張愛興 ,馬曉溪 ,陳冉 ,李慶 ,張慧 ,王玉明
(1.昆明醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院檢驗科,云南 昆明 650101;2.昆明醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院檢驗科,云南 昆明 650032)
肺癌是我國發(fā)病率及死亡率最高的癌癥種類,有研究顯示,該疾病的年死亡率為42.09/10萬[1]。尤其是地處西南部的云南宣威地區(qū)。研究顯示宣威肺癌患者中,男性和女性平均患病死亡率分別為 98.10/10 萬,83.28/10 萬[2],居世界之首[3]。 p53 正向凋亡調(diào)控因子 (p53 up-regulated modulator of apoptosis,PUMA)是近年來發(fā)現(xiàn)的一種促凋亡因子,它是Bcl-2家族中BH3-only亞家族的成員,在p53依賴與非依賴性細胞凋亡途徑中均起重要作用,PUMA基因上游啟動子序列中含p53的結(jié)合位點,受凋亡信號刺激后,p53可直接與其靶位點結(jié)合而促進PUMA的轉(zhuǎn)錄及蛋白表達[4,5]。前期研究顯示,從肺癌組織中篩選出對PUMA可能具有調(diào)控作用的miRNA,其中有10條miRNA表達上調(diào),miR-221升高較為明顯[6]。迄今為止,關于miR-221調(diào)控肺癌細胞生長的系統(tǒng)性研究在國內(nèi)外鮮見報道,由此,本研究根據(jù)miRNA的作用機制構(gòu)建雙熒光報告載體,以驗證PUMA是否為miR-221的靶基因,進一步通過后續(xù)實驗研究miR-221在宣威肺癌的發(fā)生、發(fā)展過程中可能具有的作用機制。
1.1 細胞株及主要試劑 宣威肺癌細胞株(XWLC-05)購自中國科學院云南省腫瘤研究所;質(zhì)粒pm irGLO購自美國Promega公司;質(zhì)粒抽提試劑盒購自北京莊盟國際生物基因科技有限公司;TRIzol、Lipofectamine2000購自美國Invitrogen公司;Dual-Luciferase?Reporter Assay System、Caspase-Glo?3/7 Assay、Caspase-Glo?9 Assay購自美國 Promega公司;四甲基偶氮唑藍(MTT)、二甲基亞砜(DMSO)購自美國Sigma公司;miR-221過表達/抑制表達載體購自美國GeneCopoeia公司;Taq DNA聚合酶 、Primescript RT Reagent kit、SYBR Premix Ex Taq kit購自日本TaKaRa公司。
1.2 方法
1.2.1 細胞培養(yǎng) 根據(jù)細胞貼壁生長的特性進行XWLC-05培養(yǎng),使用的培養(yǎng)基為加入10%胎牛血清、1%青霉素、鏈霉素雙抗液的RPMI-1640細胞培養(yǎng)基,具體培養(yǎng)條件為37℃、5%CO2的培養(yǎng)箱。
1.2.2 PUMA載體的構(gòu)建 從數(shù)據(jù)庫中搜索PUMA基因中能夠和miR-221相結(jié)合的序列片段,即其3’UTR端,然后設計并合成兩段此3’UTR序列,一段作為野生型基因,即不改變其結(jié)合位點序列:5’AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGGCGCGGGGG ACTTTCTCTGCACCATGTAGCATACTGGACTCTAG TCTAGACTAG3’(正向序列);而另一段作為突變型基因,即使其結(jié)合位點改變 (對照):5’AGCTTT GTTTAAACGGCGCGCCGGCGCGGGGGACAAACA GACGAGGAAGAACGATACTGGACTCTAGTCTAG ACTAG3’(正向序列),共同的下游系列為5’CTA GTCTAGACTAGAGTCCAGTATCGTTCTTCCTCGTC TGTTTGTCCCCCGCGCCGGCGCGCCGTTTAAACA AAGCT3’,在所有序列兩端分別加入酶切位點及保護性堿基,退火酶切后,將兩段基因片段分別與質(zhì)粒連接,連接后導入大腸桿菌JM109進行轉(zhuǎn)化并培養(yǎng)。挑選體積較大的菌落用實時定量聚合酶鏈反應(qRT-PCR)方法和測序方法驗證插入序列的正確性后,將菌落保存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 雙熒光素酶報告實驗 培養(yǎng)的XWLC-05經(jīng)表1中各組上述抽提野生型、突變型質(zhì)粒載體分別進行轉(zhuǎn)染,并于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)4~6h后,改為在細胞培養(yǎng)液中繼續(xù)培養(yǎng)48 h,然后使用Luciferase報告基因系統(tǒng)對其熒光素酶活性進行檢測,每組做5個復孔,取其平均值進行計算。
表1 雙熒光素酶報告實驗分組
1.2.4 MTT比色法分析XWLC-05增殖 按表1野生型質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組進行分組,在各組XWLC-05細胞中分別加入MTT液,并于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)6 h后,立即加入DMSO,輕微地振蕩混勻20 min。 XWLC-05 細胞經(jīng)培養(yǎng) 0、24、48、72 h 后使用酶標儀于570 nm波長分別進行酶活性的檢測,每組做5個復孔,取其平均值進行計算。
1.2.5 Caspase 3/7、Caspase 9的活性檢測 首先將Caspase的反應底物及緩沖液充分混勻,混勻后靜置于室溫10 min,然后加入表1野生型質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組各組XWLC-05細胞,于室溫孵育30 min。使用酶標儀進行酶活性的檢測,每組做5個復孔,取其平均值進行計算。
1.2.6 qRT-PCR檢測各組XWLC-05中的PUMA的表達水平 使用TRIzol法提取表1野生型質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組各組XWLC-05的總RNA,并使用Primescript RT Reagent kit將總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。以qRT-PCR方法檢測各組PUMA的表達水平(上游引物為:ACACGGTAAAACCATGAC,下游引物為:GTCCAAACTCATCAATGTA, 內(nèi)參:GAPDH)。qRT-PCR采用 SYBR Premix Ex Taq kit進行,反應條件為 95 ℃、30 s;95 ℃、5 s;64 ℃、31 s;72 ℃、34 s,共進行40個循環(huán),并檢測其融解曲線,使用公式2-△Ct來計算其表達水平,△Ct=同一樣本目的基因Ct值—內(nèi)參基因Ct值。
1.3 統(tǒng)計學分析 使用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件包進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。符合正態(tài)分布的計量資料以均數(shù)±標準差(±s)表示,并使用隨機設計的單因素方差分析實驗數(shù)據(jù),采用Student-Newman-Keuls q檢驗比較多組間樣本均數(shù);兩組均數(shù)比較采用t檢驗;如果數(shù)據(jù)為非正態(tài)分布以中位數(shù)(四分位數(shù)間距)[M(QR)]表示,使用 Kruskal-Wallis秩和檢驗;檢驗水準α=0.05。
2.1 重組質(zhì)粒的PCR及酶切鑒定 重組質(zhì)粒經(jīng)PCR擴增后,10%瓊脂糖凝膠電泳可見到與目的片段大小一致的PCR產(chǎn)物條帶;經(jīng)PmeⅠ、XbaⅠ雙酶切后,得到一條約7 300 bp的目的條帶及空載體條帶。見圖1、圖2。
圖1 重組質(zhì)粒PCR擴增產(chǎn)物凝膠電泳圖
圖2 重組質(zhì)粒酶切圖
2.2 重組質(zhì)粒的測序結(jié)果 構(gòu)建的表達載體經(jīng)過測序分析后結(jié)果顯示,所插入的PUMA3’UTR端序列(野生型、突變型)與設計相符,沒有出現(xiàn)堿基突變和(或)缺失。質(zhì)粒載體構(gòu)建相關結(jié)果表明已成功構(gòu)建質(zhì)粒載體。見圖3、圖4。
圖3 野生型重組載體PUMA測序結(jié)果
圖4 突變型重組載體PUMA測序結(jié)果
2.3 熒光素酶報告實驗證實PUMA基因是miR-221的靶基因 在實驗組中,pGLO-PUMA(wt)+Over-miR-221轉(zhuǎn)染組的熒光活性值為5.88±0.72,低于pGLO-PUMA(wt)轉(zhuǎn)染組(11.52±1.24)(t=-8.662,P<0.001),熒光值大約降低了49%,見圖5;另外如果轉(zhuǎn)染報告基因質(zhì)粒(wt)和inhibitor載體,則熒光素酶表達量會顯著升高,pGLO-PUMA (wt)+In-mi R-221轉(zhuǎn)染組熒光活性值為31.66±4.72,顯著高于pGLO-PUMA(wt)轉(zhuǎn)染組(10.12±1.58)(t=12.761,P<0.001),熒光值升高超過100%,見圖6。
在對照組中,為了進一步確認miR-221的調(diào)節(jié)作用是通過其與靶基因相應序列互補配對,本研究下一步將質(zhì)粒(wt)上的相應序列進行突變,構(gòu)建突變質(zhì)粒(mut)。當突變質(zhì)粒和過表達載體同時轉(zhuǎn)染時,熒光素酶表達量沒有降低(t=0.806,P=0.445),見圖5;同樣地,突變也造成了inhibitor載體抑制效果的消除(t=1.755,P=0.117),見圖 6。 上述結(jié)果表明重組質(zhì)粒載體已經(jīng)準確地插入到熒光素酶報告基因,并在XWLC-05細胞內(nèi)進行了熒光素酶基因的表達,證實PUMA是miR-221的靶基因之一。
2.4 miR-221促進XWLC-05增殖 各組XWLC-05細胞分別培養(yǎng) 0、24、48 和 72 h 后,Control組和Scramble組按照腫瘤細胞增殖方式進行細胞增殖,過表達轉(zhuǎn)染組培養(yǎng)24 h后,細胞的生長相比于Con trol組及Scramble組開始出現(xiàn)促進細胞增殖的現(xiàn)象,Over-miR-221組細胞的生長速度也明顯高于Control組和Scramble組;抑制表達轉(zhuǎn)染組中,細胞在培養(yǎng)24 h后開始出現(xiàn)明顯的抑制現(xiàn)象,而且隨著時間的延長,抑制程度也更加明顯,In-miR-221組細胞的生長速度明顯低于Control組和Scramble組[F(24 h)=98.181,P<0.001;F(48 h)=109.561,P<0.001;F(72 h)=143.782,P<0.001],見圖 7。
2.5 miR221通過Caspase抑制XWLC-05凋亡 相比Scramble組,In-miR-221組細胞的Caspase 3/7活性增高 (t=12.851,P<0.001); 而 Over-miR-221組轉(zhuǎn)染組中Caspase 3/7活性較低,與Scramble組相差不大(t=-2.181,P=0.061)。 而對于 Caspase 9,相比Scramble組,In-miR-221組細胞的Caspase 9活性也增高(t=15.491,P<0.001);而 Over-miR-221組轉(zhuǎn)染組中Caspase 9活性較低,與Scramble組相差不大(t=-2.056 ,P=0.074),見圖 8、圖 9。
2.6 XWLC-05過表達與抑制表達miR-221后PUMA基因的表達水平 因各組樣本數(shù)據(jù)不符合正態(tài)分布,所以各組XWLC-05之間的PUMA表達水平通過Kruskal-Wallis秩和檢驗進行統(tǒng)計分析,差異無統(tǒng)計學意義(H=1.262,P=0.532),表明 miR-221在調(diào)控其靶基因PUMA表達的過程中,無論是過表達還是抑制表達,在靶基因PUMA的轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控中無明顯作用。
圖5 過表達轉(zhuǎn)染組熒光素酶活性檢測miR-221與PUMA的相互作用
圖6 抑制表達轉(zhuǎn)染組熒光素酶活性檢測miR-221與PUMA的相互作用
圖7 各轉(zhuǎn)染組細胞酶活性
圖8 各轉(zhuǎn)染組的Caspase 3/7活性
miR-221定位于X染色體p11.3區(qū),呈成簇分布,是定性較為明確的原癌基因簇[7]。miR-221是一種很有潛力的生物靶向分子,在多種惡性腫瘤中均表達異常,例如Garofalo等[8]在研究與雌激素表達相關的miRNA時發(fā)現(xiàn),miR-221直接作用于ERα基因的3’UTR端,它在MCF-7和T47D細胞中呈現(xiàn)異常表達,使ERα蛋白表達下降,而mRNA的表達并未降低。Lupini等[9]在分析通過過表達miR-221來影響甲狀腺癌細胞生長的過程中,通過沉默機制對miR-221進行基因沉默,以此來影響并降低甲狀腺癌細胞的細胞增殖能力,這表明miR-221可以在甲狀腺癌細胞中起到促進細胞增殖的作用。此外,在胰腺癌、惡性膠質(zhì)瘤等惡性腫瘤細胞中,miR-221的表達也都出現(xiàn)了異常[10,11]。
本研究結(jié)果顯示,過表達轉(zhuǎn)染組細胞生長相比Control組和Scramble組出現(xiàn)促進細胞增殖的作用;抑制表達轉(zhuǎn)染組細胞在轉(zhuǎn)染后24 h相比Control組和Scramble組出現(xiàn)了抑制細胞增殖的現(xiàn)象,且隨著時間的推移,抑制程度也更加明顯,這與Ie Sage以及Koelz等[12,13]的研究結(jié)果相符。
Caspase 3是引發(fā)細胞凋亡機制的一個關鍵酶,其主要功能是對pro Caspase 3、6、7和9進行剪切,并對許多Caspase底物進行直接特異性剪切,這些通過Caspase 3介導的蛋白剪切機制是細胞凋亡機制中的一個主要組成部分;Caspase 9則是細胞凋亡階段中位于上游的一個Caspase,激活Caspase 9后可以進一步激活Caspase 3,進而促使后續(xù)細胞凋亡。在Caspase家族的凋亡信號通路中,已有研究證實puma可通過激活Caspase 3/Caspase 9等機制促進細胞凋亡以及抑制細胞增殖[14]。在本實驗結(jié)果中,抑制表達轉(zhuǎn)染組細胞Caspase 3/7和Caspase 9活性增高;而轉(zhuǎn)染過表達組別中無論是Caspase 3/7還是Caspase 9,其活性均較低,與Control組及Scramble組相差不大。實驗結(jié)果提示通過對miR-221進行抑制表達可以激活Caspase 3和Caspase 9凋亡機制,使Caspase活性增高并進一步促使肺癌細胞凋亡,這與Wu等[13]的研究結(jié)果一致;而在促進細胞增殖過程中,過表達miR-221可以促進細胞增殖,但Caspase活性變化不大,造成這種結(jié)果可能的原因是存在另外的機制促進細胞增殖,而并不是通過降低Caspase 3/7和Caspase 9活性來抑制細胞凋亡,進而促進細胞增殖。本研究在利用qRT-PCR方法檢測PUMA表達水平的結(jié)果中,其統(tǒng)計學結(jié)果差異無統(tǒng)計學意義,這可能是因為PUMA只是miR-221的靶基因之一,還存在其他靶基因共同調(diào)控肺癌細胞增殖凋亡,miR-221可能通過抑制PUMA的翻譯而非誘導PUMA的降解來調(diào)控基因表達。
本研究證實PUMA為miR-221的靶基因之一,這一結(jié)論與張春智等[15]在神經(jīng)膠質(zhì)瘤細胞中的結(jié)果相一致,轉(zhuǎn)染Over-miR-221對宣威肺癌細胞的生長起到促進細胞增殖的作用,而在轉(zhuǎn)染In-mi R-221時,細胞中Caspase 3/7、9的活性均升高,促進了細胞凋亡,最終抑制了肺癌細胞的生長??傊琺iR-221可能通過負向調(diào)控PUMA以及其他靶基因來參與宣威肺癌的發(fā)生、發(fā)展,然而miR-221調(diào)控PUMA進一步影響宣威肺癌發(fā)生發(fā)展的機制仍待進一步研究。
圖9 各轉(zhuǎn)染組的Caspase 9活性