等不同程度的疾病。近年來多種新型冠狀病毒從不同動物中發(fā)現(xiàn)，并證實了這些新型病毒具備跨物種感染的趨勢，給動物或/和人類造成公共衛(wèi)生安全隱患，因此探究冠狀病毒的起源和進化研究越來越引起人們的重視。

雞傳染性支氣管炎病毒（Infectious Bronchitis virus,IBV）作為冠狀病毒的典型代表，最先是1931 年從雞身上發(fā)現(xiàn)。此后相繼從多種不同物種分離到不同類型的冠狀病毒。目前根據(jù)病毒基因型和血清學特征將現(xiàn)有的冠狀病毒分為α、β、γ、δ亞群冠狀病毒，其中α、β亞群病毒主要從哺乳動物中發(fā)現(xiàn)，γ亞群病毒主要從禽和海洋哺乳動物中發(fā)現(xiàn)，而δ亞群冠狀病毒主要發(fā)現(xiàn)于禽和豬。與IBV 同屬于γ亞群的其它冠狀病毒大多數(shù)從鳥類中分離出來，其中包括雞形目（雞，火雞，鵪鶉，珍珠雞，野雞和孔雀），雁形目（鴨，鵝，水鴨，天鵝和長尾鴨），鴿形目（鴿子），鵜形目（琵鷺），鰹鳥目（鸕鶿），鸻形目（紅腹濱鷸，蠣鷸和黑頭鷗）和雀形目（夜鶯）。在這些冠狀病毒中，造成危害嚴重的病毒主要是傳染性支氣管炎病毒和火雞冠狀病毒（TCoV）。IBV 由于病毒自身的復(fù)制酶缺乏校正功能，基因（尤其是與病毒組織嗜性和抗原性密切相關(guān)的S 基因）核苷酸序列易于突變、插入或重組，導(dǎo)致近年來病毒在宿主中不斷變異和演化，病毒的基因型和血清型呈現(xiàn)出復(fù)雜性和多樣性，并不斷有新的變異株在雞群中發(fā)現(xiàn)，從而導(dǎo)致傳染性支氣管炎疫病的防控形勢日趨嚴峻。

一般認為IBV 只感染各個日齡的雞，并造成不同臟器的病理損傷，不感染除雞以外的其它禽類，但近年來從部分野鳥和水禽中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒與IBV 高度相似，而且根據(jù)TCoV 的基因組研究分析結(jié)果推測TCoV 與IBV 遺傳關(guān)系密切，推測這些新出現(xiàn)的禽冠狀病毒很可能由IBV 在不同宿主中適應(yīng)并進化而成，但一直以來缺乏可信的科學依據(jù)。中國農(nóng)業(yè)科學院哈爾濱獸醫(yī)研究所禽呼吸道病創(chuàng)新團隊近期發(fā)表于《Veterinary Microbiology》的一項研究工作報道了從我國山東和安徽地區(qū)養(yǎng)殖的雉雞群中首次分離獲得兩株雉雞冠狀病毒（分別命名為I0623/17 株和I0710/17 株），經(jīng)系統(tǒng)研究發(fā)現(xiàn)這兩株雉雞冠狀病毒（PhCoV）與IBV 高度相似。該項研究從病毒心態(tài)學、抗原性、血清學反應(yīng)、病毒主要結(jié)構(gòu)蛋白基因、全基因組結(jié)構(gòu)以及病毒對雞和雉雞不同宿主的致病性等方面闡釋了PhCoV 和IBV 之間存在較近的遺傳關(guān)系，發(fā)現(xiàn)PhCoV 的ORF 和推導(dǎo)的氨基酸序列中存在與IBV 相似的點突變，缺失和插入現(xiàn)象，但并未發(fā)現(xiàn)重組現(xiàn)象，PhCoV 基因組中存在多個基因位點的這些替代積累，導(dǎo)致了病毒從雞到雉雞的宿主轉(zhuǎn)移，但并未導(dǎo)致致病性的變化。而與此相反的是，本研究分析了國外分離雉雞冠狀病毒S1基因與IBVS1 基因序列的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)外已報到的不同疫情中分離的PhCoV 之間以及與本研究分離雉雞冠狀病毒之間并無顯著的親緣關(guān)系，反而與當?shù)亓餍械腎BV 具有遺傳相關(guān)性，且存在不同的進化模式和不同的組織嗜性，這一研究結(jié)果以充分的科學依據(jù)有效證實PhCoV 是在特定條件下由IBV通過適應(yīng)雉雞并在雉雞群中獨立演化而來，揭示出雉雞冠狀病毒的起源和進化。這對于新型冠狀病毒的起源和遺傳演化研究以及相關(guān)病原防控理論的研究具有重要的科學指導(dǎo)意義。